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GrainGenes Sequence Report: AA038561

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Sequence
AA038561
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA038561
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGATGCTATGGAGGCTTGGAGAGCCGCTTTGGAGGAGAGGCTAGCCGC
CAACGAGGAGACGAAGTTGTCTTTGGAGGAGAAGAGGCAAGCCAACGAGG
AGCATCTACGCCTAGTGGAGGAGGAGAGGAAGCTTTTCTTGATGGATACT
TCCCACATGGATGAGAGGCAAAAGGAGTACATCAACCTTGGTCGCCACGA
AGCGTTGGCCAAGAAGAGATTGTTGATAGCCAACATGAACACACCCACGG
CCGGCATGTTTGGAGGAGGCATGTTTGGCGGAGGCATTCCCATGTTTGGA
GGAGACATGGGAGGCATGGCCCGCATGGGAGGTATGCTCGCCATGGGAGG
CATGGCCGGCATGGGAGGCATGCTCGCCATGGGAGGCATGGCCGGCAGGG
AGGCATGCCCGCCATGGGAGGCATGGCCGGAATGTGTAGCACCCCCGGGG
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TTTGGTAGGTTGGACCGGTGCGTCTCGGGTTTGGGGAGCTACTTCCCGAA
CGATCCCTTCTTGGACTTCTCCCTATCATCACCCAATATGAGAGTGGTGG
TACGAGCTGAGATGGCCAAGTCACATGGGTAAAGTGTACAAACCCCTGCA
GGGTGTATAAACTAACTGATTAGCCGTGTCCCCGGTTATGGACATCTGAG
TTGCTTGATATTGAGTTCATGACATGTTTCTCGCTCATTCTAATTTCCTA
ATTGCTTTAATGTTGATGGGTTAACTTAATTGGGATCTTTTCAAAGAAAA
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GCCACAACTCCACTTGCAAATATGCATGTAGATGTTAGCTATATTGTCTC
CCTTAATACCTCCACTTGCCATACATTCCATGTATTGCCCCTTCGGGGCT
GCTACGTTTCATGTTGCAGGATATTCAGATTTTGAGTGATCGATTTAGGC
CACGGAACTCCACTCGGCACTTGTTCACTTGTGGGCAATTTGAAGAATGG
AGGAGTTATTCTATTTATGTTGCTACTTGAATAAGCTAAGCTAGCCTTGA
GCTAAGCCTTTATTGTAATAATGTTACTCTAGATCATCGTTATTTATGAT
ACATGGATATTTTGCTATGTTATTCATCTTTATTCTATTGTGGGCCAATG
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CCGTAGTGTTACACCACGCCACCAGGTGGTGTGACCACCCCGGAGCCTGT
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GGGAATTTCATTGGATGGGTGGAAGATGAAAGGATCACAGCTAGGCGCAA
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GGGTAATTAACACTGGACGTGCTTTTTCTCATAATATGCAAGGGATGATG
ACCTCCGTTCTAGACTTCAGTTCCTTCCCTGACGAAGTGGAAGCCCTTCG
AGCCACGGATGGGTATGATAAGTATCGAGACCTAAGGAGAAAGGTGGATA
TACTTCAAGAGGAGAATAACAGGCTTCATAAGATACTGGAGGGTTTCCTC
ACCCTGAACAAGAGAACACCACCACCGAAGGAGTGATTCGTCATCAAGTT
TTGGCATCCCCTTGGTTTGTTCCAAGCTTGGGGGAGTGTCGCGGTATCAC
ATCATTATCTTTCATCTTTTTACCTTTTTAGTAGTCATATCATGAATAGA
GAAGTTATCATATAGGATGGTTTGCATCGTGGAAGTATCTCTCCTCTAGT
TGTTTATCTATGTATCCCTTGGTGTGAGTGCCTTTGTGGAATATTAATGA
GAGGTTTCATCGTTTAATTTTTTACATCTTATTTTAGTTTGCAACTTCTG
TTATATAATTGATCTTGTTGATTAGTATTGGTATCATTTGGGAGCATCAA
GTAAATTTAAATTGGTTTCGGCAAACCGAGCTCTGGTCAGTAGCAACACT
TTTTGAGGTTTGAAAGGAAAAGATAAAAGCACTTACAGGTATTTTATATC
ATTTTTCCTTCTTTCTTGATTGGCTCATAAGTTTAGTATTCTTTACTTAA
GATTTTTTGTGTTTTCAAGGAAGATTGCATGTTTATTTTTATCACTTGTA
TGTTTGCTTGTTTCCATCAACTCTTATGCTTGCTACCCAGCCTTGCTAGC
CAAAAACCTGTACTAAGAGGGAATGCTTCTCGTGCATCCAATCCTAGAAC
TTAAACCTATGACATTTGTGTCCACCATAACTACCTATTAGCATCATTGC
TATTCCAAGTAAATTCTCGAGTTTCATCTACCTTCCAAATTAAAAATTCT
TTTGTTATGTGAAAACTAGTTAGTAAAGATCTCACGAACTTGATGGCACG
CCTTATTTTTCTTGTCCTTAATAAACTTGAACCATTGTGTCATCTATGTT
GTATATGTTTGCACTTATAAGTTGGGAATTAGCAGAACCGCGCTGTCACG
GGGAACGCTTTCAACACCTGTAATTATACCTAGTTGATATCATGATCTTT
TGTTTGCGGATGTCAGCGGTGTGAAATAAAAGGGGAGCTTGTAAGTCCAT
GGAGTTATGTATATGTGTTAGAGAAACGCGTGGGACACTATCCTAAGCCA
TGCCTAATCATGGTGGAAACTTGAAGCATCACCATAGTGAGCAATCTATG
AAGCATCCTCAGAAAAAATATATAGAAAAAAGAAGAGAGAAAAAATTTAT
GTACCATTCTCATGGTAAATAAAGTATCATTGAGATGCTCACTGTCTGTT
GCCTTGTCACTTTGATATGGGATAGATCCTGTGTCATGGGGCAAGGGGTA
CCCTGTTGGCGGTTCTCTATGATACACTTATACTTAAAATGACAAGAACT
TACCGGTAACTAAAGTTGAGTAGCATGAGGAACGACCCTCGTACTCATGG
GACCTGAAATTGCCAACTTATATTTTGTCAAGCATATACTCCATCTTTGT
TCACTTTAACCTTAATTACCTCAAGATGCTTATGATAGGGGCAATGAGAG
CTCAAGGCTAGTAAGTACCATAATCTTTTGGAAGCTCTTTATGAAACTTG
AAATCCCTGCTTCCCTCTGCAAAGGGCCTTTCTTTTACTTCTTAGTTAAG
TCAGTAAACCTATTCCTTTCTATCTCCAGCAAGCATTTGAGTTGTTATGT
TTCAATCATTCTTATGATGATTTATTCAATCATGTTTCTTATCTTCCTTG
TTTTAAACATTGTTCTTATCTGAATGAGTATTACTTTTAAAGCCATCATA
GTGAAAAGCCTTTTATGTTTGAGCAAAAGGACTCATGATATAAACTTCGT
TACAAAATCTATGCTTGAAAACTAAGTATGATTTGTCAACTATTCTCTGA
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TATTGTGACTCCCATACTCGTTGCAAGTTAAGTAATATAATGGTGAGTTG
CTTTCTATTATGAGTTGTGTATTTGTGAATGTGATGCTTCTTGTCGGTAT
TATTTTTATCGACACTTCACTCCATAAACCTGTGGTCATGTTTACTGAGC
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TCCATTTTGCATCACTATTATTGTAACACTCCGGTTCTGAAAATACCGTA
GCTTCTATGTGACATGCTAATCCCTGGATCGGTTCATTGGCCCACAATAG
AATAAGCTGAATAACATAGCAAAATATCCGTGTATCATAAATAACGAAGA
TCCAGAGTATCATTATTACAAATAAAAGCTTAGCTCAAGGCTATCTCAAA
TAATTCAAGTAGCAACTTAAATATAGTAGCATGAAACGTAGCAGCGCCGA
AGGGTCAATACATGGAATGTATGGCAAGTAGAGCTATTAAAGGAGACATT
AGTGCTAACATCTACATGCATATTTGGCAAGTGGAGTTGTGGCTAGCTTG
CATTTGCAAAAAACCTTTGTCCTACTCTCGTAAACAGTTTTGATTTTCTT
TGAAAAGATACCAATTAAGTTAACCCATCAACATAAAAGCAATTAGGAAA
TTGGAATGAGCGAGAAACATGTCATGAATTCAATATCAAGCAACTCAGAT
GTCCATAACCGGGGACACGGCTAATCGGTTTGTTTATACACCCTGCAGGG
GTTAGTACACTTTACCCATGTGACTTGGCTAACCCAGCTCTTACCACCAC
TCTCATATTGGGTGATGATAGGGAGAAGTCCAAGAAGGGACCGTTCGGGA
AGTAGCTCCCCAAACCCGACATACACCGGTCCAACCTGCCAAAATTCTAT
ATCTCTAGATACGTGGGTTCGAGTTACCAAAACCTATTGAGTCCAACCAA
CCGCCCATTTCATTATTGGCACATGGTTGTACACGTAAGCTGCAAAATAA
AGAAGCCAATCATTTTCTCTTGATACCTGAGTGCCTTTCCGCAATGATAC
CACCAAAAATTATCAATCCCATCACACCCAAGAGATTCATTGGTTAAGTT
GTTTTTAGTTTTCGCAAACCAACACATTTAGAAACAACTTTTAGTGATGT
AACCCAGCCCTCGTTCATCATAGCATGGCTAAGCACATCTACCAACGGTG
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GTAATATCCTACACATGCATCTACAAAATACACGACAATGCATTGAAAAT
AGTAGGACAACATCATGAACAAAGTAGCATCTACTTGCCTTGGCTGTAGC
GTTCGAACAAACAATCCACACACGAGCAAGCGTTGCACTCGTCACAATCT
ACACGATACAATTGCAATCACATAAACAAACCATACACAATCATATACAA
ACAATGACAATGCAGAATGCATGCATGACAATTTGAACGTTGCTACAGTA
GCATCACATATTCTTATTCAGTATACCTACTGTATGCATGCAAGGAAAAT
AATTTAAGTGCATAGAAAACAAAGCATGCAAGTTTAAATGCCCAAATCAC
AGAAGATCACAGTATGATTCGGTAACATTATAGAACTTAGGGATTCAACA
GCATAAGTTTAAACTCTTAGCAGAGTAAGATATTAGAGTTGTTACAAGCC
AGAGGTCGTAAACCCAACATTACATCACACAGGGAAAGCAAATATATGTT
GTTCTACACAACAACTTAGCATAGGGCCAAAGAGGCCATAAACAGAAGCG
ACGTCCATCCCATAGTCCTTAGGCTGCTACCTGGGACCCCCTACTACTCG
TTGATGTCAACATAAAATCCACCTTCAGTTGCAACCAGATCCTCTATAGA
AAAACAACAATGGTGCAAGGTTGGGTACGAGAATGTACTCCGCAAGACAT
AGATAATATAGTATCTACATGCTCTGGCTGGAAAGGCTTTCTCTAGATTT
ACTTTTGTGTAAAGCAATCTTTATTTGTAAACAAGAGAGAGAAGAGGCTT
GTCTACTCAGAATATTTTAAAAGGGATAATATAACAACTTCTTCATCTTG
CTCGTCGTATCTTGATAACCACCAGCTTCATCAGAACCTCCTATCTAGGA
ACACCCCCTCGACCCAGAGGAAGCATCCTTAAGCACACGTGGATCAGCAA
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GGCTTTTCAAAAAGATTTAACCCTGCAGGGGTGTACAAATTTACCCACAT
GTACCAACCGACTCTTAATTCCTAATTATTAGCCCTCTTCCTTGGAAGGC
CGGCAGAGGGTGGTTGACCACGACATTTACCTTTCTTTCGTCGAGACCAT
GAATCACGCCCTAGGGATGGTTCCGCCGTAACGGGTCAAGTCCCGAAGCC
GGTGCCGAAAGATGTGAGGCGAGGTTGGTTCACTAGGGGCTCCATCGACC
CCAAGCAACCCCGGCCATGCTTACCTACCTGTTATGATGCACCTCCTTCA
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ACTATGTGACTCATGGAATCTACTAGGCAAGTTAGTCAATCGAGGGCTTC
TGACTGCCCCGTGTGGTTGTACGCTCGTCTTGGTTTAAGAGGCAAGAACT
CGGATCCTAATGGTGGCGAGCATGAGACTACAAAAACCACACCCAACATG
GCCTCCCATGCAAGCCTTAGCACGTTTAGTTAACCCCTTCGATGATGTCA
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TAGATCGGACGTTGTTACTATGCATGGCTAAGCTGTCGGTAGCAAAAGCT
CTAGCAACGCTCAAATGCCAGACCTAGGTATGCTAGGAGCAGTGGATCGG
GAATATAAGGCTACGAAAGGGAAACTATGCAGCAGATAGGTGACACTAGC
TACTGACAAAAGACCATATTGGAATCATGTGCATCATAGCGAGAAATAAT
ATACTTTCTAAAAGTTGGTTCGTCAGTAGACAGATATGGATCTTCGGTGT
CGTTGACTTCAGCCTCGGGCTCGGATCCTATTGCGAAGAACCAACACCCG
AAAGAAAGGCAACAATCAAGACATGGCACAATGCAATGTGCAAACAATAT
GTATGACATGACAAGTTAAGTAGTGTTCAAGTGAACCCTAGAGCATGGTT
GGGTAGTTTAAATAGGGTCCGAGAGGTCCAAACCCTAGAACAGGGGGATC
CTCAAAATCACCTATGGGGTTCAATTGATTCTTATAATTAAACTTGTCAT
GAAGGTTGGTTAACAATGCATGATTATATTGCTATTGTAAAGCTCTTATT
TTTCTGAACATTTTGATATATTATTTGTATCTTTCTGATTTAAAATGAAT
TAGTTATTAATTTCTCCAATTTTATTTCATTTTAAATCATTTTTGGAATA
TTTAAATTATTTTCCAACTTGGGCCCACATGTCATAAGTTTATTCATTTA
TGAAATTATTTATGGAAAACATTAAAAACCTGACAGCCTGGGCCCACCTG
GGTTATTTATTTCCAGAAATGATATTTAGAAAATATTTAAACAAATATAA
TAGATTTACTGCATCATGTTGACGTCACTGTGACGTCATCAATGGTGGAT
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TTGGTCTTGTTCGAAAGAGGAGGCCATGGCGAGCAATATAGTGAAGGAGC
CGCCTCGGTATGGTCACCGGAGCAACGACAGTGACAATGAAGAGCGGCGG
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GGGGTCCAGGAGGTCCGCTAGCTCACCACGAGCACGACGGTGAGGTCAAT
GAAGCGAGGTCAAGCCGGATGGAGGGGAATCGACGATTTGACTGCGGCTG
CCGGAGTTGAAGCCGAGCTTGATTCCGATCAGACGCCGTCCTCCCAGCTT
GCGTGGCTTGACAGAAACGACGACGGTGACACATCGCTTCTCCCAGACCA
CACCACGGAGCACGGGGCGGCCGGAGACAACGACAGAGCTTGGTTAGGGT
TCGGACAGAGAGGGGGAAGAACTCACGTGAGGGGGAGAAAGAGGGTTAGG
GTTCCCCACTGCGGCGGCCTGGGGTTCTTGTAGGCGCCAGCGTCGTCGGT
GGCGCGAATCTTGGCGCGCGGCATTGTAGAGGTCCCAACCTTTAATAAGG
TAGAGATCCCTGTGTTTACAATTCTAGTCCCTGGATCAATAGCTAGCATC
CACAGTTAAGATGTAATATCAAGAACCAAAGGTCATAATACAACTTTATA
ATCAGGAATAAAATAATTCAGTACATCTTACATAGCTCATTTGGCTATCT
CATTACAATGCAGCAGAAATAACTATAGCATGGAGTCCTTCATCTTCAAA
GTGCCACAGGCAATCATGTTGGTTGTAGACTTGTAATCCTAATCAACACA
CTTCTAACATCAAACAAACTGTAACATAATGAGTTGCAGCCACAAGGGTC
AATACATTTGAATTGTATTGGCAAGTTTCACTACTATGTAGAAATAAGTG
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GTTGTCACCATCAAGTTTTACTTTGAGCAACTGGAATATCGAGATCTTCC
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CCTCCCAATACACAATACTAGCTTGCCTTGGCTGTAGCGGTCGAATGAAC
AATCCTCACACGAGCAAGCGTTGCACTCGTCACAATCTACATGATACAAT
TGCTATCACATAAACAAACCAAACACAACCATATACAAACATGACGATGC
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TTATTCAGTATACCTACTGTATGCATGCATGGAAAACATTTTAAATGCAT
TGGAAACAAAGCATGTAATTTTAAATGACCAAACAATTGAGCTATAACCC
AATTATTAAGCCACAGCTATTGATCAGTTTGTAAAATCTTGGAAAAATAG
CTACTGTGTAGGCAACCTAAAATAGAACCAGTACCAACTGGAATCACTCA
AAAAGAATTTATAGAATTTCCTGAGAAATTAAAATACTCCAGTAAGCCTT
TATATAGATTCTGCAATTTCCAGTACTGTAAGTCTATATTTAAATTCACT
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TTGGAGTTGTAGAACTTTTACTATGAATTTATTACTCTAAAAAGGACATT
AAACTATTTAATTAATCATGGAAAAACCTTGCTGTAAAAGTATTAAACAA
TTGTACAACATTATTCTAGGTGAAACACCGAATCCATACATATCTTATTT
GCAAATTTTGGCCCAGTAGATTATTTTCTATTGATTTCACAAGTTTCCTC
TATTTTCTACCAAAATAAATTGATTTAAAAATAAACAGTCAACTGTCTGT
TGACTAGTATGCGCTGACTGGCGCTGACTGGGCAGACACGTGGCCAGCTG
CCAGTGGCCGGTACCCCTTTGCTGGTCTCTTCTAATATCAAGCGTTAGTT
TTAGATCGGACGGTGGGGAAGCATCAGAGGCGAGCTCACTGGAGTTGATG
GGGGTGGACGGTGATGGCGGCTCAGGCGGCGATGTCGGTGGCGGGGAGGT
CGTCTCCGGCGAGGTGTGGGCGGTCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.