Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA039705

[Submit comment/correction]

Sequence
AA039705
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039705
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGAATGTCCGTATAGAGGAATATAAAATGTTTGAGGATAAGTCCACCGC
CATTGACCTTGTTAACGAGGTTGTTGGTAGCGACCTGACTGAGATGATCA
CCAGGTTCTGTGGCTCTCACCAGGAACTACTTGTTGGATCTGCTGAATAT
AAGAGAATAATTGAAGGGAACCTGGTTAGTGTAACTGTGAAAGCATCCTT
GTTGCTTCCTTCTGTGTGAACAGTATATAGATCACCATCATCATTTTCAG
GCAATAACTTGTCGGTGTGATATATTTGTGGAGGAGGTGATGTTGGGTGT
GGAGAATATGATACTATTGCCTGAAGAAACATCAGAGCCAAAGGAGTGCC
GCCTTCCCAGGGACAAAGGAGGATTAATCCTTTTCTTACGCCAATATGAC
TTCGATGTTACAGAAGACATGGTGAGCTAACTGCTTGTCCTTTTTTTTTA
TTTCGGAATCTGCTCTATTGCTCCTTTATCTTGAAGTATGTCCTTTCTGT
TCTTCTCGGCATCGATCCTTAGCAACCTTGAATAGGTCTTCTCTTGTTGT
GCAGTGTTAGTCCTTTTCGATTGATTGTGTGCTTTTACTGCGGTGAACAA
AGTTTTTCATAGATATACTGCACTGTAAATCGAAATTTGGGATCTCAGTA
TGTTTTATTTCGTTAAAATATCGTCTTCTAGAATTATTTTTCTTTTCATG
TTTCTTGCAGTGATGAGATTAAGGCTCACTTTTATGCAGGTTAACAGAAG
TGTTGTTGAGGCGGCTCGTCTCTTATACCATCTGGACTTGCTGAAAAGAA
GTTCTTGAAGTTACCGTGCGACCCTATAAAGGAATTCGTTGATGTATTAT
CTGTCACTGAGGATTGGAGTTTACCCAAATTTGTAACAGCTCTGAAGTTC
TATTGTTACCCTGGGGCACGGTATCAAATGTGGCGCCCTAATGACGTAAT
CGTAATATGTTTCAGATGCGTTTTTGAGTATGCATGTGCAGGAAATTGTC
ATTTAGGCACTAGACCGAACTGTGTTTCTTTCAGATTTTCTCAGGTGATG
AGTATAAAAGGATAATGTCTATGAGAGTGAGACCTCAATACAGAAAAATG
ATTATGTCTAAGATCCGTATCCCATCTGTCTATGAAGATGCTCTTGCTCT
ATATGGAGAAAGGCTTGACATGGTGTGGAATATAGACTGCTTGATGCCGG
AGAAGGCAAAGCCAAAGAAGTTAAGAAAATGGAGAAATCATTCTTTGGGA
GAACTTAATTTGACTGATTTACCTGCTGGCTCAGAAGTTGGAAAAGAAGC
TATTGCTGATCTTGATGGGGTGCTCAACTCTGCCACCGAGGATAATTGTA
TTGGAGTCACTGTACTGAAGAGCAGTGAATTAGATTTATCTAAGAGGCCA
CGACAAGTTGTTACTTGTGATAAGCAGGCTGCCGATACTGACGCAAAGAA
AGCGAGTGCAACACAAAGCATCGATGAAACTGAGGACAAGAACCTGACTC
GAGGCACTCATGGTCTGGTGGGAGATAAACAGGACGGAGTGGTTCCTGCC
ATAATCGCAATGTCTGGACCTGTGCAGAATGAAGAAAATCATGCCAAGAA
GCTCGTCGAGAATCTGAGGGACATTCAGGTAGAACAGCAGAGAAACACTT
GCACTTTAAGTTGCCCAAGAACTAGAGTTTGGTGGTGGTTATATTCGGGG
CATGCTTTCATTGATGCAGTGCTATATGCTTTGTACCCAGTAGCTGCATC
TTATTAAGGGTAGTGTTGAAATCACTGACTAAGATTTTATCTGCACGCCA
TCCCAGCCTTAGATTCTTTTTTTTTGTGATTTATGTGTGACTCGTCTTCA
GAGTTTGTACTTAGATAGGTACTTGATCCCGGTTATCTGGGATTTGTCCT
TTTGTGTGGTTCTATTTAGTTTCTTGTGCTTCTCAATGTAAATTACCATG
TATAATTGTTTAAAATGGAACATACAAACTACTCGTTGTGTTGCATACTG
ACACATGTTTCAGGGCAAACATGATGAACTGGAAAAGAAGTTCTTCGAGG
AAAGAGCTGCTCTAGAAGCTACATACCAGAAGCTTTATGAGCCACTATAC
TCGAAGGTATAGCACATATTTAGTGATATATTTTTTTATCAATTTTGTGT
TGCAAATGTATGGCGATTTCTCCTCCATACTTTATTTTCGTAGTTCACAT
GTTCTAACAGAACCTTGTCATGTTGCTGGTGTCCTATTTATTAAGCTGTG
TTCTCTGTTGACTTTGTTGTCCAACTTGCAGCGTCTCAAAATTTTGACAG
GTGTTGGTGAGGAACAGGGCATCACAGAAAGTGGCGATGAGACCCCTCCG
GAGCAGGACGGTAATATTTCTCTTATTCGTACTATAATATCTTTTTGCGT
GTACAGATTGATCCTTTTCAGTCCTTTTAAAACCCGGTTACAATGCTGTC
ATGCAGAGGGGAAAGGTGTTCCAGATTTCTGGCTTAATGCAATGATAAGC
AATGAAATCCTGGGTGAGGAGGTGAGTCCACACTAGTTTGTAGATTCCCC
TATTATAAACTTGCAATGTTCTATGTCCAGAGTAGAACGTGAGTCTATTT
AAGTGTATGGATTTCCTTGCTTCTAATGATAGTGTATTAATCTTATCTAC
TTCTGTGTTCAGATCAAGGAGGGGGATGAGGAAGCTCTGAAGTATCTCAA
GGACATCAAATGGTGCAGAATTGTAGATCCAAAGGGTTTCAAGCTTCAGT
TTTTCTTCGATACCAATCCGTTCTTCAAAAATTCTGTGCTAGCTAAAACG
TATCACATAGTTGGTGAAGATGAAACCAGTCTAGAGAAAGCAATCGGGTA
TGTGATCGTCTTTGCTTTTGCAAAAAACAATTTTTGTGCCAGGATAAATT
ATTTCATCAGCATCTAATATTTGTGAATTGCTTTATTTTTCAGGACTGAA
ATTGAATGGTTTCGAGGTAAGTGTCTCACACAAAAGGTGCTGAAAAATAA
GCCAAAGAAGGGCTCAAAAAACACAAAGCCTACCACAATTGTAGAAGATT
GTGAGAGTTTCTTCAGGTTCTTCAGCCCCATTGAAGTTCCTAATGATGAT
AAGGAAATTGACGTGAGTTGAACAAGGTTATATGGTTTTTGATATATCTT
ATGTTGAGAATCTTTTTCCCTTTTAATGACCTTTTTGTGTGTTTGCTTCT
CTTAACAGGCTGAACAATTGCTGGAACAAATTGAGAAAGACTATGATATT
GCGTAAATTCATTTACACTTTTAAATGCTAACGTTATTTTTTATACATCA
TATTGATGTAACGATTATTTTAGTAGCACACCTTTATTTTTTTGCTTTTT
AATGAAAATTGTCCTATTGACAGATTTACCATCAGGGACAAGATTATTCC
TCATGCTGTTTCATGGTTCACTACAGAAGCTGCTCAAGATGAGTACTACA
AAGCCATTCTCGAGGATGATGAACATAAGGAGGATTATAGTAGTATGGAC
GCTATTGACCTCTCCGCCCTCGGATTCCTACCTTTCTCCGCTTCGTTGAT
GTTGCTTGCTCTTGCTTTTTTTCTCATGGTGATTTAGTTTGGTTCTAACT
GTTTGTGGTCATTCCTGTTGACGCAGCACTCACACGGGAGCAGAACGCTG
ACATCGTGGAGTCGTTTAAGGTATTGTGATTTTTCTTTCTAAAAGAATCA
TCTCTGGATCTCATTGAAATGTGTCTGGTTGGGTTTTGGGGGACGCTTGT
GTGGTGATGTTTTATTCGATTCAACGATACTCCTGCGAAGAAAAAGCTGC
CGAGGTTAGCGGACGTTCTCGAGAGCCTTGCACCCAATGTCAGGAACCAC
GTGGAGGCACTGATGGAGCTTCAGGTAAAATCAAAACATTTGTTTTTGTA
CAACTTCAATTACATACTCCCTCCAGTCCATATTAATGGCCTTAACTTTA
GCTAGATTCGTATGAATCTAGTTAAGCATTTAGACTAGATGCATTCATAT
GTAGACAAAGTTGAGGTCATTAATATGGACCGGAGGAAGTAACTATATGA
GTTTGAATTAGAAAATGAACATTTTTGTGCAAGTTTAATTACATAACTCT
ATGTGTTTGAACTAGAAACTAACCTATTATTACATGTTTCAGCGTGAACA
TAATAAACTAGAAAATAGGCACTTCAAGGACAAAGCTGCTCTAGAAGCTA
AGTACAAGAAGCTTTATGATCCATTGTACTCAGATGTATAGTATTTTGCG
ACGCTTTCGATAAATTTTAATTTTATTTTGCAAATGTTCATAGTTTCTCC
TCCATATTTTGTTTTGTTACCCACATGGTACAACAAAAACTTTTGTGGTG
ACTGTTGTGCAACTTGCAGCGTTGCAAAGTTGTGACAAGTGAGGTAGAGG
AAGGTGATGATGAGAACCCCACGAAGCAGGACGGTATGTCTAGGGCCATT
TGTAAAATGAACTAAATCTTTTTCATCCTGTTTAGAACTTTGTCATGATG
TTTTCCTACAGAGAGAAAAGGTGTTCCAGATTTCTGGCTTACTGTCATGA
AAAACTATCAAAACACACAAGCTTTCCGTTTTCTCGGGAAAACCCCCCAT
CAAAAGTTGTCTTTGGAGGTGAGGCCACATTAGCTTGTTGATTCCTGCCC
CCTCTCCTGAAATGTCAATGTTCTCTGTCCATAGTAGAACCTGAGTCGAT
CTGTTAAGTGCATAGATTTCCTTGTTGCTAATGGTACTGGTATTAATCTT
TTTTATTTTTGTGTTCAGATATGTGAGAGTGATGAGGAAGCTCTCAAGTA
TCTCAAGGACATCAAATGGTGCAGACCTGATGGTCCGAGGAAATTCAGGA
TTGATTTTTTGTTCAAACCCAATCCCTTCTTCAAAAATCATGTACTAACT
ATAATGTATGACATGATTAATGAAGATGCACGGCTTATAGAGAAAGTATT
TGGGTATATTTTTGTTCTTGCGATTTTTTTTTGGTTTCTAGCATAAACTG
TTTCATCAGCATCTAATATTTGCCAACTGCTTTAATTTTTCAGGACTGAA
ATTAATTGGCATGCAGGAAAGTGTTTGACACAAAAGAGGCTCAAAGTGAA
GACAAATGGTTCGAAAAACACAAAACCTATCATCCTGACAAAAGATTGTC
CCAGCTTCTTCAAGTTTTTCAGCCCCCCTGCATTTCCTCATACACCTTAT
GTTGAATTTGACTTTGTAAGTTGGAATTTTTTTGGTTGTTTATATGCCTT
ACGTGAAGAATTTTTGTCTTCTTCCTGACCTTTTATATGTTGCTTCTATG
AAAAGGATGAAAAGTGGCAAAAGAAAATAGAGGCACATTATCTTATTGGG
TAATTTTTCTCATTGCATTTTATATATGCTGATGGTACTCTGAAATACAC
TATATTGAACTATTGTTTTAAAAAAGCTTATAGATAACACTCACTGTTAT
TTTTATTCTGAATGTGATTTTTCTATTGCCAGATCCACCATCAGGAACAA
GATTATCCCTCATGCCTTTAAATTGTACGAAGGTAAGACTATTAACGAGG
ACGAGGAAAATGAAGATGACATCTTTTCCGAGGAAGATGATGAAGATGGC
ATCTTTTCGGAGGAAGATGATGATGAAGAAGAGGATGCGGAGGTATGTGA
ACTTCATTGTTCCATGGAGGGTTGGTTCTTTGATACTTGTACGCAGTTTT
CACGATTGTTGCTGCAGTGGGAGGAGCTGTACATGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.