Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA004978

[Submit comment/correction]

Sequence	AA004978
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA004978
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCGTTTCAAAACATTGTATGAGAAGCACAAGGCTATTTTTGAAGCAGAT GTTGATGTGACAATGAAGAACCTTTCTGCTGGATTGAAGCGCATGCAGGC TCAACGCATGGCTGCCCTTTTGGTTGATGTTGAATCATCAAGTACAAAAG AAGAAGCTGGACCAAGTGTTGTTTTTTCAACCAAAAGTACAGCTGATGAT GATGATCAGCTGCAGGATGATGATGGTTCAGAAACTGAGGATGATGAGAA ACTTTATGCTACATCGGAGCCCGAGGACCATGGTGTTGCTGCAGCTGCTG CTAAGGATACTGATGGTGATACAGATGATGCTGTGGAGCAAGGTGGTGCT GCAGATGCTTCTGTGGAGCAAGGTGGTCCTGTAGCAACAAAACACGCCGA TGTTCCTCAAGCAACAATAATCATTGATTCTATGAGCAAGGGAGCTGATG CTACTGAGCAGCCGGATGTTTTTAGCCCTGACATGTCTCCAATTCACAGC CCCAGGAAGGATATTTCTGATGAAGCTTGGGCCAATGCTTCGGACAAACC CCCGTTTGATCTTTTCGAGCCTGGGACCGATGAGTATGCAGAGTTTTGCA TTTCACAGTCTCTCCCACCTTCCTGTGATGCCCCAACCGCTGCTGTGACC ACTGCCTCTGATGCCTCTGAGAGTATTCCATCATCACCTTCCACTTTGGT CGATCTTGCACCTTTCGGCTCTACTGAGCCTGTGACACCTGCTGTTCCCA TTGCACCTGGTATGAACATTTTATTGTAGTTTCTTAGATATGCTTCCGCT TGTTTGCTTCTTAGATATGCTTCCGCTTGTTTGCTTAAGACACAATTGTT TTCTCTTTTTGCAGTTGTTGTTAACATTGAGTCAAGTGTTAAAGGAGATG GTAGCTCGGGTTTGTTGACACACGAGAAGAAGACAAGGTTTAAGAGGGCT GCCAAGGAGGAGCTCACACCTCCAAAGTTGAAAAAGATGAAGGTCTCTGA AGATGTAGAACAAACATACTCCACATTTGTGATGAATGGTCGGAAATTCA AGGGCCATCCGATGAATAGGGCACCGTAAGTTTATGTTTTTTGCTACTCT GAAGTAATGTTTTTGCTACCTTACATCTAGCTGATTGCTACATGTGTCAA TGTGTTTTGCTACTTACTTTTTTCACTTGTAGGATATAGTTTTCCATTTA ATCTTCTACAGCTTAACTACCTACTACCTTATTTCATTTTTTTTTGCTAC TTTAGATTGAACTATTTGCTACTTTAGTTCATAGTTTTTGTTACTTTAGA TTGAACTACCTACTACCTTAGTTCATTCATTTTGCTACTTTACATTGAAT TGTTTGCTACTTTAGTTCATAGTTTTTGCTACTGTACATTGAACTGTTTG CTACTTTAGTTTATTGTTTTTGCTACTTTACATTGAACTGTTTGCTACTT TAGTTCATAGTTTTTGCTACTTTAGATTGAACTGTTTGCTACTTTAGTTT ATTGTTTTTCTACTTTACATTGAACTGTTTGCTACTTTATGTAAAACTAT CTGCTACATGTGCATTCCTTTGTGCATGCCAGTTTTTCTAGAGATTGGGC GGTATTATACTTGCTACAGAACTTTCCAAACATCGCTTCGGCCGCGCCAA AATCTAGATAGTGAGTTGATGAATGTTTGGATTGAGAAATTTAACCATGA GTCGGACATTGTTTGCAAGAAAAGTGCACAGCAGAAGAGGAAGTACGCTT TCACGCAGCACTTTGTGCTAAGTAGCACTTTTCTTGATCTTTTACTTGCT CAATATGCATATGACAGGTACTCTGCTAGCATTTTGCTACCTTTTGTGTG CTTGCTGAACCAATACAGATAGTAGCAAATTTTACTTGCTTTTGCTGCTG CCTCATACTACTTTTTATCTTCAACACAAAACAGGAGAAGCTTATTGTTG ATCCAAAAGCATTCAATGCTAAAGCATGTATGGATGAGTTGAAAGAGCAT AATGCAAAGTTCAAGATTTTCAAGTGTGACCTGGTGAGCTAACATCCTTG CTTCCTATCTTGTTCATGTTTGCTTTCTATACAAGATGCTAAATATTAAT TCATGTTTGAATGTAGCTATACTTTCATATTGTGAAGTTCAACCATTGGG CAGTTCCCTGTATCAACCTAGTAGCAAAGCAGATGCATTTTTTGATTCAA TGAAAGGGGCCAAAGATGCTACTGTGATGGATGATTGTGCACGCAATCTG GTTAGTAATCCAGCTACACTTGTTCATTGTGTTTGCTACATTTATAGTTG GGCCTTTTATTTGCTGCATATCATTAACCATGCAGTGTGTTTGCTTTGTT TTCTAGTTCGCAAACTTTGCAATTCTTGTGAAGCAATCAAAACTAGCAGA CAATATCAACTTCGACACTTACTTGCTAACCAATGCTGATCACCCGCAGC AAACTACCATGTAAGATTTTGCTCACCTTTTTTCAATCCTTGTCCTGATC ACTAGTTTCAACTTTTGCTACATTATTGTTTTTTAATTGATACCTAAGTT TACAACTCTTGCTACTTTAGCTTCCTACACTTGCTACATCAGTTTCTACT TGTTTTTTACTAATCTTTCTGTTTGTTTTTTGACAGATTTGATTGTGGAT TCTTCAGCATGCTCTTCATGGAAAGCTTCACCGGCAAGGTCATGGCGGAG TTCGACAACAATGCTATACCACTTCTAAGGAAACTTCTTGCGTCTGATCT GATTGAGGCAAGGCAAAACAAAGGATCATTGCTACAGCTGATGGAAGAAG AGCTATAGAAGAAGCGTAGTTAGGTTGAAACTAATGTAATCATTGAAACT GATGTCGTCCTTGTGATCTTATTTTGCACTTTGTAATATGTTCAAACTGA TGTAATTGTGGATGTGTTCGTTGCTGCAGCATCTGTGGATTATCTTTTGT GGATAGGTTATGTTGGATGGATAGGTGCTACATGTTTGGAATGGTTTTAT ATATAGTGTTTTGAAGTTTGGAATGTTGATTATTGTCTTCTGAAGCTTCA AATAGTGTGATTGCTTTGATAAGTTCTGTACATGCTACATACATGCTGCA TAAATGCTAAATATGAGTATTTACCTAGACATGCTGTCAATTATTTTGGC CACCCTAGGTGTTAATTTGCTACATCTGTGTAGCCATATTGCTACATGCA TAGAAATGGTGTGCTACCCAGGTGTACAAGATTTGCTACTAGGTTTAATG TAGCAAATATACCTATGACATTCATTCATAAGAACAAGTTTTGTCTATGT TAGCAACTTTATATACAAAATGCAGGCTGTATGCTCCAAAGTGGAAATAC TTTTGCTACCAACAATATTCTGTCATATCACAAAATTCATATCTTGCATC AAGATGATGCTACATCTATACTGTATGTATGCTACATAGTAATGACAAAA ATGCTACTCTCTGGTAGTACATGTAGTTTCAACTATATTTTCGCAGCATT CCCCGCAATCAGTGCTTCCATGGCGACGCATTGTTTCACGGTGTGACCTT CTTCATTGCAGTATGGGCATTTTTGCTTTCTTGGCTTCTTCTTCTTCGGC GTTGCATCAGTTTGCTTCTTATTTGTCTCTTGAGCTTTTTTCCTTCTCTT GGCATTTGCTTCATCACGAAGCTCAACCAATGGTTTGTTACGCTTCGACT TATCGGTTGGTCTTCCTTTTGACTTTACCCTCGCAGGGTTCTTGAGCGTG CTACTCGGAGCATCATTACGTTCTTCTTCTTGTCGTTGATTGTTTACACC ATGCTGTGGAGGAATACTTTGCTCTTGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.