Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA026905

[Submit comment/correction]

Sequence	AA026905
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA026905
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	AAAGCCTCGGCCAAAAGTTCCAATTTCACCCTCCCACTCCCAGTTCTTCA CCCAATTCCTCTCCTCGCCCAAATGCCGGCGAATCCCGAGCCCTTTTCGA AGCCATGGCCGCCGGCGACCTCTACCTCCCATGCCAAGACCACAACCCGT CCCTTCATATCAACCGTAGGCTGCGACGACGACGACGACGACTTCCAGAT CCCTCCCCGCGCCAGCCACGCCCGCCCCTTGAAGCCCTCCAATGGCGCCG TCTCCCGCCACCTCCGCAAGAAGCTACAACTTCCGTCTCCCTACTCCGGG AAGGAGAACCGTCCCTTCGCCAGCGGCACGGCTTCCGCGGGGAGCGCTGC TGCAATGGCTGCGGCGGCCGCCGAAACCCTAGCGGCGGGTTCGAGGGTTG GTGCCGGCGTATGCCGGGTACCAGAAGACAACGGAGCGACGGGTGGAGGA ATCTGCGGCCTATTGAGGTCCGGTTCCGGTGACCCCAAATTAGGCGCTAC CGAGGAGAAAAGATTGGGCGGATACGACGGTTGCAAGGGGAGTTCCAGCT GCTTCCCCAATTCGACGGAGTCGAGTGTTTTGGAGCCAGGTGATACATGT GATTTGGGAGGTGGGCACTCTGAAGAGGCGAAAGGGGTCCCCGGGGCTAG TAACCCAGTTCCAGGGGAGGGGCTGATGGGCGGAAGATCTGGTTCATGGC GCCATGGCCCTGCCTGTAATGAAGGAGATGTGGATGTGGATGCGAAAGCT GAGGTTGCATCTCGATCCGAGACCGAAAGGAATGAGTGGAGTGGGTCTGG AGTCGATGATGGGAATTACCACTCACATTCTATAGAATCAGAGATTTTAG TATCAAGTTCAAAACATGATCTTGAAGGTGCAGATTGCAAAGATTTCCAA GAGCCTCGTTTAGGGACCTGTAGCTTTGTTTCTGAAGAGAGGAAAGTTGT GGCAGAAGATGTTGCAACCTCCAATTCTGAGCCTGCAGAGAAGAAATCAA GTTCAACTGCAGATAGTGTGGAGTATGACTGCTTGAATTCAGTTGAACTG GAATCAAGTAAGGTCCATCATTTTGAAGCTGATGACTGTGATGATTTTGA GATTGGGACCCAGCTTAATGAGCTCATAAACCTGTGCATGGATGATCAGG TGGATAGTCATCGTAACAGTAAGGTGTCTCCTGTTGAAGAGAACAAAATG GATTCAGAGAGATTTGAGTCAGTTTATAAAGTGCAGTGCCCATTATGTGG ATCTGATATTTCTGATCTGAGTGAGGAGCTGCAACTAGCACATACTAACA ATTGCCTCGACAAAGATGAACCTGCAAAGGTGATTATATAAAACGGCAAT GCTAGTATAGTGTTTATATTAAGCATTCATGATAAATCGTTGGGCTTATT ACAAACCTTAAATGTTATTCAGTTTATGGGAGCCTTATGTACTGATATGA TTCTTTAGTTTTTCTATCAGTTTTCACTCTTAATCCTAAGCTCAAGCATC TTTAGTATTTCCATTAACTGTATATTAATTTTGGTCATGTGGCCAGTTGC TGGACATCTTTATCGGCTTAGTTAGGATGATAGATCAACATATCTTCCAA TAAATTCATTTTGGCAACACAGATTAATTCTTGTTTTTTCTATTAAATTT CGCTCTTTAATCCTACACACACGATATCAAGTATTTCCATTCACTGTGCA TTAATTTTGGAGTCTGGTCTTGTGGACTGTTGCTGCTCATTGTTATCTGC CTAGTTAGGATGATAAATGAACATACCTTGCCAAGAATTAGTTGTAGATT GTGGCATATCAGTAATACAGGGACTTCTATTTCTGTATCATGTTAACATG AGCACACACGGACTCAAGTGAGGGGTGGAGACTCTTGATTTGAAATCTTT GGGTTAATGATTTCATCACTAACACAGATAGTGAAGATAAAGATAATTTG ATGTTTCCTACGGCATTCTCCAATAGTTTATTTTATTAACCGTTTCTTAT GAGCATGATGTTTAAATTACCTCTGTTCCAGGAATCTGATCACAATCATG AAAGAGGACCTTCCACTGGAGAAAACATTGAAAGTGAATGTGTTGTAGAA TGGTTAAGGAACCTGGGGCTATCTAAATATGAGGAAATTTTTACCAAAGA AGAAGTCGACTGGGAGACCTTGCAGTGGCTCACAGAAGAGGTAGTTACTG CATAAATCTTGACATAGATATTTATTTTTCAAGCATTAGAGCTTAAGTTA TGTGATGTACCCTCTTGCAAACTGGAAGTTGTTTCTGCGTGCACTATTCT TTTCTTTGGGAGGGAAGGAAGGGGGCATGTGCTGACCTTCCCTTCTCAAT TAACTTTCAAGAGTACCAGTTGGTGTATTGAATTTGACAGTCCTTCTTCT AGTTATAAGTAAAAGAACTAACATATTGCTGCCTATGGATTTCAGGATCT TCTAGGTATGGGGATCACTTCCCTAGGACCTAGAAAGAAAATTATCCATG CTCTGGGTGAATTAAGGAAGAAAAATGATCATACGAATGATGCAGAAGCA GATGTGTTAATTTCTGAAAATACGAATAGAACTAAAGTCCCAATGAAAGG GAACAAGTTAATTACGGAATTCTTTCGGTGTTCGTCATCTGATCAGAAAC AAAGAGTCCGCAAAGTTCAGAGAACATCTAGTTTGAATAACCAGAAAAGT TCTAGTGCCAAAGTGGCTACTAGCAGAAATCGTACCCGTAAAGCAAAGGT TAAAGATACACCTGTTTGGTGTTGCATCCCAGGAACACCTTTTCGAGTGG TATGTCATTTCTGTACACAAGTCAACTGGAACATTTGTTCATATGCCAGT GTGCTCTGTAACTAAATATGTTGCTGCAGGATGCATTTCGCTTCTTACAG GGAGACTGCTGCCACTGGTTTTTGACACACTTCCATCTGGACCGTAAGTC AATCTTCTTTGTTGCCTTCTTGAACAATTCCAGTGGCAACAAATAAAGTA ATTATCATAAATGATTGCCAAACTTCCCGTGTACATGTTTTTTCTCTGTT TGAATAAAGGTTTCTCACTTAACTGGTAAAGTAATTATCATAAATAATTA GAGCATACAAAATGGAGTCGCAAACAACCTCTTTGGTCTAAAGGGATATT GATGTGTAGACAGTTTTTTTAATCAAAGAACCGATTTACTTGTCTCACTT TCCGTTGAACCATCAACCTTAATGTTTGTCTAGACGATTAACTCACCACA TGTATTATTCTATTTTCATGCCCATTGGTTGTTGACTCTATCTCTAGTTG TATGTTTTAGTCAAACAAGTCCTTCCCACCTCAGTGATGCTAGGCACTTA TGTAGTTATGTTCGATGTTTTGGGTGCCTAAGCCTAACTCTTTGTATTCA ACAGATTACCAAGGCCTGACTAAGAACTTTTGTCATGGGAAGATATACTG TTCCTCAATAACAGCAAAGCTTGTACACCATAAGATTGGTGTCACATGGG ATAGATTGCATGTACTGCCACTGAACAAAAGGGTTACTGTCGCAGGAGTT AATTTGACATGTTTTGATGCAAACCATTGCCCTGGATCAATCATTATCCT TTTTGAGCCATCCAATGGTAAAGTAAGTGTTGTTCTGATTTGCTTCTCTC GTCTGTTTGGCACAATTAGTTAGTATCTTATTTTCTCTTGCTTGTGTTTT AGGCTATTTTACACACTGGAGACTTTCGATTTTCTTCTGAGATGGCCAAC AATCCTGTTTTGCAGTCTTCTCACATCCACACTCTAATACTTGACACAAC CTACTGTAATCCACGAGTAAGTATTTTTCCTGACCAAATGTGGTACCAAA GTTAGAGTTGAGTTTTTACACGACCAATCTTCCATGTTTCCTTCATACGA ACTAAAACTCGTTTTGCAGTATGACTTCCCTAGTCAAGAGATTGTAATAC AGTTTGTCATTGAGGCTATACAAGCAGAAGCTTTCAATCCAAAAACACTG TTTTTGATTGGTAGCTATACAATCGGTACAGCCTCGTCTTTGCTTTCTTT GATAATCAAGTATTTATGTATCTCATGTCCTCTAATGTTCCTGGTTGCAG GAAAGGAACGATTGTTTACCGAGGTTGCTCGTTTGCTTCAGAAGAAAATA TTTGTTGGAGCTGCAAAGCTGCAAATATTGAAGCACTTGGAGCTTCCTCA GGAAGTCATGCCCTGGTTGACAGCCAATGAAGCTGAAAGTCACATACATG TTGTGCCGATGTGGACTCTAGCGAGCTTCAAACGGTTGAAACATTTATCA AGTCAATATGCCGTAAGGCCAACTATTTGATCCTACCAGTTATATACTAC TACCTCCGTTTCAGGGCTTAAGGCGCACACGTTTTCCAAAGCAAAGTTTG ACCGAAAGAATTGAGCAACAAAATCTTGATTATATTATACATAATTAGTA TCATTGGATTCGTATTGAAAAATACTTTCCAGTGATACTAGTTTTATACC AAAACTCTTTACGTATTTAGAGTAATTCTTGGTCAAAGAAAAAACACGCA AAACGAGGACGCCTTAAGCCCTGAAACGGAGGGAGTAGTACATATTTAAG CTATTAGCATCTCAAAGCTACACTCACTTTTCAGTATTGGTCATGTCTCA TTAAGTCAGTTTCGGGTCAGCCTGCCACCCATTACTATCATACAGGCTGA CATAATGGTTGTATTTAACTATTTAGTTTGCTGACCGCAGTCCTAGTACA TACACATATTCCTACTAGTATGCAAACTGTAATTGCTCCACAGTAGTGAT GATGTTTGATCATTAGTTCAGTACTCATGGATTTTACAGTAGGATGTTGC TATGCATCACTTCTTACTCCAAAGGAACAATGTTATTGCCATGTTCCTTG GTACCACCTATCATGATTTTCTGATAGCTACTTTGCTTTTAGAACCGATT TGACCTCATCGTGGCATTTTGTCCTACTGGATGGGCATTCGGTAAAGGGA GGAAAAAGACACCAGGGAGAAGGTGGCAACAAGGAACAATCATCAGGTAC TGTTCTGGAAGTGCTTAGGTAATATTGCCATTTTTTAAGAATATTCGCCA TGTTTGACATGGGCAGTTTGACAATGTCCCCAACATGCAACTTTTTTGTC ATGAATATGACAATACTTTTTCAGAAATTATATTATGGAAGCAGTTTTCG TGACAATTCATCTAGTGACCATTCCACCTAACAAATACTCCCTCCGATCC ATATTAATTGTCATAGAATCGGATGTATCTAGACATGTTATAGTACTAGA TACATCCGATTCTGCGACAATTAGTATGGATCGGAGGGAGTATATCTTTT TTTAAACGGACTATCATTTTTTTAGTTCTTAACTTCTTATAGTAGACAGC TATATTAGTTTGGCTGCAGTAGTTCTATGTTTCTGAACAGAGGGAAAATG ATATTCACACTGTTTGCCTGCATGAAATAGAAAAACAATATTCCAATACT ATTTAGGCTTTTTGCTAAAGAGGAGTTTAGTACTGTAGTTTTCACCTAAC TTTTTAAAATATTTGTTCAAAAGATATAACACGGTTCTAACAGCTGGAGT TCACATTCCTTTGGGCAAAAACCAAATGCACTGTTGTCAGCTTTCAACAT GGTTAAGAAAAATGAGTTTTTTCTTTGTTCAACATTTTAGAAGCTATCTT TATGAAAAAAAGAACTCTGACAAGATGATTTACCTTGTCCATGCATCGAT CTTAAAGTACTATTTGCTGTTTCTTAACCTCTGCAGATATGAAGTACCTT ACAGTGAGCACAGTAGCTTCACGGAACTCCGAGAGTTTGTCCGGTTCATA TCACCAGAGCATATAGTTCCCAGTGTGAACAATGACGGCCCTGAGAGTGC GGATGCTATGCTGACCCAATTGTTAAATGACGACTCGTGAAAAATATCAG TCCACCGTGAATCCATGACGGCCTGATTACTATCTACTGTTTTGAGGTCA TCTACATCAAAGTCCAATGGTTACGGAGCTGAAGGTAAACAATGGGTTTC CCTTGCTGACGCTGATGCCTGAATTTCTGACGCGGAGATTGTGGTGCTGG ATCCAGGATGTTTTCTGTTGGCAGACCAGTGCAAATGATTGAAGGCAAAT TCTCAGCTAAGCTATTACCACTGGACAAATGGTGCGGCGCGATATATGCT CGTGAACGATTCACGAGTGAAAAATGTAAAACGACATGTGTGCATCAAGC TTATGAGTTTGCACAGCTGATTGTCATTTTGTCAGTAGCTTGCAATACAT CATGACCTCTGTGATGGACATTCTATGATTGTAGTTCTGGTTTTCTGTAC CAGGAGTTGGGTTCCAACATATTTGATTTCTCTGGAAATATATGTCGGTA CATGTTTTTCAGGATTTTTTTTTTTAGAAACACGGTACAAACGCAGACGC TCACAATGCGTTTTAGGATTTATCTTTGACCAATGAATGGTTCAATGATA ATGTGCATGGCTTGATTGTTGGACTTGGCACTTTCCAATGATATTGTTGA GCTAGTTTTTTTTTACAATGATTCATGATAAACCTTAGAAAACATGATGA TTTATATTTCTGGTTTCCCATTGTTTTTCTTCCTAATTTTGGCGGCCGTA CTATATATGCACCCTGCTGGGCTGGGTCGCCGTGCAGCTAACATCATGAT TGTGGTAGCGTCCAAATGGGGTGTACGCGGAGCCCATGTCATCGGCCGAA GTGGCACGCTCGGCCCAGACATCCTACGGTGCAGATGGTTTCAAGCGGTC CGAATCTTGGCGACCTCCATCTTCTAGAACAATCCAGCGGCATCCTTTCT CTCCTCCTAAACTCGAGGGTAAACCCAAATCCTTATCCCAAAGCTTAGCA ACCCCTGTCTCGATTTCTCCGAACCCTCGCTCCACCACTCTCCCACTCTC TCGAGCGCGCTCAGCTGAATCCTGCCGTAGGTACGCCCCCCCTCTGAGCC TCGGAAGCTAAGTTTTGTCGGATCTTTTTTCGTATTGCACGGTGTGATTT TGTGAGCTGTTGGCGGGTTTGTTCTGGCAGGAGCCATGGCGTCGGTGCAT CTGTGCGGGCCGCAGGTGGCCTCGGCGGCGATGGTGAAGCCAGCGTCCGC GGACGGGCTGCGCATTCCGGCCTCGTCGTCGCGTGCTGCGCCGACGGGGC GGAGGTTCCGAGGCCTCGTCGTGAGGGCCGCCACGGTCGTGTCGCCCAAG GTAACAATGATTGGGCCACAAACTGCTAGCTCAGCTGCTGTATGCCTGTA TACTTGCATAGTTTGTGTTAGTTCTACGGTTGTACGGACATGTGGTGGGC AGGGTTTATTAGATGGAGGCCGATAATCTGATATCAGTAGTCGGTGTTTT GTTGGTTAGAACGAACTCTATTAGAGTTACCATCATTTCCCATTAACGAA ATATTCGGTACTCCCGATTTAGGAAAAATATTGCCTAAAATCTGTCTAGA TTCACTGAATTTGCGTCAATTAATTTGGAATGGACGGTGTAGAAATTTAG TGAGAATCATAGGTTTATACCCGTCTCCGTATCCGGTGGGCTTGTGCGTG CCTGGTGGTGTGCGTCTGCCTTAAGGAAGGAATTTATAGCAAGCAACAGT TGAATTTCAGTAACCAAAACATTGAGTAAACGACAAGTGCAAAATGCCCA ACTGAAGCTTAGAGTGGTCAATGGTGATGTAGATTTCGTTTGGAGAGAGC GAAGATCAGTTACTCATTACGAATGTGCTGGCACCAAAACCTTCTGTAGT TCTATTAGAAATCACACTCGCGGAACAAATCCTTTCCTTCTTGTGGTGTG GCTAAGCGTGGCATGGTTATTCACCAACCAAGTAGGTCATGTGCAAAGCA GCATACTTAGACCACATTGCCCACCCTACATTGCAGTTGTGCTAGCGATG TGGGTTGGTTGCTCATTACAAGTTAGCCTCATTACTGTTTTGAACATCTC AGAGTGTAATGTGCAAACCTGTGGCTTTTTACCTAAGCACTAGTGTTCAT AAACTTGTGATATGTGCAGTACACATCCGTCAAACCATTGGGAGATAGGG TACTAGTGAAGACCAAGACCACCGAGGATAAAACCGCGGGAGGGATATTG CTTCCAACAACAGCTCAGTCAAGACCACAAGGAGGGGAGGTTGTTGCAGT TGGAGAGGGGAGAAGCATAGGCAGCAACATCATCGAGATCAGTGTTCCGG TAATGTACCCTATTTGGTCGACTAAGATTATCTGATGTTTGATTATTAGT CCTATACCTGTTCAGCTGACCATATAAGCAAAGCTTTTTTGCCCCGTTTC AAAAAATATAAGCAAAATAAAATGGAAGATAAATCACCTGAATGTGTTGT TACTGGAGTTCCAGCTGTGGCTAAAAATAAAAGCCAGTTAACTGCATGCT TTGAATCTTTTCACATTAAAGTCAAACTCTTTTTTTTTAAGACAATTATT CACACGAGCCCTTCATGACCACATGCTATTATCCTATCCGACCTATTATT TTACTGTGATGGGAGAAAGTAACAATTTATTATCTGGTTACAGGTTGGTG CCAAAGTTATTTACTCAAAGTATGCTGGCACAGAGTTGGAATTCAATGAT ACTAACCATCTCATTATGAAAGAAGATGACATCATTGGTATTCTTGACAC TGATGACGTGAAAGATCTGAAGCCACTGAGTGATCGTATTCTCATTAAGG TCTGTTTTTAGTAACATATTATTTCGACAGTCTTACTGAGTCGTCACTGT ATTCCTATTACGAACACAATTTTTATTCGAATCCTGTCTCGTTCAGTATT GCAACTGCACACTCAATTTAGATAGGTCATGGTATCGTCAAATAATATTC ATTGTTATGATCAAGTTTGGAACATGGCATTATGGTGTAGCATCTATTTC AACAGAAAAAGCGTGAGAGCAAGAGCAAGACTTGTGGCATTATGATCGTA TACTCATTAAGGTCTGTTCAGAAGATAATTATAATCCACTAATGATAGGG TAAGGAATTGTGAACAAGAGAGCAAGAATGCTCTTTCGAGTAAAACACAA CGTAGAGCAAGAAAATACCTCTTAGGTTGTTTGTCTGCTCTGGTTTGTTC ATAGGCCTTGTCAACTTGATTTAATAGAAACAGAAAAACCTGCTTGTATA CCTCTTCGTTTTGTGCTTTCCTTGCTCGTCTCTTCCTTTCAGTTCGATTG CCTTTGACTTCAGACCCACTGTTGTTCTATTTTTTGGGGCACTAGTAGGA CATTTTCACCTATGTTCAGTACTTCAGTGTCTGTGTGACTGCACATCATT GCATCATGTCATGGTTTGTTTGTTTCTAGCATTCAGATTTGACAGGAGCG GAGCTAGACATTTTTTATAGCAAAGGGAAAACTATTCATTCAGATTGCGA GCATCTATTTCTCTCTTTTTTGAGTATGAATTTTTATATGGACATCACCA ATATCCGTTTACTTACAAAGTTCTACATTCCCCTTCTGCATCAGGTTGCA GAGTCTGAAGAGGAAACTGCTGGTGGTTTGTTACTGACACAGGCGACGAA AGAGAAGCCTTCTGTTGGAACAGTGAGCAATTTTGTTTGTTATGCAGCAT TTGCCATGATTAATCAGATGATATGTGATCATAAATGCTTATAAATCAAA TCTAAGAACATATCGACTATAAAAAAGTTGCATCCCTTCACATAATTATT TTTCTTTATGATGTTGATTTTTGTGTCCAACATCAGGATGTCATGACCAC TTTTACTGGCAATTTGTACAACTACTTTTAATAGTTTATTTGCTCTGAAG ATTTGTATAGAAGTGTAATCAGTTAGTGACCAAAACTTCTTCTGCCATGC TGCTTTCCTGGCTACTATCTACTTTTTGATGTGGTTACCTATTTTGCTGT TGCTTTTGTGGGTTGCCCAGTTGCCACAATGGAGCCCGCCAGTACCATTT TAGGTACATCACTCGTGGTCAATTTCGAACCACTTCATAAGATTGTAGTT TTTCATGTGGAGATCCTAGGTGCATAACAGTAACGGAGTAGCGAACGCCT CATTTACTAGTAATTAGAATTTATTTTGCCCATTGTCTGAAACACGAGAA ATCATGTGTACAACGTACATCATTTTGTCTTCTTTGCATTCTATGCTTGA GTAGTTTGGGCACGGTTACATTGACTATGAGCAACCTTTGATCTTGTCGA CTTGTAGCCTGCAGTTCCGAGCCATGACCACTTGCTGACCAATATTTTCG AAAAACAGGTTGTAGCTGTTGGCCCTGGGCCATTGGGCGATGATGGCAGC AGGACTCCCCTGACAATCACTCCTGGAAGCAGCGTGCTGTACTCCAAATA CGCAGGAAGCGAGTTCAAGGGCTCTGAAGGCGAGTACATCGTTCTCAGGG TGTCCGACGTGATAGCCGTGTTGTCGTCTTAAGCATATGTCGTTTTTCAC GTGAAATAGGAATTTTGATATGGAGTCTGTAACTTTGTTTCGTTACCCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.