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GrainGenes Sequence Report: AA022196

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Sequence
AA022196
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA022196
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAAAACCCTGACGATTCTCAGAAAAAGGAAAACCCGACCAAACAGAGAAC
AGAAACCAGGAAACAACCCGCAGGCGCAGCTCCACCACCTCTCCCTCTCT
CCTCTCCGATCCACCCGCTCCCCTCTCTTCTCCGACAGCTGCTCGCCGCA
CTCAAGCATGGCGGCCGACCTCTCCGCGGCCGCGGCGTCCGCGGACCCCG
ATGGCCCGGACGCTGTCCGCTTCACATGGAACGCCTGGCCGCGGTCCAAG
GTTGAGGCCAGCCGCTGCGTTGTCCCGCTCGCCGCCTCCGTCTGCCCTGT
TCGCTCCCCCGAGTCCCTGGCCTCGCCGCCCCTTCCTTACCCACCGCTCC
GATGCAAGCCGCCTTGCTCCGCGGTCCTCAATCCCTTCGCCCGTGTCGAC
TACGCCGCCAAGATCTGGATCTGCCCGCTTTGCTTCTCCCGCAACCACTT
CCCTCCGCACTACGCCGGCATATCCGAGAACAACGTGCCCGCCGAGCTAT
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CGAGGAGGAACTGGAGTACGTAAAGTTGTCCATGCGGAAGGCGGTCGCGC
TTCTGCCGGAGCACGCACTTGTCGGCCTGGTGACCTTCGGGACGCAGGTG
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CGCACTACTTGGTGGGCCATGCACTGAAGGTCCTGGAGTGGTAAAGATTC
TTGCATCTCCTAAATGCTATTACATGATTCATCACGTATTTTAGAGTTAG
GTGTTAGCAATTTTGAAATTTCAGCTTCATGGGAGGTATAATTTTGTCTG
TGGGGACTAAAAGCCTCAAGAACTATTAAAAACATGGGTCTTAAGTATAT
TTGAGATGGCGCACTAGACGTTGTTCTGTTATTTTTTTGAAGGATTCTGT
TAATTATTTGGATAATCTTTTCCTGAAAAATGCATAACAGAGACCAATAA
ATTTTTCGTACTCTAAATGTAATAGTCACTGATGTCAGCATTACTAGACC
GCCAAGGCAAATCTTTACCCTTTTAATGATGACACAAATGATGACAGTAG
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TGCATCTTTCAGCATACTCATACTGTTGATTGTTTTCAATGATATTTCTT
CTTTATACATAAAACTACTTTTGTCTTGAAATATTACTCCAATGAACAAT
GCAGATTGTATCAAAAGATTTATCAGAGCCTGTTAGATCACATAAGGATC
TTGATAAGGATGCAGCTCCTCATTTCCAGAAAGCTGTCAAATTTTACGAT
GGCCTTGCTAAGCAATTGGTCAGTCAGGGTCATGTTCTAGATGTTTTTGC
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TGCTTGTGTTGAGGATTATATCATGCTCAATAGACTTAAAACTGCAAAAA
TACTATTCACTTTATAGTGTTCGCTGAAAGACTGCAGCTTTTGAGCTGTG
TTTTCATTCATAGATCTGTATATACTGCCAGTCCCCCCTTATTGAAGCCT
TTAATCAAATGGTTGACTGAAATCTCGTAGGATTAAGTTATGATACTATT
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ACCTTATGCTCTACAGAGCGACAATGGCGACGTTGCAGCTCCTTTCCCTC
CTTGCCTTCTCTCTATGCATGGTCAACGTTCAAAAAAGCGCTAAGTGCTA
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CATATAAGCTCCAATCTTCCTTCAATATTGGCCCAGTAAGGCCCATATGA
AACCTTAGCTTGCCCAGCTCAATCTGAACCATCTATATTGTCCAATCTTC
ACCGTGCATCTACTCTCTTCTATCTCGTTCTCTCACCTGCTTCCTTCCAG
GCACGCGTTGACAGATGCAATGGCCTTGCTGCAGCTCCTCTCTTCCATGG
ATTCTCTGCCTCCGCCCCTCCCGCCCTGCCTTCTCCCCCTCCTTCCCTGC
AACCACCCTTCCTTCCTGCTATGTTTCCTCTACCAGAATCTAGCACCAGC
ACGACCAGATTCCCTGTCCTGCTTAATTGAGCGCTCAGACCAGAAGCGAA
GCAGAAGGCTGTCGCTCAGTGCTTAAGCGCGCCTAGGCATACTTTTTTTT
GAACGTTGCGCACGGTACGGAGGCACGCCTAAGAGAGTGCCTTACACCAC
CTTTTGGAACCATGGACATTTCATTTTTTTTCATGAATAGAAGGTTAAAC
CATGAGTTCTGTGGAAGACCTTGGATCCTTAGTTCTAACTTGTAATCTTG
TACGCACCATGCATGTCTCGACTCATAATTAGCTGATACGAAGTGTTAGG
CACCATAAATACAGTTTGATTGAGGAATAGTTATAGTAATAAGTTGTGAT
AATAATTGTTAGATGCCATAATTAGGGGTGTTGTTGGTGTGCTCAACAGT
AGATGAATCAGGCTTGTTAGGTCCATTTGGTTTGATGGTTGTGATGTTTT
GGACCTGCCGGTGCTTTGTATATTGCTGGAGATTGATTTAAAAGTTTATT
TAGGGTCAAGTTAGCAGGATATATTGGAGGTAAAAGGAATGAGTATATCT
TCTGGTCACTGACAGACTTTTGAAGTAATACTCTCATTGTTGTCGATTCT
TTTCCTTCTCCGTTTGCCATGGTCTGGTCAGATTTTCTTGAAGAACTTCA
GCGAGTACCCAATCGCAATCAGTAGTTCAGTACTAATGACAATCATTACC
CAGTCTTTGCTACTATGTACTTCTCTGTTCTTATCTGCTCTCTGTAGCCA
TCTCTTATAATAGGCATTTTCTTGTTCATCTTTCACTACAGTTTCATCAA
TGAACAGAAATAATATACCCTTTCCGTGTTTCATTAATCTTATTCTAGTT
GAATGCCTGTACTACAAACTATAACATACATGCTTGCTGCTCCAAGGAGA
AAAATTCACTGTAGTTCTTTGCGGAAGATCATTGTAATGTGAAAAGTCAC
ATGTCATAATTTCTGAAAAGATCCACTATTTGTTGATTAGGAGATGTTAA
TACTATGAAATCACATTATATGAGTATCCACAATGACTTGTATCTAAAGT
TGCCTTTAAAATCCTCCAATTGCGCTTGTTGATTTACTGATTTACCATTA
GCAGTAAATTCACTCCAGTTTCTCTTAACCGCTATATTTCCGAACAGCCG
ATTGTATTCCGCAAATGAACTGAACATGTGTTCATCATCCTTTTTTGATG
TTTGGAACACCAAAACAGGTTGGACTAGCTGAGATGAAGCTTGCCATTGA
GAGAACAGGTGGCCTTGTTGTCTTATCTGAGAGTTTTGGGCATTCTGTGT
TTAAGGATTCTTTTAAACGTATTTTTGAGGGGGGTGAACATTCTTTAGGC
CTCTCATCCAAGTAAGTTTACTGTCTATTATTTCCTTTCTTCATTATCTA
ATACATTTTCATCTGTAGATGGTATGTCTAGGTAGATCTGTATATCTGTT
TAGTCGGTAGTCTTGAACTCAGATCATTTCATCACCTAATGTGGTTTGTT
GTTTTGTCTGTTGTGCTGGCCATCACAAAATAAACATCCACCAGGTCGAT
GTCATTCTGTGGCTCTTCCCACTTAAGTCAGCAAAATTGTTCTTTTAAAA
TAATTTAATCTCTAAACAAGTTGTCTCTGATCCTGCTACACAATGGGTAA
TGATCATTAGCAACCATCCCACGGTTGGTGGTTGTGGTGCTAATGAGTAA
CGACTGAATACATGAACCAATAGCAGTGGCAAGGCAGTAAAGGGGTGGTA
ACAGGTAAGTACCAGTAAAGGGTGAGCTTCAAACGGATGTATCTTGCTAT
CTCTTCCACGGCCACTGCTCGCTTCCTTTCATGGAGTACATCCATGTTGA
CCGCATCTCTTCGAAACTGGTGGCCTTGGTCATGTTTCGGTGGCAAATAC
AATTGCTGCATCAATAGCGTATCCTCCTCTGACTTAATTATTGCGCCACC
AGGAGAGAACTTCTGTGCCCTTGCCTGCCTCTTCTTAATCTTGTTATGGC
AAGGATGATGGCTCATGGCCTCTCAAGAAGCCATGAGCTCATGTTACTTG
GAAACAGCCTTCGATGCCAGTGAGATGGATTAGTAGAGGACATGACCTGG
AGTGCCATCAGGGGCAGCAAGCTGTGACCTGAACTTGATGTGTGGTTTCA
GATGGTGGCATCCAGAAGCAATTGATGTTGTGATCGGAAGCCTTGGGACT
TAGGAGTGGCAATCGTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTATCACCACGAAATGT
CCATGTCATCACCATGGAGATGATGCCAGTTGCTCATGCGCCTAACTACC
ACTTGAAAGTCGGAATATTGTCTGAAAAGTTTTTTCCTTTTGCTTGCATA
GAGTCTGAAAAGTTTTTTCCTTTTGCTTGCATAGAGTCTGAAAAGTTTCT
TCTGGATTTAGTAACCTCTTTGGAGGTGGTCTTTTCTTACTGAGAGTTTC
AGATAGCTAGTAGAGGTTGTGCATGGATATGTGGTCTTTCTCCTTATAAC
AGCGATTCAGCGAAGGAGTTGCAAACATGTACTGATTCTTACCTTTTTTC
CTTTGAAGTGGCACACTTGAAATAAACTGTTCGAAGGACATTAAAGTTCA
GGGTGTTATTGGACCATGTACATCGTTGGAGAAGGTAGGCCTATCTTCAT
ACACTCATTTCTGCTAAGATCTCTTGCTCGTAAAAATACTAACTTGAAGA
CTTGGCTGGGCGTTTGCAACATGGAAACTGCAGAAAGGAGGTCTATGTGC
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CGCTCCAGCCAACCGGGACACCAAAATCCCGATTTATATATACAATTTGT
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TACTAAGTGTGCTGATTCTCTTGCAGTTACCAACACCCAGAAGGTCAAAT
AAGGACAAGAGTTAGTACTGTATCCAGAAAATGGGTGGATGGTTCTACCA
ATACAGAGGTTGGCCTAAAAAATTCTCGTTTTGTATGCTGTGCTGTTGAG
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TCGCAAATTTATCAAAATTTGGATGAATCTATATACTGAACTCTTGTCTA
GATGCATTCGAATTTAGACTGTGACATTCTTTTCAGGACGGAGGGAGTAT
ATGTTTATAAGTAAGCATGTGCAGTGTGGGATCGATTGGCTACAATTGAA
TGTCTTTTACTGGCTAAAGCTGTCCAATCAATGTGAACTGTCTTTGAGAG
AGAACAAGACTGTAGTGCTCTCACTGTTTATAGTACATCTAAAATAATGA
GTTTTTTCCCTTGAGTAAAAAGTTCTTCACAGGATTAAGTAGAAAGAATT
ATCAAATATCAATTCCTAAGTGTTCTTTACAGGATATTACATTTCATTTG
ATAACTTGCACTTTTGACTTGACATTTTTACATATTTCCTTTAATACAGG
AACTAGTCGAAGGATTTGACCAGGAAACTGCAGCTGTTGTGTTGGCAAGA
TACATCTCCTTGAAAATGGAAATAGAGGTAACTCTTGATAACTGCAGTTA
TCATGACTGCAAACACTGTTTGTCATACCTTTAGTACTTACCGTTAATTC
CATTCAATACTTATGTAAATCAAATCTGGAGGTCGTGATACAGTGGCTAC
TTTATTTGTTCTATTTACTTAAGTCATGAAAACTTTGTCAGACTTATTTT
ATATCGGCCTGCTGTACATATTAATTAAGTTGCAACTAGGTTTAACGCAT
GTGTTTCCATATTCATGAGAAAACAAATAAATCATTTACTTCTGTATACT
GTGTCTCCTCTTACGCATGTGTTTCCATATGTAGTCAATGCATACTTCCA
TTGTTGATCTCCTTCAGTTCTTGTGTTGATTGATGACTTCTGTGCTGTGC
GCACTGTGTTTTTAATTAAGCAGGTGAACACCGTAGTCTATATTTGTTTC
TAGAGAGAATTCCTTATTTGACACTAGTTTCAAATATGATTCCTTATCTG
ACACTGAAATTTTTTCAGTTCCTTATTTGACACCCATTGTAAATTTTTTA
CCTTATATGACACTACTGTGAGTTCCGTTACATCCTTCCGTCAACTTTTT
CCATATGGACTAAAATACCCCTGGTTATTCCCTACCTAGCCAACCTGGCC
TGATCTCGTGGGCAAAAAAGGCTCTGCCTGATTTTTGGGTCTCAGGAAAT
CAGAAGACGTCTTGTCTGTTTGGCGGCCGGAGCTGTGCACTGGAAACTGT
GCACACTGATGAGAGCTTTGCTTTCCGTCAGATCAATTTGTAGGACTAGG
AAGAGCACCAGCAGTCGTGGACAAGCTGTTGCCATTGCTGGCGCGCCATG
GCTTCATGCATGTTGCTCTATCTCCTGGTGTCCTGTTCTCTTAAGCGAAG
TCAAAGAGAGGTTGGTTGGTGGCATTGGTGTAGTGGCAAACTTTTGTCAG
GTCGCTTGCAGTTGCAGGTCAATGTCGTATGTACGTTGCATGTGTTGGAA
GTTATTCGCGACGAGAACGATGGGGATTTCGAGGGTGTACAGCACTACAG
CTCACAAGTCCCATTTGTTAATTTAACCCTCAGCAGATACATATCACAGT
ACAGCAGCATTTGTATTGTAATTTTTTTGTCACATTATGTACAAGGGCAA
AAGCGTCTTTGTACAACCCCAGTTAACACCGTTAGCTTTCAAAATGCACT
AGTGTCATCTAAGGAAAAATTATTACACTTGATGTCAAATAGGGAAGTGA
AAAATCCGGTGTCAAATAAGGAATCATTTTGGAAAGTAGTGTCGAATAAG
GAATTCTCTGTAGTCTATAGCTGTAGTTGCATTGTTGGAGTATCCTCATT
CAAGTTCACAGAAGCTACTCTTCTATGTATTTTTTGTTACTCTTTTTGAA
GGGAAGGGTTAATAGAGTATCTTTGGTTTTTTAGCTGTATTATTAAATGA
CCACTGTACCTACTTGATTCAGTGAATATGTTTAGTACATTTGTTCATAT
TGTAGATTTTTTTTCAAATCGTTACCTGTGGCTCTCTGATTTAATGTATA
ACATATCTATAGACACCTGCATATGTACATGCATTTTGTCTCCCTTTCTT
TGTGATGCTATATTGACATTTGTGTTTGAGATGCATGATTAACAGTCTGT
TTGAATCATTTTTGCAGGAAGAGTTTGACGCAACACGGTGGCTCGATAGA
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CTCTTCATTTAGTCTACATTCTAATTTCTCACTGTTTCCTCAGTTCATGT
TTAATCTCCGGCGATCACAATTTGTTCAGGTGATGCGTACACCTGTTACT
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CTGAAGGTACTCAAACTATGTATATATTTCAAACCCAAGAGCGCTAGTAT
AAATATTTTTGTTTTTCCAATCTAAATATTTAGAAATTATTAGCAGTCAA
AGTGTTAAAAGTTTGTCTGAAGGTGGTATGGTGAAACTACACTAATGTGT
GAACTGGATGTAGTATTTGTTTCCTCTTTCCCTTCAGTAAATCATTGCCT
TGCCTAATACTCAGCTTTGTTGTTACAGGTTTTCAATAATAGCCCAGATG
AGACGGCTTATTTTCGAATGTTACTCAACCGTGAGAGCATCACTAATTCG
GTTGCGATGATTCAGCCTTCATTAATTTCTTTCTCTTTCGACTCACCACC
TTCCCCTGTATTCCTTGATGTGGCATCAATAGCAGCAGATCGTATACTGT
TACTTGATGCGTACTTCAGTGTTGTCATCTTCCATGGCATGACAATCGCT
CAGTGGAGAAACATGTGTTACCAGAATCAGCCAGAGCATCAGGTACTGCT
GGTGGTCCTATCTACGTCTTCTGGTCCATAAGTGTTTTCTCCCTTAATAA
CCGTCTTAATGCAACTGTACATATCATAGCACTCTTCTTTTGCTGTATTG
GCTCATAACATTATTAATTATAGTTGTTACTTGAGAAGAGACATTGTTTG
ATCTTCTTTCTAGACAAAATTGCATACTGGTTATAGAAACTGTCAGGTAT
TGTCGTGCTAGTTTTACCAGTCAGTAATAAACACTCTGGAATGAACATGT
GAGCTGTTCAAGAATATACTAATGGTGCTAATTTCCACTGGTCCGCCATT
AAAAACGCTATGAGCTAGGGTTTTGGAGATCTGCTGGTAATCTGCCACAC
AAACTGTTAATGGGCTCTCTTCTGGTTTTCAGAACTATTACCTGGATCAC
CTCAATCAGCTGCCATTTTATCCCATTCTTGCACAATACTAGTTTTATTA
GTAGTAATTTACAATCTTCGTATCACAAACTTTGGAGAGGTTTACTGGAC
TGTTTTTAGGAATACTAGAAATGAAAACTGTTTCTATATTCCTCCTTGAG
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TGGTATTGGATGACAACACATCCGTTGAGCACACAATCTGATCTTGCAAA
CTGGCTGTTGATGCATTTGCTCAACATAATAAAAATCATACTCCCTCCGT
CCCAAAATAGATGTCTCAAATTTGTCAAAATTTGGATGAATCTAGACACT
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TGGGATGGAGGGAGTACTAATTTACCTGTACTTCTGCGAGTTAAAAATTG
GTGTCCTTTACGAGTCAGAAAAATGAGAGCTTTGACAACTAATAATTCAG
AAGATGGAAAAAAAGGAAGACAAACTCATCATTTCTTGATATTGTGGATT
TTGTTGGTTGGTTGCCAAAGCTTGCTAAGTTTTCTTAGGCAAGTTATGCT
AGTGTTTTCACCTCAAGATACACTTTATTGGTTACAATCTGGCAAGTGGT
TACATTCCCTGTGGCCAGATACACGTTTTGGCACTAAGACTCTAATGTAC
CAGGCTAATTGATTTATGTGCAACACTTATCACGCTTGAATTTCACAATG
TGGATGCTCACTATAATTCCTTTCATGTCAGCAATTCGCACAATTATTAC
AAGCTCCTCAGGAAGAGGCACAGGTCATAATAAATGGCCGATTTCCAGTT
CCTAGACTAGTTGTCTGTGACCAACATGGCTCGCAGGTGTGTATATTATT
TATAGCTTGTTTTATTATCTTGCTGTATTCTCTTATTTGTTGATACTGCC
ACCATTAACTTGTCTACATTACGGCAGTTAATTGGCTTTCTCACATCCTA
CTCTCTTTTGGCACATGTACATGCCTTTGGTGTTTTAAAAGTTCAAAGCA
TGATCTTTATGCTGCCACCGCTTTCTCTCTTTGGAAACTACAGTTCATTT
CTTTTTCCTCACTTTTGCGGCAATGTTGTTATTCGTATTGATCTGAGTAT
TATCTGTACCTAGTTCACCAAGATATTTTTCTTTCAATTTTATGTAACAG
TGTACTGCTTATGCATGAAAAAACTACAGCAGCTTGTTATACTTTCTCCG
ATCCAAATTAATTGACTCAGATTTGTCTAGATTCGGACATATCTAGATAT
GTTTTAGTGCTAGATACATTCGAATCTAGAAAAACTTGAGTCAATTAATT
TGGATCGGAGGGAGTATGTAAATTTAACATACACTCTCCCTTTCATGCAG
GCGAGGTTCTTGTTAGCAAAACTGAATCCATCCGCCACATATAACTCAGC
ACACGATGTCCCACCAGGTTCTGACATCATATTCACGGATGATGTCAGCT
TCCAGGTCTTCTGTGAGCATCTACAGAGGCTGGCCGTTCAGTCATAAGGA
GATGCATTAAGTTGATTTGCTATTTAACTTTACCAGGTTCATAGGTTGAG
TTGTAAGAAAATTTCCGTTATATTATTCTTTTGCCCATGTGTCTTAAATC
ATGACAGGTTTCCAGCCAGACAATTTTTTTTGGGAAATACTGAAAAGCAT
GTGTAAGTTTTAAGAAGTCTCATCACCCATCGTTTATAGATATAATACTG
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TTGCATAAATCTGTAGATCCTGCTTCCCGGGGCGACTCCAGCGTTGCTGT
TGGAGCAGGGAAAGTTTGGCATGGCTTCACCTACGAGACCCCTTATATCT
TCGGTCTAGAAAGCCTGGTCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.