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GrainGenes Sequence Report: AA005886

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Sequence
AA005886
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005886
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCAAACTCTAGTTCCGCAGCAGATCTCAATTCTCCATTTTCTTCTCCCCG
GTGTTGTTTCGAACGCACTCCACTGGGCACTCCTACCGGCTACCTCTGCC
GGCCGCGGCCGCCCACACACCCACCCACGACCACGACCACAACCACCACT
ACGGAACGGCACAGCCTCGGGGGCCTCTGGCGAGCTCACTCCGAAGAGGG
GCAAAGCGACGATGAGCGGGGCGGCGCTGTGCGCGGCGCTGACGGAGCTG
GGGTTCGACGGGGAGGACCCGCTGGACGCGGACGCGCTCGAGTGGCCGTT
CCAGTACGAGGAGGCTCGCCCGCTGCTCGCGTGGATCTGCTCCTGCCTCC
GCCCCTCCAACGTCCTCTCCCCGTCCCACCTCTCGCAGTGAGTCCAATCC
CCTTCCCCTCCCCTCCCCGCGCGGTCCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
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TCTAAGAATATAGGATGTGCTCTGATATTGTAAGAGGACTTCCATATGCC
AATGTTGGCAGCACAGTATATGGAGTCTGATCAAATAAAATAGCGAGGAC
CCAATTTAATTTCTTGGAAAAGACTAGAAATTGGTCAATGCTCGGCAGTT
ATTGGAAAATACAAACCATCTCTGAATTGATACCATCTAAGATTTGCACC
CCTGCTAGCAAGCAAACTTAAAAATCAGATTCATCCCAATCTTTGGATAT
TTGCCCCCACATATTATGCAAGCAAGCTGCTAGCATTCTCCTGTAATATT
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GGTTAAACCTTAGAACTCTTGCAATATCCTTTATTTTTTTCTCAGGGTGA
GGATTTGGACTCTGCTTTTGATAGTATTTCAGCCTTTTCAAGCAAGAAAG
ACAACCAAGAGGCTATCTTCGAAGCAGAGGAAACAATTCTTGACATCCGG
TATGCTCAAACTTCCATTTTTATAAACTACTCCCTTCGTCTCATAATATA
AGATGTTTTAGCTTTGTGAAGGAAATGTATCTAGACTACTTTTAGTGTGT
AGGTTCGGAGTGAATCTCTATGAACCTACACACTAAAAATAGTCTAGATA
CATTTCCTTCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTA
GTACTGAAAGCCATGACATCCTTGCATTATTGCTACATTCACATTGTTGT
AATTGTACCTGTGGTCATGTTTCACACCAAATGTGGTGGAATCTGGTTCC
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TGTATTAAACAAGAAGCTTAAAAGGACACCTAGACTGGGTGGGGTCTGAG
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GCCTGCTTAGGCTTGATGCCTGATTGGAGAAGACACAAAAATAATATGTT
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GAAAGAACTAAGATATGCTTTTATGCCTACAATTAGAACTGACCAAATTA
TATCTGACTGAAAGGGAATTAGTTGACCTATTTTTTAAGGAAACCTTCTA
GCCGTCTTCATGATATAGAAGGGCGTCAACTGCCGTCTTCCTGATATAGA
AAACTCTTGTACATAAAACATACTGTTAACAGATCAGTAAAACTTTGGAG
GAACCCATAACCTTCACGATCATTTTAGATGCTCCCACAACCATTCTCTG
CTACTAATTGACTTTGTGATGTATCTCTTCTGTTTCCTTGTTTCTGGAAA
GTTCTCGTATTTTTTGAGAAGTGCATAACCCATGTGTGCTGCTGAAAACA
CATGCTCAACTGCCTTTCCCATTGCAACATCTGGATCTTTATATATGATT
CTATTGTGCTTCTGATTGTAAATTGACCAAAAAATTTCGAAGGGCCATTT
AAAAGATTCAGATATTTCATCATACAAAAGGCAAGCACCAAAAATAATTG
TTTCTCTGAAATGGTTGAACCCAACAAAGACACCAGATGACCTATGTTCC
TTATTTGTTCCAGATGTAGTGTCAAAAGTTAGCAAGAAGATGATGACATT
CTGATGCTTTTCACTTAACCATTCAGACCGCCGATGGCCTGATTTTCCTC
GTTGATATGGTTCTTACACAGTTTGAACGCTTGTCTAAACTGATGGTCTG
CTGAAGAAGACAGAGATTCGAGAAAGTAGATGAGAAAAAGTGGTGCCGAC
AATCATCGATCGTCTTTTTTACCTTACTAGAGGGAGGACTTGACAGCGGC
AACTACAACGACGGCGGCAGCGGCGCTGTGCCATCTTCTCCTGCCGTCAA
CAAATTCACTGCAGATTTGATTTCCTTTGTGTTGCGTGTGGCTCAGCCAT
GTCGCTCTGTTTGCGGCAGAAAACAAGAATGCGAGAGGGCAACAAAAGGA
TTTCGCGTGCTGTCATGGGCTGTCTTTTTTTTTCCGGTGTGTCAGCGAGA
GAGAAGGCAAGAGACACGCAGCAGAATCGCTAGGTTTGTTTTATGATTTT
CACATACATGCAATATCAGATATGTGCACCTACAGCAGTTCTGACGTGCC
TCGAGCACGTTTGATGAGCCATGTCCCTCAGCCATTAGCCCATAACATCT
GGTTATGTCCATACCATCTATCAATATTATGTGCTTGAACTTTGGCTTTT
GAACATCCCTCTGCTGGGCCAAGTTGCTGTCAAAAACTAATTAGTGAGAT
TTGCACAATAAAATTTATTCTTAGACTCCTGTATGTGCTTTTATTTACAG
TTATTTTTCTTTTTCTTGCTTGCAGAGAAGCAAAACTAGCATATAGAGCT
GAAGTTTTTGAGTTGCAAAAGCAGATTGCACGGCAACAAGCACAGTTCGA
TTTGCTTGCAGGGCAAGCATCTTCTCTTATCCAAGGCAGACGAGCCCGCG
TATCGGCTATGTCTACAGTTAGCGTGCAACTTATATCATTAGACGAGATA
CTTTCTTCTAGAAACTTAGAGGTATTTTTGTTATCTTGCATCTTTAAAGA
TTTTCATTCATGTAGTATGCAAAAAAAAAGATAAAAAGGTAGTCATAAAT
ATTTACTCCTCGGGAGAATCTGTTTTGATATATCTGTCCATTGAAGAAAT
CAAGAGGCTAGATATGCAATATGTGCCCTTACTGAAACGTTTAGGGGCTA
GGTACTTGTAGTCTGTCAACCAATAGAGGTATGCATGGCCATTTGTCAAT
TCCCATTAACTCTTTCTTAGATTTAGTGCTTCCTTGGTTCGTCCATCACT
GTATATGTCTGAAGGCTGATATAGTGAAACATAGGTGTGGGAAAATACAA
ATATGATTTCGGATCATCTACACCTAATAAAGTAGTAGAGTGCCTGTACA
CTTGAGGAAGTTCCCTAAAAACATCTATGTACTAGATTTTGTTAAAATAT
GTGTACTCGCCAAAACCTGGAACAAATGTGATCGTATATGTACATTTTAT
TGATCGTGGTTCACAAATATTAGCAGGTACATGTACTTACTATGTCCTAC
CTCTGTTTGGGATTATTAGTCCTAAGGGCCAAGTTGCTAGGACCAAGACA
TTCCATAACTCTCTCATTAATCTATGCATACACCAATAGTTTTACATGCA
TGCAAGAAGTGAGAGGAAAAGGAGAACATGCATTGGACGAGAGAGACTAA
TAAATAAGATAGCCCTTATAATCTCCAACAAAATAAAAAAGCTCTCAGCC
CTTATAATCCCAAACAGAGGTAGTACTGCACAAGTAGACAAGTAGTTGAA
CTGTTCCTACTGGATGCGTTGAAGACTAAAGCACATGCCCGTACAATGTG
TGGGTTCTTTTACATTCGTTTGCGTTTGTGGCTCAAATTTTACTCTTGCA
TGTGTGTACACTCTATTTGGTATATATAAGATACTTGATTATCCTTGTGC
TTTTTGGTCTATATTTCTGTTATAGGGGATGTTCCCCTTGTATTCCAAGA
GGTAACTTTGCCATAAGTTTTGATTTAGTTTCTTGCCAACTTTCAGATGA
ATGCAGTTCTTGGAAGAATTACTGCTACAACCCAGGAGTTGGCCCATTAT
CATTCAGGAGATGGTATATGCTAAAACTAGTGCGTATAATTATACATAAC
ATCATATCCATTAGTCCTCGATAATTTGATTAATATTCATGATATGCCTA
TGCAGAGGACAGTATATACTTAGCATATTCGGATTTCCACCCTTATGTTA
TTGGAGATTTGGCTTGTACAAAGGAGCTAAACCGGTGGTTCTCGAAGCAA
TTTGAGAAGGTAAATTCCTTGCAACAAACTAACTAACGTCTGTTTGTTCC
AGATGTATAAGAGATGTGGGCCAGTAGTCATCTTTTTATTATTTACTAAA
TATCTCACTTTCTAAAATCTCAAACAACCACTATCTTGCCCCCTCCTCTA
TCTCGTTCCAAATAGGTAAATGATACAAGAGTAGAAACATGTGAGATCCT
GGCCCAGGGTTTAATAGGATTGATAGAATACTCATACCAACAGGTTGCAA
CTTCTTTTCCGGAAGCTTATCTGCAAAGAAACCTCCAGGCCAACTGCAAA
GAACCTCCAGGTTAAGCGTGCTTGGCCTGGAGTAATTTAAGGATGGATAA
CCGACCGGGAAGTTCTTCCCGTGTGTGCACGAGTGAGGACAAAGTGCGCA
GGAAAGACTAGTGTTGGTTTGTGGGGTGGCTGGGGTGTTACAAAACGTCA
TCGTTGATATCAAATTTTTACTTGTACTTGTTTGTATTTAATATTTACTC
AGTAATACCTTCATTTTAGTATTTTCTCAGTAATACCTTTATTTTAGTAT
TCCAAATGTCATAATCACAAAAGTACCATTTCCTGTGTAGTTGGATATTG
CTCAGTTTTTATTGTTGCATGTGGCTTTTTATGATGAATAAAACATTTGC
TCTTCTATATGCATAGCTTTTGCTACCAGATTTTGAGGACTTGTCTATCA
TCTTCTCAAATTTCCAGAACCAATGCGTTTGAACAACTGCATGTCTCTGT
TGCAGCCACACCATTTGTATTCTTTAAGTATCACGCGAGAACACTTTAAA
GTTTTGAACTGCTTATTTGTTTCATATTGTTATGTTATGTTATTAGGGGC
CATTTCGACTTGTTGCTGAGGAGGGGAAATCCAAATGTTCCTGGGTTAGT
CTTGATGACATCACAAATGGGTTGATAAGAGGTATAAACTTTGTTCAGTA
ACTTTTCTGTTATTGCTTTACATTTTATCATGAAGGGTTAGTTGAAATCT
GAGAAGGGCATAGCTATACTCTAATACTGTAATGGCATGACGGTGCTCAG
AGATGAACAGATTATAACATAGGTGTTCTTGTATGCAGGAGATTCTGAAA
AATCTCATCATCACCAGCGTGTGGCTGAGTTGCAACGACTCCGTTCAATG
TAGGTATCTTCCTCTTGTTACCTTGTATTAATCTTTATGTTTGCATCATG
ATACTGTCTAACATTTCTTTCAATCGTGCTGCATGATGCATGTAATCATG
TGATGCATCACGTGAAAACACATGTTTATTTACAAACATTTGTACTTCAT
GTTGATCGTCGAAATCCATGCAATTTTCTGGTTGCATGGATGGGGAACTG
TGGACTAGACCATAAATATGTTAGGGAAATGTTTACCAGATCTCCCACTG
TGTCATGATCTACTAAATCTCTTCTATCCACCATTTATCCATGGTCCACG
TAAAAAAACTCATATTTTGCAGTATCTACCCTTTAGGGCTAGTTTGCTTT
TGTGATGGGTGTGGCCAAAAGTGTTGTGGGAAAACCGTCATTTAGAAAAC
CTATGTTGAAAAGCAGTTAATCAAACAAGATAGCATTCCAAGGTGTTTCT
ACCAAATGTGGTTACAATGACCCATCAAACCAAATGCTATTGGTTCATTG
ATATAATATATTTGTGTGGTGCAATTGGTAAAATTGTATTGCCATTATGC
ATTCTTCAGCGTTAACCTCTTGAATTTTCAGCTTTGACTTTCTTTTAGCA
GTCATCCAACGTAGTCTGTGAGCTTACTCTAATTTGTCAACAGATTTGCT
ACAAGTGAACGACAATGGATTGAAGCGCAGGTCGAGAATGCTAAACAGCA
GGCCATACTCCAAATTTTAAAATCACAAGTATCCTCTGACGAGGCTCACA
TACATAGGGATATCCACTCTCTTAGGTATATCTATGTTACTGATCTTGAT
TGTGATTCTATCAGTTTTTCAGCTATGTTCGTCTTACATAACTGTGACAA
AATATCTGAAAAACAAGAAGGATCTCTCTTATCTTGATTACTTCTTATTA
CTGTCTTTTTTCTCCAGGAGAAAGAGTTCTGAGCTTGCTGGAGAACTCTC
GACACTTTCTCAAAAGGTGCAGCCTTTCATATCTGAGGTATGAGAACGAA
CACCGTTTTCATCTTAAGAAATGCATTTTATTCCTAAGTTGTAAGATTAC
CTTTAATACCTTTAATTCTCATGACCCAAGTTTAAGCCTCAATCTGATAA
ATTGAAGTCTAATTTTTTAATTCTACACTCATGTGCAATTTTTTTTAAGA
AACGGCACAAATTTTTTATGGACATGTATGTGAGTTCAGTGAAGTGTTCA
TCAACAGGCAGGTTTGCGGTGGTTTCAAACCCAGACTGACAACTATTAGT
CTTCTGTAATTTTCCCAAATCCATGTAGTACCGTATTACCTTTGGTAAGA
CTAGAAACTACAAAATGTGTTATAACTTCCGTTTTGAAGATATGTACTGA
TATTGTGAAATCTTTATTCCCTTGGGAGTGATTTGTGCTCATTTTGGGAG
CTACCTTCTGTTATTTAGGGAATAGTTGGTACTGTGCTTAGTTCACCCAA
AGCACCATCTCACCAAATGCAATATACTTTTAGCATTTTAGAGGACATTG
ATGCCAATAAGAATTTGTATTGCAGTGCAACAGTTATGCTCCAATTTTCT
TTAGCATGTGATTAAATCTTTAATGACATCAGCTTGTTTGTTTGATGTAT
TACTTGTTCTCTCTTCCAGACCATACCATGCCTTTGTTCAGAACTTGCTC
AACTTCAAGGCACATATATTTTGCAAGGTTTGCACAATGTAATATATTTT
GTCATTGTTCTGGAAAATTATGTCTTCTTATCTAACATTCTTCTGGACAC
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ATCTTCTTTGTGTCTTCTGTTTCTGTATTTTCTTATTGGTCGTATACTCT
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GCTGCTATCATTTAGATTTAATCGGTATGTGTTAGTGAAACTGGTTGTGT
TGCACCTTGCTGGGTTTTTTCAATTCATTCAGAAGGCGATCTTACCGGTC
AATGAAATGCCAATGTGTTTGCTACTGTGCACCGATACATGCCAGACACC
TCCAGTAGCTTCCTTTTTACAGCCAGCAGAAGCAGTAACGTTTACATGTT
TGTTGAAGTTTGGTCTTCAGCAGGCAACTGTTTTTATCTTCATACGATCG
TTTGTCAGCCGGACTTCTATTAGTATATTTTATACCTTCTCGCACTTTCT
TCTGATCATCCTGGCATTTTCTTTATTTTGCAGTTCATTAACCACTTGGT
TAATCAGCTTGCTAGACACCAATTTCTGAAGATTGCTTGCCAGCTTGAAA
GAAAGCACATAGCCAGTGCTCACTCATTGCTTAGAGTCATAGAATCTGAG
TTACAGAGCTACCTTTCGGCAGTCAACGCCCGTCTGGTAAGTAATCTCTG
ATGTCACAGACTTCTTCTTTGTCCTAACTTCTTTAGTATTTATTCATGTT
TCATACTACTTTCATTCTGTATTTACTTCATAGAGATTCTTGATTTTTTT
TTGTGTTTACTTCATCTGTAGGGTCATTACAGTTCATTAATTCAAGCTGC
ATCTGAGGTACATGAACAAGGAGCAATTGATGACCGTGACAGTTTCCTCC
ATGCAGTGCGAGATCTACTATGTATTCTCTCAAGTAAGCATGTACCACTG
CAGTTAATTATCAGTTTGAATTTATTTTTATTCTCCTATTCTTCACATTG
CCTACTCTTTTCTATAGATTCCCAAGCAGCAGTACCAACATACATGTCAG
CACATGCTTTAGTTCAGCAGATATCGGCACTTCAATCTGACTTGCTTTCT
CTTCAGTCTGAACTTGAAAATACTCTTCCAGCTGACAGGAAAAGATGTAT
CAATGAGCTGTAAGTAATAACAAGACACTGCCTTAATTCATGTCTTGAAT
ATGATTGCTTGTAGTGCTTCTTCTGGTATGAACAGTCACATTCATAGTTT
GGTTTATAGTAAACAATAAGGGTGACCTCCAAAAGATCCAGCAAACCACC
GGATTAGATGCCATCTTTCATGCAGCCAAGCTCTGGATGGTAGAGCTAAG
CAGGCAATGTGTGCTGTGGTGCTTGGTGTGCCGGCTTGACTTATTTTATA
CATATGGAATTGCTGCCTGATCTACTACCCATACAGACAATTAAGATTGT
GATATGCAAAGATAGTATCGATTCAACTAGCCATGCTCAATTTTTTATCT
TTCCTGCAGGCCTTGTAGAAAAAACCTTGTTGACCCAGTTATTCAATCTG
TTGTATACTGCATATTCACTTTTTAGTCTGCCAGTACGGTATCCAATAGT
CATCTCACACGTCTCTGATTCTGCAGATGCACTCTGATTCAAACAGTTGA
ACAGCTTCTATTTGCAACGTCAACTACTGCAGAACCAGTATTGACACCTT
GGGTATGCCCTTTGAGCCATCAGATTATGTCATTTCTTGTGTTTCCTGTA
TTTCATTACATCTTTGTTCTTGTTGCAGCCACTGATGCGCGCGCTTGATG
ATATGGAAAATGCCAATGCTCAAGTTGAAGTTGCTGTTGAAGAAGTAACC
AAGGCTCGTACACAAAAGATAAAGGTAGTGTACGTGTTAGCTGTTACTCC
CTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAATGTATCTA
GACTTCTTTTGGTGTGTAGATTCACTCCAAACCTTAGTGAACCTACATAC
TAAAAGAAGTCTAGATACATTTGATTCACAGAGCCAAAACATCTTATATT
TTGAAACAGAGGGAGTACTACACTATCATCCTTGAGGTTGTTTCTTTATG
GAATATTGGAATCAATATGCACGTGATTTTCCTGCATAGATCTGAAACTT
TGAATTATAGAGTGGTAGTCTTTGTCTCTCTTCTGTCTCCATGTTTTCCT
GTAGGATTCATGTTTACAAACACATTTGTGTTACTTCTTGTGTTGACTTG
GTTAACATTATTTGCAAGCGAAGAACTTAAAGACACTAGTAAAGAGAGTT
CTGGATAATAGTAGTATTTGTCTCTCATCTCCTTGTCCCCTTAGAATTCA
TGTTTCACGAATGCGTTTGCAGATCTTTGAAAATCGTGCTCACGAGGTGG
GGAGGGAAAGACAGGTGTTTGTTGATTTCTTCAGCAACCACGAGCGTCTC
AAGAATCAAGTCAGAGAGCTGACCTCCCGCGTGAAAGCTCTCCAGGAATA
GGGTTTTTCTAGGCCGGTAAGCATTACACTCGACCTCTGTAACCCCTACC
TGATCGCATCATGTCTCACAACTGAACTTTTGGTTCTAGCCTTCTCGTGC
CAGGTCTCTCGAGAATGGAAAGCGACTGCCAAGGCTCATGGCTCCTGTCT
GTGACAACGTTGTTTCTTGCAGAACTCCAACAGAAAGTTGGGGCGTGTGT
GCGATGCATGTATATTTGGTGTGGTGGTTGTTGTATTTATGCAATGTTGT
AAAATATGTTAGAAATCACGAGCAGGCTTGAACTAGGTTCTGGTGGTGTG
TAAAAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.