Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA004508

[Submit comment/correction]

Sequence	AA004508
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA004508
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAACAATGATGAGGATGAGGGCGATGAAGATAAGGGCGATGGGAATGA GGGAGACGAGGAGGATGAGGGCGATAAGGAGGAGGACGAGGATGCGAGCG ATAAGGAGCAAGCAAAACCATTAGATTATACAATTGTCGCTCAGAGATGC AAGCTTAACCATAATAAAGAGTGATATCTCCTTGACAACATTCCTTTAAA AAAATTCTACATCGGCCTAACACTTGCCACTCGCTTGACCAGGATGCATA TTCAGCTAATATGATATGTTTTCATTTTTTTAATTCCTATTGTATTTATA TTGTATGATAGTTATAAGGATTTTAACTTCTTCATCTTAATTAGGAAATA CCGTCGATAATTTTTTTCTCTTCAAATTTCTAAAGGTTGAAATACGCGTT GAAACATCAAGTGCCGTAAGCGCCATTTCGTACAAGACAGTGAGTGATGG ATGCATCATCTTCAACACCTAGGAGTGGAAGAACTTTGTTGAAGCTCATG ATGATCTACAAGTTGGACAAGCCATTCTTCTTCCCGCCAGGACCACTTCA CGCCGTGACATTCAGATAATGTTCATCATTGACATCATCATTCGCAGTGA CTAGCTAATTTCTTGTGATGGTTGTTAGTGTAGATGCAACTTGTGATATT TTGAACCGCTTTAATTTGTGGTGAACCAAATCGTTATTTTCTTGCTTATG TGAATATGTATTTCATGATGTTATATTACTGTTATATTGTAGCCTTTAAT CAATAATATGCAACATCTTTTTTTAATTTTTGATAATATACTTATAACAT TTGACTTTCTAAAAACATCATATAATAACGTTTGGGTCAAATAGCACCAC TATGTCTCCTAGTCTTGGCGTCCGTACCAAACACCATCGATACTAATGGC GTTCACATGGAACGCCACCATTATTACGGATGGCAATGGGTACCCGCAAC CCGCTTACCCTGCGGGTTTTTACCCATTAGGATAAGGGTATGGTAGTAAA GTTATACCCACGGGTAAGTAATTGGGCAAAAATCTCTACCCATTGGGTAT TGCGGGTGCGGGTATGGTAATGGAAAACCCGCACCCGCATACCCACTCAC CCGACATCTTAGTAGATGATACGTGGGGAATTAGTATTATAGCATTTTTC TTAAAAATTGTGAAATTCCGGAGTTGACGAGTGTTGTTATGTGACTTATT GTGGCATGGCGTGTGACTGTTTTGCAATTATTTTGAGATTTAAAAATTTG AAAAATATAATTTCTATGCAACTTATGTTTGAACATAACTTGTTTTCTTC ACATATATCATGTGTTTGACTATGTCTTTTCATTATTTAATATATATTTG CTTGCTTGCTGAAATCGTGAATGATGAAAATATATGCTATCATTTTTTAT ATGTTGTGTTATTACAATACCTTGTTAAGTTGTTTGGACTAATGGGTGGG TATTACCCGCGGTTTTTTTACCCTCAACGGGTGCGGGTATGGGATAAAAT CTATACCCATATGCGGGTGCGGGTGCGGGTTGCGGGAAAGATCTGAGATT GCGGGTGCGGGTTTGGTTAAGCTCCACCCGCACCCAACAGCCGCGGGTGC CATCCGTAACCATTATACCTTACTAATGACGTAAGATTAGTGAAATACGG CTTAAGCGTCACTAAACTCTTTTTCCAAACGTTGTCACTATACTAGTGCC CGCAACGTGTGGCTAATAGATTTTCCCGTAGTGGAAACTTCCTATTTTCC ATCTCTTAGCAAGAGCATTTGTGCTTCTCCTGCGAGGATTTTTAATCATG ACCAATAAAAAACACGTACATCACGTGCGTTAATATATTATATTTTTATT ATTTTTTTAATTTTGTGATTTTTGTCTCAAATTGACTTTGAAATATCCTA ATTTAAAAATATTTATTCACACATTGAAAATGTTTAAATTTGAAAAATAT TTGGATTTAAAAAATATTGAAGTTAAAAGTTGTTTTGATTTAAGTAATAT TCGGATCTAAAAAAATTATTCATATTTTAGAATATTCGAATTTGAAGAAG TCAAATTTTTATAAAAAGAAAAAACAAAAACAGAAAAGAAAAACGGAAAC CAGAAAAAACCCAGCAAAAAACCAGGAGAAAACTTCCTCTGCCTCCGCTA ACAGGCCGCGACCCAGTTCGCTACCGTATTGCCAGCCCATTCAGAAGACC CAAAGAACTGGCTCTCCCTCATACCCATAGTCTTGGCGGATCCGGCCCGG TCCAGGCCGCACCATACCTCTTCTCCAATCTCCCATCATCGCGTGGCAGT TGTCAAACCAAGTCTCGCACGCCATCTTCGCCAGCGCCGCCCAGCCCAGC ACTGTCCCATCCCCACCGTGCCGGCGAGCTTCACCTCCCCCCCGACGCAA GCCTCCTCGGCCCTTCTTCTCCCCTAACCCTCGTCTTCCTCCTCCTCCTC GCCTCTACTGGGATGGCGTCCGGTGGAGATCCATCCGGGGTTCCTGGTGA GCTTTGCCCTTCCTTGCTTGGATTGCCTGATCTAACCTGCTCCGATCTTA CCCCCGCTGCGAGCGATCGAGCTCAATTTCTACTCCTGGAATTTTGGGTG CTCTAATCTCTCCAATCCATCCATTTAATTACGGATTTGTTTGCTGTGCC GTGGAGTACTGATCTGCTCCAACCATCCATGTCTCGATTCGGCCCGTCTT CTCCAGCGCGCGCGTGGGCACGATCGAAACCTAAGTGTGAGGTTGTCTAG AACCCTAAATTAGTGATACTAATATCAGCTTAGATTCCCAAATTATCGGA GCCTCTTTAACCCCCACCCCTGCACGCAAGCAATGCCAAGTAATTGGTAA GAACGAAATAATTTTCTGCAACTGTTTGACGAGAAGGAAACGTTCCTTCA GCACGGTTAGTTTGCTCGGTGCCTTATTAGTTTTGCACCCTTATTCTCAT GCTTGGTAAGGAAGAAATATGCAGGTGTGCACAACACTTGATCTCATTGG AAGATGTTAGAGCCTGTTTCTGATTAATACTTGTTGATATTGCTTAGTGT TTGTTTGTTTCACTGCCATATGATGACATGCTAAAGATAAATAAAATACA AAAGCACATGCCCTGTTTGAACCAGTTCATGTAGTTTCTCTCCATTCTAA AGAGGAGGAGGGGAGCAAAATATTGTGTCCTCTCAAATCTCGAAACTATG TACAGTACAATTTATCACAGTGCTTATGTTCAAATTTTTATGTTGCCAAC TTTGTTTGCTTTGCTGTCATAGTTACTATGTTTCTTTTCTGAACCACTTC TTTGGCAGATGCAAGCAAAAGTAAAAAATCAGAAGGATCATCCAACGAAC CTCAAGGGGTTCCTCCATCTGCAGCTGCAGGCCTTTCGGGTCCTTTCGAT TTTTCTTCTATGCAAAGTTTGCTCAATGTATGCCCCTCTCCCCCTCCATT CTTCATCACAAGTCTAGTGCGAGCTCCATCATACTTGCACTAACTTTTCT GAACAAGCATATCTTTCTACTTCAATTAAATGAGTTATGGTTTACAGGAT CCATCTATAAAGGAGATGGCAGACCAAATTGCAAGGGACCCTGCATTCAA CCAAATGGCTGAGCAGCTACAGAAAGGTGCTCAGGGTGCAGGAGAACAAG GCATGCCTTCATTGGATCCTCATCAGTACCTTGAAACAATGCAAAAGGTC ATGGAAAACCCTCAATTTATGACAATGGCTGAGCGTCTTGGGACTGCTCT TATGCAGGTACCACCTACTTTACCCAAGAGACTCCTCTGGTTTCCCTTCT TTGCTGTTAATTTGGCTGCCAAGGCCTTAATCGTCTCTACTCAACTCATT TGGCTCAGGATCCTGCTATGTCCAGTATGCTGGAGAACTTGACTAGTCCG ACACATAAGGAGGAGCTTGAAGAGCGCATGTCTCGTATTAAGGAAGACCC AGCCTTGAAGCCAATTCTTGACGAGTTAGAGAATGGTGGTCCTGCTGCAA TGATAAAGTAAGGCATATTTAGTTATCTACTACTGATATCCATATATGAA TGTCTATAAAACTTGCTTCATGTACTTTTCATTTTCTCATGTAGGTACTG GAATGACCCTGAAACTCTTCAAAAGATTGGCCAGGCAATGGGAACTAACA TGCCATTTCCCAATATCTCTATTCCTGAACCTTCTGGTACTGAAGAAACT GAAGAGGAAGGTGGTGATGAAGATGATGAGTCCATTGTCCATCACACTGC CAGTGTTGGTGATGACGAGGTAATGAGGCTAAGAATAGAACTATGTATTT GAATTTCATTTTTCTTTTGAGCCGATTTATGCTTTGCAAGTTTGCATATG GTTCTATAATATGTTGGCTTTAAACTGAATAGTTTTACTTGATCATTGTC CATTGGGACAATAAATACTATAAGTACACGAATGCGCTGCAACGGATTAA TTTTGTACAGTTTATGTTAAAAGAGAAAGGTGTACTATTGTTTACCATCT CAGAACCATCCATCCTTGCTTTCATCTCAGTGGTCTGTACCAAAACAGCG TGGCTGACAATTAATGGACGGCCACCACTGGTTGAGATCTTTATAGGAAA GTTGGTGTTTCACTGTATAGTTTACTTACCCTGTGTCCATTTTGACCATA ATTACTACAGTTCTTTAAGGAATTGTTTGGGCGATTCTAGTTGGAACACT GATTACTGTAGCTTACTACTCCCTCTGTTCCATATTAACTGTCGCAGATT TGTCTTGATACTTATGTATCTAGATGCGTTTTGGTGTGTAGAGTTATGCG AATCTACACAAATCGGTGACAGTTAATATGGAGTGGAGGTAGCAGCTTTT ATGATGTACACTTCTGAATGGTTGAACCAACCTTATGTTGGTAATTGGAG AAACAAGAGGCTCTTGGCGTGTAGTAACTAGTATGTGTTCATTTGTATGG TCAACAAATATGGCCAAGGCTAGAAAGGCCTGTCTTGGCCATAGGCTGAG GTTTAGGGCAACTGGCGAGGTCCGCAGGTGAGAATTAATCCCCCTGTCGA GGACTCGACCTTCCTGGCAAAGATTTGACGGCCTATTGTAGCGAGGGGTC GAACTTCGCCAGCTGGCCATTGTCACTGCAGGGAGGGAGTGAGAGGACGA GGGCGAGAAGTTGCATGGTGGAGAAACCCCAAGTTTTGGTGTTCTTTTCC ATATATGTTCTTTTGAGATACATAGCCAGTGCTTTAATGGGCTAGGTCAG CCCATCTAGCTTATTTGTCTTTGTCCTTCCTATTTTAATTCACACTACAG CCTATCTATGTGTTTTCTTAGACTGCAGTATATTCAGTACAACATGCATA GGCATGCCTAGGCAAGCTAGGCGCTGGATGGAGGAAAAACGTCCAGTCAC TGCCTAGCGCCTTCTTAAACCTTGAATATGCCAGCTTGCAATCTACTCCC CATTGCATCTTCCACAGATTGATCTGCTATTCTTGCCAAACAATTAAGTT CTGTGGCGTAATCTCATGTGGAGCATACGATGGTGCGCCGAGTGTTCACA CTTAGCATGATCACAAAAATGATGCCCTTTTTGTTGGATGTATATGGGGT TATGCAACTATGAATCTAACATCATCTCCATTTATAGTCTTGACGATTGC TGTTTTCATTACTCCCTCCGACCCATATTAGTTGACTTAGATTTGTCAAA ATTTGGATGAATCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTTATCCAAATCTAG ACAAATGTGAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGTACAAAAATCATCTT TTCTTGTTTTTTAAATATAGCTGCTACTATTGTTTCTATTGAATTTGTTA TTGGACCTTTTATTTTACAAGTTAAGTCATCCAATAGGGTCTGAAGAAGG CTCTAGATGGTGGAGCAGACAAGGATGAAGAAGACTCTGAGGGAAGAAGG GCCATACATTTTGCATGTGGATATGGTGAGGTATGAAGATCTGCTCATTG CTCAACCCTCTTAGAATGTAACGATAATCCAGTAACTAAGCTTGTATATG TGACAAATATCAAGTTGATACTAATTTTTGCTTTGTTATTGCCATGAAAA ATGATACCAGTGGAAGTTTTATAGATATTTATCTAAATTTTTATAGTTAC TGTTTGGTAACCAGCTAGGCTTTGAGTAATGAGCTCTTTTGCCACTGAAT AATGCGCTTGTTTCAGGATTAAGTATACCTAGCTTAATTTATTTAGTTTC AAAGATTATACAAGTTTTACCATTTTTTCTCATTTTGCTTTTAAGCATGT TATATAGTTATGGGTAAAATGGAGAACTAAAAAACTTGCTGATTATGATT ATTAGTCAGAAGCAGATTAGTTCAGCTTCAGTTCATTGAATGTGCCTAGT AATCTCTGTGATGAGTCACACTACAGTATATTACATTAGCAAACTATATC GTTAGCCATCACAACTAACTTGCCAGGAGCTGGTCTCTCAAAAACCTTGC CAGGAGCTGGTAATGCTCACCTACCTACCTATATAATTGGTCCTGTGCCA TTGTCTCAGACTGCATGTTTCCTGATCCAGCCGTTCAAATTTTGCATTAA GCTGTCTTTAGGAATGTCAGTTTTGATGGCCATATTCAATGTTGGAACGC AAAATATATGAATGGCATACTATCATCTGCTGTTTTCTGTAGCCTATGTT ACATTGGTAGCTGTATTTTTACTTGGTATGTGTTAATTTAAATTTCAGTT CAAGTGTGCGCAAATCCTCCTCGAGGCTGGTGCTGCAGTAGATGCTGTGG ATAAGAACAAGAACACCCCACTGCATTACGCCGCTGGCTATGGCCGGAAA GAGTGTGTGGATCTTCTGCTGAAGCACGGTGCTGCTGTGTAAGTTCAATC TGCTCTGTTCTCCCCTTTGCAGAGTATGGTCCTTTGATGCTTATTTGACT GGACCTCCAATGCCCTTCAGCACGCTCCAAAACATGGACGGGAAGACGCC CATCGACGTTGCCAAGCTCAACAACCAGAATGAGGTCCTCACGCTGCTCG AGAAGGACGCGTTCCTGTAAATCGCCTCACTTGGCTCCCATGGATTTTTA GCTCCATCATATTTTACATCCCTTGGCATTGGTTGGATAGTCAAATACTC GAAACAGTCATTTCATTCTTTGTGTAAGAATCTGCTACGTGTGCTAGCTA AGCCTGCAGGCATACTGGCTTAGGTTAGAGCTGCACGGTGACTTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.