Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA012625

[Submit comment/correction]

Sequence
AA012625
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012625
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGCCGTGGCCGCCACCAGCAACCCGTTTCCGTGCACAAGCACAACAC
ACCCAGCTTCTCTCTCTCTGGACGAACCCTGATTCCCCAATCCCGAATCC
CCGCCAGACCAAATTCCTCCGGCGCGCAGGTCGCCGGCAATAGAGGAGGA
GGAGGAGGATCCGACCGTGGCGACGCGCGCTCCAAAGAGGCGCAGATCTG
TTCGAGCCAACGGACAGCAAGTGCCACCTGGGGGCGGCAGCGGCAGGGAA
GCCTCGACGACCTGGACCTCATAAGCCGCCTCCCCGACGAAGTGCTCGGC
ACCATCGTCTCCCTCCTCCCGACCAAGGAAGGCGCCCGCACGCAGGTCCT
TTCCCGCCGATGGCTCCCCCTCTGGCGCTCCCCCATGGCGCCACTCAACC
TTGTGGCGGATGATACCCTCTCCGACGAAGACACGCGTGTCGCGGTGGTC
TCCAAGATCCTCTCCGACCATCCAGGCCCGACCCGCCACTTCTCGCTCGA
CATCATCTCCCTCCCTGGATTCCTGGCCAAGGTCGCCCGCTGGTTCCGCT
CCGAGACGCTCACAGGGCTCCAGGAGCTTGGGATCACCAACCGGCATAAT
AAACAATACCATTACCAGCTGCTGCCGCGAGCGCTGACCCGTTTCGCGCC
GACGCTCAGCCTGCTCGAGCTCCGCTGCTGCCGATTCCATGATAGGACCG
CACTACCGAGTTTTCCGCACCTTAAGCGGCTCAACCTGTACAGCGTCGGT
ATTTCGGATGACTATCGCCAACGCTTGATCTCCAGCAGCGCTGTTTTGGA
AAGCGTTCGGCTGAGATGCGTGAGATTTTCTCGCATTTGCATCAGTTCAC
GGACTCTTAGGAGCATCAAGCTCCTTGCGCTTCTCCGAAAAGGAGAGCTG
GTCATTGAGGACGCCCCTTGCCTGGAGAGGTTACTACAAGATTTTCCAGA
TGACGGTCCGACGACCATCCGGGTGATCCAGGCTCCTAAGTTGGAGATAT
TGGGTTTCTTGTCTGAAGGCATATCCACACTCCAGCTTGGAACCTCTGTT
TTTCAGGTATGGTGCAGCAACGGCAATTGCGCAATTGGCATTCCTTTATG
CAGCCTATTGTTCTCATTAGCACTTGATTTGTTGTTCTCTAGAAAATGAT
TGCAGTCAACTTGACAACCAAAATGCACACAATGAAGATTTTGGCTCTCA
GCTCTACTGGCGCTAAGCTGGGTGCAGCTATTGATTTCCTCAAGTGTTTC
CCTTGCTTAGAGAAGCTCTATGTCGTTGTGAGTATTCATACTTGTTGCTC
TAGATGTCAAAATCAGGAGCATTTGTTCAGATTTATGATCTGGTGAACAA
GTATTTTGACACTGCTTCTATATCACTTATTTTTCTATCTCCAGTTGCAA
CGAGGAAACGGTATGGATAATTCGGTAAACTATGACCCACTTGATCCAAT
TGAATGCTTGGAATTCCATCTGCAAAAGGTGGTCCTGAAGAATTACGATG
GTGACAGGAGGGAATTTATTGACTTTGCAAAGGTCTTTGTTTTGAATGCA
AAAGTGTTGAAGCAAATGGAAATTGGAGTTCTTAACAGCGTAAGCGACAA
ATGGATGTGTGATCTGCGTAGAAAGCTTCAGGTGGAGAATAGAGCTTCTC
GAGATGCACAAATTGAACTAAAAAGTGATGCATATGCCTGTCCCTCAAGC
CATGAGTATACCATGGATTTGTCAGTGGCTGATCCCTTTGGAAGCGCGAG
ATTCCCTTTCTGAAGATTGCTTCTCCCTCTGTGTAAAGCAAGAAAAATGT
GACTGCCCTGTTTGCCTGTCTTATGTTATCTCACCCTTGTAATGCTCTAC
AAAGTGATCTGCGGATGTAGAAGGTAGATGAATGTTATTAGTCGTTATGT
GTTATACTTAATTGGTACTTTTTGTTTCTCTCGTGCTTGGTGTCGTATCG
TAAGCTGGTTGTACCTGAAGGCTACTAATATGTTTGTGACTTGTTCTAAT
GAGAAGACACATGCTTTTTTTTAATCTAAAATCCTACAGTATAATGTTTA
TTTCTCTGCATTCAGTTCATTACATCTCTGTCGGCAAGTCCTTAGAATCA
CTATTTCAGTTTGCCAGTAGAGAAGCATAATATTTGGTTTTTGCTAATTT
AGCCAAGTATGTGTCTGGTCAATGGCTGTTCCTTTCACACATTTATAAAT
TGTTGACTTACATTTTTCATTATTTAGTTTTCCTGTCATGAAATATGTAG
ATTTTAAATGGTTATTTTTCTTATTCATTTAGGTGGCATCAAAAGAAATT
TGTTAAAAACTGTTTTCAGTAATTTCATGATCTCATTCTGTCATAAGTTG
TGAAAATGGAGAAGGCCGCACTTGATTTATCAGTTTGTTATATTTACATG
TCTTGAATTCAAAGAGCAATTAATATATTAATTCAAAGATGGCTAAATAA
CCAGTTTAGTCGCAACGCTCCATTAGAAATTGTTTTATTACTCTGTTGAT
CTCCAAAATCAAACCAATTTGTAGCTCTGAAATTTCATACTAAACTTGGT
TAAATTTGCTTTCTGTTATATTTGGGCACTTGCTCCTCTCGTATATTTTA
AGCACAAGCACCTCGTTCATGTTGTCACTTGTCGGTTGAAGAAGTATACC
AACTCATTTCCCACAGAAAAAGAAGTATACCAACTCATAATATGGTAAAA
GATCTTTGTTTTTCATTAACTTTCTAGTTGTAATTTCATTTCAAGCATGT
ATTATGTGTTGCTCCTACCAATTGCTAAGAGCGGTGACAATGATGAATCT
TGCGGTGCTCTAGTGATTCGATTTACATCGGTACAATGGATAGTTGATGA
ATCCAGGTGCTGCTACATTAGATTATCTGATAAGACTATCTGTTTACCTG
TGAAGTTGTGCTAACTAATAATCAACTAGTTAACTCCAACTGATAGAGAA
TTTGTTTGTTCGCCCTAGCACTCTGCTTGACAACGACAAGTGCTCTTATT
ATCAAGGCTATGAAACTTTCATACTCTGGCAAAACATTCTAGGATTCTAT
AGATGTGGTACAACATATTATCAACTAAGATGCTTCGGATGCATATTTGG
CTATTCGCTCCTCTATATGGTGGAAAATCTTGAACCTTACTGTTGATACC
TGGCCTCCTAAATTTAGCTGAGATTACAAATCTGTATTGGTGTCTGACTT
TTAGGGGCCAACTTACCAGTCAAATCACCCTAACTGAATACCTAAACAAC
CAACGAGCAAACCTGTATGCAACAAGCAAGCAGGGCCTAGTACACTGACT
CAACTCCATAATGACAGAGAACCAACAGTAACCTAGATGCACGACCAAAC
CAGACATCTTTGATTAAAGTCCCAACCAGCGCGTATACACAACAACCCAA
TCAAATGCAGAGATATTGCAAATATATACATAACTTAATTTTTCAAATGC
AGAGATATTACAAATATATACATAATTGAATTTGGTTTGTTCGAATCATA
TGCAAACAATACCAGAGTTTGTTCTACTACAAGAGCCAAAAATTCAGGGA
TGTTATACAACCCAAAATGATCTATTCCGTTCGGCAATGCTTTGTTACCG
ACTCTGGAGCAAACATGGATTCAGGACTTTTGATGCCTAAACCCAATATT
CAAATCCAGACTTGGAAATGTCCAAGACGCTTGAAACCTACTAGTATGCA
TGTGTCATGGTTAGTTGGTGCTGGGTTATATCTCTCCTGCTTTTTTTTAG
GGGGGGGGGGGGGGGGTGTGTGGAAGCCTGACGGCTCATTTTAGCCAACA
GAGTTACCACATCATTTCCCAACTTATTACAGAATTTATGATGTACGATT
CTTTAGCTAAATAATGCACCACTGTGTTGGCTTCTCTTGGGCTATGTTCT
CTGAAGAAACAATCTGCTAGAACTGCCGAGAAGGGGCACCATACTTCAAT
TCTTTGAATTGCAAGCTTGGATCAGGTTTAGGAAATCAGACTCTATACTG
ATGGAAGACACTTCCAAACTTTCCAGCAACTCGAGGCCTTTAGATAAGGA
AAATGATTCCCTTCCCCGGACAATCGTCGTCCGGGTCGAGAGGCGGAACC
GCGCGCGTTGCGCGTTGTGTGCTGGTTACGTGTTCCCTGCGGGCCCACAT
CTCACCTTTCCCCATCTTATCACTTCCCCCGTGCCTCCGCCTCTGCTCCG
CCCTTCCCGTGCGTCGTGCCGGCAGCTGCCGCCACGCCCCTCCGCGGCCG
CGCACAGTAGCGTCGGTTGCCGCCGCCGGCCGCAGCCGCCTCCGTGTGAC
CGCTCGCACATGACCCGCACATCGGCTGCCTCCGTCGAAGCTGCTTCCGC
GGGCTCCCCTTGAAGCGCTGCCGCCCGCTGCGCCTCCCCGTGACCGGCCC
CTCCAGCGAGCCTGCCCATGTTTCCCCCCGAGGCATGGCACCTCACGAAT
GGCGGCGCTGCCTGTAGGATGCCGCCTCTCTAGCACCCTAGCCCGTCCTC
GTTGGAGATGCCGACATCCCCGGTAGTCGTGGTTGCTACCGACGACCGAC
GGCGCTGCTGCAAGGGGTACGAGGGTCTGCTACCAACGGCTGATGTTGTT
GCTGCCTGTACGGCGATGGATTTTTGCTACCGACGGTCGGTGTCATCGCT
ACCGACGACCAATGGATTTGCTACAATAGTATAAATATTTCGCTACAATA
GTTCTCCTATTTTTTTTGCTACGACATCCCCGATGAGGTCTCCGACGAGG
TGACCAAAAAATTCTCCGGCGAGGTCTCCGGCGATGTTAGTTTTTTGCTA
CATTAGAAGAACTTTGTTGCTACAACCGTCTTGTGGTTTTTCTACAACAA
TGTTAACTTTTTGCTACAAGGTCTCCGGCGAGAGTCACCGACGAGTTTTT
TCCGATGATGTCTCCGGTGAAGTCGGTTTTGCTACATTAGCATATTTTTT
TTGCTGCATGATCTCCTGCGAGGTCTCCGACGAGGTCTCCGGCGGGACGT
TCTATTTCTAGAATGAACCCTCTTTTTTCTTCAGAAGCAAAAGCAGGGAC
ATATGTAGCAAAAAGGAATGTTTTGCAGCAAATGTGGGATTTGGAGCCAT
TTTTTAACACGTGGCAGCAGCGAAAGCAGGACCCATCGTCCGAGGAGCCT
AGCACATGCCTTTAGATAAAGCTAACGCCTCCGCTGAAGCTGCATCCAGT
ACATGGTTTACCTTGAAGATCTATGCCTAATAAGTGCAGTTTCTAATTTC
AGATATGTGTGGTGTAAATGGAAGATCATTAATGGTTAGCTCATGAACAT
ATATGGTAGGCAGTCGATAAGTAAATGGAAGACTAATAACATAGAGTAGA
TTTTTTCCCTAGTTCCTTTTAATAAAAAGGACAGTGTACCAATTTCTGAT
ATATGTAGGTGGACATAAGGATGGCGCCTCGATTACATGCAACTGAAGCT
GGCTGTTTGTGTTCTCCGAGCTACACAGCTTTATACCTCACAGTTACCAC
ATTCTCTCGCTTGGAACAGTATCTCAGCATGCACTATTCCCTTCTTTTCC
AGTGAACAAGCAACTGAACCACAAAGATCGTGTCGTGGCTGCATTTGAGA
ATTGAAACCTGCTGGACACAGTCGAGGAGTGCCTGTCACTGACGCTTGGT
TGAGACCTGAATTAGGACTAGAATTGCCGGTATGTTGATATTTTTTCAGA
CTACTGCAGATTAATTTCGTCCCAGATAAATGCCTAGGGCGGGACAGGGC
GTGTGCATGAGTTTTTTTGGTGCTCTACGCATCTCTGTAAGCATATTTGC
TGCCGCTTCAGCTCTTGCTGTTTTCCTTTATCGTGCAGAAAATTGTTATG
TTTTTGTACGTTCTGATTGTATCAGAGAAATGATGTTGCTACTCTTACCC
TCGGTCATGTTTTCCTTGTACAATGCCCCATCAGGATTTTTTGATGGTTT
ATAGTCCTTGTCTATATCGGCTTTTTGGGGGAGTTTTCTATGTCAAGTTA
TATATCCCTGTCAGAGACACCCAGAGACCCGCTGCCGCTGTCGGCTGCAC
GGACTTTGCCCATCGGCTTCTTCAGGTGATGGCAAGCGGAGAGGAGATCA
TGGTCCTTTGGAGATGTAGTGGTGGCGCTTTGGTGCTTTCCCAAAAAAGA
AAGAGAGGGATTATTGTGCTAGGGAGCGAGCATAGTCTGAACTTCCAGAA
AGAGATGTTATGTTGAACCCTTGAATATGCCCAACAATGTGGGGAAGAAT
GTGTGAGCGTTTGTAAATTTATAAAGTTTCATCCTCTTTTCTGATTAAAG
TGGAGAAGCTCCGATGACACGTTTAGTTACCCCACTAAAGTACCTCTAGA
GGCCGACCTAAAAAAATGTACTCTTATCCTGAACTTTCAAGGTCTCGATC
AGAGTATTAAGAAAAAAAAGTCTCGATCAGAATTCACAGTGCCTACGATT
GTATTTTGTTTCTTAAAAAAATAAATTCAGAGTGACTAATCCCCTTTGCG
ATGGGCGAGTGGTATGTTCCCTAAAAAAACAAATAAAAAACAAATGGACG
AGTGCTATGGGCTGGGCTGCATCTTTCTGTGGGCCGTGGGCCGTGGCCGC
CACCATCAACCCGTTTCCTGTGGAAAGAAGTACATATAACCCCCCTATCT
ACTGGGTTTAGATCACTAACCACCCCTAACTATTAACTGGATCATTTAAC
CCCCCTATCTACACTAAACCGGACGAACTACCCCCTCAGGTGGTGATGGG
CAGTTTATGGGGTGGTTTTGGCCACGTTAGACACCAGTTTTTGCTACGTT
GGAGCCAAGTTAGGTGATCGGTGCCTACCCCTGGAGGATCCATTGCGTGC
TTCCTAGATGGTGCAGCCGGACGGCTGCCTCCAACATCGTACCACCGAGC
TGGTCTGCTGCTGCCGGAGCAGCTCCTCCTGGAAGCGGTTTTCCGGGAAG
TCGATGAAGGTCCAGCTACCCTCTTCAGCGTTGCACACACAGTACCCGAA
GAAGACCACCTCGCGCGCCGGACAGGAGACAAGAACTGCACCTCCGCTTG
CAATGCATTCCCGTTCCTCAGCCAATCAATCAACAACCAATTTGATCCAT
CGATCGATGCAGTTAAATTCGATTTACTAGCTGCATCTAAGATTAAGTCG
GAGTAGTAGCTACCAAGACGAGAGATCCACTGCCGAGATGGCTGGAAGCA
GCTCCGTTTCCATATCACCTGAATGGTTCTTTCCTTGCACACGATCAAAG
GGAACAGCTCCATCCACTTGTTCTGCATGATGATGTTCATGATGACGACG
GCGCTGTCGGGTGGCATGTCCCTTCTGTCCTTGTCAGGTGGCAGCGTATC
TGTGCTGCTGCTTCTCGCGGCATCGTCGGGCCAGCTTAATGACCGCGTCG
TTCTCATCGGCATCCATGACCTCGCCAGAGGAGCGGCGACGCGGTTCCTA
GAGCGGCTCGCTGGTGCGGCACATCCAGGTGAGGTGGTCAGCAGCCATCG
AGGCAAGCTCCAGTAGCAGCTGTGTGTCCTGCTCCTGGACGACGACAGGC
GAATCGCGCTATGCGTGTAAGAAGGTGGAACAACACCGTGCTTGTCGGTG
CCCATCCGTTGCTGCATGACCATGAGGTCCATGGCGTCGTGCTGCTGCTC
GCCGATGTGTCGCGGGTAGACCTTCATGTCGAGGTCGAGCGGCGGCATAA
GCACCGACAGCGGCGCTGACATGCAGCTGATCCACGAGGACATCTGGTCA
TGACCAGCTGGCGCTCTCCTCCGTATCAGGCTAAAACCGGTGTTCACCAT
GGACAAAACCGCCCATCACCTCCTAGGGGGGTAAATTGTCTGATTTAGTG
TAGATAGGGGGATTAAATGACTCAGTTAATAGTTAGAGGGGGTTAATGAC
CAAAGCCAATAGATACGGGGTTACGTGGACTTCTTTCTTTCTTGAGCGAC
AAACGTCACAAACCAGTGCCTCAGTGACAGTGAGCAAGGTCTCCATTCCA
GTTCACACAGAAGAAAACCCTGGTTCCTCAATCCCCAATCCCCACTCCCC
AGTCCACATCCCCGCCAGACAAAATTGCTCCGGCGCACAGGTCGCCGGCG
ATAGAGGAGAAGGAGGAGCCGACCGTGGCGATGCGCGCTCCAAAGAGGCG
CAGATCTGTTCGAGCAGACGGCAAGCAAGTGCCACCGGGGGGCGGCAGCG
GCCAGGAGCAGGGAAGCCTCGACGACCTGGACCTCATAAGCCGCCTCCCC
GACGAAGTGCTCGGCACCATCGTCTCCCTCCTCCCGACCAAGGAAGGCGC
CCGCACGCAGGTCCTTTCCCGCCGATGGTTCCCCCTCTGGCTCTCCCCCA
TGGCGCCACTCAACCTTGTGGCGGATGATACCCTCTCCGACAACGACACG
CGCGTCGCGGTGATCTCCAAGATCCTCGCCGACCATCCTGGCTCGACCCG
CCACTTGTCGCTCGACATCATCTCCCTCCCCGGCTTCCTGGCCAAGGTCG
CCCGCTGGTTCCGCTCCAAGACGCTCACAGGGCTCCAGGAGCTTGGGATC
AGCAACTGGCAGGAGGAAAAATACCAGCTGCTGCCACGCGCGCTGACTCG
CTTTGCTCCCACGCTCACCCTGCTCAACCTCTCTTACTGCCGATTCCACA
AGCAGACCACACTACCCAGTTTTCCACACCTTAAGCGCCTCAGGCTGTAC
AGCGTGGGTATTTCGGATGACTATCTCCAACGCTTGATCTCCAGCAGCGC
TGTTTTGGAAAGCGTTCGGCTGAGCAGCGTGAGATTTGCTCGCCTTTGCA
TCAACTCACGGACTCTTAGGAGCATCAAGCTCCATCCCCTTCGCCGAAAA
GGAGGTGAGCTGGTCATTGAGGATGCCCCTTGCTTGGAGAGGTTACTGCC
AAATTTTCCAAATGACGGTCCGGCGACCATCCGGGTGATCCAGGCTCCTA
AGTTGGAGATGTTGGGTTTTTTGTCTGAAGGCATATCAACACTCCAGCTT
GGGACCTCTGTTTTTCAGGTATGGTGCAGCAGCTATGACAATTGCACGTT
CAACATACCTATACATAGGCTATTGTTTGCACCTGATTTGTTGTTCTCTA
GAAAATGATTGCAGTCAACTTGACAACCAAAATGCAAAAAATGAAGATTT
TGGCTCTCAACACTACTGGCGCTAAGCTGGGTGCAGCTATTGATTTCCTC
AAGTGTTTCCCTTGCTTAGAGAAGCTCTATGTCGTTGTGAGTATTCATGC
TAGTTGCTCTAAATGTCAAAATCAGGAGCATTTGTTCAGATTTATGATCC
GGTGAACAAGTATTTTGACACTGCTTTTATATCACTTCTTTTATCTCCAG
TTGGAACGAGGAAACGGTATGAATAATTCGGTAAACTATGACCCACTTGA
TCCAATTGAATGCTTGGAATTCCATCTGCAAAAGGTGGTGCTGAAGAATT
ACGAGGACGACAGGAGGGCATTTATTGACTTCGCCAAGGTCTTTGTTTTG
AATGCAAAAGTGTTGAAGCAAATGGAAATTGGAGTTCTTAACAGCGTAAG
CGACAAATGGATGTGTGATCTGCGTAGAAAGCTTCAGGTGGAGAATAGAG
CTTCTCGAGATGCACAAATTGAACTAAAAAGTGATGCATATGCCTGTCCC
TCAAGCCATGAGTATACCCTGGGTTTGTCAGTGGCTGATCCCTTTGACAG
CAAGCATGCGATACGCTTTCCAAAGATTCCTTCTCCCTCTGTCTAAAGCA
AGAAAAGTGTGACTGCCCTATTTGCCCGTCTTATGTTATCTCACCCTTGT
AATGCTCTACGAAGTGATCTGCTTCATTCAGCAATGGGACTAGCCGTGAT
GTGTTATGCTTAGTTGGGACTTTTTGTTTCTCTCCTGCTTGCTGTCGTAT
TGTAAGCTGGTTGTACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.