Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA035837

[Submit comment/correction]

Sequence	AA035837
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA035837
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGCCTCGCCCCCCCGCCTCAGCCCGAGAGAGAGAGACCAACACCGACCCG CACGGCAGGCACATCCCCTCACACCCCAACCCCCCCGCCTCCTTCCATTC CCCTCCCCCACGCCGGCCACTTCCCATCGCTGCGCCCCCGCTCCCCCAAC CCCGCCGCCTCTGCCCCGCCCGCCCAGCGGCCGGACCGATCCGTCGCCTG CCTAGGGTTTTGCCCCGCCCGCCTCCCGCGCCCCCACCGATTCGGCTCGA TTCGCGCTGCTCCGGCCCGCCGCCGCCGGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTT CTGCGCGTCCTGCGGCCAGCCCCCCTCGTGTTTGGAGCTAGGGTATCTGC TCGCCGCATTGGTTGGCGCACGCATCGCGATGGTGCCCAACGGGCTCCTG CCCAATGCATCGGCGGGGGTGACCAGGCGCCTCGACCCCGAGCGGTGGGC CATCGCCGAGTCCAGGACCGCCGAGCTGATCGCGCACATCCAGCCCAACG CCTACTCCGAGGGCCGGAGGGGTGCTGTCTACAACTACGTGCAGCGCCTC ATCATGAACTGCCTCTCCTGCCAGGTATATACTGACACTTTCCGAAGGGA TCGATTGCTCCAATGCTCTGAGAAGTAACATAGATTAGTGGCTCGCAGTG TCTCCCACTCTCTTCCGGAGTGCGTCCGCATACATGGAGTTAGTCAAGTT GTTTATGCTAGGTTTGCTCCTGCCATTGCTGTATGGGACTATTGGTAGCT AAATAAAGGTCGTGTGGTTATGCGATTGACACAGTCAAATGGACCATAAC TATAATTATCATCTCTCCAAAAGTTGTCTGCCTGAGCAGCAAAGCTCATT ATACTAATTTACTCACACCCCAGAGGCTGTGTGCCTGAGCAGCAAAGCAG ACCATTATTCACACAGAAAATGGTGTATTATCTTATCGCTACTCAATAAC ATTTACGTGTCCTTATTTGGTTTACTCTTACCTAACCTGTTTGCAAGCTT TGAGTTCTTATACAATTTATATTGGGAGAAGAGTACGACCTTACGAACTT TGTAGCACACCATTTCTGTGTGCGATATAGCATACTAGTACATACCATGT TAATGAAGGCTCATGGAACTACACCATTGACCTTTAGTATAAGGCGATGG TACAATACACAAAACAGGCATCTCTTACTCGAGAAGATATTTAGTAATCC TGTTCTGTAGTACTAATTCAGTTTCCACGGGGTGCCCTACTTACTGGCAT TACCTGATGGTACAAGCATTTGTACTAGGTACATTGGGAGATGTCAGTGT TAAGGTAGTTTCTTGTTTCTTAGAAATTGGAAATAAAGTGGTTCAGTTGT TTGCTTTCCTTAAACAATTTTTATTTGTGCTAACATCTTGCCATTTTCCT GGTCCTACCTTTTTTGTGTGTGTCCCAAACATATCGTTTCTGCTGATTAT ATGTGCTTGAAATTGAATTGATCTCTTCCCCTTCAGGTTTTCACTTTTGG ATCAGTCCCTCTGAAGACTTACTTACCGGATGGTGACATTGATGTCACTG CTTTCAGTAATAGTGATGAATTGAAGGATACCTGGGCAAATCTTGTTCGG GATGCTTTGGAGCATGAAGAGAAAAATGAAAATGCTGAATTCTGTGTGAA AGAAGTTCAGTATATTCAGGCGGAGGTAGTCTCTCTCTGACAAGTTAGAT ATGATATTATGCCATAGTTAATTCTTTCTGTACATACAGGGCTCTCTTTT TAGTAACTATATACCTGCGGCAGTGTTGAATTAACAAGTTTGCCTGCACA CATTTATGTGTTATAAAATTACTATTGGGACTCCATCGCTGTATTTTGAT TTGTTCCACATGGGTCCGAGTATAACTGAATACAGACAACTCATCTAAAG TGGTAGTTCAGTTTATTCATGCATGCGTTCTCCCTTCCATTTAACTGAAA TCCTGGGGATTCACACATCTGTGGAAATTCTGATCGCGTTAGAATATTCT GGCACCCTCAGTCCCTTTGCGAGATATGTGATGCGGAGTTAGGCTAATCA CTGCAGTAAGATATGCTAACCTATTATACCTCAGTGCAGACATTTAGGTG GATTGCTAATGGAAAAAATACTTCTAACTAACTTCTAGTTCTCAGAATAG TGAATATGCATTCTTCTATTTATGTTATTTGTTTTATAAATTCCGCCTTA TTACATATATCATGCTATCTTTTGTCTTCATCCATATTGTACCATTCTCA TATATTTCGTGAATCATGCACAGGTAAAGCTTATCAAGTGTCTTGTGGAC AACATTGTTGTTGATATCTCATTTAATCAAGTTGGTGGATTGTGTACGCT TTGTTTCCTTGAACAGGTGTGTTCTCTTGTTCAGATCAACTGAATGTGTA TACTATATGCAAATGACCTGCTGGAATCATTTCTTTCTGTATATCAGTAG TTAATACTATCAAATGTACATTGTTGACTTCGTGGGTATGCTTATCACAC ATAGGTTCCAGGATCAAAGATATTTGACTTTTCTGCCTAATACTTGCTTG TAATGAATCTACATTTTATTAGGTTGACAACTTGATTAATCAAAACCATT TATTCAAGAGGAGTATCATATTGGTAAAGGCATGGTGTTTCTATGAGAGT CGTATTCTTGGAGCCCACCATGGTCTTATTTCTACTTACGCATTGGAGAC CCTGGTTCTGTACATTTTTCATGTGTTCAACAACTGTTTTACTGGGCCAC TCGAGGTAACTTTCCTCTCTTGCATTTTACTACCCTGGTATGAAAACGGT GCTCATTTGTTACTTCTTCATTTGCAGGTATTATACCGTTTCTTAGAATT CTTTAGCAACTTTGACTGGGAGAAATTTTGTCTGAGTTTGTGGGGCCCAG TTCCTATAAGTTCACTTCCAGATATGACTGGTAATCTGATATATCTTTCT TAATTTTACTAGTGCTTCATGGTTAATGGAGCATACTTTTTAATAATGTA TTGCTATTTCATGCAGCGGACCCCCCGCGGTTGGACACTGATGATTTGTT GCTGAGCAAGTCCTTCCTGGATAGATGCAATCATCTGTATGGAGTTATGC CTCGCCCCCAGGAAAACCAGGGTCAACCATTTGTTGCAAAGCACTTCAAT GTTATTGATCCATTACGAATAAACAATAACCTTGGAAGAAGTGTTAGTAA AGGTAACTATCAACCTACCTAAAAGAGTCTAATTGAAGCAGACGAATCTA GCAGAGTTCATCCCCGCTGGTTTTGTGCATTTCTATAGTCATACGATGGA CACTATACTTGTGTTTGGATTAAAGATACTTTATAATTCTACATAACCAT ATTGTTACATGCTAATCAATTTATCATATTAAACATCAGAAAAATAATAT GCTCCTGAGAAATTTGGATATGTTCAGATTCTAACTACTGAGATTTTCTA ATAATAAGTTGAATTATCTGGTAAAAATTATGCATAACTGTTATGTACAA ATAATGTGTCCTAACTTTTCAACTGGTGGAAGCTCGCCATTGTGCTGATG TATGTAGAGAAGTATCAGCAAGTACAACTTAGTGCTTACCAAAAGAATTA CCCATCTGTGCACATGCTCCAAATGGTTCTTGCTGTCATGGTTTTAAAGG CGTCTTGTAGGCGTCGCCTAGGCGACGCTTAGGCGTCTGAGCGCTGAAAG ATGGCAGGGCGTCGATGTCGCCTTCGATTCTTGACGAAAGCGTCCAGAAA TCGTCTCAAGGCGTCCAAGTCGTCGCCTATTCAGGTAAAGGCGACGCTGT GGTCGCTTTGGGACGCCATTGCCAGGTCGAGGAAGGTCAGGCGGGGAAAT AGAGCTGGCGGCGGGAAAAGAGAAATTGGGGGCGATTGAGAATTGGGGGC AATTGAGAGGGAAAAGAGAGGAGAGAGGGAGGGGAACTTACCGTGACCTA AATCAGGTCGATTGAGAGAGAGAGGAGCTTCCTCTCCTCTGGCGGCCAGC TCCTGCTCCACCCAGATCTCCTCCTCCTCTGCCGGAATACTCCCTCCTCC GCCAGCCTCCTCCTCTCTGGCCAACCTACCAGGCATCTCCACCCCCTGGC GCAGCCCTTCCCCAGCAGGGTATCAAGGTTTAGGGCTACTGAATTTGTTC TGCCTTATTTGCTCAAACCTGACAAAGGCATCGCCTTGCAACACGCCTTG GGCGCCTAAGCGTTGAGGCGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAG CGCCTGGACGCCTGGGCGCCTTTAAAACCATGCTTGCTGTAGGTATAATT GTTAGGTTTCCCCATTTGTCCAAGCCTGATATAGCTGTGTCAGATATCTG ATTCTTAAACAAAGTCCATCCTTTTCAGCTATGTTGCGTGGATATAGCAA TAACCTACCGTTACCATCGCCTTGTTCACACGGGATACATGCAGTACATG TATCTTCAAGTTTTTATTAAAAAGAAAAGGGTTACTCTAGGGATATTGGC CCAAGCCGAGTTGATGACCTATACCGGAAGAGGGAAGCTGCCACACTTGT CTGCTTGACCCCTCGATCCTTCCACCACGCGGCCCTCCTCAAGGCTGGCA GCTGCATCCTCTAGGATCTATAGGAGAGTTGACACGTTATGACTAAGGGG GAGCTGGGATAGTGAGCCTCTGATCAGCTAGGCTGAGATGATGACTTGAG GAAGCTTGTTAAGCAAGAATGAAAGAGAGAGGTCCATACGGGTTTGTGCG GTCATGTGGGTGGCGGCTGCTGGAGACGTGGGGTTATGGTGTTTTGCGGC TGCCGTAACTGCACTGCCCTTGCTGTGGTGGGCTGAGTCGGCTCTATGGG TGAGCCAGCCCTTTAATCCTTTTTATCCATTATCACTGTTTTGCTGTCTT ATTGATCTTCTACGTGTATTCTGTGTCTAGCATTTCATGTATGTCACTTT ATATTTATATTTTGATTTTGGCGTTCCCCGTATATGTATCCCCATTCTGT GCAATAAACTTCTGCGTAAGTCACATCATGTGGATATAAAAAACTTAATG GGATAACCAAGCTAGTTTGACTCCAAGTAGCCAAACCTTGTAGCCTAATA ACCCAAGTAAATTAGCATTTTGATGCACCAAGCATCCCTTAGATACTGCT GGAAAACAATTTCTTATCCAGCTGGTAAAAGACCTGAACATGCCTTTAAC TGCCACTCTGTGCACATTATCCTATCGGTCTTTGAAGGCAGATGTTAATA ATTGCGATTCTGTATTGTATTGGTTACATTTTTTTGGTTATTTTGAATTG CATTTACCACCTCTTCATACTACTGTTAGTAGTGGGCTTAAGTAAGCTAC TCTTGATGTAGACCTATAATAAAGCATGTGTTGACGGCATACAATGTACT TGTTTAATTAAGATATGGTAACCATCTTATTTTGATTGCTTAGCAATTCA AAACCATAATATGCATTGCTTGTATGTACACACAACCTTGTCGTTGGTCA TTTTGCTGCTGAGATTGATTGTTCTCTTATATACAGTGAATTTATTATAT TTGGCTGTGTTGATATAGAAGTTGAGTTCTTTAAGATAAATAAAAGTACA TCAATTTGTGAACTGTTGATAACCTGTTACTTTTTCAGGCAATTACTTTA GAATACGCAGTGCCTTTTCTTTTGGGGCAAAAAGGCTGGCAAAGTTACTT GAATGTCCAAACGGAGATCTAGTCGCTGAAGTAAACCAGTTCTTTACAAA TACATTGACAAGACATGGGAGTGGCCTTCGTCCTGACGCGCCTACCCCAA ATCTGTCTCCTGAACATGCTCTGAAGGTTGTCCCTGCTGAAGGGTCAAAC AGCCATGAAAGTGTGACAGTGCCCAAGAATAAGACTGAAAAAACTAAACT TCGAGCTAATCAGGACAGTCTCACTGAAGGTTCTCACAGTTATCCTGGAC CTATCTCTCAACCACCTCAGAGAAGTGATCTACATTCTCGAAATTTGCCA AGGACAGCTAATCCTTCAGCTTCTCATGCACAACACCAAAAAGTTTATGC GACAAAACCCAACACCAAGGTCTCTGAGCAGCTTGAAAGAAACAGGTCTG GTGGATCAATGCCCAGTGAAAGGGATGGAAAAATGCCAAATGCTCTCTTT ATCAATGGTCGGAATGGCCAAAACATGTCCCCGTTTGCAAGAACCCAGTC TAGTCCTGAACTGACAGACCCTTCTGTTGAAGGATTTTCTCGTGGAAGGC GGACTAGAGTGGTTGAAATGGAGAAATCTGTCAACAGTGATTACAATAGC AGAAGGAATAACTTGGTTCCAGAAGTGCCTAGCAACCACAGCACTAAGTC TTCACAGGATGAGTCGATGTCTTCCATGAACAGTTCATCTCATCCTAGTG CAAAAGCAGCTTCAGACTCGAATAGTGTTTCGAGCAGCTATCATGAAGAT AATGGTTTCATGACCAACGAAGAACTTCCTTCTGTCTCTGAGGCGTCGGA GATGCAGCATGAGGAACAAGTTCTAGTTAATCTAATGGCATCAGCAAAGT TGCATGGCTTCAACGGACAGGTTCAATTGCCAATGCAATTACCATCTCAT ATGTTAATGCCTCCAACACCTTTTCCTCAAAAAACTTTTGCTGGGATTCC ACCAACTAGCTTAATTGGTAATCAGTGGTTGCACAACATGCAATTTCTCC AAGGATTTGTTCCACCACCTATGACCCATTATACTTACAACCCTAATTTT GCACCAAACACTGATGATGGTAATGAGAGCGAAAAAAGTACCACATCAGA TTCAAATCATGATTCTGGCAACAATAGGTATGAGCATGGTTTTCGGTCGT CAAGAAATATAAACCATGAAGGAAGGGATCCACATGTGCATCATTTTGAT GGCAAGAACCGTTCCTCTTCACCTAATGGTGTATCTGGTGTCCCCTTGGA AAGGCAGATGGAATATACTGTTGAGGATAGTGGAGTAGTAGAAGAAAACT ATACCAACTTGTTTCAAAAGCAAACAAGCAGAGAAGTTGGTAGAAATGTC CCCATGAGTAGTGGAAATTTGAGAACGACTTCACAACCCAGTTCTTCTAA AAGCAAAGCACTGTCAGAGAGTTCCTGGGATGGAGTAGCTGTAAAGACAA CACGAGCTCCGAGGGACAAATGGGAAAAAAAGCCTACCTTTCCAGCGCCT ACCACGACTACACTTAGCATAAGTAAGACTGGTTGGCAGACAGGAAATAC CACCGAGCATGTGCCAACAGAAGTTGATGAAGGAGCCAGGAATGGGGCTG TAGTACCAATCATTAGACATGAAGCTTCTGACATAGTAATAGGGTCTGTC TCATCAGAGCCATCAAGAACTAGTCAAGTACGGAATGAATTTAACACATC ATGGATGCATAATCCAATGTTTGCACCTTTTCTTATAGGTTCCCCTCAGC AGAGGCAAGCTGATAACTCTGGACTGACTTTTGTCCCAACAGGTCCACCA GTTCCTTTTCTTGTGCTTCCATATGTTCCTGGCAGTAGAGATGGATCTGT TCCGCAGTTTGAGGGAAATGAAGGAATTGATCAGTTTCCTGTCAATGTTG CTATTCACAATTTTAGTTCACTCAACGATGTTCACCAGCCTGATAACAAT GCTACCCCAGCGGCATCATCCAGTACTGTAGCTAATCCATCTTATGAGCA CAAGCCAGACATTTTGAACAGTGATATTGATGGCCATTGGCAGAATTTAC AATATGGACGGTTTTGTCAAGATGCACGCCCCCTGGGTCCTGTATTATAC CCTTTTGCAGTGCCTCCAGGGTACATGCAGGGGCATGTTCCATGGGATGG GCCTGGAAGACCACCTTCACCAAATGTCAGCTGGGCACCGATGGTGGGTC CTGGCCAGCGAGCATTTCCTGTGATGCCTCTACAGTCTTCTTCAGAAAGA ATTTCTGGTATTCCTCCACACTATGGGGAGCATGCACCCAGATACCGTGG TGGAACAGGAACCTACTTGCCAAATCCTGTAAGCCCCTAATAAATTGTTC ATTTTTCTTACCTTATTGCGCAGATAACATATTCACTGTTGGTATATTGA AAAATAATAAAGAAGTATGAGCAGTTTACATGCAATATTCAATTGAAGAT ATGCTTCAGCTTGTCATGAATAGAGTTTGGGCCCCAGAAACAGGCAGAGT GTACCATTACCAAGTGGCTGGTTCCAGGATTCTTGTAGTAACTGGTAAAA CCTAGTCAAGAAGTATTAAAAGTAATAGTAACAGGAACCATTTCCTTGGA AGTTTTCCTAGCAATCGATCAACTCAAATACTGTCATTGATCTGCTTCTG CTGTACTGAGCAATCTTTCTTTGTACTTGATGTGGTCTTAATCACTCCGA ATTATAAAATGATGGGGAATTTAGTCATCACTTGTCGCTAAGTGAAAGTA GGAATAATTTCAGTATTCTGATCTGTAGTACACCATGGTGTTAGTCTTAT GGTGAGGATGGAACTTCAGCTAACCGGACTGTGATTGGTCATCAATTGCT GCATGGGAAACTCAAGAGCTTGTTTTGTAGCTGAATTTAAGATATTTCGT GTGATGGGTGGTTTTATACCCCTCCACCGCTTGTGCCTCGAGCGCAACAT AGTTTATCAGGCTATGCTTTATGAACATGATAGTTGCTTTATGAACATGA TAGTATCTTAACTGGGAAATACTAAGCTGTCATTCTGTTCATTGCATTTT CTCAGAAGGTTCCATATAGGGACCGAGAGCGACACCCGAGTTCAAGATAC CACAGAGGAGGTTATAATAGTGATAAGGGTGACAATAGTGATAAAGAAGG AAGTTGGGCAAACTCAAGACAAAGAAGTACAGGCCGCAACTACGGACGTA GCCAACCAGAGAGATACGGCCTGAGGTCTGATAGACAGACCACAGATGAA GGTCAGTTTGACAGGCAGCGGAGATCCCACAGAAATGACTCACACAGGCA TGAGGCAGGTGCTCAATATCTTGTACAGGGACAATCTCTTGGATCCACAA ACTCCACTCGCAAACCAGGGAACATTGCACATGAGGTTTACCCATCACCA TATACAGCTCCAAATGGTGCTGGTGCTTCAGATTCACAGTATTTAATGGT TTACCCATACGAACCAGGTCTAAATCATGGTTCTTCCTCTGAACAGCTTG AATTTGGCTCACTGGGTCCAATACCTATGACAGATGATGGTGATCTACCA TACCCCACTCGCCAAGTAATGGCTAATGGCTTTTATGGGCAAAGACATCA TCCATTTAGGGTTGGTTCCTCTCATTCATCTCCTGATCAACCGTCCTCAC CTCAACCTCGAAGGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.