Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA037923

[Submit comment/correction]

Sequence
AA037923
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA037923
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCTGGGATTGTGGAACACTGGGATCTGGAAATTCTCCAAACTTTAGA
GATGGATTCTGGGCTCAGAGCTGCAGCAACTGAGAGCAACATCGCTGATG
TGCTGTCGGTGGCACCTCATCGACACGGACAAGGCCAACTCTTAAGCACT
TTGTACGTATACTTCATTTGATGTTGAAGCACAAGGCTCTCTGTCTGAAA
AGACCTGATTCTAGACTTACTGATGGCTTGCCCTTGGATCAAGAAGTTGC
ATTGCCAGGTTAATGACTCTTCACTGAATTTTACACCCCAAATTGAAGAG
TTAGGCAGGTGAGTGATTATAATGCTCTACAAAGATGGTCCCTTATTGGT
TTATCTTCGCTGGCCTTTTGTGGATGCACTCTACAAAAATATCGGCTCTC
GTACCCCATTCATGCATATTATTTTGGGTCAAGTTAATGTAAAGAACATA
TGACAGCCTCATGTTTCATTATCTCATATTAACAGCTGAGTTACTCGCTA
ATTTCAGATGTGCTTATCCATGGTGGAGGGGTGAAAGTCATTAACTCATA
TGTAAGAAGAAAAGGTGGTCGTTGGAGGAGATTGCTCTTGTCTCAAGCAA
GAATTGACCAAAGTATGAAAAATAATAGTGCAGCTAAAGAAATATATGGT
GGCATGCGTGAATGGCTTCTTTTACTACTCCCTCCGTTCACTAATGTAAG
ACCTCCTAGATATTTCAAAGTAGACTAGAGTTGGACTAAAATGGGTGAAC
CTAAACAATAAAACGTGTCTAGATACATGCATTTTCAAGAAAAGCTAGAA
GGTCTTACATTAGTGAACGGAGGGAGTACATTATTGATTTATTATAGGTT
TATATTATGTTTTCTGAATCATCGTAGGCTTGTTTTTAACTATAATTGCT
CTGCATGTCTCTGTTCCCTTTTTTGCTGACAGTAGTTCACATTGGTGTGT
ATAGCTGAGTAAAATGCAGACCGTGAGGTCAGGTGGCCTGGTCCACCGGC
TCATGGTGCTCAAGTTCAACAGAGGTCCATATTGCAGCATTTTTTTTCTA
GAGTTGCGAGGGTGAGAAGTTGGGAACTAACTTTGCCAAGTTCTCTTTTC
CTGAGTGCTAGGGTGTTCGAGGTAATGACATGTGATGTCCGGAACGACTA
CCCATGAATTGGGGTGCAGGTTAGTTTCAGGCCTCTGAGTCTAGCCATTT
TTTATGTTGTAGTAGGAAACTGCAACACAATTTGATCACAGTGCTTATGA
TAATCTTTAATAAATAATTTTTCCACAAAAATGTCTGTTTTTATGTTATT
CATCCTTACCTTTGATGAGCATTATGCATTATAAAGTTTTGCAAGTATCA
TTTAGGTTCCACTTAACCAAAAGAAAATAAGTCCACTTCTTAACCCTAAA
CTATTGCAGAAGTTCAGTATATATGAACCTTGAACTCTGATCTGTTGTTT
GTTTTAAACGTTGATTTCCTGAATCACTTTATTTTACTCCCTTGGCCCTA
TCCCAAGCGCTTTTGTGCTGACTGAAACATGTGCCATCAGTTTTACAATT
CAGCACTTTTTCATGTTAGCAACTCGATTTTAAAAAATCGAAATCAAGAA
AGTGGATGAAATAGTAATGGTAATATTTATAGGGAATTTGTAAAAAATTT
AAAATTCATTTTTTTTAAGATTGTCCTTTGAACATCTTTCCAGTTAAATA
TCGAGATTTGGGATTTTTTTTTAAAGATTGACTACTAAAAAGAGTTTAGG
TACATTTCATATGTGGACTATTGAATCCAGCTTTTTCATATTGACTATCT
CTGAATTTCGAAAGTTCCAGATTATTAAAAAAAATGTTTTTACCATGATT
TCCCTGTTCCTTTTTGCTTAAGTTGCTGAAATGGTAAGGTGTGGACCTGT
ATGTTATGTCACATGGCTGCAAGATGTCGTCTTAGTCTGCACAAAACCAC
TTGGGACAGGGCAAAGGAGGGTAGAGTAAACTGATTAAAATGTTTAAGAT
TAAATACAACTTGCTTCAGAGTTCAAGGTTGCTAAGTGAACTTCATCACT
ATTTCAGGATCGAAAAGTGGACCTTTTATATCTAACACTAAGATGATCAG
AACCAAACAGTAAGTAGCAAAGCCTTGTTGGCTGATAACCTTAGTTTAGA
TAGCACCTTAAGTATTCTAGTTTCTTTGTAAAATTACCGTTTGGATCTTG
CTGTGACATACTGATGAAAATAAAACAGTTTGCACCTAAGCAGCTTGTTC
TGTTGAACTTTTTATCTTCGCAAATGATATTTGTAAATGTAAAAAAGAAA
CCATTTATGTCAGTGAAGTGCTTGCAGTTGATTGAAACTACTTTTAAATT
CCATGTCAGATTCGACCTGCTTATAGAATTTCCACCAGATAGGTTAATAC
TAGGAGTTATAGGAATCGAAGCCTGCTAGCTGGTTATTTGGCTCCGCCGT
TCTGCTCTTTGAGAGCTTTAAGTTACAGTACATTTTTGGGTGTCTCAGTT
AGCTGTACTGCATTAGTCTGCATGCTGTTGCGCAGTGTTTCTAAGGAACT
GAAGCAACTCTTCGGATGGAGATGTGATTCCTACAGCTTTGTGCAGGTGA
TGAATCATTCAAGATTGCAAGCAACCTAGTCCGTCCGGTTGAAGCTTCAG
TATTGCAGCATGGACATGGGAAGTGAATGCCTGCTCAGCACCTAGACCTG
GGACAGTCAGACGATGAAGACAATGGGTTTTCGCTAGCGTACTTGCATAG
TGGTTAGATTGAGCTTTGCTGGAGTTGCCGGTTGCACCAATGTATGGAGC
ACATCAACCTCTACATAATTCAGTCAGCTTGCATCGTATTGCTGTTTGCA
GCTGGAATCTTAATTCTTGACAGTGCAGTGCTGAAGTGGAGACGACATAT
CCATATTACAAGCTTCATTCTTGTCAATCTTGATTCTTGAAGTGGGGACG
ACAGAATTTCTTGAACTCTTGCCTGACTTCGAATTACAACTTCCAACCTT
TAATTGTTTTAATTTGTGACCTTGAACTCTTGATACCAGTTCGGGCATGG
GTTTAGGTGGGTTTGACCACCGCCTTTGACTTTGGTTTTGCACTGACCAA
TCTGCCATGTAAATTAACTCAGCCATGTCGTACTGAAACTTCACCTCCTG
GACAACCAAAACGCCGTTCCACTGACAACTCAAAGATGTGCAACATGTCA
TAACATGAGTATGATCAAATTTGTCTTGTACAAAAAAGACAAGCGGTTCT
TGTTACACTATATTGAGATATAAGTTGAATATTTTGTCATTTTTGCGCAG
GGTATATTTAATCATGCGTTCGCATGATTTTTTTTGTTAAGTGCTCATGA
GCATGATGCACATGTAGGTATTATTTGAGAACTGTTAAGATGCATAATTA
GGTACAAATCATATCCCTGTATGTGCCAAAACCCTTCTGGTAATAAGTTT
TTACTATTCTGGAAGCAAATTTTATTGTTGAGACAATAACAAATAATTGT
AGAGTTTGAAAAAAATGTTGATTGTTTTACAGAGTGCAAAACTACATTTC
AATCATAGTGAAATCACATTCCAGTATAATTGGAACAAGATGTTATGTGG
AAGCTTGACTAAAAAACAAATTAAAACACAAATGATTCCATAACTCAAAA
ATATGGTTCGCAAGTAAACGAGGGAATTTGGTCCATGAGCATCCAACCCG
AATGGATAGGGTGCGCGTTGTTGTCTTTCCCCATGTTGTGACTTTTACCG
GTATGTTACCCATGGGTCACCCAATCAATATTAATAATGAAAGTTACATT
TTAGGTGTTCAATTACTTAAGATGATCAATCATGGTTGTAGCTAGTCGCT
TGAATTGTAAGTGTTGCATTGGAGTTCTAATAATGTTGGTTTCAAACCGT
AATTACTTGCATGAATCATGCAATGATTTTTTTTTAGTATATTTTGCTCT
TAGATTACTGTGCAATTGAATATATAAAAAATAACGGGTACTAGATGGGT
ATGGGCGATGGACAAGTACAATAAATGGGAATGTGTTTAGTAATGATCGA
CCCCGTTCCACCTTTATTAGCAAGTATTCAAGGTTGATTTGCAACTAGTC
CAATTTGGAGCAAATCGCTATGTGACCCAGTTAATTGCGTGGTTCACTAA
TGTTTTCCTGAATCGAGTCACACATCAGGCATAGATGCCATAAATATTCC
CTTACCTCATTCGTAAACATAATATTTGCAATGTGATATAAGACCGGTTT
TCCGTTGGTTTACCTTATAAATTCGTCAATTCCTTTTCTTTTTAATTAAA
GGTAAATCATCTTTTCCATTTCATGAAACCAAATTGTGATAGAGAATGTT
GTCTAACATGGTTTATCATTGTTTTAATAAAGTATTTTTCTATCGCCTTG
GCAATGTCAAGGTTTAACTTTTCTTAAAATAGTTTAAAAGTATATTTTCA
TTTCGTTTTCACCGACTACACAAATAAGATAATATAGGACACATGAATCA
TAAATCGAGTCTTTGAACGTTCAACATTTGGGTACCACTCATTCATTGGC
AACTTTGTCATTCGAAGGACCCCTCCTTTCATGTTGTCTTTAATTTATCC
TCTGATCAATTGCATGATCTATTTTTTTTTTGGAAAGTGTGGGTTTCAAC
AAAAAAAAGCCACTCGAGATATTGATAACATCGTGTCTATACCAATTAAG
ATAGTTCCCACTTTACTATCATTGGTTTGGGGAACTAGATATTAAGGTAG
CCGTTCAGCCTAAAGACATTCGACATTTGTGACACATTTGGACCTCTCCT
TTTGTGTCGTCTTTAAATTTTTTTTTGCTTTGATCGTTAACACGATTTGT
TTGGAAAGTGCTGGATTCAATAAACAACGAAGTCAATAGCACAACACAGT
CATTGGTACCATTTATAAGACAATTTTCACCTTACTATTTGGAGCCAGTA
GTTTTGGAAACTACATATTAAGGTAGTTGCTCACTCTTGCGATATTGCTA
CTCCCCTTGTTCGTCGGTGAACTTGTAATTCTATATCTTCTGTTTATATA
TAGTGGAATCCTCATTGTGCTAGAAATTTCTGAAAGAAAGCAATTGAATC
CTACCATACTATATCATGACCTTGACACTATATTTTGCTTCGAATACTTT
GAGAAGATATCCCTTGCCTCAACTTGTTGTTGACTTCTTTTTAGCAAGGT
CAATTCATTGTCATCCTCTCCAGCTTACGTCCCATGTTCTAGTAACAATT
TTTTCGGCACCAAATTTTCGCAAACCTATCTTTAAATAGGGTATAAAGTA
AATGTGATTTTTTGTAATCATAACCACAAATTAAGTTTCTAAAATTTACT
CGATATAATATTTTTATTTTTATTAACACTCGATAGAATCGTTAGCTAGA
CCTCCCACACAAAAAAAATCGTTAGCAGGACGTTTTATTTTATTTTACCT
TTTTTTTTTTTTGAGGGTTTTTATTTTATTTTACCTGCAAAAAAAGCAAG
ACGTTCTATTTGATCACGTGCGAGAAGCGCCAGCAGTCAGGATCAGGCCG
CTGGCCCCGACACCCACCCACCAACACGCCAGCCCACTCTGGCGGCACTG
CCACCCGCATCGACGCGACTCGCGGGCCCGACCCGTCAGAGAGACACCAG
CCCGGTAGCAAGGGCCCGCGGTGAGGTTGCAATTGCGCACGAGCCTCGTT
GACACTGCTGTTCGTCGCGTCCACGCAATATAATTGGGGAACCAAAAAAA
TCTCCAATTGCGGCGGCCGCAAAAGCCAAAACCAAAATCCAAATCCATTT
TATCGGCGAAAATCGCATCTGGTTCTTTGGCTCGGGTGTACGGCCTCTCC
GATCCAGGTCAGTCTCTCTTCCGCCCCGTCCCCTCATTCATTTCCCAATT
TTTTTTTCGAGGAAATTGGGCATTGTCCGATTGTATCTGGCATCGGATTT
TGCTGGATTTTGTAAAAATTCTAGGCGTTATTGCTTCGGATCGGCGATGT
CCCGTACCCGTTTGCTCGAAACATTGTTTTGGAAGTAGATTGGTTGGTCC
GTGCGAGCTCTTGGATCACGGAGCAAACCCCTGTGCTGACCTGACCGCCC
TGTTGCTTCTTGATCTGATTGCGCAGATGGGTGCTCCGATTCTGGCTTGA
AGGATACTTCTCGCGGAGCACTTCCCGAGGACTGCTGGAGCTCCCCCCCG
GCTTGTTGATCTTGATCGCGTAGCTAGGGTTTGCTCCTCCAATAGAGGCC
ATCACCAGCTCCGCGGAGATACTGCATTTGGTGCCGTTCCAGGATGCAGC
CCTCAAGGAAGCTTGTCCGGGTGGACACGGCGGAGGTCAAGGCGCAGCTC
GTCAGGAAGCTCGGTCACCAGCGCGCCGAGCTCTACTTCCACAGCCTCAA
GAAGTTCCTAAGCTTTCAGCTCGGCAAGAGCGAGTTCGACAAGATCTGCG
TGACTGCATTGGGGAAGGAGAACATTAAGCTTCACAATTTTCTCGTCCGG
TCGATCCTCGGCAATGCTTACATGTCGCTCGGGCCGCCGCCCAGCAGGCA
GACGCCCACCGGGAATTCACAAACTAGCGCCATTACGAACGGGCCATTGG
CAAGCGGCGTATCACTAGCAAAGAGAATGCGGCCACTGGGTAACCGGGAC
AGGAGGTTTGGTGACAAGCCGAGTCCGCTTGGAAAGTCCCCTCTTGGTCA
TCCAGGGGCTGGGGAGTTTGTGTCTGTGGAGGATGGTGAGGAGGTTGACC
AGGCCAGGGGCAGCCCGGTGTGTGTGCAGAGTAAGAGCCCGATTAGGGCT
CCGCTGGGAGTCCCAAAGGTTCCGAATTCAAAGCCTTCCATATCTTCTCC
TTCAGAGGTGTGCTACAATAATGGCGAATTGCCAGATACGGGGTACTTGT
TGAAGCTACTTGAGAATAAGTTGAAAGAGCAAGGCCTTAGCATAACCTTG
GAGTGTGCTGATCTTCTGAACTCTGGGCTGAACGTGTACATAAATCAGTT
GCTGAAGTCTTGTTTGGGTGTCGCCAAGGCAAGGGGAAACAGGATGACGG
CGCACAGAGCTAGTGGAAGTGCTGTAAATGGTGGACAGAATAATGGCTTC
GCTTCTGGCTCAGGCTGTCCCTACCAAACTTCAGTGGTAGATCTCTGCAC
AGCTGTACAGTCTAATCCTCGGTTACTGGGGTGTGACTATGCCAGGCAAT
ACGAGAAGATCACTTCTCATCATCTTGACAGCTAAACAGCAGCAGCAGCT
ATAGATTTATCATAGAGCTTCAGCAACCGTCATGCTGGGCACTGTAGGCA
ATCCCATTGCCATCGTCCGGTGCTGTAAAAATCTACAGCTAGTTAGGTTG
AAGTGAAGTAGATTTTGATCGCCACAGGGCTGAGTGGGGTACCACCCCCA
GTGTTTTTGTTAGGATGGTGCATCTTACCATTTCAATACATCATACTAGC
TCACTTTCGTTACCTGTGATTATTCGCAAAAAAATGAAAGGGATATTGCC
AATTTGTCTTTGCTTCCTTTCCGCTGCTTGCAGATTGTTCCCTTAACTGT
ACAGAGAAGCAGGTTCTGTTTTCCTTGTATCTGCTGCTGCTGGATAGTAA
TTTAGATCTGCTACCAGTGCTCTGCTGAAGAACAGCATTTCTATCCCCCA
ACCCCCTGCCATGTTGAATTGTCGATACTTGTGCTTCGGATCTCCAAATG
GTATTGTGAAGTTCTGTATGGTTTGCGTGCACCCACACAAGTTTGGTGTT
TTGTGGAGCATCTGCTGTACTTTTTTCAATTGTTTCTGAAAATATGCACT
TGGATGCTGTCTTTTTACCTGTGATGTATCATAGAGCTTCAGCAGCCACC
GTGTTGGGCACTGTAGGCAATCCAATTGTCATCGTCAAGGTTGATGTGAA
GTAAATTTTTGAATGCCAGAAGGTTGAGTGGAGTACCAACAACCCCAGTG
GATGATAGGTAAATCTTAGCATTTCAATACATCATAGCTCACTTCCATTA
CTTGTGATTATATCACAAAAATAAAAAAGGATGTTGCCGATTATCCTTGG
CTTTGTTGCAGCTGCTTGCAGATTGTTTTCCTAACTGTACACAGAAGCAG
GCTCCGTTGCTTGGATTTGGTGCTGCTGGATATAGTATAGTTTTGGATTT
GCTACCATTGCTCTGCTGAAGAACATTCCTTTTGTCCCCAGCGCCCTGCA
ATTGTTTACCTGCCATGTTGAATTGTTGTTCCTTGTGCTTGGCGAAAGGA
AACCGGCATTTGTGCATGCACCCATCCGACTCTGTATGCCTCTATGCAAT
ATTGGTAATGTTCTGTCAATTCTAATATTGATGGGGAAACATCATGTATC
TAGACGAGTTTTAGTGTATACATATACATGCGAATCTAGACGAATTTGTG
ACATCTAATTCGGGATAGAGGTTGTAGTAATTTGGATTTACTGCTGCTGG
ATAGTGGTAGTAATTTGGATTTGCTACCATCGCTCTGCTGAAGAACATAT
GAATTGTTAGTTCCTTTTGCTTCTGAAATCGGACTGGTATCTGAAATTAT
ATGATCTGTCTATTCTCATGGGCGGAAATCAGCATATGTGGTGACTTGTG
AGCAGCGCCTGCTGTATCTTTTATAGCAAATCCGATCTTTTATCTCTCCA
TATATGCTACTCCCTCTGTTTTATAATATAGAGTAGATATTTTAGCTTTG
TGAAGCAATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.