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GrainGenes Sequence Report: AA017300

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Sequence
AA017300
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA017300
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTGATGTTAATGCTAACAAGGACAGTACAGCGGAAGAAAATTTACAACC
TTCATGTGATACTCATAATGGTGATGAACAAGATGAGTCTCTATTATCTA
TCTATGATCCTAGAACATGGGATAATCTTGACAATTCCAAAAGGGATATT
TTAATTGAAAAGGGAGCTATGAGAGAACTTGGTTTGGAGTTCCCCAAGGG
TGCCGGTGGAAGACATTTTTCTTATGCTTACTACTCCAGAAAGTTAGCTA
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CCTTTTGTAAGGCCATTTACAACTGCCTTACGACTTAGAGCATCCGCTAC
TACATTTGCTTTACCGGGATGGTATTGCAAACTTAAGTCGTAATCTTTGA
TAAGTTCTAGCCATCTTCTTTGTCTCATGTTGATTTCCTTCTGGGTGAAG
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AGAAGCATCACAGTAAACTTGGAAATCCTTTTCCAAATCTGGCAGACATA
GAACTGGTGCTGTTACAAGTCTCTTCTTCAATTCTTGAAAACTGATTTCG
CAACCTTCAGTCCAAGCAAACTTCTTGTCCTTCTTTAGTAATTCTGTCAT
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TCTGTCACAGCTGAAACCTTAGCAGGATCAACTGCCACACCATCCTTTGT
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GTATACCCATACAATCCATATCTTGTGGTGAATGCTGTTTTTGGTATGTC
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CCCAGGATGAAGAACTTGGTTGGATAAACCCTTTCTGTAATTGCTCTCCT
AGCTGTTTCTTGAGTTCTTTCAATTCATTAACAGACATTTTGTACGGTCT
CTTAGCTATTGGTCCAGATCCTGGCACCAAATCTATCAGAAATTCCACAT
CTCTATCTGGAGGCATTCCTGGTAACTCTTCCGGAAACACATCCGGATAC
TCACATACTATTGGTACACTGTCCATGCTAACCCCCTTAAGAGAATTTAG
CTTACTTCCCTTGGATTCAAAGTTTGACTTAAATTTTACTCTTTTTCCTT
CGGGAGTTGTGAGTGTAACTGTACGATTGGCACAATCTAATACTCCTTCA
TACTTAGCCATCCAGTCCATTCCCAAAATTACGTCTAATCCTTGGGAATC
TAGGATTATCAGGCTTACTGGAAATTTATGCTTTCCAAACTCTATGGTGA
GATCCCGGCATCCAAGGCTTACTATCATGTTTCCCCCCGGAGAACTAACT
TTTATTGGACACCCAATGTTTTCTGATGCAAACCCATTTCTATCAACAAA
TGCCTTTGATACGAATGAATGAGATGCACCGGTATCAAAGAGTACAAATG
CTAAAACTGAATTGAGTCTGAACTTACCAGCCACGGCATCAGGTTCCTCA
TAGACCTCTTCCACATTGATGTGGTTAACCTGTCCTTTCTGGAAAGGATT
TGGCTTGTTAGGTCCTTCCACCTTCTTTTCGGGGCACTCATTTGCATAAT
GTCCCATCTTTTTGCATTTGAAGCATTCAACCTGACTGATGTCCTTTTTA
GGAGGTTGGCCTCCATTTCCACTTCCATTTCCACCATAGTGGCTCTTATG
TCCACCCTTGTGGTTCTTGTACTTGTCCTTGTCATGACTGTGGTGATGTT
TGTTGTCATGACGGCTGTGGTTGTGCCTGCTGAATTTCCCATTTTTATGG
GATCCTGAACTGCCACTGTCATCATAGTGAGATCGTTTGTGAAACGATCC
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TTTTACTTTCCAAAATAGCAGCCTTGTCACACAAAGACTGATAAGTTGGA
ACATATGCTACAGATAGCTGTAGGTTCAGCTCATCATTCAACCCTTCCAA
GAATTTTTCCTTTCTCTTGGCATCTGTATCAACCTCATCCGGTGCGTAGC
GCGCCAGATTGTTAAACTCTTCTATGTATTCCGCCACGCTGCGGTGGCGC
TGTTTCAGGTTGTGAAACTCCTTCTTTTTCAGACTCATCATTCCTGATGA
GATATGAGCGGTGCGAAAACCATCTTCAAAGATAGCCCAAGTCACCTCAT
CAATAGGAGTGGTGATTTGGAAGTTGTCCCACCATGTGGCGGCTGGTCCT
TCCAACAGATGTACTGCAAACCTGACCTTTTCAGCATCCGTGCAGCCCAC
GGTCACTAAGTCTTTGTTCACAGAACGTAACCAGTCATTGGCTACCATGG
GATCAGTTGTTCCCGAAAACTTTGCTGGCCTTAGACGCAGAAATCTGGTG
AGCATATCAAAACCCGGAGGGTTGTTGTTGGTGTTGTTATTGTTGTTGTT
GTTGTTGTTGGGGTCGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTCTGGTTTTGGA
TAAACGTTGTCATCATTTGCATAAGTTGGGTTTGCGCATTCATCATTTGT
TGCATTTCCGGGGTGATGTTGTTGGGGTTGGGGTTTGCGCGACGGGGAGG
CATCTGTGGTTTGTTCAAATAGATAAGAATGAGATACCCATAGATGTTTT
ATGCACAATACAACATGAGCAAACACATAACAAGCAACATAAGAATAAAA
GTTCAACAACCACATAACAAGCTCATGAAGTGATACACACAAGTGGCAAG
CCATCCACATGTCGGATGGTCCAATAACAAGTTCACAAAACAAGTATGAA
TAAAAGATAAACGAGTAGTCAAGTCTACTCATCAATAACAATCTCCTCCT
CGACGAAGGTAAGACCTGCGTTCTCCATCGCGGTCTTGTTCTCCTCAATC
GTAGTGGTCAAGGAATCGACCTTGGCCTTGAGAGCCCACTTCTGGGAGCG
AAGTCTCTCAATAACCATCTGCTGCTGCTCAAGTTCGAAGTCCTTGGACT
TCAGTTCCTCGGTCATGTCCCGGATCCTCTTGTTCCTATCCTGGACGCGT
TTCTCTTGACTCTTGAACTTGCGGTCCTGAGCCTCGAACTTTGTCTCCAT
TTCCTTGATCATCTCATCCTGCTGCGCAAAAAGCTTGTCCTTCTCGCGAA
GCTGCACCTGAAGCTCGTCATTACCTAGCATGACGTTCGTCCTGTCCGTA
TCTACGTGCCTGAGAAGAGTCTCTAAGTCCTGAAGATAAAGACGTATCGG
CTCCGCAGTGCTCCTCGAGTCGTCCTCAAAATCGATGGACTCTCCGTCAA
CATCACGTCTTCCGAAGACGTGAAAGTGAGTACCTCTAACCTGTCGGGAG
TGACGGCCTAATAGTCGTCCTATCAGGTCCTGCATGACTACCTCCATGCC
TCTCTCCCTGTCATCGTGCATCAACTTGAAGACGATGGTCTCTGTGGTAG
GCTCGGTCTGGCGTCCTGGCTGGGTCACCTTGAAGCCCCAGAGGTCCTTC
CTCTCGAACTTGGTGAGTGGATACACCGTAATGGTAGGAAGAGGGAGGTC
AAGCAGAGTGGTAAGCTCAATGATACGTGAACCAAAACGAGTAACTCGAA
ACTCCTCAACAGTGCTGATGGCAATAGGCATCTATTTATAAGAATGAAAA
AGTTAGAATAACACAAATCAAAGTAAATTCGAGACTAACATTCATACATA
TCCATGGTATACAATCATCACGCAAATCATGCATACATAAGTCTATTACA
TTAATCAAAGTCCATACTTATTTAAAATATCTCTTGAAAATAAGGTGATA
AGTGGTGGTCCAACTAACGAAGTGTCCTTACAATCCAATCTCACGGGATC
TATTATTAAACACAATGTTCCTAGAGGCAATCCACCAATCTTGCTCTCTT
GACTCAATCACTAAGTCAATAACATCTCCCCTTATTTCTTGGTTGTTGTC
TTCCAATTCTTGAGTAAGTTCCTTCTCTTTCTCTAAGTCTTTTTGGAGGT
TGAGTATTCTGCATTTAACTCTAGCACTTAGCTCCTTGATAGTCCTCCAA
GCTGCATCCCTGGCTGACTCAAAGAATGTGGTGTGCATTGTTGTGTTGGT
GTACATGCAGAATCCTTTTTCTTTGTGGTTGTCTTCCTTGTTTTTGTACA
AGTGAAGTTGCACCCACCAATACTCCACTCCTTCATCCATCACTGGAAAG
CCCTTGTACACGGCTTCACCATGTGCATCCATTGCCTCCATGAGATCCTT
GAGAATGTTGGGAAATTCAGTCTCACACTCTATGGTCATGGTCATGAGTG
GTCCTTTCTTCACGGCTTCGTTGATGGAGTTCATCTACAAAGGAGGTTGA
AAGAGATTAGAAAAGTTTTACGAGAAAAATAGACAAGTGTAGAAGTAGTT
GAAAAACTTTTTCCTTAGTGGTTTTCCAATCCTAGGGTCATAATCCTACA
GGCAACACAGTGCTCTGATACCATCTGTTAGACCCCTCCTTTATAGAGGA
AAGGATCCCTGTGATTGCAATGCTAGTCCCTGGATCAATGCTAGCATCCA
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CAGAGATAAAATATAGTCTTTTACAACTCATGGCCATAGGCCAAATACAG
GAGTTTTAAGGAATAAGTAAATAAACATAAGTCTTCATCTTCATGTGCCA
CAGGCAAGCATGTTGAGTGTAGACTCATGACTCCTAATCATCATCGGAGT
AACCTGCAACATCACAAGTTACAGCCATGGAGGGTCAATACTTTGGAATA
GTATTGGCAAGTGATACCTTAGTATATTTTAAGTGGACTATATAACTACA
TGCATTTTGGCTAAGTGTAGCTTGGCTTGCTTTTGCTTGAAAATAGATTT
TTCCTATTTGTTGAAACTGCTAAGTTTTTTCTTTGTCAAAATCATTCCCA
AGAAACCACCAATAGACATTGGGGTCCTTCACCCTTGTTCACCCACAAAT
TTTTATTGTAGAAGTTGGAGTGATGAGATTCTTGTAGCTTCCATGTCTTG
ACGCTCAAAGTGTCCATTTCCTTGGACAAGGCTAAGTACTTAGTTTTTCC
ATCTGTAGAGGTTGTGCACTTTCCCCACCAGACTTGGTTTCCCAAGACAG
GACCCTTCAGAAGCTTTTCCTTAGTCAAAATGGACGCGCTCCAACCTATC
AACCCAACTACCACCATCTGTCCAAAATGACCAAGTTCTAGCAACCTATA
TGATCATGGCAGAGCCCATATTGCCAAGTGGTTGCACTGTAAGCTTTCTC
AACACTTGGCCTCCAAATCCCTTTGTGCCTGGGTGGCATTCCACAAGTGA
GATACACAACCCAAGTCCATGGCCTTGTGTAACCACTCAACATAACCCAA
TCTTTCCATTCCACCCAGGAGTTCATTTGTCTTAGTTGTTTTATTAAGAA
AAATATAAGTCTCTTGACTTAGTATATTTTTGTCTCATAATATATAGTTG
TTCACCACCCTTGTTTGCTATGAGCTAGGCTAGGCAAAATATGGTAACCT
ATCTTAGGAACATTTCCCTAACAATTCTACTATTTCACTCTACTTAGGAT
TTCCCAATTTAGCACTTAGCAAAATATCATGCAACACTTTAGCAAAATAA
CTAATGCTAACATAAAACTTGGGATAGGAATATTCATGAAAATATCACTT
GCCTTGGTAGTGTGGGGAGTAGCACTCTTCACAATCACAATCACAATCAA
AATCTACACAAGAAATCAAAACATACAATTACACACATTTCAATATAACC
AAAATAATATGAATGCATGCATGCAAGAATTTACCATGTGTTAAATTTTG
AAAAATTCTACCAAGTGTGTGTTCATGACTACTGAAGCATAACATGTCAC
AAGTTTGTCCAATAAACCTATTTGTCCATAACAAAATTTTATAAAGATAT
TTTTATATCTAAAATAGCCCTAAACTTGTTCCACAAATAAAACATTTTTA
ACTGTTACTATATGCTAAACAAAAGGTATATTCTGATAGGCCTTGTCTTA
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TTAATCTAAACCTTGCCACGCGTCGCGTTTCTACTGGCGCGTACCGGTTC
GCACCGGATCACCCTTCTAAGCCGTTGGATCTAACTAACGTTGCGCGGCT
CAGATCTGTCCATACCCCTTCGATAAGTGAAGTGTTTCTACGCGTAGGAT
CCAGATCTAACGGCTAAGATTCTTCTAACCAAAAACGAGCGGCGCTGCCG
GCGGTGACAGGCGGCGGCGCGTCAGTCAGTGGCGGTGCCGGCGTTCTAGG
TCGCCCGGAGAAGGAAGGAGGTGCTTACCAGAACCGTAGAAGGCTGCTGA
TGCTCAAGGTGGCAATGGCTTGGGAAGGGGCGTACGGGTTCGTCGGAGAT
TTCTCGCCGGAGTTCGCGAACGCGTCTGCCACGGTCAGTTGTCGACGTTG
GCGAGGTTCCTCGTCGCGCTAAGTCAAAACAGGGGTACTGTCAGATGCGC
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GTCGTCGACGTTGCCAACGCTAGGGGTCATGCGAAAGCAAACGGCGAGTG
TCAGAAGATGCACAGGGATTCTCTGAACAAGATAGCGTGAACGCGAGACT
GGGGGAAACTCGAGACTCACCAGAATTCGCCGGCGCAGTCGTCGGAGACG
GCGGAGTTGCAGAGAGCAATGCGCGCAGCCTGGGGGCGTTCAGTGCTTGG
GGTTTTGGGGAAAAGAGAGAGGGGACAGAGGGGTTTCTTATAGCCTGGTC
ACGAGCGAGAATCACTCTGCCAATAACTCGAATTGATGCCACGAATCAAG
ACCAGAAACGCCCGCGTTGATTTGGGGATGAATGAGTCGTGCGGGTGGAG
ACGATGCTGGCGTGGGGTTGGCCCGCTTGTCAGTGATACGCGCAGGATTT
TGGTGGGGTCTGGCTGTCAGCGTCTGTTTGCTTGCGCTCGCGCGTGTGAG
GAGAAAAAGAAGTCCCCGGGTGGGCTTACTGGGCTAGTTTGGCTGCTGGG
CCAGATACTGGCCGCGTGGCCTTTTTCTTTTGAAGCACTCTTTTCTTTTT
CTAAATTCATTTTCTGGTATGAATTTCAATATGAATTCAAATCCTTTTGA
ACTCAAACTGCCTTGGGACTTTTGCAGGGTTTTTGTGGATTCAAAACAGT
CACAAAACTAGATGGTTACATTGCAAAGCTTGGTCCAGCTTGGTTTTAAT
AATAATTAGGGATTTGTTCCTGTTTGCAAACATTTGAAATGGATTTTAGA
ATTTACTTCTAAATTTGAAATCTTTGGGGTTTAAAAATTTCTCCTAATCT
TTCCATCAATGAAGGCAAGCATTGAAGTATTTAAACATTCAAATTTCAAC
AGGATGATGTTCAATTGGGACAATTTGCCCACATGAAATCATAACTCACA
TTCCATTTCTAAATGATTTTTGAGAAAAACCCTAAATGAATGAATGATGC
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CTTTCGAGGATCAAGTGAGAAGTTGTATGAAGAAAATAATGGTAATTTTC
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ACCCAGATGTGAGCCATCAAGAATAAATGACGCTAATTGTGTGTTGTGTA
AATATGTCAAGTAACATTCCGAGAGTGGAGGAGTTTTCCCTAGAATTCTT
AAAGGTTGATGACACATCGGGATTGGGGCTTTTTAATGTATTATTGGATA
CATTGGATTCTCTTGATCTTAATATCGATAATGTGAGAGGGCAAGGTTAT
CACAATGGTTCTAACATGAAGGGCAAAGTTCAAGGCATTCAAAATTGTTT
GCTTCTGGCAAACCAGAAAGCATTATATATGCGATGTGCATGCCATAGTC
CGAATCTCACTCTTTGTGACATGGAAAAATCTTGCGAACAAGCTATTTCA
TTCTTTGGTATTATCCAATGTATATATGCATTGTTTGCACGTTCTCTAAA
AGGTGGAAGATTTTGCTTGATAATGTTCCAAATCTGACTCTCAAACCTTT
GTCTAATACTCGTTGGGAGAGTCGAATAAAGAGTGTGCAACCTATAAGGT
TCCAAACTGCCCAAGTAAGATTAGCTTTTAAGGAAGTAGAGAGGCTTCTA
CTGATGATCCAGCTGCAGTAAGTGATGCTCAATCTTTGTTCAATGCACTT
GGAAAGTTTGAGACTTTAGTTGGTATGGTTATTTTGAATGAGATTCTATT
TTCTGTAAATATGGTGAGCAGAAAATTACAGGAAAAACTCATGTGCATCG
ATGCTACTCTTAAGCACATTGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.