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GrainGenes Sequence Report: AA026502

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Sequence
AA026502
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA026502
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGTCAACCCGACGCTGCAACAGGTCGTCGGTCCAGCAACTAGTCCCGT
CTTCCCCACCAATTGCGCCGATTTCGCTCCTCCCCGCCGCCACCGTCACC
CAACCCCTTCCTCCGCCACAACGAGGGACTTCGGTCTCCGCCACGGCTCG
CCTCACCACGGCCAAAACGCCGCCGACGAGAAGATGACGAGCGGCAATGG
GAACCAGTTAGATCGGGAAAGCGGTGTCCCCAATTCCACCACCGCCTCGA
CCTCCCACTCCACCCCGACGGCAAACCCCGACTCCACCATCTCCGCCACG
GTGGAAAACTCCTACGGTCCCGTATCCAACCCTACCACCATCGCCTCGGC
TTCCCACTCCCCCGCTCCGGCAAACCCGGACGCCACCATCTCCGCTGCGC
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ACCGGAGGAGTGCTCGGTGCGACACCCTGGTCCTGGTGGGCAATGTGGAG
CAACAAGCCATCGGCCTTCCAGAGGGTGGGCGCTACGGTGACACCAATGA
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TTCTTCTGTATGCGTGTTGATTCAGATGATGGAATTTCTGACGATGAGTG
TGGTAGTGCCATGGCTCCAGGGTCCAGCCGCAACAGAAAGCGTAATCAGA
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TTGGAGGGACCCGTGCCTTCAATGTCCAGATGACAGTGAGACGGTATGCT
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TGTTACTTGTTCGATCATAGTAATTCGTAAATCCTTCTTTGTATTTCAAC
GTGGAAATAATAACCAGGATCTTGATGAGCCATCACCTATGCATCATAGT
AATGCATTAGTATATCTGATATAGATGTTACTTGTTCGATCATAGTAATT
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TGTTACTTGTTTGATCATAGTAATTCATAAATCCTTCTTTATATCTCAGC
GTATTTAAATAACCACTTGATTGTTTAGCAGAGGTCAGAGGATGTTTTGT
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TGCACGTACAAGGATGTCGCTTTTACTGATTTTAACTCCGAGTATGTGTG
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CCTTGCACATGGTTATAGTTGTCATACTCTCTTTTGGGTGTGAACAGATC
TGGAATGGTATGTATGGCACTCCTTTCATGTTTTGTTTCTCATTTTATTT
AGCTCTCTGGCTAGTATACTCAAATATGTACTGTATTGAAGGCAAAGGTT
TAGTACGTCGTAGCTTATATTATTCACTCTTACGTAATACAATATCAGTT
CAATTACATAATGTAACTGAATGCTTATGATTCTTATATTTATCTCAGCT
ATGGGTTCCTTCTTTTTGGTTTGTTGTAAACTTGTAGTGTAGTGCTACTT
GGTATATTTATTGACCTTTATGTGTATATGCAGGTTAGAACAATGGGAGA
TCCTTCTTTTCGTCTGTCATTAGAACCCACGGTTCCTGTACGCATGGATG
CTAGACGTGGATGTAGTAATGAGGGCAGCAATAAGCCTCCAGACAGTTCT
CTCTCTCTCTCTCTCAAATATATGATGCAAGTTGGTATCATGGTTTCTTT
GTTGTGCTTGTGTGTAGAATTGCTGCTTTTTGGGGGCACCGAGGCACGGA
AGACAAAAAAAAATCCCTGATAACTTACTGTATCTATATATAAAATACCT
TTTCACATTTGATATTGGTTTGTGCAGGTGTTGCAATTGATGATATCATC
AAGAGAACTACTGAATATTTTGAATCGAACATTGCAGTGAGTGAACTAGG
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AAATATGGGTGACTAGTCAATTTTCAGCCCAGCAATTTAGTGCTCTTGGC
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AAGTTTCTGTAGTGCAGCAACAGGTTGGAGTTTTACTCTGTCAAGCTGAG
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TAGGAGGCCTCAATGGCACTACTGAGGTTCATAGAAAGATCAAACAGACA
AATACCATCAAATTTTCCATAGCGCTGTTGGAGAAACGGTGGTCTGGAAT
TTTGCTAGGCAATTCTGGTGAGTTGGGGAATGATATTGCTCAACAATCGT
ATCCTGGATCAGTTTCCTCTCAAGAAGCAATTAAGTGCTTACTTAAGGCT
CCATTATTGTCTGATCTTCTTCTTTGGTCAAATTGGGATATGCTGTTTGT
TCCCTCATTGGGTTCCTTCACACATTGGTTGCTGAATACAAGTCCAATTC
AGGAGTTATCATGCATTGTGACCACAGATGGCAGGTTTGTTAGAATAGAT
ACATCAGCCACAGTTGGCCAATTTTTAGAAGCCGTCATTCAGCAGTCACC
ATTTCAAGTGGCAGTGAAGCTGCTTTCCTTGCTACACATTTACAATGGTT
CTAGCAATGCTCCAATTTCGTTACTGAAGTGTTATGCACAAAGAGCAGTG
GATGCTATAATGAATAGAAACATCGATTTAATCAGTACTGGTTCTGAAGG
AAAAATATTTGTGCGCGAGGGACTGCATGCAAAAATTTCTGAACAGGGTG
CATGCTCTTCTCACTATATTGGCCGCATTCAAGGAAGCTTATCAAACATT
GATCACACTCTTCAGTCGATTGCGAAATTTATACTGGACTGTCTTGGCCA
TCTACCTTCTGAATTCCGGAGTCTGGCAGCAGATATACTATTGTCAGGAC
TTCGGACTGTTACTAAGAATTGCTATTCAGCTATCTTGCATGCATGCAGT
GAAACTTGGCAGCTTTGCATGCTTCACAATATTGGGTTGTCACTTGGAGT
TGCCGAATGGGTTGAAGATCGTGACACGACCAGTTGGACTGAAGATATTC
ATGCACACGGAGAAATTGATTCATCTTCTGTACCTGGAGGACATCCACAT
GAAAATACTAGCATGCTTAATGATGCAGCTGATGACATGATAAATGAGCA
AAGCCAATCATTTAATGGCTTGGAGGCTATAAATAATGAAAATATGGAAG
TGTTTGATCCTATTGAAACTGAGGCAGATATGGCAGAATTACTAGCCACT
AACAAGCCCGCCGAATTAAATCTTGAGGAAGCAGCTCTTATTATTGAGAC
TATACGTCAAGAAGAGTTTGGTTTGGAGCAGACACTAAGTTATACTGATG
ACAGCTTGTTGAAAAAGCAGCATGCTCGACTTGGCAGAGCTCTTCATTGT
CTCTCACAAGAGCTATATTCCCAGGATTCTCACATAATTCTTGAGCTAGT
ATGCCATCCTATGCATTTATTTTATTTCATTTTGTGTGCGTTGGAGTGGT
TTTTTCTGCAGATATTAATTTGCTGATATTTTTCTACTCTATTTCAGATA
CAGAATGCCGATGACAATACTTATCTCAAGGATGTCGAACCAACATTAGC
ATTTGTTCTTCAGGAGAATGGAATTGCTATTCTCAATAACGAGAAGGGCT
TTTCTGCTGATAACATTAGAGCGTTGTGTGACATTGGTAATTCAACAAAG
AAAGGATCAAACATGGGGTATATTGGAAATAAAGGCATTGGATTCAAGTC
AGTATTCCGGGTAGGTCCAAACATAATTATTCTCAGTTATCATCTTAATG
CTGTAAGTATTTTTTCCATCACGTACATTGACTTCTCGTCTCGAACTTTT
TATGTGGAAACCATAGGGGAGGCCCCTACGGTATTTTTTTATCGACAAAT
ATGATAAATACATCTTAGTTTGCATCTCTTGTTTCATCAGTCAATTTGTT
CTTTACTTATACCTTCCCATTCCCATCTTTCAAGAATTTAAGTTCTGTGT
GAAATCAATACATTTTCTTTTGCAGGTAACCGATGCTCCAGAGATCCATT
CAAATGGTTTTCATGTGAAATTCGACATCACAGAAGGCCAGATTGGTTTT
ATCTTGCCAACTGCAATTCCACCCTTGGATAGCGATCCTCTAAGTAGATT
GCTATCTTCTGAAGATGGCTTTGATGCATGCTCCTTCTGGAACACTTGCA
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TTATGAGAAGAAAGTCGCTTGCCAATGGCATCGTGAGGATCTCGCATGGG
AATGAGGCAATGAGTTGGTTAGTAATTAATAAGAAATTACACGGCTCAAT
TGTGCGTCATGATGTATGCAGTACGGAGATAGCTATGGCATTTCCTTTGC
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AGATTTCGTTTTGCCTTCATCCAGAGAGGAAGTGGATGCAGATAGCGCAT
GGAATCAATGGTTACTGTCTGAATTTCCTTCTTTATTTGTTAGCACGCAA
GAATCTTTTTGTGCTTTACCTTGCTTCCGGAAGTGCCCTGGGAAAGCTGT
GAAAGCCTTGATGAGCTTTGTGCCTCTACTTGGAGAAGTTCATGGGTTCT
TTTCTCAGCTCCCACACTTGATTCTTTCCAAGTTACGCCTAACCCGCTGC
ATGGTTTTGGAGGGCTCCAGTCTACAGTGGGTCCACCCATGCAATACACT
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ATGAACATCTTCACCTTGGATATCTATCAAAGGATATCATTATATCTGAT
ACCTTGTCAAGGGCCTTAGGTATACATGAGTATGGACCAAAGGTTTTGAC
TGATGTTATTTCATCTATTTGTGGAACTGATGGTTGTCTCGAGTCACTGG
GACTGGAATGGCTATGTGCTTGGTTTGTCACACTTCATTTGGCGTTGCTG
TCTCATTCTTCCCACAATCTTCCCTTTAAAACAAGTGTTGAAAGTGATAT
CTTATGTTCTCTCAGGAAACTGCAATGCATTCCACTTTCAGATGGCTCGT
TTAGCTCTATAGCAGATGGGCCCATATGGTTGAATTATGATCTTCTTGAC
TCTCCATCTGATTCTGAAATTAGCATGCAGAGCTTCCCAGTTCTATATAA
TAACCTTCGAATTGTGAGTCCTCGCATTCTCTTGATGTCCTGTAAAAATA
GTTACAATATGGAAGAGATGAAAAAAGATGACCTTATAGATATTTTACTG
AAAATCGGGGTGCGGAAGTTGTCTGGACATGACATTATAAAAAATCACAT
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TGACAGACTATTTGAGTTTCATTATGCTGCACCTTCAATCCTCTTGTACA
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TGTTTTACTTACGAATAATGGCTATAAGTGCCCAGCTGATGTACCAATTC
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AATGTGGATACTACGTGGATTGAACTTGATAATTGTTACTTGAGGCATCA
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ATCTGGAACACCTTGTGTTGTTTATGACTGGGAGTCACCAGAATTGGCTA
ATTTGTTAACAGTATTTTCTTCAAACAAATACCGAGAAAATTGTATATAT
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CTTCCTTTATGAAGTGTCTGCGAAACTTCAAGTGGATAGCATCAAGTATG
GATGAGGACCTTCATTATGCAAGAGATCTATTTTGTGATTTGCCAAATGT
GCGATCCCTTGTAGGCAGTGTTGCCCCGTACGCTAAACCACTGGTTAGTA
GTTTATCCTTGTCAAACTATATTCATTTTATCTTAGATTCCTTAACTCAA
ATTCTTGTTGAACAGATTACAAATAAGTCACTTCGGAAGGACATTGGGTT
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TATGAATTATAGAAAATGGTAGTTGCTAAATAATGTAGCTACCTATTTGT
AACCTGCCTTGCACCACCTACCTTCATTGGGTTTGCTTGAGATTTGGGAG
GTGTAGAGAGAATAAGGAGGGGATTAGGTTTATTTTGGAGGCTTATGTTT
AATTAAGTTGCTAATTTATCACTAGTTATAAATACTCCCTCCGGTCCATA
TTAATGGCCTCAACTTTGACTAGATGCGACCAAATACTTAACTAGATACA
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TGTGCTTTATATTCCGTATAACTACGTATAACCCTGCAGCTCTTTACCTG
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AAGAAGAATGCTGTCGATGGCTTATCCAAGCCTGCATGAATTCTTTACTG
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GAGTTTTTTCGTGCACAAAATACCTAACCCACATGGTGTAGACTTGGCAG
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TGTCGAGGAGAACAATTTCCTTTACGTTATTAAATCTCACCTTCGCACTT
TATGTAGGTATTTCGTGTATTTGTGAGATGGGCTAATGATCTCCATTCTG
GAAGTGATAAGATGAATGATATCTTGTACCTGAAAGAATCTCTTCAGAAG
TTGGAGACAACGGTATTGCCAACCCTGGTCGATAAATGGATGTCTCTCCA
TCCATCTTTTGGCCTTGTTTGCTGGGCAGATGATGATGAGCTGAAGCAGC
AATTTAAGAACTCTAGTGAGATCGAATTTATACAATTTGGTGAACTTTCT
CTTGATGACAAACAAACTCTATGTGTAAGAGTTGCTGAACTAATGGACAT
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CCTTTTCCTGTATACTAAATTCACCAATTATTATTAGATATAAAATTGCG
AAAAAAAGAAAACTCAGAAATCAGAGAAAAAAATCAAGTACGTAGTTTTT
CTTGTCTTTAAGTTGAACTGAATTCATTATCCATGTCTACTCCAAGAACT
ACAAACAATTCAGCAGTAATGGCTAACAGCCTAACACATGGAGCGTGCTA
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GATCTACCATTTGTCTTGTGATTCTAATCCACTAGTTCCACCTTTACACA
GGTTGTGTACCGGGAAGCAATATTCTATGGTACTGGGAACAACAGGAGAA
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AAGATGCATAGAGATACTTACAACAACTTTCAGCAAAATGAGGCCATTAA
GCTTAGCAGTCTTGAAGTTATTGTTGTTCAGAAGTTATTCTTCAAGTATA
TGCTGAAAGGACGTGATAGTTCTTCTAAGAGAAGATTTGAGTGCCATTGT
CTCCTGCAGGTTAGCATCTGCCTTTATCTCTGCAATTATAGTCAGTACCA
GGCTACCAGCCAGCTGTTAAGGATCCCGGAGGACACATGCAGAGATCGGA
TGGTCTATTCTCAGTCTCCCCAAAAGTAGTGTACAAATGAACAATAGCAA
TATAACTTAGCTTGCAATGAACTTATAATGCAGTTATTATTAGCAATCAC
TAGTAATGAATACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGT
GAAGGTAATGAATCTAGCCCTCTTTTAGTGTGTAGATTCACTCCAAACCT
CTTTTAGTGTGTAGATTCACTCCAAACCTCTTCGAACCTACATACTAAAA
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ACGGAGGGAGTAGTAGTTTGCTTTGGACCTGTTAAAATTTGTCAGTGTGG
TAACATTGTTTGTCGACCTTCCTGCCATCTGCGAACATGCTAGCACCTAA
GATTGCAATTTTCAGATTTTTTCTAGGTAACATTATCAGCTTTAGAATTC
ATTTGGTTCGTTTCTCATCTCCAGGCAAATATTTTATATGCTACACAAGA
AGCTGATTCACATTCAGTTCTTTTGGAACTCTCTAGACTTTTCTTTGGTG
GGTCTGGTGATCTACACTTTGCAAATTTTCTTCACATGGTCAAAATCATG
TCGGAATCAGGCTCCACAATGGATCAAATTGAGTTCTTTATTGCATGTAA
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CCTCGTTTGTGGACAAGGAAATATTCACTTCCGAAACAGTTCAATTGCAA
CCTCCATCTGAACCCAGTCATACCCTCAAGCGAAAGAGGAGCCCAGATAT
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CAGCTCAGCAAGCCTGTTGAGTGTGGACTCACTGAAGATACTGTCAAGCT
TGATCATGTTGTGAAAGAGGATTTAAAAAGGGAAAACAATATGTTAGCCG
AAGAAAGTAAAATGGAAGTTGGCGACGAGCCTACCTGTTTGGGCTTGGAG
GCAGCAAGCTCACCAAGTCCGGTTGATGAAACTACACTAACCGATGTTGA
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CTCCATGTGGAAGCGAGTTAGGAGCTGTCACACCTGGCGGTAAAGCCGCA
GTACGCAAACCAAGTGAGACGTCAAGAACTGGCAGGCTTGGTGAAGTTGC
GGTGCATCACTACCTTGTCGAGCAGCTAGGAGCGAACAATGTCAAGTGGG
TGAATCAGGAGAGCGAGACTGGGCTTCCCTATGATATTGTCATCACGCCG
GAGGGTGGCTCTGCAGAGTATGTGGAGGTGAAGGCGACCGTGAGTTCAAG
GAAGGACTGGTTCTACATGTCACCCAGGGAATGGCAATTCGCTTTGGAGA
AAGGGGATTCCTTCAGCATAGCTCATGTCCTGTTGAGAGGTTCAGACGGA
GCGAACATAGTGATTCTGAAGAATCCGCAGAAGCTCTGCCAGCAGAAGGT
GGATTTGAGCCTTGCTCTCATGATGTCGAGAAAATGTAGAAACCTCAACC
AAATTTCAGTTAAGTTGAAGCCTGACGCCAAATCACTGACAGATGAATCT
GCATCTTGATCAAGACTTCTTTCATGTGGCTGTGCCTCTGTCATTCCTAA
CTCTAGCTTGTAGATTGTGTATATAAATACCATAGTTCTCTAACCTGCTC
TCTTGGGGGATGGTACCTAAACTTGTTTAGTGATGCCAATCCTCTGAGTG
AATGCGTCTACTTTTTTTTGCAACCATGCGCTGTTACCTCACAAGCTGAC
AAGTTAGGGGAAATCTCTTGTAAAATCTAGAGTGTTTTTTGTGCTGAAAG
TTCAGAGGAAAAGAGATCCTCTTCTGCAGATTGCTGTAAAGACCAGCTGT
CATTCTAAAAATAGACGCTGGTCTTTGATTGCAATCATTCTATTAGCTTT
AGGTTCTAGAAAACCATGCATTGTCAGCATAAACTGATGTCCTGAACTTG
GTCGGTGACGGTGTGGAAGTGGCTCGGGTGTGGGTGTGGGTGGTTGAGTT
TGTTGATTAGTATTTTGGTAACCATAATTTCAGTTTCCCTCGGAAGAAAA
AG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.