Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA033098

[Submit comment/correction]

Sequence
AA033098
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA033098
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GACACGTCTGCCCCCTCGCGTTTTATTTTGGGTTGACGACGCGTCGCCGA
GACAACGACGCGGGCAGTTCGACCCAGCCGCATCGTCCCCGCCGCCGCCG
CTCGTCTGTCCTGCATCCCCGCCGCCGCCGCTCATCCCAGCCGCCTTTCT
CCCATTCACATGCGGCCGACGCCACTCCGCCCAGCACCAGCAACGTCAAG
TCCCGTCCCGCATCGGCCATGATGACTCCCCAAACTTCCACCTCCTTCCT
TATCTCCTCCTACCGCCCGACGCTTTCTCCGGCCGGCAGCAGCCTGTCTT
TCTCACCGGTAAAGTTTCCTGCCTTTGTCCCGTTCCCAATCCTCACATGT
TCTTGGGTTTCTTGGTCTTTTTTGAGTTCCTCTGTATGCGATTGGCTGTA
GTAATTGAATTTCCAGTTGTACAACTATCTCTGTCTTCCAAACAGGTAAA
TAAGCCAAAAGTATTGCCGAGAAAGAGGAATATGGTGTAACCAAGTGTTT
TGGGTGATAAGAGTTTTTCCACCCAATCCCCTCGGGGAAATGCTATCGTA
TACTCAATGTTACACTCCTGCCAAACGAGGCCTTAGCTGTGACCAGCGTA
CCCTTCAAGAAACCATTGGACAACACCTCCTCGGCTGATCAAATTTAAGC
ATGCATTCAGCAAATGAACGGAAACAGTTTAGCACCATATCGACAGGATA
TAACACAATATATCAGCAAATGAATAGAAACAGTTTGGCAGCAACTGTGA
AGTACAGACAAGAATCTCTAATCTACATGCTTTTTTTTGTTCAGTTCTGT
AGCAGCAACAAACACATGGAACAGAGAACAAAAATAAGCTACAAACACAT
GGAATCTCTATTCGCAGATCCTGCAGATAAAAGATTTGAAGAATTTATAC
ATGGTCATACAAGATTACCTAGCTTGTACGTCAGGACGATCCATCCAAGC
CAGGAGCAAGAACCTACAGTAGGGGTCGGGGACGAGTAAGTGAAGGAGCA
CGTGGAGGCTAGGCCTTGAGGGTGTCGGGAGGAGCACGTCACGGTCGTGC
CACGGACGGTCGAAGTGCGACGGCGGCGGCCGGCCACGCCGGCGAGCTCA
CAGAGCCCTCGTGCTAGGGTTTCAGGAGATTGGCAGGGCCCCTCCGTTCC
ATGACTACGGGAGCGGGATTCAGGAGGGACGAAGGCCTGCCTCCGAGGAG
ATCCTCCGCCGCGATGGTGGACGTGGTGGTCGGCACCGCCGGGGAGCGCT
GCAGTGGTCGGGCCGCTGGGTTAACAGAGCTAGGAATCTTCAGACGTAAG
TTAGATGGGCACATGGGTAAAAAGGGAAAAGGTAAATCAATTAATTGGCA
AAAAAAAAATAAAGTTTCTAACAGAAGCAGACGGAGTGGCAAAACCCAAT
AACAGAGCAACCTTTCGATGGTATATGCCTAAAGAAAGAGCTTTTGATGG
TATAGACCTAAAGAGTGGATCTTTTAATGGTATAGACCCAATTTTCCCTT
TAATGTTTGGTCCATATTGGGTATTTTGCCAATGTACAATCAACTTTGCA
TAAATTATCTAAGGTTGATGAACTTTTGGGTAAATAACCAATTTTCCCCC
CCAAAAAAAAAGCTCCTTGCAGAGGCAGCACGCAAGATCTTGCCGCCCAC
CGCATGCGCCTGGCCACCGGCCGCTGCCGTTCCCCGGTTGTCGTCGCTGT
ATCCCTTTGATGCGCACGCCTTCACGTATCCGGCTGCGCTGCCTCGGCGT
CGGTGCCCTTACCATCGTCGTCTGATGAGTTAGGTGCCGAGCAAGATGTC
CAGCACGGTGGAGGTAGAACAGGCGGCGGTGGAGGGAGGAAAGAAGCCGA
CTTCGGAGGAGGAGAAGAACCTGGCGGTGGAGAAGGAGAAGTATTTGGCA
AGCGGACGGGACGGCATCGGCATCAACCTAGAGGGCATGGAGCAGGTCTG
ATCTCCCCCCTCATTGCAAAGAATCCTGCAATATCCTAACTGTCGAATCA
TTTCTGTGTCTATCTCTCTCTCCCCTCAAATTCAGTAAGAAGATTTGTTT
TCACATGGTCCGCACTGCAACATCTTGATCTGTGCTGCTGGCACAGTACT
GTATAACACTAATCTAACAGATGTGTATAAGATTTAGGGTCCCATAGTAC
CTTTGAAAACATGTTCGTCTCAACACCATGACAGTGATGATCCTAGAGCA
AACTAACGAGCCAGTCACATATAGTTAACTGATCCACCATATGCAGTGCA
GTAATAAACTGAGCATGTTAATCACATTCTGCAATCACCATATATACCAT
ATGCAGGTTCAGTCAGAATTTGTATGTGAACAGTGTAGTGGTAGTGGAGG
TTGCTGATGATGAGTAGTAGAGATCTGTAGCCGAGCTCCTAGGGTTATTA
GGATGATGGATGGATGAAATGGATGATAGTTAAAATAGACCTTGTGGTAT
CATTGGATCCTGGATCAGCTGCTTTTGTTTGGCTGCCTACCTATGTTTGT
TATGTTGAAAGAGAGGCCTTGATCTTTCATTATTCTGTACTACCATTTGA
TTCTAGTTCTGGTTCTGATGTTTCCATTCTACATCATATGGTTGAACCGT
TATTTTTCTTTTCATAGGGTTACTAGTCAGCTAAACAATTAATTCTGAAG
ACTAACACAAAACAAGATGCTAGCAGACTATCATGATGGCATGGCAAGCT
CATGTTCCTAGTACGTTCCATGCATTATTTCTAGGTGCATAGTCTTAGCA
GGGAGAAAGAGCTGAGTTTGATATATGAGCTATCATTGCTAAGTAGACTA
ATCGTACCAAGTAGAATTTTGGATGATCTACGAAGCTAATAATTAGCACT
TGGTCAAAGAATTTGTTGATTAAAGAAGCTGATGGTTACTTGGTTAGTTT
AGGTTGCATTTATGCAGCTACATTACTATGAGTTATTTATGTATCTGAAG
TTCAGGTTCTGAACATCTGTACCAGCTACTAATTCAGCTATTGACTACTG
GGGTATGTACACTGAAGTATATAAATTTTGTGAATCATTTTGTGTACTCC
CTCTATCCCGAAAAAGGTGTCGTATATATATTTTTAGATTTGCATGTATT
TATACACTTAAACGCATCTAGATATATGTATATTTAGACAAATATTTGAC
ATCCCTTTCGGTATGGAGACAGTACATAAGTTAGAGTATGTAATGCAAGC
TAGCTAGTGGACAGGGCTGATGTTAAGCTAGCTAGTGTAACAAGCTGTTT
ATCAAAGAAGATACGTATACAAGCTATACTAAGCTAGCTAGTGCGCATGG
TCCGTATTGTCCACTGGATTTCTGTGGGCAGCTGAATGCGATTACATGGA
CTCCATGGACAGCTAAATTTGTTTACACGGCTCAGTCAGTAGACACAACG
GACTCCGTCCACGCGTCTGTCTGCATCCTGAGTTGGGCGGCCGCCGGAGT
CGGCAGTACCCGAGAGAAGAGAGAGGGAAAGAGGGGAGGATGTTGATTCT
GATTCAAGGATTCTCTGGACTCTGGGGGGTGGGGGTGGGGGTGGGTGGGT
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGGGGGGGTGGGGCGACGTGTTGGT
GAGATATTCTCAGCTGTCCGATCTCTATCCGATCCAGCCTCGGCTACTTA
CAGAAAAGCCCGTAGGCCGTAGCCATGGGCCAGCGCCTCTCCACAAACCC
TACCTCCCTGAACCAGATCGACCGGCGCCGCTGGTGCCCAGACCAACCGT
CCCTTCCCGGAGTCACTCTCCGCCTGACATCCTGCTCTCCTCTCCCCGCA
ATCCTCCTCGTGAGACCGACCCCCTCTGCCACAGGCTGATTTGGTACGAT
TAAGATCACTAGCAATTTCTGCCAAATGCAGTTCTCTCATGGTAATGTCA
TTTATGCCGCACATGATACAGGACATGAATGAAGGTCGACCTCCTGTCGA
AAATGGTGGCGTACTATGGTCTGATGGGATGGACTTGCTCAAAGATGCGG
CAGAAAGAAAACATTTCCTCCCTACCGGACTTGAAGGGTACTCCTATCTT
GAATGTTATCTTTCCCTCTCTATTGATACCTCTTCTCGTGTCATGAACCT
GCTGGTCTCTGTCTAGAGGACGTCCCGGTCACCATGCAGAAAATTACTTT
ACCTTAAAGAAGCTGATTATTTTATAATTTATGATGCCCTGAATTCCCAG
CATTGACACACTTCTTGGAGGCGGACTGCGCAAAGGTCAGTTGACAGAAA
TAACTGGACAGTCGTCTTCTGGTAAAACACAGGTGAAAACATGATCGATC
TTTCTTAAGATACTCCCTCCGACCCATGTTAGTTGACTTAAATTTGTCTA
GATTCGGATGTATCTAGTACTAAAACATGTCTTGATACATCCGAATCTAG
AGAAATCCAAATCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTACTTAATATGCTTA
ATTGTGAATATAGTTGCCATGTAAAAACTGCAGAGCATAATGCATGTATA
AGCATGATGTTATTTACCCTGTGTACTGTCAACTGCAGGCCTGCCTATAT
TCTGCTTCACATGTTGCAGCCAGGCATATGGGTGCTGTTTTGTACTTGGA
TACTAGTAATTCATTCTCTCCTAGCCGAATTGCTCGTATTCTGGATGAAC
TTCCCGGCTCTTTGATCAAAGAGGTTAGTAGTAATGAAACAATGATCCAT
GCTCCTTGCCCTGCCCTGCCCTTACCTACCTATTGTCTTCAGGGGTCATA
TCTTTTTTTTCACTCGTGTGGTGTAAGAGGAATGACATTTGTGTTGGCAA
TCATTAGATTACCCTAAAAATTCTTAACCATTTGAGTTCTAAGAACCCGA
TTTTCAACTTGCAGCCAAAGGACGTGAGGCTTAAGAGGGTCATGAGCAGT
ATGATCTGTGAGTCTGTATTTGATATATTTGCTTTGTTTGAAGTACTAGA
TCAACTTGAGGTCTCACTGAATGACAAGGTTAGTATGAAGGGAACTAGGG
GAGTCTTCTGTCTCCCTTTTTATTGTCCTAAACACTCCTCTCACATCGCA
AGCTTAATAGGTAAACAATGGCGGTAACAAGATATGCCTGCTTATCATTG
ACTCTATATCATCTCTACTTGCTCCCATCATCGGCGGGAAGTATTCACAA
GGTTCTTGCATTGCCTTGTCTAATAGATTATTTTGTATCGTATATGATAC
ATCTTAGCACTTCAGCTATACTAGAACTAAATCAGGTGTTAAAGATCAAA
GTCCTGAGAGCCACATAATATGTATGATAATGTGTGTTACAAAATGTAGA
AAATTGGTGTAGCGATCAGATTCGGCAACATAGATTATTTACTGTCATTA
ACTTAAGCAATGCAGTGCAACTAATTGATAAATATGCAGCCTGATGTTGA
TAATTTGAGTTGATCATAATTCACTGCGCCTTTGTCGATGATTTGAGCTC
CTGGATAGATTATTTTCTGACATGATTGCTTGCTTGCTGAGAGGGGCATC
AATCATTCTTGAACTGTAGCCTGAATTAATAAAATATCACTTCTTTTGTC
TGAACATGTATTAATAACCTGGCAGGGAGGTCGATGATGATATCAGTGGC
AATGATTCTTAAGAAGTTGGCAGATAAGCATAATCTATCTGTTCTGGTAA
TTCCGCCTGCTCTAACTTGATTGGTTGCCATTCATGGCATGTAAAGTGTA
TGCTTTGGATTTGAGCATAGTGTTACTGCCTTTCTGAAAATATTGTTCTG
ATCTTTGGAGTGAACGCATGGATTTAATGTGCTTATCACTTGGTCTCAAA
TGAAGCATCTATATGGCATTTAGTTGTGAAAGCCACCCAGATTTCAGTGT
CACACTGAATGTTCTGGGGAAAATCGAGGGAATGTTCGATGTTCAAATTT
TGTTTAGTGAGCACAGCCCTAGTCGACCCTTAAGTGGATGCACCAGCCTC
TTTTTATGAATACTTTTCATCGTAATAACCAATTTATTGTGTATACATCA
TTGACCAGTTCCCAGCATTTACTAATTCAGCATGCCATCTTTTTTATAAA
TAGATGTGCCATGCATTTGGAGTATTCCCATGGGTTAATTTGTTCTGGTT
TCAGTTTGTTAGAGAGTAGTTTGTTGTAAAATGTTGAGTAGGGTGTATTT
GTCCATGTGCACATCCAGTTTTAGAGTAAACTGTAGTCCCTGAATTTACC
TGTCTGTCAGGTTCAGACCCTAGGGAGAGCCGTACTCGTTTGGAGCTACT
AGTAAAAGTCATGTAATTTTATCTTAGCAAAGAGCCTTGCACTTCTGCAT
CATGATTCAAGTCCCACGAAATATAAAAGAATCCACCTGGATGAAAAAAA
AACCTTAAATGGTTTCTAAGCACTACTTCTAATACAACTCTGCGATTCTG
CATCAAGGATTTCAAAAGGTGTTTTTTAATGGAAAACAAGGAACTTTCTA
AAAAATATTGAGACTAACTGCTAGATCTTATCTAGTAATCACATAGTATC
TCTTTTCTCTAGTTCTAGTATTCTCTGTATATAATCACGAGAGTAGGTGG
CCGCTGATGGGTACTTTTGTACAAATACCAAATTATTTTCCATTGCTTAA
GCAGTTTAAGTAATATCCAACTCACAGATCTACTGTATCCAAAATGCATG
ATCTTGAAGATGGAACTGCTATGGCACTTTGCAGGAATCCACAAGAAAAC
ATGTACAAAATATTTCTCTAGTTTCCCTCATTTCTAAGGTATTGTATCTG
CCTTAGAGTCTTGAATGTGAACTATTGATATACTCACAATCAAGGACATC
GGCTCAAACTTTGGTTTCTGACAGTTCATTAGACTATATGAACCTTCGGG
CAGTTGGACTGTTCGGTCAGCAATCGATTTCCTGCAGGCATTCACGAAAT
ATTAGGCCTAACTGTTAGATTTTTATAATTTCTGTCAGATGTGAAAAAAA
AATGCAGTTATCCAACCCATCCATCTACTAACCATTTTGTGTTGCCGTAG
GTAACAAATCATATGGTCGCTGGGAATGGAGCTCCTAAGCCTGCCCTTGG
TGAGAGCTGGAAAGCCGTTCCACATATTCGTTTGATGATCTCTCGTGATC
GTGGGAGCAATATCTGCACAGCAACGATATTGAAGCACACACTACTGGTA
TTTTAATTGCGGTTTGGTTATATTTTTAGATGTCATGGCCACACATTATT
GCTTCTCTTCACCGCTAAATTTCATGGATGATAAACATAGAGAAAATCTT
ATATACATGTGCTAGCTTAAGAAAAACGAAAAAGATGTTTGCAATTATCC
CATTGGATGCCTTGAAGATAAAATAGGCACATAAAATCAGTAGTAAGCAG
TTAACTAGTTCAAGGAATGCTTCTTCTTAGGTTGTATATCTGCTCTTAAA
AAAATGTCAACCTATCTGCATCACTCCTTCACTAAAATGCTCATCCGCAT
AGCTCACTGTTTTTGTGTCCGTAAAATGTTCTGGTACAAGAGGTAGTCCT
TCTCTATGTGTTCCCTCATCTGTTGATGACATAGATAGTCGCTACAACGT
GTTCTTTTGCACTTCCCTTTTGGGAGTAAATTGGTTGGCTTGATTAGTCA
GGCATGCTCATACTTGCTCTCTGGAGGTTTGCTGTTCCTATTTTGATTAC
AATATAGAACAGCATTTGAATATAGATTGGTGGAGCAAAGGCATGCTGCT
AACTGCTACGAGTAGTTTTTTATTTTCATTATTATATCATGATGATGCAA
GAGGATGCCTCATTTCCAGTGAAGGTAGCAAAACTAGAATTGCATTCTGT
TGGAGTGGAAAACATGCCTGCATTGGGAACTTTGTTTTTGTTCCCGTGAC
ATGATGCCTTGGGTTTCCTCTAGGTTCCTGACATTCTGTTGTTTTATTGC
AGGCTTCTGGCCGCCATATGAAGTTTGCGGTACCAGGCTGAAACGCTAAG
ACTAAGAGCACAACTAAAGGTTTCTTTGAATATACAGTATTTTCCTAAGA
CCAAACATCAGAGGAGTATATTATATACTACAAATAGGAAGACCTTATAC
TGTCTTGTCCTGTGTTGGTTCCCTAACAAGGGAAGCCTGCGTTGCTGCAT
ACCAGTACTGGATGCATGTAGTTTTCTGGTGTACGTAGCCATTGACG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.