Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA040078

[Submit comment/correction]

Sequence	AA040078
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA040078
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGATTGAATTTGTGTCCGGCGAAGGGGTTAACGCGAGGCCAGGTTCCAG CCGAGGAAGAAATCCCTCCACCTAGCCAAGAACGGATCCCTCTACAGTAC TCAAGACCAAGGCCGGCTGCTCACTGCAGATCAACCGGAGAAATCTTTCC CGCCAGCGCCGGGTACATCCCTCACTCTATTTTGCTTTTTTTTTTTCTGT TTGCTGCGGCCGGCGGCCGGCGAGGGAGGCGGATCCGGCGGGGTTTCTGC GGAGCGGCGCAAGATCTGCGGCCCGCCTGCTCCGCCGTCCGGCCAGTTAT TAGAGGGGAGGAGCTATCGGGGTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG GGGGGCTTTTTCGGGGTTAATTCAGGCTTTGTGCATCGACTGATTCCCAT GAATTAGCACCTGATCTGATGGTAAAGCTTTCCTTTTTTTAATTTTCCGA TGAACTTGCTATCTGCTGTAATAGTAGGATTTAAGTGTAGATCAGAACTT TTATTTCTTTGTAATTTCATCTCTGATTTTGAACGGGATTAGAAAATTAA TCATCTATACTCCCACTAGTAATTCACCCATCACATCTTCCTTAATTAGG CACCACGTTATGCCTATTTTGTTTCATGATCTTAAGGAAGACACGTACTT GAACAATACGTGCCACTTTCTAAACAAATCTTACATGGTGTTGCACAAAA TTCTACTATCTTTTCCTGCGGTGTTGGCTGCTCCTCGTGGAGAGAAGTTG TCTCAGGCCATGGTAACAGAGAGGAAATCAAGCATTGGCTTCCTAAGTCC AAAGCTCGTGACACCTAATATTGATCCCAAGTACTCCTCAGTCCTGAGTG GTAGATTCAGGTGATACCAGTATCGCGGTATTGTCTGTCTCTACTCAGTG ACTTACCAATCTTCACAATTACCTTCAGTCTGTAGCTAATATAGTTTTTA GTCTTTCTTATAGTCTGTAGCTGCAATAGTTTTTTTACACAATTACCTTC AGTCTCATCCTTAACTTTCCATGGTTATTCTGATTGATGCATAATAGGCT GTGTGCATTGATTCCCACGAACTATCACCCGATTTGATGCTACCTTGTCG TTTTTTAATTTTCCGATGAACTTGCTAGCTGCTATAATAGTAGGATTTAA GTGTAGATCGGAACTTTTATTTCTTTGCAATTTCATCTCTGATTTTGAAC GGGATTAGAAACTTAATCATTTATACTCCCACCAGTAATTCAGCCATCAC ATCTTCCTTAATTAGGCACCACGTTATGCCTATTTTGTTTCATGATCTTA AGGAAGACACGTACTTGAACAATACGTGCCACTTTCTAAACAAATCTTCC AAAATATATCAGGTATTTTGAGCTGAGATTTTGCAAGTTGAGACATACTG CTTTCCTTACTGCAAATGGATATTTTGTAATTCAAGTGCACCTTGGCTGC CAGTGCCTCGATCCAGCCATTTGATTAATTTAAAGGGAACCTGCACTGTT AAACCACCTTGTTACAAAATGAAGCTTGGGTGATGAGGATTTGCAATACT GCAGTGCAAGTAAAACATCTTTTGCGTGTTCCAAGGTCATATCCTACTGA CTCCATGAGACGCTCACATTTGCAGTCGATTCCCTCAACATATGCTGTGG TAAAATGTAGGGGGTGTCCTTATTTGTGTTAAAAGTGGTAGCTCATTAGT AATACTGTTCTCTTGGGAGTCGCTTCGTTAATTGAAGTCTCACCATCCTC TCTCTCCTTCCTTTGACAGGAGCCAGTTTAAGATCTCACATCTACGTTCT GAACTCTCAAGTCTCCTATCAGCTCTTCTCCCTTCCTTTGACAGCTTGAG AAATCATACTTCGTGCTACCTAGAGATCGAGATTCCAGTCACCTTCAAAC TCGTCTTGACTACATAACTGGTCTTCATCAGGTAAATACCAAAAGTTCCT CCAAACAACCATTCTTCTTTGTATCTAATTTCGCTGGTCCTTCTTGTAGT GGCCTGGCCTTACTACCTAGAGGTCGAGATTCCAGTCACCTTGTTGGACC ACCCTTTTGTAATTTCTCCCTTTGATGACAGACAGACAGAGAGCCCTGGT CTTAGTGTGGAAGTCATATCAAGCTCACCTCGGCAGTGCTTCGCCAGGTA ATTTACCAAAGTTCCCCTGAAATTAATATTCTCCACATCCAGTTTGTCCT AAGTTGCGTGCCCGATGGCTCAATCACCTTGAGCAGAGGAGTTTGAACAG AGAAGTTGTCTCAGGAAATCAAACATTGACTGCCTAAGTCCAAAGCTTTT GACACCTAATATTGATCCCAAGTACTCCCGAGTGGCTTCAGCTGATACTC AGTGACTTTGGAATGTACTACATGGTTTCTGCAAGCTGCAAGCACCATAA TTACATATAAGCATTTGTTATAGTCTGCAGCTGCAATCGTTTTCCCTACA CAATTACCATGAATCTCATCCTTAAATTTTGTCCGTGACTGGATTCTTGA TGCTTAAAATTGATATTAGAGTATCGAGCGCACCTTTGGTGCAGATGTGC ACATGTATGCCAATGGTTATTTTGATCGATGTATAATAGTCAGAGAGGCT TACTTTGAAAGGTGAGATGATATTTTATTCGTTCATGCTGTGTGCATTTG TCTTCTTTTCAACTTGCAAGTATTAATGATGTGAAGACAAATAATATTGT CGTGTGAAGAGAATCGTCTTTACTGTTAACAATCCTGAAATACATCAATA CTGACTGTCATCTGTAATTTTCTATACTTCATAATTAGTAACGTGGTTTT GAGATCTGTTTTCAACTCATCATGATCAGGCATATATCTATCAAAGGCTC CTGCACTTGGAGATGATCTGAATATTGTGATAATAAGAGAGGCATTGATG ACTGCATTCAAGACGACACACAACTTACAGAACATGTTTTGATTAGTAAG GTACTTTGAGTTCCTGATGATGCCTAGTAAAGAACTTTCATTTGACTGTA CAGCTGGTTTATATACTTGTGAAAAGAATTATTGCTAGCTGCTGTAATCG AAAATCAGGATTTAGTGTATATCATAACCTAATTTCCTTGCATTTTCGAC TCTTATTTTGAATGAGTAAAGTTACCCCAGCGAGCAATTCAGGTGAACCT TGTTGGTGACATCTTCTTAAGGAACCACAATGTCTATTTTGTTTGATGTC TAAAGCAAGCCATGCACTTGAGCAGTATATGTTACCTTCCAAACAATCTA ACATTGTGTTGCACAAAATTTCTATCCTTTCCTGCAGTCTTTCTTGCTAC GTAAAATTGGAGAGAAGTTGTCTCGGGTCCCTTTGCACCCTATGGGACGG AGGGAGTAGTAATTTAAGCACATAACATATTTACAAATATCTGCAGCTAC AATAGTTTCGTATACAATTACCTTGAGTATGTCATTCTTAATTTATTTCA GGTCTGGTCATGAGCACTTTGGAAATCTTTATAAATTTTGTAAAGCCAAT TTGTTATATTTTACAGGAATAAAATATTGGCTTCCTAAATTCAAAGCTCA GGTCACCTAATATCGATCTAAAGTATTCCTCAGTGGCTTCAGTGGGTGAC ACAGGTATGGTTATATAGTTTACTCTTTGTCTTTTTGTCTTCAAATCATG ATGTTTTTTAGTCAATTTTCAGCTTTTTATGGTTTCTGCAAGCACTATGG TCATAAGCTTACATAATAGTTATTTAAGCACATAGCATATTTATAATAAT TATTGTCATGGTTTGAATCTGCAGCTACAGTAGTTTTGTATACAATTACC TTAAGTCTGTCCTTAATTTCTTTCAGGTCTAGTCATGAGCATTTGGGAAA TCTCTACGAAATTTATAAGCCAATTTGTTATGTTTTACAGGAATATCACC CTATCAACCATGGCAGTGAGCGCTTCCACTGGTGTAATGAACTCCCTTCT TGGGAAGCTCACTACCCTGATGGGGGATGAGTATCGGAAGCTCAAAGGCA TGCGGAATAAGGTGGCGTCTCTTCATGAAGAGTTCAGTAGCATGAATGCT CTTCTTGTGAAGCTTGCAGGAATGGACGAGCTTGATATTCAGGCTAAGGT GTGGAGAGACCAAGTGAGGGAGATGTCGTATGATATTGAAGACTGCATCG ATGACTTCATGCATGACCTTGAAGTAAAAGGTGCAACCACTGGGTTTCTC AAGAAGAGTGTTGAACGCCTTAAAAAGCTTAAGGTGCGTCATCAAATCGG CAACAAGATCAAGGGGATTGAGGATCGTGTACTTGAAGTGCATGAGCGGC GCATAAGATACAAGCTTGATGAGTACAACCCTACGTCCAGTATTGTTCAT ATTGATCCACGGGCACTCGCCATTTTTGCGGATACGGCTGGTCTTATGGG TATTGATACCCCTAGAGATGAGCTTGTTGAGTTGTTGATGCATCCAGATC AAGAGCTGAAGGTGGTTTCTATTGTGGGATTTGGAGGTCTCGGAAAGACC ACCCTTGCCAGTGAAGTGTGCCGCAAGATTGAAGGGCAGTTCACTTGTCA TGCATTTGTATCGGTATCTCTAAAGCCTGATGTACCAAGGCTTCTCCAGA ATTTATTATTAAAGCTTACTGGACAACAGTCCTCTGAAAGTAGCAGTTTG GATTTGATTCAAAATATCAGAGAGTATTTATTGAATGAGAGGTATTTTTA TTTTGTGTGTTTTATTGTAGCAATGTACACTTTATGCATTTTTACCAATA TATCTTAGCAAGTAATGGTGATTTAATGCACTCTAAAAGTACTTTTAGAT AAATCATTTTAAAATTACCATTTCCAGCGCAACCATAGCATTTTCCTTCA CAATTAGGACATATCTGTCTCTGTTAGAGAAGTCAGAAGTGTCACACAAA ACAAATTAGGACATATCTGTCTCTGTTAGAGAAGTCAGAAGTGTCACACA AAACAAATTATTCCACTGTATTGTTGGACTAAGAACTTTTTTTAATACAC GATACAGATGTATATAGCACTAAAACTTGTTTAGATACATCCGTATCTAG ACAATTTGGAGTCAACTAATATGGGTCGGAGTGAGTATAATGAAGTTCTG TATTCCCAGACTAACTTTGCATACAACTCAAATTACCTTGAAACTTACCA ACATTATGGTATAGCTAAATAAAAAGCAAACTTTTTGACGAAAGAGGGTA TAAATGCATGTTTCACAATTTGTACTTGCGAGGATTTAATTTTAACTTTA TTTCGTGATATAGAATACTAAAATTTATAACTATGAAGGAGTAAACAACT CAGCAAGAACTAGCTTGCCACTGGCACCAGCGTTGGCGCAGTTGGAATTG GTGCACGTGGGGCAGTTTTGGTGAGGTGGTCTCCAGAGTGGGTTGTCAAG AGTAGGCCAGTGAGCGCCGCTGGTTGTCCGAGAGCACCGTAAGGTGAGGT TGTGTGGGTCCGCTGGTTGCCTGATCTCCAGAATAGGGAAATGGACAAGA TCAAATCAAGTGATGTCCGCCAAATCAACTTTTTACCCCACGCAGGAGTT ATTATTTTTTCCCTTCTGTGATTTGTGGCACCGTTGGTGTATAAAGCCTC CATACTACTAATACATTGGTGTTATAAGCACTAATTTTAGCTTCACACGT TTAATGAAGACACTAATGTTAGGCCTTTGCTAACAAAGGTTTAACTCTTC CAGTGGGAGCACATACTAACAAATGATGAAGTGCCGAGTACAAGGAAACG GAAGTTATTACATATACTACAAAACGACTTCTACTACCTGTATTTATATC TAATCACGGATGATTCAAAGGCCATTTGTTGTGTACAATATAATTTACGT AAATCTAATTAATAGTACGTGTTATCATGGTGTATGTTGTAGACATTTAC ACAGAGAATTTATGATATAGGTAAATAGGACTATAATTTTTCAAGTTTAT AAGATCTCACTATTAACTAACCTTTATGTGTTCTGAATGTGATGTGATTT TCAGGTACTTTATTATAATTGATGATTTATGGGACACATCAGCATGGGAT ATTATTAAATGTGTTTTTCCAAAAAACAATAATGGCAGTAGAGTGCTAAC AACTACAAGGATTTATTCTGTTGCTGCTGCTTGTTGCTCTAGAAGCAGAG GATGTGTTTACAAGATGAAAGCTCTTACGGACAAGGATTCAAGAAGATTG TTTTTTAGCAGAATATTTGGTTCAGAAGATTCCTGCCCTACTGAATTAGA AGATATTTCAACAGATATACTGAAAAAATGTGGTGGTATCCCACTTGCTA TTATTAGTATATCAAGCCTTCTAGCCGATCAGCCAAAGCCAAAATTTGAG TATGTAAGAAAGTCTCTTGGATCCATGTTTGATGGAAATCCTACTCTTGA TCAGATGAGGCAAATTTTGGAGCTTAGCTTCAGAAACCTTCCTAACCATC TTAAGACATGTTTGCTCTATCTTGGTATGTATCCAGAGGACCACAAGATA TGGAAGGTTGATTTGTTGAGGCAATGGATAGCAGAGGGTTTCGTGTGTGC AATCTCTAGTATAGATGCAGAGGATGTTGCAATAAGCTACTTCAACGAGC TTATCAATAGGAGCATGATCCAGCCCGTGGGTACTGACCATAATGGAGAG GTGTTGAGCTGCAGAGTACATGATATAATGCTAGATGTCATCAGATCCAA GATTGAAGAAGATAATTTTATTTCTGTGCTAAATGACCCGGAAGTTGTGT TAGGGATGCACAAAAATATCCGGAGAGCTTCACTCCAATGCCATGGTGAA GAGTGTGTAGTGACATCGGCAATGGTGAATGGGTCATTATCAAAAGTCCG GTCAGTCTATGTTTTTGGAGGCTTTTCTTGCCAATCTTTGATGATGCTGA AATATGTCCGAGTTCTATATATGTATATCGGCAGAAATGATGTGCTTGAT CTCACTGGTATATCTAGGTTGTTTCTTTTGAGATACTTAATGGTGGTCGG TGGTCAGAGGGTTGAGCTACCTAGCCGAATTGGTAAGCTACAACAATTGG AGACACTTGAGCTAAGAAATTCCGCTGCCTCCAAGCTTCCATCTGACATT GCTAGTTTGCCTCTGCTGCTGCATCTTATTGTTCACAAGGATACAGTTTT TCCCGATGGCATTGGCAGATTGAGACATGTGCGAACTATAGGGGTTTTCG ATTTGTGTAAGAACTCAGTGGAGAATATCGAAGGCCTAGGCGAGATGTCC AGCCTAAGAGATTTTGAGTTCCAATGGTCAGGAAAGGACTTGGTTGAAGG GGCGAGGCGTATGGACGTCTTGCACTCTTCTCTAGAAAGGATCAGCGACA GCCTCATGACCCTTTGGATGTATGGTAGTGGTTGGTATTTGGATGGCTGG AGCACATTTTCCTCTCCACCTATCCATCTTCGAGAGATGTGGATGTTTGG TTGCGTGTTCTCGACGATCCCCAACCGGTTTGGTCAACTCCGCGACCTTC AAACCTTGGATTTCAGTGTCGGGGGGGCAGGGTTGAAGGATGATGGTGTT GCTATACTTGCAGGGCTGCCATCACTTGTCTATCTTGAGTTATACGCAAA AGAAGACGTAGAAGAAAGGGTGCACATCACTGGCAGTGGCATGGCATTCC GTGCTCTCAAAGTGTTTCATTTAAGGTGTTATCATAACGTGTTGCTGACC TTCGAAGCAGGTGCTATGCCCATGCTCAAGAAGCTTTATTTAAGTTTATC AGTAAGCGGTTGCGAGAGTGGTGGGTCTGTGGAGTGTCCAGTAGATGGCA TTGAGCACTTGCCAGCTGGCCTCAGAGAAATCAAGTTAGGGATCTCCGGT GAAAGAAGAGAGGCCGTGACGTCTTCGTTGAAGATCGCATTTGAGGAGCA TCATCCCAGCGCTTCCTTGGAAATCCCTTCGTTGAAGATTCTCGTCTGAA TTGCCACTTCATGCGGCATGTAAATCATGCACTCTTACCTGTTTGCTTAA ACAATTTATTTATTAATTATTAGTGTCCATGTTGAAGTTCCATCCATGTA CTCCTCCAGTATGGAACCCTCCTAAGTTACATCCATGTGCGTTTAATTCA ACCATGGCTAGCTTTTGTCCGCTTATCTGTTATGTATTGCAATCATGTAC TCTGCCGATTTTGTTGCTTTCAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.