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GrainGenes Sequence Report: AA013198

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Sequence
AA013198
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013198
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCCAACCCCCCCCTCTCCCGCACTGCACCCATCGCCACCAATTCCTCGA
CGCCTCCGCGCCTCCCCGCTACCCCGATCGAGCTCTCTCCCAATTCCCCC
TCGAGCCAGCCAACCCTAGCTCCGTCCTCAGCTCCTCACCACCACCCAAG
CCCTCCCCCAATCAGATCCGGGGAGGGGCCCTATCCGCCCGGACTGCCGC
TGCGGACTCGTCGAGAAGCGGGCGCCCTCCGGCGCCGAGGTCACCGCCCA
CGCGCGCGCGCACTCCGGTATTGTTCCTAACCCCCCTGCGCGCGCGCCGG
ATGTCTCTCGCTGCATTCTGTTACTCGCTGCCTTATTATCCGATTTTCCC
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GTAGAGGCATCGTCGTGTGTTCGCTCATTATAAAAAAAAGGAAAGAAATC
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AAGATGAGCTGGAGCACTTCTACGGAGCTTATAGAAAATATGGAAAAGAT
TGGAGGAAGGTTTGATTTCTGCCTACTTTATTGTGGAGTGGTATTACTTT
AATAAACAGCTAGAAGTTTGTTCTTTAGGTAACCACGTACTACACCAACA
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AGCACTCTCCGACCTACCGAGAAACAAGATCAAGATCAGTGTACAAATAT
GGACTAGTTATATATCAGATCCTTGCATTCCTAAAGGAATTGCAAATGTA
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ACCAAACCCATGTTGGTCTGCCTTGGGCTTCTTTAGTCAAACCCTACTCC
AGTCAGCCAATTTTTGAGTTACCTACATCTCTTGGTCCTGAGAGGCAACC
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GTTTCAACTTTCAATCCTGACTAGAAAAAATGTCTTAAGATGAATTTATT
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AATTAATTTCTGTTGTACCCATGATTCCATCTTTTTACAAACCCTATGTC
CCGCTATGCACCTATATATGCGTAATAGCTCGCTTAAATATATCGTATAA
GTAGCACAATTCAGTTTGCATGTGTGTGATTGTTTATGTAGCACAATTCA
GTTACATGTGCTTGTCTTTCTTTTGCTATTTTCAAATGTTATTTTATTGA
CGGTTATGCTGATAAATTGATCAAGTTCTGTTGTATGTCTAGGCATATTT
ATCTCTTCCAGAAGGAACTGCTACTGCTGCAGGGTTGATAGCGATGATGA
CTGATCACTATAATATTCTGGTAAGTTAAACTTGAACGGCTATAATATTC
ACGAGCTTCTGTAGTTCTTTCCATGGATACCTGAAAAGATTGTAAAAACT
ACAGGAGTTCCATAAAGTACTGTATTAAATGTTAGTTGATTCTTGATATA
TGTGAAAACTATATCAAGTACAGATTCAGGGAACAGGAACTATTTGTTGC
ATCTTGTAATAGAGTAGTACGAGATGCTTAGGACCTTCCAAGTTCCAACT
ATTGAGATTGTAATAGTCATTTGTGTTGACTACATTAAGCTATTTAGTAG
TGTTCAGGCTGACATCTGCATTGCTTTGCCATCATTTATGGAAACATTCT
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CTGTCAGTATGCTGTGTTATTTTGTTGCATTTATCAAGAATGTTTGTAAC
TAAGGACATCTGTTCTGAACCGTAGGATGGAAGTAACAGTGATCGTGAGA
GTAACGATTCACTGAAAGTTTCTAGGAAGCCGAAGCGTGGTCGTGCAAAG
CTTCAGTCTGTGTCGAAGACATCGGATACACGCTACCCTGATCTATTGCA
ATCTCAGCCTGCTTCATCGAGCTATGGATGCCTTTCTTTGTTAAAGAAGA
AACGTTCTGGAGGTAATTTCAGCATCAAAGTCTAAATGTGTTAAAAAACA
AGAAAATTCAAGTATACTGTAAATAGTAGCATATTGGCCTTTGCCCTTTG
CCCTTTTCCTTTTTATATATATTTTTATTCTCATTTGAATCTAATAAAGT
TTTATCTACAAAGGAAAACTAGGGGTGGGCCTGATGCGGCTCAGTTCAAT
TGACAGTCTTCCTGCTCCGAGAAATTGATCACTTTGGTTCAGAGGTTTGG
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CGGACCTATTTTAGTTACCCACTCACCCCAGTTCGCAGAGCAGCAAGCAA
GGAGGGCGAGCGTTATGTTAACTAGGTTTTTTACATAGATACAACATAGC
AAGCAATCAGGAGGTTATGCAAAATCAGTAACCCATTCATTTTGACGAGA
ACTCCATTTTCTCCTTTCTTTCAATCGATCATTTTCAATAGCAAAATCAA
ATCCAGAAATAATCAAGAGATAAACTGTGGCCTCCTTACTTTGCACCATT
TAGTGGCAACATAGGAGGGGAGGGCTCTGGCCTCTGGTGATGCCCTCACT
GGGGGCAGATCTGGTGGCCTCAAGTGAGAAGTGGGAGCTGAGTGGAGCCC
TGGCGGACAGGATGTGCTGGAGAGCAGGGCTGGCAACCGGCTCCCTCAGC
TGCTGATGAACTGCAAGGGGATAAGGCAACGGTGTCTTGAGTTCTGCAGC
GCTTGCTCCCGCTCTCCCTCGCCTAAAGGAAATGGACTGCTGATAGACTG
CAAGGGGATAAGGCAACGGCGACTGGACTTCTGCAGAGCTTGCTCTTGCT
CCCCCTCCCCTAAAGGAAATGGATCAAGTGTAGCACACTCTTTGGCCCAA
ATGTTCGATCTATGCAGTTTATATACTCCCTCCGATCCAAATTAATGGAC
TGAGATTCGTCTAGATTCAGATGTATCTAGTCATGTTTTAGTGCTAGATA
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TGAGAATTCGGTTGCTAGAATAGGTGCAGTTCTGAACTGGGACGAACCAT
GCCACTCCTAAGGAAAACACATAGCAAATCCCAGTTTCATTCACTAAAAG
CATGTAGGTCCAAGTTTATACTAGTGTGCTAGTTAGTATAAACAGTTCAC
AATCTACAATTCAACTGTGAGCACAAAACATTTCACAATCTACTATGAAC
TCATAGGAAGGCAGCCTAGTTCACTTGGGCAGGGGAGTGGATGTGCAATC
GCACCACCTGGTCTCATGTCAAGATGACATGAATTTGGGTTATTGTTTAT
ACTGTTCAAGGCTTCCCATAGAGTTTTTTTTTAAATTGTAAGATAGAATC
CTGTACTATCTTTTATGGTGAACATAATTTTGGTAAAAGATATCGACAGT
AGTATTACTTTTTCTTGGCATGGCTTGTAGCTTCAGCTTGTCTGTCTAGG
AGCTAAGTCAGCTCAAACACCTGTCTTATCCATTTTGTTTTTGTGAAGCT
GGAATCAACTTAATGAAAAAGCCAAAAGTTGATTTCTCTGGCTTCCCCCC
TATTTTTGACCCAGTCTCCACCTTAAGATACCTGCATAATATGTGAACAC
AAATTGTCTGGAATTAATTTAATTACTTGTTTTCCGAAGTGTTCATCTAC
CTTGGAAATTTTATTATCACCTTAGACCGGCCAACTTTGATGTCAATAAC
TCAATATAGTCTCTTGCCCCCGTAAAAAATAATAGTGTTAAATATATAGT
ATGCTCACTGCCATCATAATGTAGTCCCTCTAATCTTCCTATTTTATTTT
GTACGTGAACATGAGATTGTCCATCTTTTACGTAAACTACTCTGTTCATT
TTCTCATTTTGTGTGGGATCTTAATAGGCATCTTTGATGCCTCTTATGCT
CTTCCTTTATACATGTTATTTTTGCACTGAATTTAGCTGATGGCATGTGT
TATTATTTTCTACTCGCCACTTTAGGACCAATAAGTATTTAATGGTTGAA
AATATGGCCTCTGAAATTTGCTTTATGGCTGCACAGTATTAAGACCTGAC
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GAACAGGCCACGTGCTGTTGGAAAAAGGACTCCACGAGTGCCTGTTGCAA
GCATGTACCAACGTGATGACAAGATAGGTCCAGCAAATAGACAAGCAAAA
CCAGATGCTACTAATGGTGACGATGAAGGTGCTCATGTAGCTGCTCTAGC
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CTGGAAGATCAAGTGATCGTATGTTCCTGTCTCCTGTTAAAAGTACCGAC
AGAAAAGTAAGAACCCAGAATCTGTTTCTTCTTTATCTCTAGCTCACTTA
TTTTGCAAAGTAATTGCATGATCAAATCTGTATAATGCTTGCAGAATGCG
GATTCAGAGATGGGAAGCTCAAAGATGCATGGATTTCAAGTAGACGCCGA
TTATCCGGAAGGTAGCTTAGGAAGCAGGGAAGCAGAGACTGGTGACCACC
CCAAAGATGCTTCTTATTTTATGAATAATGAAGATTCTGCATCTGGCAAG
GCTAAGCAGAAATTAAAGAGGGCTCAGAAGAGAAGAAAGAAAGCTGCACT
CAAAGCAGACGAACAATTCGAGGACGACAGAGAGGCTTGCAGTGGCACTG
AAGAAGGGTACAGCGCCAGAAAGGCTAAATATGAATCAGAGGTGGACGCA
TTAGGAAGTAAAGCTTCATGGCTATCTAATAAATCGAACAAAAGAAGTCG
CCAGCTATTTTTTGGCGGTATGTCTGTTCTAGCAATATCTTTTATTTTAA
AATAGGTAATGAGATGATTGAAATATGACCATGGCATATTATCTTCTAGG
CTTCTAGCGCGGTGATACTTTCAGTAAAGTTAATGGACTTTTGTGAACTT
TTGAATACAATAGATATATTCATATTACCAAATGACAATAGTATACCAGC
ACGATGGACAATGGGTTGAGTTTCTTACAGTACTGTATTTTTTCGATTGT
GTGCTGAAAATAAGTTTATCCTACACTGTGATGGTTATCTATCAATTTTT
ATTTCAGAATAATGGTTGTCTTGTTGGGTTGTTGCATTTGTAAAATCAAC
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GATTACTACACTGAAATCGATGTTGCTATGCAAACTTCGCGAGGAGGATC
TATTGTTCTTTCTAATGCATTCTGTTCGGCTTTGCTTTTTACCCATATAT
TGTTTATTTTATTGTGTAATGCTTGCTAAGTTGTAAGGATAACTTGTTGG
AAATGTTGCTTTTGTATCTATGTAGCACAAACCTTTGGTCCTGATTACCT
TATTGGACTTCGTTTGGCAGATGAAAGCTCGGCTCTCGATGCATTACATA
CATTAGCTGATATATCTGTGAATATTCTACAACCTTCTTCCAATGCTGAA
TCTGGTTAGTCTTATCTCATACTATGGTGCTAATTCAGAAATTGTAAGCT
ATATTTTTATTATTTAATTTCCTTGCACCTTACTTTATTCATTATCATCA
TATCATGTACTACCTCTGGCCTAATTAACTGACGTACTGCTTGGCATAAC
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TGCCATGGACAGCTTAGCCAGTTTATTACTTGAGTTCTTGCAATTGCTAT
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TCTTTTGTGGAGTCTAATTAAAGGAATTTTGGATAAATTCCTATACGTAC
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CTTCCTCATGTCTTCTGGAAGAAATGGATGCAGTAAATGTTTCAATAATA
ATTGTCATTATTGTAATGCTATTGGTCACCTGCATGCATTGTCGACTAGT
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GCCCTGCATGCCTTCCATCTGTTTTACCGCAACACACTTAACTCCATTCA
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GATTTTTTTTTATCGATATGATAAGTTTATAACGCTTTGTGTATGATTAT
GCTATTGATTCTTCTGATGCCTATTTTCCAGAATCATCAGCACTCATTAA
GGATGAGAGCAAAGACACTGAATCCGATGAGAAGCCTCTTGCAGCAGTAC
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AAGATTGTAAATGTGGTGTTAAAATGGAGAAAAAGAAAAGGAAGTCTTCC
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AGAGATTGCCAAGATATGTTTTTGTCAATGTGAACTTACTCTTTATCTAA
CTTCCACCACCATTTAGTAAAAAGAATAAAATCTAGCTTTCTCAGATCCT
TAATCCTTAAACCTCCATTTGGGACAACATACCTAAGAGAATGACACTAT
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TATATAGTTTTTGAAATCAATGGCATATAGAAAATGGGAAGGCCACTAAG
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TGCTTAAATGGCACAATATAAATTTGCTTGTATATCTGCATTTGCTAGGT
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GCACATGATGATTTTGCAAAAGAAGCCATGGATAATATGGACACAACACA
AAATGCGATAACTCAGCAATCTGACTCGACGTCGAAGGCTAAAAGCCGGC
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GCATGTCTGAATGGTTCTATAGTGCAATTGATTACCCATGGTTTGCAAAG
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GCAGTTGGACAGCGTGTTATAGCCTGTCATCCCAAAACAAGGGAACTTCA
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ACTTTCTGTTTTGGTTATTTCGGTGACATGTTTTATTTTATGTCTTCTGG
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ATGCATGATTTCAATAAACTGATTCTCTTCACTTGTCCATGTGGATGAAC
CAAAAAACTACGAGTCATTAATGCTGAACTGAAAACTAGCAGAATATAAA
CATTTTTGTTTTGTTTTTGTTCCTTGCTTTTCACTCTTTACATTTGAGTA
TGCTTTGACCAAGCACACCCATGGCTTTTCTTTAGAGCCTTGTTGGCGTC
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AGTCCAGTCACAAAGTACTGTTGTTTTGTACACTCACATAGTCCCAAAAC
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TTCATGTGATTTGCTTTCCTTGCACAGCTATACCTATTCATACCCGAGGG
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ATTGCCATGTCAAATAGGTTGCTGTTACTCACTTGAAAAAGGTTGTTAAT
GTTGAGGAGCTTGTTATATTACAGGATATTGATTGTATGCCACTACACCC
ACTGGAAAATTTCCCTGAGTCTCTCAGAAGGCAAAATATTGTGAATAAAT
ACTGCAGCAGCTTCTCAGAAGTAAAATTTGAGGATCGGTCCAAAGAGTAC
GGTGGTGGAAGTGCAGCAAGATTCACACCAAATGTGAGTTTCGACAGTGC
TGATGCAACTTCCTTTGTACTTTCTAGTCACCCAATAAGTATTTCAATGA
ACCAAGCTAAGGTGACAGCATATTCAGTGGAAGCTTTACAATATATGTAC
TCAATGTGGAATAACCTAACTGTTTCCCCTTGTGGGATTTCTGCAACAGG
GAGACACATTTGATTCAGTTGCACACGCCAAAACTACAGTGAATGAGGCT
ACAGTTGCTGCACAACAGGCAATATATAGCCAGCCATGTACACTGTCACA
GCTACAGGAAAGAGAAGCAGATATAAGGGCTCTTGCTGAACTATCACGTG
CTCTTGATAAAAAGGCAAGTGCAACAGACTTTGGCCTTGTGATTATGTTT
TCTCTAGTGTTTGAAGATGAAGACAGAACCACCTTTGTTTTTAAAAGTTT
GAAGCCCCAATTGAGGATTGAATTTGGATGAATCCGTATGACCATACAAG
TTTGTTTTGGTTCACACATCATGCTGTTACTGTAGGGTTCTAGGATCGTC
CAAATACCATTATGGGCCAACAGTGTCCAATAATAATTTATTGGTTACAC
ATGTTTTACGATTTTTACACGATCCAAGTGCACAATATTTATGTCTATGA
ACTATTTAATCTTTTGTAGGAAGCTTTGCTGGTAGAGTTGAGGCACATGA
ATGAAGAGGTGTCTGGGAAGCAAAAGGATGGAGAAACTATTAGAGATTTG
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TGCGGGTTTCATGCACTTACAAGATTCAACAATATATTTCATACTCAGGT
GGCTTCGGCCTTGCTTTCTCTGCGGCAACGTAACACATTTCATGGGCAAC
CAACACAGTCATATCCTAAATGCACGGAAAATGGTGGAGCTTTTAATAGA
ACACCAGACACATGTAACCTTTTTGGTTATATTAATCAGGAGTCTGGATC
CCAAGTGATGGAAATTATTGAGACTTCGAGGTGCAGAGCTAAAACGATGG
TTGATGTTGCTATTCAGGTTAGATAATCATCCCTATTTGTATTTCTATCA
GTATCATGTTAGTTATTCAGTCCAGCAGTCCTAGATATTCACCATCTGCA
TCTGGTAGTACAGATCAGTTTCACTGCATGGTAATAGTTAGAAGTGTATA
TGTTGTCAGAGTGCAGAAATTAAACTATTTTTAACCAGTTCATGCACCCT
ATAATGCTCTTTGATCTTCACCAGATCATATTATTTTTAAAATATTTCAA
ATTGGCAATCTAACCGTAAATATTGAGGTAATGATAAAATACGTGAAACT
AAAAGAGAATAAGTAGCAAAGAGAACCTAATTTTTGTTTCAACAATCATA
TATGTTCGGTTCAATCCTTAAGGGAACTAAAGATTCTAGAATTACTTTGA
GTAATCACCAGCACATGATTTGTTCATGATTTCCTCTTCCATTTTTGCAG
TCAATATTCTGTATGCTGCACCCTTGAATTTGGTTTATTGTTGGATACAT
GGAGCATATAACTCCTAGATTTTTTTTATGTCTGAAGCATTGCCTATTTT
ATTCTGTCCATGTACTTTTGGTGTGAGTGAAGTAGAAGACTTTGCTTTGT
TTTTAATTTACATGCTGTCATTTTTCTGTGTGACCAGGCGATGTGCAAAG
TAAGTGACGGGGAGAATGCTTTTGCGAAAATAGGGGAAGCACTAGACAAT
CTGAATATCCGTGGTACCGGCTCTGGTTCAAGCATACTAGGCATAAGGCG
GATACCTCCTGATTCGGGACAGGCAAATTCAGCCTGTCAAGATAGCAGCA
CGTCTGGCCGCTTTGACCCTGCGACAACTAACATCTCCAGTCCTAGATTG
CCCAACGGCCGTGATTCCGAAGCCCAATTCCCTTCAGAGTTGATTTCATC
CTGTGTAGCTACCATCCTTATGATACAGGTAAACCATAGTGCATATTCTT
CGGTTGTAATGTGTATGTGTCTGGTGGTCTAATGGGTGGTAATCTTTTCA
ATGCATCAGAATTGCACGGAGAAGCAGTATCATCCTGCCGAAGTAGCACA
CATTCTCGATTCAGCGCTCTCGCGCCTGCAACCATGCAGCTCGCAGAACG
TCCCAATCTTCAGGGAGATCGAGATGTGCATGGGTATCATCAAGAACCAA
ATGCTGGCTTTGATACCCACTCCTAGTGGCTAGCTGTGACATGGCTAACA
AACATTCTTTCCTGTGTTATATACATATGTAGGGGTTAAAAAACTTGACA
AGGAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.