Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039939

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039939
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039939
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCTCAGCGGACTTTTGGTTCTGGTCTTCTGGGCCTTAATTAAAAAAGATC AAACCCGTTTGCTTTCTTGACCTTGTCCGTCGTCCTCCCTTTCTCCGCAC ACCAAACAGAAAACCCTCATCGAGCAGAGGGGGGGAGGTGTGGTGAGTAG GGGGAGAAAAATTCGAGCGGATTCGCGAGGGCTAGACCCAGGGTATTCGT GGAGGAGAGGCGGGCGATGGTGGAGGTGATGGCCTCGGAGAGGCAGCTGG TGGTCGCCGTGGAGGGCACGGCGGCGCTCGGGCCCTACTGGCCCGCCATT GCGGCCGAGTACGTCGAGAAGATCGTGCGGTACGTCCTGCGATGGTTTCC TTTTTCTAGGGTTTCGGTAGTGGAATTCGGATTGTCCGTGAAGGGAGAAT TCGATCTCTTTTTTTCGTGATCCCTGTTTAGGTTTTGTGTGTGTGCAGAC TGCTAGTGTTTTTTTTTCTTTCACTTAAAGTTGAGATGGAGTTTCTGTGA GGGGAACCAGGCGTAGCCTTTCCCACTGCCAGATTTTATCATGTTTAATC GTATTTAATGGAAAACATTTCTTTTTTTTTGAGGGAAAACATTTCTAGTG TCACTAATTCATGAAGAATTCTGAATTTTTGCAGGAGCTTTTGTGCAGCT GAACAGGTAACTCCCTACTGTTTAACCATTTGTGATCTGAATTCTTGATT GATCCATATCATCACCTGAATTCTGTCTAACTGTAAATACCTGATCTCTG CAGAAGCTTGGGGCGGTACCGCCTGAGCTCGCATTAGTTGTCTTCCATAC CCATGGACCTTACAGTGGTACGATTTTGTTTTCCTCTATATAATCCTCCA GGCCACTGGTTCGATTCATCACCAAGTTTTCATGTTTAGCTCTCTATCAA ATAGGTAATTTACGAAAATGACCTCCTGTTGCAATGCAGCTTTTGTTGTC CAACGCAGCGGTTGGACAAAAGATATGGATGCTTTTCTTTCGTGGTTATC AGGAATATTGTTTAGTGGTGGAGGCTTCAGTGAATCTGCTATCTGCGAAG GTCTTTCTGAAGCACTGATGGTATTGACGTGTTATCACTATTCACAATCT CTTTGCTAATAATAACTTGCTCTAGCGTTGCTTTATCGTTCTTGTACGCG TAGTTTGTTCTAAAGTTTCAGTAGTGTACTTAATTTCCTACCTGAATAAG ATAATTGTAATGACACGAACAAAACAATCAACTTATTTAACCTACAATTT CTGTAATCGAGCCCACTTTTGTAGGTCATTTCCTTCCTTGGTAAATGAAT TGTTCCATTTCTAGAGATGTTTTAGTTTGAAAAATAATACATGTTTCTAC ATCTCCTTGTACCCGAGGATACGGTTGGATTTTGTGTATGGTATGTGCTT GTTTTTCTCCATGCCAGGGCGTAAGCACTGGGCATAGTTAGCGGGAGCTT CTTAGTATTGCCATTACTTTCATTATTTTGTTAAGTTTTCCAGAAAGCGA GTTTGTATTTTGTACTGCTGTTATTTCGATTATAGGCCAGGTTCTCTTCT ATTTATTTCTTGCACAAAGCCATTGTTTGGGTGAGAACGTACTCAAGTAT GAGATTGAAATCCCTGATATGGCTATGGTTACTGTTGGGCAGTTGGACTT GTATAATAGGCAGAGCCCTAATTATTCTTCCGTGAGATAAAACTTGTATA AGAAATATCAGTAGATCAAGGTTCAAAATTTTCTGCAAACAAAGGAATCC TTGGAGCGACGTTCACCATTTTCTGCAAACAAAGTTATATCAGTAAATCG AGGTTCAAAATTTCTACGTTTACTCTTGTTAGTGTTTTTCAATTTCCTTG GAGCGGCGTTCGCCATTTTCTGCAAACTGGCATCGAACTATGTTTTTCTG CAAACCTTCATCTATGAAACAGACATGTAAATTCTTTTTTTTTGCGAAAA CGCAAAAAGCTTTGCACTTCGATGCACTGATAGATAAGAAGTATATGATA CAAGTCCTAGAGAGGACCAACACCCGCACCATACAACTCAACCTGAGAAG CTAGGCTAAGGGAGTATTTGGCGCAACCCCCGTGCTCCAGCATCAGCCCA CGTCATAACCTCGGCTTTGATCGTGTCGACTAGGGAAGCCACCGAGGGGG ACTCGTTGTTGAAGACGACCGCGTTCCTATGCTTCCAAATCCACCACGCT ATGATAACTATGTCACTTTTCTATTCAATTTAGTTGCTATGTTGTTATTA CCATATGTATTGCCACCATGCTTATTTCTTTTTATTTATTGAACCAGATA CTCCAAGGCAGTCCTAGTAACAGCCAGAATAATCAAAACAATGAAATACA AAAGCATTGTATACTTGTTGCTGCGAGTAATCCTTACCCTTTGCCTACAC CTGTCTACCGTCCTTATGTTCAAAGTGGTGATAAAAAAAAGAACAATGAA GCAACAAAGGAATCCTGTCTTGCTGATGCTGAGACCGTTGCGGTTGCATT TGCTCAGGTGCTGAATCAATACTACTAACTTGCATATTATTGATTACCTG TATTTAATGGAGTGCTAAGCAGTACTTTGTTGGATCTAATTAATGATTAT GGATGCAGTGCTCTGTATCGTTGTCGGTGGTATCTCCTAAACAGCTTCCA ACCTTGAAGGCAATATACAATGCGGTAATTCATCAGTTATTGTTTTGTCA ATCTTAAATAAATTGGAAGCATCCACTCTTATGCTATTTCCTTTCTTTGA TACCTTAGTCGATTCACTATTCTAGTTGATAGATTTATACTTGCTTATTT ATTTTGACTTGCTCGGGAAAAACCTTGAACAAACATGATCATGTGAAGTT GTGCTTTCTGCAGTACCTCACCAAATAGCTTGGGCCAGTCCACTAGTTTC CAGAAAAGTTTAGATGTTCTTGTAGTTGTGGGTCTTAAACTCCCCCTTTT TTAGTCATAGTTTGTAAAATATAAATGTTTTGAAGCTTCAAGCGTTGTAC CACATAACCTTTGTTGCGGATTACAAAAATAAAAATCCACCCACGTTAAT TGCATTAAATTATATAGCAGAGCAGATGAAATTTCAAGACAATGCCTTTC CATGATCTCCATATTTCCCCACTTAATCATGTTAGGCGTCACTAACTTAC ATGATTTTAATCTGACTTTATGCAAAATGATGAGCACTTTGTTACTCTTG TGAGTGGGCTCCGAGTACTGATACTGTTCATGTTTATTGCAGGGGAAGAG GAATCCTCAAGCTTCTGATCCATCAGTCGATCATTCAAAAAATCCGCATT TCCTTGTTTTGTTGTCTGAGAGTTTCATGGAGGCTCGAACCGCTCTAAGT CATTCTTTACCAAACCTGGTACCAAACCACACCATTACAAAAATGGACAC TGCACCTGCAGCTAATGTGCCAGGACCAACTTCGAATGTCAATTCCTCAG GTTGAGCAACTGCTAATTATACTTAGTTTCACTGAGATTTTATAGCCTTT GGTTCTGACCCCATTTTGCATGAAACCTTGTGGCTTGTGCTGTTGCTATG CTGTGTGCACAGGAGGGGTATAGAGAAGGCTTTTAAAAAAGAGGTATAGG TGTTTGTCCTAGTTTAGTGTGAAATTAGTTCAACAAAGCTGCAATTTGGT AAAAAGGTAAATAGCGTTGGGCTAAAGTAAAAACCACTTTGGATATTACC CTTTGGGTTGGGATACACAAATGAATATATACATTGATAAACACTTCTAT CTGTATATACGCACGCTGTGTTTCCATGTGTATGAGTGTTGATGTAGTCC TTGTTTGTTAGTGAAGTAAATTTCACAAACTCACATTCCAAAATGCTGGG TTTTAGCTCTTGTAGTCAATGTTGCTATATACCTATGTATTCAATTGCGG TGATGCATTTTTGATATTGTTTACAAGCTCCAGCTATGTTAACCAAGGAC TCCTGTGATTTCACATCGTGTTCTTTGCTTCTGCTCATATCGTCTCATTA TTGCCCCACCAATTCGTGATGGCTAATATATTTATAATATCTCCAGTGAA TGGATCGCTAATGGGCCGGCAACCGACTGCAAATGTTAAAGTGGTAGGCT TAAAAAATATACCTTTTATTTTCTGTATATGCTTTTGATTGTAACTGTAC CTTAACAATTTGCATTTTCAGGAACCAACAACTGTACCAGCAATGGTTTC TGCTCCTGCATTCTCCCATATGACACCTATTTCAAATGTTACTTCACAAG GGGTAACAACCATGCAAAGTTCTTCACCATCGATTATTTCACAAGAAACA AATGGTGCAAATGAAATCTTGCAAGAACATAAGCCTTTAATAAACCCTAT CCAGCAACAAGGTCGGCCTGGTGGCCCAGCAAATGTCAACAACATCTTAA ACAATTTATCACAACATCGGCTTTCTTTACCAGGAGTTACCTCGATGGGA CCTAACATGGGGGCAACTCCTATACAAGTGCACATGTCAAATATGATATC CAGTGGCATGACATCAACTCCCCCCATCATAACTTCTATGTCTGGAACAG TACAGCCAATTGGTGCTGGTCTCGGTTCTTTTGGATCGAACACTTCTACT GTATCTGGCAACTCAAATGTTGCTGTATCATCTTCTTTGGCTAACATGCA AAACAACATGGCTATGGCACAAGGTGGTCTGATGACTGGTTCACATGGTG CACAATCAGGACAAAGTGGAATGGGTACGAACCAAAATATGGTAAGTAGT ATGTCTTCTACGCCTGCAATGATGCCAACACCAGGGATGGGCCAACAGGT TGGAGCAAATACTCTTAGTGTGAACAACAGTTCTGCTATGAATATGCCTG GTCAGAATCCTAATGGGCAGCAACCATCCAAGTATGTAAAAATTTGGGAG GTAAAGGTTCCAGCTTGTGCCTCATACCTTTTCATAGTAGCTTTTCCATA GATTGCTAAATGTAATGTACTGTTTTAAATTATGGTAAATAGTTAGTTAG TAACTATCACTTTGAAATTACTTCAGCAAAATGTTAACTGGACAGATATT CTCCAAATCTATCATATATTGTTCACATTGGGTCATATTCTAGGGAAGTT TAGTTGTATGCCACTATTACATGACCAATTTTGAGACACGCAACCGTCAC CGATCAGTTTTGGGGTATGCTACTGCAATGTTTGTTCTTTGAGAAATGGC ACTGGAACCATTTTCTTCCAAAAATGCTGCTATTGAGTACTCCCTCCGTT CAGAAATATAAGACATTTTAGCTTTGTGAATCGAATGTTTCTAGACGCCT TTTAGTGTATAGGTTCATAGAGGTTCGGAGTGAACCTATACACTAAAAGA CGTCTAGATACATTAATTTCACAAAGCTAAAATGTCTTAAATTTCTGAAC GGAGGGAGTACTTGACTGCTCGTTCTTTGAGATAGCCATGATGGACAACC TAAGATCAGGCCATAATGCTCTTCCTTCTCCATCCATGTATTGAGGTTAT TATGTTATGTTTAAAGCAAAAGAGGTTAACGTTTAGTGTTTTATTTTCAA TTGATTATGGAGTTTTCATTGGACATAGATTTTCCACCCATGTGGGTCAT GTGATGCACATGTACCTTCTGAATTTCATGGATCCTATATCCTTGTATTT CTGTGATGTCTGGACCTTATTTCCTGATGTATAAACTGGAATGGAAATGA ATTATCTGCGAGTATATTTACTTTGCCTTCTATACTTTAAGTATCAACTC TTGAAGAAAGCGTGTTACGTGTGAAATTAAAATACACATTGCTATGATCC TCTATTTATATACTATGCATGCTGGCATTAAATCTAGAATATATTATCGA GTCATTGAAAATTTCTCTTTTTGGATATAACCTAGCAACATGCTATGAAA AATGCTGTATGCTACAAGAGCTCATAGCTAACTCATGTGTTTATTTAAAC TCATATTTTGTGATTAACACTTTTATAGCCTCATGTCGGGTTTATTCATC TTGCTGATGTTGTGTCTGGTGTGTTTGCCTAGTGGTACAGAACATGATGT CTTTCTATTTATATTTCAGGGAACTTTGTCTGGGCAAAGGCAAGGACAGC CTGTATTTATTTGTAAACTCGAAGTAAGTCTCCATCTGTATTGCTGAACT CACTCTGATACAGTGACAATTTCCCCCCTCTATTTATCTGGTTTTTTTCG AAACGGGCTGTTTATCTGTTGTGTTTTTAATGGAAAAGACGATTAACAAT CTGTGTCGTCAAAATGGGGTCATATGTTTTTTCACCTCTTTTCTGTTAGG ACTGCGCACTGATTGGATGCAATGATTCATTAGTGCATATGTAATGCGAT CATTCATGACAATAATACCTCTCTAGAGTGTTCTCTATTCTTGAGACGGT CAGAAACTCACTACCTGGAATAAAACTTTTTTTTTGTGTAAACAGCATCT GAGCCCCACTGTGGATTATGTGAATTAGTAATGAAGATGTAGGCTATTGA TCCATTAGATCCAAAATTGAAAAAGATCACAAACAAATGATACATAGAAT CTACAAGCTATAAACGATACAATAGATCATAAGGGACATATTATGTAATA TCCAACATATTGCATAAAATCGCTGACATCTCGGGAGAGATTGTGACTTT CAATCAGTTCAAATCCAAAAAACAACACTCTTCTGTCTATGCTGAGAGCT GACTGTTGCTCAGTTGGTGGGGGTGGGGGTGGGGGTGGGGGATCGTTAAC CCACCCACCAGGGTTCGGCTTCCCTATATGTTTATTTGATGAATATGTTC AAAATATGCAATTGTTTCTTGTAATGCAAAATTCCAAATGAACCAACAGC CCATTGGTATTATCTCCTTGAAGAATAGCTTGGTTGGACCAGCTTGATTT CTAGTTCAGGCCAAAACATCCAAGACTTATAAAGATGTCCTCCAAGAGAT TTTAATAAAAAAAGGTTCAATCTTCCAAAAACCTTATTGCTGCAAAGAGC ACAGACTTAACTTCCCCCACATTAACATTCTTCTCTCCATTAAGTGTTGA CTTTGTCGTGCAGCAAAATTCATAGAAACACTGTTTAGCATACATGTTTT TCTGAACCCAATGGAAGTTGGTGAAACATGGAACATGAACATCTTTTCAT GGTTTTAATGTACACATTCAAATCTGAAACATATTGGTACAGTATTGGAT TGTGTTCTGTAAATCTGCTATTCTTTTAACTGTTTATGCTGTACCATATT CTGTGCAAGCCATATTAATTTGTTATATTCTCATCTTAGCATATGTCTTG CAGGGTTACAGGAGTGGGACAGCGTCTGACACGTAAGTTTTCTTTTGCAA TACTTTATATGTTTGTGAATGTTTTGTAGCTAGCTGCTGCCATTGTCTTG AATATGAATTATTCAGCAAAAAGAGTTACCTTTTAGTGCGTACTATGGAT GCAACAGCCGTCCTCCTCATGAGGTCATTCTCATTATACTACCATTCCAC CTGTTATGCATCTTGTGCTTTCTGGGAAATTGTCTGCACACATTTTAGAG CAGCAATAGGATTATGGGATGCTAAGGTTTGCAGACCCATTAAATACCAA TTGCTCTAGATTGGTATGTCATGTTTATTTCGATTTGCAGCACCTACCAA ATAATACTAGTGTACTATTGCCATATATTCACGAACATACAAATTTCCTG AGTTAGCTGCTGGTCAAGTACAATGACAGTAGGAAACCTATCAAAATTCC TCGTATTCCTAAATACAATACTGCTGGATGAAGAGACTTTTCATTCTCTT GCACTTGTTAGCAATTTTTGAAAGCAGATTACATCGACTCAGTTATAATC TATTAACATGTTCTTATGTTTCTCCTTGCGACGTGCTTTATACAGTCTGC ACATTATGCTGTCAATACCTAGAGAAACTGAACCTGTACTTTCTGTTTGC AGTCTTGCAGCAGACTGGCCAGAAACAATGCAGATTGTGCGACTCATAGC CCAGGAGCATATGAATAACAAGTTTGTCGTTCAACTACCCCATTATTTTC CTTGTTAAAACCGTCACATTATTACATTATCTAACAATGTGATGGTCCTA ATATCTTTCCTGCTAAACTTTTTCTGTTTGATCATGTAATTCTACAGGCA GTATGTTGGCAAGGCAGACTTTCTAGTATTTCGAACATTAAATCAGCATG GGTTCCTTGGACAACTACAAGAGAAGAAACTGGTCAGTGACTTTTACTGA ATGTTACTCACTACATGTTTAGTCTATTTTGGAATACTCATATTCTCATT TGAACTGCATTTCATCAACCGTCATACATACATTTACTTAATTTTAATGT TCAAGCTGTTCCTTATTTCAGTGCGCGGTGATTCAGCTGCCTTCACAGAC TTTGCTGCTGTCAGTGTCTGACAAAGCTGGGCGCCTCATCGGAATGCTTT TCCCAGGGGTATGTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.