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GrainGenes Sequence Report: AA039570

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Sequence
AA039570
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039570
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGATAAGGGAGTGGGATACTAGCTAGTAGGTAGTATAGTACGTATGCGGC
CAGATCGGCACGCGGGCCCCGGGCCGTCTTCGTCGTCTCCTCGGCGAACA
ACTAGCCCATGATGTGGCAGCAGGGAAGCAGCAGTAGCGCCCCCCAATTC
ACCTTCCTCCCACCACGGCCATGCCGCGCGGTCTTCCGAGCGGGCATATA
CGTACCTAGCTACGCGCGCAGCAGCATCTACTGTGCAGATCGCCTCTCTC
TTCACGCGCACCGGCGCAAAGGCTAGCCAAGTGCTCGCTCCCTCTGCCCC
GTCCCGACCTCTCTTCCTAGCTAGCTCCCTCGTAGAGTCCACTGCACACT
GCTCGCGAGCCAGATAAAGAAATATAGTGGGATGGAGAGCTGAGGTGCGC
GCGGTTTTAGGTTCTTGGATCACGCGCCAGCGAGCACGCCAAGCGAGAAG
GAGGAAGGAAGAGTTGCTGCTACTGGCCTGCTATTTAGCTGAAGCTTCAC
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TCATGCGAGAACTCCTGCTGTGGGAGGTTCCTCCGTTCCGATCCTCCGAG
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TGTCGATGCAACACTAATTACCTGATTAGGTGTGTTGCCCTGAGGCTGAG
GGAAGGAGGATCAAGACGTACGCATACGCGTGCCTGCCTGCCTGCATACT
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CATTGGTTGGATGGATGAGGATCAGAGGATGAGACAGACACTTGCGCTTC
AACACTGCCTGTCCCTTTTAGCTAGGCTGGCCTTGGCCCTTGGCCTTGCT
TGCTGGTGGATGCTACTGTGTGATTTTCTCTCTCGCCCTGATCACTTTCA
CCTTTCACCCGACTTGCACTCCACTTGCTGCTGCTGCTACTTGCTGGGTA
CCAAGCAGTACTAGCAGCTCAGATTAGAGACTGAGATGCGTACAGTTGCA
ACGTTGCTTTCTGCGTACTCCAGTCTAGTTAGCCGCTACAGTCCAACTTG
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CCAAGTAGTGTGAAAATCGATACTGTAGGATCTGAGTCACATGGTCCGGA
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TTCCATGCCGCCTCTGTTCTCTCCTCTGAAACTTTCTAAGCTTGCAGGGA
TCCCCTCTTGCTGTACATATATATCAGTAAACCTTTCGTGTCACCCTTCT
CTATCGAACCACTAGTTCAAGTATCCAGGAACAAGTGTCGATCTCGACCG
GATGAACGAATCCAGTTTGCCGCTAGTACGAACGAATTGAATTCTAGTAT
TGTGACACCAGACCAAGTGCTTGTTACGTTCCTTTCTGCGCAGTATTGTG
ACACCTGACTGATCCGATAGAGAAACGCATGAAAGCTAAAGATCGTTCAT
CCGTGCTGCGAAAAAGTTGATGTTGATGCAGATTAGCCGGTGTTGATTTA
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GCTTCTTTAATTTCTGTCCAAGTGTGTTGTTACGTGTCATTAATTTCTGC
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GCTGCCGCGCGACTCCCGCGGCTCGCTCGAGGTCTTCAACCCCTCTTCCT
CCTCCGCCGCCGTCGAGCCCCCCTCCGCGTTCCGCCCCGCCGCCAGGTCC
GCCTCCCCGTTCATCGAGGAAGCAGCGGGCGGCATCGAGGATGTCGGCAA
GGCCACGCAGCGGGCGGCGGAGTGGGGCCTCGTGCTCCAGACCAACGAGC
AGACGGGCCGGCCGCAGGGCGTGTCCGCCCGATCCTCCGGCGGAGGCGGC
TCCGCCCGCAGCAGCTCCGACGACAAGGCCGTCGCCGGCGCCATCCCCCG
GGTCTCGGAGGAGCTCCGGGCCGCGCTCTCCGCGTTCCAGCAGACCTTCG
TCGTGTCGGACGCCAGCCGCCCCGGACACCCAATCATGTACGCCAGCGCC
GGCTTCTTCAACATGACCGGCTACACATCCAAGGAGGTTGTCGGAAGGAA
CTGGTAACCAAATCGTCTTTCCCCTTCGATTCGATTTATTCCCCGAATGG
CATTCTGCTCTAGCTAACTAACCGATGGAATGTGCGAACAGCCGCTTCCT
CCAAGGCTCCGGCACCGACCCGGCGGAGATTGCCAAGATCAGGCAGGCTC
TAGCAGATGGATCAAACTACTGCGGCCGTGTCCTCAACTACAAGAAGGAC
GGCACCGCATTCTGGAACCTCTTGACCATTGCCCCAATCAAGGATGAGGA
AGGCAGGGTCCTCAAGTTCATAGGGTCAGCTACCACTTCTCTTCCTCTTT
CCCCTTGCATGAGTGCCACGATATGTTTACCATTTGGGTTGCTAATCCAG
GATGCAAGTGGAAGTGAGTAAATACACTGAAGGGAACAAGGATACTGTTG
TTCGTCCAAATGGCCTGCCAGAGTCACTCATCAAATATGATGGTACTAGT
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TGTTATTTACACAAGTTAAGTTGGTTTCAAACAACTGAAGAGAAAAATAT
ATTTGTGCAGCCAGGCAGAAGGATCAGGCCCGTAGCTCAGTGTCTGAGCT
TCTGTTGGCTATCAAGAATCCACGATCATTGTCAGAATCAACTAATAGCA
CCTTTAAAAGAAAATCACAGGAATCAGTAGGTGCATTGACAGGTGATCGT
CCTGGCAAGAGAAGCTCAGAAAGTGGATCTCGACGTAACTCAAAATCTGG
AGCAAGAACCTCACTGCAAAAGATCAGCGAAGTACCTGAAAGAGGCAGTA
AAAGTAGAAAATCTGGTCTGTATTCACTTATGAGGTAAGCTAGTTAATGC
AAGTCAAATGGTAGAATTGCACCATCTCATTTCTTATTCTTTTATGCATT
TCTTGTTGCTTGATTTTATTTTGTCTTACTTATTTGTTACGTGCAGTTTA
CTTGGTATGGGCCCTGGAAATATAGAAAAGGACATGCTGAAACCAAGAGA
TGAAGACCCGCTACTTGACAGTGATGATGAAAGACCTGAGAGTTTTGATG
ATGAGCTAAGGCGGAAAGAAATGAGAAGGGGTATAGACTTGGCTACTACA
CTTGAACGTATTGAGAAGAACTTTGTCATTACTGACCCAAGATTGCCAGA
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CATCTTTTCGTTTATAGAGATATCAACTTTCTTGAATGCATGTTCACTCT
TTTATCGATGTTTCAGATATTCGCGTCCGATAGTTTCTTGCAGTTGACAG
AATATAGCCGTGAAGAAATTTTGGGAAGAAACTGCAGGTGAATGACAGTC
CTACCTTAGACATTTATTGCACAATTTAACTGGCAAGGTTTTTCCCAATC
TTTAGCAAATTTAGATTTGTAGATTTGTATTAAAATCCTGATATTGGACC
TCTTTTGCTCTGCACGTTTGTAGATTGGTATAAGCTAGTGTTTCATGCAA
AATACTAATGCATCACTTTCATGTTACTTCCCTCGGTTCTCATTGCAGGT
TTCTACAAGGTCCTGAAACTGATCGCGCGACAGTGAGAAAAATTAGAGAT
GCCATAGATAACCAAACAGAGGTCACTGTTCAGCTGATTAATTATACAAA
GAGTGGTATGCTAGTCTTCACATGCTTTGCATGTTCATGCCATGCAAGAG
TCTCATGCAATTTCTATTCAATGCTTCTGTTTTCCCAAATGTTTGGCCCT
GATGCAGTATCTTTGTATCAGTTACTAACATAGTAAATATAGTATTTTTG
TGTTTAAATATATCCCTTCATGGTAATGAGTCCAGCTAAATTACTTATTA
TCATGCATCACTTATACAGGTAAAAAGTTCTGGAACCTCTTTCACTTGCA
GCCTATGCGTGATCAGAAGGTACTATACTAATGGACGTCATATGCAGCTG
ATTCCATATAGTTGAGTGGCAATTGTTTTGCATGTAATTTATGGTGCACC
AATTTTTGAATTTTGATCAGGGAGATGTACAGTACTTTATTGGGGTTCAG
TTGGATGGAACTGAGCATGTCAGAGATGCTGCCGAGAGAGAGGGAGTCAT
GCTGGTTCGTATCCATTTTACTTAAAGCTAGGTTATTTGTGCATGTATGT
ATTCTATATGAGAATTTGTAGTGCAAAACTTGCAAATTTTTGTTAACGCC
AACAGCCAGCGAACTTGTGAATTATTATGTGTTAGAGATGTATAGCTAAA
TTTTGTTAACGCCGACAGCCAGTCTTCATAGTTAACATTCTATCTGTCAG
TTGTGAGAAACATGATATGATGACTTTCTTCAGAAGATGTATTATGTTGT
TTTGGTCTGCATAAACTAAATTAACCACTTAATCTGCCGTGCACCATAAA
TTTCAAATTCCTGTTGTCTGAAAGCATTTGCTGTTTAAGAACTAACCTGA
TTTTTTCATGTGACAGATTAAGAAAACTGCAGAAAATATTGATGAGGCGG
CAAAAGAACTTCCAGATGCTAATTTGGTAAGGCAAAACCATTACTCCTTT
AGTTCATCAAACAAGTGTGTGTGTAGTTCTGATAATCATCCATTGCTTCC
AGAGACCAGAGGATTTGTGGGCTAACCACTCAAAAGTAGTTTTGCCAAAG
CCGCATATGAAGGATTCTGCATCATGGAGAGCCATCCAAAAAGTATGATA
CAATTTACCAAACTGCTTTTTACATGTCATTTTAAGCTCAGTAGATGAAA
CTAGCTTTATGTAAAGAAACTAGAAATTAATGGAAATACATACCTAGTTA
CTCTTCGGTATTCTCATTTTATGAAGAAAATTGAGAGAGTTATTTTCCAT
GCATTTTCTGTAAAATTCAGTTGCCATTAGAGAACAGTGATTGCACGTCT
CGACCAGGATATCTTGTTGGAGACATACATATGACACTTTCTCAGTGATG
ACCATGTTACTTCTTTTGTAGGTTCTTGAGGGTGGAGAAAACATTGATTT
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GCTATACTCGAGTGGTCATTTTCAGTTTCAAATAGTAAACCATGTCTATT
ATGATTGAACATGCAGCGTGCACTTGGTGGAGTTGTTAAACACAGGTGAA
TACTTTGCCATGAAAGCTATGGATAAAAACGTCATGCTTAACCGCAATAA
GGTATGATTCTTGTTTCACCTTTCGAAATCATAGCGACACTCATTATCAT
AGGAAAATGTAGTCTACTTCGGTTTTGCTTATTGTTTCATGTTTCTGATA
ACATTATAATGCCTCTAGGTTCATAGAGCTAACGCTGAACGAGAAATCCT
TGATATGTTGGATCACCCATTCCTTCCGACATTATATGCGTCATTTCAGG
TTTGTTACATCAATATAAGGCAGCGCACTTATTAGACATAACACTGTACT
TGTTCATGTGTAATCATCTTGATGAGTAAGCTTGTCTAACTCCTAGCATC
TGAACATAGACACTGAAGTATCTTGAGGTTCTTCCAGTTTCATAAGGCCT
TGTTAAATATAGTACTGTATATCGATTGGTTCCTGTAATCCTTATCATTA
TTATGCTAGTTTTGTTCTGAAGCCAGCAGTTTAGAACCCTAGATGCTAAT
TATGCATTGTTCTCAAGGGTTTGAGGCTCTTCACAGACCTCAAATCTATA
AGTCGGGTTTAAAAGTAAATTTAAGCTTTTTTGAGAACAAACACATTAGG
TCTTTTCACTTTGTTAAACACTATCATAGCAGCCCTGAAATACAATCTAA
TATCCCGGAAAGTGTCTTTGGTTCCCGAGCTCCAGTGGTCCCTTTGTTTA
AAAAAATTCAAAAACCATATTTACAACTTTCAGGAAAAACTAAAATAAAT
TCTGGGCATAGTCAATGTTGTATCCTTAAGCATGAAAAATCGCAACTCGA
AATTCTTTTTATTTTGACCTACACAAAAATGACAAATCTGATAAAATTTC
GGATTTGAAAACATACTTGCACAGATCTACATTTTTGTCATTTTTGTACA
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AATCATGGGCTAAATTCCAGGTATTTTTTCATATTTTTTTGAAAATCAAA
AATATGAGATTTGATTTTTTTTTAAACCAGGATCACTGGTGCTCATGTGC
ACCAAATCTTCTTTCCTAATATCCTTTCTATCATGTTTTGTAGAGGGGTT
TGGGTTAGGAAAGGGTTATTTTAATTTCATTTACATCATGACTTTTCATG
TTCTTCCAGAGAGTAACCTTTTTGTTTCTGCTCATTTTGCAGACAAAGAC
ACATATATGTCTCATTACAGACTACTACCCTGGCGGGGAGCTCTTTCTGC
TCCTAGATAGACAACCTCTAAAGGTTCTGCGGGAAGATGCTGTCAGGTCA
TTATTCAAATTCTTTATTGTTGTTAAATCCGGTGGGGTGATTTGCATGAT
TTTGGCTGAAGTAACAACATAGGCAACTGATCACAGTCGCAGACATGTTA
CTTTAATGTTTTGCGATTTTGTCCAACCTAGATGTTGTAGAATATAAGAT
CTTTTTATGATTGGAACAGGTTCTATGCTGCTGAAGTTGTCATTGCACTT
GAATACTTGCATTGCCAAGGTATATACAAACACAACACAGCATGCTGCCA
TCAGATTGTGTGTACATGAAAAACTATGAAAGTCTCTTTGATCACATGAG
CATTATCAGTTGCTACTGTCCACCTATTGCTCAAAATACAGCTGAAATTT
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TTGACAGACTTTGATTTGTCTTGTCTGACATCTTGCAGACCGCAGGTGAA
AAGACACAAATTTCATTTTACAAAAGTTGGCTAAATTTTTGGATTTCTTT
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TATATTTTCTATTTCTGGTAGGTCTTTCTTCCAGAAGAAGCTAATAAGAA
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ATTTTGTCTTCATTTTCTTTATTCTCCACCATTTTTGCAACATTTTCAAG
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TTATTCAGGGATCCTTCTGTATGAAATGCTGTATGGTTACACGCCCTTCA
GAGGTAAAACCAGGCAGAGGACATTCGCCAACATCCTACACAAGGACATC
AGATTTCCCGCAAGTATATCGGTAACTATGCAAGCAGCTAGCATATACTA
TTATGATATTTTCTTACAGTAGAGGATTTTGATTTCTGCGGAGAAACCAT
ATATTTTGTCAAGAGTGTTTATTCTTTCATGTGCTGTACGAATGCGCAGG
TGAGCCTCCCAGCAAGGCAGCTGATATACAGGCTGCTACACAGGGATCCT
TCGAATAGGCTGGGATCGTACGAGGGATCAAACGAGATAAAAGAGCACGC
CTTCTTCCGCGGCATCAACTGGGCTCTCGTGCGTGGCACGGTAATGAATA
CCTCCTATTATTATTAAGCCTAGTGATCCTGTTGTTCCCAGAACAGGGAC
TTTAGGTTAGGTGTAGCTAGGTTTCGTTTTGTTAGTGCTGTTCTTGATTT
GCCGTTCCTTCCTTCTTCTTTTCTTCTGCTTTTGGTCTTGTGATTTCCGC
TTTCTTGTATTGTATCGTGCATCCTCTGTTATCTTCGATAAATGAACTGG
CATCGTATATGAGAAATTCAGAATTCTAGCAAGTATACTAACTAACTAAC
TATGAATGTGGTGATGCAGGCTCCTCCAAAGCTGGACGCTCCACTGTTCC
CGGATGACACGGACAAGGGAATGGGCGATGCTGCTGCTGCTGATACTCAC
ACCGACATGTTCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.