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GrainGenes Sequence Report: AA017030

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Sequence
AA017030
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA017030
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCAGCACAAAGGTTGTGGAGGAACAACTCCACCTTGCTGCTATAATAA
AGACAGCACAAATGTTGAAGGAACCACTCCAACGTGCTGCGCTAGATATC
GCTCTAGGGGCGTGAGCTAGATATCGCTCTAGAGGCGGGGCCGTCAAGAG
TTTAATCCAAAACTCTTAACACACAAGATCTAGTCCAAGATCTTAAAACA
GGAACACAAAGTTCTTTATTGATAGGTGAAGGTTACATAGTCTGGTCCCT
AGATAGAGGAGTGCTCCTCTATTTATAGGCTCCATAAGCCTTCACTACTT
AGTTCTACTTGTAGCTGGAACATTCCAGAGAACACTACTTAAAGCTAATA
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AGTTAGAGCTGTCTGTTTTAGCTGTGAAAAACTGTGCAGGGTTGGATGTC
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TTTTCCTCTGTCCAAACACCACATTTCTAGCTCAGCTTTCTATACTGGTC
TTGTTTACTACACATGCAGCCAACTCAGCCAAAATTTCACTTTCTCATTA
AACAATGTCAAGCCAGGTTCTTGTTGCACCCATTTACAAATGATAACCAT
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TTGCTTGTTTGTTTTATATAGCACCTTTTGCTTATTATTTATGTCTACCC
TTGAACTTGTCCAGGAAGCTACAAATTGCGTGCTTCTCATCCTGATTATG
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TTTATATTAACATATATTAAAAATTTTCTTTGCCAGGGAAATCCAATCTT
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TCTGGTGCAGATGGGAAGTTCTCATTTAGATCAATACCCTGTGGTAAGTT
AAGTTGTCTAAACTTCTTCACACTCACAGTGCAATGCCACTGGTACATGA
AATTCTTCGTTTACATGTTATGAAGATTTCCTTTTGAACATGTCCTCTTA
TGATGTCTTCCATGATGACAAGAGTTGTTGTACATGCATGTTTTCATCTA
ACTAATAATAATCATCTCCTAGATGAGGAATGCTTGTACTCTTGCAGCAT
GGATTGTAATTATTGTTATCCATTGAAAGTCCTGTTCTGTTTTTGCCAGG
TCTGTATTCCATTCGTATAGTAGTAGATATTTAGCCTACCTTATTTGTTT
TATAATAATGGTTTAGATGCACAGTATCATTGGGGTTAGTGCATCAAGTT
GTAGACATTCCTTCGGGTAGTCCCATGTTTTAAATTTTGAATGATCCATC
TTTTTATTTGTAGCGCTAAATTTTGTTCTGATGAGTTATTGGTGTCTTGG
TTCCATTGCTAATCGATATTTTCATGTGTGGGTGGGGTGATCTTTGTTCC
ATACCATTTTATGTTGTATAAAAGCATGGAAATGTTCATTTTGGTATAAT
TTTGCAGGTAACTATGAGCTGTTGCCATACTACAAAGGGGAAAACACTGT
TTTTGAAGTCTCACCTTCATCACTGCCTGTTTCTGTTGAGCATAGTCACA
TGAGAATCCCTGAAAAGTTCCAGGTAATACTTGAAGATACTATGCATCTG
AGCTTCTCATAGTATGGACTCTTTAAGTTATGAGTGAACCTGTTTTTTCT
TGAGGATGTCAGACTCTTAAGAGGACAACCTATCATTTATGGGTAACTGT
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GGATGTAAATAAGAGATGGTTGCACATGATTGAAGCATTCAAAGCAGTTA
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TTGAACTTTTAGCTGCTTAACACATTTGAGTTCTGAAACTTTCTTTATTC
GCTGTGATCGTGAACGTATTCTTGCACATTCATTTTCAGTAGTTATCTTC
CTCACTCCTGATATGCAAAACTGGTTTTGACTAAGAACTAGCATATTTTC
ACATATATCTTGCTAGGTTACTGGGTTTTCTGTTGGTGGACGTGTTGTTG
ATGGCTCTGGTGTTGGCGTCGAAGGTGCCAATGTTATAATTGATGGTCAG
TTGAGAGCTGTTACAGATAATCTTGGGTATTACAGACTTGATCAGGTAAA
GCTTATTGGATTGATTATTATTTAGCACATGTTTTGATATTGGAAGTTGC
TTTTCATCTTAACCATATCTTTATTTTCATATGAAATATCACTGTGAAGC
ATGGTTATTTGTTTCGAGAATACTAATTTCACTGGTCTGCTTAGTTATTG
AAAGCTGGTTCGTGAGGAGCTAGAAACTTTGTTGCTGACCAAATTAGTTA
ACTTGGCTGTTGCTCAGCCTGTAAGTGGGCATGCCCACGGCCGTCCGCTA
GCCTGCCGTCTGTGCCCCTTTGATTAAACGGAATTAAAAACTTGCCTGTT
TAAGTCCCGTCTCGATTCCGCGGCGTCCGTTCTAAACCCGCCAATTAGCA
ACCGAAAGCTCTACTTCTCATGCAGTCCTGCTCGTACTGACCGTCTAAAC
CAGTCCAAGAGTCATTGGCCTCTCCGCCCGTGGCCTTCGTCGTTTGCTAG
CCACCGGTCGCCATCACGTGTCCAACTGCACCTCTGCAGCAAACTCCAAT
CAGTCAATACGGTGGCGGTCTGCTCCCTTCTCCTCCTCGTGGCGGTGGTG
CTCACGTGTCTCCTACGGCTACAGAGAACGTCGGCCGAAGTCGTTCGCTG
CCGCCGGATTGCCGGGGTACTGCTCCACCATTGCTGTCGTCGAGCTTTTC
TCCTCGTCGCTGAAGGTGGAGCTTCTCGGTGGGGAATGGAAGGTGAGAGT
GTGTGCTCTGGGAGACGGCGAGAGCACTGGCATTTATAGCCGAAAGAGGA
AAAAGCGGTGAAGGCGGGAGGGGTGTACCGACGTGGGCGAGAAAAGAGGA
AATGGCGGAAAGATGGGCCGGCGGTGGCGCGACATCATGGCGACGCGTCC
GATGAGACTGGCAGTCAATGCCTTACGGTCCGTCGCGGGAGACGAGGCGA
TAGGAATGAGGATGATTTGGTTTCACACACTGACAGTGCAAGGCCACCGA
CGGAGTTTTTTCTGCCCATTTCACTTCATCCGGCGTTCCTAGACGGTCCC
AGCGTCCTGGGTTCAGCCTGAGAACGCCGGACGAAACATGGTCCAAATTC
GCCAAAAATTGGGCGCATAGGAACGTGATTGGACAAATTTTCGCGGTATG
GATAAAAAATTCCGCTTAGGAAGGCCTTTCTGAAAATGCTAGTGGAGATG
CTTTTGGAAAAGAAGCATAAAAAGAGAAGCTTTTTGTTTTTGAGCGAGCG
ATTTATTTCCTAAGAGAGAACGAGAAAGAATTAGTGGGCTTAATATGGCA
GAGGATTGGTTGCCACCGGGTTTTGGTTATTGCAATCAATGGATGCCTTG
CTCGTCGCTGCCTGGTTTGACGATGGCCGACGGAACCGCATACATACAAA
TTTGCAGATTGTCACGGGCTGGCGGCGGTAGCGGCCGGGCCGCGGCTGCC
AGCCAGTTCTGTATTCTTATTTGTGGGTGTTAACAGACATAATTAAACGG
GAATGGCCTGGTGGCGCCGTGGGCTGCCGTCACCACTTGCACCCTGAGCT
GTTGCACACTAAACATTGAAACTATCAATAAATATAACTAAAGTACAACT
AAAGTACTGAAGTTTGAAGTCCCAGTTAGAGGCTAGAATCTTTGCCAAAG
AAACTGCAAATGGTGTGTTATAAGTTGTAACTCAGACATGTCAGGTGGTA
AAGGATATAAGAGGTGCCAAAAAGAACGCCTCCAGGTTTTGCTCTAAGGA
ATAAATAAACTAGAAGCTAGCTTAGTTTATGCTGCAGATTTGCAGTAATT
AGCCCTGACCGTTCTGGCACAAACTGTCACCTTCTAATAATTTCTGAATC
ACAAATTTCACGGTAAAATAATTGGACCAAATGTACTATTGGAACCTTAA
ACTCCTAAGAGCAAGCAATTCAGCACATTTGAAGCAACACGCTTTTTGTT
GTATTTAACTCAGCATGGGTGGAAAGTTTGGACTTAAGATACTACAGTTT
CCTGATTTGACATGCCCTTTTCTTTGTAATTCCATGTCACTCAAAAAAGA
ACTCAAAGCCTAGTGCAATTAGTAGGAATTTGGTAAATTCCCTTGAGCTG
ATTGTTAGTACATCTTCAAACTGGACAACTTTAAAACAGTCTGACCAAGA
GACACTAACTGAACCGTAATTTCGTACTGTTAAGTTCTTGTCAAGTTGTC
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GTACATAATTTTGTCTTTTCAAGCACTTGTGCCCTGTTTGGAATGGAGGA
ACTTATAACTTAGGAACAGGAAACCACAGTAATTGAATTATCATGGACTC
CATCTGTACCTAATTATAAGACATTTTAGCATACTATACCAGTGTGCTAA
AACATCTTATAGGTACAGAGGGAGTGCTTCAAAAGAGTCCTTTGGATGTA
GCACAATAAGAACACAGGGAATTTGGAGTGTAGACACAAAAATAACTAAA
GAAGAAAACACGAGGTCTCAACATTCCTGTGGCATAGCTCATTCCATAGG
AAATTCATGTCAAGCTTCATGCACTAGCTAACGTCAATTTTAGGATAAAC
TATGGCTCAAGAGGCCTATACATGGACACCGAGGGGCCAACGTCAATTTT
AGGATAAACTGCGAAAGCCAGGACTCGAGCGGGGCCTTAGTTCCTCTAAT
TGACGTGAAAAGAAAGAAATGCAGATACTTATGCTGTCACATCATTTTAA
AGTGTAAACATGCTATTTTCATCTGCGATAAATTGCCTTCTGTTCTGCCT
TTGTGTAGGTTACGTCGAAGAAGTATACCATAGTTGCTGAGAAGGATCAT
TATAAGTTCAACCGTTTGGAGAACTTCATGGTAACATATTTATTGATTGA
GGAAACATCTTACTCCCTCCTTCCCTTAATTTAAGGCATACAACTAGGGT
TGCAAGTGCAGCGCCGTATGTGCCCGCTTCATAGTATAAAACATCTGGAT
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CGAGGGAAAAATATCAACATCTACACTACCAAATCAATATCAGTAGATAT
ATTTTGAAATATGTGTTTATTTGGTATTAGAGATGCCAATATTTTTGCTA
TAATCTTGGATTCTTGGTCAAACATCAAAAGGTTTGACTTAGGACAAACT
TATATGCCTAATATTTTGGGAAGAAAGGAGTAAGACATTAAGATCAAATG
CCTTAGCTTCCCTTTTATCACTAATGTCTGTCCTTTTCCATTAGATTCTA
CCAAACAGGGCAAGCATTGATGATATCAAATCAGTTCGATATGATGTATG
TGGTGTTGTCCGAACTGTAACTCCAAATTCCAAAGCAATGGTAATATACT
GATGTGGTTCTTTGTTTCATCGAGATCACAACAAACTTTAGCCTCACACT
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GGTTATATTTGTTTTTCCTGGTGAAACTACATTAAACTTTCACCTAATGA
TGTTTAATTCCTTTACGACTTTTTCATATGAAGATAGAATCCTACACTAT
CTGTTGCAAATTAAACACTTGTAACACTTTCATAATTGTTAGATGCAACA
TTAACTTCCATGCATACAGATTGAACGAACATAAGGCAAAGTGGAATGTC
ACAGCAAGCCTTTTCTACTAATCATAATAATTTTGTGTTCTGCATGTGAA
TAAGATTTTTTGTTATTGCATTGAATCTTCTAGCTTGAACGTGGTCTGTC
TATGCACGAATCAGCTCCCGATGTGACCTCTGGCACTGCTTTTATTATTT
AAGTAAATTAATCTAAAGTTGACTTGTATGGCACGATTGTTAATTCTTCT
TTCTTTCTTGCAAATTTGCAGGTTCCTTCTGGTGAATACCGGTTATCTGC
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ATATCGATGTGAATGTCAACAGCCCGTTGCTTAATGTAGAGTTCTCTCAG
GTAAACAATTATTATTTTTACAAATTATCATGATTTTTAAGTATTATTTA
ACTTCCATCAAGTGTCATGTATGCTTTGTAGACTGATAATATCTGAGTAC
CATCTCTTTGTAAACAGTCACAAGTCAATGTTCACGGTAAGGTCCTCTGC
AAAGAGAAATGCAACCAAAATATTCTGCTCTCACTTGTTAGAATAGCTGG
GGGTATCGAACATGAAAAGAAGACAGCCAGTTTGGAGCATGATGATGCTA
ATTTTGTGTTCACAAAAGTATTTCCTGGAAAATATCGCCTACAGGTAAAA
TTTTGTGTAGAATAACTGATATTGAATGTGTTACTGTTCTGTCTAAAGTC
TTACTACCAGTTTTGTGATTGGACTATTCCTTCTAGGTGAAGCATTTTTC
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GGTTACTGGATAGAGCTAATCGCAACCCATGCGACTGAAGCATACATTCA
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ATTAATAAAGCTACTGTACAGTATATTTGAACCAATAGTACTTTTGGTTA
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GAAACTCCTGGGCAACATGAGCTTCATTTAGTTAATCCTTGCATTTCCTT
TGGGAACTCGTCTATTGTATTTGATACACGGAATCCAATGGTGAGCAGCT
TGCCTACATTCTTTAAATTTTATCCAGGTAAATTTCACTTTGGCACACTA
ATGCTAAATGTATTCCCCCCCTTTTAGCCGGTTCATATCAGTGCAAGGAA
GTATCTAGTAAGAGGTGAAATCCATGTGCACATGAGCTCTCCTCTGGAAG
AAATTGATCTATTGGAAGATATTGTTGTTGATGCCTTTAAGAGTGATGAG
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AAATGGCATTACTGCCTTTGAGTACTCTACTTGGACTGATCTTGGGGAAG
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CTTTTAGTTTTCAACCAACAGTCTTGTATCTACCAGAGTTTCTCAATAGT
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TTGTACTAGCTTAGTACAAAATGAACGACACTTATTATGAATCGGAGGGA
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AAGCTCTTATTTTATCCATCGCGACAGCAGGTGAGCGATGGTTTATTAAG
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TTGCAACGCTGAAGAAAGGTGATATAACAGCAGAGACAAAGACAAATTCT
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TGAAGCTTCAAAGGTTTATATTATTTTCGGCAAACAAATATATATGGTGT
TCTCGCTATCGTCTTGAGTTTCTGGGTATATTCTGCAATTGTGTTGGGTA
CTACTGTGCATTGGCATGATTTCTCAGTTTTCTCCTTTTGTTTTTACTGG
CGATACAAACTGCTTTACCATTCCTCTTTTTTCAAATAAGAAAGCCATGG
CAGTGAGGCCTATGTGGAACACCTTTTTATTTTTATTTACCATTTCACTA
GATGACCAGTCATTGCATTTTATTGTATACTGCTTAGTCAGAAATGGTCC
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TGTGGCTGGTAATGATATGCATGAGTTATTACATATTAACAATAACTGGG
AAGGGAACATTTTTTACCAAAAATATGCTTTGTTGAATATCCTACCTGAT
ATCATTTTCGACCTTCCTGCAGGCTGGTTATCATCTCAAGCAAACTGGCC
CATGCAGCTTTGCTTGTCAGAAACTTGGTCAAATATTAGTGCGTATTTAT
GGTGAAAAAGATACAGAGATGCTGCCATCAGTATTATTATCCTTAAGTGG
CGAAGGAGGCTACAGAAATAACTCAATTAGTGGTTTTGGTGGAACTTTCA
GCTTTGACAACTTATTTCCTGGAAGTTTCTATCTACGTCCTCTTCTTAAG
GTACGTTGTTGTTATTCATACTCTCAGCGCTAGTTTGTACCACACCACAC
CTATTATGAATAAGCTAAATTCTTCAAATTAGATGTTATGATTGAACAGT
CTAATTACATCAGTGGGTTTTTTCAATGTTATTATGATGTCACATTCTGT
AAATCCTGTTTGTAGTTTTCATTTACTCGTACATAACATGGACTGACGTG
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TCCAATCCCCTCAAGGCCTCGACTGAACTAACTTATTATCAAAATTTCTG
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TTTCACTAATGTAAGACCTTCTAGATATTTTAACGTAGACTAGATTCGTA
CTAAAATAGATGAACCTAAACAATAAAGCGCGTCTAGATACATTCATTTT
CAATAAAAACTAGAAGGTCTTACATTAGTGAACGGTGGGAGTAATAAAAC
TTCAGAACCAGTGACTGTTGTGGATTTATCTTTTCTTTTGGGTCTTTCTG
ATTTGTATAGATTTTTTGACCAGGTATGTTGCCCACTTCACAATTCACAC
TTGAATTGGTTTTTGAGATTTTTTGAAAGCCAGTGTCCATAGAATGATGG
AGTCAACTTGCGCACTAGCCCCTTATATGCCATCTAGGCTATATAATATA
AGATTGTGTCATTATATTTCAAGATTATTGGTTGGAGAGCCCTTAATTGT
TTGGTGGTTCTGCTGTAGGAATATAAATTTACTCCATCAACTGTTGCTAT
TGATCTTAATTCTGGGGAGTCTAGAGAGGTTGAGTTCCATGCAACCCGTG
TTGCCTACAGGTTTGTTTGTTTTTTACATAGGAAATTCGAGCTGCATGTT
TTTATTTGCTCCCATCTCTTGCTATCTATAGAAAACCATCTTATAAACTG
CAGAAAATTCATGGCTTAGATTTTTTCTGGAATCCATCATTTGAGTATTT
GTTAGGGAAGACTAGTTATGAATTCTGCTGATGCATAGTGTCAGTTCTGG
CTATGCAATGCTAACGTGAGAATCTGTTAGATTTGATTTATAAAGTATAA
TTATGTGACGTCAAGTTTTCATTTACTCATACTGCACTAAGGGAACTCAA
TGGTCAAAGCTCAGTTTTTGCTGATGGGTATTGGCCCTTTTATTTTGAGG
TGGTGGGTGGAGGGACAATGTGTTAAAGCAACAGTTCTTAAATAAGCAAT
TACAACAGTTCTTGCAACATGCTTGACTAAACCAATCTTATGGCACTAAC
TCAACCAGCATTCTAATGTAGTGCCATGGGTTCTGTAACACTGTTAACTG
GCCAACCAAAGGAAGGTGTTTTTATTGAAGCTAGATCTGAATCAAGAGGT
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ACTTGTGCCTGGTTCAACTTACTCAGTAAGAGTGGCTGCAAAAGGTAATA
TCAGGCTGGCAGCAGTTGAGCGTGCTTCACCAGAATTTGTATCGGTTGAT
GTAAGTTATTGTGGATCTTCTTTGCATGCAACATTTGCATATTGCATCTC
GTCACTGTTCAAGACTGTTAATGACAGAGGCACTGCTCTTTTTTTAATCA
GGTTGGTCAGGCGGACATCTCTGGTATTAGTTTTGTGGTTTTTGAACAGC
CAGAAGCAACAATTTTGAGTGGTCATGTGGAAGGAGATGGCATTGACCTT
TTGCAGCCACAACTATCTGTTGAAATTAGATCAGCTGTTGACCCTTCTAG
AATAGAAGCTGTAGTTCCTGTGCCTCTTTCCTACTACTTTGAAGTACGAA
ATTTACCCAAAGGCAAGCATCTTGTTCAGCTTCGGTCTGGCCTTCCATCA
CATACGCACATATTTGAATCGGAGTTGGTTGAAGTTGACCTGGAAAAGCA
ACCTCAGGTTCACGTTGGTCCTGTTAAATATAAAACTGAAGAACGCCATC
ACAAGCAGGTAACGTCTTTCACAAACTTGCATCAGCATTGCAGAACACTG
CTGTAGCCTTTTTTTTGTTTATTTTCAAAATTGGTGAATTGAGGTAAGAA
TTGAAGAAATGGGCTATTTGAAGCCATTTTCTTGAGATGTCTGTACCACA
GATAAATATTCCTTTTTTACGGGGTTGGTTCTTATTTAATCAGAACCAAA
TCTTTGTATAATGTACATGTATCTGTACCAAATTTATTAAAGGTTCCAAC
TCAGCACCTTTCATGTACCTGAAGTTTATGTTCTAAGTTGTGTGTTTAGG
ATATCATCTAACTGCTATTTCTTGCAGGAACTGACCCCAGCCCCAGTGTT
TCCTCTTATTGTTGGAGTTTCTGTTGTTGCACTCATGATCAGCATGCCAA
GGTTTGTTGATATATCACGTCAGACTTCTTTATGTAAACTTTAAGTAATT
ATGATTTTCATTTCTGTCATATATATATATATAAATGATGATATAATGAT
GCCTATAGGTTGAAGGACTTGTACCAAAGCGCTGTAGGAATGACTTCCCT
AAGTTCAGGAGGTGCGCCAACAAGCAGAAAGGAACCACGGAAAACAATAT
TGAGAAAGAGAGCGTGAAACACATGCTTCAGATTAGGTGTTGCAAAGTTG
AAGTGACAGCGTCAGGATTAGAAAGTAGCTGTTTCTTTTCTTCGGGGGAA
TTATGCAGATGAGAAAAAATAACCTAACAGTTAATATTCTGCAAGTCCCA
TTATTGGGAATGTTGTTTGATGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.