Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040853

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040853
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040853
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGATCGCCGTCTTGGCTATCAAGCCTGTCCTTAAGAAGCTGGGCGA
CCTGCTCGTTGGTGAGTTCACCCTCGAGAATCGTGTGAGGAAAGGCATCG
AGTCTCTCATCACAGAGCTGACTCTGATGCAGGCCGCCCTTGAAAAGGTT
GCGAAAGTTCCGCAGGAGCAACTTGACAAGGGGGTCAAGATCTGGGCAGG
AAAGGTGAAGGAGCTGTCCTACCAAATGGAGGACATCATTGATCGTTTTA
TGATCCGTCTAGAGGATGGTGGTGAGCCAGGCAACCCGAAAAACAAAGTC
AAGAAGTTACTCAAAAAGACTATCAAATTATTCAAGAACGGCAGAGAACT
CCATCGGATATCTGATGCTTTGGAAGAAGTAATGGGTCAAGCTAAGCAAT
TGACTGAGTTGCGTTTAAGGTACGAACAAAACATACCTGAATATGGAGCC
GTTGCTAAGGTTGACCCTCGTGTGATGGCTCTGTACACAGATGAGACAGA
GCTCATTGGGATTGAAGATACACGGGACGAGATAATCAACATGTTGACTA
AGGGTGATAATTGGTCAAATCATCCGTTGAAGACAGTCTCTATTGTTGGA
TTTGGCGGCTTAGACAAGACAACTCTAGCCAAAGTAGTGTACGACAAGAT
CAAGGGGCAATTTTATTGTGGTGCCTTTGTTTCAGTTTCTCAAAATCCTG
ACATGAAGAAAATCTTGAAGGATATCTTGTTTGAACTTAACAAGACAAAA
TATGCTGGCATCTATTATATACTAAAAGCAATATAAGGTTGTGTTTCGAG
GCACCACGTTAATCCACATCATCATAATAATTTCTGATAGTTAGATCTGA
AAACTACGGTTAGGATTTAACTAAACAACGTAACAAAATTTTATTTCTAT
ATACACACATCTAGCCCGTGTCACGTCTTAAACATAACGTGGCCATGTTC
TGATTTTTTTTTGCATGGATCCGATCGGTCATGTGTTAATTAGCCAAAAC
AAAGTGTCCAAGTTAAAAAAAAAAGAGTACACACATAAGTTGGAGTATAA
TACAAACGTGTAAGCCTGTTCCGATCGGTCATGTGTCAATTAGCCAAAAT
TAAAGAAAGAGTTTGTATAAGTTGGAGTATAATACAAGCCGTGTAAGCCT
AAGTTACCTAACGAGTTACAGTTTTTGGTCCGACAGAACTCGGGTGCATT
GAGATTTGCAAAAAAAAAAAAGTCCGGCTGTGTTACAATACCAATCGTTC
AAACCCAAAGAGAACCTAACAAGCTAATTTTTTTTTGCAGAACCCATCAC
TTTTAACGCAAACGATCACAAATATGCACATATACGTATCCCTATGAATA
ATATACGTATTCGTACAAATACTCGCACGCACACCCTATTCCTATGAACA
CCTCCAAAAGACTGAAAGACTGATTCAGCGGGTACTCGCGCTGTCACGAG
CGTCGCCTCCCAGCGAAGGATATTTCGTCTTTTGTGAGATATCTATGTGG
TGACCCTACTAACACATTTATTTACCAATGTGTGTACAAGGTAGCTAGCA
ATATATCACACCAATTAATATATGTGTTTTCGCTCTTTGTTGAAATGGTG
AAAACGGATCATTAATCAAACTAACAGTCTTAGAACTAAAACTTTTAAAA
AGTTTACAACCAAAGGAATCTAGATGACGTAAAATTACATGCATGCAAGA
AAGAGCGGGAGGCTTCCACCGCAGGATCTAGCAAAATGCAGCGCCCTCGG
GTAGCACTCTCCTTAAATAAATATACAAATTGGTTTCAAAAATCACGGCA
AGCTTTAAAACATAACATAATTTATTTTCATAAATGTACAAATTAAACAA
CTTTTAAAATAATATAGGGGATATCCAACTGAGGCGAATATTCGAATGGT
ACAAAGATGAGCATCCAAAAATTCAAGGGATAGCTTAAAAGTTATTCAAC
CAAAGTGCTAAAAAGAAAAATACAAAATATTAAACGCACAATGATGGGTT
CTAAAGTTTTACGATCAAATTTTAGAACATAATAGAGAAAAACAAAGAAA
GGCTTCCATGTATTTACATAAAACTTCAAAATTTTCAAAAAAAAAAATCC
AAACGAAATGACATTTTCTAAAAAAACGGTAACAAATTCAAAATTAGTTT
AACCGTGCCTTTTAAAAACCTTTCTTTTGCACCAAAAAATGGCAACTACA
CATGTGTCGTTGCACTATCTAAAACTGGAAGTGTGGCCACGTGGCAGAAA
CTCACCTCGCATAGGTTAATCATCCATGTACAAGTAGGGATTGATAAGTG
GCGCATCCTAAGACGTTCGACTCACCGTCATAGGGTAGTTGACTCGAAGA
GCATCGATGAAGTGTGTACATAGTGGATGTGCCTTGAGAGATAGAGAGGA
GGAGCAATAGAGCACAATGGAACTTTCCTCTCAGAGAATTGTGTACATCC
CACAGTTTTGGTGGATTATTTGAAGGACATTCATCATGTAATAGCAATAA
CGATATAGTATCTTGCCAAGGAAAAATCAATGGCTGATATATACAAAATA
ATCTTAAAGAAAACACATTTCCGAATGTCTGAAAGATAGATTATATTAAC
CACATTAAACATGCATATGTAACATGCGAATACAATGCTATGACGATTTC
TATTTGGCACAAAGCTTAACACGAAGAGTGGGAAAAGACAAGATTGAATA
TGATCCACAATATGCTTTGTGCATGAAGACAAGATTGAATATGATCACAA
CTTTTATAGGAACACAATTCTCAAAAGATAAGCTTTCAAAATGTTGCTTA
ATCCCTTAGTCGGGAAGGAGATAATCGAATTTTCTAAAGGATCGTGTATA
ATGGAATTGGTTCCACAAAGTAAACCATTATGGTCACACCAGAATAATGA
TTGGGCCAACATTATTGGTAAGACTAAATCTCGACAATCATAACTGACGT
GACATGTTGATCTATGGTTACTTTGCTTCCTGGCGTCTTAGTGGATATTC
TATGTGAGATCAGTTGGCGAGGACGATGGAATATTGATCCGGTGCCCATC
ATACAAGCTAAAGACTTTGATTGTTCTACACTAAAGTGAGAAAGCAAAAA
TTTGCTATTTCAATCTTGCTAAATCATCTCTTTAACATAAATTTAAAGGC
CAGTCAAAATATGGACATGCTCAGCATATTTGGAAATTATAAGAGAAAGT
ACTAATAAATTACAACACACAAAAACAAATCAAGAAATTCACACACACAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATATATCTTT
AGACCCCCTAGGGTGTAGAATAGTTATATCTTTAGAACTGTATATTATTT
TTACATAGCGTAAATTTTGTCTTATTTCGAGAGTTGAAAAGAACGTAAGA
AAATATAGGCATATCATAATTTTTTTGTTTACATGCCGTATAAAAATACG
ACGTAAAATGCGTATTTTTAGTGTTTTTTACACTATAATTACTCATAAAC
TATTTTTTATGTCAATTTTTTGCGTTGTGGATGAATATGAACATAATTAT
TTGTATACAAAACATAAATTTCTAAATGTGACAACATAAAGTTATGTGGG
GTACAAAATAACTATTCTGCACCCTGGGTATCGAATAGGATTTTACTTGC
AATGAATTAAAAATATGGACTGTAGAACTCTATGGTTTTACTTGCAATGA
ATTAAAAATGATACCCTCGCAATTGCGAGGGTCATCATGCTATTTATAAT
CTAATAAGGGAAGAAAAGCAACTCATTGACGAACTTGTTGAATTCCTTGG
TAACAGAAGGTATGCTTCATCTATCATATGTAGCAGATAGACTCAAATCG
TCTACTAAAATCATGGCACCATTTTGCATATGCACCATAACAGAATGTGG
ATTAACACTAAGTTTATAGACTTTGTGTATAATTCCTCGGGTTTGCTCTG
GTCAATTTTTACCTAAATAATCCATCTTTTAATAGTTCTAGTGTGAACTT
AAGGAGATTGCAAAATTCTTATTTCTAAATCGACGATCTCAACCACTAGA
TCACTCCAATGTAAATTGGAAAGTTACACGTTTTAAATTTCATGTGAAGC
TTTGGTTTTAGAAATGTGTAACTAGGCAGTCGCATGTTTCCATAAGTATA
ATTTCACATGATGTTTTGTGCAACTGTAGCACATCCACAACAATTATCAT
CTTTTTAGGGTCCTTCTCTATACATACTTTCAAAAAGGAACGCCAAACCT
CTCGCCCTATGCACTCATATGTGCACAACCTAATTATCAAAATGTCCTTG
CAGGTACCTTATCGTAATTGATGACATATGGGATAAAGAAGCATGGCAAT
TAATCAAGTGTGCTTTCTCCAAGAACAGTCTCGGAAGTCGACTAATCACG
ACAACCCGTATTATCAGTGTGGCAGAAGCATGTTGCTCTTCTAGTGATGA
TATTTATAGAATGAAACCTCTTTCTGGTGATGTCTCAAGAAGGCTCTTCT
ATAAAAGAGTATTTCCTCAAGAGAAGAATTGTCCTTGGAAATTGGTGCAG
CTATTTGAAGACATATTGAAGAAATGTGGCGGGATACCATTAGCCATTAT
TACGACAGCAAGTCTTGTGGCTAGTAATCATCAGATAAAAATAAAGGATC
AGTGGTATGTTTTGCTCGATTCCATTGATTGTGGACTTGCAGAAGACCAC
AACATGGACAAGATGAAGAAGATATTGTTATTCAGCTACTATGATCTACC
TTTTTATTTGAAGCCTTGTTTATTATATCTAAGCATCTTTCCGGAAGATC
ACAAGATTATAAGATCCAAGCTAATATGGAGGTGGATATCCGAAGGTCTA
GTTTATAGCAGAAACCAAGAAACTAGCTTATATGAGCTCGGTGATAGCTA
CTTTAATGAGCTAGTAAATAGAAGTATGATCCAGCCAATAGACATTGATG
ATGAAGAAAAGGTAGAAGCATGTCGTGTACATGACATGGTACTTGATCTC
ATACGTTCATTGGCAACCGAAGAAAACTTTGTCACTATATTGGATGACAC
CAAGAGAAAATTGACAAGCTTGCAAAACAAGATTCGCAGATTATCTATCC
AAAGTTGCAATGTAGATGTGACTACCAGCAGTATGGCACAATTGAGATCT
TTTGCTATCTTCACAGATAATAGTGTTTACCAAGTGCTGAATATTTCAAG
CTTTCAATTTCTGCGCGTGTTGGATTTAGAAGGTTGTAACATTTCAGATA
TTCGATATGTGCGGAATCTATTGCATCTGAGATTCATAGGGCTAAGGTAT
ACTGATATCAAGGAGCTTCCGGTGGAAATTGGGAAGCTACAGTTTTTGCA
AACTCTGGACATAAGAAAGACCCAGATAAAGGAACTGCCGCCAAGTGTTA
TTCGGCTAAGACATCTGATGTGCCTGCTTGTTGACCACACGGTGAAGTTT
CCATCTGGTATAGGAAACTTGACTTCACTGGAAGTACTAGAGATGCTAGA
TCTCCATCAGTTATCTTCACACAATTGGAACCTCCATGTTGTGAAAGAGC
TCGGTTATCTGACCAAGTTGAGGGTTCTTAATTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.