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GrainGenes Sequence Report: AA023306

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Sequence
AA023306
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023306
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGACGTGCAAGGTGAGGCCATCGTCACATCAAAAAGGATTATTATTCA
GACCATCTGTTCTTGGTGATGTGGAAAGCTTATAATTGTTGGGATGTTTG
TGTGTTTCTCAACCATCAAATCTCTATTGTATTATTTTCCGTTTTTGCAG
CGACTAATAATTGTTTGATGGTTGGAAAACGACAGCGAGAAAGTTTATGT
CCAATTGTGTATAAGTTTGAAAATCAACAGAGAAAAATCAACTCTTTTTA
GATCAAAGGAGTGAAGCTCCCTATTCCATTGAAGAAATTGATGAGAAAAT
TAGCTTGGCATCTTTATTGGTTTTATTTAAGTACTCCCTCCTTGTCAAAA
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TGATGTATTTAGTATGGTACTGACGAGAGTTCGACTCGTCAATATCCATT
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TTGTCGGCCATCAGATTTGCGTGACGCTGATCAGTCTACACGTTCTCTTG
TCTAAACCGATCAACTGATGGTCAGCGTCACGTGTGGGAGCAAACAACCC
TCCGATGGGCCCACAGAATAATCACCTTCTGCGATCCACTTAGTACTCAG
TTTTAAGCGATGTAACGATCGATATATAGGAGGACAGTGGTACAGAGTCC
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GTCGTCTTTTTTACTGTTCAATTTACCTCATGGTTCGTATAAAATGGAAG
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CTGAGAATTAGTACAAATGAGTTATAATTAGGTTGTAACTGAGAATTAGC
ACAAATATTAGGATGATATCAGCGACTTAGACATAAGAAGTTCTCAGACG
CCTGAGATCTAGACTCTCCATTATTTTTTATTAGGAAGATGATAACTTTG
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GTAGTGTGCATGGTTTATAGAAACTAACTTATACATATGTCATGGGTGGA
CCCAGCGTCCTCTAAGCTGGGTAGCCGTCCAGTCTTACTCTTACCAACAA
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GTTTACTCCGAATCTGCACAATAAAAGATATCTAGATGCATTCACTTAAA
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TCTGCGTTGGCCCTACAGCTGAGGGCCTACCATTTGTAGATTTGTGGGGT
TTTTTCTCAGCGCAAATGCTAGACTTACGGAAAAGGGGTTACGGATAAAT
CTCACGGACAGACGTGGTGAAAACTGATTGGTTTAAATTTCCTCCTACTT
CAAAGGCACGAGTGAATTCAGGTCGGCACGGTTTTACTTCCGGGGCGGCC
TCCTTGTCCTTCTCTTCCACCGCAGGCGCTCCGGAGTTCCGACCAAAGTC
TGAGCTCAGATCCCCTGGAGCGGATTTCAGATCAAGAAAGGTCAGATTCC
GCAGATTCTTTCTCCTCTCTCTCGCCCCGCTAGCGTGCGAATCGGTTCAC
GGTTTCGTGAAGGAGCAATCTCTCCCGATTTTCTTGGAGGGGATCCTTTC
CGCGCGCAGGCAGGCTGGTCAGGCCCAGGATTTTAGTCTTGCCATTTTTC
TCCTTTGTTTTTCTTGGGGTGTGGGCGGCGTTTGCTTCTCGTCATTTGGA
TGGAGGATTGAGGGTCTTACTTACTCCAGCCGTGAAATTTCACGGTGAGT
GAACTGTTCCTGTGTCATGTACTGTTGTGCATAGGCTCCTCCGATAGGAA
ATTGGTCCATTTGCCTTTTGTCTGCGATTTTCCAGGGGCACTATTTGCAG
CATGCAAATGAGCGAGATACCCTTTTTCATCTAATAATTTAGTTCGTTCG
GATGATTAGATGTTGACGTGCGACGTGTGGACCGTGCAGCATCTTGATAG
CTCGTCTTTAGGGGATTGTTTTGTATGGATGCAAAATTTTGATACTACTA
GTATATAAGATGCCGTGCTCTCTTGTTTTTCTGTACTTGCTATTAAAATT
AAAAGTAAGTTTTTTTCCGTATTGAAGGTTGATGAGTCCGTCAATACTTG
CCATCAGCTTGAGTTACCGTGCCTTTGCTAACTCTGTTTTCATGTGCCTC
ATCTGCACTTGTACAAGATAAAGTTTCTCCACTGAAATTGGCGTTCTGTA
ACATGCTCTAGTTATCAATGCCGATCCAAACCAACCATTTTAAGCTTTAC
ATCGCACCAAATACCATGTCTCTTTTTTTTCCAGCCACAGCTCCTTTGAT
AGGGGATGCTGGGTTCTCAATATCGCGTAATAGATACTCAAAATGGCCGA
TGGTGTCAAGATCTTGAGTTGATTTAACACATTTTGTTTGATCTTACATG
CTTTTTTACTGGGCATATCCAGATAGTTTAGGAAATACAAAGCTGTATGC
TTGTTACATATATTCAAATCTCAATATGTGTACAGGCCTAGCTCGAAGTC
GAAGGAAGGAAAAATGGCAAAGAACGGGGTCCATGAACCACCACCGGGTG
TGTCTCGGAATGGTTCACCATCGCAAATTAATGTTGATTCAGTGAGTTCT
TTTTTCCAAGATCCATTTGAAAGCTGCAAACAGATTTATTCCATACCATG
ACGACTGTGGATTCTACTGGTATCTGAAATGTTTTATAAATTTGTTTTCC
ATCAGCAATCAAATCCTTGTAACATAAAATCCACAGTATTTAATAGTGTT
TGTATTGAAATATGACCATTGCATCATCCGTAAGTTAACACTCTTCAGCA
CCAATTTGAATTTGTGGATCAAGAAAAAGAAAAAAATAGAAATTATTTAC
TACTATCGTTGACCCTTTTTTTTAAAATTTTCGTTCAGTGTTCTTTGACT
TCTCAGGAAAAGGTTGACCCTGGACAACTTCCAGAGTTGACATGGGAACA
CAAGCTAAGTCATGTTAGATATGATTTGCCGTCATTCGGGCTTACATGGA
GCGAGATTTGGCAGATGGTATTTCTTCTACATTATACAAGTCTTAGTCTT
TTGATCTGCTACAGTTTGTCAGAGCAAAGTTAATTAGTCTAGTGATCTAG
CTGTTGTTCGTGGAAATAACAATTGTTAAGCAACCTTAAATTGGATTCTT
ATGTTTTGCTTTCTTCTGATATTCTCTGGGTTCTTACTAGGCTTGTTGAA
GAGATGGGCGTTTGTAGCTTTCTAGTTCAGCGAACTTTGTTATTGGCCGT
TCTTACTTTGTTCTTCACATTTCTAATATTCATTTCATTGTTGCAGTCCG
GTCTTGGTATTCGTCTTTTTCGACACATCATTGAAGAAACTTCAGAAGGA
CGAGTATGTTTTCACATGTTTGGTTGAACTGCTCATTGTTGTATGGAGTT
TTGATCTATTACTCTTATTGTTTCGGACATTTAATTAGATATTTGTGTAA
GTGCTATCTTTGTTAGTTTTCTGCAGATTGCTATTATTGATCCCACGAAG
AAGCGCACTGCCAAATCTGGTCAGGGTGTTCCACTTGGCGGCATTGGGTA
TAACTTCTCCCAGTGTTACATGTGTATTCTTGTTATTGTTGAGTTTGCAT
CTGTTACGGGGCGAGATCATCCATAATGGTCTCTATGTTATCACTAGGAA
GCTGCCTTTTGCTAGTTTTACCGTGTTAAACTGCTTGACGCACAATTAAA
GTTGGAGGATTATAAAAGCCACTATATCCAGTGTTTGTTTATCATGTACC
CTGTTGTGTTTGTTACTCTTGTCTAACATGTTGTAATAAGTTACATTAAA
TGATTTTGCTATATTTGTTCCTTCTATTCATTCATTCACTTGTAGAGAAA
AGCATCACACTGTAATATGGATGAGTGGGTTCTACACTCGTTCTTGGTGG
ACAAACAAAACATTTTTATATGGATAAAGATATCGTAGTCCCTCATAGAA
TCTATTTTATTGTCTCCGAGAATTTTTAGTAGCACACGCTTCAAAACTCT
CGTTTTGTTTGATGAATATTTCAGTGCACTATTCTCTAATTTTTAGAGAA
CTGTAGTGCAGGAAGTATCGGAAGAAGCTGCAGAGGTGAATTTCAACGCT
GGCAATTGTACCCGGGAACTTGTGAAGATAATCCAGTAATGGCAAACCAA
TTTTCTGTAAGTCTTCACTATTATTCATTCTTCCTCTTAGGCACATATAT
ATATGCTCTTTTAATATTGATGATTGCTGTTGTAGTCGACATGACTTTGA
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TTATTGTGGCCCAAAGAAGATATCATATATTTTTCTGCCTCCTTGTCGTC
CTATAGAAGTTTTAAATATTACGGACTGAACTCCTTACAATATGTTCTTA
ATCCCCACAGAAATAATTATATGATTTGATTTGAACTTAAGTACCGAGTT
CTGCCATTTTCCGATCATTTAGTTTCCCTATAAGAATATTACATCTCAAT
AAATCATTAAAACACTTGCAAAGCCGTTTTCGAGGCTACCTAAAACCAAA
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GCATGTCAACATTTTTGCTTCATTTGATGTTTAAGCATTAAGTTAGCCTA
TATAATAGATTAACGAGCATTTTAATGTATTTTTCAATTACATGGAAAAA
GTTCCTTAGATTTTTTTTTAAAATGCAGAGGAACTAACATTTCAGGGATT
GGATCCTGGGATTGGAATCTGAGTGGACAGAAATCTACTTATCATGCACT
TTACCCTAGGGCCTGGACTGTCTATGATGGTATTGCAACGACCATAGAAA
TCTTTTCCAAGTAACTATAGTTATTTGTTTTGTAATTTCGCATTATGGTT
ACTAGGAGAACCTGACCCGGACCTGAAGATAGTGTGCCGTCAGATTTCTC
CAGTTATTCCACACAATTATCAACAGAGCAGCTATCCTGCTGCAGTGTTC
ACTTTCACAGTAATATGGTCCTTTCCCTGGATTTCCTTATATGCATTAAT
AAATAATTGGTTTCAGTTAAAAAAAAATGGTTTCAGCTTAATGATACACC
ACACCAGTACATCTTAAGCTGACTTCTTTTATCACAAAAACAGGTAACAA
ATTCAGGAAACACACCTGCTGATGTGACTTTGCTTTTTACATGGGCTGTA
AGTTCTTATTTGATATTTTGCAACTCTGTTCTACTTCTGGACCTTTCAAC
TTGGACGTAAGTTTACATCTCTGCAGAACTCTGTTGGTGGAAAATCTGAC
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GAAATACTTTGTCTTGTCATATTTTCCACCTTGTAATTGAAAAATAGTTG
GACTTATATTTTCATAAATCTAATGCTGACAGAGAAAAGGATGGCGTGCA
TGGTGTACTATTACATCACAGGTAATTTCTTATTTCAAATTCTGTATAAT
GCTCAATCTCCTGTGACTTAATGATATCGATGATCTCAACTTTAACTCAG
CCATGAACGATTTTCTTAACTGAGAGCAGAACAGCTGATGGACAGCCACC
AGTAACTTTTGCCATAGCTGCACAAGAGAAAGAAGACGTTCATGTCTCTG
AATGCCCTTACTTTGTAATATCTGGAAGCTCTGATGAATTCACAGCAAAA
GATATGTGGAATTCAGTGAAAGAGGTTTGTTAAGAACTATTCTTTTCGGA
GCAGACACATTAATGTCACAATGTCATAGTTATATTTTGCAAAAATACTG
AATGAAATATCCCCTGCTGTATCATTATCCTAGCATAAAATTCTGAGGAC
ATTGTACAATCATCTCCAATGCAACTTATTGTCTTGATTTTAAATAAGTT
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TTACTGGATGGAAAATATTGCGTGACATATCAGGCAGCACTCCTGTGTCA
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CTTGGAAAGAGAAATGAGTCAGCTAGCCCAGAATGTTTGGGGGGGGGGGG
GGGGGGGGCAAATCACTCAAAAATTTCCCATCTAACCCCCTAAAATAATT
TTTTCTTCATTGATTGTTCCAAGTCTGGGGGGGCCATGGCCCCCTCTGGC
TTGTACATAGCTCCGCCACTAGCCTGCAGCAATAATGACCGTAAACATCG
CAGAAAAGGCCCCTGTCGAGGCAGAGAATTTGTTCAGTATAGGAGTCCAG
GAAAAGTTTTGGTAAACCAGGAAAGAAGTCTAAGTCTATTCAGAATTGGT
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GTGTAGGTGTTTATTAAGGAAATAAGAAATCTTTCTTCTGTAGGCTAAAG
CTGGTAATGCAGCAGTCGGGAGTGGTAAAATTCTTTTTCAGTGAAATGGA
TACTCTTGGCTATTGAAATTATATTCCAAGGAACTGTGCAAGTGGCTCTG
GAGAAAGACAGTGCTGTTACAGTTAGAGCCTAAGAGGTCCGACAGTTTCT
CACAGCATGCAGGAGTAGCAGTAGGGTTGCAGGCGGCACAACATGCGAGG
CGGACTCACTTTCCGACTAGTACGATTACCTACAGGTGGGATGGAGAGCG
GTTGTACAAATTTGTACTATCCATCCTGCCTGCGGGCCTAAGCGGGCCCC
GCTTGTGCAACCCTAAGTAGCAGGACCCTTTGTGCTCTTCTGTTAATTGG
TGGAGTTAGTTTTTCAAAACTTATTGCCCTGTGTTGTTCCTGCCGACTTC
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GATCCCCCACTTGTAAATTTTGTAGACTTCTCTTACTTACGTTCAGTAGG
GCTCTCCCATAATATGCACGAACACAAATACATTGAACATTGCAAGATAG
TCCAATCTGCTAGAAAATAAGATATTGTCACAGGAGTAGAATGTTTTTTT
ATATCATTTGTTTCAGTTTGGAAATCTTTTTCCATTACTTAATGTTGATA
AGCCACTTAAATTTGAAACTCTGAACATGATATATTTTGGGAGAACTCAA
TTCGACATCCTAAAATAGTTTGCCAAATAGTACACAGGTTCTATGGGCAT
TTTATTAGATCAATGGATTATTTGACTCCTAAATGAAATTATTTCATATG
AATTGCATGCTAGGTGTGTAAAGTCCAAAATTTTGGTAACAGTCACATCC
AGAAGTTCTGATGCAGAGAGATTTTTTCCTCCAATATCGAAAAAATTCAT
TTGCTTTTTTTTGCATCGTTCTTATGTATTCTTGTTAAAAGTGCTACTAA
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TTCTCTCATAATAAGGAACTGACACAACTTCCTTTCCATTTTGGCAGCAT
GGATCTTTTGATCATCTTGATCCTGTCAAAACATCGGCTTCCTCCAGACC
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AAGTTCTGCAGTGGGAAAACATACCATAGGTTAGAACCGAAGCCAAAACA
ATTACTTGCCAGAAAAGGATAAAATTGTAAAAAAAGAAAAGAAAAACTGA
CCTCTTTCCTGTGTTCGCAGGCGTTATACAAAATTCTATGGCACAGATGT
TGATGCAGCAGCAAACCTTGCCTATGATGCCATTCTTGGTACAACCCAAT
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TCACTGGCTGTAGGAATATTGCTTCTTAGTTTTTCTGCACACCCATTGAT
AGTATAAAATCTGTTGAGAAATTTGTCATTGAACAGATTATTTTCGCGAT
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ACTGTATTTCTGTGGCAACTATATTTTTTTTATTTGTTACTGAATTTCAT
CGTTTAACTCTGGACAACTAATAGAACATAGTACGTGGGAAATGCAAATT
CAGGAATGGCAGAATCCTATTCTACAAGATAAGAGGCTTCCTGCATGGTA
CGTTCGGACTTGTATAAAGTAACATTTCCTGAAGTACTGTACACTGATGC
ATAGCATAATTTTTCTTCAACAGGTATCCAGTCACATTATTCAATGAACT
TTATTATCTTAATGCTGGAGGAACTATATGGACAGGTATTTCTCAGAACT
TGCTTGGTCTAACTGAAGACAACTATCTTTCATAAGTATTAACATAGATG
CATCTAAACAGATGGACTGCCGCCAATTCAAAGCTTAACAGCCATTGGGG
GAAAGAAGTTTTCTCTTGACATGTCAAATGGAGAAACAGATGATGACAAT
GAGATGATTTCAAAGACTAATACTGCCACTGACATTCTTCATCAAATGGC
ATCCGTGCTTGAGAGAATTCATGCATCTCTTGCATCAAATTCTGCTATAG
GAACAACTTTGCTTCAGGGTGAAGAGAACATTGGCCAGTTTCTCTACCTT
GAAGGAATTGAGTATTATATGTGGAACACATATGATGTTCATTTCTATGC
ATCTTTTTCATTTATCATGCTATTTCCTAAACTTCAACTCAGCATTCAGA
GAGACTTCGCCGCTGCTGTCATGATGCATGATCCTGAAAAGCTCAAGCTC
TTGCATGATGGAAAATTGGCTGCAAGAAAAGTTCTTGGTGCTGTTCCTCA
TGATCTTGGTCTATACGACCCATGGTTCAAAGTGAATGCATACACACTCC
ATAACACAGACCGATGGAAGGACTTGAACCCAAAGTTTGTACTGCAAGTT
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GCCATCTGTTTATATGGCAATGGCATATATGGAGCAATTTGATAAAGATA
AAGATGGGATGATTGAAAATGAGGACTTTCCAGATCAAACTTATGATGTG
TGGTCCATGGCTGGTGTAAGTGCATACTGTGGTGGTCTTTGGGTGTCTGC
TCTTCAGGCCGCATCGGCTTTGGCACATGAAGTGGGCGATAAAGCTTCTG
AAGAGCTTTTCTGGAACAAGTATGAGAAGGCAAAGTCTGTTTATGACAAG
CTGTGGAATGGTTCTTACTTCAATTATGATGATGCAGGCACTAAAGTTAG
CACCTCCATTCATGCTGATCAGTTGGCTGGACAATGGTATATATCTGTTA
ACTGTATTGTTTTCTAACTTCGTTCTGGTTTCCGAATCTGCACCAATCGT
ATCAACCAACTTTCTTGTGATGAGAGAAACAGAAACAAGTTAGGCACATA
GCACAGTTTTTATCTTCCGCCGCCGAAGCATTTCCTAAGTACTAATTCCT
TGAGCTTCTGGCATTATCTAATGATAGCTATGCTCATTCAGATTATAGTA
AGGAAAAATGTTCGTTCATACTTTGCTAATAAATTTCTAACAGATACATA
TTTATACTGTATTTAGTCTGCTTTCTGAATGGCTGAAATCAAAGTACCAA
GGGTGAAAAAAAATCCTTTTAAAAGTACCAGGGTGTGCTCCAGGTCCAGT
TGTATATATGAACTCCATTGATTCACAATGTATTTCTGTTCAAGTGTTGG
TTCTGTCACATATCTAACATGTCGTTTCCTAATGCACTTACATGTGAACT
TGGTTCCAGGTATGCCAACGCCTGTGGGCTCTCTCCAATTGTTGACAAGG
ACAAGTCACAAAGTGCATTAGAAAAGATATATTCTTTCAACGTGATGAAG
TTCATGAATGGTAAAAGGGGCGCATTGAACGGGATGTGGCCAGATGGCAC
TGTGGACATGTCCACAATGCAATCTAGGGAGATATGGCCAGGCGTGACGT
ATGCGCTTGCTGCAACTATGATTCAAGAAGGCCTGGTTGAGGAAGGATTC
AAAACAGCTGAAGGGGTCTATCATGCTGCCTGGTCTCCAGAAGGACTTGG
GTGAGTATTTTGAATATTAATTGAGTTTTCGTGTGGTAACATCTGACTTG
AGGTGAGAAACTGAATCCGGTTTATTATCATCTTGGCTAATTTAGATCTT
GTAGAGTTGACAATGCAATATCTTCTCCAACTTCCGGCTTCCATTGTATT
GTCTAGAAACACTCCATTGTATTGTCTAGAAACACTGACAATTTTTGTTT
CCAGATACGCATTCCAAACTCCTGAATCTTGGAACAACGACGACGGGTAC
CGGTCCCTGTGCTACATGCGCCCGCTCGCCATATGGGCGATGCAGTGGGC
CCTCTCAACACCAAAGCTCCACAAGGAGCCCCATACAGATGTAACACAAG
CTTCCTTCCCTAAGACCCAGTTTTCGTATGCGCGAATTGCGAAGCTCCTG
CAGTTGCCTGAAAACGAAACGTCCAAGAGTACCCTTCGAGTGATCTATGA
GATAGTCCGGAATAGGTTTAGCTCATGATTTAAGGGCCGCTACCTGCCTG
AATACTGAATGCCCCCATTGCTGCAACATTGATGAATGTGATTGTTGGTT
GCGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.