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GrainGenes Sequence Report: AA035702

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Sequence
AA035702
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA035702
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGCTGCCGTATCCCCTCTTCCTCTCTGTCTCATATCAGGTGGACGCCGGC
AGCCCGGAAACCCTAGCTAAACCCCGCTCCCAATCCCCATTCGCGCGCGA
CCCCAACCCCGAGACAGAACCGGCGAGCGGCGGCGGGGGCAGCGGCGGCG
AGGATGAGGAAGAAGGTGGACGAGCGCATCCGCACGCTGATCGAGAATGG
CGTGCGGCAGCGGCAGCGCTCCATGTTCATCATCGTCGGCGACAAGTCGC
GCGACCAGATCGTCAACCTCAACTACATGCTCGCCAAGTCCCGCGTCAAG
TCGCGCCCCTCCGTCCTGTGGTGCTACCGCAACAAGCTGGAGATCAGCAG
CCACAGGAAGAAGCGCGCCAAACAGCTCAAGAAGCTCATGCAGCGGGGGC
TCATGGACCCGGAGAAGGCCGACCCCTTCTCCCTCTTCCTGGAGACGTCA
GACATCACCTACTGCCAGTACAAGGACTCTGAGAGGGTTCTCGGCAACAC
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CTTCTCACATTCAGAGTTCAAACTCTGTATTAGAAAGTACAAAAAAAATT
ACCTATGAACTAATGAACAGACTATGGATGCACATGGCGGGTAAAAGACT
GGCCAGTTGGAGCCTTGAACACGATGATCCGGGCAAAGATTGGCAAGCGT
CGGTGGCCGGTGTGGTGATCGGGTGAGGAGGTTAACAACCACGCCGGCGC
GCAGGCGTAGCGAGTCAGCGTCTTGGCGTGGTCTAGAAGAGCGAACAATG
TGGCTGCGCGGGCAAGTCTCCGTGGCGGCGGCCGCCGGGCACGATAGGGT
TAAGGAATTGAGGCGTCGTTTACTCATTTAAATCGCGAACAGTTTTTTCT
CTCTGCTAAGGAAAAGCACACGAACAGTTTACTTGTTTGGACTTTGGATC
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ACAGCCCGGGTTATTCCGGCCCAGAGAGACGGGCTGGGCAGCATGGAGTC
TGAAATTTCTCAGGAATTTACAAGGGAGATACCTGTACCTCGTGGCCCAG
ACCGGGGCTGTAGCCTGGGCTGCCCGGGGCCCAGGCCGCCCCTGGTTGCT
ATGATAAATTGTCTGAAATTCTATGTTTATTCATGCAGGACTTCGAGGCG
CTGACACCGAACCTTCTGGCCAGAACCATTGAGACCGTTGAGGGAGGCGG
TTTGATCATCCTGCTGCTCTCTTCGCTCTCCTCGCTAACCAGTCTCTATA
CCATGGTCATGGTGAGCTCATTTCTCTCTTGCAAGTCCCCTCACTTTTGT
TTCCGAGCAAACAAGCATGATTTTGGATTCAAGGCTGAGCTAAAGCAAAC
GAACTTGGGTGCTAACAGGATGTCCACGAAAGGTTCCGAACGGAGTCTCA
TACTACCGCAGCCACAAGGTTCAACGAGCGGTTCTTACTGTCCATAGCAT
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TCATCTCACATGAAATTTATACAACCAGTTACAAATAATGAGGTATGCAT
CTTTTTCTTATGCCCTTTGAAGCTTTGCTTTTAAAATTATGCATCTCTTG
AAGATTCTGGTTGTGCCAATTTGGTTATCTAATTCCTTTTTGACATGCAT
ATTATACCATGTGTTTAGGATTCCGAGGGTTTGTCAGAAAGGGAACGAGA
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TGATTGGGAAGTGCTGCACGATGGATCAGGTGCAATTTACATACCTCATA
CACTGTCTGTGTTTTCCTTTGGACATAAAAAAACTGCTGGTCCCTACCAT
AAACTGAAAATGGAAAAATATTCACAGGGTAAAGCTGTCATCAATTTCCT
GGACTCTATTTTGGACAAGTCCCTTAGGAGCACGGTTGCCTTACTCGCTG
CTCGTGGACGTGGAAAATCGGCTGCCCTTGGTCTTGCTATTGCTGGAGCC
GTCGCAGCTGGGTAAAGCCCAACTCAGTAGTGTTATTTATGTATTCATCA
TGTGCTCCTTTCATTAAGGCTAATGCTTTGGCTTTCCAGGTATTCAAATA
TCTTTGTCACCGCTCCAAGTCCGGAGAACCTTAATACACTATTTGATTTC
GTCTGCAAAGGAATAAATGCATTGGAGTACAAGGTGTCTGTTTGTTATAT
TGTTTTATTGTTGAAGTTTAAACTTATGTTATGTTGTTGAGAAATGCATG
CTTTATTTTCCCCTTTTAGGAGCATTTGCATTATGATGTAGTCAAGAGTG
CTGATCCAAATCTCAGGAAAGCAACAATACAAATAAACATCCATAAGCAA
CACCGTCAAACAATCCAGGTAATAAGAATATTTGCTTGCGAACATATTTT
GCTACCGTCAAATATCACTTTGCTTAGTATCAGTGAACTGGTTCAAAAAT
TTCTCATGTTTGCAGTATATGAAACCACATGATCATGGAAAGCTTTCTCA
AGTTGAACTTCTTGTCATTGATGAAGCTGCTGCTATTCCATTACCGATTG
TTAAGTCCTTGCTTGGTCCATACCTTGTTTTCCTGTCTTCCACTGTCAAC
GGGTATGTTTGCCTTTAGTCACTAATGCTCTAGAATCACAATTCATGAGG
GTGATTGTTCTGTATATTTTCCTGTTGAAGGTATGAAGGAACAGGTCGAT
CCCTGTCTTTAAAGCTCCTGCAGCAGTTAGAATCCCAAAGCCAGCCATCA
GCTTCGAGTGATGGACCCAATTCCAGTACGAGTCATCTTACTTTCATCTA
AAATAGTTGTCTACATTTTGAGAGAACCTTCCGAGTATTTGCATCTTTTA
CACGTGTTTGTGCTTTATTTTGGCTTCTAGGTAGGCTATTTAAGAAAATC
GAATTGAATGAATCCATCAGATATGCATCTGGTGATCCTATTGAGACCTG
GCTTAATGAGTTACTATGTTTGGATCTTGCAAACTCCATTCCAAATATCA
GTAGGTGAGTATGATCTGATTTATGGCTGTGCTGTATTTTTCTTTTCTTA
TATTGTTGCATGCTTAGCAAGCAAGTCTGTGGTTTTGTAGGCTACCTCAT
CCAGAAAAATGTGATCTGTATTATGTCAACCGGGACACACTTTTCTCATA
TCACAAGGAGAGTGAGGTATTCTTACAGGTATGAACTAATAATGTTCTGT
TTTCCTTGTAAATTTATATATTTGGTTTAAATATGATACTGAAATATGGG
TGCTTTACATGTCCACTAATGGATATTTATTCTGTGTACTTAATATTTCA
GCGGATGATGGCACTTTATGTTGCTTCTCACTACAAAAATTCACCAAATG
ACTTGCAATTAATGGCTGATGCACCAGCTCATCACCTTTTTGTACTGCTT
GGTATGGAGCAAATTGATTTGCCGGCACACCATTTTAATATGATGACACT
ATTATATAGTACTAACTTGTATTCTTTATTTGTTAGGCCCGGTTAATGAG
TCCGAAAACCAGCTCCCTGATATTTTGTGTGTGATTCAGGTTTGGATACT
CTATCCTGATTATCTTGTGGAGGATCTTAAATTTTGAATTTTTCTCCAGA
TGATAGGGTGGTTTATTAATTGCACGGTGACTGAACTACATGAAACAATC
GTACATACATGAAATACATGCTAATGCCAGGCACAAATAAGACATAGAAG
ATATTCTTTGTTATTTACCTACCACATTTGAGCTTTGTTGCCAGTGGATA
TCATGCGTTTGGGCAAAACATCCTATCCTAGTTTCTAGTTAACCAAACTG
AAATTTTGCTATTTGCTATCTGTTGAAGTGTAAAATCGCTCCCTGCTACA
TATAAATAGAGCTTATTGTATAAAGTTACTCTGTTTTGTTACTTCATTGG
AGTGTGCTCAAACTACAGGGGTGCAATTAACGTCAATAACTTATGTCTAG
TACAGTTGTTCAGTGGTCATTGTATGCTGCAGGTGCACAACATGCTGTAT
GTATGAGTTAGAAAATTCTGGTCGAATTTGGGAATATGACCTGATCACTC
TTTTATCTTAGTTGCAAATTTTATTTTTTAATATCGTTTCCTACTACTTC
AGTTTAACCTCCATCTGTGTTACACGTGCTCTTTAGGACACCTTATCGTT
TTAAAAACCATGGTTATATTACTCAAAAACTGCCTTTATTTTCTGATAAT
CTTATAGTTCTATGGAAAAAACGTGTTTCTGTTTTATACTTGAACTAATT
CGTTTTATCCTACGGGTTAAACTCACTAGTTAAGCTATGTTGATTGCTAT
TCCTTCCGCCTTCATGACGTGGACAGTTTCCTTCTGTCGACACCATTCGA
AGTTCATCTAGGAATTTGAGATTAGAATCTTACTAGATAGCTTATACACT
CATTCACCACATTTTAAGTTGCTAGAGCCTGTTTGAAATGTTCAGGTCTG
CCTGGAAGGACAAATATCTCGAAAATCAGCTATTAGAAGCCTAAATGAGG
GTCATGCACCTTCTGGTGATCAAATACCATGGAAGTTTTGTGAACAGTTT
CAAGATAATGTTTTTCCCAGTCTTTCAGGAGCTCGGATAGTACGGATTGC
TGTTCATCCAAGTGCCCTAAGGGTCAGTATTTTGCCTCAATTAAATGTGA
TTCTACCTATGTTAACATCACTCTGTGTTCTAAATTCTCTCTTTTTTTAA
TAACGCAGCTTGGGTATGGTTCAGCTGCCGTCAACATTCTAACAAGGTTA
TACATTATTCTTTTTTTATTACTACATCTAGGGCTCTATCAGTTGAGGCT
CTTACGTTTTTCTTAAGCCTAAAATTTGACAATTAGTTAGGCGTATGATA
AGACAGGGGAACTTGCAATATCTTAGTTGTACCGCCCTGGAACATGACTG
CTAGGCCCATGGAGGGGCAGGGAGGTATGGGCAATGTCAAACTTCGACGA
GGGCAATGAGGCAAAAGATGCTGCCTGTAAGGGAAGATGACTGTGTCCAA
AGGCTGCAATCCTATATTTCCTTCGGAGGCGAATGTAGATAAAGCTGCAG
GCATGGCTTGCCATCGTTCAGTGAAGCACGACCTCTAGCAGTCTTGTGGT
GGTGACCCATGCCGTGAAGGCAGTACCAGCTACGAAAGTGCGGCATTGCA
CAATTCAGTAGGTGTTGGGCATGGATGGGTCTGGCCTATGTTACGTCGGT
GTACACTGACCAGATACTTCAAATACACCAGGATGTATATACTGCATGTG
TTTGGAGATATTCGCACTTCCTAAGAAAACAAAATAAATGCCAATGCTTA
TGGGATACTCTCCCATACCCACCCAATGCATATATAACCCTATGGAGGCA
CCATTAGGCCTCTTGCACATTATTTATAGTTGACAGTGAAATAACTTACA
ATAGAGTGCATATCAAGCTGGTAATAGCATTTGCATAAATTTGTGTTGTT
TGGAGTTGTACTGAACAAGAGGCATGCCTGAAGTATTTTGCTTATTTCTA
TCTCTGCAATATCATACCCTAATTTACTCTTTAGTAGTTATTTCATGTAA
ATCTTATGCTATGCTCAACCTCTGTCAAATATATTAGTCTTAACCTATTC
CTATTTTATTGACAATTACATTTGATTTGATTGGTTCCATAGGTACTATA
CAGGAAGCATGACAGATTTTAAAGATGAGGAGGAAGTTGAAGAGCCTGCA
GTAAAAATTAGTGAAGCTGCAGAGAAGGTTCATTTTAACAACTGTGTTTT
TTTGGTTCTTTTTTCATATCTTAGTGCGGTAGCATGAAGTTCCTTTATTG
TAATCTTGGAATCATATATATATTTACTGTCCCATACTTGTGAATTTGTG
CAAGTTCTACTTTATTTCATCATGTAAGAATGATTAGGTCCTTTTTCGAT
GTATGTATGGCTTGTGCCTCTCCTCACTTGTGTACCATCCAATTTTGTAT
ATGTTCTTGCAGGCTTCTCTGCTAGAAGAGAGCATACAGCCTAGGGCAAA
TCTTCCACCTCTCCTTGTTAATCTTAGGGATCGTCGCCCTGAAAAGCTCC
ATTACCTGGGTGTATCTTTTGGGTTGACACAGGAGCTTTTCCGATTTTGG
CGCAAGCACGACTTTTTTCCGTTCTATGTGGGCCAGATTCCAGTAATGAT
CTGATCTGATTTGTTATTTCATGAGGTTAATTGTTCTCACCCTTTGCCAT
GCTTTTATCACGGGCATTAATTAGCTGTTTCTGTTTCATAGAGTGCTGTT
ACTGGAGAGCATACCTGTATGGCCCTGAGTCCCCTAAATAGTGATGACAT
CAAAGTGGGTGATGATAAAATCAAGTCTGGATTTTTGGAACCATTTTATC
AAGGTATACCTGAATGTTCTTTTATATTTTGTAGTGATCGGTGTTTTGAA
CTGAAGCTGCCTGAGTTGTAACTGTATAAGTTAGAGTGAATAGAAAATGC
TATGTTGTTTTTTGCCTTAGCTGATAGATGCACAAGGTAGTATTGCTTCT
TTTGTTTTACAGCATGCTTCTGCTTTAGAAACATGCTTTTGGTGCTCTAG
CTAACTTTATAAGTAATATGTCCAGATTTCAGACAAAGGTTCAGGCGGCT
TTTGGGAACATCTTTCCGGCATCTCAACTTTAAGCTTGCAATTAGGTATG
TTAAGCCTTCATATTACTCTCTTAGCAAAAGACAAGTGCTTCTCTAATAT
ATTTTTTGTCATGTTTTTAGTGTTTTGGCTTCCAAAATAGATTTTTCACA
TCACGAGCCTTCAGAAAATGATACCAGTTCGACACTGAAGTTACTGAGAG
ATGTATTATCCCCACATGACATGAAGCGGCTAGAAGCATATTCCAACAAC
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GTCTATTTTGAATGCAGTTGTCATAATACGTTTCTTTTTAATTGTTGTAA
AATCTCTACTACCTCTTGATATTGACCTCACTCATCACCTGTGCTGCAGA
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TCTTCTTTGCTTCCCGCTTGGTCTTTTTTATCTCCTGAAATGCATCTTTC
CAAAGAAACTTGAAATCTTCATTGGCTGCCAACATTCCTGTATGCAGAGT
AAACCTCCTCCTACATATATAGCTATACATGGTAGAAACCTTTCCAATTT
AAATATTTTTATTTTGTAGATTTTGGATCTTGTCCCTATCCTGGCACATG
AGTACTTTTCAGAGAAGCTTCCTGTTACATTACATGGCGCCCAAGCTTCA
GTCTTGTTCTGTATGGGTCTGCAGGACAAGGACATAAGCGCTACAAAGGT
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CTGTCTGGTAATTCTCTTATTTTCTCTGTTAACAGGAAGAGCTTGGCATA
GAAAGGGAGCAAGTTCTATCTAACTTCATAAAAACAATGAAGAAGCTATA
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GCCTGTAATATCTCTGCCAAAAAAATGTTCGCACCTCATAATTCCTTTTT
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ATGGTTTATTCACACGGAAAATTGAGCATGGCTATTACTTTGGAATAGTT
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AGTGAAGGTGAGATTTGAGAGATACATCACCTCGTCTTTGAATTGTGATG
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TGTTACTCTGCCTTTGGTAACCTTTGCTCATAATACAGGAGAAAAGAAGA
GCTGCAGATGAAGCTACTGTGGACCCAAAGTTACTGCAAAAGTATGCGAT
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CTGCAAGCGGTGTTATCAGTGTAAAATCCAATAGGACAAATGCCGACAAG
AAAGAGAAGCACAGGGAAAAGGAAAAATCTAAAAGGAAAGGAACAGATGG
TAGTAGATCCGAGTCAAAGAAAAAGAGGACTTGAAGCTCTCCACAAGAGG
AACTGTTCCCCAGAAAAGAAAACCCTTTTAGCAGCCAGAAATTGAAAAAA
AACTCGATCATCTATCTGAAGAGAATGGGTAGAAGAGAGCAGAGGTTGTG
CCTAAGCTCCATTACAGGCTATAATTTTGTAGATCGACGATAAACGCAAT
AGTGTGCCCTGTAAAAGGTCTCCAAAAAACCCTGTGGCACTATAACGCCT
CAATTTTGATACTGCATCATCATTTGTTCTAATGGAATACAGTTTTGCTT
TCTCGTGACTGTATAATTTGTTTTGTTGGGAAAATTTGTGGATTAAGTGA
CTGGACGTTTTATGCTTGAAAACACCACCATGTTTGAAGATCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.