Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA023002

[Submit comment/correction]

Sequence	AA023002
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA023002
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GAGCTCGGCTTCATCCGAGCTTTATTAAGTTTGATTTATGACAAAAATAG AAATACGCAGAGGCACGCCCATAATTGATCTTTCTTACACGGTGCGGGGA GAGGGGGAAAATAGTCATTTCTGTTTCTCCTCCTACCACCAGCACCAGGT CTCTGTTTCTCCAACGCCCACCGGCATCTCTCATCCCAAATCAAACCGCC TCCCCGTCGCATCGATCCCAATCTGACCACCCCCAAAACCCTAACCCTCA CTTGCCTCGTAGCACGGCGGCTGATTGCGGCGGCAGAGGCACGAGATGAC CACGCGTGCTTAAGCATTGTGGAGGCGATCGCGGAGGTGGGGGCTGCCTG CGACCTGCGAGCGGTGTAGCTGGTGCCGGCGCGTGGGTATGGCGACGTCG TCGTCGGCTGGTGGGAGCGGCGCGGCCGGGGGCGCGCCCGGTCTGAAGAC CTACTTCAAGACCCCCGAGGGGCGGCATAAGCTGCAGTACGAGAAGACCC ACTCCCCCTCCGTGCTGCACTACAACCACGGCGCCGGCGGCAAGACCGTC TCTGAGGTATGAACGGCAACGACTCAGCAACGCCGGTGATATGGCCGTGG GGTTTGTGGTGAGGGTTGGTACGACTGTCGGGATCTCGATGGGCTGTTCT GGATGGGGTGGAATTGGGCAGTGGTGCTGGGTGTTGACCTGATCAGGTGC TGGATTCGGGTGTGTCTTTCTTCGTCTATGTGGTTGGGATTTTGATTGAT TTTAGTTATAATTTCTGGTAATTTTTGGGTTGTGGTAATTCAGGTGACAT TTTATAGGACGTTACTTCATATTTAGTGCCTCCATTAAATTGGCATCCTA GGTTGCTTCCAGTCCCTTAGGAGTGACCATCTATGGGGCCTCACATATTG ATGAATTTAGAGGGGTTTCTTCTTGACGGTTCTAATGGTATAACTGATGA TTTCAGTTATCTTGCTTGCTTTGTGATGATTGACTTCATAGCGATGTTTA TTCTTGTATTTTGAAAAGTTAAGATTGTATCACTAACTTTTGACGATGGC AGATGACAGTGGCATATTTGAAGGAGAAACCAGTGGCGCAGGGTTCTACA CCTTCAACGCCAAGTTCTGGCAGCGGTATGCGATCTGCAGCTGCGAGACT GCTTGGTACCGGGAATGGGAACCGGACACTTAGCTTTGCGGGGAACAATG GTGTCAGCAGGGCTGTTTCGGGGAGCAGCCGTGTGGGAGGAGGCATCGGT ATGTCAACGAGCGTTAGTGGATCACAAGCCGTGGTGAATTATGATGGCAA GGGCACGTACATCATCTTCAATACTGCTGATACACTGTTCATCAGTGATC TCAACTCACATGACAAAGTATTTAGTTCCTTTGCCGAATGCATGCTAAAG TTACTTACAACTATGTTGCCATGTTGCTCTCTGACCAAGTTATTAACTGC ACCAGGATCCAGTAAAGTCCATCCACTTCAGCAACTCAAACCCACTTTGT CATGCATTTGACTCGGAGGCCAAAGATGGGCATGACCTGATTGTTGGAGT ATGGTCAGGAGATGGTCAGTGCTTTGTAATTGATAATGCTTCACTCTTAA ATTGAACCATCTCCTGAGTCGATTTATCGAGTTATGTGTACATTGTGCAG TCTATTCAATGTCATTGAGGCAGCAGTTGCAAGATCCTGGAAAGAAGCCT GTTGCATCTCAACATTTTATAAACAAAGACAAGGATGGAACTGCCAACAG GCATGATTGCTTCTTCCTTTTTTTTTTGAAAAAACGGAAACGATAAAATT TCATAGTATGATTGTTACAATTTTATATCATAATTACCTCACAAGTGCTC CAACTGTTTCATATTTTTGTTTCATGCCACATCCTCAATACACTATTGTT AACAAAAGCTCAGAATTCCTACCTTTTCTTAGAAGTTGTAACCTGTAAGA GAGTGATGCTATTTTTAGTGGTTAAGGACTATGCCAAAGACTTCTTTTAC TTACTTCATTTGATGGAGCTTAGTGGATGGTAGCAAACATTTATTTCCCT TCATCATCTATGTAAGCACTATTGAAATGCCTGGTAGTATGCTCTGCAGT GCATGCTTTTTCATGCCGACTATTTCAAATTGGCATGCAAGAGTTTGTCA ACTTGTCAGTTCCTTGTTTGAATGTACCCTATTATGGCGGGTCCAATAGT AATCTCGTTCCTGCCCTCTTTATGGAGTTCATGAAGATCGTTTAGTGTTA GCATTTTTTTGGTACAGAGAGCTCAAGCTGAATAGTGATGTACCTCCCTT GCCTACTCACTCTGAAATGAAGCATTTTGGTTGCATGCATGTTCTTCTTG CCAACCGAAGGACATGACTCTGCCATTCGATATATGAAAAATACGAGGTA GTTACAGGTGCCATATTTGTATGGGAACATGGTGGAAAATGCAAACCTCA TGCGGTTTACTCCCAACTTAGCAAAACTCACTACTGACAGCAAAATGACC ATTGGTAACCTGCAACTCAGGAAATGTAAAAACCCTCGAAACAAAATTCC GTAAGGGGCTTGTGCTAAGACCTCCCTACAGACAGCACACACATTTTCCT TCTCTGTGGTGGCCGAGTTACTGAAGGATACTGTTGATTGTTGAAGATGT TATGGGCTGACTGCTGCGGTACCTAATGTATATGCTCCTAAATAAGTAAA TAATATCTTGGATTTTTGGGCTGATCTGATATTTGTTTAGATTTGAGGTC TTTTTAACATTGCAAAAAAATAAAAATAAACGGAAAGTGGACTTTCCCTC CCCTATATACTACTGGCTTGGTTTACCTCCCCCCAACCCCTCTAAACACT TGAGCCCTCAGAATCTCATATTTGAAAAAAACTCCAAAAAAATCACACAT GTAGGTTTTGGGATGACTGAAGTATATACATTTAAATATTGGTTGAAAAA TATGACTATTTGCGATCAGCTCAAATTTGACTTCACTGGATGCTGTCATT GCAGTCGATGTACTTGTGTTGCATGGGTGCCGGAGCGTGAAGGCATTTTT GTTGTCAGTAATGCTGATGGAAATCTGTACGTTTATGACAAAGTGAGCCC CTACTGTTATCATGTTTTGTTACAACGTAATCATGCGTTGTCATGTCAAT TTTTTGAACTGATTATTTTTTATGTTCAGTCCAAGGATGGAAATGCTGAC TGGACATTTCCAACTGTAAAGGATCAAAATCAGCTGATGATTTCACATGC AAAGTCCAGCAAGGTATTGTAGAGCACTTGATTTCCATCTACTAATGGTA TTTGTTATCTTTTAGAGTTGACATCTATGGCATTTGATATCTTCTACTCC CTCCATGTCGAGAATTTGTCTAAATTTGGATGTATCTATATACTAAGGGT GTGTTTGGTAGCCCGGCTGGACTATCTCAACTCGTACAAGCTGAGTCCAG CTATGCCCACTTCATATAAGTTGATTTTATTTGCTGTGTGGGGTAAGTTG TATGAGCTGAGAAGTGCTCAGTTGAGATTGTGTTTGGTTGTCCCGTATGA CATGAACTAGGCCAGACATTATTAAACAGCAATCAGGTCCCTAGCTATAA ATATGAAAAGCAATCAGGTCCTTGGCTATAAATTTTAAAAGCAATCGGGT CCTTGGGAGGTTGCAGCCGCCGTTGCCGGCGTGGAGCCACCGCTGCGCGC TGCTGCCGGTGTGGAGCCGCTGCTGTGCGCTGCTTCCTGCGTGGAGCCAC CGCCACGCGCAACCATCGCCGCCGCGCGCTGCTTCCGCGCGCAACCGTCG CCGTCGCGCGCCACTGCCATGCGCCGCCGCCGCTAGGTGGCCGAGCTTCG ACTGGGCCGTCGCTGCTGCAGGTGTGGAGCCGCCGCTGTGCGCTGCTTCC GGCGTGGAGCCACTGCCACGCGCAACCATCGCCGCCACGCGCTGCTTCCG CACGCAACCGTCGCCGTCGCGCGCCACTGCCACGTGATGCCGCCGCTAGG TGGCCGAGCTTCGACTGAGCCGTCGCTGCAGGGGAATCGTAGGTTGGTGA GTTGCGACGGAGGCCAGAACTCGCGGCGGGTAGAGGGGACCCGTTCCCGC CGGCAGGGAGAGAGGGGCTGTCGATCTGGGAGAGATGGAGAGTTGAGACG CACGATGCAGAATGACTAGCGCGAGTCAAGCGGGGCCGCTACCCCTAGCG CGCTGAGCGGCAGACGCGGGATGGACTCAGCCAAGCTCAGTCGAGAAGCT CGATTTGAGGTTCACAACTCGGCAGGGCTGAGAGCCTCTTTTTGCATGAG GTGGGCATAGTTGAGTACACCCGACCCGACCTAACAAACAGAAAATAGCG GGGCGAGGTGAGAATTTCTGGGTACAGCCGACCTACCAAACACGCCCTAA ATAGTGTCTAGATACATCCAAATCTACACAAATTTATGACATCTATTTTG AGACGGAGGGAGTACTAAAAACACGAACACACATGGATATCGATGTTGTG ATGGTTTAACATTTGGTAACGAGGAAATACTTGTTTTGAAAACTTTCTTT AGGAAAGAATTAGCACCTGTATGTCCGGGGAAACTAATGCACTCATACAA TTATTTGTCGGGTTTGATAGCCAGAATGTATGCCTGTAACATTTTTTCTC TTTAGTTCATTACTGGATTTTAAGATCCGTCGTTGTTATTTTCTGTTTTT AACATCTCCTAAAAGGTAGAATGATTCACCATTTAAAAAAACTCACTGCA GCACATTAAACTATTATTTATAAGATTCAAAAGACAGTATCAGCATGCTG CCAAATCTGCATCAGGAAAATAAAGAAACTGATAAAAGTATATACGTTTT GCACATATTGGTCAAATCTTTTTTTGTTGTAAACGAAAGCATTTCGTGCA ATATTGTATCCAGCATCTTTAGAATGCACATAGAATTTAAACATTCCAAT TTTTCCTGATGCTTTATTGAAACACTCCAAAATAATATGATGCAAAAACT TAAGTTAGCTGTCGCAGCATATGAGGTTTGCAACAACACAAAATAGATAG TCCCTCCGTCCCAAAATAAAAGATCGCTTGACTTTTTCTTTTCTTCCCTG CACAACTTGATTATGATATTCACTTGTATTATGTCTAAAAAATTAATATG AAGACATGAAATAGAAGTATTTCACAGGACAAATACAACAATACTCCACC ATTTATACTACCTCAGTACCTCTTGTTTCAAAATGTAAGATGTTTTGATA TAATAGCCCACCAAAACATCTTACATTTTGGAATGGAGGTAGTATATGCC CAATCCATATACTTTGACATATATTATTGGTCAAAGTCGTGCATTGAAGA CCATGCAAAGTCAAGCATGCCTTATATTTGGGACGTACTGAGGATTGAGA TAGCATTTGTTGAGGGAACTGCTACAATATGTTGTGTAACTTCTGCACCA ATGTAAACTAGATGTTCTAACATGAAAAGAATGTACACAACAAAAGTATG GGGGTTATGAGGCGTACCCCCACTCACACGACAGTACGACACAATAACTT TCAGTTCACTTGGGTGTAAACTGTGTGGGTGAAGTATCAGTTTCTCTATG TCAGGATAAGTCCCTCTAGGGAACGGGGACACCACATTTCTTTTCATATA AGTGGGTAGTGCATTTCACTTCTTCCCTATTTGCATGGTAGAAATTGTGT GATATGTGTGAGGTCATATGTCGTGCACCGCCTCTATTTCTATATAAATT GATAAGGTAAACCATTATTCTAGAATTACGAATCATAGGCCTCTAATTCT CGTAGAACGTACAAAGTTAGTTTCCTGCATTGTTAGTTCTGGTGTTCTTT CTTGATAACTGACACATTCTGCACAAGCTTCATGTGGTTGTGCTGGCTTG ACACTTGCTAGTTGACAGCAGAGCATTAACCAATATTCTAGAATTATGAA TCATATGCCTCTAGTTGTCACAAAGGTAAGAAGTTAGTTTCCCTGGTGTT CTTTCTTGGTAACTGACTCATTCTACACAAGCTTCATGTGGTCGTGCTGG GTTGACACTTGCTAGTCGACAATAGAGCACAAACTGTGTGTTCTTTTGCT AGCTCAACTTTCATTGAATGTACTGTCGTGATGTCTATCTATCACTTGGT CCTACTTCTACCATATCAGGCTACGTCAGGTTCTTAAGTACTCCCTCTGT TTCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTTGTGAAACGAATGTATCTAGACCT CTTTTAGTGTGTAGGTTCACTCCGAATCTACACACTAAAATACGTCTAGA TAAATTAGTTTCACAAAAGCTAAGGCCCCGTTTGGTATCTAAGTATTTTT AAAGTATTAAGAGAATACTTTGGTTTTTGAAAAAACTGAAGTCTTAAATA CTTTGAGGTGTTTGGATCCAACAAATAATATGGTTTTAAAACTGAAGTAT CCTCTAAAACTATGGTTTTGTTGAAGTATTTGAGAAAGAGGTTGGACCCT CTTTTTTCTAAAACTGAGAAAAGAGAAAAACTGAAGTATTCCTTTGCTAG GCACTAAAATAATATGGTATTGATATACTTCAGTTTTAGAAAAAACTTTG TTGCCAAACTACGCCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAGT ACTTTACTAGCAGGTCATACTGTTACCAGTACCATGAACCTGGAAGTCTA TTCTTGCTGCTAAGATTTCTTTTCTAAATGCTGCAAAATATTAATTCAAG TGAAGTTAAGAAATTTCTGAACATGATGGTTTTTAGACTGTAGCTGCTAT CATTGATTCTGGGATGTAAATAATAATGCAGAGCAATCCTACAGCAAGAT GGCACATCTGTCAAGGTGCAATCAATGCCATCTCATTTTCCCCTGATGGA GCTTACATGGCAACTGTTGGTCGAGATGGTAATTTCTCTAGCCAAGAACG AGAATTGACATGCACTAAAATTTTTCTTGTCTGCGATATATTGTACTCAA GTGTTTCAATTGCTTGCAGGCTATTTAAGAGTATTTGATTTTGCGAAAGA ACAACTAATATTTGGTGGGAAAAGTTACTATGGTGCTCTTTTATGCTGCT CGTGGAGGTAAACTGCTGATTGCAATGAACTGTTGCGCTGATATATGGTG CCTACTTTGTCGTATGCCCTCACCTACTTCGCGAAACCAGCAAGGCTCCA AAAGCGCTAGGCTTTAATGTCAATTTGCATCTGCCTAGCGCTTATCTCGC CTAATCGCATGCCTAGGAACACATAAGCGCTAGATGTTTTGCTGTGGCCT AGGCGCGCGTGTAGACGCTCCTTTTTTAGCCATGGAAACTCGTACTTCAA ATCTGACAAAACAAAAACCAATAGTTCTGTATCTGTTTTTATGCATAAGT TCTGTTGCATCCACTTTTAGGATTGTCATGTTTACCTCTTGTAATTGTGT CGACTAAACTGTGAATCAGACAAAACCATTTAAGGTCTTTCTGTAAATTA TACCTGTCGCTGTGAGACTATTTTTTCGAGTTTTCATCAGAATTGACCAA TCTACATATAAAAACTGTGGAAAAACAGCAGCTAAGTGTATTTATGATGG ATGAAACTAGCAGCAACATAGTTGGTGCAGACAGCATGCATGTCTATTTC TTATTTATGGTTATATATTAAGTTAATCTTAAAATTTAAGCATCCATCTT ACACAACTCAATGTGACTACATGTGAAGATGGTGTTTGCTACTTTGCTTA GTATGAACTCAAAACCGCACACTAAACTTGAAAGATCTTGTGCTGAAACA CTACATATACAACATGTTGTAGCAGGCTACTGTAGCCCCTCAACTGTTCT AGCAGCCGTATATCGAGCTATAGAAGTCATGGCTCTTCATGCAATAGACC TATAGCGTGCTACTAAAAGTGATTTTCTTGGCTTCTCAGTTAGAACTCAG CCTTATTTGACTGCTAGCAAATTGTGTTATAATTGACTGGTGCTGTATGA ACTCAGCCTTATTTGACCTGCTTGCTTATTGAGTTACGTTTGACTTGGCA CTTCTGTTTATGTTCTTGTAAATTATTTGAGTATTCTTTGTTATCAGAAT CATCTGGAACTCCAGATCTTGAATTGTCATGTAATAATATATTAAAGAAA TCGTTGTCCATTTGTCCAATGCACATTGGGTCAAGATTGCACCTTATCTA GGCTCTCGCAGCTCGATCTGCCATGATATTTTGTTGTCTTACTATTTTCT GGTTTCGAACGAAGTTTGTCCATTACTGTGTAATATGCTAAGTAGTATTC ATATTTGCATCTCTTATCCCTTTGCACATTGTCACAACATAACTTAGTGT TGCTTGTACGATTTTCCTGATGCAATTGGATCTATTTGTGCCATTTCACA ACAGCTGTGGAGTTAAAGTTTTAGCTATATAATCGTTGAACAGCATACCC ATATAAAAAACGCTGCTACATATGAATTTGGTAGTGTATTTATATAGCCA TTGCATTTTTTCTCCGTTTACCTTTCTTCTCTAAAACAGAACAAGAAAGA TGTCAATAATTTGTCTGTGTTGTCCTGTTACAGTGCGGATGGAAAATATT TATTATCTGGCGGGGAAGATGATCTTGTGCAAGTATGGAGCATGGATGAC AGAAAGATGGTTGCATGGGGCGAGGGGCATACATCATGGGTGATATTATC GTTACAGTTGTCTTTGTTTACCAGCTATTTTGTCGAAACTTGCTATTTTT ATGCAAATCTCTTTTCTGGTCTGCAGGTTAGCTCAGTTGCCTTTGATTCG TATTGGTCCCCACCAAATTCTGATGAAGCAGTAGAAAGTGTGATGTATCG CTTTGGTTCTGTTGGTCAGGTAACAATAACTTCATATAAAATACTCCCTC CGACCCAAATTAGTACTTAGATTTTTCTAGATTCGAGTGTATCTAGACAT GATTTAGTATTAGATACATTCGTATCTTGACAAATTTGAGTCAACTAATT TGGGTCAGGAGGGAGTAACAAATTTGTTAATCAGGGGCATAATTTGAGAT TGATATAGCTCTTGCTCAAACTGACATAATAATAGTAAGTGGTAGAAAGA ACTTGTTTGTTTTCTTATATACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTT TAGGTTTGTGAAGAAAGTGTATCTAGACTTCTTTTAGTGTGTAGATTCAT TCCAAACACGAGTGAACCTACATACTAAAAGTAGTCTAGATACATTTGCT TCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAGCTGTGAG TGCTGATAAGGATTGAAATGTTAGTAATATCTAAGTTTTGTATCAGTACT TGCTTGCTGGGTCGATTAACTTTACAGTTGTGAACAATGAGCATGCCTCT AGAGTTGGATCTCACTAGTTTTTTGCTAAAAAAAAGTAGTGATACGCTGT CTGCCGCCTGCCACATTCTCATGCTGGCCCTTTCCCCCTTGTTTGGGAAG CCCAGTTCCGGCAGGCATCCTGGCCTAAGCCTGGACAAAATGGACTGGAC TGGATTTGGCAGGAGGTGCTGAGGAGAGTCCGGGCCTCACAAATAAGTTG GTTGTATTTCCTATTATATGCCTCCCAAATAAGTATTTTGTCTTTCCTAT TTCATGTGTTTGTTGTTTACCTGTGGCATTAGATATTTACTCTTGACCAC GCAGTACAACTTGAAATTTCATTTCATTAATATATCTTGGACATAGGATG TGCAATTATCATGTGGTTTATGCTTCAATTTACCATTAAGCATATTGTTT CATACTGGAAATAATGCCTTTTCACCTTTCCATGCACTTAGGATACTCAA CTGCTTCTCTGGGATCTGGCAATGGATGAGATTGCTGTGCCACTACGACA TCCTTCCAGTGGCTCACCAACATTTAGCAGTGGAAGCCCTTCTGCACACT GGGACAGTGCATGCCCTCCTCCTACTGGTGTTCTTCAGCCTTCTCCACGG ATGCGAGATGTACCAAAGCTCTCGCCCCTCGTTGCACACAGAGTACACGC TGATCCCCTCTCTGGCTTAGAATTCACCAGTGAATCAATTGTCACCATAT GCCGTGAGGGGCTAATCAAAATCTGGGCGAGACCACTCCATAGTGAAAAC AGCCAGCGGCCAAATTCTTCTGAGCTGGTAGCTGGTAATGTCATCTCAAA GGATAAGATGATAACATCACCAAACAAAGCTGGTGCTTCCAGCTCTAGCT TCAAGCAACCATCATCTGTTCTCTTTTCGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.