Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA024045

[Submit comment/correction]

Sequence	AA024045
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA024045
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAAGTATGCTCAGCTGGATACTTCAGGTTGCGGCCTTCCTCTTAATGC TGGCTTTCTTTGACCTAAGTTTTTATGGTCATCTCAATTATTTTAGAACT GCATTCTGTATCGGCTTGTAGAGTTTTTGATTTCCACACTAATCTACAAA GGAAATAGGGCCATGGACGATTGAACTGAAAGTTACCAATGGGAGGTCAT CGTTCTTATCCATATTAATTGGGCCAGTTCCTAATTGTGTAGATGGTGGC TGATTTTGGAAGAAAACATATTGTGGCATATATACACGAAGAATATGATC TAAAATAAATCTTAGTATGGCATGATTTTTACTGAAATATGATAGAGGTT ATCAATCATATTTGTCTAACCTGTCCAGGGGCAAGATTAGTATAGTGTGA TTTTTCATGTGAATAAGAATTTCAGCAGCTAATTGGCATTTTCACATCTG CATGTATCCAGTTTGAGCTGTAGGCATGCCATTGTTAGATGTAGAACATC TATTGATAAAGTAAATGCCCTATGTCTTATGAAATTCAGCAAAATGGGAA AAGAAACTAGGATGCAGCATCAGAATTTCATAAGATTATCAACTTTTTAG CTCATAATACAATATTAACGAGATATCTAAACAGTACTAGGAAGGGTTAG CCTTGGAGCAAGGGTATACCATTTGGCGTCCAAATAGTACTTTACGTTCT ACTAGGCATCTTATGAAACTCCTTCTAATATCGACATGGTGATTTACATG CTTCATTTATAGAACTAATGGTGGAAGAAAAATACAGTTAACTCATCTTC TTGACGCATGTTATCTTTCCAACACCAGATATACAAGATACCATATACCT GATACATGGACAAAAATAGAGTCTTCCTGAATAGACCGAGACAATGTTGA GGACTTGGTATGGTAGCTCTCCATTTATTATTTTTTGCCAGTTTCATCAC TTTGGTTTTCAGTTTGTTGACTGCTTGCATTCTGTCGTTAATCCTTTGTT ATTTGTAGATGAAAACAGTTCAAAATAAACCTTAAACTTTTAGGTGTTAG CTAAATCAAACCCTGAAATCCAAATCCTAGAAATCGGTACTCTGAACTAT CAATTCCCGGTCTATTTTTAACATTACATCTATTTGGCACACCGGAAATT CGACGAACCAGACCGGGATAACTTGCTACTCTCATTGACAATACGGTCGC ACCTGTCATATCCATCCCCAATTCACCACCTGTCAGAGGGGTCTCGCTGG CCTTGTCGCTTGCCGACACAACTATGTATCATTCCCAGCACGTGATGTCC TGCACTGCTTGTGGATGCGGATGAGTGTGGATCAAGCACATCTGTCGGGG ACGGCCATGTCCAGCAGCGTCTGAAACATGCCTAAATTAGCTGGAACATG TATGATTACTACAGCAGGGGACGAGCATGGAGAGGATCTCGTCGATGAGG TGCCCATAGTTGACTGAATTATAGAATATCAGTAGAATGGATGTGTCTCA GAATATGCTGTTTTTACTGGTTGAGAGCCATCAGTCGATATATTTTAGTT GGTAGTGATGTTTGCATCCTCTCTATTTTTTTTCCGAATGAGTCAAAGAT AAAACAAATAGCTCAACTCTGGACATGTTCCTTTTTCCTATTATCAGGTG GATTCCATTTTTCATTGAAGCATTCAGTATGTTTGTTTACTCAATGTCTC TCCGAAATATAATCATACTTTCATTTCACTGTCCAAAGAAAGTTACAAAT TTATACTATCAAGTGCCAGGTCAGGAAAAAATAGTAATATTGTATGATGA TCTTAGCCTATTTTATGCTCACTTTTGTACCTGATCTTATGCTGAGTTCT ACATGTAGGGTGTACACAATTTGCAGTATCCATGGTTTGCATGTCTTGAA GGTGCTGCTAAGCTAACACAAAGAGTGCAGAAGAGCATTGTCTGCGAGGT TGCAAGAAATTGTGTTGCTGCTGTAATCCAAAGCCATAAGCCTGGCGTTA ATGGTTCTAATTTTGCTGGTCCATGTTGAGAAGGAGTCCATATCCTCAGG CTGGTGTAAATTATTGAAATGTCTTTCGTCTACAAGATTCTATTGCTAGC CGCTTACCCTTTAGTTCCCTGGAATTATCTACTAAATATGAACCGTTTCT CTTGATTGCAGATACGATGATGTATTGATACGAGTGAGCTACTTCTGCTA TACACCGTTGTTTTATTTTGTAGCCATTGTACCAGAGTGATCTCAAGATT TCATAGGTTCGAGATACCATCATCTTTTAGATCTCAATATTTCATAGGTT TGAGATACCATCATCTTTTTCCCTATAACTTCAGGGTGTTTGCCTATTAG CTAGCAGTTGGAACCTGCCATAGCAATCTGGAGTTATGTATAGTGCAAAG TTAAGCTTCTCGAGGACAATCACCAATACTACTACAAATTATTGACCATC CTTGTTATTTTAAGATTTTCGAGTTATTAACTACAATTGAATATATTGGT CCGTTGGAAGTGCACCAAAATCTTGTTAGCTACCTCTTCTTGGTAAAACC AAGAAAACCATTTGTGCAATAAATACATTATTGTTGTCGAATATATTGAA AAGTTATTTTTTTATTAGGATGAGAATTATAGTGCAAATGGGTCTATGAT CAACTTCGAAGCCATTAGTATCCAGGAATTACAAAGAAAACTAAGAGGGG GAGGAAATAGTCAGAGTAGCAATTTAGCAGAAAAATTGAGATGGAAGATG GATACAAGACAGCTTGCACATTAATGGATGGTTGGACCTATGTGGATGTA GTTATACCTGATAAAGGAGATGAAGGCTTGATAGGATATTGAAACTTAAA GGAGGGTCACAATGCCCCTAAAAAGAGGAGGGTCACAATGATGTAGAATT ACACCTTGCCTAGACGCGACGTTTTCGTGTTGTAGTTCTATCCAAACCTA TATATGAAAACTTAAATAATGCTCAGGTCCTATCTTGGAAGTTAATGTCC AAGGAAGTAGTGTTGTTGTTCCATCTATTCAGAATATGTACGATGATTCT TTAGTCAATGGTTTAGGTCACCAAACCTGATGCTACAAGGCCATTATGTG CTAAGTATACATTGTCGCCTAGGTAACGACAATTGGATAAGAAACTCGCA ATAGTCGGAGCAATGCAAAGAGTCTAAACTTACCGGTGGATGGATGGGAA GGAAAGAAAACTAGCTTTGTCTTCTTGCAATGTGGATGAAAAAAGTGGTC GTGAGATAGGAATAAAGTAAAACTGACAAGGATAAACATTTTAGGCCGTA GCAACGCACGGGCACTCAACTAGTTAGTCATAGCAGCGCTTGGTCCTTTT CTATTCGACTTAGTCCCTGTTGTTGTCGCCGGTGTCAACGATGCTTTGGA CCTAATCGAGCTAGGTAGTGTGGCCTAATGTGATTTTTGCCGGTTTTCAA AACTATACCGCTTGGGGTCTTTTTTCGTCCGATATATTTTTAACCGAACA CGTGTTGTATGGGGTATCGGCCAGTTTTCCTTACAAACTGGCTAGCTCTT TTCCTTTTTATGAAAAGACAGAGCTTCCATGGGTTTCTAAAAGAAAGTAT TGAAAAAATACGAGATTTGATGCATTCGGGAAAAAAGTGTTGATCGATTA GCTTGCTCCTTAAATTAAATTATAATTATAAGTAAATAAAGAAGTATAAA GAGTACGGCCATTTCTAGTAATGTCAACATATAAATATCCCCATGTAAAA AAAAACATATAAATATCCCCCTCACGGTGGAAAAGTGCTCCCGCAACGTC CCCGCCCTATTTTCCTTGCATTTTTTCAATAAAAAAAAGAGAAACCAATT CTACCAGCACCAAAGCAAGACGGGCACGGCATTCGTCTCTACTCTCTATA CAAGTTGCGACCCAGCTGGGTAGGCCACACGGACACACCCCTCACGCCGA GGGACCGAGGGCACCCCGCTCCTCTCCCCTCCTTAAACCCTCGTCGCCCT CCGATTTCCCTCGCCGCCGTTCAGATCTCCTCGTCTGCGACCGGCCGCCG GTTTGCTCTGCGTCACACCTTCGAGGTTCGTCAGCCCCGCCTCCTTCCTA CCTTGAGCGACTTCCGTGGCGCGTGTATCTCCTTCCTGGTTCGGATTCAT TTGGTTTCTGGGACTACTCAGCGAGTTTTTTATTCTCCCCGTGCGATTGT TCTGTTTCGGAGGCCCGAGATCCGCGTCGCGAGTGCGGTTGTTGGTTTTA AACTGTATTCCGAGATCCGCCTAGGTTTCGGTTCCTCGTCCCATTACTAC AGTTTAGTTCGAAGTCCGATGCCTTTTCACCGCGCTTGGTTCGTTGTTTT GGAGGCCAAAACCCGCGTTTATTACGGCCCCGTTGAAATTTCCGCCCCTC GACCGAAAATCCCGTCGTTGCTTGGTTGGTCGTTTTTGCTCGGCCTAATC CCGTCGTTTCCGCATTTCCCTCCGTAAAAAGGGGAACAGTCAGGAGGTTA CTCTAAAATCTGGCGGTCAGGGTTTACTGGGATAGGAGTTTACAAAGTAT CCAGGCGGTGCTAGGGTTTCTTCCAGCGCGGGATCTAGGGCTAGGGAATG GGGACCTATTTGGGTTACTTGATTTCAGGAATATGTGTGCTTATGAAGTT GATTTCAGGAAATTATATGTTATAGTTATTATGTATGTTGCCAGTGTTGA TTTGGATGGGGAAATCTGATCATAATGCAGCTGCTATCAATCTTAATGCT TGAGCTCTTTTCTGATTTTTTTATTTTGTAATAATCAAATTGTTGATTTA TACTTGGGCTGCTGTCTTATGTTGGCTGTGTTGGCAACTAATGGTGCTCC TTTTAGTAGTTTACACTTTATACTGCTAGTGTTTTGGGTCTTTTACTATT GTATTTCAAGCTATCGGAATTGAAACTGTAATCTGCTTATGTGGAAAGTT GTGTTGGGTTTGTTTGTCAAAGAGGGCGTTGTATAAATGCCACAACAGCT GAGCAGTACGTTTTTTGATCGAATGCAAGTTCGTTGTACTGGATGTATGT CCTGTGCCTAACATTATAGTTGCCCACTCTAAGATGTTGTATAAATGCCA CAGAGAAAATATTATGCATAAGTTGAATGCAAGGAGCACAACAGAGTAAC CTGCAGAGCATTGGGAAAACAATGTGTGTTTGCTAATGTGACTCTTTACG TGCTTTCTGCTCTTGTCTGATTATCAACAAGATTTTTCCTTAGATATGGA CTATACCACTGCATAATTTCTCTTGAATTATCTAATGATTCAGTTTTCAT TTGTTTGACCAATTTGTGTTCATGACTAGATAGAAGTCAGCTGCCATTTG GAATATAAGTCATTTCCTGTAGAATTCTACAAAAAAAATTGACGAAAGCA GTCGGCACTGCATTAGTTTATATAGAAGAAGAAAATTAGTTGTTTGTGAG GAGAAAATTACCCCAGGTCTTGCTGTACATGTTCTTATTGGCCAATACTA TGTGTTTCCAGTTAAGAAGAAAACATCCTCATGTGTTAAGGAAGGTATCG TTCTTTTGGTGATGTTCACAGTCCACACTTTTCTGTTGTGATTATAGAGG GATATATAATTATTTATGGCATAATAGTAACTTGGGAAATATCAAGTAGC TATGTCCATATATCACTATCTTGGGAAAGTACAGGTTGTTTTGTGCAGAG CTTTAGATACAACTGTAGTCTAGATTTGCCGTACACTCATTTCAGGCTTT GGTGTGATTGCTGGATATAGGTGTTTCGTTTTCGTTTCTCCATTGCATAC ACAACTGTCATATGCATCAAGTGAGTATGATAATTGATACAGTTAGTTGT CTCAAGTACCTTTCACATAAATTGTCTCTTTATAATCTATATATTTACTT CTACATGATGCAAATACAGTTTAGTTTTGTTGAACGTAAAAACTTTCCCA GATACACTTGGGAGAGAAGATCAGTTAAATATAGAACGAACAGCTGGGGA TTTATTTCCGAGTCGTATTGTAGACATTGTAAAAAAGGATTGTTAATATC AGTATGATGCGTGATTTAGATAAAATAGCGCATCCAATGTATGTTGGATT AGTCTCTTATATTGATTTTTTCATTCCAAGTCATCTCGTGTTGTTAAGCC TTTTGGCAGGTTCCCTCCTTTTGTTTGATTACATTTTTCTGCTAAGTAAA TGCAAAGCTAAATGATCATATTCTACTACCCAAGTTATTTTTGAACTTCT GATAGGAAAAAATGAAGACCACATACTTTACTCTTTGTGGTTCGAGTGCC ATGGTATTCCAGGAGACATGGTGCCTAGCCGCTATACTGCTGTAGAGACT CTAGAGAGCACAATAAATGTTGAGTAGTGAATCCTACTGACAACAGTGTT GCATGAAGAGAAAATAAATATTTTTTCCTGTTTAATGGGTCGGATAGATG TATTTGTTATATGATTAAGAGTAAATATCAGTTCCTGTATAGGTTCTGCC ACATCGCCACTTTTTCTGTTCCTCCAAACCTTCTATAAGAAGGCGTCTGC CTTCCTTGAATTGATGCTCTAATTCATGTCATTGTTTATTCAACATTTTA TAAATGCATTATTATGGTAATATTATAATTCTATTCTATATTAAGTTGCA ATACAAATTCTAAAAGCTTTTACTGCACCCACTATTTTATATTGATTTCA AACCTTACTTCTATAATTCAGTAAGTTGTGTTGGTCATTACATAAGTACG TTGAAGCATTAACCAATGTACGGCTGCACACTGCTAAAAACTTGCATCCT TTCATTGTTCGTTAATTTTAACAAAATGTTAGTCGTATAATATTTTCTTT CTTCATCTAAAACTGACTGCTAATGCAGAAAGCACATTAAGCATGTTATC ATTAAAAGTGGAAACATCTGATTCTTGGTAGCAAGAGAAGAGATATAATA TGAGTTCAATGGCTATTGTCATTTTGTATGAATAGTTTTCACAATCTGCG GTTCTGGAGTTTGAGATGCACTGTATACTATAATATACTTACTGGTATGG AACATCAAATACCTTGGACATTAGTGTGAGGGACATGACTTTGATTTGCA TCTGTATGTCCATGTAACTGTAATGAACAATAGGTTCTATTTCAATTCTT CGTCTCTAAAGTTGCTAAGGGTCGTCGAGTAAAGAAGTGTAGTACTAGAA GTTATTCTCTATCAATTCTATTGCTATAGCAAAGGTTTTTTCACCGTAGA AGCTAAACAATGCATGTTTTAAATAACTATGTGATATACTTTGCTTTTAA ATAACCGTAATAAGTAATTCTGTTGATTTACTTGGTTTGGCCGGCTGGGT TTCTCAGCCTGTCCATGTTATGTTCTTGGGGCTTTTGCATTTTAAGCTTT TCCTATACTAGTTTATTTACACTTTGCTATTTGAATTGAGAAACTGAAAA TTCCAGTAGGATTATCTGCTTATTTGGAAAGTCTTATTGGGTTCTTTGTT TGTCTAAGAGCACATATTATCATTAATATTATACAATCTGACTGGTTGTT GGTTTTCTAAGATAACATTTTTCTGATATATCATTAACCAACTCATTATA CCATATGTAGAAACTTTACCTAGGTGTTTGCTTTGAATACTCACATGTTA TTTACCTCAAGTTTAAATTTCCTTCTAGTACTAATGCATGTGCTTATTTA TTTTTTATTCCCAGGGAGGTCAAAATGGTTCCTTGGAAAAACACTACGCT GTGCCGCAAGGGTAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC TCTCTCTGATTCTGTATCTGTATATTTTTTCCAGATGCACTAGAGCTTGT GGACCTCGCTATAAATACAGGACATCTTGGCAGGCATAAACGAAATGCCA AAAGTATATCTCTGTGTTTGAGTTTACGATTCCACATTATTATTAGTTTA TGTTCCTAACTTTGATCACATGCAGAGCTTGCTGAGAGGCTGGGAAGAAA ACAGTTTTACAGGAATCATTTCAAGGCATCAAAAAGCGATGCACTAAGTG TTCTCAACTTTGCTGCCAAACATGGACATGTCTTATTGGCGACTCTACTA ATGGCTGAGCTGGATGTTAATCCAAACATAACTGAGTATGATGAATATGG TATGGTTCTTCGACCAAGTCTGATTTTTATTCTTCACTGTTGATAAATCC AGTTTGTTTTCTAATTAAGCTACTACTTTCTTGTAATTGCAGGAAGAATA ACATTGCACTATGCAGCAATGGGGGGGCATCTTGAATTGGTTACAGAGTT GATGATTACCTATCGTTCTGATGCTAATGCTCCTGATAAGTGTGGATCAA CGCCTCTGCACCTTGCTATCTTTTTCGGTAAAATTGTGAAACCTAGTTTT TTCATGGTAGTAACAAACACTTCTTAACTATCAGTGTGTACTATTTTCTG TTTTCTTGTCAGATCACCCAGATACAGCATGTGTGATGATCAGACTTGCA GCCAATCTTGATATTACAAGGCAAAATCACTTTGGAATGGCAATGCACTC TGCTGCATTCAATGGCAGCATATCCGTTGTCAAGTCCATCCATGAAAAGT ATCCTACTCAGGTACTTCTTCCTAAACTAATTTTCTATTAATTTAATATT CAGTTTCTTAACATGATGTCTTTTGCTAAATAGGTAAATGCTTTGATTTC TGGGTTTCTTACTCCATTCACCTGTGCAATATATGGTGCCGAGCCTGAGT GTGAAGATTTCCTGAAGAAGGTATTTCCTCTTTAATTTCATTCTTTGGTA CTCCCTCCGATCCATATTACTTGTCACTAAAATGGATGTATCTAGACATG TTTTAGTGCTAGATACATCCATTTCAGTGAAAATTAATATGGATGGGAGG GAGTACTAAAATTTCTTGTGCTATTTGGTAATTGGAATTGTATGAACATG TTTTATCTCATATTAAATATGATCAGTTATATCTTTGATAATTCTTGTAT ATTAGTGAACATGCGTATGTAGATTTTTTCCGACAGTTGTCTATATTGGT GTGACGACACATTCTGGGTTATCGTCATTTTCCATATGTTTTCTAGCTGG TGAAGCCTTTAACTTTGACATCATGTCAACTCATCCACTGTATGTCACAA GTTCTAATGCATGAACTTGTTAACTTGAATTACCTAATCATTATCCGAAG TGCTTTGGCAACGTTTATGCAGTAGTTGACATCTTTAATTATAATGTATG TGTACTTTTTCTTTGTAACTTTGAAGGTCACTTCTTTGAATGGAAAAGCA TTCTTATACAAGGTGGTGGCTTTTAAAACAGAGGAAAGTGATGCTGCTGA ATTAGTGAATTCTTTGATACAACTAGGAGCCGATGCGAATCTATGCGAAG AGGTCTCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCTCCCTCCCTCCCTC CCTCTCTCTGAACTCTGTTCTAGTTATATAACTGTGTAATGCAACATTCA TTTTATCATGATTTACGTACTTTTCGAAGATCCTGCCATAATCTGTGCAG CGAAGAAGGGCTGGCGTAATGTTGTATCTTTGCTCTTAGAGAGATCTAAT CGTATTTCTGGTATTAACTGGACTACTGATGGTGTTGTTGAGTATGTGAA CACTGATGCTTTTAAACAAATGGTACACCCTTTTGTGTCCAATTGTAATT ATATGCTTTATTATGGCCTGACTATTTTTATATTTAAGTATTTTCTTATT GTCTAGGACACTGTGAGGGTGAATAATCGAGTGAATCATTTGAAAGTAAA AATCCTGGAGGAGCTAAATGCTAAGAATTGTCTTACTGCTTCGATTATTT GTTTGGTAAGATAAGTTCTTTCAGGCTTGGAAGTTCACAATTGCTTTATT CTGTTTGACATTCTTTTGAGCTTATGTAGGCTCTGAAGCTCGATATGAAC CCTGTTGAATGGGACCACTGGAAGAATCTTTGTCAGTTCCTTACATGTAT GTTGTTCCAAGCTTCTCCTGTTAAATGTGATGCTGCAGACATCTATTCGC ATTTGAAGACCTTTTCAAAAGCAGGGGTAAGTGAACTATGGACTCAACAT AGTTATACGCTATTTTGTATTATCCATTCCCATATTCAGAACACACATTT ACCATGTTCGCAGAACGATCCAACAAATCTTGCTTGGGCTGTAATGGGAG CAAAGGCCTGTCTCGCTTTAAGACCAGATGATCCAAGATTCGTCGAGCTT TACAATGCTTTGGCTGAGAGAGCTGCTGGGTAGGTAGTAGTCATATTGAT GTCTAAACTCTAAACCTACATCTGTTTCTCTGTTTACAGTTTCCAATGCA CCCATATGTTTTCAGTGGCAACTTTTATGATCATTTGAGTAAATCTCAGT TTGTACAACCTAAAATTACTTGAGCTGTGAAAATTTTGATAAGCTAATAC CTCGCGCATTAGTTTAATGCTAAGTAATAGTAGGTGGCGCAATCTTTAAT ATATTGTACAGTAGCATTTTAAATTTAATGAGTACAACACATCTGCTTAG TGACACGTCACACAGACATTGAACTACAAAACTAATTAGCATTTTGTGAC ATTGGCAGGTCAAAATGTCAAATGGCACCATGTATAAGTTAACTAATGGG GTACCTAGCTTAATAGTACTGATCTGCTTCCACCCTTTTTGGGGGAACCG TTACTTACAGTGTTTTCTGGCTGTTGTTTTTGCAGAAACTGATAGCAGAG GAAACTGGAGAGGAGCTTCTAGGAGAAGCAGCTGTCATCTGGCTTAACAG TCCCAACATGCATAGATCTTCAGTCCTGTTTCATATTCAAATGCTGTAAT ATTGTGGACCGCAGCAAATTGCCAAATCACCTACAGTAACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.