Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA008795

[Submit comment/correction]

Sequence
AA008795
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008795
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCTCCGGCCACTCTGCCTCTTTTCAGTTTCGGTGATCTCAGCGGCCGGGA
GCGCTGCCGCAGCAGTAGGCGATGAAGCGCTTCTTCCAACCTGTTCCCAA
GGACGGCTCCCCCGCCAAGAAGAGGCCCACCGGGGCAGCCGCCTCTGACT
GCGTCGATGGCCCCGCCGCCACCACGGCCAGCGCCGGCGGGGAGGGGGGA
CCCTGCGAGGAGCCGCGTAGCTTCGTAACGTGGAACGCCAACAGCCTTCT
CCTCCGGATGAAGAGCGACTGGCCCGCGTTCTCTCAGTTCGTCGCCCGCC
TCGACCCCGACGTCATCTGCGTCCAGGTGAGCTAAAACACCGAGGGTTTC
ACTCGGCGCCCTTCTTTCTGTCCGGATTTGCTTGCTCCCTAGGGTTTTAA
CTTTAAACTGCAGTGCTATGTACTGTTCGGAGGGATTTTTATGCGAGTAT
GCTGCAATGTGGCATGCAAGAGCTGCCGTTGCTCGGAGGCATTTCATCGA
GCACATTTGGGGGCGTACATATTACTTGTCCTCTATGCAATTAATCCAAT
AATTCCGCTAGGGTTTAATCCAATTAGCTGATTAGCTGGTGATTGATTAT
GCCAACTGAGGACTCCTGAAGTGCATTTTTGTGTTTTTTTTGGGCGTGCT
TTGTTATATCTGAACACGACGCAGCAAGGCCCGACCTGCTATGTACTGTT
GAGAGCAGCCCTACTATCCTTTGCTGTACTTCTGGAATTGTGGGACATGC
AATGCTGATGGTTCTATATGCTACGGTGGTTTTTGCCGAGGTTGTGTTAA
GCATCTTATGAAACAGACTAATGCAGTGAAAATGTTCTTAGATCAGTGAA
CTGATATCTACTTTCCCATGTCTTGTAATTGTGGATTAATGCTGGCAACG
TTGGGACAAGAAAAGCTCGCTTTCAGTTTTTCTATGACTTATGTCAGTCC
TGGTGTTCCTATACCAGTTTTCGTTTGCTCAGGTAGCCACTCTACTGCTA
CCACAAGTACTGACATAAATAGCATGTACATCAATAGTACAATTATGAAA
AACTATAGACCATATGGTGAAGTACTTCTCAAGTAAATCATTGTATGAGA
GAACCCTATGACCTCTTCTATATTCTCTTTCTCTGCTGTCTAGATATGGT
GGATTGATTAACCGAGTCTGTTTTGGAAATCGTAGCTCAGTAGTTGAAAT
CCAAATCCGCCTTGGGTTCTTCAGCTCTTTTTCAATTCTAATACCCTTAA
TTATTACGAGTTATGGCAACTTAACAGCTTGGTATTACTATTCTTTGTAT
TTTTAGTGTTTAGGTTCCTTAGCCAAAAATTATTGTTTTATTTTATACTC
CTAATCAGTACTCACAGCTAGTTTGCTGTTCTGGTTAGGTTTTCTGCTGT
TTTTTATTATACTTCATAAATACAATTTAAGCATATTATGTATTATCAGT
GAGAAGGATGTTTGCTGAACTTCTTTGCCACTTGCCAGGAAGTGCGAATG
CCGGCAGCTGGTTCGAAAGGGGGACCAAAAAATCCTAGTGAGCTAAAAGA
TGACACGAGCGCGTCTAGGGAAGAAAAACAGGTAGTTCTGACTGACCTGT
TGGTTCTGACTGAAATGGAACAGCAACATTATGGAAGAAGACATGTAGTT
CCATGAAAGTGCTTCGTAAAATCTGTGTTTCTGTGATTGATGTGTTGTTT
GTTGAAAATGCTTCTTAAAGGGGTGGTTTTGTGATAATGTTGCAAGAGTA
TATGCAATTTTGAGAAATTTACTCTAGATTAGGTAAAATTAGTCTTTCAT
TTGTATCAGTTGCATCCTGAAGTCTTGCTGCATTTGTGGTGACTGTGTAT
TTGCAAATGTGGCCCAGTGAGCAAGCAGGAAGCTATTATGAATTATTATC
AACTTATTCCATAACCTGTTTTCTCTTTTCAGCATAACTTCTATAGATGC
TGCATTTGTTGGGCTCAATGAATATATGTTACAATCACTTCTTGATGGTC
ATGCAGATAGTGCTGCGTGCTTTGTCGAGTTCACCTTTCAAAGACTACCG
TGTCTGGTGGTCCCTTTCAGAATCAAAATATGCAGGCACAGCTGTGTTTA
TGAAGAAGAAGTTTGAACCAAAGAAAGTGTCGTTCAACTTGGATAGAACA
TGTAAGTTTGATTTCAAGAGATTGAGCAATTATCTCCCCTGTTACACAGT
TTTAAAAAATGTTCCATGCTTCGCCAGACAGTCCTTCTGTTTGTCGTGTT
TAAATTTTTTTGATTGTGTTATTGGATCTGGTCAACGTTGTAAGCTTTAT
TTAGTCCATATATGATGGCCCTTCTCTTAATTTAGTTTTCTGGCTGTGTT
ATAGTATAGGATCTGCTTTTGTAAAGTCTTAGAATCAGTCTTCTGAGATG
AACTAATCAGAGAGCTAGGCAGATCCAGCCTCCCTGGCATGGTACTGCTG
CTGACCTCCAGGCTTCAGTTTCGATTGAAATGAGCAAAAGCAGAAAACTC
TTAAGAGGCTGGTGTATTATGCTGGCAGGCTATTTATCAGAGTGAGGAGA
TGCTATGTGAGTATACCTATATATAAGAGGTGGGATCTGATGACCATTCT
GTGTGCAACTGTAAGAAGAGGTGCAATAACATCGAAGGGTTTATGCTCCT
TTGTCTCGTACCTTTCTCTGATTTCTTAACCCATGGCCACCGCGGCTGAT
GCTGCTTCAACAACTTGTTAGGCTGGGACCTGAGGCAGCATGGTGCTGCC
CTCCTAGCACCTAGTGCTTCTTACATCACTCATATTCCCATTATCAAACC
AAATCTTAACATTTATGGTCATTTTGAAATGATGAGGCAATTAAATATGG
GAATAAACCTTATGGTCATTTATGAATACGTGAAGTTGGTATCGGCATAT
ATCAAATTAACCCTTAGCTGTAAGTGTAGCATATCGAAAAAATAACTGGC
ACATTTTTAGTTATGGTACACTGATAGCGCACTGGCATGCTATTTTCCCT
CAAGATAATGGGTGATCAGAGGGGATTATATCCTGCTAATTAGTACGGGG
CCCCTCCTGGCGCAGTAGATGTGGGGCTGTGACACTGGTAGACCTGCTCC
TACATGACAAATAAACTGCCAATTCTTAAATATTGCCTGCTTTTAGAATT
CATTTTCGCAGAAACTATTGTTCTTTCTGAAAGCATAGTATTTTACCTGT
TTCAGCTTCTAAGCATGAGGCAGACGGTCGTGTCATCATTGTGGAATTTG
AATCATTTTTGTTACTTAACACATATGCTCCAAACAACGGGTGGAAAGAG
GAGGAAAATTCATTTCAAAGAAGAAGAAAGTGGGATAAAAGAATGTTGGA
GTTTGTTCAACAAGTAGGCAAGCCCTTAATCTGGTGTGGAGACTTGAACG
TTAGGTAATTATGAACATGTAGCTGATTCTTTTATGTTACTCCCTCCGAT
CCATAATATATGGATCGGAGTTAAGTATTATATATGCCCTCCTCTGGCAT
AAAGTTACTTTTTATTATTGTTTGATGATAAGTTACTTTGAATCTTCTGA
AAACAACATAGAATTAATAAAACATTTGAGTTTTGGATTTTACCTTTTAT
TTGGCTAATCCAAACTTCACAATTAGGGCCCATCCATGTGGCCTACTGGT
AAAGCACAAGGCTGTGGCTGTTGAAGTCTTCGGTCCAAATCCCCCCTTTC
CTTAATGATAGGTTGTTCAACCTACATATTTTTTATGACCGCTCTTAATC
AGAAAATTCACTTCAAGTATTTTTTTAGCCGACAACTCCAAAGGTAAGGG
AGAGAAACTTCATTACTTATGTGGCCATCCGTGAGGAATCTAGGTTTTCT
ATACAAGATATAGACAGAATGAGCTTCTCAATTTCTTCACAAACCAACCT
TAGCCCCTGAAGTTACTCTTTGTTTTGAAACCTTTCAGTCGCGACGAAAT
CGATGTCAGCCATCCAGAATTTTTTAGCAGTGCTAAGATTAATGGATATA
TCCCTCCAAATAAAGAGGTATTATTACTTTACATATGCAATTACTGGTTA
CTGTTATAAATCCGCTTTATGTTACCATGGCACAGGTGTTGGAAATAATT
CTTGCCATAATCTGTTGTGCATCCTTCGACTCTCACCTGTATTCTGCTTG
TCAAACAAATCCAAATGGGTCATGGTGCTAATCCTAGGTGTGACATGTTA
TAGGATGATTTGGCCCATATGGCCCATTTAGTCTAGGTTTGGTATGTGTG
GCCCAATATATATGTCCATCTTACTTATGAAATAGGTTGCACAATTAAGG
ACATCTGAATTCTCTCTCACTGTATTACACTTGATTCATGTTTACCGATA
GCTTATTTTATTCTCTTTTTGATACCTTGCTTCCTCTTTTAGATTCAAAA
TCGTAACTTGCAGTTATTTTATAGAAAATGGTAACTTTTGTTATACCGGC
CTCTGAACCATAGGTGCATAGACCAATTATTGCTTCATTTATTAAAAGAT
ACCAAACAGTAGCCTAACCTTGCAAGAAGTCTACCTACAAAACCTATTGC
TAGCCATGGCAGCAAATAGGCTTGCTTCGGGAATTAGCTGCTTCAGGTTA
CACATATGTGGTGTTAGCTGGCAAGCTTTAGAAACCATTGAATTTTCTGC
AAAATAGCTAGCAGTTCATTGGGTGGTAGCCATAGATATAGTTTTGTTAT
TATGGGTGTGTCTGTTCATATTTAATGTATACTGCATATGGCTATAAGTT
TGTCGTATGTTATTCAAAGAATTCATACTGAAAAATTTATGTTACTCACC
AAGACATAATTTGACAACTTAAGGGCATCATATTCTGAGCAATAGCAAAC
AGGGCCTTAAGCCCTTAGCAGATGTTCAATGTATGGACTAGGACATAACA
TCCTATTCTCCATTATATCGCGAGTGCATCTTTCAGTGTTACTGGATGAC
TGCTACTCTATTACTTTTTTTTTACCAAGGACTGGTAGCCTATTACTGAC
ATATCCTTTTGGCCATTGCATTAATGCAATGGAATGTCTTTATCTATTCT
ACAGGACTGTGGGCAGCCAGGATTCACGCTGTCAGAGAGACAGCGGTTTG
GCAATGTATTGTCCCAGTAAGTGTAAACTAATATACATTTCAGCATTATT
TTCGTCTGATAGAACACTCCCTTATTATCAAATGGATGACGTCCTTGAAT
AAGTGCATGCATCCCTTTAATTTGGCTTGCATGCTCAGTCTACCTTAGCC
ATCGTTGTTTTCTCTCAAGTGGGCCCCACATCGATATAGGGCTGAGCGTA
TTTTCATCTCTAGTTAGACCCAAACAACAAAAACATACCATAATAAGCAT
CTCAGATGTGAATACTCCGTGGAACTGTGATCATGGAAACATAAAAGGGT
TATTATTTCTGTATTCCAGTATGTTAAATGTTCAGCACAGGACAATTTTT
TTGTTCTAAACAAGCATCTATCATGTTCAATATTTACTATGATCTACGAT
TTACATCTATTAAGTATATATTTTGTCGAGTCTATATATATGTAGAAAAA
CTTGTTCAGTCTAATTATTGCACTATCAAAAGTCCTTGTCCAGTGTATAT
ATTGCTCTGCCAATCTATGAATTATTCTGGGTAAGGAACAATTAGATATG
TATGTCACTGACAAACAAAAAGTTTCTATCAACAAATTGTATCCTCTACT
AAGCTATCACTTCCATAGTTCCATATATAAATAAGTGGCCTTTCAAAATC
CCTATGGTCTCTAAACCACAAATTTGAGCACACAATTCTTCTGTAATATA
ATAGTAATGACACTAATTTGTTGGAAATTGTTTTATGACAAGTCCTCATA
TCATCATATGGGTATTGCTGGTAAATACAACCACTAAATTCTTTAGAAGC
ACTTGGCTTATCGTTGTAATTCGTAAATTCAAAATGGACCAAGGATTTTG
CAGACACAAAAGAGAACTTCAGAATTATAGGAAACAGCATCTCTCTATGG
ACTAACTCAATAACAGGTCTGGAAAGCATACCTTTAAACTGATGATATGT
GGATTGCCCAATCTTCTCCATCAGTTCGTACTTTTTGTTCTACTGGTTGA
TGCATGAAACTTAACATAAACCTATGAATGATGAACGAGGCATATTGGTA
GAAATCAATAAGGCATAAGTTGATTGCATAGAGGCATTATTATTTTATGG
TATTGATTATTTTTTTCTTGAATACCTTATGGAAGTACATGTCGATATAC
AGGGGAAAGCTGGTAGATGCTTACAGATGCCTGCACAAAGAAAAAGACAT
GGATTGTGGCTTCTCTTGGTCTGGGAATCCAATTGGGAAGTAAGAAATGT
TTCCATGATTGTATAACTGTTAATTTGTTAATTGAGACGCGCAAACACAC
ACCTGTTGGGGTCGTCATAACATAGGGTGTGTTTGGATTGTGGCCAAAGT
TTACCCTACCAATATTTTGGTCATGACCAAAAGGTTGTCTCTTGTTTGAA
TTGTTGCCAACTTTTTGGCATGCCAATGCCCACTACCAACTCTAGTTCAA
TTTTTTAGCCAATGTTGGCCAACTTGTGGGCAAGCAAAGGCTCAACCAAA
ATTTTGGCTAGCCAAATATTTGGTGGGGTAATCTTGGGCACAAACCAAAC
ACACCCATAAACCCTGACTATCGGGGTTTTGTAACAAAAACACCGGCTAT
TGGGTACCGTAGTAACAAATACCGTAATTCTGCAAAAGTTAGGCCATTTT
ATACAAGGATTAAGACATGCAGAGCCAACCTGGCAAGTTCATTGGGTTGG
TTGGCGCCGTCACCGTCACTGTCGGCTCCCCCGCGTGTCTGAATCCGTAT
ATATTGCCCAAATTTTGTAGAATTGTAGATTTTTATAGCGGTACCCGATA
GCCGGTGTTTTTGTGAAAAAAACCCAAATAGTCGGTGTTTCTGTTACGAC
GACCCCAGTAGGTGTGTGTCTGTGCAATTTACTCTTGTTAATTACAGTGT
TCAGTTGCTTATCAGATTTTATCTCTGTATTACTGTAGCATGTCACCGCC
CGAATGTTTATCTGCTGTTCCCTTTTATGTCTGTGATGGGTTAATTGATC
CCATCGTGTAGATATGGTTTGTAAGCATATGTTATTTAATGTTAATAAAT
TATCCTCCATCTCAACAATCTAAGTTAATTTCAGGCAGTTAAAAAGGGAA
TTGGCAGCATGAATTCAATTATTTATGGTCTCCCGATAAGCAATGTTCTT
TCATAATTACTACATATGAACGCTAATGCTATAGTGTATGTGCTTCATCT
TTTTCTGTGTGGACCCATTTATATTGCTTAATATTTTTTCAGGTACCGAG
GAAAGAAAATGCGGATTGATTATTTCATCGTTTCAGAAGGGTTAAAGGAC
AGAATAGTTTCATGTAAAATACATGGTCATGGAATTGAACTGGAAGGTTT
GTATTGCACAACTTTCTTTATGTGGTGATTTATTATGTAACTGTGATATG
TCTGGATTTTTGGTCCTTCTGAAGTTCTCAGTTTATTGTTTTTAAAAAAG
TGGACCAAGGGGAAGAGACCCTCAGTGTTGCTATATTACTAGAAGTGGGT
ACGGCCCACATTTGCGAGCACGGAGGCCCAAATGCGGGCGGGCAAGGACG
CGTCAACCCGTCCTACTGTCCTAGCCATTCTGTCCAAGTCTTGGTTAGCA
AGTTTATTTGCCTATCATCTGCTGCAAATAATAAGGGGAGGGATCATGGA
TGATAGGATGTTTGTTGGACCATGTGTTGGTCTTATATATTTAATGTCAA
ATAACGGAGAATAAGAGTTGCTGTATCTAGTTTGTTTGTTAGGTACATGG
AGGGATAAAGAATACTGCTATAAGTAGGTTTGGAAATGCCCTAAACAGCT
AGCTGTTACAAATCTTTGTTGTTTTATCGCCTGTTTATCTTATGTGCATA
TGAAATAATGGTACACTTCATACGTACTGGAGTTCTGTGCATACTTATCG
CTTGACATAAATCACACCAGGTCCCCAGCTGTGTTCAGGTATCCCTACTC
GTTCTAAAACATGTAACTGGTTCAGTCATTCATAAATATTTGCTGCAACC
GGAGATCATCTAATTTATTGTGGCATTTGTATGTTTTACTGTTCTCGTGT
GAATCCAACTACTCTTCAGCCAAAAATTATCAATGGTGACATGAATCTGG
TCTATAGGTGTCTGTTTTTGCCTTCATGTTTTTTTAACAACCTTTTTGCC
TTGATTTAATTCATGGGCTTTCTTGATCGCAGGATTTTATGGAAGTGATC
ACTGTCCTGTTTCACTTGAGCTCTCCAAAGAATCAGCGGAAGCGCCAGAA
TCGAAGAGCCCCGGCTAACTTATGGTTTTGTCTTAGCTGGTAATCATGGA
TTATTAGATTAGGTCACATGAAGCGGTTGGCCTCATGAGATATTTATTCA
TTTTCTGGGACCTGCATTAATTTAAACATTTTCTATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.