Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044216

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044216
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044216
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCAGACCGAACTGGGGGGCCCAACGCCTCGCGCGCCCCACGCGCCCGCC CTGTCAGCGAGACGAGCTACGACTCCAAAACCCTCGTCCCGGAACAAGAG ACGTCTCGTTGTTGACTCCTTGCTCCGGGGGTCTGACCTCTGCTTAGCGG CGAAGCCACACAGAAAACGGCTTCGAAATCAGGAGAAAAAAGGGAGGAAA ATCTCGCTGTCCGAAATCCGGAACTGGAAATGAATCGCTGCCTCCCCGTT CCCCGCCGCCTCCGCTGCTGCTGACCGGGAGCACTCTGGTCGTCGTGGCC TCCCGAGGAACAGCTCGCCCGGTCAGTGCGTTTTCCTCACTCTCCCCCTG GTTCTTCGAGTCCCGTATTAGAAGTTCACGAGTTCAGGATTCCAGGGCGT TTTTTTTTTCTGGTTAGGTAATTTCTGGCGTTCTCTGGGGATTCGCAATG CGCGCGGCGGCGCTGGAGATTAGGGGCGAGCGGGGTCATTTTTGGAATGT TGCGTAGCATTTGCGTGGCGGCGGGATTCGATTCCCGGACGGATTTCCTG CCCCCTTTTAGCGCTTTCCTTTCCCTGCCTCCGGGTACCAGCTGGGAAGG TTGAGATTTGGGGATTCGGGGAGCCGATTCTACGGGGGCTGTTTTATTGG TATGCCAATTGTGTATAAATCTACTCTCGCGCAGCTGAACTTCCCCGTCT TCTCCTCTTCTGGTCTGGGGTTTATGGGGATGCTCCGGTAGCCTCTTCGG TGGCCGTCAAATCTCGGTGTGTGCGAGTTGTGCGCCGAGGACAGCCGAAT CGTTTCGATTTCCTCTTCTTATGCGTTTAATCTTTTCTACTAGTACAATC TTTTCGCGTTCCTGGGTGTAATTTACACTATTTCAGCCGTTCCATCGAGA CTGAATTGCTGACGCAACGAATACTGTTTGCAGGGTTATTAAGAGATGTC TGACCAAGAGAGGGATGACATCCCTATGCTGCTCAGAAACGTCGAGCTGC CAAGATTCCCCAGAAGCACATCCATGTGTATGCCGGTGAGGGATGACGAC TACGAGGAAGACACATATGTAGCCCACACCGGCCCTCTATCCAGTCAACC GCCGGCTCAGACTGCGGCGGCCGGCAATCCGTTTATCGGCAGACGCACAC CGGATAGGCCGCCACGGCATCCGCAGGTGAAGCCAGTCAGCAAGCCACAT GCCGTCATGCCTGAAGAGGCCGGGGTGAACAGGTGGTCTCACACTGGAGA TGTCCCGAAGAACGAGCATCTGATGATGTCTGGGCCTCTGGGGCAATGCG ATAATCCTGACTGTGTCCAATGCCCTCCCGCGTGCAAAAACAAGAGATAT TTCCAGAGAGCTCCGAATCATATTGACAATAAGGTGGTTTTGTTTCCACT GCTACCTTGTATAAGGGTCTTCTAAGTTACTTGATTTGCTCTATACTTGA TAATTATTATGCTTAGATCAGTCCACTATGTTCTTTTTTTTAGTAAAACA ACCTGTTATTGGTACTTTCTTTTCATTTCTTATGAGTTACTGAGATTACA GAGGTTTAATACCCTCAGAGTATTCGAATTGAGGTATAGTTGATAGCTTG TTTGTCTAGCTAGATTTCCTTCATACAATTCTTCAGACTGTCATGGCTGT TGAACTGTGGTATTGATGTATTCTTCTTTGCTCCTTTGAAGCTCCATAAT ATTCTCTACGGTCACCATCGTGGGTGGAAGAAGAGCATTGAGCGCTTTCT TTCATACATTCCAATCATGAATCCACACGCGAAGATTGTTCAACACTGGA ATCAATTCTTTGTGATATCTTGCCTGGTTGCCATCTTCATCGATCCTCTG TTCTTCTTCCTATTGTCAGTACAAAAGGTAATATTGTACAAGTTCGGCAG CTACAAACTCCATTTTTTTTTCTTCATGTTGTCCCGGACAGTGACAGAGT CTCCAATATACACCTTTTTCCTGAGAAAATGGCAGGAGTGCTGCCTTTGA GTTCAGTAGATTTAGAAGCAGCATACGCCTGTAAGATTTAGGCTTTCCAG TGCACACCTTTGAGTGTTATTTTTCTACTTGCATGCGCTATTGGGAGATT CTGTTTAGAAATAACACCGCACACGCAAATCAAAATACTCATGTGTATAT TAGCGGGTAAAGTTTTAAAAGTTCACGAAGTTTGATTCTATGCTCTACGA AATAGCACCTAAAGAAGAATGGAGTACTTATTAAAACAACTAATGCATTA GGTAGGTTTGCTTGGATGCTCACAGCTGTCTGTTGCTGCTTTATCTTAAA TCTCAGTTGTGGTGCTTGTTACTGATCTTGGGAGAGCTTGTCACATTTAT AGAGTACATGTCCTGTTGCAGCATGGTATTGCTCCATAATTTCACCTCCA AGAGGTGTTATCTATTGTGTTGATGAGGTAGGAGCAATAAGGTTTATGAC ATTCTCCGGGTTGCACTCATCCTCAGAAGTCATACTATAGACACATTAAT TTAGTCGGTTCAAGAATTTGCAATATGAGGATATTTCCGTATCAGCTAAT ATTAGCTGTTCTTGAAGTAACTCTGATCAAAACAGACCCTCATTTATCAT TTTCATTTGGGCTCAATGCAGGATAACAAATGCATCGTGTTAAACTGGAA GTTCGCTACAGGACTTGCCGTTGTGAGAAGTGTTTCTGATGCTATCTATT TTCTGCATATGCTTCTTCAGGTAAGAGACTGACCAATTGTGATACACGGC CTCACATTTTATGAGCCATGAATCAAGTAGGTACAAAATGAAACGATGTA AATGAGATATTTTAATTTGGTATCCATATTGAGTGTACTATTGACCTTAA TAGTTTGTTGATTTTACTTCTTTGATTGAATGATTTTTATTATCTTGTAG TTGGTTTAGAATGCTGCTAGTAATATATTAAATTTTGGAGAAAATAGTTG ACCACTTAAAAGTTCTTCCATGAAAAAAATATCTTTTCAGCTTAAGAAGT CTACCTTATTTGTTTACAAGGTGAAATATATGAACATAAAGATAAACTTC TCTTTCAGTTCAGACTGGCTTATGTGGCTCCAGAGTCAAGAGTAGTGGGA GCTGGAGATTTAGTTGACGAGCCAAAGAAAATTGCTGTTCATTATCTTCG TGGACATTTTTTACTTGATTTCTTTGTTGTGCTTCCACTCCCTCAGGTAA GTGCTTTGTCTTTCTACATTCGTACCAGTGGTTTTAGACATTAAGCTTCC TCATCTCACTCCTAGCAAGGACTATATGTTATGTGTGCCAAAATATTTTG TTGTCAAACACATTGAACATACATGTTTTGAACATTTTGACTTTGGTTGT GCATGTTAGTTATGTGTGCCAAAATGTTCTATTCTCAAACACATGCATAG AACATTTTTGTAAACGTTCTTGCTATGTTTATGATTTGTGCTAAGTTTTT TCTTTGTTGTTTGATGAAGGTAATGATATTGGTAGTCATTCCTAGATATG TTGGGTTATCAACAGCAGACATTGCCAAGAATTATTTGCGTGTCACTATT CTGCTTCAATACGTCCCCCGCATCATCAGATTTGTACCATTGCTCGGTGG CAGGCAGTCTGCCACTGGATTCATATTTGAGTCAGCATGGGCTAATTTTG TGATCAACCTTCTAATGTTTGTTATGGCGGGACATGTCGTTGGCTCGTGT TGGTACCTTTTTGGATTACAGGTTAGTTCATTTCTATTGCAATGAATATT TATAACTTGTATTGGCAGAAGCAAATTTTGAATTTAGAGAATCGTAACAA TTGACTTATTCCTTTGTATTTTACTAGTCTGGAAATATTACCTCGGCTGT CATTAGTATAAAGAGTTGCCCTGAGGCACATCCAGTTGCATTCAGCAGTA TATGCTCTGCATTTTAACATGAAGATATGTGATGAAACTGCCATATAGAC CTGCTCAATTTGATTTCTACTATGTTCAGATTTATATGTTCTTCAGTAGT TATCCTTATCATGAGTTAATGGATTTGCACAATTAATACTTGACAGCTGT TGTCGATAATGAAGACCAGTAGAGATATGTTAATATTATTTTTCTTCTGG TCATATTTTTTCACAGAGGGTTAACCAATGCCTACAAAATGCTTGTTCTG CATCAAACATTCCATCTTGTGAGGTTTTTCGAGACTGCGGACGCGGCTTT GATATTGGGGGGCAGACTGGGTTAAATTGGCAGCAATGGTATAATGACCC AAATTCAACAGCTTGTTTTAACACTGATGGCACTAGTTTCCAGTATGGGA TTTATCAGCAAGCTGTTATGCTGGCTACAAAACGCAGTGCTATTACACGT TATATATATTCCTTATTTTGGGGGTTTCAGGTGAACTCTTCCACAATACT CTTCTGAATCTTTACCTTTTCTTATCTCTGTTCTGATCAGTGGTGTTCCA TTCTATTTGTATATGTGCTAATTTAGAGGATTTTATTTATCCCTGACTAA AGTTTATATTTCTATGTAAATGGTCTAATTTCAGCAAATAAGCACTTTAG CTGGAAATCTTGTCCCAAGTTACTTTGAAGGTGAAGTCCTCTTCACCATG GCTATTGTTGGTTTGGGACTGCTGCTTTTTGCACTACTTATTGGCAACAT GCAAAATTTTCTCCAAGCTCTTGGAAGCCGGTATGTGATTGTACCATGGG CTTATTTATCATGCAATAGTATCCACCTTACAGCTTGAGCTCTCCCTGCA TATCCACGGAAACCTCACGCTAATTATTTCATTACTGTGTGTGGCATGGA ATATTGACCAGTTGAATCCAATTATCTGTAGTAATATTGAATCTTGTTTA CGAAGTTCTCTTGTCTTCTGTAGGAAACTAGAAATGCAACTTCGACGGCG TGATGTTGAGCAGTGGATGAGTCATAGACGTCTGCCTGAAGATTTGAGAA GGTTTTCTTTGTAACTGTTAAACAAATATTATTACTTTACATACTTAGTG GACTTGCACAGTTGTGCCATAACAACAGCCATTTTTTATTTTATTATATA TTTTTGACTTGTTTCTAATCTGCTTCATTTGCTTGACATACTACACAAAC TTGCTTTCACTTATATTTATTGTTTCTGCTGTTCGAATAGAAATAAAAAT TTGCCAAATACTGGTCTTGTCAATTTCTCATGTTTCATTGAAAACTATCT TTAAACTTCATGAAATGCTATTTTATTTTGTTCCGTGGGAAGAAGAAATG TCTTGTCAATTTCTCATGTTTCATTGAAAACTATCTTTAAACTTCATGAA ATGCTATTTTATTTTGTTCCGTGGGAAGAAGAAATGTCTTTTGTAATTTG CAAGCAAGATTTAACAGAAATAGAACAATGGTTTGACATGCGTTCTAAGT TGGCATGCAAGTAGCTAATGTCATGTGCTATCTCATAGCAATGTCAATGA GAACTTAATATGTGGTTTAAAATATCCTTTTCATGTTGCCATAATCATTT GGTGTTTTGGTTCTACACTTCATCAAAGATAGTAACCCTTGAAAGTTTCC AAATTTACAGGAGGGTTAGACATGCAGAAAGGTTCACCTGGGCAGCTACT CAAGGAGTAAATGAAGAAGAGCTCTTAAGTAATTTACCAGAAGATATCCA AAGGGACATACGGCGACACTTTTTTAGATTCCTTAATAAGGTTTGTTGTA AATTTGTTGCCATTATTTACTCTTGCTGAACAGGACATGGAATTATTAAG AAAAAAATGTGATTTAAAATGGAGGTGTCCACCTAATGGGTGACCCCAAT ATGAACAACTATAGAGGTAATATTTTTCCCTAGAAAAGAGGTATAGACTT AATCTACTCAGGTTGTAGGTTCGCCTTAGTATCCATGCCTGTCTGGTAAT GACCCTCCTCTGAGCTCGTAAAGAATCACTGTGTGTAATTATTTTGCAGG TTCGATTGTTCACCTTGATGGATTGGCCAATCTTGGATGCTATCTGTGAC AAACTAAGACAAAACTTGTACATCAGTGGAAGTGACATCCTTTATCAAGG TGGCCCTGTTGACAAAATGGTTTTCATAGTGAGAGGTAAGTTGGAAAGTA TCAGTGCGGATGGAAGCAGGGCTCCGTTACATGACGGAGATGTATGTGGA GAGGAGCTCCTCACATGGTACTTGGAGCACTCTTCAGCGAATAAAGGTTC ACAATTTCTTCCCTGCATGCCTGTAGTTATACTACTACTACTACACAGTT TGTAATTGAAACCGCACATGCACTGCTCCTGTTTCAGATGGCGGGAAAAT CAAATTTAATGGTATGCGCTTGGTTGCAATTCGTACTGTGAGATGTTTAA CGAACGTTGAAGCTTTTGTTCTTAGAGCAAGTGACCTCGAAGAAGTCACT TCACAGTTTGCACGGTTCTTACGCAATCCACGAGTGCAGGGGGCGATCAG GTAGCCATTTGCTTGTCCAGTTTACTATTGTATGATTATCTATTTGTTAA AAGCTGTGTTCCACCTGAATTGTTGGATGCTGAGACTGTTATATTGATTA ATTTTACGGATGAGAAAATATGAGTAACTTTGCTAGTTTGCCACCCAGCC GGATTATTATTTATTTTCGTAGGAAAGAACTACTACTCCCTCCATCCAGA AATAAGTGACTTGGCTTTGTCTAGATTTGCATGTATCTATACACTAAAAC ATGTCTAGATACATGCGAATCTAGACAAATGCAAGTCACTTATTTTTGTG ACGGAGGGAGTATTATGGTATGCTAAATATCCTTTTTCTGTACTCATGTA TTGACTGATGTGCTTGAATCTTGATGCTGCATCTGCATCCCACAGGTATG AATCGCCCTACTGGAGGACCATTGCTGCAGCGCGCATCCAAGTTGCCTGG AGGTACCGGAAGAGGCGACTAAAGCGAGCGGAAAGATCAAGGCCTAGCGA AGAACCTGCTCGTGTACCTAGGTCGTCTCATTATGCTTTTCAGCACTAAC AGAACGGGTGATAGTCTCCCTAAATGGATACTAACTACTGGTTGGAGTCT ACAGTACAAATGCTAGAAATCATGAGTCCTTGTCTGCACTTGGTCGAATG TGTTTCCGTGGGCTTGACGTATTTTCGGTTTCCCAGTTTGCTTATTTTGT AGCCTGGCTCCGGAGATTTGAAACTACTCTCCTGTACATAATGAATGAGA TGGACAGTTAGTCTGTTCATAGTTTCGTTTTAGCATCTTCATTCTTTTGT TTATGAAATCCTAGGTGCATTGTTAATTTTGTGGCTCGGTTGGCCCCAGG TCATTGTCTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.