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GrainGenes Sequence Report: AA037150

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Sequence
AA037150
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA037150
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCCCCCGCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTGTCTCACGCGCACCGCCACTC
CCACTCCACCCCTCCCACGCTCTCCCTCTCCCTCCTCCCACCGAACCACC
CCCACCCACCAGCACAGCACACACCTAGACAGTGTTGCATACTCTTCTTC
CTCAACTCAAAACACAACAGAAAACAATAAAATCAACAACACTGCAGAGG
AGAAGCGAATAAATAAACAATAAAATTCTCCCTAGCAGCTGCCGCCGTCG
CCGTCGCCGAAGGGGAAAAGGAGGAGGGGGAGGACGACCACCGGGCGGCT
CGCCGCCTCCAGCACGAGCCGCGGCGTGCTGCCGCCACACGGCCTCAGGC
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TGGTGCTGGAGCTGGTGGCCGTGGCGGCGGCAGCGGCGGCGGTTGGCTGG
TGGCCGGCAGGGCGATGGCGCCGGCGAGGAGGAAGCGCGGCATGTCCGCG
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GGGGGACTCTGGAGTTAGCTTGCTTAGGGTTTCGTTCCAGGGTGGAAATC
CCAGCTTGTGGGGCAGCTGCGTCGCCATATTGGCTAAATCTGTAGGTTGT
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CTGGGCATAGATAACATGTGCGCTTAGAGGTTTTCTAGTTACATGTATGC
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TGACTTTAGACTATTTCTCGGAGAGAGTAAGTTTCACATTATATGACCCC
CCCTCCCCCTCACTATTGTTGGGTGCTTGCTTGTAGCTTCAGTTGGGAAC
TTGGGATAGCTCTATTTTCTTGAGGGAAAATTTGGTGGGATAGCTCTGTA
ACTGCTTTGTAGGCTCCTTCTATTCTGTTTTCCCCTCATTTTAATGTTTG
GCTTGCATATCGCCTCATTTAAATCGGGCTTGCACATGAGATAATGTACG
GATGAACATACAATTTGTACTACAGAGTTTATCTCATTTTGAATTTGCAT
TCTTTGCAGATAAGTGAACCAGAGCAGTGGGGTCTGGCTTCTGTTAAAAA
TAAGCGGCTGGTCTACTTCTATGGAACTAAACAGATGTAAGTTCTATTTA
TAGACTGAAGAGTTCTTCTACTTTTTGGAATTCATATGATGCTTTTGTAT
CTACCAGACAGCATCTGCGTAGAAACACCATATTGTGTTAGTGTTGATTA
GAAATAATATTACAGTTTTTCATCAAAAGTAACAATATTTTGTTTAAAAA
ACTAGGACATTATCTCTAGTTAAAAGGAGTCCAATGGAGTGTTGATTTCT
CAGAACTATAATAAAATATGTCAGAGAACGACGGTTCATAATTACTTTAT
ACTCATGTTGTACCGGAGCCACCTTTTGCGTGTTAGAATGTACTAAATGC
CACTAGATGAGATGAGAAGGAATCATGCAGCTTTCAGAGTGTTATAGCCT
GTGTACTACATTTGACCCAATACGCTGAGAGAATTGCAGCATAGTTATGG
AAATTGGAAATACTGGGGGCAGTATCAATAACAAAAAATGTGGACTACCA
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TAACTCGGCAGGGTTAGCTGTACATACTACAGAGAATGTCTTATGGAACT
GAGTTACCTTAACTAAGACAAGTAATCTGTTTTTTTTTTTCATATCTGAC
TGCTGGTTCTTTTTACTCCAGTGCTTTCTGCAACTATGCAGAACTGGAGG
CGTTCACTGAAGAGAAAAGGAGGTCTCTGTTTGCTAAGCGACATGGCAAA
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TTTGAAGGAAGATAATAACGAGAAGCTTGATCTGACTGCCAATGAAGCAA
AGCCAGGTGAAGAAAATCCTGGTGATAATAATGGCATGCTGGATACTCAA
GGTCTAGTTAAGAGCTCAAATATTGATAGTGATAAAAAGTTAGAAGACCA
TGCAGTCATTGTAGCAGATCGCAACTTAGTCAATGCTAATGAGCCAACAA
GGAGTGCACGATGCGTTGTAAATTCTGCTCCTGACGGGCTTACTGAAAAT
ATATCGATGCTTGACGAAATGAGGAATATCCCTTTGTCTGCTACTTCATT
TTCGAAGAAGCCAAGGGATGCACACCCTCAGAATTGCTACACACGGAGTA
GGGCTCCGGCTTTGCGGAGGTCAAGAAGTTCATTAGTTGTTGGAATCAGA
AAGGCTCAGGATTCTTGCAAGCATTCGGGTGAAACCAGTTTGGCTTCTGT
TGATTTGGTTCCTGATGACAACAAGGAAGATCCCAATCTTCATAAGTACG
CACTGAATGACAAAGCAAACTCAGATTCCCCTTCTATGCTTGATGATCTT
TGCTATCATTCAAGCGGAGGCACCTTCAATCAACCTGGAACTCCTGGTGC
CAGTGACAGTAATAAAAATTTGTCTTCTACTCCTAAGGTAGATAATACCT
GTGACAGTGAAGCATCTCAAAATGGAGCTTCAACGACAGAGTTTAATTCT
AATGGTGCATCAAGTCTTCCCATGAAGTCAGCGATAATTTTCAAGAGGAA
AAGGAAGCCAGATAGAAACTGGGTTTCCGATACTGCAGATTGTATAACAC
CAAATAAGGATGAAGAATTGCAGGATGAGTTGAGTGGAAACCTTGGGGAT
TCTCCAAATTCAAAGAATGAATTAAATAAGTCAGACGGAGATGAACACTT
GCCATTGGTCAAAAGGGCAAGGGTTCGAATGGGAAGGCCTCAGCTGGAGG
CTTCACCAGGGACAGTTGAACAGGTTGATGTTCCTAATAATAGATCAGGG
CTTGCTGAACCTGCAGACCACAGTGTTATGCATATTAGTAATGTCTTTTC
AGCTGATCAGTCATCAGTGGTAAATAGTGTTCCAAATCTTTCATCCATAT
TGGACATGCCTCTCCCATCAGGGGAAGGTCACTCTGTTTGGAAGAATAAA
GAATACCAACCAAGGGTTTTAACATTGGATGTGGAAGCTGCTTTGCCTCC
ATCAAAACGGCTCCATCGTGCTTTAGAAGCTATGTCTGCTAATGTTGCGG
AAACTATTAGTAGCCTGCCTAAAGAGACAGGATCAAAGCAATTGACCCTA
AGTGGCTGCGTGTCTTCAGAAAACAGCCATTCCAATAAATCGTCTGATGC
AGTGATCACAACCCCCAACAGATCTGGAATAATTGAAGGCCTTGGATCAT
CAGGCATGCAATTCATGCATAGCTCAGCAGGCAAAACACACACCTCAGGA
TCAACTTTGCAGAATAATAGTGTAGTTGTTTCCATGAAATTGAGTGAGCC
TGCTCTTGATGTGACAGTGACACAGACCATAGCTTTGCCTGATCTGTTAT
CTTCATCTTCGGGGAAACCATGTAATGCTGTCTCCAAGCTAACTAGCTGC
AGTAGTAATACAAAACCACTTGGCTGCCCTACTTTTGAGGTCAGCAGAAG
TTCTGAGATATGTGGTGAGCCAGTTGACCCACCAAAGCTTCTGTCTGATA
ATAATGTGAGCAGTGATTCAGTACCACATGGTGAAACTGTTTTAGCATCA
GCAACTAATTTGGGCGATACAACAAGTAACTCTTCATTGGCTACCAAATC
TTCTAGTATACAGTCTGATGCAGATACCCGAACATCTGAAGTGTAAGCTC
TGTCTTTCATGCCAAAGTAAATCTTTGCTTGTGTATGCACAATTTTTTTG
TTCACTTCGATATGTTCCGTATCGTCGTGTATCATCTTTCTGGAAACATT
ATATGACACCTGTTATTTCTGTCATGATCATGTTTCTGTTAAGTTATGTG
TTACTATCACTTTTCCTTCTTTGTAGCGATGCTACCATGTTACGGATAGT
TATTTACCCTGAAGTCTACCTTTGAAGCTGCATGCTTAGATAGACAATGA
TTATATAAACTAGATAAAAAAAGATGGTGGGGCTTGAAATATGCAATTAC
CGTATTAGGCATATCTATAATAATATAAAAAGATAGGCATAAATCGTATT
TTATATTTTTTGTGTTTATCTCTAACTCGAGGTACAGTAATGCACTCTCC
CAGGGTGGGCCATCTTAACAAGAGGTCCAACAATGCAAGACCCTAGTGTG
GGCCCTTCGCTCAGGCTCAGATGAATTGTGCTTCAGTAGCTTATTGTGGA
GATGGGATCCGTCGTACACATTATTCACAATATCTGCGGGGGTTTAAAAA
TTTGCCTCATCCATGTGACTCAATCTATTCAGTGGCTAACGTTGAAAGTT
TGCATGATTGCACCCAAATGGGTTTGCTTTAGGTTATTATTGATGGTGGA
AGGAAATGCCATTTTGCAAATCATATTGAAACAAGTTGTCATTTGGGTTT
GTGATAGAGATCGAAAGAGAAGAGGTTGGCACTTGCCAAGAGGTCTAGTA
TTCCTATTCCTTGGGAATATTAAATATGTAGTAATTATTAAGGCCGAGAC
ATATGATTTTCCATGAGTCTGAGCATTATATGTAGTTTGATTGTATTCAT
ACACATGAAGAAGCTGTAGTGATGTGGCCCTCTGGCGCCATAGTCTCAGT
TTGTATTCCGATTTATTATGGAGTTAAAGCTTACAGTATACCTAAAAAGG
AAAGGCTTATTAGTTTTAAACTGTCATACACCAATCACCAATGCACGTAT
TACAGGTCATACTGATTTAATATAAGATCCATGCCCTGCTCGAAACTGAG
GAAATTTGTTGGAAGGAGCATCAATTAATAATTATCACTAATGCTGCTTT
CAGTATGATGTTCGTAATGCACTGCTTCTAGTTATGAAATAGTTTGGATG
AGTAATATCACTGGCATTTCGGATGCAGTTGCTGATGAGAAGCATATTAA
TTCTGTATTCCTATGTAAAGTTGATTCTATGAGTTGGATTCTCCAAATTT
CCTGTGCAGATTTGATGCTTCATGAGTTGGATTTTCTGAAGCACATACTG
GTTCCCCTGATCCTACAAAAAACTCAATATTCTCCTTGTAATTAGCCAGT
CGAAGTGATGATTGAACTCTTTCACTTAAAGGAAACTGTGACTCATAACT
AATATAATACTCTGTACATTCTAGATGCAACTCCAGTAATTTGAGTTGAA
TATATCTTGGATATGGTCCAAAAATGCACAGTTATCTTTGCTGTATCTGA
TTTTTCTTTATTCTAGCTTCTAGTTGGTGCTTGTATTAATGCAGTCTGGA
AAGGCATGATGATACTTACTTTGTCTTCAGGCACACCTCAGCTTTGGCAT
TAAAAGAACTGAACCACAGAAACCTGAAGGATAGGTGCACGTCTCCAGAT
TCAATGCCTATGAAAGAACTCATTGCTGTTGCCCAAGCTAGAAGGTTCTC
TCGATCAACTTCCTTTTCAGATAATTTGTTGATCGGCAAGTATATTGCAA
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TCGAATCGGATAATCAGGCGCACCTCTACAAATGACATCATTAATTCCAA
GACTCTTTCTGATAGCCTGCAACATAACGACGTGAAAATAATAGCAGGGA
GCTGTGAGGCTAGTGCAGCACGAAAGGCTTTTGGAGCTTTTCTTGGTACT
CTGACAAGAACAAAAGAAAACATAGCTCGTGCAACGCGTCTTGCTATTGA
TTGCGCTAAACATGGCATTGCTGGAGAGGTTAGACCATGCATATCTTTTG
TTGCGACATCTAGATCTTTGCTATATGCTCTTTTTAAGGGTTATCATCAT
TTTTCTTGTTTGGCAATTATTTGGTGCTTGGTTCTCTTATCCTGGTTTAT
GTTCTTCATGCCAATCACAAGCTGTTCTATATATGTGCCGTGGGGTATGA
CTGGGTAGATCAGTGATGGCACATAGTTGTGCTACCAAGCAACCCGGGTT
CGATCCCACCTTCTTAAGAATAACTAGTGATAATGTGTGCAGTCGTAGCA
TTATTTACCAATTCTAAGTTGGATAACATATCTTATTTTTAACAACATCA
TGCTGTCTTCAGCTTGCCAAGAAAAAGACAAACATGGTCGTCCATGAAAC
CAATCAAGCATTTTAACACTGTTTTTCCTCCATTGTTTAGGCGATTGATA
TTATTGTTGAACACATGGAGAAGGAAACGAATTTATATAAGAGGGTGGAC
CTTTTCTTTCTTGTTGATTCAATAACTCAATGCTCTCGTAATCAGAAAGG
TAACTATATGCCCTTCTCATAATTTTCTTGTTGTCTTTGTATGAGTCTTA
ATCTTCAATACTGTAGGAAATTTTGCAGGTGGTCCTGGAGATCTATACCC
CTCTCTTATTCAAGCAATTTTGCCTCGATTACTTTATGCTGTTGCACCAC
CTGGAAATTCAGCATGGGAAAATCGAAGGCAATGTCTCAAGGCAAGTGCC
TTCATTAGTCTGGTAGAATAGATGCCATGTGCAGTGTTCCTTTCCCATCC
CTTACAAGTTTGTGATTTGATCTCTAGGTTTTGAAACTTTGGCTTGAGAG
GAAAACACTTCCAGAATATGTCATTCGTCATCATATTAGAGAACTTGAGG
TTATTAACGAGGCATCATTTGGAAGCTCTCGGCACCCTTCAAGGACAGAA
AGAGCTTTAAATGACCCTTTGCGTGACAATGAAGGGATGCTTGTTGATGA
GTATGGGAGGTATGCTTGTCAAACTGAAAAATTCCCCAAGCGGACCTGTA
TTTTTATTGCATTAAATAATGGTTTTAACTTGAGTGAACTGTAATAGTGG
AACATGTTTCTGTTGTTCATATGTTTATGTGCTTGCACAATTAAGATGAT
GACTAGATGAGATAGTCCAAAAATAAAATGGATCATCACGAAAGCTCTTG
GTAGGCCAGGTCAGTGTAGGAGGTTAGCGTATGCTTTATGCATATATGGT
CATGTCCTTGTTGTCATGCATGAAAGAGCTATCTTTGTTTTGAGAGCCAT
GGTCTAAACATCGGAACCAGGTAAAATTGCAGCCAGTACACATGTGCACT
TTTAGAATTCTGAGCACTGAGTATTTTGTAAGCATTGGGCCTTGGCTGAT
CTGTTTAGCAGCGAGCTATGATGGATTAACAATACTGGCATCCAGCTAGC
AAGTATTTTGATAAAACCCGATAAAACCCACAAACATTCAATTGAACTCC
CGTCTTTTTCGCTATGCTAGCACATTTGCTAGAAAATGCGAAGAATTATC
ACTGGATTATTAGGGAGAGGACTCTGTAAAGTTGCTTCATGTTGAACAAT
TTTTAATGCACACCCTTAATAATATGTGTGGCATAAATCTATTGATACAT
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GCAACATTGCAGTGTGGCACTGGCATCATATGTGGCTTATTTCGTGATTT
GGTGCTAAGAGAGCCTTTATTTTAATTCTCATTACATTAGTATAGAAAAT
TACAATTACACGTATTCAACTATGCAGCAGCATCTTTTGTTTGATGGAAT
TGTTCCCTCTAGTTTCCTATGTTTATACGTTTCATTATTTTCCTCAGCAA
TGCTGGTTTTCACATACCAAACTTAATTTGCACGAAAGTACTTGAGGACG
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CAGGATGCTCCAGGTGGTGATGAGAAGGAAGAATCTCAAATGCCTGTGGA
GAAGCATCGGCTCATCCTTGAAGAAGTTGATGGTGAGCTTGAGATGGAGG
ATGTATCTCCACCATCTGAAGCTGAAGCTAGTACCTTACGCCAACCAGAC
CGGAGTGATACCAACTGCGCAACATCTTATCAACATCCTTCGGATACCGG
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CTCCTCCACCTGTTCCCATAGCTCAGAGTACGCAGTTGCAAACAACTTTA
CAAATGGCATCTGATCCAGTTGGGCCACATCCTCCAGTAGCTACCAATGT
ATGCTAAGTTTCTCCCAGTGCAGACATTAGCCTTGTTATGTTGTGAAATT
AATCTCCCCTTTATTTTTGCAGAATGTTCAAAGTCAGCAGCCGCATCCTA
TTGTGGAGCATCCACGCAGCATGAATTCTTCTGTAGCTCCATTGCAGCCT
CCGTTCTGTAATTCTGCACATGCTGTGCATCAAAATCAGATTGCACCACT
CAATCCTCCTGGACCCCATAGCAATTTCCCTACACCACCAGCACCATACC
ACGGAAATAACTATCATCAACACCCAACTGCATCAACGCCTAATGGGGGA
TATCATTTGCAACGACCACCCCCTCCACCTCCTCCAAATCAATTCCCTCA
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ATGGGCATGATCGAGATCATCAGAGACACGATAGCATGCATCACGGGCAT
GATAGAAGACCCCACTTCAGTGATAGAAGATATCGCCACGATGACAGAGG
TCACCACTTTGATGAGAGAGCTATTAGGGGGCCGATGCACCATGATGCTG
ACAGAGGAAGATTTCCTCCTTTTCCACCAGGTACTTTTCTTATTTGGCAT
GCTCATATCATCACTTCATGGAACACTCCTGGGATGCAATGGTGGGCGCA
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AAGTGTGGTTGGATTAAGTCTTATTCCCCTCATGTAAATAAATAAAATAA
ATACATAAACGATCAAATCATGAGCCTTTTCTTACTAGCATTTTCAAAAA
TAATTTCGAGATATGCAGTTCCATCAGGAAAACTAGTTACTGGTACTTTT
TTCACCTAATGAACTGTTCTATTATCACCCAGTATCAAGTTGATTTCATT
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GGGTGGTCTAGGGAGCCTCCAGTTCCTCATGTAGGAGGAGGTAGGTTACA
GTTCATGCGCCATTTTTCTTTTTTCAATTCTGAGTTGCATCTCTCTGTTC
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CTTTAGTGAAATATTAGCTGAGGGAAGCCACGAAAGAGAAATTATGTTGT
TTATCCTGTGACCATTATGTTTTTGTAAACATCTGTGTGCTGGGCCTGGT
CAGTAAAACAATTTTAATTCTTCAGTGAAATATTAGCCGAGGGAAGATCT
GTTTGATCTGGGACCATAATTTGCACTTCCATTTTCCTTGGTTGTGAAAA
GAGTAAACCGCACCAGCGGTCCTAATTCTTTTCCCGTGCCTTCACTTTAG
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GTCACGCGAGGTCCTAAACCGGTTTGACCCAAGTTGACCAGTGCCACGTC
AACAATAGGGCCCATGACGCATATAAGCCACCCTGCATATTTGCTAATAG
CCCCCCAATATTGTTTTCTTCCAAAATTCGGTCCCTGTGGAGTTGGACTT
GGCCCATTCGGCCCCACCCAGCACCCCACTTATCCTTGTCTTACCTGGCT
CCCACCATCGGTGTGACACCCTCCAGCCCTTGACCTTGTGCGATGAGGTA
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GTTGTGCCCTGGTGGATTTGACTGCCCCTGACGGTGGAGGTGGACTCCCG
GAGTACGTGCCAATGCAACAAGCAGAGTGCCTCGTACAGGAGCGTGCTGC
AGAAGGAAGCTTGACGGAGGGGATGTCGGCTGCAGGGGTGCGCTACGGCA
GGGATGTAGCGTCGGGCGCGTGCTGCGGCCAGGATGCCGGCGAGGGGAGC
AACATTGCAGAGGGGACCGCAACGGAGGCGCCCGCTATTGAGGGGATACC
GGCGACAGGGGCGTGCAGTACTAAGGTTTCCCGGCGAGGAAGAAGGAGAG
GAGAGGTCGGGTCAGGCGATGATGTGACCTTCATTGGAGCAGCACCTCCG
TCAACGGTCTCCTTCTAAAAGATTAAATTGCCATAGAGGGGTAGGAAAAA
ATGACATGTTATTTGGAAGGAATACAAATGGGAGGGCCTTTTTGCAAATA
TACAAGTCTAGTCGGGTCCCGCTGTCGACGTGGCACTGGTCAACTCAGGT
CAAACCTGTTTAGGACCTCGCGTGACTCAATTCTGAAAGATTTAGGATCT
AGACATGTAATTTTAAAGAATTAGGACCAAAGTGAAGGCACATGAAAAGA
ATTAGGACCGCTGATGCGGTTTACTCTTGTGAAAACATCTATGATGGGCC
TGATCACACTTCCTCCCATTTATTTTTTTGTTTTGCACTACATAAAATGT
TTGCTTTAACAAGATGTGGTTTGCTTAGAAATACCGTGTAAGATGTGGAA
GTACGAAATGAGCAGTTCCACACATCTCCTCAGGTTATTATGAAGTTGAC
TATATTAAATGTATCTCTTTTATGCAGCACATGGTAGCTGGAGGCCAAGA
TAACACTTCACTATGTTTGAAGGGAGGCCAAGATAACATTTTACTATGTT
TGGAGGGTAAGCTATTTGTTCCGTTGCTCCAACACCTGCCACCCTGTACA
TATGGTAGGGTCATACCTTGTAGCGCGCAGAAGCGGGAGGTGGAGGGCTA
TATTTGCAGGGATAGGCTGTCATGTGTCAATCTTAACCAAACATTGTACT
GTTAGCCTAGCAGTATTGAGTGCCATTCGTCGAGTCTTCATTGTTTTGTA
TGTCCATCCCATAACCCCTTCTGTCCTTACTGATAACAGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.