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GrainGenes Sequence Report: AA007886

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Sequence
AA007886
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007886
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGACATGCGAAGCAGCGGAGCGGCACGAGGTGATCATGGCAGTGGTGGC
GCAGCAGGCCGGCGAGAAGGAGCTCGCGACACGCCGTGTCAAGCAGGAGA
TCATCAATATCGCGCCCGACTCTGAGTGATCGCCGACCATGTCGCCGATG
CAACTCGTGGATTCCTGTGAGGATTCTCAGCGTCGCTTTTTGGTTAGGCT
TGAGGTTAGGACTGCGACTTCTTTTAGGATGATCCAATGTATATATAATC
TACTGTACGCGATGATCCGAAATTTGATCTGACCGTGTTCATGTTTAATT
CTACCACGAAGGCGGTGCTGTTTAATTTTCAAAAGTTTACTTTTGTAATT
CAGTATCTGTTTGTGCCGATGCATCTGCAAACTAAAAAGGTGTTTAGATT
TACTCTTATATATTACAACCTGGATAACTCATTATTATGAGTGGACAAAT
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GACTGTAAGAGACAGGCATGCGGGGCGAACGGCCGGACGAGGCGACGCGG
TGTGTCGCCCGCGTAAAATCTGCCCGCTGAGTTTAACAATTTATAAGGCG
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GCCCCACCCACGCTATTGATGACGCAGACAACTAACCTGACAAAGTAATA
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TCGATTTCCGCGTCTGCTCCTAGTACAATGCTCTAAATTAGCGCCTCCAT
TTTAGCGGCGGCTACGCAGCGCAGCGCCGTGCCGCCACCCTAGAAGAAGA
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CTGCCCCTGCCCATGTGCAGGATCGCCGCCTATCGCCCCACACGGCCACA
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CCCCGCTCCGCCCCATCGTCCTACCCCTGCCCTTGTCCTGCACATACTGC
CCAAGTTCACCGCCGAGTTCCATCACTGCAAGTTCACATCTAATCTTGTA
CTGTGGCTTTTTGTTCCTTTGGCACAGTACTGCGGCTAGTTCCCATCAAA
CGAGAAATGGAAGTTTCTACTTAAAATATGTATCTCCTGGGTTGTAATAA
GTTAGAAGGATGGGTTTTCAGTGTACGCCCTGATAATGATGCCCATATAA
ATTTTACATTAAGGACAACCATTGTTCTATACATGTATTGTTGACCGTTC
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AACTCTGTTCAGCATGTTTGGGCCAGAATAATTTGTGTTCATGGATTGAT
TCATTCAGCCCGAAATATAGCCTGATGCTAATGTATTGATGCTTTTTATA
TGAACACCATTAAATTTTAAATTCACATATCATCCTTGTGTATGTGTGAA
AAAAAACATGAATTGGGTTAATAGGCCACAATGTTGAAATGCAAGTATAA
TCCCAGAAACCAATTAAACGAGAGCTCATATAGATGCTACAACGCTTAAG
AAACAATGCATTGGGGGTAGTTGTGTCTAAATTTCTACCATGTCCTTTTT
TCGAGAAAACGCAAAAGCTTTGCGTTTCATTCATTGGTAGGAGTTTTCAT
ATTGATACCGTGTCCTAGAAAAACGCACTAATAGACGGTTGCTCGCATTG
ATGTTCTGTATTCCATTGGATCGTGTCTTGCCATTTTCGCTTTCTCTACT
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TAACAGAGGAAGTACCATTCATCCAGTGTTTGCTAACCACCTTGTTTCTT
TTTTTTTTTGGTAATACCTCAGATTGGTTGGACATGGATCTAATTATTCC
ATTTAAAGTTGGAGATTTCGCAGAATCGAAGTCCTTTGTTGTAGGTTTCA
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TGTATGGTTTGAGTTCAGTAATTTAGAAAGCAAATGACTACTCTCTCCAC
ATTGTTTTTCGTGCCAAAACGGTCTCTAAAGCTGAAAGTTGGCCAATACT
TTTCATTGCTAATTTGCTATATATTTACCCGGCTAATTTTTTTTGTAATA
CCATAAGTACTTGGTGGGACAAAAGTGTCATAATTTTTACGAATTGTTGG
TTCTGGGGGAAAATTTCTGGATGGGCTGGTCCCTTGGACCTCCACACCCT
CTAATATGTATAGCTGAACTTATGTACACCTTTACTAGTACACCAAAATA
CTCTAGAATCTAGTAGGACACTAACTTCGACTATATTCACTGGAATGTTC
CAGGCAGTCCTAGGACAGCACTACTATACTAACACTTACTGAAATATTCT
AGGCTCTCTTATGACAGTCTCCAACACTCCCCCTTAAGATGGGTGATAGA
TATCTATCATTCTCATCTTGTTACAAGCTGAACTGCACTCTTTATTTCCT
AATCCTTTAGTTAAACAGTTTGCAATTTGCTCGCTAGAGGTTACATGATT
TATCCTAATTATACCGTCATCCAACTTCTCCTTTATGAAGAAGCGATCAA
TCTCCACATGCTTGGTTCGATCATGTTGAACATGGTTGTTTGCGATGTTG
ATCGCCGACTTGTTGTCACACCACAAATTTAAAGGGCATTTTCTCAACAC
TTTTAGTTCTAAAAGAAGATTCCTCATCCATAACATCTCACTCAAACCTT
GCGACATAGCTCTATATTCAGCTTCAGTTGTTGACTTTGAAACCATCGTC
TGCTTCTTACTTCGCCATGACACTAAATTTCCCCCGACAAATACACAATA
ACCAGATGTGGATCTCCTATCATCCAAGCAACTTGCCCAGTCAGCATCAC
AATACCCATCCACATTTAGATGACCATTCCTTTTGAACAGTAGTCCCTTT
TCTGGACTACCCTTCAAGTACCGGAGGATTTGATTGACCGCATCCAAGTC
TCCGCTCCTAGGACCATGCATGTATCTGCTCACTATTCACTGCATATGAA
ATATCAGGTCTTGTGTGACATAGATAGATGAGCCTTCCAACAAGCTTTTG
GTACTTCTCCTTATCCACTGGTTCCCCAGATTCGGCACATAATTTATGGT
TTTGATCGGTAGGTGTTGATGCAACCTGACACCCAAGCATGCCTGTGTCA
CTAAGCATGGGAGAGAACAATCCCTTTGGGAGATCTAGCAATTTCTATGC
CAAGAAAGTAATTGAGTTGGCCAAGGTCCTTTACCTCAAATTCTTTGCGT
AGCCTGTCTTTCAACCGTGATATCTCCACCTCATCATCTCCGGTGATTAT
GATATCATCAACATATACAGCAAGGATTGCAATCTGGCTATTTGAGTGCC
GATAGAACACCGTATGATCTCCATTACACTGCTTATATCCCATACAGCAT
ACAACTCGTCTAAATCTATCAAACCATGCCCGCGGAGATTGCTTGAGGCC
GTATAGAGATTTTCTCAACCTGCATACCTTTCCTGATGTTCTAGGAGTGG
AGAAACCAGGTGGGATCTCCATGTATACCTCCTCATGTAAATCTCCATGC
AAGAATGCATTCTTGACATCCAACTGATGCAAAGGCCACCCGAAGTTAGC
TGCACATGAGATTAGGATCCTCACTGTGTTCATCTTTGCCATCGGCGCAA
ATGTCTCATCATAGTCAATCCCATATATTTGACTATATCCTCTCGCAACT
AGTCTTGCCTTGTACCTTTCAATTTTCCCTTCTGGATTCTGTTTCATGGT
ATAGATCCATTTACACCCAACAGCTCTCTTTCCTGCTGGAAGATGTACAA
GTTCCCAAGTTTTATTCCTTTCGAGAGCATTTAACTCCTCTATCATGGCC
TCACGCCACTTTGGGTCTTGCTTTGCTACTCTCCAGTCTCTTGGAATCAC
CACAGGTTGCAATGTTGCGATGAAGGCCATGTAGTTCGTAGATAGAGATG
TGTACGATACATTATTAGCTATGTCATGCTCCTCCCGGTACCAATTTGGA
GGTTTTCTAGCTCCAGCTCGGGTTCCTTTTCTTAAGGCAATGGGTAGATC
CAATGAATCATCAGTGACACATGGCTCACTCTCAGATGAGTCAACTTCAT
CGACCCCTGGAATTTGTTGTTGATGTTGCTCCCCCTGCAGCTGGATCTCA
CCATTTGTTTGACCCTGTTGTTGATGCGGTTGCCTCCTCGTATACACCCT
TAAATTTTCTTCCTCCTTTGGTTTTCTCCATCTCTCTTTATCCATAGGTT
GTCTTCTTGTATACACCCTCAAATTTTGTTCCTCATTTGGCTTTATCCAT
CTCTCTTCACTCATAGGACATGGAATTGAATCAACCACAAATCTCGATGG
TTCATCTTCCCTTGTCCTGAGTGGTTCACTCTCCCCCTCTCGACTAACAT
TACTTGTGCTAGGAGAGTCAAAGTCAAATAATGAGATGATATCCGTCTTC
TCTCCATAGAATGGCTCAAACTCTCTGAATGTCATATCCATGCTCACAAA
TGTTCTCCGCTCACTAGGACTCCAACACTTGTAGCCCTTTTGTCCAGATG
GGTATCCAATGAAGATGCACTTCATAACACGTGGATCTAATTTTCCCGCT
GAAGGTCTGTGGTCCCTAACAAAGCATGTACATCCAAATACCTTTGGGGG
AACAATGAACTCATTTTTCCCATAGATCATTTCATGCGGAGTCTTTATCC
GAAGAACTTTTGATGGCATCCGATTGATTAGATAAGTAGCAGTCATAACT
GCTTCACTCCATAAGAATTTATGCACATTCATAGTAAACATAAGTGATCG
AGCTACCTCTAGCAGATGTCGATTCTTCCTCTCAGCTACTCCGTTTTAGG
GAGAAGTATCAGGGCACAAAGTTTGATGAAGTACTTCCTTTTCTAAAAGA
AAATTGCCAAATTCATGGTTCACATACTCTGTCCCATTGTCAGTCCTGAT
AATTTGAACACCAATGTTGAAACGATTTTGGATATATGCATAGAAGTCCC
TGAAACATGCGAACACCTCACTTTTTTGTTTCATGAGATATATCCAAGTC
ATCCGAGAGTAACAATCAATGAATGTGACAAAATACTTCATTCCACTAAC
AGAGGCCACAGGAGACGTCCAGACATCAGAGTGAATCAGCACAAAGGGCG
ATGTGCTCCGGAGTCCACGACTCACATATGATGTCCTTGTGTGTTTTCCA
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TTCAGGAAATACCTTACTCATAGTATCAAAGAACATATGGCCCAATCGAC
AATGTTGGAGTATCACCCTTGCCTCATCATTACTTGCAACTGTCAGAGCG
GTGCACAATGCTCTATCACTTTCTTGTCTATCTAAGTACCATAGTCCCTT
ATGTCTCACTCTGATCCCAAGCCTCCTTCTGGTCTTCCTCTCCTCAATTA
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GAGCTCGTAGACACCAAACTCACCGGAAATGATGGAGCATATAAGACCGA
AGACAATGTAATTGACGGAGTGTATTTCACTGTCCTTTGACAAGTTGATA
AGTTCCATCACTGTTTGGATGGTCTCTTTATGCATGGGTGGATGTGGAGC
ATATGATGCAAACTCACTCCACCTACACGTGACATGTGTAGTTGCTCCCT
GAGTCTAGTATCCAATTTGAACGAGAAGTTTCATCTAACGTAGGAGCCTG
ATTTGAGATACCTTCTTCAATTTGTGCAAGATTGACAAAATTGCCAAGAA
CTTTTTTTGCCACTTTGATTGGCTCTTTCCGCACTCCTATTTGATTTTCT
CAATGTCTCCAAATCTTTGGTCGAGAATTCAAGCACCTCCCCTGATCCCT
TGGCAGTAAAAATCAACGTGTCCTTGTCTTTTGCCTTGAACAGTTCAGCC
AATTTATCGAGCAATTGCTCAATATCTCGATTCTCTCCCATTCTTGGAGC
ACCGCTATGCCCTCTTGTTCTCCCTTTATTATGTGTCTTGTTGCATGAAC
TCTGTAGCACGAACTCTTTTGACTGCTTTGTGAGCCTCCAGTCCACTCCT
TGCAAATGCTGCTAAACTATCTACAACTGCTCTGGCTCCTTCTCCTCTCT
TCCCTGTTGTAGCAGCAACTCTCCCTGCAACACCAAGTCAACCACGTCCA
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AATTGCGTCCTCCTCACTAATCCTCTGCTGTTTCCAACTTGCTGCAGCGC
CGCTAGTTCTCCTCGCCACACGCGCACTGCTGGCCACCGGTCTAGCCTTT
TCCTCTTCCTAGAGTCACCACTGAGCCTCACCTACAGCTCGCCCTCCTGC
TCCACCGCCGTGTCTCCAGCAGGGCACCTCCACACACACGAGCTCCGGCA
CTTGGTGATTCACCGTCGGCCACCTCCAGGAACCAGCAGCACCTCCACCT
TGTGCTTTGATACCATGTTGGTTCTGGGGGAAAATTTCTGGATGGGCTGG
TCCCTTGGACCTCCACATCCTCTAATATATATAGCTGAACTTATGTACAC
CTTTACTAGTACACCAGAATACTCTAGAATCTAGTAGGACACTAACTTAG
ACTCTACATTCACTGGAATGTTCCAGGCAGTCCTACGACAGCACTGCTAT
ACTAACACTTACTGGAATATTCCAGGCTCTCCTATGACAGTCTCCAACAC
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AGTACATATGCCTCTTATTCTATGTGCACCTGTAGTACTTGAGCCAATCC
CTCACACCATTTCCCTTCACTTGTTACAGTAAAATTCGCGACAAGTAGTT
ATGTATGCTAGCCTTGGAAGAGGTCGTTGTCGTTGTACATGAATGGAAAT
AGTGACTCATGGATATCTGTATAAACTCTGTTACCCTAGGATTGGATCCA
AATGACATAGGGTTGAGAGGGTCAAGATCATAGGGGTATAAGCTCCGTGT
AACTACGTCATGCTCTTTATAGAAACTTCTGCATGAACAAGGTCGAAGAG
ATGAATGTCCCTCAATTGCGGTTTATGTAGGCCTATAGTCTTGTTGATTT
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AGAGTTAGGACCTTAGACCATTGCTTATGGACTTAGGACATGTGGACCTT
AACTCTTTACTTCTCCATTTCGTTATCCTGGTTGGGCATCTTTCTTCTAG
GATTTTATTTTACTTATGAACTTCTTTATTTAGTCTTTGGTTGTGTGCGG
AGCCCAGTGGGGTATGTTCTGAACTAAAGCTAGTCACGTGGGCCTCCACA
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TGTGGGTCATAAGCAGATACCTCTATCGTGGAACCTCCTTAGTTCTTGAT
CAGGCAGCACCTCCCTCTTGGGACACATCACCTATATCCAGTCCTCCTCG
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TAGCTGAAGTGACCACTGGAATATGACCCAGTAACATAAGTTGTCCTCTT
GAAGGCTGATTGCATCGTTATTGAGGCTTAATAGTTAATAGAACTACACT
TTTTTTTGCTATGTTGTTTCCGGACAGAGTCCATTGTTTAATGTATTGAC
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AAGTAAGGTATGGGACTTTACTAACACATATTAAATTAACTACTTTTCAG
ATAAATGATATGCGTGTCACAGAATGTGGGCACCTTGAGTATTACTTGGA
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TTATCACTTGTGCATTTTTTTTGTTTTGCATATAACCTTTTTCTGTTTGA
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CTCGAACTCTTAGCTTAAGGATGTGGGTGGTGCCAGCACCTTGTTTTCCA
TTTTAGTAGACATAATTTGTGCTTCGAACTTTGGAATTATCCTTGTATAC
ACCATGAGATCCTGGAGGCAGTTGCTATACTTTATGCTATGCGCCGGATT
TTTGAAAGTGGACCTGCTAATTGTACATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATACCCAACATTTAAACAAGAACA
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GTCTGCAGGTGGTAGCGCGGGGTACAGTTGGTGTCTGTAACCTTTTATGT
CAAAGATTCCTTGTCATGATTAACTTTATCCTTATACTGTTGGCTAGACA
CCAGCAAATCTTCGAACACCAAAATCTAAGGAAGACTGAACATTGATTAT
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ATGGATTGAAGTCTTTCAAAAGAACCCTTTCAACCCAGCAAGCCAAAAAA
AGGAATCAAGTACGAGTAGTCAAATCATGCTGCGCCCTCCCTTTCCTAAG
TGGTATAGGGGGGATCAAGTCCCCGAGCACTTCTCAAAGAGCGAGCTGAT
AGCAAGTGTTCGCCATACCTGGAAAGTAGGTGATTGTGTTGATTGGCATT
GTTCAGATTGTTACTGGACTGGAAAAATTGTTAAGTTGATCAGTGACGAT
GTAGTTGAGGTAAACTCTTAGTCAGAAATTTGCTGCTTCCCATTATGAGG
ACTTTCTTGGTGTTCACTGTTAATGGAACTGGCCTGTGGATACTTCCATT
AAGTTCTTTTGCTTGTTATATGGTGGTCCAATGTTGTTATGGGACGCACA
AACAAGTTTCTTGATTATGAAGATGACACACACTGATAAAATCACATTAT
ACAAACCTCCAACTCTGGACAATGATTAAAATATGAAGTGGGGCAAATTG
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AGATTATAACAAAAGTTACCAGATATAATAATTCACATCTTCCTGCTTGA
CATTTTTCTGCAGGTGGTTCTGGTTGAACCTCCCATAGGTGAAGGTGGGC
CCCCTCATCAGGTTAACCCTAAGGACCTGAGGCCCGCGCTTGATTGGTCT
ATCATTGAAGGTTGGACTGTACCTCTTTCAGCGGTAAGTTTCTAAAGCCT
AGGTTCTAGCTTCTGAATACATGTTAACTTATGTTTATGGTAGAGATAAA
TTTTGACAAGTTTTGGATTAGTTTATTTAATTGAGTTGATTATTTTTTTA
TGCCACAGATAAAATTGGATCTATTATCTATTTTTGTGGACAACTTTATA
GTGTATTTATTTATGGTGTCAGGCAAATGGGAAACGCTGGTATGCTGCTC
GTCTGATTCATCCTAAATCTGGTACTGTGATATTTTCTGGATATTGTATG
GCTCTCATGCACATCAGGAAAATGTTGGCCTGGTGGCTTTCAATACTTTA
CATAATTCTATAGAGCCAAGATCATAAGTTGGAAAGTAAAAACAATAGGC
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AAAATTACAGGAAAAATGAGGACAACTTTAGGCAAGTTGAAAATACAGCA
TATTATGACAGCTCGTTTAAAGGCAGTAGGTGAATATGCCATGTGGTCTT
CGTACTTTCCTTTAGACGAGCTGACCTAATATTTTGACAACAAATTAGTA
ATCAGCCATATCATAAGCCACATTATCCAAAAAAACTGTAAGCATAGTTC
TTTGTTGCCTGAGCACGGCTGGGATATTTTGTCAATCTGATTCAGTGAAG
TGTATTATTTTTCCTTGGTAGTTTTTCATGTACTGAAATAAAGGACTTCA
CGGGGATGTTAGTCCATGCAAACTTATCGTATTTGCTATTCTCTGATGGC
AGGTATAGAAGAGAGCAAAACAGATGGAGATGAAACTCTGAAAAATATGA
TGCCAACCTCGACTCACAAATCACCAGACCCTACTAAACGAGGTACCCAT
GGTTCCAGGAAGCGACAGATAGCTCCGTCTGAGCTTGTTCAGCTGCAGCC
TCTTGACACTATCAAAGGTTCAACGGCAGAACCAGAGAGGCCCTCTAGCG
GAACTGGAGCCCGCCGGTACCCCTTACGAGTCCGGAAGCCTGTGAAGAAC
GCATTGCTGCAACAGAAATAAGCTGGTAACAGTGCGCACTTCATGACACC
CCATGGGATCGTGCCATCACAGCCATTACGTTATACTAGATACGCATTGA
CACGAGGAGATGTTCAATCAGTGTCTTTGCAAAATCTGCCACATTGGCGG
CTTACCTGCCACATTGGCGGTTGTCACGACATTTCTGATGAGAGTGTCTA
GGGCAACATTATGAATTACCCACGTAAAAAAACATTATGAGTTACCGGAG
AGCGGGTGAGCGTTTCTGAGTTCCTGGGCTCTTGTGGTCAGGCTGGTTGT
TACTCTGGGCTTGTGATGTATCATGTGGTTCTGAACTTCCGGGTCAGGAT
CAGATGTGTTACACCAGGAAATCCGTGATGAAAAATATAACCTCGTGGTT
TCTTCAAACTGAACATAAGCTTAGGAAGACAGGGGCAAAGTGAGAAAACA
TCATGTGGAATTGTAGATGCCTGAAATTTTGTTAGGGAGTAGGTAAGGAC
TACAGGATTTGGGTCTTGTTGATACTTCTTTTTGCGGGGAGGGTCTTGTT
GTTACCTGGTGCCAATAAATTATGTTTTGAATAGGTATTGATCTATGAGT
CATTATATACAGCGGTGTTCTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.