Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA000408

[Submit comment/correction]

Sequence
AA000408
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000408
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGAAAGCTTGCGATGGCGGATCCAATTACCATTAGTGCTGCTGTAGGATG
GGGCATGTCAGCAGTAGGTTGGCTCGCCTCGCCTATCATTCCTAGGCTCC
TCAACAAAGGTTTCGCCCTCCTCAACCTCAACACAACAGAGAAGCTTAAG
ATACTTGATACACAAGTTTTACAACTGCAGCGAGTGATGGAAGTAGTCGA
CGAGAGCACTTACAGGGTTCGTTTGGAGCCACTGATAGACACGCTTAAAT
CTGCTCTCTATGAAGCCGAAGACATCTTGGATCGTGTTGAGTATCAGTGT
CTCAAGGAGCAGATCCAACATGCCAAGTCAGACAGCACTAAGATGGATTT
GCTGAGGAAGAATCTTTGGTCTGCCATGCCGAGCTTTCCCCTAAAAGATG
AGGTCTTTCCCTGTTCTCATACTTGGATTTTTTCTGCTTTCTCGTAGGTC
TTCCCATCTTTTTGTACCACGCAGATATATGTTAGTGATAAAACTTGGAA
CTGTAGCTGTCAATCAGAATGCAATCTCAATTATTTGTCATAGCTATCTA
CCTTGATTATAAGATTGTGAAATACACTACATACTGTTAGGAATAATAGG
ATTAGTTTTAGCCATCTATGTCCCTATATAAGAGAGACTTCTGCTACATA
GATCATGTTCTTTGTTAAAGAAAAAACAGTATTTAAGACCTTATAAATTC
TGATTTTTTATAACATACATATATAGATGTTTAGTATGTAAGTATAAATT
TGCATTATCATATATAATTTTCAGCCGTGGTCTACAGGAAAAGAAAGACA
TGTGTGGATTAAAAGTCGAGTTACTATTTGATTTTATAAATGCACTTTTT
TTTTTTGTGTAGCTTACATATTACTCCCTCCGTTCTAAATTAAATGACGC
AGATTTAGGCAGAATGTTGACTAAAATCTGTCTAGGTTCAACGAATATGC
GTCAATTAATTTGGAACAGAGGGAGTAAAGTATTTTTCACTAAAACTTTC
CAGATATGTAGAATACATCTACCTACATACTTTGATTTTTTAATCATTTA
AATATGTTTTTCACAATTTTGAAAATACCAGGCTCTGCGTAGCCCTGCAC
CAAATTGTCATAGACATACTTGTGCCCCATATCAACTGAGCAATGAATTA
GTCGGATCTTGAAGGTCTCCACATAGCTTGCCAGAAAGCTAACAACATTG
CTTTGCTCATCAAAATCTTCCCCAAAGCGACTGCGCGCCTCTGTCATAGC
ACTGCCAGCAGTTGTCGGCATCATAACAAGGCAGTTGTTACCAATGATTC
CCAAAAAAAACGAGACCAACCAGGACTAGCACTTGGTGGCATATTTTTAT
AGAAGAATTTATCTAAGCACCCTACCTAGCCCAAGACTCAAACCCGGATG
GGCTGTCTGCACTCTTGCAAGCCTTACCACTGATTCTGGGTTGCCTACTA
ATCGCTGAGTGCTGCATGGAGGGCGGCTTGACTCCTGAGCAAGTCGTGCA
GCTATACAGGTAGCCGATGATTAATCTCTCACTATTCGAGCGACTAAGAC
CTTGTAGCAGGACCACTGCCAGAAAAGGGTAGACAGGCGGAGTCAGGGAA
GGAAAGGAGGGGGAGAAGACAAAGCACATGATCAATAAAAGAAGGTACCC
ACTTTCTGTAGAGACGGAGAGGTGGTGGTGGTGATGTTGGGAGGGGGGGG
GGGGGGGGGGTGGGAGGTTGACAGGTATTAATGCTCTGAGCATGTAAGGT
GGCAGTGCCATGAGCAGGGTTGTGGGCGTTTTTTATGTTTCAGTTGATCA
GGGTTGTGGGCGTTTTTTATGTTTCAGTTGAGCAGGATTGTGGGCGTTTT
TTATGTTTCAGTTTTCGCCCAGTTTCGTTTAACTTTTCATAGTGCTCAGC
TAGTTGTTGAGTCGAATTTGTCTGAACTTTCATGGCTCACCTCTGATAGC
CTCCAAGCTCCAAGTAGACACGGTGATATCGCAGATTGTTTGTATCCCCA
AGTCCAAACCTCCTCTCTATATCCTCACACACAGTAATCCAGGAAGACGA
ACCGATAATCAAGATCACAAGGATCAACACACAAGAGTTGATACACAATC
AACACCTGCATAGTGGATTGCAATTGACGAATAACTAACAAAGCAGTGGT
GAACCACATGATATGGCTCCCGACTGGGTATTTCTGGTTTATAAACTTAA
TCAAAATCTTAGGTAACCATACATGGGCGATTGCCCTTGGTTTTAATTTC
ATCTGCCCACACATCCACTCAGCTACCATGCAACTAACCATACTTGTCCA
TTGTTTAATTCCTTAACGGGCTCAGCTTGAGTAGCATCAATAGTCCACGG
TATGGTAACGTATCAACTTCACAACCAACTTCTTAAATAATACAAAAGAC
AAAAAATTTAACCTCAATTCTGATAAAAAAATGAAGTACCCAAAATCAGT
ATATTGCAATTTGCAAGAGTTATAGAAAGAGATTTACTGGAAAGCCGCCC
TGTGGTTGGATGGTTAGGACGGTGACTGAAACCCCCTGCCTACTATAGAT
CAAAACCCGGGTTTGATACCCTGGGTGTGTCATTAAGGTGGAATGTTCCT
TCAGTTGGGGGCGACGTTGGCCTCAACAATTAGAGGGTTAGCCGATCGCA
CAGAGGTGCCTGGAGTGAGGGATCTCGGGAAGCACATAAGAGGAGGTAGT
GATGCGTGTCCGACATGGATCAACTTGAGGAATAATAGAATGAGAAGGCT
CTGATATCGCAGATTTACAATACTCAATGCACATTGTATTGATTTCACGA
GAACAGTAGTCCGTACATATACATGGGTACATAGGGAGCCGCACGCAATG
CGTGTGATCCGATTGACCAGGAGCTAACGCTAGCCTAGGACGGTTAGTTA
CAGGAGTACAACGTTAATACAAGTACAGAAACCATATGTTCAACAACTCC
TAATCTCGTGCACCTCTATTGCACAGCTGCCTCGGCCTTTGACGACTTAG
ATTCTCTTTGCCCCTTGCTCGCTTTGTCTTTATATTAACAAGGATGGAGA
GGAAAAACCCTCTAGTTTTCACTGGGATATGAAATAAGCCTATCTTTGTG
GGGGAAAAGACGACATATATTCTTCAAACGAAAGAGTTCTTGATCACCTC
AAACTTACTGTTGTTTGGTTTTGCAGGAGAGTGGTATGTCAAAATTGCAG
CTGGAGAAGAGCCTAAAAAAGATAGAAAGTGCTATAAGTGATGGATGTAA
AGTTTTGGAACAACTGAACTTGCCAGGTGTAAGTAATGATAATCGGAGAC
GGGCTGTTGCTACCAGTTCACGTGGTGAAGGCATTACCATAGGCCCTCTA
AGAGTTATTGGTCAAGATCGAGACCGTGACAAGATCATAGCAATACTTTA
TGAAAAGGAAGACCAGTGTCAAACAAATAATGTTAGTGGTACAGGTTATT
CTGTAATTGGCATTCATGGCATCGCCGGGTCTGGGAAATCTACACTTGCA
CGGTGTATTTATGATCATGAGAAAAAGTACAAGAAAGATAAAATGGAAGG
CCATTTCGATATTGTCATGTGGATATATGTTTCCCCGAAATTTGTTTTGG
ATTCCATTTTCAGTGAAATGTTTGAGGGGGCTACACAGAAAACATGCCCT
AAATTCAGTAGTCTTCATGTCCTAAAGGAAAGTCTCGAGGAGGAACTGCG
TGGAAAACGGATTTTATTGGTACTGGATGATGTCTGGTACAACATCGAAC
TCAGAAAATCGTGAAGAACTACAGAAGTTAATTTCTCCGTTGCATGTTGG
GAAGGCAGGAAGCAAAATTTTGGTGACTAGTCGAACTGAAGCTGCATTAA
TAACTCTGGGTGCTGTAAAAGAGAGATGTATTCCAATATCTGAACTGGGT
GAAAAAGTGTTCCTCGAAATGTTCAAGCATTATGCACTTCGAGATGCAAG
GGTAGGTGACAATGATCGAAGAATACTTGAAATGATCGCAGAGGACATTG
CAAAAAAGCTGAAGAGATCACCTCTAGCAGCCAGAACAGTGGGTTCACGG
CTCCGTGAGACGCAGACTGTTGAGTTTTGGAGGAGTGAGAAAGATCGGAA
CCTTCTGAATGATACGATGGGAGCTCTGTGGTGGAGCTACCAGCATCTTG
ATGAGCAGGTCAGGCGATGCTTCGCTTATTGTAGTACTTTTCCCAGACGA
CATCGTTTGAAACGAGATGAGTTAGTTAAGTTGTGGGTGGCAGAAGGTTT
TATAAGGACTAGTAAGCCTGAAGAGGAAATGGAAGATGTTGCTAAGAATT
ATTTTAATGAGTTGCGATCGGCCTCATTTCTGCAATTAGGAGGGAAAGAA
AAGGTACGTGGTCATGAGGTTGAGTACTTTACAATTCATGATCTGCTATA
TGATTTAGCAGAGGAGGTTGCCGGAAGAGATTGCTTCAGAATCGAGAAAG
GCTTCACAGGACAAGTTCCTCAAGATGTTCGCTATCTTTTTATTGAAACC
TATAATAGAGAGATGCTTACTGAGAAGATATCTGGATTGAAAAACTTACG
CACTCTCATCATCGGTGGTGTCATACTGGTTAAACCAACCGAGTGCGAAC
TCTTTGCGAGTACATTGACTATGTTGACGGGGCTGCAGAAATTGCGGGTA
CTGAATATAGGTATCTTTGTGGATGGTCTTCATACATTCTCATTCCCGGA
TTCTATTTGTCAGTGGAAGCATCTGCGTTATTTAGCTTTTCGGGTGTTTA
ATACCAAGCTGACTTTACCGGGCGCTTTTACCAAGCTTTACCACATGCAG
GTGGTAGATTTTGGTGGTTGCACTAGATTGGCATTTTCTAGTGGTAAAGA
TATGATGAACCTCGTCAACTTGCGCCGCGTAATCAGTGGCACATATCTTG
ACTTTCCAAACATTGGCAGGCTAAGATGGCTCCAAATGTTACCGGTCTTC
ACAGTAATGCTCAAAATGGGGTATGAGTCACATCAGCTGAAACACCTAAA
CAAGCTTCAAGGCAATCTGCAGATCCATGGTCTTCAGAATATTAGGAGCA
AGAAAGAGGCTCTTGAAGTCAATCTTGCTGGCAAGGAAAAACTCACAGGA
CTGGTACTCGAGTGGAATGATTTGAGCTTTACCTCAGAAGTTCAAGAAGA
GGTACTTGAGGGTCTTTGCCCATCCAAGTATCTTGAAATACTTAGTATTG
TTAACTACAAAGGTACGACATTACCAACTTGGATGATGGGTGCGCATAAC
AGCAGCCTGAAGAACCTGCAAGAACTGAGACTCGGAGGATGGAGCAAACC
AGGACCTGCTCCTGACCTCGGGGCTTTCATTCATCTTCATTCGCTATGTT
TTTCTAGCTGCAGCTGGTATGCATTACCAGGTGATATGGAGCACCTCACG
TCGCTCAAGAAACTGGAGATCCTACAGTGCATGAATTTGCAGTCGCTTGG
AACGCTGCCCAAGTCTCTTCAGGAGTTTAAAGTCGTGGGCTGCAACCACG
AGTTCATGCGACTGTATAATGATTGCTGGTCTAAATCGCGGAAAAAATTG
AGCACATTCCGACAGGTACATATTTAAATTCCTTCAATGTTTTCTTTTGT
CCATTGTGTTCAAAAGATGTTACACTTTGATTTCATGGTAAAAAAAGATG
TTATACTTTTGGTTTTAGAATTTTTGCCAAACACCCGTACCCAATGCTGG
TCCCAGTGTCGCTGCGGGCCGGGCTTCTCCACCGTGCTCCCTAGTCCCCT
CTCTTCCCCTCCCTCCTAGTCTTCCCAAGACCCCGATCCCCTGTGTTGCC
ACCTTGCCGGCCCCTAGGGTTGTTCGGGAGAGAGAAACGCCAGCCCCGGC
CAGGTCCCCCTGCCTCTCTATATCCTTTGCCGCCACGGATGACTCCACCG
GGCTAAGTCACGCGGAAGATGGGCAATAGAGGGGCATTTCCTCCCGCGGA
GGTGCGATGGCAGCGCTGAAGTGCCGACATCCCACTTCCTCCGTGTGCAG
TGGCCTCAACGCCCACTGGTTGGTGCATTTGTGGGCTTTGTGAGCTTCAG
CCTGGCAGACCCGCCCAACAAGATGGGCCCGGGTAGCGGCTCCCACTCCC
TAGTCATTGGTGATGTGAACTTTGGCAGGCAGGCACATTGTTGCCTCCGT
TGGCAACGGCGATGGTAGCTCTGGCATGGTGATGACACTGGTTTGCTCGT
TGACAACGATGATGGTTTTATGCTGGTTAACCATGCAATTGTACTCTTAT
TTTTTAATGAAGCGAGGCAATGGCTTTGCTCGTCTAAAAAAGAGAGTAAA
TGTTAGAACTATAACTATTAATCAGTAAGATTGCTGCTGTTTTTCTGATT
CATATGCTAATTGTTAGGTACCGTGGCCTTCATCTGTCAGGGAGCCAAAG
GAGATGAGACGAAACCTTTAGGTTCCTGCCGGGTTTTAGAAACTTGTTTT
GCTGATTCTTGCGTGCGTGAGAATGAAGTGGTGCTGTGCTCATACTGTCG
GAAACCCAAGGACGAATGCAAAATGTAATGGCTGCATACAGTGATGAACA
CTGAATTTGTTTGTTTACTATATGGTAGTATGTAATAATGTGGAACAATG
ACCACTGGATTTATTTTGCTTCCTAGATTTCACTTGTAACATTGTCCAAT
GCATGACGAACCCCAGATTGTTTGATTCCTATGGTTTGTAACAAGACTGA
ATGATATGAAAATTGCACATGGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.