Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023104

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023104
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023104
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAAACCGTCCGCCGCGCTCCCGTTCCTCCCGGCTACATTTCTCTCGCG CGGACCGCAGCTCCTCTCGCCGCTGGGCCCTTTGTTCTCTCGCCGGACGC CCTGACCTGGAGGGGGTCATTCGTGGGTGGCTCTAGCGACGCAGCTCGTA CCTGGAGCCGGCAGATCACAGTTGGCGCAGCCAGTTCTACTAGCTCGAGC GCAGCAGCTCGTAGCCGTCTGCGGGCTGCGGGCTCGTAGCTCGTTCCGCG CTGGCTTCGTGCATCTGCAAGGGAGCCGCTGTGCAACGTCTCCGTAGTTC TTCGACTCGCCTCCAATCCCACAGGAGACACAAGACGCAGGTAAATTTCC ACGGTCCGCTTCTAGCTTGCCCTGCATACTCCATTTCTGCCTATAAGATT CAGTCTTTCGGGGGTTCAGGCTTTTTTTTCATGTACTTCTCCTGTAAACC GAACAGTGTTCGTGAACGACAGAATGAGCCAAGAAAGGGATGTAACACAA CAAAATTACTCTATTTCTGCGTACTATAGGATTCAGTCTTTGTAGAGTTC AGGCTTTTTTTCATGTACTTCTCCTGTTAAACTGAGGAGTGTTTGGGAAA TACGACAGAATGGGCCAAGAAAGGAATGTAACACAACAAAATTACTCCGG GGTGTCTAAAATCCACTCGCAGATTTTCTCCAGATTTTGTTGTTAAAGGG GAAAGGACAGAATGTGCCAAAAAAGGAACGTAATAATAACAAAAAATACT GTCAATGAGCTGTGTCCCAGCTAGAGCCTGTCTCTTCTCTCTCAAGACTC CAGCCACGGCTTTATAAACCTCGACGACGTCTCCTCTTCCCACCCTCCCT GCCTCGCAACAAACCATCTGCTCTTCGCGTATCCTTTGCTCTGGTCCTCT AGATAGTGCTGTAGAGTTAGAAATGGCGGGGCAGCAGGAGAGGAAAGAGA GCAGGGCGGCCATGGCAAGGAGGGAGAACGGGAAGAGGGAGGAGAAGGGG AAGGAGGTGGATGTCAAGAAGTTTGGGCAGCGATTCTGCACGGTTTTCTC GGCTCAGGAATCCGGGGAGAGATTGGTGAGGGTTTCTGAATCTCTGGTTA ATCTTTCAATGATGATCATATGTTTATGCCTATGTTTCTCTCCATTATAT TTTGATTGTCTAAAAATTCAAGTAACTGCTCATCCACCAAGCCGGTATGT TTCAGATGGAAAAGGAGAAAAAAAAGAGAGCATGGACGATTTCCTCTGAA TCTTTGTTTCTTTGCAAACTTTGACAGTTCGGTTGTCTTTGATGAGGATG GGATGATTTGACTTTGATCTGTGCTCTTTCTTATTTCCTTTTCCAAATGG AATTTGTGGTGTTCATATGCATCGATTTAATTGGAGAATAAACAGATCCG ATCAAGCTAACATAGCATTGTCCATGCCTAAGCTTTTGTCAGCTTTCGCT TGGTTTTTCCCTACTTAGTTATCAGGTTTAGCAATGGCGTTTGTTTGCTT TGATTGTTACAGTTTGTTGATTGGAGTTTTGCTCTGCTTACTGCTTACTC TGTTTTAGGGATGCTTACTGCTTACAAGTTTTACTGGAATGTTCTCTGTT AGTCCAATATATGACACGATGCTTCCATAGTGAACTATATTCTCCTAATT CCTTGATTAAGGTCAGCTTGCTTATGTTGGTAAAGAAAAAAATGTGAGTG AGGACTGGTATAAATAGAAATGGAACTAACTCACATAATCCCTACGGACT CATGGCTTTACGTATGACTGAGATTCAAAAATATATCACAATGAGAGGTG AATGCTGAATCCTTTTGTCCAACATATTTTAGCATCATCAAGTCATTAGG TTAGTGTACTGACATTACCTTTTCCAAAAAAATTGTTAAGGAACCTTTAT TAGATACATGTGCTTTCATGTGTAAATAAGATAAATCATGTATTACATGC TTTGTCTTCTACATTTAAACTCAGGCAACCTTTATTAGATCACAATTTTT TTTTCAGGAAAACTGTTAGATCGTAGAATTGTTAAGGAACCTCATATTTT ATTCAGTCATAATGGGCACACATGTAGGGTTACTGACTTGAAAAGGCAGC CTGCCGACGAGACTGCACATGACATGCTACCCTGATAATCCCAACAGAGG TTAAATAAGGGGTTTTATCATCAATAGAATTAACAAGTGCCTGGGTTCTT GCCATTGCGTCTTTAACCCTCAATAGATTCCAACCAAGTCGAGCATCAAC GGTCGGGACCAGAATTGCATTTTACTCTTTTCGGAACTCACTTGAATGAT AATGTTAAGTAGATTGTACTAATGATCTGTCAAAACATATCTCAAAACAC AAAGTTCTATATATGGATATTTGTCAGTGTTCATTATTACATGATTTGGT AAATGGCAGGATCATTTACCAATTACCAGTATACTATTTGTAAAATGCAT TAATGTCGTCTGTTACGTGACATTTCTTCTTAGTTAATGCACATTATGTT GGGCCGCTATTCTGCAGGGAGAGCGATTGGTGAGGGTTTTCGAATATTTG GTTAATCTTTCACTGATGAAGTTGATATGTTTATGTTTCTCTCCAATAGA TTTTGATTGTCTAAAAATGAAGACTCTTGTTTTGGTTATGTGCTCATCTG CCCAGTCGGTATATGTCAGTAGGAAAATGTTCAAATCTCCGCTTTCTCGT GACATGATAATTTCCTTGGTGGATGTGTATTCTTGATTTTAAATATTTTA CCATCTTTGTTAGTTCAGTTTTCTCTAAGGATAGATGATTTGTCTTTGAT TTGTTGTCCATTTCTCATGAAATAGAATTCATGGTGTTCATGTGCACTGT TCAATTGGAGCATAAACTTATCAGATCAAGCTAACACATCATTGTCCATG CCTACACCGTTGTCTGTCCCTACTTAGTTATCAGGGTTAGGAATGGTATT CTGTTCGTTTGCCTTGCTTTTTTCAATCAACTGATTGCAGTTTCAGTCTG CATACAACTTGTGCATGAATGTTCTTTATTAGTCCAATATATGGTAGAAT ACTCAAAAAATGTCATTCTACTATAACATAACATTGTCGCGCCGTTGGAT CCGTATACCAAATTAAGATGCCACGACTGAAAGTGGTTTTACTTTGTGTG ATTTTGGTAGAGATAATTGTAGAAGTGGTGTTCATTTGTTTGAATATATA GATGTTATTTCTCCTTTCATTTTTACCTTGATATGTTTGCGACGTTGACT GATATCTGCTTTCATGAGTAATAAATAAGATAAAAGCAATTATGTGAACT ATATGTTTTATCTTCCACATTTGAAACTCAGGCAACTTTTATTAGATCAT AGAATTGTTAATGCACCTTATATTTTATTGATCATTACGTATAGTGGTTG TTACTTGGATAGCCAGGGTCACGGTGGAGAGGTTAGGTATGTTTTTTTAA TAATAGTTAATCCCTTGACAGATTCTAGAGTAGAGGGACTATGTCGAGCA TCAAGTGTCCAGATCAGAAGTGCATTTTTTACCCTTTTTAGAGCTCACCT GATTGTTGATGTCAAGTAGATTGTACTAATGATCTATTTCCCCAAAATAC AAGGTTCTGTATATAGATATTGTTCCGTGTGCATTACTACATGGTTCAAT AAATGCAAGAATCATTTACCAATATACTATTTTTAAAATGCATAAATGGA AATTCGGAAAAGGGGCATTAATTTGTCGTCTGTTGGATGGAACAAGTAGC ATTTAGGTGTAATGACCATTTTTTTAGTTAGTGCACATTATGTTGGGAGG GAATCTACATTATGTGGATTTCAAAGATTAAAATTATGATAATTCATTGG TTATTTGAGATGGTTTAAATTTTAGCTTGTTTAAAGTTGTTTGCTTTTAT CGGTCATTTATATACCCACATGTTATTGGTACATTTTCATATTTGGTGCT CTTACTTCATAATTGCTTTACTAGCTTAGGACAACTTGGTGCGTTGGTGG CCTTTTAGTCCGACACATGATATAGCATATCATATTTGTTTGATAGTTTT TCTTGGAGCTGTGATTGTATTGCATATGTATTTCACATTGTTACCAAATT TCCATGCGTAACCTTGATAAAAAAATAAGAATTTTTTATGTTATGTATTG CAGAGAATTCCACCATCATTCAGCCAGTACCTTGAGAATGAGATTGGACT GGTTTACCTATTTGGTCAAAGTGGGAACCCATGGCTTGCAGACCTTGCTT CAGACACTGAAGGGTTCTTCTTTGAAAATGGGTGGAAGGATTTTGTTACG GATCATTCCATAGAGGAAGGGCACATTCTAACCTTCTGTTATAATGGAGA CTCACATTTCTCAGTGGTGATATTTGATGAAATGTGTATTGAGAAGCCGT CAGCTTTTCGTGCTAAGCCTTCCTATGATCTGGTTGCTACAACAGAAAGA GATGAGGAGGACAAGCAAATATCGTCTGCCCCCCTTGAGGAGAATAATGC TACCAAAAGGAACAGGACTGGAGAAATAGATGCAAACAACTCTAAATTGA GGAAGCGTTCTGTTGTAGCATCAATTGATTACAAGTCAGCCAGCCCTAAC GGTACAGAAGGTAAACCCTCGTTCATTAAAAACATGGTATTTATCTGCAT TTACTCAGAATTGGGTTCATATAAAAATGGCATATGTAGTAGCTGGTGGC AGGTGATTGGCACAATATACATAAACTGTTAGAGCAACAAGCCGATAAGA TTATGTAGAATGAATATTCAATTCATAACTCTATAACCTTGCGGCAGGCA TGGTCAGATATATGATGATATTGAGTATTAGTTACTTACATGTGTAGTAC AGTATAGTGCTTATAATCTTTATTGGTTGCCATGCATGGCCATAATTTAG GAGGCTTTGTTGTGTCTGACTTGGTACTAGATGCTAGAAGAGATCCATCT GTAAGTGCTAGGTTAGATGCGACTTATACCATTGACATTATACTAATTTT TCTCGAACAATCATTGCCTTATACTGGTTTTGACAATTATTGTTTGTACA TGTTGCTAAGGGTTTGTATGAATTCCCTGCAAGCTTACAATTCTTTTCAA AGATTCTAATTCTTCGAACCGCGTGATAGAAGAAAGTATCTGTCTAGCAG CTATTCTTCAAAGTCAGTAGCGATGCTTAGATTTTCTAAGTATGGGGATA TACGTGAAAAAATTAAGTTATCCGTCCCCTGTACTGTTTTGTTATCACAA GGTTGCTACCACGCATGGGTAGTAAGAGTTGCCATTCTCAGGGCATGATT TATTTAAGTAATTCAATTATGTATTTCACTTTCCAGACGTCATGAGAGTT CAAAGACAGCCAGCAGTAATGTCGCAAAGACCGCCAGTAAGTCAAGGATG GAAGAACTACGCTCTTCAAAAGGCAAAGCAATATAAATCGAAGTATCCTA TAACTCTGCAAATAATGAAGAAGACTAATGTCTACAAGACATATTTCATG GTAATGTTACTTTCCCCCATATTTTAGTACTTATATCAAGTTCAAAAGTC TTCATTTTTTATGTATGCATGTACAAGATTCTTTAGTACACGTATCGAAC AGGATTAATTCTCCCAATTGCCTTTTTTCTGTTTTGCTCAGTGTTAGAGA TTTTTCTTCAGAAAGTTATAAGCTAATCCACTGTTTTCAACATCCGTTGG CATCAGTACTACTATTATTTTCCATGGAATTTCCATTGATGATGCGATCG GTAACTCAAATAACAAACTACCTGGTTATTGTTGTGCAAGAGGTTCATGG TCCAAGTTACTGGTATGAGTAGACTAAAGAATCAGGTTGGGTAAGAAATA TGGGAGTATTCTATTTCCCTGCTCAAAATCTGGAAAAGTAAACCCCGCCA ATGTAGTAAACACACAAAATCTGGACTGGATTAATTAACCTCATAATAGG GAAACAATTATTTTTCAGATTCTTTCACTTAGCTAACGTTTAGAGGTTCC GTATAATTGTATGTTAACTTATTTTCTTATCTGCACTGTTATGACTTTTC TGACTTATAGTCAGCATCGACCAATCATCCGCTTGTAAATGCATACTGTA AAAATAGTAGTAGTCGTTCCAGAATATATGTTCTGACAAGCAATATAGAA GTACCATTATACTGTAGATTATCATTTTCCTGAATAACTTCCTTGTCTGG CAGATTATTCCAAGTGAATTTGTCAGGGAGTATCTTCCCCACACCGACAA GAAGCTGACACTCTTTGATCCGTATGGAAATGCTTGGGAAGTTACCTATG TCTATTGCAGCCAGCGTTATGCTGGCGCTTTCAGTGAGGGCTGGGGCAAG TTTTCTCTAGGTAATCATCTGGAGGAGTTTGACGTCTGTGTCTTCGAGCT CTTATCAGAGGACATCATAAAAGTGCACATCTACAGAGCTAACGCCATGC TAACTCAGTATCTCCTAGATTCTAGCAACGAATAATAGCGCTGCATTTCC ATATTGCCCTGGGGCTCTAGTAGTCAATAATGGGACTATGCAGATGCTAA GAGATATTTGGTGACAGAGTGGCTCCCTGATAAACAAGATTTCACTTTGA TTAAATTGTTGGATCACTGGTTTGTATCATGTTGTATCGGTGCAATTGCA ACCATTCTATTGCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.