Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA031482

[Submit comment/correction]

Sequence	AA031482
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA031482
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTGCCATCTCCCTCATCAGATCTCTCTCACGTCACCACTCGACCAGATCC ACATCCCAAACCTCCCGCGGCAGCAATGGCGGCACGGCCGAGCCTCTTTT ACTTCCCGTCCGACGCCGCGCTCCTAGACTCCTCCGGCCTCCCGTGGGGC GTCGCCGTCACGCCTTTCTCCCCCACCGACGAGCGCGGCTCGCCTCCGGT GACTGGCGAAGAGGGCCACCTCCTCCCGCGCTGCACGTCTTGCTTCGGCT ACTTCAGCACCCATTGCTCTCTGCACCGCTGGTCGTGGACGTGCCCTATC TGCTCCGAGGACAATGACCTCTCCGCCGACGCCGCCGCGCGCTACGCTCG CGACGGCAGCCACGACCCGCCCGAGTTACGCTCTGCCTTCGTCGACCTCC TCCTCCCAGGTATGCCTCTCGCACTTCCGATCTGATGCAATGTGGTGCAG TGAGATGATGGCTTGTTATATTTTGCAGGGGAGGAGGGCGATGCGGCCGC TATGACGACGCCCGTGTACGTGGCAGCCATCGACTTATCCTGTAAGATAC GATGATCTCAGAATTTTCCTCGCCTTAAACCATACACATTCGGTTCCAGC TTTACTTGTACTGCGTCTCCAAATTTTTTGTCATCATCATGGACGACGGA TAAACTCACAAGAAAAATGGTTGCCTGTTAAGTTCTAAGCTCGCTAAATA TTTCCGCATATGAATAAGGTTGCACCCTGATAAAGGGCGCCTTATGAATA GATAAAATAACGGCTTTTCTGCACACATGCCTTGAATTTGGTCCAATAAG TGATTGATTAGATTCTGCGGTACCTTTGGATGCTTGGTTGCTTTGCTTTC TCTGAACTCTGAAGGGGAAAACAACATTGCAACATTACTGTGAGCAACTC TACCAATCCAAGTTTCCTTTCTGTTGCTGCGTTTTGTTTTCCTCTAACAT GATAAATGGACTGATGCCATCCAAAATCATTCCAGTCAAGGCTAAACTCG CATAGTTGAGGTTACAACTTTTTGTGAAGGGTATTTTGGATTTTCAAAAG AATAACTTAGAGAGTCTGTTGTAAGTGGGAGATTTTATTTCATTTTCTTT GAAGTTCACTGTCTGTGTCTTCTCATAATTTATTTCTTCACGTTGTGTTT TAGCTTCAGAGGAGTTTTTGGAGCTAGTCAAAAGTGCTCTTCTGGCAGCT CTTGAAGGTGAGGTCCAATCACAACTTTAGGAGCTGATATTTGTATAGGA TTGTCATAAAACTCAACATTTTCATACATCTATGTGTACACTGATCTAGT GATCCTTGCAGCTCTTTCTCCAGGATCATTATTTGGAATACTAACGTTTA GCAGCAAGATAGGACTATATGATGTTCAAGGTCCGATACCAATCGTGAAG AATGTTTTTATCCCTCCTGATTCCGATGGCACCATACTCGTGGACCTTAA AGATGTCATGCCATTTCAGTCATTTTTGGCTCCTGTATGTATATTGTACT ATAAATTACACTTGTCCTCTTATTTTTAATTCAATTATTAGTTATATGCG CTTTCATTACTCTAGCTGTGATCCTAGAGTATTCATCTCTCTTGTATGTA CTTATGTTAATTACATGTCAACAGGTTGACACCTGCAAAGATAGCATTGC TCGAGCACTAGAAACAATTAAGCCAATGTCTTCGTGGGAAATGGCAACTA CTGCATCGGAAGTTCAAGATCATGCGTTGCATCATACACGAGGTTTTGGG GCAGCATTGGATGCTCTTGTCAACTACCTAAGTGTGGAATACGGAACTAC TTTCGAACTTGGTATGTAACTTTTTCCTTGTGGTGAAGTTGGTATGTTAC TGTATTGACTACAGTACCATTCTGTTATTTTATCAGCAGAACATAGTCTT ATCTTCTGTTTGAAGGCTTTATTACTATGTAAACCTCAGTATATGGCCTT GCCTTCTACTAAAATACATTGTCCTGGTAATTCAATAACAGCTAGGATAT TTGTGTTTTTATCGGGACCACCGAATTATGGGCCTGGCCAACTAGATGCA GGAAGCAATGGAGACCACAATTCTGTTAAAGTGGTGGATTCAGATCATAC ACTACTTCCTGAACAGACAAGTTTCTACAAGAATCTGGTAGGTCTGCATA AATATTGGTCAATGCATTCTGAGAATATTTTAGGAGGTATCCTGATTGGC ATATCACAGGCTGCTAGTGCTGTTCAAGCAGGTGTGTGTGTGGACCTTTT CGCCATTACAAATGAGTACACAGATCTTACTTCTCTGAAGGTTCTGAGTG TTGAAAGTGGTGGCTCATTGTTTCTGTATTCAAATCCAGATGAATCCACA CTTCCACAAGATATGTAAGTTCAATCGCCATATTTACTTTGTATCTGTTT ATTTAATAGTCGAACTGTATCACTTTAAGTAAAATATATTCTAAGGTGCT CCACTTATCAAGACACTGTTTGATCTGTCTATAATTTATTGCTTCCTCTG ATCACTAATGCCCATTTATCAAGACACTGTTTGATCTGTCTATGGACAGT TAAATCTATTTAGTGACTTTAGGTTATAATTTGATATAAATCTGTCATAG CTATTTTTTTAGTCCTTGTGCCACGGAATTTCTTAGCCAAGGCTAACTTT GGAGCTTTCTTTTGGGGTGGTGATGTCTTAATAGTTTTCTTCCTATGATC TTATCGTTCTATTGTGGAAAACTGATCCTAGTACCTCTCACCCTTTGAAT CTTAGATCATGCCGACTTGCCTAATGCCACCAAATTCTGAGTGTTGGTCA TGCACCGCTTTTTTTTTTCTTTCATGTGACCGGCCCTGCCCCCAAATTTC TATAGTATAAACTGTAGTAGACTTGGTTTTAAAGTTAGTTGGATACCTGG TACCAGTTAATACAATCATATACCTGTTACTAAATATATGTTCAGAATGT GAGAACATGCTCCAATTATCCTTTGAGCTATTTTATTTCTACTACCTCCG CTCCTATAAATAAGGCGCACATGTATTCCAAGATGAACTTTGACGAAAAA ATTAAGCAACAATATCTTGATTATATTGTACAGAATTAGTATCGTTGGAT TCGTATTGAAAAGCGAATGATGTTAATTTTATACCAATAATCTCTGTATA TTTGGAATAATTCTTGGTCAAATAAAAGACATGGAAAAAGAGGGTGCGTT ATTTAATGGAATGGAGGGGGTATATAGCTCTGAAGGAAAATGTAAATTTA TCTAGCATTTTCACTTTTCAGATACAAAATGCTAAGCCGTCCATATGCCT TTGGCTGTGTACTAAGATTGAGAACATCTTCAGAGTTCAAGATTGCTGAT TCTGTAAGTACTCTTGAGAAACATGCAAATTTACCTACTGAACTTCTTAT ATGTTCCTTCCTTCTGATGATATTCTGTAATCTATGTCCAACAGTATGGG CATTTCTTCCCAGATCCTCAATACGCGCATGTTCAGCACATAAATTGCTG TGATTCGTTTGCGAGCTACACTTATGACTTTGAGTTTGAAAAGGATTCTC AGTTTTCGAGGTAAAGGCCATTCTCTTATTTGAAACAGACTATGTGCTTT ACATGTGTTAATCTATCCTTCGATCTGACAGCTGGAAACTTTACATTTCC TCAGTTTGACGAAATGGGAACTTATACTGTTCCGTTTGGATCATTAGTCT CTGATAGTAATTAGTCGTGGCAAATTGTTTCCAAATCTTTGTATGAGAGA TTTGTTTTTCCCCTGCTGGTAGGGTCTCATTTTTTGTGGTCAACACCATG TGAGTCCGCAGGTATTTTCTAGTGGCTAGCTTTAGGTATTCAGTACTTGG GCAGTCTGGCCTAAATCTGCTAATGGCACTTTTTTTTCCATTCTCCCATA TATGGATCCTATATTTCCTTATTCACAAGTTGTATTTAGGTTAAAAGACT CCATAGTACAATAAGAAATACACAATGCTATACCAGGGATCTTAATAACT ATGCTATACAAATACATAAAATAATACTAAATCATTTCTAACCATTGATC GAAAGTGATCCTTTCTTGATGTCTTTTAGAAAGACGCTATGATTTCCACG TCTCAGAAGGAACTGTAACTACTGTCATTCGGAATCATTATAAGTCTTCA GCCAAACAGTTTAAACTGTTCTTTAAGATTATCTCCAAAATCCGTACAAT ATCACGTTTGCACATGCAGGAAGTCAAGACCTCCTATTCTCCAAATCGCT TTCAAGTACACGACCATTGTGCACCATGGTGATACATCTGATGATGTCTC AAATTCTGGTAGCAGGTAAAATTTGCTTATCACTGGACAGAGATTTGTAA ATACTTAGGTCAGTAGTACTTAAAACATATTGATAATTGTCCTTGTGTGC GAGATGCCCAAATTATTTCTCTGTGATCCTGTGATGTACTCCCGCCGTCC CATAATATAAAATGTTATAACTAATATAAGAGTATATTGGTTGTAATAAA ATCTTATATTGTGGGACGGAGGGAGTACTATTTTTCAAGGAACATCCTAT GATCATGTTTGCACCTGCAGGAGTATTGGCTTACAAGTTCATTACTTACT TCATAATGTGTATTTGATTGTCAATTTGCAGATGTTCCATGCTAGCAGAA GTTTTATACACACTGGTATTTATGTTTTATATCTTAAATATATCTTGTCC AGGTCTAGGTTCTCGTTACAAAGGCGGCTAAGGGTGCGGACTATCCAGTA CAATACGACTGCTAATATCTGGGACCTGTATGATTTTGTTGACCCAGATG TGGTATTGACCATACTTGTACACCAGGTACAACCTTTCTTTCATATGCAG TTTTATTACACAAGTTTGTGGTAAGATGGTTGGGATTATCCAGTACAACA CGACTGCTACTAAGCTGTTTGTGGCTAGCACAAAGGCCATTAGCTGAACA TGGATTCCCATCCTGTTTAAGATAGGTAGATGTTAGTTGCATGAGTACTC TATTTAAAAGTATGCCAGTTATCAACGAAGCTAAGCTTAATAGTTATGAA CTATTCCTACCTGGTTTCTCGTATGATAGCAGACCATGCATCATGGTGGG ATTGTCAGATTTAGGCAGGCAGGGTTTTACGGTTGGCAGCTATGGCCCCT ACATTGAAACCATAGAATATATAAATTCCCTAACCTATCACGAAGGCCAT ACTCAGGCGATCTAGTTTTATCACTTGACACTTCTTTAAGTAGCAACTGC ACACATTGTGTAGACTCTAGATAGACCAATTGGCTATTGTAGCTGTTGCA AACATGATAGCGTTGTATTATATCAATGGAATGTTGCTACAGATTCAATA GGACTAAAACAATTACAACATGAATTAAATGCAGTATTAGAAAGATGGTT AGGACCTTCGTCTGGGCTACTGGCTTGTTTTTATTTAAACATTTATGTAC CCCCCACCTCCCCAATAATTGGTGCAGCCATATACTATGGCCGGAGGGAG TAATAGATTTATTTGTAGTTTATTTGAAGATCCATCTTACATTTTTATAT TTAATGTTACTATAAGATTGATATCCATTCAACCATCCTGGGCTTAAGAG TTAGCAGGTCCCTATGTTGGCAGGACTGGTTTATATTGTTCCCTGCACAC CAGTGTTTGGCTCTACAGCTCCAGTTTAGGCCAATCTGAAGCTAGCATAA TCAGGTTGTCTGGCAGTAGTTTCTGGTTTGGTGAAATTGATCCTTCCCAG CAAGTGCTGAATTCTTGGATTCCAAAATGCTCTCTAGACTGTTAATGCAA GAAGAAATGATAAATTTGACCGCAGTCATCATTAATATATTATCAATTAA TTCATCATAAGGAAAAACAGCCTTGCTTAAACTCTAATTCTCTGAATCAG CTTGTTTACAAAGTACGATGCAGATGGGGACAATACTGTATCTTGCAGTA AACCTTTTGCACTCTGAACCTGTATCTGTCATTTCTGTTATAATGCTTGC TTGTCGACTGAAAAGCCAGGACAGAAGTTCTCATGATTATCAAACCTAAC AATATTTCTAGACTCTAGAAGAGAACAGTTCTAGCGCAGAAGATCGTTTG AGACTGAAAAGAGTTTATTTTCCAGGTTCTTTTGGCTTCCCTAAATGATG TGGTAGAAGCAAGGTTATGGCTCCATGATTGGTTGGCAATTTTCATTGCC CAGTACAACAAGGCATACAAGACCGTTAGATCCTCTGATAGTGAAGTTTC TTATATCGATGTTGACTTCTCAAATTGCTCACAGTTGCAGCCTCTGGCAC GGCTTGTATTTGCTTTTCTTGTAAGCCCCTTGCTTCAAGTTCAAGATCAA CATATTCATCCAGATTATCAGACATATTTGCAATGCCTCTTCAGGTAAAG CATATATTTTGATACCATGCAATTGCTAGAATTCTAAAAAGAAATAATTA AATTCCACATGTTTCCCGTCTGCATTTATTTTTCCAAATTCCAGATTACT CTCTCACTGCTGTAGTTTATTTGAGCTACTCAAGTGCTATTTATTATAAA GGCCAATATTAATTATGTTTGCTTATTATTTTTCTTCGCAGTGCACTGGA GCCGGCTTCTGTTCGGCAAGCTCTATGTCCTACGTTGATTTCGTACTCCT CTCCTGACACCGAAGCAGAAGTTCATCAGTCGCTAAGTCGCAGTGTATTC ACCAGCGAGAGACCAATATTCCTTCTTGATGCTTACACTAACCTTTTTGT GTATTACTTGCCTACAGCCAGCACCTCAATTCCCTTTCCCCCTCCACGTG ATTGTGAGTCCAGCACCATTTCTTTCATGTACCACTTAGTTGTCTTGAGA CTAAGATCCTTTCCTCATTAAATCGTACTAGTTGCATTCCTACGACTTTT GTGCACACATATAGAAGGCGTCATTTATAGAAGAATGGAGAGAGCGTTAT TTATTGTTACTGATGCTTATTTCAGTCAATGCATATACTAACACTGAAAT GATGTTTGCAGGTCTGTTGAGATCAACTATAAATAAACTGAAGCAAGAAA GGAATTTAACCCCCAGAGTTGTTTTTATTCATGGTGCGCATGATGATACT ACAACATTTGAGAAATACCTGATCGAGGACCGGGCTCTGGATGGTACTCT GCTGGGAAGCTCCACAGGTTTCAGATCATTCCTTGAGGAGGTTAGGAGCA GAGTAGCTGAGTTTGGTATATAGAAACCTGTTCCAACTGTTGTTTGAGCT GTTCAATATGCAGAGATTGGTGATTCTGGATTTCTGGTCATCCTGGGGGT TTGCTTATTTTTGTGGTTGTCACGCGAATACGTTCTCATCCTTGGTGTAG TTGGGGAGGCTGATTGTCAGTTATCATGACAGTTAGGGGAGCCAGTTTGC ACTTAAGCAAGACCGCTGCAATGATATGTGAAACCAACAGGACAGGTTGA AGAGTGGCTGGGTTTGCATGCTTTGGAAGTTCGGAGTCGATGCTGAATAT GCACGTTCTGAACATGTTTGTACTTTGTAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.