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GrainGenes Sequence Report: AA021489

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Sequence
AA021489
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021489
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGTGCCGCCGGCGCACTGGCGAAGCACTGCAATTGAAGACGCCATGCA
AGTTGGAAACATCAGCGAACGACACGACGGCCAGGTTTGTTTCCATTGTT
TTCCTCTCTCTTAAGTCTTGTTTTTTTAGATTTACTAGAATCGATATTGT
AAATTCCAGATTTGGTATATTTCCTAGTAGACTAATTTCCTAGATCTCTT
TTTCTTTCTTGTAATATAGATGAAGAAGAAGAAAAGTGATGTTGGCGATA
GTAGCATATTTTCATTGTGGGAAAAAGCATCAAAAGCCAAAAAGACAAAT
GAAACAGCCACACCGAATCAAACAATTGTTGAAGCAAGTAGTTCTCATGA
TCAGCCAGAGAACAATTTGCATTTGGCACTAGTGCAGTCACCGCCGGATG
AAGAACGTGAACCGGAGAGCAGCCGTGCAATCCCAAATCCAATTGTAGAA
GATGAAGAAAAGTCGATGAAGAGGATGAAGAAACACAAGCAGATTTGGGG
GGGACTCGAACATGATCCAGGGAAGCGGATTCCCATCTCAAGGTATGATG
CCAACGACAAAGCTAGAGTAAGAAGGAGATACATTGAGATGGGGCCATGT
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TCACTTTTGCATGTTTTGGTTTCAAGAATATCTATCGGTTGAGTACAGTG
TGGACAAAGATGCTGCTTTCTGCTTTGTTTGCTATTTGTTCAAAGATAAA
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GCACATGAAATCGAGATTGACAAGACATGAAGGTGGTCTTAGTAGTGCTC
ATGCTGAACCTCAAGAGAAGTATGATATGTTAACTACACCATGTGCATCG
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GAAACATTAATACTTGTGTGATTTGTAAACTAAAATAAGAGTCCCTAGTA
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GATCATGAACATACAGATGTTATTAACAACAGGGTCATATCATTAGGAGA
ATGATGTGATGGACATACTCCTATAGATAAGCGTAGCATAAAGATCAAGT
CATTTTAAATAGTTCAATTGCTATATGCTTTCTGATACATAGTAACCTAA
TTCCTTCGACCATGAGATCATGCATATCACCTTTGCCGGATGGATGCTTT
GATGACATCAAACACCACACCGTAACTGGGTGGCTATAAAGGTGGCATTG
AGTGTTCGGAAAGTATTGGTTGAAACACATGGATCAAGAGTGGGATTTGT
CCATCCATATGACGGATAGATATACTCTGGGCCCTCTCGGTGTAATGTCA
TCCAATTAGCTTGCAAGCATGTGACTGGATCACAAGGGATCACATATCAC
GGGAACGAGAAAAGAGTACTTATCGGTAACGAGGTTGAACTAGGTATGCA
GAGATACCGACGATCATAACCTCGGATAAGTAAACTATCGTGAGACAAAG
GGAAATTGGTATCGTATGTAAGTGGTTCATTCGATCGCAAAGTAATCGTA
GAAATATGTGGGAGCCATATGAATTTCCAGATTCCTCTATTGGTTATTGT
TCGGAGAAGTGTCTCGATCATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGAGAGA
CACACTTAAGGATTCGACGTTGTTTGAGTAGTTATGGTATTATGAGAAAG
AGACCGAATGTTGTTCGGAGTCTCGGATGGGATCCGAGATATCACGAGGT
GATCCGCAATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATAAGAAAAGTCCCGTTTC
GGAGTTCGGAAATGATTCCGGTGTTTTCATCGGGAATGTTCTAGAAGGTT
CCGGAATGTCCGACACTCCGGGGGGGAAGGGGTACATGAATGTGTCATTG
CATATTGAATGATTGCATCATGTACTAAGTGTTCTTGCTGTTTCAAATAA
AGGATTAAATTGAATCCTAAAACAGAAAAGTCAAATGTCCAGTTTGAAAG
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CTTGGGGAGGGACTCCCCTCCCCTTGGCCGCCCCTCCCACCTATAAAAGG
AGGGGCAGGGCCTCCTCCTCTAGACACACAAGTTTCCTAGCCTCTAATCT
AAATCCTAGCCCTAGACTCCGGTTTAGAGCTGTTTTGGTTTAGAGCTTCT
AATTGCCCTAGCCTTCGGATTAGAGCCTTCTAATTGGTGTGTCTAAACTC
TAGACCACTAAACGCTCTCTCATACTCCACCATACTCGCTCCGGCTTAAG
GCGACGCCCTGCGGGATCTCCCCTCTACTTCCGGTACCACGCCGTTGTGC
TGCCGGAATCGCGAGGAGAGTGCTACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACAA
GGGAGAGGAAGGTCTTCGTCGAGTACCGAACGTGTGACCGACTGCGGGAG
CGCTGCCGGAACGCAGCGCCGGAAGGATCGTCTACGCGATCTTGAGATCG
GAAAGAGTACGACTACATCACCCACGAGAATCTGCTCTTGTTAACCGCTT
TGGAATCTTCGAGGGTAAGTTATTCCATCGACTCGTTGCTACAATCTAGT
AGATAGATCTTGGCTTGTTTGTTTGTATGCGATAGAAATTTTTTGTTTTC
CATGCTACGAACCCCTACAGTGGTATCAGAGCCGTGTCTATATGTAGATC
TGTTGCACGAGTAGAACACAATGGTCATTGTGGGCGTTGATGCTTTTATT
GTCGATTGCTTCTTGTGTACTTTGCATCTTGCGGTATGTTGGGATGAAGC
GGCCCGGGCTAACCTTACATGACATCGTTCATGAGACTTGCTCCACGCTT
GACATGCAACTTGTATTGCATAAGTGGCTTTGCGGGTGCCTGTTTCTCCT
AGCATAGTTAAGATCCAATTTACAACGGGTGATTAACAATACTAGTATCA
ATGTTGTGGTTCTTGTTCGTAAGTTAGAACGACACTTATTGAAAGCCCCA
AACAACGTAAAATATGCAAAGAAAGTAGAGGCGTCTAACTTTGTTTTGCA
GGGGGTGTGCAGTGATGTGATATGGCCATGATTGTGATTATATATGATGT
ATGCAATGTTCCTTATTGTAAGTCGGCAACCGGCAGGAGCCATATGGTTG
TCTTTAATTTATTTTAAGACCCGCGTGTCTATTCAAAGTAGTTGTAATAG
TTGAAGCCGGTGGACGACAACCATGGAGAAGCGTCATTGACCTTGATGCA
ATGCCGGTGATGATGGAGATCATGTTCGTGCTAGAAGATGGAGATCGTAA
GCACAAAGAAGAAAGGCCATATCATATCACATATTATGAATTGCATGTGA
TGTTAATCCTTTATGCATCTTGTATTGCTTAGTAGACGACGGTAGCATTA
TAAGATGATCCCTCATGCACATGAATTTCAAGTCATAAAGTGTTCACCCT
TAGTTGGCACCGTTGCTAAAGCTTGTTGTTTCGAAGCACCACGTGATGAT
CGGGTGTGTTAGATTCCGCAAGTGTATACAACGTGGGCAAGCCATATTTG
CTCACGCGGAAGCTAAGGTTTGATCTTGACGAGCCTAGCATGTACAGACA
TGGCCTCAGGAACACGGATTACCGAAAGGTAGAGCATGATTCATATAGTA
GATACGATGAACATGTTGATTGTTCGCCATTGAAGCTATATCAACTCTCG
TGATGATCGGTTTTGATGTGGTGGATTTGGTTCGTGTGATCACTAAAACA
ATGTGAGGGATGTTGTTTTGAGTGGGAGTTCACCTAGATTAATTTAATTA
TTAATTAGAACTCAATTTATCATAAACTAAATCAAAGTGAATTTGCATAG
TTGTTGTAGTCATTGGCATCCATTTACCACCTTGTGCTTAGTTATAATTG
AGATGATAGAACTATAGAATTCTGGTTAGTTACTTTACGAACTGGTATCG
TATTGTTTTTGAAGTGTTAATCTAAAGTTTAAAAGTCCTATTGAAAACTT
CCAGTAAGTTCCGGTTACTCCATGAAGTTTAATAATTAGTATTAAATCAA
GAGTAACAGTTCCAAGTGTTAGTATATAAGTATCATGTTTGTCTCCATGA
TTCTTGATATTCAAAGGATTCTCTTAATATCAAGGTTATCTAGGATCTGA
AAGAGTTGTTTCAGAAACCATGATGTGTGGAAGATATTATGATATCTGAA
ACGAAGTTTTGGTTGCAACATGATAGAGTATAATATAGCAAAAGTCATGT
TCTCATATTTGATGAGAATTTGCAAAAGGTTGGAGACACTAGTTGTCCTA
ATCCTACAAAAGGGTTTTGGAGAGCAACATTATACTCGCGATTCACCATT
ACAAGCTAAAAGTAGTTTGATCTTGGATAATTCCATGATAAAGGTGAATG
TTTGATGTAGGTAAAATGTTTACTACACCAAGAGATTACTAAAGAAAGGA
ATATGAAAGAACACCAACCATTTGATGATGGTGATCTACTTCAAAGTGCA
AGTCCAAAGACATTGGTATTTAATTATACACGCTTTGGACTATGTGTCAT
ATGTATGACTCCACTATTGATATTGATAGATTCTTTCAAACAGAAAAGGA
AATACTGAAAGAGAATCTTATAAATATATGGCAGAAAAGAAAAGACTAGA
ATTGTTCAGTTTAAGTATATAGATGATATACCTGTTATGGCTATATTCTT
TGCTTATTAAACAATGTGGTTCTTAAGTATTTGATACTGAATTTGTTGGT
GTGAATCGTCATACGAAACAACACAATTCATGAACTACAATGGCCTAAGT
AACTAGCAAAAGAATATGTGTTGATGTTCATCGAGAACAAATAAAGGGTT
ATTGTGTTGCTCATTAAACATCAAAGTTTGCCTTCAAGATTTGTTTTATC
AGGTATTATGAGACCAAAAAGGGTTGTTCAAATAATTGCCGTAATCCATA
AAAGATGGATGATTCACAAATCTCGTTGGAGAAATCACATCCATAAAACT
AGTGCTAAAAATGTCGAAAGAAAAATTGATTGAAAGATCACTTAGGAAGT
GACATCGCCGTTTAAATTGTATTGGAAAGAAAACATGAAGAAACTCCATG
TGTATGGAATTTTGGAGTCTTTTGATTTTGATCAAATGACGCTGGTGAAA
CTTTCCTAGAGATAATTAAAACTTCGTTCATAGGCCAAAAGGGAACGAAT
GACTAGCCTATTGGAACTTGTACATATTGTTGTACGAAGTCCATTATGTG
TAGTCAAGAGCGATGGATTTCAACTTCATATGCTTTCTCCAAAAATTTGA
GTGAATATATGAATATTTACTTAATAAGGATGAAGTATGAAACATTTGAA
AAGTTCAAAGACTTTCAAGATGAAGTGCAAAATCATTGTAACAAGAATAT
AAACAGTTTATGATAAAGATCATAAAGGAAGATATTTGAGTTACAGAGTT
TAGCATAATACCTAAGATTTAAGGAATCGTTCCGTGGATTTGCATTTCCC
GAAACACCATAAGAGTATGGAGCATTCGAGATATGTAATTAAACCTTGTT
TGACATGGTGAGATCAAAGGTGTAATTCATAAAATTGCCATTGTATTTTA
AAGATTAAAAGCTTTAGAGATTACCGTTTTTCCACTGAAAAGAGCTTCAT
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CAAGTAGTCCTTTCTTAAACATTGGTATGCTATACATAAGAAAGATGTTT
GCAACCAAAGTCGGATGAATCTTTCTTTTTTAAGTATTTCTCCATAACAC
CGGAGACAAAAGTGTTTGTCGCTTAGAACGTCAAGTTTCTTTGAGAAGGA
ATTTTTCGTGAAAAGTTAAGTGGGAGGACAATAGAACTTTGATAAGGTTA
AAGGAACCTTAGCTATATGTGGAAAGTTGCGCAGCGCCGAAAAGTGTTCC
GGAGGCAGCAACAATGCTCATGGCTCACGTGCCTCAAAGGTTGTGGTTAC
AATAGTCAAAGTTTCTATTGAGACAAGTAGGTCGGGTAAACAATCAAATA
CCAAGATTTGAGGGTTGAATCATTATTTGAGAATAATGAACCGACTACAT
GCAAAGAAGCGATGATGGGCCCTGACTCCGTCAAATGGCTTGAAGCCATA
AAATCCATGATAGTTCCATACATGAGAAATCAAGTTTTGAACTTGAAGGA
CCCTCGAGAAAGGTGTAAGACCTTACAGTCGTGTTTGGATCTATAAAGAA
ATAGACATGGATGTTTTACATCTATAAAATAGTCGACATGTTGGGAAAGA
GTTCACAAAATGTTTAAAGGTTGACTATGATAAGATTTGATCTTTCATAG
TGATATTTAGTCTAGACGGATTAATGTAGCAACCACTAAATATAAATTTG
TTATGTGGTAGTTGAATAAACAAAACAAGTTCTTCTAATAGAATTGTTAC
CTAGGACATGTGCGTAACACGGTCCATAGGGTTTTGTTAATTCAAAGGAT
GCTAAAAGCATATGCAAACTTCAATGGTTGAAATAAGCATAGCAGAGTTG
GAATCTTCACTATGACGAAACTGTTAAAAGAGTTTAATTTCATCAGAGAC
AATGAAGATGCTTGCATTTGCAAGAAATTAAGTGGGAGCGCTAAGACATG
TTTCTAATACGTTATGTGGAAGACATATTGTTGATTGGAAATGATGTATC
TTTTATTAACACATATTAAGAATTTCATCTCGATGAAAGACTTAGGCAAA
ACCCAAATATTAGGCATGAATAGACGCTAATATGGTTGTGCCAAAAGTAC
ATAGACGAGATATTGAATGAGTTCAATATAGAAACTACAAGAAAGTTTCT
TGTCGCACAGAAAGGATTGAATGAGTTCAATGTTGATGATATATTCAAGT
GTATTGACATTTGGTAAAGTGAAACAAATAATCAAGTATATATTGATACT
TGATGTATGAAATCACAAAGAGTATTTATATCAATCATAATGTGATATGT
ACAAATCCAGATATGTCCTATGCTCTAAATATTATGATCATATACCAGAA
TGATTCATAAGATGATTATTGGACAATAGTAAGGATATTCTTATGATCTT
TTGGAAGAACTAAGAATATATTGTTTGTAGAAGTGACAAATAGATGGTTA
GTTCATTGTAAAAGTACTACATTGATACTAGTTTTGTCACAAAGTGCAAA
TTAAGTTTATCTCAATCTAAACTAAGGGTGGCACAATATAATGGAAAGTA
AGTTCCATAATGGATTTGGATGAGTTCCAAAGTTAAGACATTGTGACAGA
TACTACAATAAAAGGCTAAGTATATGACTGCTATTATAGCAGCTAAAGAG
GGCATTTGGGTCAAGTAGTTTGTTATCAAACTAGGTGTAGTTCATAGCGG
GATAATACTATGAAGATATATTGTACGACAATATTATCAACATGTTTTAA
CCGTAAAGAACTAAAGGTCTCACCAAAGGACCAAATTTATACAAAGCCAT
CTCATTAGAGAATGAGTGATGCGTACAGACGCAAATACATGCAATTACAC
ACGGACCTGGAAGTGTCAGATCCAAAGATCAGTTGACCACTAGCGAACGT
GTACTTACAACACCAGAAAGCCATAGGTGTTGAATACACAAAAGGTTTGA
AACTAGATTATTGACTCTAGTGCAAGTGGGAGACTGTTGGAGATATGCCC
AAGAGGCAATAATAAAGTGGTTATTATCATATCTTCACACTTATGATAAA
TGTTTACATACCATGCTATAATTGTATTAACAGGAAACATTAATACTTGT
GTGATTTGTAAACTAAAATAAGAGTCCCTAGTAAAGCCTCTTGTTAAACT
AGCTTGTTGGTTAATATATGATCATGGTTTCCTGTCATGAACATAGAGAT
GTTATTAACAACAGGGTCATATCATTAGGAGAATGATGTGATGGACATAC
TCCTATAGATAAGCGTAGCATAAAGATCAAGTCATTTTAAATAGTTCAAT
TGCTATATGCTTTCTGATACATAGTAACCTAATTCCTTCGACCATGAGAT
CATGCATATCACCTTTGCCGGATGGATGCTTTGATGACATCAAACACCAC
ACCGTAACTAGGTGGCTATAAAGGTGGCATTGAGTGTTCGGAAAGTATTG
GTTGAAACACATGGATCAAGAGTGGGATTTGTCCATCCATATGACGGATA
GATATACTCTGGGCCCTCTCGGTGTAATGTCATCCAATTAGCTTGCAAGC
ATGTGACTGGATCACAAGGGATCACATATCACGGGAACAAGAAAAGAGTA
CTTATCGGTAACGAGGTTGAACTAGGTATGCAGAGATACCGACGATCATA
ACCTCGGATAAGTAAACTATCGTGAGACAAAGGGAAATTGGTATCGTATG
TAAGTGGTTCATTCGATCGCAAAGTAATCGTAGAAATATGTGGGAGCCAT
ATGAATTTCCAGATTCCTCTATTGGTTATTGTTCGGAGAAGTGTCTCGAT
CATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACTTAAGGATTCGAC
GTTGTTTGAGTAGTTATGGTATTATGAGAAAGAGACCGAATGTTGTTCGG
AGTCTCGGATGGGATCCGGGATATCACGAGGTGATCCGGAATGGTCCGTA
GAATAAGATTCATATAAGGAAAGTCCCGTTTCGGAGTTCGGAAATGATTC
CGGTGTTTTCATCGGGAATGTTCTAGAAGGTTCCGGAATGTCCGGCACTC
CGGGGGGGAAGGGGTACATGAATGTGTCATTGCATATTGAATGATTGCAT
CATGTACTAAGTGTTCTTGCTGTTCCAAATAAAGGATTAAATTGAATCCT
AAAACAGAAAAGTCAAATGTCCAGTTTGAAAGTCAAACGGCTAAAACAAG
AAACTGTGGGAAACAAGCAAGAGGTGGTTGGAACCGACTTGGGGGAGGAG
TCCCTCCAAGCCGGCGCGCCAACCAAGGCCGACTTGGGGAGGGACTCCCC
TCCCCTTGGCCGCCCCTCCCACCTATAAAAGGAGGGGCAGGGCCTCCTCC
TCTAGGCACACAAGTTTCCTAGCCTCTAATCTAAATCCTAGCCCTAGACT
CCGGTTAAGAGCTGTTTTGGTTTAGAGCTTCTAATTGCCCTAGCCTTCGG
ATTAGAGCCTTCTAATTGGTGTGTCTAAACTCTAGACCACTAAACGCTCT
CTCATACTCCACCATACTCGCTCCGGCTTAAGGCGAAGCCCTGCGGGATC
TCCCCTCTACTTCCGGTACCACGCCGTTGTGCTGCCGGAATCGCGAGGAG
AGTGCTACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACAAGGGAGAGGAAGGTCTTCG
TCGAGTACCAAACGTGTGACCGACTGCGGGAGCGCTGCCGGAACGCAGCG
CCGGAAGGATCGTCTACGCGATCTTGAGATCGGAAAGAGTACGACTACAT
CACCCACGAGAATCTGCTCTCGTTAACCGCTTTGGAATCTTCGAGGGTAA
GTTATTCCATCGACTCGTTGCTACAATCTAGTAGATAGATCTTGGCTTGT
TTGTTTGTATGCGATAGAAAATTTTTGTTTTCCATGCTACGAACCCCTAC
AATAAGCAGCGTTTGACATGGACACTCAAGTGTTTGAGGTTTCTATTACA
CCAAGGCTTGGCATTTAGAGGACATGATGAAAGTGAAGACTCACTAAATA
AAGGAAATTTCCTCGAGCTCTTAAATTGGCTAGCAGGAAATTTTGAAGAG
GTTGACAAGGTAGTTCTCAAAAATGCTCCAAAGAACTGTAGGATGACTCA
CCATGATATACAACATGAGCTCTTAAAATGTTGTGCGCAGTTGACTACTA
AACTAGTCATTGAAGAACTTGATGGTGGCCATTTTGCAAGACATTGCAGA
TGAGTCTAGTGATGTGTATCAGAATGAATAGTTGGCTGTTTGCTTGCGTT
ATGTTGATAATAAAGGAAGGGTTGTAGTAAGGTTTCTTGGTCTTGTTCAT
GTTGAAGATACTACCTCTTTGACACTTAAAGCTGCAATTGAACAAATGCT
AATGAATTTCAATTTGACATTTGCGATGGCTCGTGGGCAAGGGTATGATG
GAGCTAGTAAAATGAAAGGTAATGCCAATGGACTGAAAAAACTTATTATG
GATGAGTCTCCTTCTGCCTATTATGTTTACTGTTTTGCCCATCAACTACT
CTTTTTCCTATTATTGCGATGGCTCTTGGTCTTGTTGCGGTTGCTAAGGA
GAGTGGTGATTGCACTTGTTTCTTTCAGCAATTTGCATACTTGTTAAATG
CTCTTGGCATGTCTTGTAAAAAATGAGAATGCTTCGGATAGCTCAGGCCA
AGGGACTGATTTATGCATTGGAATTGGAAGAAGTAGTAACAGGGAGTGGG
ATCAATCAGGAAATGAGTTTGGCAAGGCCATGTGATACACGTTGGAGCTC
TCATTTCAGAACTGTGAACCGTGTCATCTCTATGGATGGTGCAATACGGC
GAGTTCTCACCAAGATTGGAAAAGAGTACCATGGTGTGGAGGCACATGCG
GCGCTAGCCATGTTGACATCATTTCGGTCATTTGAGTTTGTTTTCATGCC
ACACTTGATGCAAGAAATATTTGGATTCACAGATGATTTGAGCAGAGCTT
TGCAAGTAAAAGAATTGGATATTGTTCATGCTATTCAGGTTCTTGATGAC
ACAAAGTATTTCTTACAGGGCTTGAGGGATGATTCTGGCTGGGAGGATTT
TCTTATGAAGGTAACATCTTTCTGCACAAAGCATAAGATCAAAGTTGTTG
ATATGGAGGTTCCTTACTTTCCTGTTGGGCGACCGAAAAGGGGTTTCTTT
AAAGGTGCGATGAATTTCCATCGCTTCCATGTCTATATGTATGTGAGTGT
CATTGATAGGCAAATTTCTGAGTTGAATAGAAGATTTGATGAGGTAAACA
CGGATCTACTTACTTGCATGGCAGCATTTAGTCCACTTCGCTTATTTGCT
TCTTATGATCGAGAGAAGTTGGTTAGGCTTGCTACAAAGTTTTATGCTAA
TGATTTCACAACTGACGAGCTTGCAAGACTTCCATGGAAATTAGACATGT
ATATTGCTCATGTGCGTAAAGATGAACGGTTCAAAAGCTTGAAGAACATA
TGCGAGATTTCAGTTATGCTTGTCGAGACGAACAAGCATGAACAATAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.