Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA029933

[Submit comment/correction]

Sequence	AA029933
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA029933
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAGACCCCGCCCGCAGCCCCACTACCACATCGCCTCCTTTCCTGTCCC GCAAGAAAGGCCGGGGAGCAAAGCGAGAAGAAATAACTTGAGCAAATCCG TCGCCGCCGAGGCCTCGAGGTCGAGGGCTGACGCTTCCTACACCCCAGCG GCCACGCTCTCTCTTCCCGGCCAGGGGCTGGAAGCGCGGCGGGCGCGAAG CGAGTTCGCCGCCGGATCTCGGTCTCCTCCGCCCCTCTAAACCGTAAGCC CCAAGCTCCCTCCCCTTTTCGGTTCAGTGGCGCCGCTGTTAGTTGAGAAG GTTCCCTTTCCTGCGATGTTGATAGGGGTTCCTAGTTTCTTACCGCTTCT GGATGCCGCCGTCACTACTTGTAGAACCTTCTCCGTGCGCCGTCGGCTTC AGTTCCGGCGTTTCCATGCGAGTTTTATTTTGACTGCTGCTCTTCAGATT GTTCGGTTCGGTTCGGTGTTACCTGATTCGTAGTTTATGCAAATGTACCA TCCGGGGACTAGCATGGGCTGTCGGTTTGTGGGTCGTTCCTTCGGTTCCA GTCGTAGACCCGAATTTCCCCCGCGGATTTACCTGATTTTGGTTGACGAA GTTTAGTGGCTGTGATTGGGTTAATACTGCAATTTAGTAGCTGTGCGGAC GAAACTTCAGTTCCATGGTGCCGAGAAGCCCTAACATGTCATACATCGTT GCTCTGCTGTTGAATCATGTTGTCCTCGGCCTGCTGTTAGTCATCGTTGT TACAGTTCAGTATTAACCTTGCTGTTGCTTTAATTATGTTTATTCTTCAT ATATCTGCATATATTAAATAATTTCATATTTCAGGACACAGTTTCTCTTC ACATCTTGGTTAGAAGTCTTTCCTGTGGATTACGTGCCAAGGTTGTTCTG AAGTATGTCTGGGTTTACAGCAGTTTTGCGCCGTTCATCTCTAGCAGCTG CGGGTGAAAATCTCATGGAGCTATATGTTGGGCCTTCTATATCTTCCACT TCATCGAGGGGATTCAGCAGCTTTGCAAAGCGTCCGGGCACTTCAATTAT TGGCCACCCCAAGGCAGTGGATCATCGGTTCTCTCGAATCTCTCCAGTGC CCCTTTCTGCTCACATGGGAACTAAATGGCTGATTACTTCAAAGCCCAGT TGTAATGCATTGCCAGGAGCGTTCAGTGCTTCCAGCATCTGTCGTGCTTA CTCGTCAGACACCGGTATCAAGCCAGAAGTCCCGATTCCTCCTACTGAAA GCTCCGAGGTTGTCTCTACAGGGGCTAGTACTTGGATGGATCTTTTTGAA AATGCTCGGAACTCCACTATAGATGCTACAACTGATGCAGGAAAGAAATT TCAGGAGATGACTGATGCGATTACACCCCATGTGCAGCAGTTTTTTGAGG CAAATCCAGAACTAGAGAAGGTAGTTGTTCCACTTGGAGGAACATTATTT GGTACAGTCATGGCATGGTTTTTCATGCCTATCGTCTTGAAGAGGCTTCA TAAGTACGGTTCACAAAATCCTATATCAGCACTTTTGGGGAACTCAACCA AGACTGATGCTTCATATCCCACCAGCATTTGGAGTGCATTGGAGGATCCT GCAAAATACTTTATCACATTTATGGCATTTTCAGAGATGTAAGGTTCTCT TTAACTTACCTTCTAGAGCTTTATCACTTTCTATCATGTTCAGGTGTTTT TTATTCTTTTCTGATGCATGTTATTGATCTGGACTGATGTCTTCCATTTT GGCTCTAATTGATACATATTCACATCTTCAACACTTACTGTAATTGTATG GCAGCATCTGTCTTGTCCCTCTGTTAAAAAAGTGAGAGAAGCACCCGCTG CCTTATAAAAATAATAATATGCTCTAGATTGACCAGCAAGAAAACGGTTC CATAAAATTCGAGGATGCTTTTTTACCTATTTCTTGTTAATGACACATCA CTGCAATATTCATTCATATTCAGCAATTGTATGAATAATTGTGCTTAAGT TTTACCCTGATAAAAAGTGGCTTGTTGGGTTCTGTGAATGCTCATTATTT CCGATGTTTTTTCTTCCTCAGGGCTGCAGTGGTCGCACCAAGCATATCAC CTTATTTTCCACAAGCATTGAGGGGTGCCTTTGTTCTCTCTACTGTCTGG TTCCTTCATAGGTGTAAAGCAAACTTTATCACCAAAGCTATGAACAACCA AACTGCCTTAGTGACTGATAAAGCCAGGTTATCAGCATTTAACATGGTGT CATCATTGGGACTGGTTGCACTTGGAGTAATGGGTCTTGCCGAGGCTTGT GGTGTAGCTGTTCAATCAATATTAACTGTTGGTGGTGTGGGAGGTAATGT TCTAAACAGTTTTGAGGAATAATATCTAATACTACCTCCGTTTCAGGGCT TAAGGCGTACACGCTTTCCAAAGCAAAGTTTGACCGAAAGAATTGAACAA CAAAATATTGATTATATTGTATATAATTAGAACCATTGGATTCGTATTGA AAAATACTTTCCAGTGGTACTAGTTTTATACCAAAACTCTTTACGTATTT AGAGTAATTCTTGGTCAAAGAAAAAACACGCAAAACGAGGACGCCTTAAG CCCTGAAACGGAGGGAGTATGACCATATAATAATCCATTCGGCAATCAGG GTCTGCAATAAAATATATATTTAATAACCAAACATAGTTTGTACAAGTGA GCTCTGAATAATTGTTTGTTTCGTGATGCCATTTTACTTCTCAGACCAGA ATATCTCAGTATCATCCTTTTCCTTTTGAAAGAATCTTTTACTCCTTATC AAAGCTGCATTTTATTTATTTGGCCTACCCTGCTATACAATTTAGTTATC ATTTTAAAACGAGATGTGGTCACGTATGTTTATTAGAATGATATGGTAAA TGGAGCCATGATGGACCTTTCCAGTAGGTGCATAATATGGACCCTGTATA ACTCATTTATATTTATGCTATGCATGCTAAAGTGCAGAAATTGATAGGAA ATGTTACTGCCTTCAGTTATCTGCACTTAAATATTACAGCTTGTGCTATT TCTACTCAGTGTGATGGCTCCTGATATTTCTTGATTGCAGTAGGTAATAC TTCGAACAAAACTGAAAACCTTTTTCCCTTTGCTGTACACTGCAGGTGTT GCTACGGCTTTTGCTGCTAGAGATGTCATGGGTAACGTGCTGAATGGGTT CTCCTTACAACTTTCTCAGCCATTCTCAGTTGGAGAATACATAAAGGTGC CTTACCATATATGCGATCACTTTTTCTGGACACGTATTTGCTAGAACCAT AAGTTTACCATGTGTACTCTGAAATTTCGTTAATCTGGGGCTACCATGAG CTATCCTATGCACTATGAAATTTTGTTGCCCTGGGACTCGCGTATAATTC TTTTATCTAGTACTAGTACAGTAGATTTTGGTAACAACAATGATTTGGTT TGCTGTGCGATAAACGCAAGTGGTTGTAGTAAGTTGTTAAACAGTAACAT TTAGAAATATGAGTTCATGATTATCAACCCCTAGGAGAATAGGAGATGTT CATCTTAAGCTTGAGATATGTGAGGGCATGCTCTGACAGAAATAAAACCC AGATCTGATAGCGTTTAACCACTACATTGCAGACAACTCTCCAGCAAAGT GATACCAACTGACAAGTCATGGCCGTTTAGAGGCTTTATGAGGGATGAAA CAAAGTCGACCCAAGACATGAAAACCTACTCTTACAGTTATAACCACTGC GTTTGTTTCAATGGATAAACACACTTCCCCAAAATTTCTATGGTTACGAA TATCCCAAATTTCTAGCGCTATTGTGCTTATGCAACCAAATGCTATTGTG CTTTCAGCACTTGATAATATTAGATACGTGTCCCTGAGGAGGAAGTGTTT CATGTCTTTCTAGTAGTTGAGGGGGTAGGGAGATGCTAATCATATCCTGT TGTCAGTCAGATGTTACCTTATTTTTTACGAAGTCAATGTTTGGAGATAA TCATAGATATTCACAGGCCAATTATTACCTTTTATTGATTTATAATTGTG TAGCATATGACATATAGAGACTCAAGTAAAGAAAAAAACTGTTGCAGGCT GGGTCGATAGAAGGCACGGTGGTTGAAATAGGACTCACTTCTACATCATT GATCAGTCCAGAAAAGCTTCCATTCACAGTACCCAACTCTCTGTTCTCCA GTCAGGTATCATCACATCTTCGTTTACTGGATACTTATATATTCTTATAG CACAGGTTATACTTACATGGTGACATATGTTATGTGTCGCAATGCACAAC ATCTTGTATTTCCATTTGTTGGTCATAATCCTGATTTTGCTGGGTGCGTT ATTTTTGCATCGTGTTTTTCTTGGCACTGGGTGGTATGGTATCACTCACT ACGATAGGCTGGATTTCCTCTAGTTAGTAATCTTTGCTGAAATGTTTTAC ATGGATTATCTTAGGCAACTTGAATGAACCACTTTGGCTTTGCACATGAT GTATATGTATATCTTACACATATGACCCTGGAACCATCTTATATCAACAT TCCACTACTTGGAGTACGAACACCCTTACTATCTTTAACCAATGTTATAA TCACTAGACACACCATAAACAACATCCGAAATACCTAGGAAACGTGGAAA CGAGAATATGTGGCAATCTCGCACATGTATCTCATGCAATAGCAAATTTT TTTTTTTTTAGCTATTGTTACTATAGCTCAAGACAAACAAATTAAGAACT TAGTGACCGCATAGTTATCAGTTTATCCTGCTAAAGCTTGCTATATCCAT AGATAGTACTATTTACTGACATTTAATATGTTTTCTCCAGACCACAATGT GTGGGAACGTTTTGCAGTGGGTACATCTTTTTAACAGCTTAGGATTTTCT AATAATGAACTTTTGTGTTGAGTTGGTGCAGAGGCCGGCTGTACTTGATA TATTCTTAATATTAATATATTGCCCTTTATCGAAAAATAATGAGCTTCTG TATTTATAGCCTTGTTCCTGTTGTAATGCAGTTTTGAGTAGGAAGTTGTT CAAGCGTGTTCATTCATTTTGTTAGTTAAAATATCCTAGAAAGATCACAA TGCATGTGAAGAATATTGTTGGTAGGTTTCTTCGGTGTATTATTTATGTC CTTCTGTTATTGAATCGGATAATTAGTATCAGCGTGGCTTACGTTCTCAC ACGGGATCCTTTGAATAATTTGCAGATTATAGTGAATAGGTCACGAGCTC AATCACGAGTTAGTATTACCAAGATTCCTATAAGACTTGAGGACATTCAG AAGGTTCCTGAATTATCACAGGAGATAAGGGCTATGTTAAGGTCCAACCC AAAAGTTATCTCGGAAACAGATGCTCCTTACTGCTATCTCTCAAAACTGG AAAATTCATATGGAGAACTCGTCATAGGGTGCATCCTCCAAAAAATGGTG CGTTAAATTTACTTTTTCCTTAGTTATTTTGTTGGATTCTGGTGGGGTAT TTTTTTGGATGATACGGTGAAAAGTAGTGGCTTAATTCTCACAGTAAGGA CCAGATAAAGGTCATATGGTGATAACCTGGCAAGACTGCTTGTCTGTTGT ACTTGTACTGTTGTACATACATGTTTCTCTTAGACGTCTCGTCCGCGATC AAAAGTAGAAGAGAATATATGTCTTGGAATGTTACATATCCCTTTGCATC AATGCATTAAGCATAAAATGGTGATCAACACTTACTAGATTGCATCATAT CAACCTGTTCTGTTGAGTCCTAGTTGTAAGCTGCTACTGGTGTTGTGGAG CTGTGCAACAAGACCGAGAAATATTGTGTCTTCTCGAAATGCAGAACCTA CCATAACACATTTTCTGTCAGTGTCTGTCCAACTTAATGCGGTTGGATGT TCCACAGTAATGCAGAACCACCTATTTACTAGTAGGATGCTGCAGTTGTT TATATCCTCCCACGACTATTCATAGTTGGTTATTATCAATAATTCACCAC AAGGGGCGTAGCCATGTAGAACAATGTTTTTACCGTTTTGGAATCTTCTG TACTAGTGCAAGTTTAGAATACTTATCGCCCTTTGTTTTTGTTGTTTGAC ATGAATTTCTTGCACACTTTCAGAAAAAGGATGAGTTGCTATACGTAGAA CAAGACATCCTTTTGGCAGCTGCTGGGATTATCAGGTCGCATGGCGTTGA ATTTGGAAACACCACCACGCAGTGCTGTTGATTCTGATGTTTCTCAAACT CAAGTAGGGTAAGTATTTCAATATTTGGCTGTTGTACCCTGTAGATGAAC TGTCTAAGACAGTAAGAAACAATAGTAGTTGTCAGAACGAATCAAACTGC TATGTTAAGTTTTGCTTTCTATTTTTCCGTTCACTCATTTTTGGCATTTT TTCTAGCTCAAATGTGATGTCGCTAGAGATGCAAGTGGGTCACCGTGAGG GTACCTTTTACCCTCTTTAGTTCAAAAAAATGAATGATGATCTCATCAGA GAAGTTAGTTCATTTTTGTTAAACTAAAAAGAGTAGAGGGTACCATATAC ACTTGCATCTCTAGATATCGCTTTATGGTTTCAGTTCCTCACAAACAGAA AATGTGCCCATAGATATTTAGCTAGCATGAAAACAATTTCAGAGCGTCCT TTAGATGTGCATCCATGTTTCTTTCTTTGTGGGTTAAAACAATCTCTATA TATTTTCATGCACTAGAGGTTAACATGTGAACGCTATGCAGCCTACCTCT GATGTGAGCTGCTCATTTTAGCTGGTGCTATAATATAAGCAAACGTGATT GGATGGACCATTTTTGCTAGCCTATTATAATAACGTTTAGTTTCTTATTA TACTCTGTATTACATTACTGGGTTAAGTTAGATTTGTATACATTTTTTGA CTGAGGGAATTGCATATTTGGCAGGTGAATCTCGTTAGTCTGCAGGAGTA CATACGCGGTGGATAGGAAATTTTGCTTGGTGTGGGAAGGCAAGGACCCC AGTCTTTCATGTCTTCAGATCCTCGACTGCATATACGAATGTTTCATTTG GAACGAAGGTCCAGTTCCACTTTTGTTGCCAGAGAATATCACTGTCTGTC AACCGTTAAACTTGTTTGCTACGTTTGCTGGCACTGGTTAGCGGGTAGTT TCGTCAAGTGTTGCTAGCTGTGGTAACTTGATGGATATCTGACTCTCGTA GTCGTAGAGCTTTTACCATCATGATCCACCTGAACTCTGCTCCAGTTTAC CCACCGCGTCAGGGACCAGCGTTTTCCCATATGTGGCCTTGGAACTCTAA ATGCTGGAACATGTTCATGCGTGCAATTGTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.