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GrainGenes Sequence Report: AA023810

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Sequence
AA023810
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023810
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGATAATGTTCCATCGTCTGTCGAAGCTGGCCTTCGCGACGTCCGACCA
GGTTCGGCAGTGGACAATGGCGAGCTGGGAAATGCCGCTCAGTCTGGCGC
CCCTGCCGTTCCAGGGCAAGATGTAACTGGTGCAGTTTACCGCGTACGAT
AAAGGTTCGCTGATATTCAGGATCGACCCGCCCGGTGGCCATGGAGCCCT
GGCCCTGGCTGGCTCCCCGCCACCGCCGCCCAGGCTGATCGGCACCTGCC
GCCTGGAGAGACACTACGACGGTCGCCATCTGATGGAATGTGACTCGGAG
ATCGTTAGCCATACCGACGATTCTCAGTCGCACATTTTGATTTATAGACT
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TCTTCACTAGTAATCATGTACATGCACGCACGTCTGGACTAATACATATA
TCTAAACATATTACAAACACTAAAATTATATAACAAATAACTTTATAAAA
GTTAAAATGATATTGGTAAGTAAATATTTGTCTATCCAGTAATCATGTAC
ACGCAATGCACATGCCAACTAATGTAATTATATCATACATATTCAATAAA
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GAGATCATGAATCCGTTACTTGAAACTTAAAGCAACAACATTCATGTACA
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CTTCTCATACTTAATTCCCTCTATTCTAAAAAATTGATAGGGCGGAGAAT
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AAAAACAGTAATTTCTCGCATGTATCAAAACTGAAGTTTTGTTTTATATA
TTGCAGTATTGTGCTCGTTCTAAAATAACAGTTTCCAAACAACCTTTGGT
TATGGACACACAAACAATAGATCCTCCTCACAGCCACCTCAAAAACTTCA
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TTTGGTGTTTTTAAAAAATTTAATTTTTTGGTGGTCTATTGAAACTCTAA
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TTCATGCCCCAAATCTGGTGCTTTCTGATATTTTTAAAGTTTTTGGTGGT
CTTTTGAAACCCTAGCCCCAATTGTGATGGTTTTTTATAATTTTCTCATA
GAGAGCCAAAGATGCATTGGTTCAAGCAATATCACCTTTGGAGTGGCACT
TGGTCTGAATCGGTAGACGAACACGGTATTCATGGTGTTGGAAAGGGCCC
TCACAGCCTCGTCCACCATATCATTACCTGCTGTGCATTCGTGGTGTCTC
GTATGTAGTTTCTTTTGCTTTGGTGTTTTCTTTTGACGTACTTTTTTATA
TTCTCAAAAGGAAGAAAATAAGAATGAATGTTTTGTTTGGAAGGATAAGA
AAAAGTTTTGTCATTGGGTAAACTTTTTCACAATTAAAATCCTCTATTTT
CGTACGTACTCCCTCGTAGGTGATTTCCTAAACAGAAAAAGTACAATCCG
CAAAAGTCAGAAGCAGCTCCATGAGCTTGTTCTTGTGGTGGAGCTTGTTC
TTGTGGTAGTCATAGTTCCCTTATATTTATTGTGGTAGTCATAGTTCCCT
TATCTAGCGCACCGGTTTTGAATTAAGATTTGTCCAATTCCTTTATATTC
TCCATACTAACCAAGCTGATGTTTATCCACTTCTACATATGGAACTTTCT
TATATTCAATTTTAATTCAAGGATAATTATTGAAATTTGTCTTATTATAT
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AAAGAAACTTGTACTATATGATATTATTCTAGTTAATTCCACCAACTGAA
CTGAATGGTACCACACATATTGCCTAACTTTATGTCTAGATGCTCTTTGC
CAATGTGTTTTTCATTATATTATTTATTTATATTCATAGATTGTGTCTGC
AAAAATGTAGCATTCACAACCTAACTTTTATCAAAACTAACATGTGTATT
TTTTTTACCCAATATCTATGTGCATGCATTTTTTTGGTAATTAATATGAT
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TAGATCTCGCTTAGCATTTGTCCATTGTTTCACTACTAGTTTTGTAGTGT
ATCAGTTTTGTACTATGATTTAATTTTCCAATGCTTAACCCTAACAATAA
TAAAATCCATATGCTCTCGGTTCAGGTCTAATTTATCAATTCAGCTCACA
TAAAATGTGTTTGAAAGTGAAATGGAGTTCAAATAGTAGGTTTTGTATTA
GGTGGACTATCAATCAATGTTTAGGTGGAAAAAATTAATTTTAGAATTCA
TCTTATTGGCAACATCAATATTGGATTAAATCGTGTGCTCTATATATTGT
GTGGGAAATCTGAAGTTTTTCTATAATATATTAGAGAATATATAGCCCTT
CCCCTAAAAAGCTATAAAAGTTGAAAAAATGTTTTTAGGGAGAAACATTA
TCTAACCAATCCCCTAATTTTGAACTCCATAAAAATAGCTAAATGCCCTC
CAACATCCCCACTTATGTCTACCTCCCCATCCGGATTTTTTTGTGGGGAA
CTTTTCACCTCAACCCACTCGATGTCGTAACCCCAGCTCGCCTCCAGCCC
CTTCATCGCCTCCTCATTTATGGGAACCGTTTCAATATGAAATAGTTTTA
AACCGATATGCTTGTGGTGTGAATTAGGATGCATTCTCCGTGTGAATTGA
AAATTCCTAATGCATGTGTGGGTTTAATGCTCATATGTCTTCCATCCTTA
AATACTGCTTCGACCGAGAGAAAGACCACCGATATTCACACCTCCAACAG
AATTATCTGACCCAATCGCTAGACACCTAGTTCGTAGAGCCTTTTCTAGT
AAGCCTAATAAACCTAGATGGAGGGAGTAGTGGTAGTTTTGGTGATCTTT
TAAGTGAACGTAATTAAATTAGCGCCCTTTAATGTTGTACGTTGCTATTT
TGTTGAATTTGTATTTGCTTTGAATCTTATTAAATTTGTGAATTAGAAAT
ATTGTTGAAATTTGTGCGAAATATATTTCAAGGTTTTGAATTAATATGTT
AGGAAATTGTGTTTACATATTAGAGAAGATAAGAGAAATATGCCGAAAAA
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CGTCAAATTATTTGGAGTTAAGCAAGAGAGATGGTATATGGAGTTAAATT
TAAGAGGAAGGGAGATATGCTTTTAGTTATAAACAAACTCCTAATTCATT
CCACACTGTATGGACAAGAAGTTATTGCAGACTTGGCAGCTTACTTTTAC
TAGTTTCATTCCTACAGTAACACTTCCTTAGATACATGTCTTCCTTTCTT
ATCTTATTTGTTTGGTGAGATTTATGTAGTTGTGTTTGTAGTCACCTGTA
TGAAATATACATTTGTGTTTGTGTTTTTGTGTTATGTATGCTACTTCTCA
AGGATCATTGTTGTGCAAAGAAGGTACAAAAAATGCGTATACATCCTTAC
AAGTATGAAGTAGAGGGGCTGGTGAATGAATCCATATTTCACATTAGAGT
TTAAAACATTGTGATACTTTTTGTATGTGCTTATCCTAGATATGTGAACT
TATTTTATTTCATGAACTACATGAGACAATACATGGGCATAACTTGGGTT
TGGCCGGCCTCAGGCTGGTGCATTTATAGTTACTGCAAAATTACAAACAA
AAATAGTAAAAATAGCTTATTAGGAGCACATTCAAGATCATTGTAGACCC
AACCAATTACTAGTTCCCAACCCTGGATGAAGTGGAATTTAAAAAATTAG
TAATAATAATAATAATAAAATTATTGAGTCATTTAATTTACAGAAGAATA
CCCGAATCCAAGAAGTTAAAATAACAAATTCTTATTTACTCTAAATAAAA
AAATATCCACTTAGAATATCCAAACAGATTATATTTGTCGAGAAATGCAA
AAGGATATGGATATGGTCTTCATTGTCTATTTTGACCAATTCTATTATTC
CCCTGTGTACTCCTATAGGAGGTTTTAATACATGTGTCTTTAGCTTCTCT
TTTATCATCTTGTCCAAGAGAGGATGTATCTTTCTAAAATCCCAATCTCT
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AATCCAAAGTAGGAGACATTTGTTAAATGATAAAGAGACCCCCATGGAAA
ACATCCGTGCCTAAAAAACCCAAAGTTGAAAATCAGGCCCAAGCCAGGCC
CAGCCCAACCATCGGGCCTACAAATTAGGCCCGAGCCTGGCCCAAAGGCC
CAAAAATCCCATCCTGGCCAACCCCTATATAGTAGGTGGGGTTGGCCACG
CTGGGCTTCTCGTGATGTGGGCTAGGTCAACCCGTTCATATTCACCTACC
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GTGTGCGGATGTTTCTTGCTGGTATTTGTGGGGCGTGTGGGCAAAATTGA
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CTTGTTTGTAATAGGAGATGAGGTGAAGATGGTTTGTCATCAGGTACACC
CTATTAGGGCACCATCCATGAGGAAGGCAGAGGGTGAGAATGCTCGTGAT
GGGACGAATCCAATGGAGGAGTTGTGAACGTCTAACTACAATAGTGATTA
CACAAAGGAATTGTGGCATGCACCTCCATGAAGAGAGGATGGGGTGGTGA
GACATGTTGAAGATAATTTGTCAGCATGAAGATTGTAGGAGTCGTAGGTG
GTGCCATGATTGTTAAGATATTAGTTGGAGGGAGGCATTCATTGGGATTC
GTTGATTTGAATAGGGATTCGTCTGTGGTCGTTTGGTGTGGGAAAATGTA
AGCCGAAGTTTTTTGTATGTTGAATCAAATCATGCTGATTTTGGGCCTAA
TTCTAGGAGAGGCAAGATTGGTTGCGCCTTACGTTTTTATCTATGTGCAA
TGTGTATGGTGCTATGTACCTTAACTCTATTATATATTTTTTCTAGGGAT
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GACCACCAATTGTATGTTGCCCTCGAGTTCTTTCATGTGTCTATCATTTG
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AGAGAAGGTAACTTGTCCATTCATGCACCCATCTCATTTGAAATTTCCAT
GAACTTTTGTTCTTTTGTTAATAATTGTGTAAAATATTTCTTTCTACATG
TGACTTGCTTAGAGCTTGCAAACACAATCATCATGAACACTAAATGAGAT
AAAAGCTAATGTTTATGTGCTTACTATCTATTTCTTTTTAGCATTCAAAC
TTTCTACTCTGAGCATGCAACAACCAAAAAGTGGGATCAACTTATACATA
GTGCATTGTAACTATGAAGCAACATCATGACAGCCTAACATCGTGTATGG
CAATTTTGTTTATAAACGTATGGTAAACTTCTGTGTACCATCTGGTATAT
TTAAAATATACCATACAAGTAAAGATGTACAAAATATACCATACAAGTAA
ACATGTTAAATATACCGTACAAGTATATTTAAAATGTTCACTTGTTAATT
TATTCTTTTTTACGTTAAGGGAGATATCATTTGCTTAACCAGAGGGTTAC
AATTGTTCAGTACAGAGCGAGTAACTTGTTCAGGTACAAACCGGTGCCAA
ATGCCTACGGTTCCCTCCACTCGAGCTAATTTTTCCAGTTCATTGGCAGC
AATACTCCCTCCGACCTATATTAGTTGAATTAGATTTATCTAGAATTCTA
GATACGAATGTATCTAGTCAAGTTTTTGTGCTAGGTACATCCGATTTAGA
CAAATCGAGTCTCGGAGGGAGTATTAAAATCTCTCTTAACTAGAGACACA
GAAAAATAACAGTCTTCTCTCCTGCGGCGGTAGATCTATCTGTAGATGAC
GCACAGCCATGATAAGTCTTGGTGTCTAGCGTTCAGTGCTGCAACCACAC
CTGCACAATCAGACTCAACGACAGCAGGTTTGAGGTCAAGTTCAGAACAG
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GGAGCATAGCGGCCATTGAGCAAACCTTCAAAGTTCCTCACAATTCCACC
CATCGTAGCTTGACCAGATTCATGCCAAATGGAAGCATCAACGTTCAGTT
TAAGTATACCTTGTATTGGTGCAATTCAGCGAGCCTTGGGAGCGGACGGA
GTGCAGACCTGAGAAGCACATGGGTGTTTTGCAGTACCAACCACTGCATT
TTCTCCTTTGCTAGTGCATGGCAGTTCAAAGTATGCATATAATTCTGTAA
ATGAACCAACGAGGCCTCAATGGAACACAGTCCATCGTGGATTATATTAT
TTCGCAGGTGCCAGGCGCTGCAACAAGAAAAGTAGAATCAACGTGTGAGT
TTCAGGGAGTGAGTTCGACACAGCAACACAAGTAACCAATCAGGACCAGT
AAATCTGAAAGTGTCTTCATGGGGCAAACTCCATACCTCTCTCATTGTCT
CTAAGAGCTTTAGCCTTTGTACAAGAAACAGTGGCATGGAAGCAACTCTC
CTCTCCCGTACCACATATGGTGGTGCAGGTACTGTCCAGCTCCAAAGTTC
CTCTCCACTTATTTCTCCTTGTCGCTAGGTTGTCCCAGGCACGTCTCCAG
GCAAAGATGTGTATCTTATTTGGAACATTGCATCTCCATATCAGCTTCCA
AATATTTCTAGAGTCGTCAACGAGACACTCCATCCGCTATTAAGATGAGC
ATTTCTAGAAAGATCAAAGGAAAGCCTGTAGGCACTCCTAACAGAAAAAA
TCCCGGATTTCTCAAAATGACACCCAGTAAATCCTCTCCATGCTACATAG
TCTTCAAACAAAGGATATCATTAGCATCATGAGGCAGAAAGATTTCCCTA
GCCTTGCCCTCATTCCACTCCCTAGTTCCCAGCAGGAACAAATCCTTTAC
CCTTCTACATCTTGTGTGGTGTTGGAGATTTCTGACCTTCGTTGGCATCC
TGCAAGGAATCCAGTTACATCTTTGGAAGTCCACTTTAGACCCATTTCCC
ACTCTCCATATTATTCCTTTTTTTAAGGAGCTCTAAGCCATTATTGGTTA
CTTGCTAATTTATTCAGTTAGAAGAAAACCTAATTTGAGTCTCAACTAAT
GTTAAATATACCATACAAGTAAATTTAACATGTGTAAATTAACAAGTAAA
CATGTTAAATATACAAGAAAGTCTGATAGTTTTGGTCCCTCAATTCTATA
CGAAGTAATCATGATCGCCCTTGGTCTCTTTCTCAATTTAGATTATTTCA
TGAAGATGTGACTACGTACAGCCTCTGGCCTTCACTGACTGACGCGGAAC
ACCGACGCAACCTACCTATCTACACCAAATGGGCGGTCTCGCCATGACTG
AAGCTGAGAACAAATAGATAGTTTGCTGTCATGCTGGAGAACTCTTAGGA
GTCCTGTTTTCTGGGAAAACCTGACCCCTGTAACATTAGCTGGGACCTGG
ATGCTGTAATGAACGCTGGCGCCTTGTGCGCTGTTTCATTTCGATGAAAT
GGAACGGGGCTTTCTATATTAAAAATAAAATGTGACTGCATCTTTGCACA
CATGAAAACCCAGTTAGCACCGCAAAACAAAAATAAAATCAGGAAATATA
GGAATGGGCATAGAACACCAATATTATTTTGGTGAGCACTCAAAATGGCA
GCACATGCTAATCATCAAGCAAAGGCTTACGTCAACTATACTGCAAAAGC
TTCTGCTCATATTTGTTGTACCTTGTTACGGACTCAAAATTTTCTAAAAT
ACTTTACGTAGCAATTATCTTAGGCAAAAAGTATTTATTTCAGAATCTTC
ATTTTCTTTCCGGCTTTAGTGTTATGCTGACTGCTTCCCCATTTTATACA
GGAAACCTTGAATTTTGGTGACGCTGGCTGTGAGGTACTGCAGTACTACT
CGGTGAACCAGCAACTCGGGAAGAACGCGGTGATGCAGCCGGCCAAGAAA
ACGAGGCGCCGCTGCCCCGCGGTGGCAACCTCAGACGATGCCGCGGGTGA
GTATTCATCCTTATGGACGACGTCGCTGCCCGGAGACCTGCTTCTCCTGG
TAGCATGGCATGTCCTAGCAGGCGATTTCCTGGACTACATCCGCTTCCGC
GCCGTCTGCAGGCAGTGGCGCGACGGCACCATGTGCCCGCGCGGCCGTGG
CGTGGCTGACCCACGCTTCCACCCGCGCCGCTGGCTAATGTTTCCTGAGG
GCCACGGCCTCCACCCCGGCCACAACAAGCTCCGCGGCCACCTTCGCTTC
CTCAACCTCGACACAGGAATCTTCGTCCGTCTCAAGCTCCCACACTTCAG
AGACCACTGCATCCTCGACTCCGTGGATGGCCTACTCCTCCTCCAGCGCG
ACCACGACGCCGCTGTTTTCCTCCTTCACCCCTTCACCGGCGACCTCGCC
GAGCTCCCCCCGCTCTCCACTCTCCTCCCACAGCTGCAGAGCTACAGATC
GTCCTTCTGCGTCGACAACTGGTTCTTCATTTTGCTTGGCATGCTTGCCA
CTGTCTCTGGTGATGCCGATGCTGGAACCATCACCGTCATGATTCTGTTC
TATCGTGTGAAGGTGCTGGCCTTTGCTACCACCAAAGACAAGCAGTGGAC
CCTACCGAGTTGGGATGTCCCACCATATGCTGCACCCCTTGCGTTTCATT
ACAAGATATACATGGTGCAGTATCCGACGTACGATGGTTCACTGGTTTTC
CAGATCGACCCGCCCCCACAGGCCGGTTTACCACCACCGCCACCGAAGCT
GGTCGCCACATGCCCTGTGGAGGAACTCTACAACGGTTACCATCTGGTCG
AATGTGACTCAAAGATCCTGCTTGCTGGCTATACTGACAGTTCCCGCTCG
GCTGTTGTGATTTACAAACTTGAGGACATCATGTTGGAGAGGTTTGTCCC
TGTAACTAGCATCGGAGACCATGCCCTCTTCCTTTTAAATACGAGTCTGA
GTGTCTCCACCAAGGCTACGCCTACGGTCATGGCTGAAACCGTCGTCTTC
GAAGGGCCAAGCACAGAGCCCATGTACATGCAATACCACCTCGGGACTGG
CACTTGGTGTCCAGCAGTTGACGAAAGTGGCGCCCGTGGCTATGACCCAG
GTCCTCGTAGCCTCATCCAGCATATCATTACCTGTTGCATTCGCAGTGCA
TGGTATGTAGGTCTATGTCTCACCCTATTCTCATGTTAGAATTATTTTTC
AATTGCATCATCTTATTTACTGACCAAGCTAATATATTCTCATTGTCCCC
TTTAGGAATAAAGGGCTCATATGTTCTGTAAAGGAAGAGGATAAGGATGG
ATGGCTCATTTGGAAGGTCAAGAGGAAGTTTCGCCATTGGGTAATTGCTC
ACAATCAAACCTCTTGTTTTCGTAATCTCATTTGTGCCTCTGATCAACTC
CCAACTGACAGAAAACTCACCAGTCATCTTTCAGAAGCAGCTCCTTAGTT
TGTTCTTGTGGTACTTATAGTTATAGATCCCATTTTGGATATATCTAGTA
CACCAGTTCTGAACCAGGATTCGCCAATGACCTTTATATCCTCCTATAGA
CGATGCCATTTTGGATAATATCTAGCAGCCATTTATCTACTTCTTTATAA
GGAAATATATGTCTTTGATTTCTATTAGACTTAAGATAATTTTAGTTAGC
GGATGAAGATTTGTTGTGATGATGTTAGTTGTAAGCTGTAAACAAGTGCA
GGTTTTTGCTGGGTACTCTTTGGAAGTTGGGCTATTGCCGGCACAAGCAT
TGCTCAGTAGGCTTTTCCAGAACTTACGCCAAGGATAATTCCCTATAAGC
TGTTCTGGTAGAGGCCATGTAGTTTGTTAGTTCTTTCACCAGAACAAGAA
ATGGAATAGTTCATATTTTCATATTTAGCTGCTGACTAACTTGTACGTCT
AGATGCACCTTTTGAACATGTGCTTTTCAATGTTATTTTTAGATTTGACC
ATATTGGTTTAATTAGTACAAATCATCCATCTGACATCTCTTTTTTTACT
TTTTCTGTAGTCGTAAATGCCTCGAAGAAGCTGGTGGATGGATCTCCTTG
GCCTAACCATGACGCATGAAGAGAGGAGAGATCACCAAATGTCTAAATAC
ATTGCCGTCTTTTCCTTGCTGCAATAAATTACTACCTCTGTTTTATAATA
TAAGACGTTTTGGATAGGCTACTTGCCTACCTAAAACGTCTTATATTCTG
AACCGGTGGTAGTACCATTTTAGACCATGACATTGCTACAAAGTTTATTC
CCATGTTCTCTATTGTTAAGTCGATGAAGTTATGACACAAGATATTTCTG
AAGTCTGTCATCTGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.