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GrainGenes Sequence Report: AA006425

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Sequence
AA006425
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006425
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTGATACTGAACTTAACCCCCAGACTGTTAGTCGAAGCCAGGAACGGAGG
CATGTCTTCGCGGCGGCGGCTGCTCTCGCTCCTGCGCAGCGCCCGCCTCG
CCCCGGCAGGTCGTCTCGCCGCCGCCCCGCCTTCCAGGACCTTCAGCCTA
GCCCCCGCCACGGCCGCGGCCGCATCCACCTCAGGCTCAGGTGAGCGCTT
CCCCCTCGCACGATCCCCACGCCCGCGAGGGTTTGGAGAGTCCGGTTTAG
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TGTTGAATTAGCAAGTGGATGTACTCAGAGGTTGCGGTGATGTTCCGGAT
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CCCCTGATGCTGACTGATTTAACCTGTTTGGTCTACACATTTTGCGTTAC
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CATTTGGAACTGGAAGGTTTAACCTGCCATAAACTATGTGCTTTTTTGAT
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GTCGCTCGACAAGTTTGGTTTTAGCAACTTCCCGTAAGTACATGGTCCAA
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TTTAGCTATTTGTATGACTGTATTATAGTTGTTATTATCCTCTTATATTC
ATTCTCCAGGGAAAGCTAGATGAAGCTGAGAAATTGTTCAAGGCAGCCCT
ACAAGAAGCTAAAGAAGGATTTGGACTGAGAGATCCACATGTGGCATCAG
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CCATCAGCCAAATTATGAGTTTTAGAGCCTGTTTGGGTTCATAGCCACAC
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GCGTTAGTATGTCTTTTAGTCACATATTAGGTAATATTCCCTTTTCGGTC
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ATCCTTGTTCACTTGCCTGGTATATTCACCTGCATTTATTATCATACCAT
TATATGCATACCTATGTCTATTTTGTAATAGTTAAACTGCACGCTGTACT
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ATGTGAAGTTTTATCTTGCCTGCTAGCATGAGATGCCCATTACTTAAGCT
TCCTACCCAAACAACTTTAAAAGACCGGAGTTGTTTGTATGTTGTACCGA
ATCCTCATATACAACTTTAAAACATCTTCAGCACGGTAGTTATCCCGTTG
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ACAGTTAATACTAGTCTTATCTGAAACAACATTCATTTTTGTTCCTTGTT
TCTAATACTATCCTTAGTTTTGCAGGCGGAGTTTTATAGGTTAAGAAAAG
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GTTTTCTATCGCAGGGGTTTATAATTTACTGTTTAGGGTTGAATAACAGT
ATAGGTGACACAGTATTTTTCCTATTACACTGTACCGGTTATGCATCCCT
GCCTGGTTGGTATGTACTATTGTTGTTGAGTGGAAGAACGGTGTGCACTT
CCCTCTGTGTGTGTGCGTGATTTTTTTTTTTTGAAAGAGTGTGTGTGCGT
GATTGATCACACTAGTTGATGCATATGATGTTTCGTCTAAATTCCCTGTG
TTGTAGAACTTCCTTAAATTTTTATTGCATAAAAGATACGTTACATGCCT
CTTGTAGAGTTGGAACAGCTTTGCGAAATCTTGGGCTGTATTATCATATT
CAGCGCAGGTTTGATCAAGCTCAAACATGTTATGAGGTACCTACTTTTAA
CTCATGAATCTTCTGAAGTTCATCTCTTATGCTTATTGTAAGTGTTATTG
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GTTTGTGAGGATTGAATATATCAGAGCAGTACCATTTTCTGTTGCTTACC
TTTATATGTACTCCCTCTGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTTGTG
GAACACATGTATCTAGACATCTTTCAGTGTATAGGTTCGGAGTGAACCAC
ATACTAAAAGGCATCTAGATACATTCGTTTCACAAAAGCTAAAACATCTT
ATATTATGGAACGGAGGGAGTAGTTGAATCTTGCTGGAGCAATGATGGAG
CCATTTGTCAATAATCTTTGCAAAGCTGAATAATGTGCAGCATCTCATTC
CAACTTTCTTAGGGCAGGTACAACGTGGCACTTATTTAGAGGCGCTAGGA
GTAAAATCCTGCCTGTTTTGCCGGTTCTCATAAAGATCCCAGGTTCTTTT
TAGACATCGACACATAAATGAGAGTCCGACGCTTAGAAACCGCGTATGAG
ATACTGCTGCTAGCGCCTGACGCTTGTGCACCATCGGGGTTTGACCTTTT
TAGCGCCTACGCAGGCGTTTTGCAGTGCACATGCCCTTAGAGCCAGGAAA
ATCGAAGATAGGAAATTAAAAGACTTTCTTAAAGAAACATAGCATCGTTG
TAAATCATTAGACTTTCTTAAAGAAACATAGCATCGTTGTAAATAGACTT
TCTTAAAGAAACATAGCATCCTCAACACTGCAAAAGCTCATGTGGATTCT
CATTTGTGCTAGATGAAAGCATTAGCATGGTGCACATCTTCTATCTTGCT
GTTACTGTTCATTAATTTAAGTTTCTCTACTTGTTTGAGTTGTGCTCCTT
CTGGCCATGTGCAACCTAAAAGACTAAAGAAAGTCCTTGTGGAATGATAT
ATTACAATTGAACCATGAAAGGGAAACATGTTTAGCCATTGTAATTCTTA
ATATAATTATTTCATAAATTTTCTATCGTTTATGCATGTTTTCTGACTGT
AAACTTGCTTATATCATTTTATTTTTCTGTTGTTTCTTTTTGCAGCGTGC
TTTGAAGGTAATGAATGTTAATTCTCTGGCCTCTTTTTTCTTTGCATGTT
TGACATTCATTATCTGAATCTCATATATGTCACCTATGCCACCAAACTAA
TCAATATTACAACAATTGTAATTGTTTGTTGGGTGACGCATGGCACATAA
GCAGACCAAACGACAAGCCACCAGAGAAATATATTATTATTTGTGTCATG
ACCAATTTGACAAAGCATTAGAAAATCTGTGCATGTAAATCGATGATGTG
TACATGAAAAACTTTTCTAATTCACTGTTGAAGGCCAGCATGACTAAGCA
TCAGTTGATCTTGTGTATGGATAAAAACTTTATTGTTCCATGTGAATACT
ATTAATATCCAAGAGCTTGTAGTCTCCTTTCCCCTCTTGTTAGTATTCCG
CTTACTTTAGCTTTATTTATTTTCTTTAATCATCTTAGTGATACATATCA
GTTACTGATCTAACTAGAAATTAAAATAATATGTGCTAGCTTTTGTTCAG
AAATAATATACTTGGCTGGTTTTTGGGGTAAGGTTTCTAGCCCTTCAATT
TTAACTTGTCATGCAGATAGAAGGACGTGTTATGGGGTTTGGTCACCCAG
ATTATGCAAATACGATGTACCTTCTTGCCAAGGTACAACTGCTCTGTTGC
TGTATAAGTTACTGTTCTATATCCTCTCTCATTTTTTTCACAGACATCTC
TCTCGAAGGTCAGGAGCTCTGCATTTCATTAAGACTATAATTGCCGAGTT
ATTTAAGTGAAAACCAGACACAACGGACAAACACCTAGCTAAAGTAGGTC
CTGACTCCTGAGACCCACATGTCAATAAAGCGATGGAGACACTTTTGTGG
TATGTTTATGTTTAGTTTGAGCGCAAGTTCACCATACCAAATATTTGGCT
CGCCAGAATTTTGCCTAAGGTTTTGCTTGCCCATAATGCCAGTGTTGGCA
ATAATCTGAAGTAGATTTCGAATGGGCATGCGAAAATTTTGCAGCTATCC
AAGCAAAGACCAAAATTCCATTTATGACAAAAACTTGGTGTTTTGGACAC
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GAGATGAAAGGAAATGTGTTCATTAAGCATATATTGACGTTGTGAGTTGT
GACACTGTTGGTGGAAACAATGTATACTTCATGGATGTTATTCAATGTCC
ATGACTCCATGCTAACTGAAATGTGCTTCTGAAAGGCAATCATGACTCAT
GACGGTCGTCAGTGACCTAACAGTACAGTGTTTGATTTATGAGTGAAGAT
ATCAACTCGAACACGTCGCCTGATATGTCAGCGCCATCACCAAGAGGTTG
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TTTTGAAGTCCAAACACACCCCTACAACCTGTAGAACGTTAGGTTTAAGC
AAAACATAAACTGTATAGGTTTTCCTTTTGCAACATTAATTCCCTCAGAC
AGTTATTGGATCACATAGTCCCAGTTGCTACAGCTTGGAGCTTGCAGCTG
CCTCTACCATTACTGACAGCTGTCAGGCTCCAGAAAAAGTTTTATAATAT
CTTTCTATTTGTCAGCACTGTGTCCCGGTGCTTCCGCACCACCATTACCA
TGGTTCATGTGGCAAGCAACAAGGAAAATTTTACTCTGCTCCATGCATTG
GAAGTTAGCAGTGCAGGCTCAAAACATTCTACTATATGATAACATAGCCA
GAACAGTTCATCATTTTCTCACTTTGTTAATAACATAGCCAGAACTTGTC
TTGAGAAACATGAGATTAGAATGCATTCTCAGAGTACTGGAGAAAACCTG
GCTTTGATGATGTTGGTCAGCTGTGAAATAAACTCAATGGCTTTACCTGT
ATGCTGTGTGTACCATAGTTCACAATTTATGGATTTCCTTCAAGGCTCGC
TGCACATAGCTCATTTCATCCTTGCATTAAGCACTTACACTCCTTGAGCT
CACTTTAAACTGTGTGTTTTCTTGAGCATTTACCTCATTTTGGCGGTTCC
CTTCTCCTAAATAGATGCAATCAATTGCAATTATTTACCAGAGAAATGCC
TTTTCAAACTCTCTGACAGAAGGCTATCTCTGTGAAGCTAAGTTTTATAC
TGTTGTGCATGTTCTGCTTCATGTAACTTTATTTCATCTTTGCATGAAGT
GCTTTCACATAATACCCTTCTTGAGCTCACTCGAAACTGTGTTTTCTTGA
GCATTTCCCTCATTTTGCTGGTTCCCTTCTCCTAATAGATGGAATCATTT
GCAAATTGCAACTAGTTAGTAGTTACTAGAGAAACGTTTTTTTCCAGCTC
TGTAAACTGTCTTCTACTCTTCTGTCAGAAAAGGCTAAATCTTTCTTTTC
CTGTCCATAGGTATTAAGTCAACAAAGAAAAGGAAATGATGCAGAAGCTC
TTATCCGAGAATCAATTAGGATACTGGAGGTATGTTTCCATTTCAGAGTT
GATTTTAATTTATTTCTTTTTTGTGTATGAAAGGGTTTAATGAGGATTAA
CTTAGGAAGCTGGACTTGGCGAATCACCCGCATGCATACAAAGAATGAGG
TTTCTCTCTTTGGTAAGCACCTACTGTCAGAGATATCCTAGCTCTCAATA
AAGCAGTAGGCTTTTTAAACTCATGCATAGGGGGTTGTACTATGTGGGTG
TTCATAAAAGAAATATGGTGCCTTTTGCTATTCAGACACATGACATGTAT
ATGCCCAAAGTTGCATATTAAATAGAAACTTCAATGCGACAACAATGCAA
CATGTCGAGCAAAAGCACACTATGGTCTTCACCTGGGAGAGGAAGCGCAG
GAAGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAGCTTGGCCTGGTTTATATGTCCAA
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TTCAAGGTTCATGGATGATGGATTCTTTTAGTACTCCCTCCGATCCATAA
TAAGTGTTTCTGATTTAATGCAACTTTATACTAAATCAGCGACACTTATT
ATGGACTGGAGGGATTACTATATTTAGGATGGTTATGTACAATCAGTTGG
AAGGACACTGTAAGGGTTGGGAAGATAGTGGAAATTGTGGATGACACCTA
AAAGTGTCTCCAAAAGTTAGATATGCTCATTTCTTGTTCAAATCGATAAT
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GTGTAACTGTTAAGGATCTGACAGGAATCATTACATGTCATGAAAGCCAA
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CCTCACCTGGTACCCACCACCTACCTTATCACCTCACCTGGATGTCTCCG
GTCCACCTACCTCACCCTTTCCTTTCTCCTTCCTTCCGCCTCTGTCACGC
ATCCACACTTCCATGCCATGCACTTTTTTTCTTCCTCGACAGCGGTGTCC
CTGCACCTCCCGCTCCCTTGCGCTGGCTCGTTTTGCTGCTGCACAGATCT
GTGTGGTGTTGCTGCAGAGGGGCTAGCCGGAATTGTGGTCACCGGCATTG
CGGCGAGCTAGATCCGGAGCTGCAGCACTCAGGGGCAGTGCTGCGACCGC
TTAGGGGAGGGGCTTCCAAGGGTGGGCGCTGGCTGGAACTGCAAGCCATC
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GCAATGGAGCATCGACAATTGCTGCCAGGGGCGGATGCCGATGCTACCGT
AGGCGGACAGCGTTGCTACCATAGGCAGACGGCGATGCTACCATGGGGCG
GAGCTGGGGGCTGATTTTGCTGCATACTTGTTTCTTTTTTTCTACATACT
TCTGCTACATCGACGTTTCCGAAATGCTGCAATGCTTTTTTGTGCATTTT
AACACCACAGGAAAAGTTGTTGGGACGATGCTACAATAGCACACATTTTT
TGCTACGAGTTCTCCGGCGACTTTTTAGTCCGACGTGTTCTTTTTTCTTT
TATTGTGGTCGAACTGTTTTTGCTACAATGAACCAAAAGCAGGAGGATTT
TGTGAGGGAATTGGACACGTGGCGGTCATTGGAGGCGGGGGTTCCGGGGG
AAATATCCCCCAGGGGAAGCCCAGAACTGTCTTCAATTATTCTCACTCTC
ACCAATTGACAATGTGCATCTTAATCTCGCCATGACCCCAGATTGTGCCA
TAGATCACTCACATAACAGATGTCCACACCTCTAAAAAAGCTCTAAACTA
CCACATCATAAATTTTAGCTACTTAAAATGTCAAAATGGCAGAAAAAGTC
ACAGGTGTAGTATCTAAGGCAGTCTACATTTTTGGACATCTCAGGTTACA
TTTCAAGTCTTCGGAGATTCAGCGGCACCACACTAAAAGTTTAGGGACCT
TTGATATAACTTTCTCTTTAATTAAATCTGCCTTGCTGAAAACATTTCTC
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GCCTTCAGGCGCGCTTTATTTCAATTTGAACAAGGTTACATCATTTGTTA
CATCCGGTAAAATAAAACTGGGGGGTCGCAGTCCCAACAAATGAAATTAT
TAAACAAACCCTAGCAAGTTTATGCGCCACACTGTTTGCCTCCCTGTAGC
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AGGGAATCTTGAGCCGGCAATGGCTTGGCCTCTGTCATCATGCAGAATCG
CAGCAACAGCCCCTGATCCATGCATCAGTGTTCAGCTTGTATGTATTTGG
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TCTGCATGCATTATTTGTTCATGTTTAATGTGCCTTTTTTCCAGGAGTTG
GTGAAGTCAAAGCGACTGGTTGAAGCTGAAAATTTGCAAAGGAAGATATT
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TGTTGATTCAAGGTTGAGTGGACTACAAGGTGGACGGACAATGTTTCACT
CATTTCCTAATTTCCACTGTATAGAAGTTAGCAAGCAAGTAAACTACTTC
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CGGGTGCATCAATGCCTCATTTCAGCTCTTGGCCTACTAGTTATGTATAC
TTGATGGTATCAACATAAACTAGAAGAAAAGTTCGACTGGTTAGCTAGAG
GGGAACTTAGTTGAATAGAATCCTTAATGTGCAAATTTTGGTGATCATTG
ACATTTCGACTGGTATAAATTCTACCACAACATATTAATAGACCACTCAT
TAACATTTCAGATAGTACAAAATCTATGAAATATTGTCGCTGTCACATTC
CGTAAGTTTCTAGTCCAACTAGCAGTCCATAATATTTCTGATAAAACATA
CTCCATCCGTCCGGAAATAAGTGACTTGAATTTGTCTAGATTCACATGTA
TCTAGACACGAACTTATTTCTGGACGGAGGGAGTATATGAAACAAAATAA
AAGCCTACTGAAGAGCAGAAAAGGAAAAGGGGACATTGACACACACTATT
GACCAAAGCCGATCACGAATTAGCCCTACGAAAACTACTGAAATATATCT
GTGGAACTGTTTGATAGGGATGGGATTCCTTGGATACTACAATGGCAGCT
GAAACCTTAAGTGTTACTCTTCAAAACACCGGAGAGTTGAAGGAATCAGA
AGAATTATTAGAAAGGTAAGAAGGTTATTCAATAGGTTCCTTGGTTATTT
TTTAAGTTTTCTTACTTAAAGGTTTCAATGGTTATGATGTTTAGATGCCT
CGCAGTCAGAAGAAAGATTTTCTCTGAAGATCATTGCGAGGTTTGTCTCA
CCTTATATTTGGTTTTTGATGATTTTTTATTATAATATAATGACATCTTG
TTTGACCAAATAAAAGCATCGTGACCAGTTATCTTATGTGCAGTGGACGA
TATAGCCTTGGTAGTATGATGTTTACACTTGGTAGTATGTCACAAGCTTT
CTTACATGGACACTCTTACAATCATATGCATATTAAATATCCCTTTGTTG
AGTGAAATATGTATATAGGATGTCTTATTTGACCCATATAGCCTGTCTAG
GATGACTTGGCTTGGGTGGGCTATAACCCTACCGTGGGCTCGGACCCTGG
AACCTGATACCCCCTACATAGCTGGATCCAACCTGAACTGAATTTTGAAA
CCTTAACATTTTTTTTTGAAACGATCGTATTTTATCAGTGGTTCATTACC
CATTGTATGTTTTTCTCGTTGCTACAGGTAGCAGGTATATTGGTACACTT
GGCAAGGCTAACTTTGCTTAAAATTACTAGAGACATCAAGTTGAACAATG
ACCTGTCTCCATCTCACCTTGTGAAGGCAAAACAACTTGTCAATGATTCA
ATAAGGTACTGTCTTTTAGCTCCAGTTTCTTACATTTTCTGATCCATAAA
CCCAATCAGCACGTCAAAAGGTAATTTTGTTTTTCAATAGTACGTCATAA
ACTCATAATGTAATGAATTCTCTTGGGATTTTCTCATATTTAAAGATTAT
CCTTTGAAAGGTAATCTTCTCATTGTTATCTATGGTTTTACCACTAAACT
TGCTGGTGTCATATTTTACAAGTTACCCATAAAATGTGATTGTCTGAACA
GTTCCATTGGTGAAATTTCAACTAAAAATTTCAAATAGGAAAAAAGGTGG
TATCTAATTTCGCAGATCTGTTTGAGAGACTGCTCGCCTTCATTGCTATT
CCATGATGCTAGAATACCATTTAACGTAATGAATTGCTTGAATCTTATTG
AAGTCTTATTTCATCATGGTAGGATAACAGAAGGAATATTGAATCCTTTG
AGGGAGAATCAGAAAAAACTGAAAAGCACAATTGGTGTGGAAAGAGAGAA
GATTGGGGCAACAGCTGTACTTGTACGTTTCTACTTCCTACTCACCGCAA
GTAGGGAGTATATCTTAATATTTGCTATCATGTTCATGATTCTGAACCCT
TCCTATTGTCATTCTTACATTTTTTTCTCTCCTGCTTTTGTGTTTATTCA
GTTTTGCTTCACGGATTAAGCATGGGTTCTATTCACAACCCTCAGGGTTT
CATGGATTGCATTTTAGTTAAACCATTTGTGCTTTAAATTTTCAAGTTGA
TCAAAGTTACCATAAAACTTCCATTTAACATCAGCTTGCCTTTACCTTTC
TTGTGGGTTCATCTTCTTAACCAGGCAGAGGCATGAATACCATGCTTTTT
TAATTAATAATACCTATTATTGCAGTTGCAAGCACTTGAAGTTCTTGGAC
TTCTTGAAGCTGTAAGAAAGAGAAAACAAGAGCCAGGGGTATTCCTCCAA
TACTTCATTTATGCATGTGGCAGTGATCTAATAATATCTTACACAATTTA
TTTGTTTGCTTCTAATACAACAATGTCCGCTCTAGAAGTTGGTACTCTTG
CTAAGGCTTCCTTGGGAACATATGAAGCATGGATACTTCAAAATTGCTGC
TGTACGCATATCAGACACATGTCGGCTATTCATATGGCCAGATAAACAGC
TGATAGGTGTTCGATATGCCACATTGCGTCTCCATTTTAAAAATAATTTT
GAAAAGGTTTGATACAACACTGACGCATGTTCTAGTTTACTAAATCATGT
ATTTTAGTAATATATTTTAATTTATTCAGATATAATGGATGTCTTCCATT
CTCGATGGCCAACACAAACGATCTTTAGAATTTGTTCGCAATGGGTGGGA
TGAGACTCATTGCTCTGATGCTTATTTCAATGGGGGAAATGCTGCCGAGT
CTTATAAATTGATCGATTTAATAAAATTGAGCCACTAACTATAATAGTCG
TAGTGAGCTTATGTATGGCAAACATTTGCTTGGTTGTTACGAGTTCTAGA
CTTTAAACTGTCAAATAAACATGGATATAGTTGCTTTTGCCGTACTTGAT
CAACTTTCCCCTGTATTGTGTTATTCATACCTAATTTTCCCCTGGTATCT
TAGCTGACTGGGATCTCTTCATTTCAGTCTGATTATGAACAAGCTGAACA
AGCTCTGCGCAAGTGTATTTCACTTTACAACGAGGTATATGTCAGATCTT
CCCCATCATTTCCGTATTTATACAGAAGCAGTCAACAAGGCATCAGTCGT
GCTGCACAATTGGATGTAAATTGGCAGGAACTAAAACAATAACCATTTTA
AACACTATATATTTACTGTTGCAGCCTCGTACACGAAGTGTGGTGTCTAA
ATACCTCAGGCAGCAATATGCGAGATGCTTGAGCAGCCTCATGCTTATTA
TTCAGCATGATCCAGACATCTCGAACACGCCTCGGATGCAGGATCTGCTA
GGTGAAGCACAGCAAATAATGAAGGAATTGGGCGAAGAGAAAAATATGAA
GTGATTTTTTGTATGGACGATATGGTGGTGACCAGAGGAATAAAACATGG
CGTACAGAATCATATGGATTCACGGCTTATAGAAGAAACCAAAAGTCCAG
TTTTTGCCAATTGTACAAAACGTTGATACATACATGATCAGTTCTATTGG
TTTTGTTTATATCTTTTGACCGTTTCTGCTCAGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.