Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA036442

[Submit comment/correction]

Sequence	AA036442
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA036442
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCACAATCAGTCAAGCAACACACGCCTTCCTCCCCCTCGCCTCCCTTCCT CCGCCCTCCTACCCGCACTCCGCACACCAGAGGAAAAGCCCACCCACGAC CGCGCTCGCCGGCGACGAGCAGCCGCTGGCCGCTCGCCGGAGAGACGAGT CTCCTTGCTGCGTCGTGCTGCGCGCTCTTGCGTGGGAGACGCGGCCGAAT TCCTCTGACCGGGTCTCATCGACGCTTGCCGTGTGCCACCGAGTAGATTT TAAAAGGCCCTTTCTCTTGTCCGGTATTGTTGTTTCGGAGGTTAATCTAA TCCAAGGCGACCGGAGGCTCGCTTCGGAAGAGACTCCGTCGCCGCCGTTC TCCCCTCGCCGAGCCAAGCGGTGGTGATGAGCTCACCCCAATCCTAGGGC TTCTGACGGCGTCGTCGAGTCAAGCTCTCCAGGGGTTCCGAGAAGGAGAT GGTGCCCAGTGGGCTCTTCGGGTGGGCTTCGCCGCACGTGCAGCCGCTCA CGCCGGTGTCCGAGGTCTCGGAGCCGCCGGAGTCGCCTTCGCCGTACGGG GATGGGCCGGCGGGGGATGCTGGCGTTGGGATGAGGGAGGGGGAAGGCGT CGGCGAGGAGGATGTGGAGGAGGACGAGGTCGAGCCCCCTCCCGCTGCGG TCTCCTTCTGGAGGCTCTTCGAGTTCGCGGACGGCCTCGACTGGGCGCTC ATGGCTGCTGGCGCGCTCGCCGCCGCCGCCCACGGCGCGGCACTCATCCT GTACCTCCACTACTTCGGGAGGACCTTGAATTTGCTCGACTCTGAACGGG TCGAGTCTGCTCTCCACGGCCGAAGCGAGGAGCTCCTCAACCATTTTATG GAGGTAAACTCATGCTTCGGATGCTTGGCTATTAATTGTAGGCATGGCAG GATCTGTAACGTGATATTTATTGCTTGAGCCGGATTAGGCATTCCTTAAT TTTGCTATTATTAGAACTGGGTAGGTTTTGTGTAGCTACTTGTGCTCTAT TATACTTCTGGTATATGCTCTACCTTGTGCATGCTATTCTCAGAACTTGT AAACCCTAAATCAAATTCTGCTTATGTTTTGGCGGCGCCATAAGGTTACC CTTGAAATATATTGATAATTAGCGCTGAAAGATTTAGCAGCTGACAATTG TTCCTTGCACTACAAAATTTTGTGTGTACGAATTGTATTTATGACTTAGG TTACATATCATCTAGGATCAGTGCATCTACAAATTATCGGATGCAAATTT TGCCATGATATGCACATTCTTAATTGGTGGGTTTGCGTGATGATGCGTTG CGTCTTCTTTGCTTCTAGTTGATCGTAATTGGCTGATTGCTCCTGGAGGG TAGTTCAGAGGTTGTGCAATTTTGGCTATGCTGTTAGGTATTGTATATCA GCGGGGGTGGGCATGGGTTTTGTGTTAAAGGTGTATCGTGAAATCTGGGT GTTCCAGTTTGTTGGTCAGAGTTAAATTCGTTGTGCCTTTTGTCTCGCAT ACTTGTATACAATTGCAGTATGGCAGGGCTTGAGGTTACCCATTGAGTTG ATCTATATTGTTTTGCCTTGTTGACAAGTTAGGGATGCACAAAATTGAAC GCAGCATGGTTGGTCATGCTAGGCCTCATATTGGTGGCTCTGTGGTAGTA CAATGGTATAAATGGAATATCTGGATCTTAATTATTAAGTTGGTGACTGA TAAATAGTGGGAGCATCTGAAGATGCGTCAATCATGACAACAGCAGACAA GATGACCCGAAGTTCCTCCCCGCTGGCTGTTGGGGATCCCTGAGGTTGAC ACAGGACCCAGGATTCCACGAGTCCTAGATTCCTAGTGGAGCGCCAGGGA CCACTGTTCAACTTTTAAATAGATGTTAACTGTCAGCAAGCAGCCATTCC ATCTTTAAGCACCTACTTGACTTAGACGGTTAGTAGCGTTGATATGTAAA GTGACCGAGTTTTACCTTCAACGCTATCTGGAACCTTTTGTACTTGTGTA CGTCCCCTATAATAGTTTCTTCAGTTAAGATTGTTAGTGGTGGATTGATG GGAATTTGGCCAACCACATATTTTATAGATGACCATGCTGGTATGATTGG TCGATGGGATAGAGTCCAATGGTAAAATTTTATCTCCGCGTCATGTTGGT TATGGTAACCCTTTAATTTGCTGGATATTTCAAAGTTTTTAGTTGTTTTG TTTTCCTGTCTCGTTCAGTTACAGTTTTTTTTAGTAAGTCAAACTAGTAA CACTCCCTTTTCTTCCAGAAGACTGCAAGTATATGTGCATGTCTTAACAC TTCTCTTCAATGCATTCTACTCCCTCCATTCCTAATATAAGATGAACTCC CAAAACGTCTTATATTCAGGAACAGAGGTAGTACTATCCAATGATCCAAT CCATAACTTGTTCTCTTATCATTACATCTATGTTTGTTTGCAGCATGCTC TGTATATCATCTACATAGCTGCAAGTATATGTGCATGTCTTAACATTTCT CTTCAATGCATTCTACTCCCTCCGTTCCTAATATAAGATGAACTCCCAAA ACGTCTAATATTCAGGAACAGAGGTAGTACTGTCCAATGATCCAATCCAT AACTTGTTCTCTTACAATCATCATTACATCTATGTTTGTTTGCAGCATGC TCTGTATATCATCTACATAGCTGCAACTATATGTGCATGTCTTAACACTT CTCTTCAATGCATTCTACTCCCTCCGTTCCTAATATAAGATGAACTCCCA AAACGTCTTATATTCAGGAACAGAGGTAGTACTGTCCAATGATCCAATCC ATAACTTGTTCTCTTACAATCATTACATCTATGTTTGTTTGCAGCATGCT CTGTATATCATCTACATAGCTGCTGGCGTTTTTGTTGCAGGATGGATAGG TAAGTTAAGATTTTTTTTTTTGAAGTGCGTTTTCCGTGTATGTAACTAAT ATTTTGATTCTCTAGAGGTGTCATGCTGGATTCTCACTGGGGAACGGCAG ACTGCTGTCATAAGGTCAAAATATGTCCAGGTCTTACTAAATCAAGACAT GAGCTTCTTTGATACATATGGAAACAATGGTGATATAGTTAGTCAAGTTC TGAGTGATGTGTTGCTCATTCAGTCAGCTATTAGTGAGAAAGTAAGTTCA GAGTTAATTATGCTTTAATTGCTCTATAAGTATGTTCTCAGCATGAACTT TGAGGATTTTGGTCTGTTCTAACAACTGAGTGCTTTTATAGGTAGGCAAC TACATACACAATATGGCCACATTTGCCGGAGGTCTCATTGTTGGCCTGAT CAATTGCTGGCAAATAGCACTTCTAACTCTTGCCACTGGACCCTTGATTG TTGCTGCTGGAGGAATATCTAACATATTTCTCCACAGATTGGCTGAAAAC ATTCAAGATGCATATGCCGAAGCGGCTAGTATTGCTGAACAGGTTTTCCC CTATGAATTCTGCCAATTCCATTTCTTGCGCGTTTATTTATTGATGACCA CCTTCTGAGATTGAGAACACTGTCGTGGAGCAGCTATTTCTCCACTCTTC GTATTGTGCATTGCATAATATTATTGTAGCATGTGCAAATAAAAATATAT CCAGATATGACTGGTGCCATATTTTATTTGACAAAAACATGTGGATGTGC AGGCCACCTCATATGTCAGGACGCTCTATGCTTTTACAAATGAAACTCTT GCAAAGTACTCCTATGCTACCTCACTTCAAGCAACCCTGAGATATGGAAT TTTGATAAGCCTTGTCCAAGGAATTGGCCTTGGATTTACATATGGATTGG CCATTTGTTCATGTGCTTTGCAACTCTGGGTTGGAAGACACCTGATTGCT CGTGGGAAAGCTGATGGTGGTGAAGTTGTGGTAGCTTTGTTCGCTGTAAT TCTGAGTGGACTGTAAGCAGCCTAATACATTCCCCTTATTTTCCCCATCA AGTATAAATGCAAGTGGGTCAATATTAGGGTACCCTTTACCCTCCCTCTT TAGTTAAAAAAAATGACTAACTTTTCCAAAATGATGATAGGAAAAATTAG TTCATTTTGTTGAACTAAAGAGGGAGGGTAAAGGGTACCCTAATATTGAC CCACTTGCATCTCTACCATCAAGTATTTTCTTTACCTAATTTATTTTGCG CGATTTGTAGTGGTCTGAACCAAGCAGCTACAAACTTCTATTCATTTGAG CAAGGGCGGATTGCTGCTTATAGACTATATGAGATGATAAGTCGTTCAAC TGCAAGCACCAATCTTGAAGGGACCACCATACCCCAAGTGCAGGGGAACA TCGAATTCAGGAACGTGTACTTCAGTTATCTCTCACGTCCTGAAATTCCG ATTTTAAGTGGTTTCTTCCTCAGCGTACCAGCTAGAAAAACGGTTGCACT TGTTGGTAGAAATGGCTCAGGGAAAAGCAGCATAATTCCTCTAATGGAGA GATTCTACGATCCAACGTTAGGTAACATCATTGAGAAGCATCTTTAATTT TCCTATCCAATTTCCCCATTTGCTAAGGCAGCTCTTTTATTGTTTTCAGG GGAAGTCCTTCTGGATGGGGAAAATATTAAGAATTTGAAAGTAGAATGGT TAAGAAGCCAAATTGGTCTGGTTACACAAGAACCTGCACTACTGAGTCTG AGCATTCGCGAAAACATTGCTTATGGAAGATTTGCTACTTTTGATCAAAT AGAAGAGGCAGCCAAGACAGCACATGCCCATGGGTTCATCAGTTCGCTTG AAAAGGGTTATGATACACAGGTAATGGCAGTGCCAAATGATTAGGCATGG ATGCTCCAGTACATTTTCTTACCATTCTGATTTTATTTACCTCCCTAGGT TGGTCGAGCTGGTATGTCATTGACTGATGAGCAGAAGATCAAAATCTCTA TAGCTCGTGCTGTGCTTTCGAGTCCATCGATTCTTTTGCTTGACGAAGTC ACAGGAGGACTTGATTTTGAAGCTGAAAAGGCTGTGCAAGATGCATTAGA TGTTCTCATGTTGGGAAGGTCGACCATTATAATAGCTAGGCGTCTTAGCC TCATTAAACATGCTGATTACATAGCTGTAATGGAGGAGGGACATCTTGTT GAAATGGGGACACATGATGAATTGCTAAACCTGGATGGCCTTTATGCTGA GCTTTTAAGATGTGAGGAAGCAACAAAACTTCCTAAGAGGTAAGCTATTT TCTCTGGACAATATTCTGATAAGAGTACAAGTTTATATTAGTTTAGATTT AGTACCACATTGCTTTCAGTCTAGACTAGCCAAGGGTTCTGAGTTTGAGA CCTAGCTGGTACGGTTTGAAGAAATAGAGGTGGGTCCAGTTCTAGTCCGT ATTGAGTCCAGGTAATTTTCCTGATAAAGCCTACACTTGACCGAGGGGGC GTAATTAATGGAATTGCTCACCTTTCCTCGATAGCTTAAGCTTTAGTGTG AATTGGTTAGTGCATGGAGCTCAGTTTGCTAACAAGAGTTCTAAGTGTAT CTAAATTTGATACTTATGTATTCTACATATACCTTGAGTGTTGAGAGCAT CCAGCTACTGCGCTGAAGAAATATCGGTTGACCTTATTGTTCTTACTTTT CTTTCAGCTGTGTTATTAGATTTGCGCGGTTTAATCGCAGCTACTGTATT TATACTCTCAATCTTTCTCAGGATGCCAACAAAGAACAGTAGGGAGCGCA AGTCACTCCAATTTGAGGATCCACCAGTCAGCCAGAACTTTCAAGAATCG TCCTCTCCTAAGATGGCGAAATCACCTTCTCTTCAAAGAACACATGGCAT GCTTCAGTTTTGGCGATCAGACACCAACAGAAACTCCCATGATTCACCAA AAGATCAAAGCCCACCATCAGAACAAACTATAGATAATGGAATACCTTTA GTGGCAACTGAAAGAACACCATCCATTAAGAGTCTGGACGGTTTTGAAAT GGAATTGCCTGATCTTCCAAAACTTGGCATCCATCCCATACAACGGCAAT CTTCGAAGAATTCAGGACCCGATTCACCTATATCTCCTCTTTTGACATCT GATCCAAAGAATGAGCGTTCACATTCACAAACTTTTAGTAGACCACAGAG TGAACGGGATGATACAAGTTCTGAACAGAGTGAATCAGATGAATTGCAAC ATCACAAACCACCGTCATTCTGGAGACTTGCAGCACTTAGTATTGCTGAA TGGCCTTATGCTCTCTTAGGCACAATTGGTGCTGCTATATTTGGCTCATT TAATCCACTGCTCGCTTACACAATAGCACTCACAGTGTCAGCATATTATC AAGTCGAAGATAGTGACATGCAGCATGAAGTGAACAGGTGGTGTTTATTC ATAGTAGGCATGGGTGTCATTACAGTGCTGGTCAACTGGTTGCAACATTT TTATTTTGGAATAATGGGGGAGAAGATGACAGAACGTATAAGAAGAATGA TGTTCTCTGGTATGTTATTCACACTTTTATACTACCTCCGTTCCATATTA TAAGACACCTCTGTTCCATATTATAAGACACCTCTGTTCCATATTATAAG ACATATTATGGAATGTCTTATAATATGAAACAGAGGAGTACATATGAGCT GCTTTCTTTTTTTGTAGTCTGCTGCAATTGTGAAGTTAGATTAGATCTTC TTGTGTTCCACACTAATTATGAAGTTCTTACACAGCAATGCTGCGCAATG AAGCTGGATGGTTTGACAAAGAGGAGAACAGTGCTGATACACTGTCCATG CGTCTGGCAAATGATGCAACATTTGTCCGCGCTGCATTTAGTAACCGCCT TTCCATATTCATACAAGACACTGCTGCAGTTTCTGTAGCTCTTCTTATTG GAATGCTGTTGGGATGGCGGGTGGCGCTTGTTGCACTTGCAACTTTACCT GTTCTTGTTGTCTCTGCCATTGCACAGGTAATACATTCTGAAGGTTTATT GGTCTATTATCACCTCGAAACACTGATTGCATATTTTGGCACATTAACAG AAGTTACGGTGTCTGTTGTTTTGCGCATTTTTGCATATGCTGAAAATTTG GATTTGAAAACCCTTAATATATATCACAAGTTTTTCCTAGGTTTATTTTT AGATTACCTCAGATCTTCAAAGGTTAACATACAAATTAATTCTAAGAAAG CAAACTCACTGGTCCTGGATGCTTCATAAATTATCACTTGAACACAAGTC TGTAGTATCTAGCACATGCCTCACTTTGCCCATACTCTTACTGTTAAATA CCAGCACACATATTAAACACTATAAATATTTTATATCCTGTTACAAATGG CCTTTCCTGACAATGATAAACATCATTTTTACTCTCTTTCTATAACCACA TGTTGATATTCCCTTGTAATAAAGTGTCCATGTAATACTGTTAATTTCAT CTGTTATACACATGCTTTAGGCGCCTAGGCGTCCAAAGTGCCTACCTAGG CATCGCTTAGGCATCAGAGCGCCCCCAAACCGCTCTAAGACACCTTGACG CCTTTAAAACCATGGTTATACACTGAATTTGCACATTGATCTTGAACTGC ATGCAAACCTTCATGCAGTTTGGTATTCAGTAACTTTATACTGGTTATTT TATGTTAGAACTGGTGTAAATAGGCATGCTCTAAATTCTTATGATAAACC GTGTTACAGAAATTATGGCTTGCTGGCTTCTCAAAAGGAATCCAGGAGAT GCATAGAAAGGCTTCATTAGTACTTGAAGATGCAGTCCGCAACATTTACA CAGTTGTAGCTTTTTGTGCTGGAGACAAGATAATGGAACTCTACAAATTA CATCTTGGTAAGATACTGAGGCAAAGTCTTGTACAAGGATTGGCTATAGG CTTCGGTTTTGGCTTCTCGCAGTTTCTTCTTTTTGCCTGCAACGCCCTTC TTCTATGGTACATTTCCACCTCAGTGGACAAGCAGCGCCTGACAATAGCC ACAGGGCTAAAACAGTACATTCTTTTCTCGTTTGCATCCTTTGCATTGGT GGAGCCCTTTGGACTCGCGCCGTACATACTTAAACGGCGGAAGTCTCTCA CTTCAGTGTTTGAAATTATTGACCGAGAGCCAAAGATTGATCCTGATGAC AACACTGGCCTGAAACCACCCAACGTCTATGGGAGCATTGAATTCAAGAA TGTTGATTTCTCCTATCCAGTTCGTCCAGAAGTCCTTGTGCTGAGCAATT TTAATCTTAAGGTAAGCGGTGGGCAAACAGTTGCAGTGGTAGGCGTTTCA GGGTCTGGAAAGAGCACTATCATTTCCTTAATTGAGAGATTTTATGACCC AATGTCTGGCCAAGTTCTGCTGGATGGCCGAGATCTGAAAGCATTCAACC TGAGATGGTTGCGAAGCCACATGGGCCTAATTCAGCAAGAGCCTGTCATC TTCTCGACAACAATAAGGGAGAACATTATCTATGCAAGGCACAACGCAAC TGAGGCTGAGATGAAGGAAGCTGCAAGGATAGCAAATGCTCACCATTTCA TTAGTAGCTTGCCACATGGCTATGACACTCACGTGGGGATGCGAGGGGTT GATCTCACACCTGGGCAGAAGCAACGGATTGCCATTGCTAGGGTGGTTTT GAAGAATGCGCCGATATTGCTATTGGACGAGGCCAGCTCCGCAATTGAAT CTGAATCGAGTAGAGTGGTTCAGGAAGCTCTTGACACATTGGTGATGGGG AACAAGACAACGATCCTCATCGCACACAGGGCAGCGATGATGAAGCACGT GGATAACATCGTTGTTCTGAATGGTGGTAGGATAGTTGAGCAGGGCACAC ATGACTCTCTGATGGACCTGAACGGTCTATATGTTAGACTGATGCAACCC CATTTTGGCAAGGGCCTTCGCCAACATCGGCTAATGTAATTAACATGGAG TTTGGTAGGTGTAAATTATTTTAGGACATGAGCAAGTTCCCTTGTCGCTC TCTGTCCAGACATGTAGCTCCAGAGCTGCTGGCGGCGGAACGGTGACATG GCCTTGACAAAATTTTCGACTGGAGATTGATTCAGATAACTAGGTGTGCT TAAACTGTAGGGAGCTTTATTCCTGGAAATAGATAGCAAGTTTGGAGTCC ATTGTAATTGTTGTAATATATGAGTTGCAAACATTCTTTGTGGGGCTTGT GCACTCGATTCCTTCCACCTCTGCAATGCACCGATTTGACTTGATCATTA ACGTGTTTGTAAAGAAATATTGTTTTCAGTACGAGTCAAATTCTTGGTGC CATTATTATGTCCGTTTGGCCGAGATTGTATGAATGTCCATCCGACAGAA TGTCGAGTTGATTATCCCACCGCAACAGGAAACAGTGACCTTCGTAGGAT CATAGTATAGATCAGGTATGTATCTATAGAATCTACTGCATGACCCATAC AAGTATGAATAGCTCGATGCATGAGCAACGCGGATTGGTTCGGTCCGCTT CCCTTCGGGCTCAGGCTGTAACACTACTATGTTCCTCCCTTTGTTTAGAC CAGTGGCTATTGCCTTCCACTGGCACGCAGGATCAGGCGTTCAAGTCCGA AATCTTGAAGGAGTCCGCGACGACTTTGAGCTTGTTACGCAGCCTGCTCC ACCGTCGCTCGTTCGCCGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.