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GrainGenes Sequence Report: AA046674

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Sequence
AA046674
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046674
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTCGCCGTGCCTCTGACTCGATCTTCAAATTTCTCGCTTTTTTGCAGCA
GTGGTACCCGTTGAGTAGACAGCGGGACAGGACGAGGCTGGACGGGATGA
TAGAGCACCTCATCGTGGCGGCGCGCCAACTTGCTTCTCCCTCCGGGCCC
TGAGCGCGTCTTCGGGACGTGTTTGTATCCGTGTGTGCTAGACTGTGTGG
GAGTTGAGTGTGTTGTGTGTACTTTGTGTTTGGTGCTGTACTTTGTCGCG
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TGCGCATTCTGTTTGACTGGTATGTGGCGTGTTGGTTTTGTATGCAGGTA
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CTGCGCGCCTTGGCTGATGGCTCTGTCGAAGTTGTTGTGGTGAGTTTGTA
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CATAGTGAGGAAGACAGTGTAGTTGCAAAGAGGAATCGACAACTTATGGA
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TGGGTGATTTCTTATAATTATTGGCTGCATTTTGCAGAATACAGTAGTCG
GTTTAATATGGATATTGTTTTAGAGTGTAAAAACACAAACGATCCTAGTG
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AACAGTTCCGCTTTGGGGATTCAGAATGTCTTTCTAGGAAAATATTTGTG
GTTGGAGATGGTATCTATGTATGCCACTATATTTGACGGTTTTTTATTGA
ATATGCTACTGTACTGAGTTGCTATTGGTATTGTTCTTTTAGTTTTTTAG
TTCATGAGAAATCTCTTGATATGAGGATAGCTAAATTAGTATTTTTATAT
ACATGAAGGACTTCGCATATCATTTTGCATGTTCTTCAAATGCCGATGAA
TTGCAATTGCATGTATAGAGTAATTATGGACTATTCCAATATGGTACAAA
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CCCTGTAAATATTAAGGGGATATTGAAAACGTTTATGAAATGAATCATAA
AGTTTCTGTAACATTAAGTGTTTTCTACTTTGTGCCATAGCCATCCCCTT
GTGCATGTGAGTGGTGGATATTTGTATAGTTGTACACCAAAAATGATCCT
TACTCGTTATGTTTTGTCTCTTTTTTGTTTGGAAAATCTGCAAATATATT
TTGTGCAGAAGAGATCCAGTTGTAATTAAATTAAATGCAAACATTGGTGC
TGAGTGCTGACCCATTGCTGAACTCTAACCAGGAAAAGTTTGCAGCAGAG
GGTACATCTGTTCCTGGCATGGCTTGTGGTCAAGTATTAAGTTCACTCGA
TAGTGCTGGTTCTTCTGAGATAAATAACAAGAGAACACATTCTGCTGGTC
CTTTGAAAGATGTAGTCCCATTGACTTTTCGACTCATGCGTGTCCAAGGT
CTTCCATCCTGGACTAACACTTCCGCAGTTACCATTCAGGATGTCATACA
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CGGAGCCAATTCCTTGACCTTTAATAACCATGCGTGAATGTTCTGCTTGT
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CTATTTGCTGTGCTCTCAAATTATATGGTGGACATTGATTGGTTGCTTAC
TGGTAAGTTGTTTATTATGGAAATAAGCTTGTTATAATGTTTATATTGTG
GCAGTTAATGTTCATCTTATGCCAAACTTAAACTTCTGGTCTTTCTTACT
AGACGATTGACACACTTGGTAGGTTCAGAAAATTAAACATGTCTTCTGGC
ATCTTCAGTTATCTGGCTCTACTGTGTGCGCATTATTACAGGACATTAGA
TGGTTTAAATATCCTGTTTATATTGCACCACAAGTTCAACGTATTGGCTG
AATTGAAGTCCCTCCACTATATTGAAAGTTAATTGCGACCTTATTACTGA
ATAATAGTTTTTGTCCAGACTATCGAATTTCGCTGAAGCTTTCTTGATAG
CATTAGTATTCATTGGTGTGAATCTATTTTTTTACTTGGTCGAGTCCTAG
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ATTTGTCTACATTCGCATGTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATACAT
GTGTATCTAGAAAAATCCGCGTCAATTAATTTGGAACGGAGGGAGTACAT
TTTTGTATCCAGACAGTCAGAGTGGCCATTTTCTGTTGGTTCGTTAAGTC
ATTTCTGTTATTGGCTTATTGCCTTGTGACCTTCCTTAAGTTATTTCATG
TGTATGAATGCTGAATGAGCATTCTTCTGAGCTGCTGCAGCTAATCTTTA
AGAATAAAACTTATATGTGTTGATGCATTTGTTAAATATAGTGGATAATG
GTAATGCAAGATAAATGAGTAAGATGTGTGCCATGGAACCGTCCTTATGT
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ATATTGTGAAATACCGATGCGTCTTTTCTCCTCATTATCTATATTATTTT
GTAATGCAATCAGATATTCCATGTTGCAGCATGTCCAAGTCTAAGGAAAG
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TTGAAGGTGGCAAAAATGCTTAAACAATTCATTAGCTTGTTTATTTTCCC
ATTTCATATCCATGCTTGGGTGACAGAAATCGAAGCCTGCTAATTGGATC
CTTCACAAGCCTCCACTCCCAATTTCATTTGGAACACATCATTCGAAGGC
CATGCTGCTTGTATATCCTCAAGGGATTCGTGTTGTTGTTCACACTGCAA
ATTTGATACATGTTGACTGGAATAACAAAAGTCAAGGACTATGGACACAA
GATTTTCCCTGGAAGGATGGCACTGATACGAATACAAATATTTCTTTTGA
GAACGACCTGGTTGATTATCTCAGGGCACTTAAGGTAGCAGGATATTCTA
CGTGCTTCTAGAATATTTAATCCACTGTTGTTTCATCCCATTCATTCTGT
TCAATTAATTAATTGTCATTTTCAGTGTCCTCAAATTTGAAATTTGTTAT
CAGCATGTTAAAAGGAAGGCAGTCACTTGATTTACCAGACAAAGAATGGA
GTAAATATCTATGTGCAGCTTCAAAAATCAAACATTCACAATTGACACTA
GAAACTTGTGTTTGTATCCAGTTGTCTACTTCTACAGAACAAATTTATAT
AAAAAAATATATTAGGAATTTCAGTGTTAGTAAAATACTGTTGGATGAGG
AAATATGCACTTCAGCTTTAAGTCAGATAAAAGTCTAGTAATCGATGGTA
ATACTGACATTATAAACTTATAATAATGACATAGTAGATGGTTCTTATCA
AATCTCTTACCAAAATCAGTGAATCATATATAACAGATGTCTAAGGTTCA
TCATAAAATATGCCTTAAAGAAGTTAAAAGGGTTTCTGTAGAACAGAAAA
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TGTCCCTGAAGTTGGATTTTGACCAACTCTATATTGCCTATGATGATGCA
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ATGCAGCATTTTTTAGGAAATTTGATTATAGTAGCTCAACGGTTGGTATA
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AAAGGAAAAAAAGAAGACTATTGGCTTATCAAATGGAAGTAGAGCTCTGT
CTAAATATCAGTTATTTGACTTCGCATGCTAGGATTCTAGTAAATCTTGT
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GCATTATGTTACCTGTGTGCACTGTGCACTGTGAACCATATACTGCTTCA
TCTGGAAGTCTTCTGTTGTGCCTGTCATTTTGACCAGCTTTACCAGATTC
ATATAAAATGTCTGCATTGTTCCATTTGTTATCCATTTTCAGATCCTGTG
ATTGCGTGCCTTGTACCACTCTGGCAGCTGTTCAAATGATTCTTAGCATG
CATTTTGCTAGATGACTGCATTACATGTTAAAAAGGTGTGATGTGTTATT
TTTTCCTTCAACCCTTGCATGTGCAAGCACCCATTACCTATAAAATATCA
TCTGCTCTTCAATCATCACGAGTGCAAACATATGGCATATCTGACTATCA
TAGCACACATGTAGTTCATATTTTTTCCCCTTACGTTATCATTAATTAGT
CTCAGCTAAGTTCTGCAGGTCAGGCTGATTGGGTCTGTTCCTGGTTATCA
CGTGGGTCCCAATATAAAAAAGTGGGGCCATATGAAGCTTAGGAGTGTTC
TTGAAGAGTGCGTATTTGAAAAGCAATTCTGCAAATCACCACTTATTTAT
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TTGGATAGACGCCACTGCAATTTTCGCGTATTTGAGAAACGCCATTGCAA
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ATGAATGCACCAGACTACAATATATATGATCCAGGTTCACAGTTAACAAT
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GGTAATGCGGTTTGTCATCGTTTACCACTCATGTTTGAGCTTCTTGATGG
ATGCGTAGCATTAATTTCTTTGTGCATGCAGTTTTCTTCTTTGGGGTCAC
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AAAGCTTTATCACCGCGAAATTCCTTCTTCATTTGTGAATGGCCCTTCGT
CGTTTGGTCTTTCTTGACCTTCTTGACTTTGGAGCTTGGTAATATGAGAT
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GTGCCATATGTCACAAGAGGATTTGCTTCGGCTGTTTGGTTTTGTCACAT
GGTAGTCCTGATCAGAAGACTTGTAACTTGGCACTTGGCAGCAAATATAC
ACTGGTTCTTGGTGTTCTTTGGCCTTTATATTGTGGTATAGCCTTTTCCT
AGACCCATTTGTGGTATAGCCTTTAAATTAACCTTTGCCAAAATATAGCA
CTTGAAGAGAAAGCTTTCTATTCCATATTTCCAAGTAACACGGTAGTATG
ACTAAAAGAGCTAATGATGGAGATGTTTTTCTTATAATCCTGCCATACTC
TGTCATGACACCCAATTCAAGCAGATTATTCTGCGTGGTGTAGCTGTGGC
CTTGTGATGTTGAGGTTTACTGGTTTCATCTCATCTGGAGTGCTTGGCAA
AATAAGGTCTTAAAAATCCTTTACTAGGTGGATTTTGCTTTACTTGCAAT
GAATAATCGTAGTATAACCTAAACAATAGAAATTCTTGGTATTAGTATGT
AATATAATGATTATGACTATTCTCTGGACTACTCAGTTACCGTGGGCATC
TTTAGCTGATTACTGATATCGCCTGCAAAAGATGTGCATTGTTACTTTTT
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AGTTATTCAACACTGTCAATTTTGAACCCAGTGCTACTTTCACAGCATGG
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CATCAACCAGCTTTGAAAACCAACATATGGGTGATTTGTACTGATTCTCA
AAGTTGAGGCGGTTAAGAAGCTGGACTTGTAGGGCCTAATCTGGACTCTT
GAAACTAGGAGGGGCGTGGTAAATGGTTTACTTGCCTTTAATCTCGTATA
TCCCCATCAGATGGTTTCTGCTTACGTCATCAAATTTAAGCAAAGCTGCT
TGGGGTGCACTGCAGAAGAACAATACACAGCTGATGATACGGTCATATGA
GGTACCCAATTATGATGCTTGTTGCATTTGTATGGTTTTCTGGCCACACT
AGATTACAGAAATTCAACGAGAAAGCAATGCTTATAAGCATAGGTAGCTG
ACTAATTTAAGAGTTAGCAGAGGGATCATGACTTATACCTTGTCATTTGA
CCTCTTTTCAGTTAGGTGTATTGTTCTTGCCCAAAGCTCTCCAGTCTGTA
CCACAATTTTCATGCACAGAGAAGAACCGCCCAAACCAGGTAGTGCCAAA
TCGTTCCTTCTTATCATTCTATCATCTCTTTGCAAATCAGTCTCTTTCAT
GAGCCTTCATTTCTTGCACTTAAACCCAGGACAAACTTGCCCTTGGTAAG
AGCATAAAAACCAAGCTGGTCACACTTTGCTGGCAAGGCGATGAAGAAAA
GGATCCGTCTGCAGAAGTTGTCAGATTGCCAGTGCCTTATCAACTCCCTC
CACAGCTGTACGGAGCTGAAGGTTAGCTCATGTCACGATGAGAATGATCT
CATATTTTCGGCTGTAAAACCTAAAATGTTGTTTTATTTTCAGATGTCCC
ATGGTCGTGGGATCGGAGGTACACGAAGAAGGATGTGTATGGTTCGGTCT
GGCCGCGCCATGGCTAGCTAAGCTATGCGCCGATGAGGATTGTTCCGTGC
ATTCAGGTTAAGGACATGATTGCTGCTGAAATCATCTGTAGATAGGACCT
GATTTGCCCCTCCCTCCCTGTGTCTTGGCCACTCGGCCAACTCTGAGAAA
CCAGAAGTGATGATGAAACATTTGATTAAGGAAATGCTGGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.