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GrainGenes Sequence Report: AA031346

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Sequence
AA031346
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA031346
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGGCCCTCACGCGGGTCCTTCCCGAGCAACCTCCTCTCCTCTGTCGAGCC
ATGGGTACGCGCGCCGCCGCCGCCTAGGGTTTCCCCGCCGCCAGCTGCTG
CCGCCCCATCTCCCACCCGCCGCCGCACCTGCCCGACGCCAGCAGAGCGC
CCGCCCGCCGCGAGCACCCGCCCGCCGCGAGCACCCTGGCCCGCTGCCGC
CGAGTCTTCCCGTCGCCAGCACAACCGGCCGTCCCCGATCCCCGCCGCCA
GGCCGCACCCTGCCATTCCTGGAGCCCGCCTCCCGCCGCCAGGCCGCCGG
GAACCCGCACAGGAGCGCTCGCCGCCCGCCTCTCGGCCGCCGGGGACGCG
CACAGGTGCTCCCATCTCCATGGCCAGTCCACCGGTAAGCTTCTGTTCTT
CTCCTTTTTTTGTTCTGTTCTTATTTCTTTTTTGTTTAGAAATAGCAATA
TCAGTAGTACTAGCAATGATATATGATGGATTTGTGTGCTGGATGATCAT
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TCAGGGGCAACACAAACATTACACATGTCATAAGCCCAAATCACATAAAC
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CCGGAGCGAGGCCGTCTTGTCGAGCGCTTCGCCTCCACTCTCCTTTCCTC
TGGCGACGGCCCGACATTGGTCGTCTTCCTTCCTCCGAGTTGTACTCCGC
CTCGAAGATCTTCTCGCCTCCTGTGACCAAGGTTATCTCCTCCCCCTCTT
CCTCGTTTTGCTCTCTCCCTGCTGATTCCTTCCATTCCCCGCACTGATGC
TCCAGATCTTTGCACCGTTCTTCAGTAGAGTTTTTCCTGTGGGATCTCTT
TAGGTGCAATTCTGTAGGTGCATTTTTTCTGATTTTGTTAACTTGACCAG
AACTACTTGGATGCCAAAATAGAGGTACCAATGACATTCCATGGTTATGA
TCAGAGTTATTTTGTTCTGAACTTCACATATCCCTCGTGCCATGCACAAA
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GCCACCTCCATCCCGAAAAATCGGCCCCGCGTGTCCTGATTCTTTCCCCG
CCTGTTCGCCCAGGAAACCGCCCACGACCCCTAGACCCCAACCCGCCCCC
GAGCCGCCCCCCGTTTTGTTCTTTCTCCCTTGTCGCTCACCCCACAGCCC
ATCGCTGCCAACCCTTCTGGCCCCAGATCCCGCCGCTGGTGAGCCTCCTC
GCCCCTCTCTCTCAGCCGAATTCTCTCCCAGCCCTCGTCCCCTAGGCTCT
GCCCTTCTGTGGTTGTCGGGCGCTCCACATCGGCGCTATGGAAATCGGCA
CGGCCGGACGACAACCAGCAGCCTCCCTTCTGTAGCAGCCGCCATCGAGC
CGGACGAGGACGTGGACCGCTGGCTGTTGTCTTCCACCCTGTTTCCCAGC
CGCAGCGGTACTCCTCCGCCCCCATCTGCTGCTTCCCAGCCTCATCTACA
CCGGCAGCAGTACTCCGCAGCAGTGCTTGCAACGTACTAGCAAAAACGCT
GCAATCTCTTCTTGCCTTCCTTTCCCAATTAATTTGTGTTGTTGTGGACA
GTTATCGTAGGTTTAGCCACTACCTGTCACACCAGCCAACTTGAGCGTGA
CCACCGGTCCGTGTTCAGGCGCTATCTCGTACTCCCTCTATTTCATATTA
CTCCGCACACTGAGCATAGTAGAAGTCAAACTTCATAATATTTGACCAAG
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AGTATATTTCACCTTGTCTCTGGTAGTATTGATTTGATATTATAATTATT
AATATATTTATCTATATTATAATTATTAATATATTTATCTATATAATGGA
TCAAACTTCGTGAAGTTTGACCTCGATCGAAACTAACGTGCTGAGTAATA
TGAAACGGAGAGAGTAGTTAATGCCCTTCTTGTTAATCTGGATCTAGGTC
AGTGCTCCGTAGGTGATGCATGCGGCAGTCGCGTCATGCCCTTGCATAGG
ATTTCTCAATTTCCCCGTGAGAGAAACTTGCAGGCATGCAATTCGTCGTT
TACCCCCCTTCACTCGCACAAATATTAGGCAAACCATAGGCGTGTCTATC
TCTTCCTATGTCCCATGCCCACCCATGAGAACACGCGAGGAAGTTAATTC
CTTTTTGATCATTTGTTCAGTCTCAACGATGATGTGGCTAGTTGATATTT
CATGAAACTTAACATATATGAAGCGGGTGGACTCGATTTAAAAAGGAGTC
CACCTGGTTCATATACGTTAAGTTTCATGAAATATCAACTAATATGAAGG
GGGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGTGCGGCACCTGCCCCCTCCCCATC
CGGAAGCGGGCTCGCAGACCGCCGACCTTTGACCTTCCGGCCTCGCGCGC
GGAACTGGACAACCGGTCTACCGGGCCGGCGGCTGTGATCTACTCGGCTG
GACCGCTGGATCGGGCGGGTCATATGAGGAAAAGAATTGGGGACAAAGGC
GGAAAGAGTGGACGTCCGCGAGCTCGTCCGCAAGCGGCAGCGCTGCTGCA
CCTCCTCTGCACCTTGACACGAGCCCCCTCAGCACATGTGCGGAAAGAGA
AAGAGTGGACGTCTGCGAGCTCATCCGCAAGCAGCAGCGCCGCTGCACCT
CCTCCACGCCTCAACGCGAGCTCCCTCAGCACAAGTCGGACGCCGCACGT
GGCCGCCGCCTATACACCGCCACCTTCGTCCAGCTCGCCGGCCAAGCCTA
CTGTCGCCTCCCTCGAGGCTCGATCTCCTCCGCCTGCCAACCTCCTCCAA
GGCTCGATGTGTACCTCACACAGATGAAACGAACCAGGACGAAGCAGTTG
TTGACTTACCTGTGGTAGTTGCTGTAATAACTCCAAAACATCAGGGGCAA
AATTGTCCAAAAACGGACCAAACCAAAGAAACAGTTTTGCTTTTATTAGT
AGGTATAGATTTGACGGAGCATAAGGGTAAAGGCCTTAATTTCATGAAAA
TGGAAGCTGATGTTCGTGAGGCCTCATTCAAGCGTATCATAGCTAAAAAT
CCTGATCTTGTTTGACGTGTTGTCGGTTGATGCTACTCGAAAAACTATCT
CTTTTGTAATGCTAATTAGAACTAATGCATGCAGACTTTGTTATATGCAT
CTACTATTGATCACTCTTATGTAGTTATTATGACTTTATTATGCATGACG
TGTTTCTTGGTGCTGCAAATTTGGTGATTATTATGTGCCAAAATTATTAT
GGACTTGTTGAATTTTGCATCAGTTGAATTATTATTGGAAGAGGTAACCA
CATCTCACACACATGCAATCTACCAAAAAGAGTCTGAGCTCAGCATGTCT
GAACAGACCTGGGCTACCAAACAACATCTCATCTCAACATATCTTGATAG
ACACAAGCTACCAAACACATGAAAGAATCTCAGCCCAACTTGGATGGGGT
CAACATGTATGAGGACAGAAAGGCATTCTAGGTTCACCCGGGCTACCAAA
CACACTGGTAGTGAATAATTTGAGACAAAGCACCTGTCAACTTACCTGAC
TAGTTTTTGGGCGAGCAAATTGCTGACCGTAAGTGAACGTAGCTTGTGTT
TGTTTAGTAGTTGGCTCAGCTTCTAACAAACAATACAATAGCTGCTAGCA
GAGATGTATTAACCGTGAATGTCCCTTTTTAATGATGATTGTTTTATGCT
GCTACTTTCTCTGTATTAGTCTCATCTACTCTCACCATGAGGAACATTTA
TAATTACCGAGGGCATTGTGAGTACTTCAATGTGGAGTACCAATAACCAT
TTGGAATATTTATGATTACCAGAGAGCCTTGTTGAGGCCTGTTTGTTTGG
GCTTTTCCTGGCTTTCCACAGGAATTAGCTAGCAAACCCAGCCAAAGAGG
CTAGCTTCGCCAAATCCACCATCCCGATTACACTGCCAAGAGAAAGAACG
TTTTGAGGTGCTTCCTGCAGCTTTTGACCCGAAGCGATATGTCTTTGCCC
ATTTCGGACTACCACCGAGCCAATCTTTCTTTTCTCCTGGCCAAATCAAC
ACAGCCCCCAACCCCCATGTCCATGCCCATCGAGTGAGAGAGTGGTTTGC
GCCGCCGCCACCTACGAATGCCGCCTTGCTTGTCGCTCCTCTAAGATCTG
ATGCTGGCGCTTGATCCGCCGCCCACCCTTGGTCCACCGGTGCCCGCCCG
CCTTGCTTCCCGTCCGTGTCGTCTTACTGGTGGCCGAGTACCAGGGGAGG
CTCCTGCAGGGCATGCCCGTTACGCTGACGCCCTCGCCGTACCCTGCGAG
CCACTGGCCGCTGGCCGCCGTCCTTCCCATCCCCGCCGACGGCCTGGTCC
GTGCATTGCCACCGTCTCTGCCCGTCCGCGCGCACACTGTGGAGGAGGGA
ACGTATTTAAGATATAGAAACTTAGTGGTTCTACAACATTTCTTGCACTG
CGGTAATGATGTTATTGAGCTGGGCAGCCTGGACTTCTCATGCAGCTTTT
ACTTTGGATATTTGTTTAGCATAATTTTTACTTATAAGACATTTCACTGA
ACTGTGTAATGAATTCACTTGTAAGCAATGATCTTCTGTGGCCACTATCT
GTACAAATGTTGGAACAGTTTCTGTAATTACCGAAAAAACAGTATAATAT
GGATAGTTCCTCATATAAACGTTATGCAGCTACTTGAACAAAAATAAATC
TGTTTTTATTATTTGGTGCAGATGATAGACATGATTTGTGCCATTGAAGA
GCTTAGTGGGCTAACGACTAGGGAACTCAGTGAGATGCTGAAGGAGTCAG
AGAGTTTTGTCTTGCAGTCCAAGGCAGACGATGGAGGTCCAAAGCAGGTA
ATTAGGTGCAACGTTTACATCCATTGATCACATTTTCCCTAACACCTGAT
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TCGTGGCATGCGCTTTTTGCATAGTTTATCTGAGCTAGCAACTCGCCACA
CTAGGCTGGAGCAGGTAACTTGTTATTTCACATAAGCTCGTCATTTCATC
ATATATGATTTCTTATCCTGTTCATATGAATCGTGCTATCCTGCTAGTCC
TTTTCTTCCATGTCAAATTTGGCTAATGAATCACATCATGTTGTGCTGGT
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TTATCTTCTTGCAGGTTCTTCTAGATAATGTGAAATTATCTGAACAAGTC
ATGGACCTGATATTCTTTGTGCTATCCATTCTTTCCCACTGGAAGAAGGT
TCGGCAACCACCAAAATATAAATTGAGCGCGGCATGCTTGTATTTAAGTA
TTATCATTTCATACTACTTTTTGGTAACATCTGTTGTTTAAAATTAGGAA
AATCATCTTGGTGCTTCTCCATTAATACATTCATCACTCGTAGCAACAAG
TCTTCATCTGTTGACAAGTTACTTTTCATCTCAGTGGCATGAACTTGTTC
ATATCCTTCTTGCACATCCAAAGGTAAGTAGGTAACATATGTGGTAATTT
AGTGACTTTTTAATTCCATGATTTGATTCTTAAGAAGCTGTGAACTAAAA
CCATAGAAATTGTCTCGAGAATCTATACCATGTTAAAGTCTATGTTTAAT
TGTTCCTGGAGGTGCATGGCAATGGCGGTGACGCCGTGCCGTTGTTCTGA
ATCTTGACGCCTCGCTATTCTTGGCTGGAGGCAAGGCTAGGCGAGGCCTA
CTGTTGTTGCGTTCTGTAGTTGAGGGCACCTGTAGTTGCTTTTACTGTGA
GGACTGTATGTGTCTGCCCCTCCTTTCTGGGAGGTTGTACCCTCGATGTC
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ATGTATCTAGACATGTTTTAGTGCTAGATACATCAATTTCAACAAGTAAT
ATGGATTGGAGGGAGTAGAAGAATTGATAACAATATTTTTATTGTTGACT
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TATTAAATCAGATTGTCAATCTGAGCGGGAATTAGTACTCCCTCCGTTCC
AAATTATTAGATGTTTTAGCTTTTTTCTGAAACACATGTATGTAGACATC
TTTTAGTGTGTAGGTTCGTAGCAAAATGAGTGAACCTTACACACTAAAAT
ATGTCTAGATACATGTGTTTTATAAAAAGGCTAAAACATCTTATATTTTG
GAACTGAGGGAGTAGTACTGTTAACATGAGTATATTTAGTTGGTTGCACT
ATATTATTACAGGCTGTTATCTGCAGGGATCATTTTATTATGTCATGAGA
GTAAGAGACCATGTTATTATTTTACGTCTTTACTTATTCTAGTATTCTAC
TGCTTGATGATAAAGTTTATCTGACTATTGCATGATTCTATGCACTACGG
TATTAGTTATTCGAATCATGTTTGTATTTATATATATATCTCAGTTAGAA
AAATGTTCAGAATAAAAAAATCATCAGAACACCTGTTCTTCTCATAGTTC
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ATGTTAGCAATACATGGATCTGCTGGTTCGGTACTTCGTCTTCAGTCTAT
TCATCTTTATTAATGTTTTACGTTCGTGGTCAGGTTGATATCTTTATGGA
TGTAGCCTTCGATTGTCTGCATGAAGATACGAGGCTATTGAGTGTCAGGC
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GGACTTAAGAAATTACTGACTCAACACAGGAGCTCTGTAGAAATGGAGGT
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ATCTTGGCACTGGAGGTTAGTTCTCCTAGGCCCGATGACGGCTGGAGGCA
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TTACACACTGATTAATACAGGTTCTTAATTTACTGAAGACCGCATTCGGA
AGAAAACAAAAACCTCCTGCTGGTTCCCATGATAAGAGCTACCCCATGGG
TTCTGTGCTTATCAGTGCATTGCGTCTAGTTGATGTCTTCTCCGATGATT
CAAACTTTAGATCTTCCTTCATAACTAATACTGTAAGCTCGCTTTATTGC
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TACTTCAAGTTCGTTTTGTTCATCTTATTCTCGTTGCAGATTCCCTTTCT
GACCCAAATTTTGGCTACCCCTCATGAAGAGTTTGTCCCGAGTTGGTGCT
CTGTCAATCTTCCAGTGATGGAAGATGATGCTAATCTGGATTATGATCCA
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AACTAAAGCAAACTATTTATGCCCTTTTCGCTCTATCAGCATGCCTTCAA
TAGAATATGCACAGACAAGAACATCTTGTGTGGTGAAAATAATAGCAAAT
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GCTATGATGTGCCATACAATTTTTGTGCAACCCTGTTAAAAGAAAATTCC
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ACTTCTTTTGCTGGGCTTGCAGGATTTTTGTCCCATTATGCTAAATCATT
AATTCCTAATAACTTGTTGAATGAGGAAGATGTGCAATTATTGAGGTGGG
TAATGTCATTTTGATTAGTCTTATCATGTTTCTTGATGTGCCACTTGGAA
ACAATGCATCTGTTTTTCTAGCTGCATGGCTGATTTTATTTGTCAATTTT
TGGTTGGAATTTGTTGCATCACCTGAAAACTTTTTTGATGATCTTTCTCT
ATACTTTCCTTTTCCTATTTGCAGTGAATTTGCTTATAAGTTACAACTAT
GGTGTAAATCGCAAGTTGGACACAGAACATTGCAGGTTTGTTTGCTTCAC
TCATTGATTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAAACACAAAGGACCTCTGTGCAT
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TTCATTTCATATGTTAGATCATCTATTACACAATGTTTTAGGTCGCAAAA
AGTGATACATCATCACACATGAAGGAAGACCTGCAACCGGTGCAACAGCC
CCTGCCAACAAGGGCTAATGTTACTAGTGTCCCAGACTCCAATATGGATA
CCCTTCCAAAGGTAATATTATTGGTTATGTTATTAGCTATTGACTTGGTA
TATGTTTGATCCCTCTCCAAAATTGACACTAACAGGTTGTGCAAAACATT
GAAGAGTCTACCGCAACACCCTCCATGAAACAAGAGGGAAATGCTAGGGA
TGAGACTCCAAGAACCCGTGTCGGTGTAAATGGTGGGCTCCTGCAGAACT
CAGTTGGTCAAAACCTAATCCATCTTGGTGTTGCGAGAACAACTAGCGCA
GGCTATGCGAGTGCTGGTACTGCTACTAGTATGGAACTCCCACGCTGCAA
AAGTGCAGATCATTTCAAATCACCAGAACCTACAAAAGAAGGTGGTCTCC
GGGATGATGATGAGAGGCAACCTAAGAGAAAGAAGCGGACCATTATGAAT
GATGGGCAAGTAAATGAAATCGAGAATGCTCTAATTGACGAGCCTGAGAT
GCATAAGAATGCGACTTCACTTCAGACATGGGCAGAGAAGTTGAGCCGGC
AGGTATTATTAGGCCTTTTCACTCGGGTATATTTTTTATTATGTTTATTA
ACTGGTTTATGTGCGTGCGATTCATGAAAATGTGGCTACATTTTTCAGGG
TTCGGAGATAACATCATCGCAACTAAAGAATTGGTAAGGTGAAATTATCC
TTCTTTCCTAGGGATTTACCATACCATAATATAAACCATCTTTTAGTCTT
TCAAAGTAATTTAATGCTACACCCTACAGATAGCCTTTATTCCTGCATCT
TAGCTATTTGTTGTAATAGCCTTTTCTTTAATTGCAGGCTGAACAATAGA
AAAGCTAAGCTTGCCCGCATCGCGAAAGAAAGGGGAGGACCGTATGATGG
TGAGAATGCTGATAAGCCATCTACACCAACTACTTGCCACTTTGGTGACT
CCTCAGAAAGTGCTGGCGAGGAGAGCTATTTGCCACCTTCAAGGATGCTG
AATGATCTAGGCATATCCAAGGGCAACAGGCTGGTGATCCCAGACACCAA
TGATCCAACTACACAGGCTGAGTTCAATCTGACGAACCGCTCTTTTACAC
GACCATTCTCATTTGAGCCTGGTCGTCCTGTTTTGTTGATTGACAACGAA
GGGAATGAAATTGGCAAGGGGGAGATCTTTCAAGTTGAGGGCAGGGCACA
AGGAAAGGGCTTGGTAGAGAGTCACATCTGTATTATCGATATCAGCGAGC
TTAAGATTGAGAAATGGAGGGAGCTCCCTCACCCCTCCGAGGCATCTGGA
AGAACGTTCCAAGAGGCAGAATCAATGCACGGTGGCGTGATGAGGGTGGC
GTGGGATATTGCCAGGCTTACTCCAGTGGCGCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.