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GrainGenes Sequence Report: AA045497

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Sequence
AA045497
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045497
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAACCCATAGAGGGGAGAGGTGACGGAGACGAGGAAGGGAAGGAAGAAA
GGAGACGAAAGAGGAAGGAGGAGGGGATTGGGACTCGCCGCCCCGCTCCA
AATTCCCCCACTGCTCCACCACCTCCAGCTCCCCGCTGCGGCCGCCCCCG
CCGCCCCAAGTACGGCGAGTGCCAGCAGCCCGTCGTCCTCCTTCCAAAAT
CCTGCCCACCCAATTCCGCCCGGCTCCGAGCTGTTGGCTCCGCCTCGGGG
AGTCCCGAGGGGTGAGAGGAGAAGGAGGGCGGGGGAGATCGGATCGGAGG
GGCCGCGGGCCGGAGTAGCATTGAGCGATGGCCGCCGCATAGGATGCAGC
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TTACCATTGTTCTTTTTATATGATTATAATGCACCACATGCTCATATACC
TGATGTTCCACTCTGAACTTCAACTTTTTATCCCTGCAGCTTGTTACAAG
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GTTTTATGTTGGAAGTTAGAAGTACATATACTTGGAGCACCCATTATGTA
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TACCTTTGGGCAGGTTGCTAAATGCTGGGATGCAGAAACGAATAGCTATG
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GGATTTTTTCCCATGGAAAAATCATTTATGCATAGCGTTTGAAATGCTTG
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TGTGGCAACATAAACTCCAACATTGTAGGTACGAGTTGTTGAAAAAGAAC
AGCTTAAGAGGTTTACAACTGAAATATGTCCGTACTTTCTCAAGACAGGT
TAGGTTTCGTTTTCCTATCTTGTGTGAATGTTGTATGTATTTGTTACAAT
ATTACTTATGATATATTATTTTTAGATATTGGATGCATTGGTTGTCATGA
AAGGTGCTGGCATAATTCATTGTGATCTAAAACCAGAAAATATCCTTATA
ACTCCTAAGTGAGTTGCTTCCCCTCAAAATAAGCACTTTGTTTGAATGCC
TTCTGTATGCTGCCACTTCCAACCATGCTAAGTTTGATGACTGAGGTGAT
CTTGCAGTGGAAAATCAGCAGCTGGAGTTAAAGTAATTGATTTTGGATCA
GCATGCATGGAGGGTAAAACGATTTACTCGTATATTCAGGTATTATTTGA
ACTCACTCTTTTGTGTGAATTTCATTTTATTAAGTTGAATGTATATGAAT
TCAAGCTTGTATATTTTCCTTTTCCAGAGCCGTTATTACAGATCACCTGA
AGTGCTTCTTGGTTATCCGTATCCTTTGGAACATTTCTGTTAGCAAACTT
AATAATAGCCACACCAACATCTTTTAGAATGCATAATCTATGAATTTTAG
CTTGTGGGCTTGCACACTTAACGAATGATAGATATACTACTGCCATTGAT
ATGTGGTCATTTGGCTGTATAGTTGCTGAACTATATATAGGGCTACCTTT
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GTTGAGCCATTTCACTTCAGTTAGTAAATTTCATCAATGTTAGAATAATT
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AAGAGAAGACGAGGTTGAAGCAGTAAGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTT
TTCTTGATTTATTCTGAAGTCCTTCCATGTCCTTTTTATACTACATTTAC
TTATGCATACCCTGTCTAAACCTGCAACACAGAGGGATTCCAAAAAGCCA
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TGCATACCCTTGGAAGAATGTGAATGAGACTGATCTGTCAGGTTTGTTCT
GTGACACTTCTGTTTATTAAGGGTGGGCTTTACCCCTGTTTTACGGTAGA
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TTATTTGTGGTCTCTGTAGTCTGGTAGTGCTGTTTGAACATTAAGTGGCT
GTCATAACATACAAAATCTTGGTTTTCTTACTCTGTTTCTAGGGCTGGCC
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TATTTGCTTCAATCCTGAAGCCGGTGTCACTGAAGTACACACTTATGTGG
ATAGGGTGAAGAGCTTATAACACACACAAACAGTACTAGATGTATTCTTT
AATAATTGGATCCAATGTTTGTAATTTGGGTCCAGTACCTTTTGGGGGAA
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TATTGCATAGGGAGTGGTTCCTTGAATGATAATATCACCGTCCTTACACT
GAAGTTGCTAATTGAACCCTATGTATTTTGACACAGAGGCTGAAAAGGCA
GATTGCTTAGCATTGGTTGATTTCTTGAGAGGACTTGTTGAGTTTGATCC
TAATAAGCGGTGGTCACCGTTGCAGGTATTGGCTAATGATTAATTGTCCC
TCTGGAATTTGTTGGGAATCCTAGGAAATGTCGAGTAGTTTGATTTCTAT
GAGCACTAGTTTATGTTCCTGAAGAACCAATGGAAGTGCTTCATAATGAT
TAAAATCTATTTCAGGCATCATATCATCCATTCATAACTGGTGAAGCCTT
CACTGGTCCTTACGAGCCTTTCCAGGAGACCCCAATAATTGTAAGTATGG
TTGTATTCCAGATAATTTGCTGCATATTTTATTCTCATGAACAATATGTG
ATGTGAAACCACCATTAGCTGTAGTAATCACTTTTGGTTTGCTTCAACCA
ACTGGAGAAAACCATTTAGATTTGAATATTCTTGTTTTCATCTGGTCAAT
ACACAATTACACACATGTACACCAGTGTTTCTTCCCATTAATCTTGAAAA
CTTTATTGTATTTACACCCTTTAGACTTCATGCACATTGGTTATATAGCA
GAATGGTTGGGCGGAAAACCCGTGAAATATCTGGACCTTACGAGCTGCCT
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GTAGCCTGTTGGTCGTGCTGCAGAAGTCGATCACAATCCTGGAGGAGGTC
ACTGGCTAGCTGCTGGCCTTTCCCCTCAGGTTGTAAGTATGTTCTCTCAT
GCTTCTCTTCAGTTAAAATTTTGCAAAATACTCCCGTAAAATAATATTTA
TAACTTTTCTAGGTTGGAAGCATTAACAGATCCCTACCGTTCAATAACGT
ATTTCCGCCAAAGATGCCCTTATCATATGGAAGCAGCTATGGTAGCTTCG
GTAGCCATGGTAGCTTTAATGATAATGTAGGTCCTGCAAGCAGCTACGGA
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GTTCCACTTCTCCTGCAAGGGGCAGTCATGGCTCTTCAATGGGAAAAGCC
GCTATGACAGGCCAATACAATAGGAGAAGGAATCTGGGCCACCCACCTAT
GTCAATGCCACCACATGAGTACACATCTCAGCTGATCCAGGGACATCATG
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GGTGCACCTCCTAATTCTAGTCATTGTAATTGGAGGCCACAAATAGGCGT
TACCAGTGGTTTATCCGCAATCTCTTCTTCCAATCATGGTTATGTTCAAC
GATCCTCCCGTCCTATGCACTCATCCAATGTGTCAGCCGAAACGTTCGCC
TCCACTTCATCAGTACCAGATCCAGCTGATTGGGATCCCAACTATAGGTA
ATCCTGCATATTAAGTTACTATTTTTAAGTAGTGTAGCCTATGGATTAGC
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AAGCTCAAATCCTACATCCATGAATCAGAGGTATTATGGCATGATGATAT
ATTGACATTTCTTTGCTGCATCGGGTCTTCCTTCAACTTTGTCGGTTTGT
ATAACTGAAACATGCTATGGTTACTACTGTAGAGAAATACTATTGTTGCT
AGATTATGGTAGACGAGACTAGGCTCGAGAGAGGAACTAAACTACAAGGA
AGACAAATACATCTCTTTATATAGAGATGGTTAGTCCCAGGCGATAGGAT
CCAATGACTCCCAAAAAGAAAGGACCACATGTTGAGCAGGTGGCTGAAAA
AAAAAATTGAATCTAGTATTAACTAATTGCTATATTCCTAACAGTTAGAA
ATTATTCCTATATAATAAGATACCCCCCCCCCCCACACACACACACACAT
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TCAGCTGCTGGGGATGCGTTGGAGTCCTTAGATGTTAAATAATACATATC
CATACTTGTTTACATCATTAGGGAAAATGCACAATTCATTTTTTTTCACC
CTGTGCCACACTGCTGGTTGCTGTTTTGTTACACCGTAACAATATTTAAA
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ACAAATGGAATTGATGTTTCAGATATAGAGGCAACAATATGGTTTGTCCA
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ATCCTGTTATCCTGTTCCCTTAGAGATAGATGAAACTGATGCTTCAGATC
TGGATGTAGAATACGATTTCTGAAGTCTGTTCGTATTAGCTAACTCCTGG
GGATGAAACCATGCAGATGCATTTAACCTTCTGTATCTCTTTATTTTTTT
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TACTCTGTACAAAAAAAAAGGAAGAGGAAAAGAAAACACTAGAGCTAGAT
CGAAGGGACTAGTAGAACAAAAAGGATCTAAAAAGAGTCTAGCCAATCCA
CTAGGGAGGCCTTATGTGAGTGTTTAACCCTATAGACGGCAGTATTAAGA
TCTGACTTGAAGATGGCCTTCCAAGCTTGAAACGTTGGTATGCTCCCATC
AAATATTTTGGCATTTCTAGTCTTCCATATCCCCCATAGGGCACAAGTAG
CAACTTCAAAGAATTTTGGCCCCTGAAAACTTTCTTTTGCGTCCTGAAAC
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AATATTTGCAGCAAAAGAACAGTTAAAAAATAAATGTTCCCTCGTTTCCT
GCTGATGTGCATTACACACAGCACACTCAACTCCAGAATGCAAATTCCAA
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ATAGGCACCAGACATGACTTATGGAAGTTTACTTTTAAACCTGTAGCCTC
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TGTGTCTAGTTCGTAAGAAATTTTGGTTTTAAAGCATTTCATGCACCCCA
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GGAATTGGTAACATGGTTCTTTTATATTCTGGATGCTGCTGCTCTTGAAT
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ATACGCCCGATGGGGAGTCTCCGAAATGGCCAATCTGTCTGGTCTAATTA
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ATGCATGAGTTATTGACTGAGGATCTGTTGAGGATCACCTTTGTAGTTGG
ATCTTCTTATCCTACTACTACTATGGCTTATCTTTGAAGTTATTAGTAGT
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GTTTGCATCCATGTGTTTCAAGCAATAATACTAATCAAAATGAATTATTT
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GACTAGTGACTAGTGAGTGGTGGTGCACTTGTGGTAACTTGTGTTTGCAG
CCACTATGGTGGGCCGTGCCAAGTAGAGTTGTGCTAGCTGTTACAGTGTA
TGTAACTTGACACTAACAATATATCTGGGTCTTTCGGACCCGATATAAGT
GCACAACGCTGGTGTGGACACCGAACTCAGAACATACATAAATTTCATGG
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CAATGGTTGCCATGCCGTGCCCTCCTGCGAGCACGGGGCACTAATGGTGG
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AGGTTGAATCACAGGGGTAAGGGCAGTCCACCTTCTGGAACTGACTGCGG
TCGTAGAACCAGTCTCCGACTGCATTTGCTATCTTCTGCAACAGAGAGAG
GAGGCCCCTTGTAAGATCAACATCAGGTCATCGCTCGCGGGCTCTAAGCC
ATGGGAACTTATATGCAAACAAAACTCAAGGGTGCAATAGAGTGTTTACT
TTGTCACCGAGCACAGGAGAGCCGGGTGCGAACCATATGTCTTGTATCTC
CGACTGACAGTGCACGAAGCACGAGTTTATGAATAGCCCCCTGGTCGAAG
AGCTCCCTTGTCCCTCCAGTGCTTCCAGAAAATGGTCCCTGAATCCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.