Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA030641

[Submit comment/correction]

Sequence
AA030641
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA030641
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGCCCTCGGGCTAGTTGCCGGAAGCATGGGCGCATGGCGGGGTCGCGAG
CCCACGAGCGGCAACCCTTGTTCCACCTCCACTTCACTGACCCCCACCCG
GGATGCGGATACCCGTTTTTCTTCCGTCTCCGATTCGTTCGTTCGCTTCC
CACGCTTCCTGCCCACCTCCGCTCCTCTCCCCCTCTTCTCGGGTTCCGGT
CCTCCCGGATCCCACCTCGGGCATCGCGCGACGGAGTCCGCCGCCCGGCC
GATCGGCCGCCACAACCCCGGTGAGCGCACGTCCGCCCCTCCCTCCCGCC
CAGCTAGCTCACGGCGTGGCCTGGTTGTTTGACCGCGCGCGCATGTCATT
CGTCCACCGTTTTCGGGGGTTAGCCGTGACTACGACTTGTGCGCATTTCA
CCTGATGTTTTGGCGGAAATAGATCGCTCAACTGCTTCCTCGCGGGCAGG
GTGTGCAGCAGCCTCGATCCTTAGTTAATGACAGGCGTAGCGGATTTTAC
AGGTTTTGATCATTCAAAAATGAGTATGATGCGATTTAGTCTAGGGGCCA
TGGCGGATATTTCAAATCTAATGACTGGGATTGATGGATACGATTACACG
ATACAAGTAATAATGAGAGTATTATCTCTGAATAATAATAATAATAATAA
TAGTGTGAACTCAAGTGGGTAATGGAATTAATCAAACTCGTGTAGCTGTT
ACATATTTTTCAGTCAGATTGTTATATGGTTCATGAGTGTTTAGGATATC
CCCTGAAAAAGCTACTGCTGTTACGATTGTTTTCTCTTGATTTCCTTCTT
CCGGTCAAGTGATTGGAGGGGTGGTCGGGTCTGGTCGTTCATGATTTTAT
TCACATGGAAGGGATGATGGTGCATGTGAATGCTCACATGGAAGATATAA
AAGCTCTGCAATGACATCATGCTTGGCAAACGGGTGCCTTCAGTGGAGAG
TAGGCGTTTCTTATCTATCTATGTGCTGTCCCTATTGCAGAGTAAGCAAT
ATGATAGATCGGGATCTTATTAAGGGCAAATTGAACAGAAGTCTGGTTAC
ATGAGCATTCAGGCTGTGTTGTGGTCCTAGTTGCTGAAAAATGGACAGTT
CCTTTTTTGAGTAATAAAGCTCTCTTTCATCGCAATAAAATAAAATTGGA
GACATTGATGCCTTTATGGATTGTTATAGACCTAGTACGTTTTCAGGTTT
AACTACTGTATGTAAGTTAATTATGGCTGGTAACTCTTGTGGCAGTTTGA
CATTGCTGGTTTTGGACATAACCGAGTCATGAAAATTGCTGATTTTTGGA
GACCTGGAATAAGTTTCCGTATTTATTTAGGGATTTTTGAACTATCATTT
CTGTTATGCAACTTTTATGAAAAAAAACTGCTAGTTTTTTCTTCTTGCAT
GTCTTTGTATACTATATATGTGGCGATGCCCATAACTAGAGGTTGCCATG
TTCCAGGGTTCTTCCTGGAGAGTCATGACACTGCCACTCTTTTGAGTCAA
GGAAGCAGCAATCAAGAATGGCCTCGAGGGCAATCGTTAGGAGACGGAAG
TATTTTCTGGAGCATACTAATGCGCCTCTTTTGTTACATTCATCTAATGC
CATTTTTGGGCAAGGAACATTTGGATTTGATGTTGAGCACAGCACTGTAA
GCCATCTGTCGGAGCAGAACTCAGGAGATTCTAACCGTGAGAAGGTGCTA
TATACCTTAAGGAAGAGAGACCATTTGGGCCTTAGTAATGGATTCCTGTG
GCGCCCAACTCTTGGTGTTTCTCTTGCCTCATATGAATCTAAAGCACAGA
ATTTGGGATTCCCCTTGGGAGCCAGGTATTTACTGCAGTCAGTCCGCACA
GTATCAAAAGCAGCTGGGCAGCCTAAATCTGGTGTTCTGAATGAGCAGAG
TGGGGATCAGGAGCAGCAGAAAAAGGAGGCGTCTCCAGAAGAGTGTGATC
AGGCAGTGGAAGGCTTAAGCACTGCAAAAGCAAAGGCTAAAGCTAAGCAG
GTTCAGGAAGTTCAAAAAGCTGACCAATCAATCATACAGAAATTCTGGGC
AAGGCTTCTGGGTATTGGTCCTGCCCTACGTGTTGTTGCTTCAATGAGCA
GGTCTTTGTTCCCTTCTTTGAATTGAAGTATTTCTGCTGTATTGCTCTTT
TTCATGGATGGCTGTTTGTCTCGACGCTTTAGTTTATATTTTGTTTTGTG
GTTTTAAGAGCTGATTGGGCTGAGAAGTCGAAGCATTGGAAGGAAGAATT
CGTTTCTACACTGCAGCATTATTGGTTGGGCACTAAGCTACTGTGGACAG
ATGTTAGAATTTCATCAAGATTGTTGGTGAAACTTGCTGGTGGAAAGAGC
CTTACAAGGAGAGAGAGGCAACAGCTGACACGCACAACAGCAGACATGTT
AAGGCTGGTACCTTTTGCCGTGTTTATCATCATTCCGTTCATGGAGCTCT
TACTGCCAGTGTTCCTCAAGCTATTCCCAAACATGTTGCCATCTACTTTC
CAGGACAAGATGAAAGAGGAGGTAATAACCTATGACCTACCCCTTATCGT
CCTGCCAGCAAAATCTACACATAGATATACTCACGACTACATTTCATTTT
CCTACGTACAGGAGGCATTAAAAAGGAAACTGAAAGCAAGGATGGAATAT
GCAAAGTTCTTACAAGATACAGCAAAGGAAATGGCAAAAGAAGTTCAAAC
ATCACGTAATGGGGAAATGAAACAGACAGCCGAAGACCTGGATGATTTTT
TGAACAAGGTATTTGCTCAGTATTTTTTCTTAACTGAAAGTGTAGATTAA
TGGTACGCTGTATTAATGATTTTCGGTGATGCCCTCTTGGATACGTAACT
AGGTCAGGAAAGGTGGACATGTCTCCAATGAAGAAATTTTGAGCTTTGCA
AAGCTGTTTAATGATGAACTGACTCTGGATAACATGAACAGGTTGGTGTT
TCATTGAATATTTAATTAATCCTTAATTTTACCAGCTCACTATTTTTCCA
TTAAATTTTTCTGCAGATCACGGTTAGTAAACATGTGTAAATATATGGGG
ATTAAGCCTTTCGGTACAGATCACTACTTGAGATTCATGCTTCGGAAGAA
ATTACAAGAGTATGTCCTTAAATTGCTTCTGAATATAGATGTTAGAGTAA
GAAAATGGATACAATGGATGATGTAGAACATATCTTGCTTGTAATCTGTT
GTTCTTCAACATTTAAGCATGCTTTCATACTATACTTAATCACTACTAAT
GCAGGACTCCTACGTATTTAAAGATCAGCTAGTAACTCGAATTTGAGTTA
AAATGTTTTTCAGGATATCTAAAGGAAAATAACCCATTAGAATATTTGAC
GTGATTTGATAGTTCTATGACCTCTAAGAAACTCAGAATAATAGGCCCAG
AACAGAAACTACTTTAGTGTACTGTTACGTTTTTAAAGATCAGTTAGTTG
CTCAAACCCGACTTGAATTATTTTCGAGAAAGCCTGCCAAAAAAATATTC
CAGCTGAAAATTTGAGTGTTCTATTAGTTCTCAACTTCTCATGACATCAA
CAAAGATTTAGAATGATGGGTTCAGAACATAATAATGCTGTTGTTGCAAG
AGTCCCAAACCCCCTTGACGTTGCAGCTCAAGACAAATGTTTTTCCTTTT
TCAGATTGCTCATCCAAATTGTGCTAATGTACAATTTTGGTAATTAACTG
TTTACAATCTTTATGTGTCTATTCACAGCATTAAGAATGATGATACGATG
ATCCAGGCTGAGGGAGTGGAGTCTCTTTCTGACGAAGAACTCCGACACGC
TTGTCGCGAACGTGGCCACCTTGATTTATTGTCAATAGAGGAGATGCGCC
ATCAGGTTTGTATGTTTCAAAACTGTTGATGACGCATCTGTGGTATTGAA
AAGCACATCAGGTGATTATTATTGGAGGTGTATATGTTCTTGTATTGTCA
CTCTATTAGTTTAATTTTTGCCATTCATACCATATGCCCTTGCTATTTTT
GCAGTATTTTCTAAAATTAGTGTTCTGCATGGATTATGCCAGATATTTAC
AGCGTGCTAGCACAAATTTTGCAAATATCAAACTATTGTGAGATTTTGAA
CATTTCTTTCTATGTTCAGCTCGAAGACTGGTTGGATTTATCTCTTAATC
GTTCTATGCCATCATCTCTTCTGATTTTATCAAGGTAATTCTGGTGATAA
TTGACCTGCTGACTTGATGCCTATGTTCAAATTTTAACCTGTGTTGAAAA
ATCCTGTCAGAGCTTTTACTGTGTCTGGAAAAATGAAGGCTGAGGAGGCT
GTTGTTGCAACGTTATCTTCTCTGCCAGATGAAGTTGTGGATACAGTTGG
AACAGTGTTGCCTTCTGAAGATTCTGTTTCTGAAAGGAAGAGAAAATTAG
AATTCCTTGAGATGCAGGAAGAACTTATCAAGGTACACTAATGTATTATA
AATAATCTGTCTTGGGTGTCTTCTGTGTAGGTCTTCTAGACACAGATCTC
CTCTTATTTTCACATTATTGATTGTATCAGCAATCGCCCAGCTGCAATAA
AGTATATGCCACATTCTTAGTTTGAACGTTCTTCTCAAATTAGATATGAG
AAGGTGAACTAAATTTTAGAATGGTAATCCATATCATACTAGTATACATT
GTTTTTCCCAAACAATTTTCTTTTGAAATACAGAAATGTGAAATCGCCTG
TACAAGGATCATATTTTGCTCTTCATAGCTCGTTTGTTTGCTTGAACTTT
TGTCACTAATTGTACTGGAACTGAAGATTAGTAAATTATAGTTGTTTTAA
AAATTTAAGTAGGAAGGTTACATAATTATATATGTTTACCTATGCAGCTC
TGTGCACTATCCGGCTGAAGAAACAGCGATCTTACATATGTTTTTCTCAG
TGCCACTGTTTTATGTTTCAACTATGTGCAGCGATAAATTGTTATTAATG
TGTATGTTCTGCTTATCAGGAGGAGGAGAAAAAGCAAGGAAAAGAAGAAA
AGGCAAAGCTAGACGAACCACAGGCTACCGAAGAAGATTTGGCTTTAAAG
GAAATGACTGAGCCAACTTCTAGGGAAGAAGAGGAGCTAAAGAAATCGAA
AGAACATGAGAAGAAGGAAAACCTTTGTGATATCAGTCAAGCATTGGCTG
TGCTCGCATCTACTTCTGTATGATCCTTCTTTATTTTTGTGTTAATAATC
TTATCCTTCATTTCATGAAAATTTGCATTAGCACTCAGTTGGGCCTGTTC
AATTTGCATCTTACCTTGCAGTCTGTTACGAACGAGCGCCAAGAGTTTCT
TAGTCTTGTCAATAAGGAGGTATATGAGTTGCAGTTGGACTGGAACTTTT
CTGATCTACCAGTTTGCATTAGGTAATATTGGAACGCCGAATGCAGATTG
AACTATATAATACCATGCTGGAAAAGGAGGGCACAGAGGATGAAGAAGAG
GCTAGGAGAGCATATAGGGTGGCCAGGGAGGAATCGGACCATGCCGCGGA
GGTGGTTGCAGGAGAAAAGGTTTCCTCAGCGTTGATAGAAAAGGTAAGTA
ATACTTTTTTCTGTGTCTAAATATTCATCTATTAATCTGTCTCTGCTACT
TCTACTAAACTGAATTTCAATATAAATGTGTGTTGGTTTCTTAAACATAC
ATCTTAGTCCTGAAAACAGTTGACTGCCTTACTTGATGTTACTGTTGAAG
TTTGGACTTTTGGTTCTCCTAGTTGGTGTGTGGAACTTAATATGGTGTCA
GAGCAGAGGTCTTGGGTTCAAGTCTTGGCTTTCGCAATTTTAAAAATATT
TGCTTGCCCTCTTTTTGTCCATTTATACTAGGTTTTATCGAGTCACACAT
CAGCCATAAGAAATTTTGTCTCAAATTACAAAATTAATCATTGATGTTTT
ATACTCCCTCCGTCTCAAAATAGATGTCTCAGGTTTGTCAAAATTTGGAT
GAATCTGCAACATCTATTTTGAGACGGAGGGAGTACTAAACTGAGATAAT
AAATGGTCTTCTTGCTGCCAGAAAGAAGTTATTGGTACTCGCAAACCATA
TTACCAGAAAACTAAAGGCTATAAAAGAGCGACATGTGTGGACTTCGTAT
TTTGCTTTGTCGGGGAAGAGCTAAATATTAGATATACTAGTGATCGCTAC
CTTCACCTTTCTTGTTTGCACATTCTGACCTCGCACCAAATGGCCAGGAG
CTATCATACGAAACATCATAAGAAGTTAAGAACTGTTTTAACCTAATTTC
GAGTTTTCGACGATGTCTATTGTGCTGGATCTACATAACTGTTGTAGTAT
TCTTAAATCAGTTACTCAAATCGCACCAACCCACTATTTCATTTTCGGCT
GGATATCACATTACCTATATTTAACTGGGTCATTTGCTGTTGATTTTTAT
CTGTAACTCTGTATTCACTAGCTCCTACTCCCTCCGTTTTAAAATATAGA
GTAAATTCCATATTTTACCCCCTAGTTTACCATTTGTGACACTAATTACC
CAATTTAGCAGTAATTTATTCAGCTTACCCCATTTAGCGAAAGTTGTGCC
AATTTTTACCCCTTCTAGTTTTTTAACCTATTCTGTTAGGATTGACCCAG
TAACCATGTCCATGTGGTGTGCCACAATGTAAGTGTGATCTTGCCAGGTG
ATTTTTTATTTAGCGACATCACGTCAAGCTGATGGATTCCCTCCTTGGTC
TCACGACCTGTACAAAGCTAGCTAACTGATTGGTTCTTTGGATAAGCTAG
CTAGATAGTCTGATCAATTTTGTGGTGGAATTAAGCTCGCCCTGCATAGC
GCACAGACCAGTACTCACCAATGTCGTCGTCGCCGACTCGCCGTGTACGT
TGTTGGATTGACTGAGAATGAGAGAATTAAAGGCATGGATGCTAGCTAAA
TTGGGATGTAATTGGATTGATATACCACCAACAAAAGTACGTTGCGCTTG
TTGCTACAATTCCCTCAGCTGCCACACACAAACTCTGGATCCACTGCCAA
ACATGTAGTTCTTGATGTCATTGCCGCTGGTCAGGCATGATACCAGCGCG
CTCGCTCTGTCCGGCGGACAAGCCCAGAACCTCACTGGCAGGCATTTCTC
GGCGGTGCAATGCTGTCTTCTGCAAGAGGAACGGCTGCTACATTCTCACA
TGATACCTTAGTATCCAAATCTGATAAAACAGGGAAGTAGAATAATAGAA
GGGGTAAAAACGGGCACAACTTTCGTTAAATGGGGTAAAAGGGATGAATA
ATTGGTAAATAGGGTAATTACTGTCAGAAATGTCAAACTTGGGGGTAAAA
AGTGGAATTTACTCTAAAATATAAGATGTTTTACCCTTTTTTTGAAATGA
ATGTATCTAGACGCCTTTTGATGTATAGGTTCAGAGTAAAATGAGTGAAC
CTACACGCTAAAACTAGATACACATGTTTCAGAAAAAGGCTAAAACATCT
TATATTTTGGAACATGGGAAGAGCTTCTATGTCTACTAATGAGGGTATGC
ACTCTGCAGTATTCTCTTGCGTTTGCACGACTTTATTCCCTATCTACTAA
TTTAAAGATTTTTCTTGATAAATACGAAATCTCTCTTGTTCTTCTTTTGA
TGAAAACAGAGCCCTGCTAAAGATAGGTTAAATATAGTCCAAATAAAAAG
GGATACTGAGAGAACAAAAGACAAGAAAACTAACCGATATGCTTAAACAA
TGTATTAGACAAACCATGCAACCAAAGGCATGAAACATGTGTTTCTGGGC
TCTAATCTTTGAAGCCTCTCTCGTTACTTCAGACGTGATATTTGTGCATC
TCTATTGTCACTTCTTTCTCGTGAATCGCTTAGGGGCTACTGTTGACACT
CTGTTTTGCTGCATTTTCAGGTTGATGCTATGCTTCAGAAATTAGAAAAG
GAGATTGATGCTGTTGATGCACGAATAGGCAACCGCTGGCAGCTGCTTGA
TAGGTACTCCCTCCGTTTCATAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAATGA
AATGTATCTAGACTACTTTTAGTGTATAGGTTCGGAGTGAATCTCTATGA
ACCTATATACTAAAAGTTGTCTAGATACATTTTCTTTACAAAGCTAAAAC
GTCTTATATTTTAAAACGGAGGGAGTATATGCTCTTTAAATGTGCATAAG
GGTGCAATGAGTCACTTAGTACTAGCATGTTTGGGTGCTACTTGCCAGTG
AATTTCTAGACACGTGTCTGGCGAGTCCAAGCTAGGACATATCTTACCAG
CTTAGCTTAGCTCTATCAGAATCGAGTTCAGAACTTGAGATGCCTACTTA
GCCAGAACTTGAGATCGTCTGGTTGCAGGGACCGTGATGGCAAAGTAACT
CCTGAAGAGGTAGCAGCAGCTGCAGACTATCTCAGAGACACCATGGGGAA
GGAGGAAGGTATCCAAGAGCTTATCAGCAATCTTTCCAGAGACAGAGGTT
CGACCCTGACACATGTACCAACTGCACTAACTGATCACAGCACATCTTCC
CTGCTCCTATGTTTCTAACATTTTCTCCGCGCCTACTACGCCTAACAGAA
GGGAAGATCCTCGTGGAAGACATCAAGAAGTTGGCATCGCAGACGGAGGA
AAGCAGCAATGAACAGGAAGAGACGACGCAAAAATAGGTAGAAGAACAAC
CGCCATCTCGCACCTGTTATACTACATCAGCAGTCCATTCTTTTCCCAGT
TTTAGTTCGTGTGGATCTCGCGTTTTGAGGCAGGGCGGTCATATTTTTTG
TTGCGGCCGGCTGCCTGCCGTGGATCATTATCATAAAAGTCGCTGTGGCG
ACATTGCGTATAGTTTAGTCCCTCCCTGATGATGCCGATCATTAGTCAGC
TGACCGCCTGAACGGCAACTGAAATTTTTCAACTTTCTGCCGTTTAAATG
TACCTGCTGATTGGACGAATGGGTTAATAAATCCATGTCCGGCCCGAATA
ATAATCTGAATAAAGGTACATGTGGTGAACAAGTGTCTGGCTTAGTTTAC
G

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.