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GrainGenes Sequence Report: AA008089

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Sequence
AA008089
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008089
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGGAACATCTCTCCAAAACTCTTTCTTCTCCCGTCGTCTCCTCCTCCTCC
TCTGTCCCCTGCCTGCTCGCGACCGTCAAAAAACTCCAAACAACGCCACA
GGGAAAAGCACGCACCACTTTTCAATTTTTTTTTCTGCCCTTTCCCGATA
CCATACTTCCTCCTCCTATTCCCCCTATCCGCCTCCACCGCCAGCCCGCC
CGACTCGGCGACGACCCGCGTACTCGCCGCCGGCTCGGAAGCCTCCTCGC
CCCCCTCTCCGCGGAGAGCCGCCGGAGCCTGCCGCCCGCCGGCTCTGCCC
CGCGCCCGCCAGCCCGCAGGCATTCGCCTCCCTGCGCCCGCCCGCCCGCC
GAAGGTTCGTTTGGTCCCTTCTCTCCTCGTTTCGTTTCGTTTCGTTTCCC
TTGGGGGGGTAGGTAGGTAGGGAGGGTTATTCCCGTTGCTCCACGGAATT
TCTGATCCTTGCTGCTACTGTCTCGCCTTCCGGCGCCTCCGCAATCTCAT
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AACAAGATGATTTGATGCCAAAAACTGAAACCCAGGTCTCTGGACGAATG
AACGAATATTCAGTTCCTTCTGTTTCTGGGCGCATTGATGTTTCTTCAAA
TGGCAAGGCAGACCGGGTTGCTGAAATATCCGGTGATCCGGTGACATACC
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CTGCTCTGTTTGATGGTTATAATGACGGTTTTTCAAATTCAGTCAAGTTT
GATATCCAGCAGCTGCCACATGACATGGATGCCATGCTTCTGAAGAAAGA
TGGTAATGGTGAACTGGAAAAGGATGTTTTGCTGCCAAAAATTGAAGCCA
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AACCTTGCTGTTTCTTTGGATGACAAGTCTGGTGGGATCGGTGAAATATC
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AGGTCACGCAAAACATCTGGGAAGAAAGAGCAGCCAAGTATTCGCAAGAC
TCGAAGTTCAAGATGTTCAAAGAATAGGTTCTCTCCCTTGCCTGCTATTG
GATTTGCATCGAATGACCAACCTACCTTTTCTGTTACAACTAGTACTTAT
GCCTCCTCAGAAGGTTACATAGGAAACTTTCCAAGATCGGATCATCATGC
ATTGGTCAATGGTTCTGATGATGCTCACAAAACTGCAGAATGTATGTCTA
TCCAGACTGGCTTGCAGCAGTTAGACAGGTGCTTGGAGAGTGTTACTCAG
GAAATATGCCCTGCATACATCTGTGGAGACTTTGCTAAATCAACTTCTGA
ACCTTCTCTGAATATTGCCGGTGTTGGATTTTCACCTGACTCTGTTTTGG
ATGTAGCTTCTGCTACATGTGAAAACAACACTGCTGCAAACCATGATGCT
AAACTGCACACAAACCCATCTTGTCCTGCTGCATTGACTGAAAATGGTCT
TCATCCATCTGCTTTGTCTACTTCTGTCTCTCGGAAAAATCATGCTTCGT
TATCAGCAGATTTGGAGCAGTGGGCCCATTCTCTGAGGGGGAATGAGAAC
ACAAGACATGAAGACATTAATCCGTCTCATGCCATATTAGGTTATATTGG
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AAAAAGTGGGAAAGCAAGAACGACAGAAGAAAGATGGAATGAAGGGAAAA
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CTCTGATGATTCATGTTCACTTGTTCCATCAGTTCCCCCAAAGTCCGGTT
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ACTTGACAATGTGAAATCACCAAGGCGGAAGAAAAATGATTATTCTGGAG
GGAAGAAGGATACGATGTGGGATCCATATGTGAAGGGAAAAGGCATGAAT
AGAAATATAGCAGGTGACATTTTCCTTGATTCTGGATCTTCTACTTCACC
TTCTCAGTTGGTTGCTGACCTGGCAGCATCTCATATGAATGACCAGAGTA
GGTCTCCTCTTATTTGAATTTTGTCATTTAATCCTTTTCCACTATCATGT
ATCAAGCAATTTCAATAGATTGACATTTTAAATTTATTGTAGGTAATCGT
ACTCCAGCTACTGAATTTGCATTTGAGAACTCTGCCGTTATATCTACTGG
AATGCCTAGAAATTCTGCTTGCATAACAGATGGGGCATCTCTACCACAAC
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ATACCAGCTGACTTCGCAGATATCATTGGAAAAACAAATTGCAGATGGTA
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AATGTAATTGAGGAACCATGTACTGGAGTCCGGTAGTGTGTTGTTCCACC
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TTTTCCAGCTGCTAATCCTGAATTACCTACTTGAAACGAAATAGACAATT
TTGCTAAAATGGAAGAGCTCAACTGCGACAATACTGTCATCGCACTGCAT
TCCTTCTTATATGCTGTGTAAAGCTGACATTTTGATACTCTATCTTCATG
TAATTCTATGAAACTTATATTTTGTAGTTGCTTAAACTCTTCGTATCTTG
GCAGTAGATGCTAATCAGTTACTCAGGGGAATAAATGCTCCTTGATTGTT
CCCTGTGCAAACAGCTATGGAGCTACAACTTCTTTCTTCTGTGGCTTAGG
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CAAATCTGTATTTAGGTCTTTGGTTTATTTTTTCTCTTCTATATTGTGTT
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AAGAGAAGACAAACGCTGAGATCAATGCCGAGCTGGATCTTTCAGATGCT
TCTGCTGATGAAGCTGATAATGATGGATTGAACTCAAAAGGTTTTGAATT
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ATTGTTCTTGTGCATCTATGATATCTGTTTTTTATGATGCTCTTTTGCAT
CATTTCTGTTGTGTAGCTTCTAAAGCACCATCCTGGACACATGCAAGGAT
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CTGTCTACAGTGGTTTTTAACTTTTTGAGCCGTATAGATTCTCATAGTTA
TTCTATTGGACTCGCTACGTGACAATTTATCAATCTTAACGGGGATGAGT
GTGGTGTGCACTTGTTAAATTCAATCTTCTTCCACTTCCACATATTACCA
CTTCTTGCTTCCACTTGTCAGATGGGCTGGGAAATTTTCTGGCAAAGTGC
ATAAGTTGATAACATTTGTACTCTAAATCAAGGATGGGGGATTGCTATGT
TACATAAAATTAACTGCACGGAAGTGTGGTTAGAAGATATTGTTTTAAAT
ATAACATTTTTTACCTCTACTTGTAGGATGAATGAATAGTGGAAATTAGA
AACGGAAGTGTACAAAAAGAATATTTTTTATCCTAATCCCTTGTCCCTTT
TGTTTTACCATGCATTCGTAATTGTTTAATCTGCTCTATCCTCTTCCCAG
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ATTGCAGTTGCAAGAAGAAGTATCCGAAGGACGGTTCCTTATTGAATATG
TTGGAGAGGTACTAGTTCAGCCATTCCTACGTCCTCTATTTTCCCTTCCT
TTCTTCACTTGGTGGTGATCTGTCATATGGGATGGGTTCATGACTGCATG
TGTGGTGTTGCTATATTCCTTCTGGTTGTAGTGGTACTTTCCCAAATGAG
TAGGTTTCTGGTTTTGCTGATACCATGGTTGCGCTGATCCCTCAAAAGCG
TTCTTTTTTGTGTATGTGTTGCTAATACCCTATTTTTATAGACTTAATTG
GGTTAGCTTTGTGCTATTTGTAATGTTTAGGCTCCTGTTGAGTTACAGAA
TTTTGATCTACTTCTGAATTAAGCAGCAACAAAAATTGTATTCTGTTCAT
TTTTCTACCACACATTTGATTCTATCAAAGGGAGAATAATTCAGAATTGT
CAATAATTTCATGCTACCAACATACAAATCTGTATATGCTTATGTGCTTA
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TCCATCACACAAACAACTCCCCACTTCTAGCCAAATATACAACTGACTGG
GATACAAATCTTCCTGCTTTTCTGTTCGTTTTAAAGATCCGAAAATATGG
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CGGCTTATGAATCCCGCCAAAGGTATTATGCTTCTAAGGGCCAGAAGCAT
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CTCATGACAGTTTACCCACCAACTATCTTATCTATTGTAAAGATGTTAGC
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TATCCTTCTCCCTGCCTTTAATAAATGATATCACACATAAGTATCCAATC
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AAAAGGTGAAACTTATGTTTATTTGCTTTTCATGTTTGCATTGTTGCCCC
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AACGTGAGTTTACTAAAATATTTTGACTTGTTTCTGTGAATATAGTGGAT
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AGGTAACGTTATCATCTAGAAACTTAGCATTTTTTTAACGTTATAAACTT
AACTGTTTACTATTAATGACGGTTTGTCCATAAGGGAATGGTAATTTATC
TGTTTATAACGTATAAGTAGTGCAAACCAAAGGTCCTCTTATGCATTATC
AGAGTTTTGTCCTGTATTCGCCTATATCTACATGCTGCGTGTCAGTGATA
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TGTATCTGGTGCTGCTCCTCAAAAATGTTTTTGTGGCACTGCCAAATGCC
GGGGTTACATTGGCGGAGACATATCAGGGTCTGGTATCATTGCCCAAGAT
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TTGAGCATGAAACTTACATCCAAGGAGAAGACTCCAATAATTGCCCACCT
GCAACCCCAGATTTGGAACCTCACCAACAAACTTCGCCTATCTTATCTGA
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TTACTTGGACTGAATATTTTACCATGGCGTTATGGTGACTTGTAATTAGT
ATGTTAATAAATTGAAAACAGCATACTCTCTCTGTTTCACTGTATCTGTT
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GCTATTCCACTGCACATATACTATACCAACTTTAGTACATGCATAGATTC
ATATGCATTACAGCACTTCAGTATGGAGCGAATTTTGTTCAGCACTTTCA
GTAGCCTCATAGGTGCAGATGTGCAGTAGACCAAATGCCCCTTTGCATGG
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TGCATGGACAGATACTTCCTCTATCTTAATTTATATACATGCAGCACTCT
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CCCTTTCATACATCATGAAACATATTTTCACATGGTATCTATATAATATA
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GCAAAGCATAGCTTGAACTTGAAAGGCTCTATATAGTGCAGATATTAGTT
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CAGCGGATGATGATGATGATGCTGGGAAAACCTCTAAAAGGTTTGATTAG
CAATTTCCAGTTGGCATGCCTAACCGGTTGGGCTCTAAATGTGTTACTCT
TTTATCCCTTTCAGTATAAGGGATCTTGCATTGATTCTTGAAGCACTCCT
ACAAACAAAATCAGGAACCGTCCTCTTAGATATCATCAACATGAATGGTA
TATTCCTCGCCTTTCAGCAACTTTCACTATGAAATATAATCTTTTATAAC
TAAACTGTTTTTTATGTTTTATGACAGGATTGCAAATGCTTCATAATATA
TTGAAGCAGAATAGAGACCACTTCCTTCGAAGACCTATAATTCGGAAGCT
TCTGAAGGTTTGACACTGGTTTGATTTTATCAATAACTATAATCACTGCT
GTATGGTTTCAACGAAAATCACCATTCTATGGTTTTCGGTTGATATATTC
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AATGAGGGTCCTCGATCTGAAGGAATGGAAAGGTTAGATTGCTCAAATTT
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TGCCCCCCTGTCTATTTTTTAGGCTCATGTTGTATGTTCTTTTTTGCTTT
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AGCTGGTGGATAACGTGCCAGAGAAAATTCCGAGTTGCCTTATTTTTCAC
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TATTGTTGCAGCTTCAGGGACTCGATGTTGAAGTTGATCTGGCATAAAGA
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GGATATGCATTTGTGTGTTGTCTATTTGTTAGAATGCATAGCTGATTCAT
GGACTAATGCATGAAAGATGGTTAATTTGCTGGTGTAATTTACATATGGA
ATGAATAAATAGATAATCCAGGTGGGAAATCCCACTGTAAAAGAATAGCG
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CTAATGTTTACCAGTCTCTGTCTTAGCTTAGCGATTTCTCGAATAAAAAG
TCCCGGTCTTAAATCTTTGCTGGCTAAAAGTGGCTATTTGCCAGTTCTCA
GTATTTATTATTTTCTCTTGCCCAACCCTGTTCACATTCAGTTTAGGTTT
TCAAATAAGAAATAAGAATTTCGTTACTCTGCATGCATATGCTATGTAGT
TCATGAATAGCTGTTGATTTATCCAATTTTCCCAATATGTAAAGTGACCT
GCTTAACTTTTTTGTTAACTTTTAACAGGTTCATCCGATTGCTCGAAAAT
TCTGTGATAAATGGATCCATCCTTATATGGATGGACTCGCAAACTGTTCT
ACACATTCATATTCCTCTAGAAGAAAGCGCAAGAGCCGTTGGGATTATCA
ACCAGAAAGCCACTATAAAATGGTTGGGTTACAAACTGCGAAAGTTCATT
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AAGATCAACAGATGGTGCAGATGATGATGTGCCTCCAGGGTTTGAGCCTC
AACGGGAACGTCAGCCTGCACAGGCTTCTTTAGACTGTGGGGTTGCTCCG
GGATTTTGCCAGGGGAAGTATTTGCCAAACTTGAGTATTTCATATGGAAT
TCCAATCGCAATTGTTCAGCACTTCGGAACTCCAGAAGTTGAAGGAACCC
AGTGTGGCAAGAAATGGAAAGTCGCACCTGGTGTGCCTTTTAATCCTTTT
CCACCGTTGCCTCGAGGGAGTCCTTGTCCTTCCACTTCGTCAACTCAGAT
GTCTCGTCATCATGGAGCATCCACCATGAAACACGACAGTTCAGGATATC
GAGGAAGAGGCGTGGACAGAGGCGGAAGAGTACATAGGAATTGGCGGAAT
GAGGAAAGAACAAGATTTCCTTACGATAATCGAGGAAGGAGATTCCCAAA
CAACCATCATAGATTAGAAAGATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.