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GrainGenes Sequence Report: AA046639

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Sequence
AA046639
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046639
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCAAGGCCAAACCAAACGAACCAAAAACGCAACGCCTACACTCGGCTCC
CTTCCTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCTGATCTGTCCTCGTCTTCC
TCCTCACACCACTTCCTCCCAAAACTCCAAGCGATTCCTCCCCTCCTAAT
CCCAACCCTAGCGCTAGCCATTTGATGCGGCGGCGCCCGCCATGTCGTCG
TGGGGCTTGGGCTGGAAGCGCAGCTCCGAGATCTTCCACCTCACCCTCGA
CTACGGCGACTTCGCCGAAGAGCCCGATCAGGACCCCTCCTCGCCCCCGC
CTCCGCCTCCGCAGTCCCCCACCGCCGCGTCTGCCAGCGCGACCTTCACG
CCCACCGCCACCACGAACGGCGACCTCGGCTTCCGCATCGAGCTCGACTG
GTCCACCAGCGACGACGAGGACCAGGTCGCGCTGCGCCTCCAGTCCCAGC
TCATGGTCGCGCTGCCACCGCCCCACGACGCCGTCTCCGTCGATCTGAAG
CCGGCCAAGGACGGGGAGGGGGTGGGGGTGGAGATGCGGGTCGTCAGGAG
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CTCGCGCCCGCGCCGGCTGCCGACGGAGCCGTCGCCGCAGGCGTGCCCGT
GCTTGCCGACCACTGGCGCTCCGTCACGGTGCTCAGCCTCTGCAACTGCG
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TCGAATTTGTCGTCGTTTTCCATGCGCCTGATTAATACTGTAGAATTCCG
GTACTGCTCCTCATATCAGAGGTCACATAGTAGTAGTTTTGAGGGGGTTC
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TGCTGTTGCGTTTACCTGTGTGAAATGCTGTGGTTATGGCTGTCATTAGA
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GCTTAATTCTGATTGTTCTGTGCATTCAGTATCGAACAATCAAACCTAGC
ATTTGCAGCAGGATAACTTTTAGATTTTTTTTTGTGTAGATTATTTGTAC
TACTTTATTTATTGTTGTAGGTGGATTAGTGCTAGGACTGTAAGATACTG
ATTTTATGGGATGTTTATCTGATTTGAACACCTTATAAACCAAGAACAAC
CTGAGGAATTCATTGAAGAATTTGAGTAGAAAAAAGGGATCAACCACACT
AATTTTCTTTATTGCAAAGGCAAGGGTTCTAAGAACTACACTACTACAGT
ACTCAGGATACAGAAGAAATCTCATTTTTCATTGCTTCTTCACCATACAC
ACATGGGGTTTATATGCTCAGGCACCACAGCACTGTTTTGACTGAAAAAA
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TCATACATTTGGCGGAAGTGCTCTCTCCTAGCCGTGAGATATCTGTAACA
CCTGTGTCAGCTTCTATTGAATTTTCTCAGTCAACTGCCTGTTTCAAAGA
TTGCACTTGTTTGTATACTGAACTTAAATGAGAATTGGTCCTTGTGGATT
GCACACTTGACCGGTTTAGAAATTAGTTAATTATTCATATGAAGAATTAA
ATCACCTTTCTCCTTCAATCAAGTATCTGATCACTAGAAATATAGCTGCT
TCATACGCTACTAATTATCAGAATCTGAAACCAATACTATTTATCATTTT
GGATTAGTGAGTATTGAATTACAGTTTACCATTTGATGGAAATTTACTGC
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GTCTAAACTAAAAATGTGTTGTCGGGTTGTTAGTCTAACATGTTAAATCT
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GATGATCCTGTACTGTTTCGCCGCTTACTATTACCCCCTTCACTTCATAT
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GTCTGCTTTGGGGTATGGGACCTTCCTTTGCTTCTCTACAATTTGTTCAT
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CCATTGACGAGCCTTTTGGCCTGCGTCGGAAGCTTGTGTCATGGCTATGC
ACTCTAGCCCATGTGTAGCTATGTGGCTCTCCACAATAATTCTTATGTGT
GTCAGCATTCTGGCTCCCCTTGGTCAATGTTAGGAAGTTGATATATCTCA
TGCAATTCCTTGCTGACTTCTGCTTGGGACAGAATTTTCTTTTGCAAACT
TCACCGGCAACTCGATCCAATGCTCAATTAACCTCATAATCTCTAGCTCC
AACATGGATGGAGCAGCAGATGTTCTTCAAGACCACAAAATCCGTTCTTT
GAGCACCACTGCTACGGGCTGCAGTGGTAGAGCTCTGGTGGTGCTCATTG
GCATGTGACGTGTCTACTGCAACACCTACAATGCATGCTCCCTACTTTAT
CTCCTACTGTACTTGCATTTTTGTCTTAGAGCCGTGGAATAGATCGCTAT
TCCTAACGTGGTATTGAGAACATGTTTCTAGGGTTCACTTTTTCTCTTGT
TTTCCCTTCAATCTTGTTGATTCTCTCTCCTCTCTGTTCTTCTGCATGCC
GTGACTCGGTGCATAACTACACACACACTCTGCACCCTTTTGGCTTCGCC
TCTGCCAGCCCTTATTTTCCGCCTCCTCTATTTGTTGTGCCGCAGGTCCC
CCCTTGGGGCCTTTATTGCCTTAACAGTTTTGCTAGTATTGTCAATTGTG
CCTTATTGTCTGTTTCCTGATTTGAAATGTTTGTTGTCCTCTTGTCAGAT
ATACCTGTGGCTATGAAATTTGAGACTGATTGACACTAAAAGCAACTCTA
ACCATGAAATGTTGTACAAAACGTTGGCAGGTGCTTCCGGTTGAATTGAC
TCGCCTTTCATTTCTTGAGAAGCTTTATATTGACAACAATAAATTGTCAG
TTTTGCCTCCTGAAGTCGGTGAATTGAAGAACTTGAATGTGCTTACTGTT
GACAACAACATGCTAGTTTCTGTCCCTGGTTAGTGTGCACAGCTTTTATT
TCTGTATAAATATAAAACTAGTGTTTACAACTTTGTAGTACCTCAAGATT
GTTTGCCGTTCATGATTATGCATATCAACAGTCATTGCAATGAGCTAAGT
ATCTCCCTGTCTTTTAACAAAGCAGTGGAACTACGACAGTGCGTTTTGCT
GGAGGAATTATCTCTAGAACACAATAAGCTTGTCCGCCCGTTATTGGATT
TCAGGTTATTAAATATTTTTCATAGAGATTGTTTATTTTTCTTTAGTTTC
TTTCGATTGGTGTAATTTTCCTCACAGTTTATTATCATTTTCCACAGATC
AGTGCCTAAGCTCCGTGTATTGCGCTTGTTTGGGAATCCCCTAGAATTTC
TTCCAGAAATTTTGCCGCTGCACAACCTTAGACATCTGACACTTGCAAAT
ATTAGAATTGACGCACTGGAAAGTCTTAAGTCTGTGACTGTGCAAATAGA
GGTAGATAATACTATCTTGGCATTCTATCATTCTATTAGCTAGGTCATCT
CATTTCTTTTTGACAAATTTTCCTTTGGGTTTTCTTTACAGACCGAGAAT
TATTCCTACTTCATTGCAGCCAGGCACAAACTTAGTGCCTTCTTTTCACT
TGTTTTCCGGTTCTCTTCCTGTCACCATCCTTTGCTGGCCTCTGCTTTGG
CCAAAATAATGGAAGATCATAACAATCAAGTTGCCATTAGCAAAGAAGAA
AATGCTGTCAGGCAGCTTATCAGCATGATAAGCAGCGATAATCGTCACGT
GGTACTTACTCAACCCTGAAAATACAAAATGTGCTTGAGTTCTGTGGAAA
TAATTTTATATTTTAACCATACCACCATTTGTTTAGTAATGTCTTAATTG
GCAATTCCTTTTTCAGGTTGAGCAAGCATGCCTTGCTCTTTCGTCACTAG
CATCAGATATTTCATCAGCAATGCAGCTGATTAAGTGTGATATAATGAAG
CCGATAGAAGCCGTGCTGAAATCATTTGATGACGAAGAATTGGTATCAGT
ATTGCAAGTTGTGGTCACATTAACTTTTGTTTCTGATCATGTTGCCCAAA
AGATGTTGAGAAAAGATGTGCTCAAGTCACTGAAAGCACTTTGTGCACAC
AAGAACTCTGAGGCAAGATGTTCTGGATTAGACTTTGGTTCATAGTTGAT
GTGTTGTTTGGATAACCACTGGAAGCTCACCTTTATTTGCTTCCTTTTGT
TAGGTGCAACGGTTATCTCTATTTGCAGTTGGCAATTTGGCTTTCTGCTT
GGAGACTCGTCGCACCCTTATGCACTCTGAAAGTTTGCGTGACCTTTTAA
TGCGCTCTACTTTTTCACAAGAAAAAAGTGTCAGCAAGGCAGCTGCACGT
GCTCTGGCAATTCTAGGTATATTTGTTTGTGGTTCTGATTGACTTGTTTT
CTCATGATTAATCAGTAACCATAACGTGCGTTGATGGGTTTTGTGAATCT
TTTCAAACTTTATAGGGGAGAACGAGAACTTGCGCCGGGCAATAAAAGGA
AGGCCAGTTGCAAAGAAGGGTCTGCGTATTCTTTCAATGGATGGTGGTGG
CATGAAGGGCCTTGCAACTGTCCAAATGCTTAAACAAATAGAACAAGGAA
CAGGGAAACGCATACATGAAATGTTTGACCTCATATGTGGTACATCAACA
GGTGGCATGCTTGCGATGGCTCTTGGAATCAAGCGGATGAATTTGGATCA
GTGTGAAGAAATATACACAAAACTTGGTAAATATCTTTTGGTTCTTCATG
ATTTATTATTACTTAAATTGTTAATGCCAACGTGCTGCCAATTGAATTGT
CGCTTTTCTAGGGAAACTTGTGTTTGCTGAACCTGTCCCTAAGGACGAAT
CTGCTACATGGAAGGAGAAGATTGATCAACTTTTCAAAAGTTCGTCACAG
AGTTTTAGAGTGGTTGTACATGGTTCAAAGGTATAAATCAACCAATGAAC
TTCTGTGTGTTGTTTCATGTTATGCACAATGTAGGGCAGGTAGTGACTTA
AGGAATTTTTGTTGCAGCACAGCGCAGATCAATTTGAGAGGCTACTAAAG
GAAATGTGTGCTGATGATGATGGTGATCTCCTAATAGAGTCTGCTGTGAA
AGGCATTCCGAAGGTTTTTGTTGTATCCACTTTAGTCAGTGCCATGCCTG
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TGGTTTATTGTTTTCAATTCGAAATTTATTGTACCATGTATGCTGGGACT
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AGTATTACTTTAGCTATTGTCATCGTTTTTCTGTTCTTTTTGTTCTCTTA
TTTTTTTTAGTTTTGTGGCATATTGTAATATGATAATGTATTCCAGTATC
CACCTGGCACTCTGGAGGTGTCACCAGGAATGGCAGAAAGTCCATCTATC
GGCGCGGTTGGAACGGCTGTTTCTGGTGCACCAGTTGGTATTAAACGTGG
TGCTTTTATGGGGAGCTGCAAGCATCATGTATGGGAAGCCATAAGAGCAT
CATCTGCAGCTCCATATTATCTGGATGATTTCTCTGATGGTAAATATTCC
TAAACTTACTAGTGTATTTTCATATATGCAAGGACAAGTATGTCTATTTG
TTGGAGTCTTCAAGATACAATATCTACTTCTATCCTCATTTTTCTTGTTT
ATTGTTTTCTTCCTTTTTTTTTCTTTCCAGATGTAAATCGCTGGCAAGAC
GGAGCTATTGTAGCGAACAATCCAACGATCTTCGCGATAAGAGAAGCACA
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GCTCAGTTCCAACAAAGGTAATACAAATCATAGTTATTGATTTTGCTACT
CCCTCCGACCCATATTAGTTGACTTAACTTTGTCTAGATACGGATGCATC
TAGACTAGATACATATAAATCTAGACAAAGTTGAGTCAACTAATATGGGC
CGGAGGGAGTACTAAAATAACTTTCATAATTAAACTATTCAAAGTTATGC
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GAGAAATTACCTTTTCTTATTCTATGGATGCTGGGATATCGAGCAACATA
GTGCTATTCATGTAAGTTTTATGGATACGATTTTAATTATTTTCAACGAT
TACATGCTTTTACATTTTGTGGCATTACAAGGAATGTATTGACCTACATG
CTCTATATCAAAATGTCACTGATCTCTCTTTCAGAAATAACAAATCCAAG
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GACAAATCCAAGTCACTTATTTTAGGATGGAGGGAGTACAAGAAACACCT
AAGTGATCCAAGATGAATATTTGTTGCTTGATAATTTACTACTCCCTCCG
TCTAGAAATAACTGACTTGAGTTTGTCTAGATGCAAATGTATCTATACCT
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ATTCAAATTTAGACAAACCTAAGTCAGTTATTTCTGAATGGAGGGAGTAC
ATTAATTCCAGTGAACTTCGATCTGAGATATGGAGCTTTTGCTCACTGTT
CTCATATGGTGATATTTCATATATTCATCTAGAGTCGGCGAGGTGGATGG
CGCTACTTGGATACAGGGCAAGTTTTAATAGAAAGTGCATGCTCAGTGGA
GAGAGTGGAAGAAACCTTGGATACGCTGATACCTATGCTTCCTGAAATGC
AATATTTTCGCTTTAATCCAGGTAATCTAACTTCTGAGGAAGCTGTATGT
TTGACCAGTATCAACACAACCATAAGTGATGTTTAGCAATTTTGGCACTA
TTGAAGTGTTTATCTTGGATATTCAAATGAGCTGACATCTTGTTATGCTG
TCAGTTGATGAACGGTGTGGCATGGAGCTAGATGAGACTGATCCTGCTGT
CTGGCTTAAGTTGGAGGCTGCAACGGAGGAATACATTCAGAAAAATTTAC
AGGATTTCAAGAATGTTTGTGAGCTTTTAGTTCCAAGATATCAAGAGGGA
GAGAAGTCCTCTGGAATCATTAAATCCCTGTCGTTTTCAAGATTAAGTTC
GTCAAATTCAGGTTTGCATTACCTGGATTTTAGCACCATTCTGTAATACT
TTGTGGGATATGTAGTTGATACATCTTTGATATATCTTATAATCCTCTGT
CAGGTCTAAGTGAAAGTAATCCTACATTAGGATGGAGGCGTGTGGTTTTA
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CCGTTCACTTGAAGCATTCTGCTCTCAGAATGGTATTAGGCTTACTCTAA
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GTGTAAGAGAAAGGGTGCATATTCTGTCTCAAAGATTTCATGTTTGTCTG
AGTTGGTTGCAGAATGGCCGTCGTTTGAAATTGGTGGGATACATCACCGC
TACATAGGGCGCCAAACACAGGTAGGACTGCTTTTACTTTTGTTTTTTTC
CCAGACAGGTCAATAGGTATACTGAATTACCTTGTACAGGTAATGGAAGA
TAATCAAGAAATTGGTGCCTATATGTTTAGGAGGACGGTGCCTGCTTTTC
ACATGTCACCTGAAGATGTTCGATGGATGGTAAGCCATTATCGGCAGATT
GCACTTCCTTTGAACTGATCTTCGTATGTTCATAGACCCACCAGTGCAAA
ATTGTCAGTGATACTTAGTGAATCCAAAATGCAAGAACAGCTCCAAGGAA
GATCTGTAATAGGAGTAGTATATTATTGCCAGTTGACTAGGAGTATAGGA
TAAAGCATGCATATTTTTGGTGGTGCCGTTAAAATGTTGTCATAGTAAAT
GCACAGCATGAACCTCTTGACTCAAATGAACCAAATGGTAAACATAGGTT
GATGGCTGGCAATGAATTAGCAAAGAGGCACAGTTAAGTTAGCTGCCACA
TCATAATTCCTTCTGTCTAGTTACTATGTTTGTTACAATGCATATTTCAT
GGTTTAGGGCACTGTTGATTCTTGATACCTTAAATACATATTGTTGCCCT
AGGTTGGAGCATGGAGGGAGAGGATTATTGTGTGCAGTGGCAAGTATGGC
CTTGTCCATGGCCTCATCAAGGCGTTTGTGGATTCTGGTGCCAAAGCAGT
CATTTCATCATCTGCCGAGCCTCCAGATTCCCAGGCAATTGTATACCATG
GGATGGATGTTAATGGAAGCCTAGAGAATGGGAAGTTTGTAATTGGGGAT
GATGAAGCTGATGAGTCAGAGCCTGAACCTGTTAGCCCTATAAGTGACTG
GGAAGACAGTGATGCTGAGAAAAATGGTGAAGGCAACAAAGATATTGATG
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TCCTAGGTTGAAGTACACTTGCCATTTACCTAATGTTTTGTAGTTAGTGA
CATCCACAAGCCATACAAATTATGAAACTAATAATACTAGGGAAAAAAAG
GATCAGGTGGATTCGGTGATAGAGTTTATTTCTGAGGGGTTATAGAGTAT
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ATTGCTTCGCTGTAGATCAAGTGCCCGAAGTTTTGTTGCTGTACTCTGGA
TTTCATTGTTTCATTTCTTTGTAGTAGTCGGTAGATAACGCTGTCTGATA
TTCATATCTTTTTGTGTTTTCTTTCAATTTTGTGTTTCTGGTTTAGCAAA
TTGAATGTGGGTTTAGTCAACTGTAGGCATTGCGGTGTTGAAGCTGGTCG
GAAAGGAATCTGTTCTGCCGAGTATGATATATGAGGCCACATTTGATAAT
TCTTTTCAGTAGGAAGACTTTTTTATATGGAGTACATTATGTTTGTTTGA
TACAGCTGTGCAAATTAAAATACGCACCAACGAATTAATGCCGGTTCCAT
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GTGGCGGCGAAGCCTGTGATGAACTCCCTGACCTCGGCGTTGGCCCTGTC
CAGCGCCGTCCTCCCGTCGGCGTCCTTGACGTCGTACTTGGCGCCGGCCT
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GTCGTAGGTGCCCTCCACGGCAAGCATCCCCATGTAGTTGAAGTACTGCG
CAGATTATTAAGACCCACAGCCATTGTTGTTAGTTGTAGACTGACGGGCA
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GGGAGCGGGACGGGTTTTTCACCTGCTCGACGTCGTCGCGGTCGAAGTCG
TCCCTGCCCTGACTGCCGTAGATGCCGGCGCCCTCCGCGTCCTTGTTCCC
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TCAGCAGCGACCATCCTTGCATCCTCCGCGCCGGCAGCGGCGTCCTCACC
GCTGCTCCTCCCGCTCCCTGCCTCCACCTCGACGGCGAGGATGCCGTCTT
GGCCGCGAGCTGGATGGTGCACGGGATGGACGCCATGGCGGTTTGCTGAT
TCTTGGAACGCCGCGAGCAGGTCTGGGAGCGAGAGGTGGAGAAGTGCAGA
GAGGTATATGTACGGAGCGGATAAGTAGTGCCAGTAGTACAACTGAACTG
TTTGGTGCACCTGGGTGTGTGTGTGAGCAGCTTGGCCTGAATTTTCTGTA
TCTTTTGCCTTTGCCTCTTCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.