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GrainGenes Sequence Report: AA028858

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Sequence
AA028858
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028858
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCGAATTCGACGGCTACGAAGCCCACCGGGCACCCCACGCCATGCGGCCC
GCGCCGCCACCTCCCCACTCTACGTCGGAACCATCTTCAAATTTGCATCA
CATCGATTTCATGCGCCGGTTCCCCAAATCGACCCCCCCGCCCACCCTCC
CACTCCCACTCCCATTCCTCCCCTGACGCATATACTAAGGCTTAGGCTGG
TCGTAGTGGTAGTATCATACTACTAGTATCATGCATATGATACTAGTGCA
TGATACTATGTCTCTAGTGCATTGTATCATATAGTAGTATCATAGTAGTT
GTATATTTATTGTTTTGTAGAATCTCTATGTAAAATGTGTGTATAAGATT
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TTTTTGCCAAGTTGGCATGCATGATAATCTTATGATACTAGCACTAGGAC
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TTCGACGATGGCGTGCCACTTATGGGATCCCTGTCAGCGACACATCAGTG
GTGGTCGCAGGACAACTCCTTTTATCGCCAACCACCTGTTTGACCGAAGG
TCCCAAAACAGACATCACGGTATCATTTAACCTTTTTCTTGGAAACTGGG
GTGTGACAACCCCCCTCCCCCGAAATCACAAAGATTTATAGAAAGTTAAG
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GAATCTAGACACTATTCACTACTAGATATCCCATTATAGCCGAGGGGCTA
ATTACCGTCGGGCATTTTAGTTTACTGTCAGATAACTTTATAACCGACGG
TTCACCGTCGGTCATCTCCCGTCGGCTATGCTCGGTCGGCCATTAGTACA
ATATCCGACGGTACAGTCGGTTAATATCTTTGCCAACAGTACTAAGCTGA
CGGTTGGCCGTCGGTTTTGTTTTGGGCTGCACTTGCCTCACAGTAGCCGA
CGATGCTAATAGCTGATGGTTTCCCATCGGGTATTTATTTTCCTATAGTT
ATTGTGTACCGTCGGTTCTTGTAATAGGCGTGGGTATATCCGAGGTAAGC
CTACCGGTCAGTTATTCTACTTACCTACAGTTCGTACGCCATGTCGTTGA
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GTCGACATAGGTGTCATCCTCATCATCATTAGTAGCCTAGTATTGCTTCA
GATTCCCTAAGAAATTAAGAGATGGAAAATAATGCATTATACCAGAAATT
TAATTACAGAGCTTAACTATTCTAGAATCATCTATGTTGGTTCAGACAAA
GCTAATCACATCTTAGTATTGGAACTAAGAGCTCACGCCAAGTGTACAAC
AAGTACTAGTGTTATACTAGTACTTCATTCCTCTTATAACCAGTAACCAT
CAAGGCAGATAATAAGCAACAATGCAATTCATATGATTCTACTAGCAAAC
TTTAGTTAAATCACTCTAAATATGCTAGCACTTGCTGGAAATCACCTCAC
CAGCTAAAAATTTCTAATAATCTACTTTTATTTGTACTACAACGACTGCA
AGATTTTTCACAAAAAACCAATAGACGAGGCTAAGTGAACAAATGTGATT
AATCTTGAAATGTTAGAAATATACATAATGAAGTGCCCATTCTGGTTGTG
CTAACGATGTGCAGATTGAAGTGATAGCTAGTATCACTTTGAAAAATCGA
TATCCTAGATGAGCTATCTTCTTTTATAATCTATACAATTGCTTCTACTA
TACTAGCTACCAATCCATGTGTCAATAAGTGAAAATACATGGATATTGGA
TTGTGCACTTACACAGAAATCAGGATGGCGACAGACACGTCCGCTGCATA
GACTGGATCAGCCGCATCACATGTCCGCAGTGTTCCCAATAGCTTGGTCA
TCAGGCTGCGGTGTTTGACCGACACATGCAGACATGGTGATGCGTACAAG
CTAGCTTGCAATAATCGTTTGTTGCAGCTTCTAATACTTGATGAACAACC
TGATATAGTGCATTAGCAACCGTTACAACAAAATAATTCACGTAATTTAT
ACTTCAGTGTACAATATTAACACATCGTGCATTTTCTTGTGGTACTTCAG
TAAGTTCAAATACAAACCAATACTCCAGTAGACAGTAGCTGATTTACTAC
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ATACTAATTACCATTCAACCATTACATACCATGTAGAATATCTAACATAT
ACTTCACTGTCTGCATCCTTGAGCACTCAAGCTAAGAACGAACATGCAAA
AATTATTCAGTGCTCAAGTTCCAACATTATTCAATCATGATGATCGAATT
GGCTAAGTTACTAAATTGACTGGTACAAAGATTTGTACATAGTCCACATG
CAACAATTTTTTGAATTCACGGAAAATGCAATGCGCTCTAGTAGTTCAGT
TCGATTTAGAGAGAGGCGATCCATCCATCAAGGTTATTCATCAGTGCCAA
AATCGATCAAGCAATGTAACTGAAGAGAAGGATAAAAAAAGTCAGACATG
TTCTGCTAGATTCTCCTCCTCCTCCTCCTCTGTCGCTTCCTATCCTCCTC
CACCGTGCCAATTCTTTCTTGGCAGCCATGGACGGAAGGGCACACACGTG
CAGATCTGGCGAGTAGTTAGTAATACATCAGATGGAGCAGATCAACAAAC
AAACCTGGTCGGGAAGGAGAAAGGGAGATGTCGGCGGGTCACTAGTTGTG
GCCCTAGGACCCAGCGTGAAGTTACCTGAGGCTGACGACCATATCTTGCA
TACCGAGCCGCCATCAGGCCTGCACCAGTCGTCAAGAACATCCGCTCTAG
GAGAACAACACGCGCAAGTGGATCCGCGCGGATCTAAGCAGTAGCCACAG
ATGAGAAGTCATGGAGGTAAGGAGGTCGTGGTTTCGTGTGGGAATTGATT
GGATCTGGAGCATGTTGACTCTTGGCTGCGTGAGGAAGAAAATAGGAGTG
GTGGTGGTGGTGGTGGTGACGGTTTGGTTATGCGGGGCCGATGGGTGGTG
GGTTGGGGGTGGGGTCTAGCGCTAATTATCCCGCCAAAAGAATTTCCATC
GACGCATATTTTCATCTAATAAAGCGCTCAGCTCCTGCAAAACTTGATGT
GCCTATTTATGTTTATGACCAACACTCGTGATTCGGCGGTGGAAATTTTC
AGGTCGCATAACTCAAGCGTGCAAACAAACCGTCGGTTGTAGCAGCTAAT
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TTACATTAGATAGCCGAGAGTACATTTTTCCCGGTCAGTTATGAAACTTA
ATACCCGACCGTGAAAGTAGAACCCTCGAGTATTAGTGCATACCGTCGGG
TATTAGGTTGAATAGCCGAGAGTTAGTGTCTTCCCGTCGGGCAACAGAAC
GTACCGTCGGTTATTAGCAGTCATACCCGAGAGGTTTTTGATAACCCTCG
GGCATAAATGCTACCGTCGGTTATTAGCATATTAGCCGACGGTCCGTCGG
TTATTATAATTCACCGTTGGAAATCCGGGGATTTCTAGTAGTGATTTAGT
ATATAGGTTCATCCAAATTTTGACAAATCCAAGTCAACTAATATGGGTCG
GAGGGAGTAGCTGTATAGTAGTTTCTCAACTTCTCCACATATTAAGTTAA
TGGAAATTCTGGTGTAATCGGAAAATACGTTTCAGATATTCCAAGAGAAA
TTCCCCTATAACAACACAAGGTGACTTTTGCCTATGTCTATCTACCCACA
TTTGGTACAAGGTAAGTAGGTAAATGTTAAAATGAAGCAAGATTGCCTGT
AAATCTGTCATTGAGACGACTCTCTTAATTGTAGGATGTGTTTTTTATAA
GAATATTTTGTATTATTATCGATGTAATACCGAGGCTTGAAAGATAGCAT
CCACTAGCTATACAAGATGCCAAGCAAATATACGACATTATTAAAGAAGC
TCAGTATTCTTTTGTGGAGTGAATGCGAAAGGTTTTCATCAGTTTATTTC
ACAACTGGAAGCACTAAAAGTCAACAAAATAGAAGTGGTACGTAAAGATT
AGATGAATATGAGCTACCCATAGTTCAGTACTTACAATATTGGCATAACT
GATTAAATGGTAATATGGTAGTTTCAAAATCTTTAGAAAAATGACCGGTC
CTTTACTCAAGCTGTGCAATTTATCATATGTATACTTAAAAGTATAAATA
TCTAAAAATAATGATAAATTAGAGCACCATCAGACTCTACCGGCCATGTT
GTGTAACACCGTTACGAAGGCGGCGAGGCGAAGCTCGCCTCTTCGTCTAG
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CCGGAGAGAAGAGAGAGATGGCGCGTGCAAGGGGCAAGAAGCGCGCTGCG
GCTGCGGACGCCGGTGGCTCTAGCCAGGCGGAGCCGACGGCGCGGGGGCG
GCCGAAGTGCGCCAAGACGGAGCCCAAACCCAAGCCCGAGCCGGAGTACT
TCCCCGAGCAGCGGAATCTGGTGAGGACACGCCTCCTGCATATCTTGTGT
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GGGCTCGATTGGGCTTGGTTGTTCGATGTAGCGTGCGGACTGTGCGGTGC
GGGATTGGTGGCATTTGGTACGAGCATGTTTCTGCGTCTCTGATATTGGC
TAAAGTGTAGGCTATGAGCTGAATGATTCGTCCTCTGCACATGTTTGCCC
GATGTGCCATGTATATGGTTTAAAATAACGGAACAGAGATGATACAAAAC
GCTTGCTGAGCCAAGTTCAGTCGACTAGATAAGTAACTCCGCTGGATAAG
CTTAGACCTGCGCGTGTGTGCCTCTGCCGGTGCGGCTCCCGGCGGCAGAT
CAATCACGGTCCCGTCTGCCTGGGAACAGCGCTGCTGCTGGCCGTCTGTC
ATCAAAGCCACCCGCTGGTAAACGACGGCGTTGGCGGCGTCCAGAGCACT
GTACGCCCATACATCTCCAATCGATTTTTATTTCTGCTCGTCTTTAGGCT
GTTGTAGTTCCCAAAATTCATGCATGTTGGCTGGTGACTTTGCAACTTGA
TCAATATTGCTGGGCCTGACATCGACTTCTGTTCGTGTTCTAATGGCAGT
TCTATTTTTTTGCTAGAAATTGGATGGTCAACAGCGGCATGCATGTTCAC
ATGTATGAAAGATTGTATAGAATTTGGAGAGATGTGTTGTTGACTGCTTG
ATTAAAACATACTATAGGCAAACTACTGCTTTCCTTGAATGAACAATTAA
ATGGGTAAATTTGTTTAGTTTACAGAAAACCCCCAAATTATACAGAGACT
TAATCCTTTTGTGGGTATTTTACCAATGGACAATCAACTTTGGGTACATG
ATCTAAGGCCTTTTGGGCAAATAACCAATTTTCCCGTGATAAAAAGATGT
TCCACTGCAACATCATAGTTTAATTTTTCACCGGGATGCCCATTTTTTCG
AAGTTGTTAAAATTTGGTTGTTTGGCTCCACCCATTAGATTTTTCAGTTG
AACCAAGGGCATACACTTTGTGCCCTTGTTTGTAGTCTTGCTATCTCAGG
GTTGGTGCATATTGTCTAATGGTCTATTACTGTGTTCAGGAGGATCTTTG
GTTGTCGGCTTTTCCTATTGGGACTGAGGTTTGTGTGCATTCCCTATCCT
TGTTTTTGTCACACTTCAATGTGCATAAAACTTTTCTGTCATGCATATTT
GGTGTTACTTCAACGTTTCCTTGTTTCTGGTCCTGTTGTCTGCAGTGGGA
AAATATTGATAAGATAAAGGAGTTCAATTGGAACTTTGAGAATTTAGAGG
TATGCTGGTCTTATAATCTTCAAAGTTTTCCTTCTCTTTTGTTTTTAATT
TTTTTTCCTTCTAAAGTTAAGTTTCCTTATACATTATTACATTGTATCAC
ATGCTTTATTGTTGGCAAACAGGAAGCTCTAGAAGAAGGGGGGAAGCTTT
ATGGGAAGACAGTTTACGTATTCGGCAGCACTGAGCGTAGGTATTTTTAT
TCTTATGCCACCCTTGAAGTTGTATTCTCGGCCCATTGATGCATCGGCAA
TTTTTTTTTTTGAGATGATGCATTGGTAATATTTTAGCACTGGCAGTAAA
CTGATGCCATCAGTTTTATCAACGATCATCTGGGAATTCGATAATTATAC
TTTAGAGCTACTGTTGAACATCTATTAATACTGAAATGTTCTCTAAGCAT
CCTAGTAGCCCTATGGTCTTATATTATTGGTCTAATGGGCTTATTTTTGT
TGGTATGCAGCTCAACTATTGGATGTTAATGGTGAATCAAAGATAGTACT
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AAAAAATGCAATAGTTAAATTCTCTCTGTTTTACATTGTATTGAGTTCTA
TGTTTGTCTTATGATTTCACCAGCCATATTATATTTAATATGAATGCATT
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GATCTTTGATGATTAAAAAATTCAAGTTATATTTCTGAGAAATCAAGGAA
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TTTTACTAAGGGGCTAAAACCCTCACTGGTCTGGATTCTGCTATAAGGAC
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TGTTCCACTAGAGGACCGGTACATCCATCCTACTTATTTTAGCTATATTT
CTTATTTTCTACTTTGGGCAACTATATCGTTACCTCCCTCCCCATCCTTA
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CAGCAGGATGGAAAGTTTGAAAACTAAAATATTCACTCTTGGCTGCACCC
AACGAAGGTCAGTTTTATTCCTGCTATATTAGTATATCACTAACTATTCA
TGCTTGATGGCTTATAGTTCTGTTGCTCCCAATTATTTATTTGTGGGGAA
TGCTGCCACCCAGTAAATGCTCCCATGTGTGGAATGTTTATTTTCCTGAC
TTGTTCCAGCATCCCATTTTTTTATATATGGCAGGTCCGCGCTGAAGCAT
CTCAAAACTGAGCGAGTCAAGAAGTTCGACTACTGCATGCCTTGTAAGCT
GAATTGGGATTGTTTTTCATAGGCCTTATTTGTCTTCTGAAATATCTGTT
GTTGCTTTTGGATCCTGCGGTTCCATTGCTGTACATATCATCCTTACTTG
GTGCAGTCCAACAATCTATAAACAGCACTGTTCAAATTTGTGCATAATAT
TAAATAGGATCATGACCATGTCTTCTTAGTTTAATGGTTTGCAATGCAGC
AGTATGCCATGGGCTGAGAACCCTTCTGCTGATCTTTTTTTCTTGCGGGT
ATCCTTTTTTAATTTCATAGGATGGCAGTTAATTTGCATGGTCCCAGACT
GACTATTTAGTTTGCGATTTTATTTTGCTGAATGGACTGGCGTTCCATTT
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GCCTGGGTGGGGGGTGGACCCCAGCGCCAGCTTCCTTCAAGAATAGTGAA
TGGCGGTCAATTTGGTTTGATACCACTTCATATACCATCTCAACCAAGCC
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AGAGTATATCAGTTTAGGCATGTGAAGGGCATTGATCACATGAAGATCCC
AACACACCCACCACCACCTAAATGGCACACCATGTAATTAGAAATATCCG
CTGTACCACTAGTTGATTAGATCGTAGATGAAAGGAAATGTTTGATCCTA
TGGTTCCTTTGAGAGTTATGCGATGTGCTCATTAACCTGTTATATATATT
TTCTGAGGCAAGAGGCAGGAATACTGATCTTCTTGCAATAATTTTGCAGA
CTATATGCCACTTAGTCCTCCTGAAGATGAAGATGATACTGTTGTCAACA
TCATGTATCCTCTAGAACCTCCGGTAGGCTTCCTTCAGTAGGCCTATGAC
ACCATGCTGGAACTACTGCCTAAATAGTCACGAGCATTTATTGCTTCTCT
TATTATTCCTTGAAGTAGTCTGTTCATGAAACTCATAATTAGCGATAGAA
ATATCAACAAAGATACCATGTTTGTAGTACAACAGTCTCTTTAATCTAAA
TCAAAACTAATCTGCATCAAAACTTCAAATGGAGTTGTTTGATTTGAACT
TAACTATGTTTTTGTTGGTAGCTTTAATTGACTCAATTAATATAATTAGT
ATGCTAGTTATTTATGGAATGTTTGGCGGCTGAAATTGGCCTATCTGGCT
CATGAGAAAATCTGCATGCCGTATCTCCGGTTGATTTCATGACTTATTTC
TATATACCTTTCAATTGCTTGTGCATTGATGATCCATTTTGCTGATGTGG
CTGTCCATGCTAGTGAGGTCAAAACCGATCCACATACTGCTGCTGTGACC
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CTTGCCTTGTGATCGTGAATTTATTAGAAAACCCAAGTTTTATCTTGACC
TACCAACTGAAATACTGGGATAGATTGTTTCCTTTTTTCAATGCCAGCCT
TTGGTTTCTCTGGAGGGACAAAATATCTGCCCATTCAGTGATCCACTTTT
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CTTCCTAGTTGGCCTTTTTGGCTTTTATTTCTTGTAGCTGCTAATTAGTG
TTATAAACCACTGTATTTATGTTTTTGCTGCGTATTGCAGATAGTATGTG
ACTTTGACTGGGAAATGGATGATTATGAGGTATGTATGTGGATTTGTTTT
TCCCTTTCTGAAGTTCTGCTGAAAGAGGCATTGCAGAATATCCGGTTTGT
TTTTCCCATTGAAGGACATCTGTTGAATCATTGTATTGCCATTCAGGATT
TTATTGATGAGAAAGTTAAAGACGAGGTTCTGCCAGAGGACGAGAAAGAA
AAATTTAAGGTGCACATTCAACACTTTTTTTTTTGCATAACTCTGCTACA
ATGATTACCTAGCGTAGTCCACCTGGATTACCTTGAAAAGTTTTCTGTTC
TCTTGTAATTTTGCTGCCATGTTTCATTAATAGGACTTCATAAAGGAGAG
AGTTAGAGAAAGGAAGAGAGAGCTGAAACAGGTTAACAAATGCACCAAAA
TGTTAATTCTGTTCACCAAAGATTATAAAATGCATCTAGTACTGAATGTT
TCTCCAATATTTATGCAGGCTAAAGAGGCCAGAAAGAAAGCCATTGATGA
TATGGATACTAAGTTGAAAGAGGCATTGGAGAATATCCGGTTTTACAAGT
TCTACCCTGTAAAAACCAAAGATACTCCTGATGTTAGCAAAGTACAGGTA
TGCAGTTGCTCGGTATTTCTTGGCCTGGACTTGTGTATTTTCAAAACTGA
TGAATGGACTATTTGAAGTTGCCTTGGATTAAACTCTGCATATATTGCAT
TCTGCAGGCGAAGTACATCAATAGATACTACCGCAACGCACATGAACTGC
TGTGATGTGCAACCTGTGAGCAAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.