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GrainGenes Sequence Report: AA000373

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Sequence
AA000373
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000373
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCAGAGCTGGTGGCCACCATGGTAGTCGAACCACTGCTCTCCATCGT
GAAGGAGAACTTGTCCAGCTACCTCCTCGACCAGTACGAGGTGATGAAGG
GCATGGAGGCGCAGCACAAGATCCTCAAGCGCAGACTGCCTGCCATCCTG
GACGTCATCACCGACGCCGAGCAGGCGGCAGCCTACAGAAAAGGTGTCAA
GGCTTGGCTCGACGAGGTCAAGACGGTGGCCTACCAGGCGAATGAAGTCT
TTGATGAGTTCAAGTATGAGGCTCTTCGTCGTAAGGCCAAAAAGGAGGGA
CACTGCCAGGAGCTTGGCTTCGGTGTGGTAAAACTCTTCCCCACTCACAA
CCGTTTGGTATTCCGTCACAGGATGGGAAGAAAGCTCCGCAAGATTGTGC
AGGCCATTGAGGTCCTTGTGACTGAAATGAATGCCTTTGGCTTTAAATAT
CAGCAACAACCGCTGATATCCAAGCAGTTGCGGCAGACATATCATGTTAT
CTTTGATCCAAAGAACATCATCAGCAGATCAAGAGACAAAGATAAGAGGT
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GTTCCCATCGTTGGAATGGGGGGTCTGGGCAAGACCACATTAGCACAACT
TGTTTACAGTGAACCTGAAATTAAGAAGCATTTTGATTTGCTGCTATGGG
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GAAGCAGATTCCAACAAGAAGGATGATGGTACAGTAGCAGCTGCCGACAA
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ATAGCCTTCAGAGTGCCGTGAGCAGGCAAAGGTACCTCCTTGTACTAGAT
GATGTCTGGAAACGAGAGGTTGATAAATGGGAACAGCTCAAAACCCGCCT
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GAGTTGCTAAAATAATGGGTACTGTTAAAGCTTATAATCTCACAGCTTTG
GAAGATGAATTCATTAAGGAAATCATCGAGTCAAGAGCATTTGGACATTT
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TTGTGAAGAGATGTGTTGGCTCTCCTTTAGCTGCAACAGCACTGGGCTCT
GTACTGCGTACCAAAACTAGTGAGGAAGAATGGAAGGCTTTATCAAGCAG
AAGCAACATTTGCACCGAGGAGTCTGGAATCTTACCAATACTCAATCTCA
GCTACAATGACTTGCCATCACATATGAAACAGTGTTTTGCATTTTGTGCT
ATATTTCCCAAAGGTTATGAGATTGACGTGGACAAGCTGATTCAACTATG
GATTGCGCATGGCTTTGTTATCCAGGAAAAGCAAATTCGTCTTGAGACCA
CTGGCAAACAGATTTTCAATGATCTGGCATCAAGGTCATTCTTTCAGGAT
GTGAAACAAGCCCGAGCCACATACAAGGAAATTGAAAGCACCGGGGCATG
TAATTCCAGAACTACATGTAAAATCCATGATCTTATGCATGATGTTGCAT
TATCTGTAATGGAAAAGGAATGTGCCTTGGCAACTGAGGAACTATGCAAC
ATAAGATCTGTTGTCGCAACTGAGGGACCAAGTCAGAATGAGTGGCTTTC
AAACACAGCTCGGCATTTACTTTTGTCATGCAAGGAACCAGCAAGAGAAT
TGAATAGCTCTCTGGAGAAAAGCTCTCCAGTCATTCAAACACTTTTGTGT
GATAGTGATATGGGAAATTCATCGTTGCAGCATCTATCAAAATACAGCTC
TTTACAAGCATTGCAGCTCCGTGTAGGGAGATCATTTCCTCTGAAACCAA
AGCATCTACATCACTTGAGGTACCTAGATCTCTCAAGAAGTTCTATCACA
TCACTTCCTGAAGATATGAGCATTCTATACAACCTGCAAACATTGAACCT
CTCTGGCTGCATATATCTTGGTGGACTTCCAAGACAAATGAAGTATATGA
TTTCCCTCCGTCACCTTTACACTCATGGTTGTCCAAAGCTGAAGAGCATG
CCTAGAGACCTCAGGAAACTCACATCCCTACGGTCACTTACATGTTTTGT
AGCAGGTAGTGGCCCTGATTGCAGCAATGTTGGAGAGCTCGGGAATTTAA
ACCTTGGTGGTCAACTAGAGCTATGTAATCTCGAAAACGTGACAGAAGAA
GATGCAAAAGCGACAAACCTCGTGGAGAAGAAGGAACTAAGAGAATTGAC
ATTGCGATGGACCTTTGTACAAACTAGTTGCCTGGATGATGCAAGAGTGC
TCGAGAATCTCAAACCTCATGATGGGCTACATGCTATTAGGATAAGTGCC
TATAGAGCCACTACGTTCCCGGCTCTTTTTCAAAACATGGTTGTGATCAA
TATTTTGAATTGTATAAAGTTGCAATGGCTTTTCAGCTGCGATAGTGATA
CATCATTTGCATTTCCAAAACTGAAAGAGCTTAGCCTAGGCAATCTTGTC
TGTTTGGAAAGATTGTGGGGAATGGATAATGATGGGATCCAAGGAGAAGA
GATAATGTTTCCTCAGCTTGAGAAGTTGGGTATTGTCCGCTGTTGGAAGT
TGACAGCATTGCCAGGACAAGCGACCTTCCCTAACCTCCAAGTTGTTGTT
ATTAAGGAATGTTCAGAGTTGACAGCCACTGCTAAATCACCAAAGCTCGG
TCAATTAGAAATGGAAGGACTTGAGATGGAGCTGTTACTGTGGGTAGCTA
GGCATGCGACTTCATTGACCTATCTGGATCTGACGAGCCTTGAAGCCAGT
ACAGAAACCACCTTGGCGGCGGATGAGCATAGTTTTAAGGAAGTGGTGGA
GGACAAGAAAAAAGGGAATGATCATGATTTTCCTCTGATAGATTTGATGT
TAACAAACTTTAAGTCCTGTGTAACAGGCCTTTTTGCATGTTTTGTACAC
CTTGTAACATTGAAAATTGAGAGGTGTCATGCGCTTGTCTACTGGCCGGA
AAAAGAGTTTGAGGGATTGGTATCCTTGAGGAAGCTTGAGATTACCAACT
GTGGTAATCTGAGTGGATATGCACAAGGTCTTGCCGAGCCATCAACATCA
TCAGACAAGAGATGGCTCCTACCACGTCTAGAGATTCTGAAGATATCTAG
TTGCGGAATGTTGGTTGAGATCTTCAATGTCCCTGCGTCTCTCAGGAGAA
TGGATATTCGTGATTGTAGCAAGCTTGAGTCCACATCTGGCAAGAGGCTG
CAGCAGGGACAGTCAGCATCTTCAATCCATCAAGTGGCATCTCTGGAATC
ATCATTCGGAGCTGGGGTGGAGCATTTAATATTAGTGGGGTGTCAAGGCT
TAACAGGGGTCCTCCATCTTCCCTCGTCCCTCAAGGTACTACAAATTGGC
TGGTGCCATGGATTGACATCTCTGGAATCTCGCTCGGGAGAGCTCCTGTC
CTTGGAGATGCTTGTGCTTCTACAATGCCGTACCCTGTCATCCCTACCTA
TTGGGCCGCAAGCATACCCATCTCTCAGACATCTTACCATTCAAGACTGC
CCTCGTATAAAGATGCTCCCTACAAGCCTGCAGCAACAGCTGGGCAGCAT
CCAGCATAGAGAGATAGATGCCCATTATTATCGAGGTAAGCACACAGCAA
CTACCATCTCTTTCACTTAGTAGTGAGTATAAAACGCACCAGTTGGATAA
TCATCATAGCATCACTAGTAGTATGACAGAAGATCAGAGTAAATTAAATG
GTAATTTAGCCTAAATCTGTTGTTTCTTTAATATGATGCTCCTCTAATTG
TACATTTTTCATCATTACTCTCTGCAGATACTCCAAGGTCTATGCCATCT
GTAAATATTACAGAGCTATAAACATAATCGCGGGAATACCAGCACGGAAG
TTGGCATGCAGGTTTGTGATCTAAAAACATGCGACACTGTTGGAACCCTC
TGGGCTGTAATTTTATCTCCCAGAAAGACGAATCTTGTTTGGATAATAAG
TACTTCCTCCGTTCACTAATAGTTTGCTAAAACGTCTTATTTAAATGAAC
AGAGGGAGTACTTTTTTTCCATTTATTATTGTATTTCTTTTGCAACTACC
ATGACGATATTCTACCCTACGCATTGTTAGTTTTTGTAAAAATTCTGTCA
TAGTTTCTGAATTTTTTTCTATGGACAGTACTATTTACAACCAATATTGT
GTTTTCCACGCATGGCAGTACTACTGTTTTGACTTGTATTATGGATAGAA
GGGTGTGTGAATAACATTCTAGAACTAGAAATTTGTATTTATCACAGCTG
GGCCTAGACTGTTCTATAGTATATACGAAGACAAAAATTTAAAAAGGTTG
TAGCGAATGTGAATTGAAGGGTTTCAGGTCTCACTCAAAATAAAATGCTG
AAGAAACACTGAACGATTTTTTCCAAAAAAGCAACTGTAACACTCCGGAA
TATTTTTCGCAGAACGGTGCTAATAGATACATCAGTATGTTACGGAATAA
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GTGGTTATCGCTGTAAACACCACACATACATATGCCTTGCTGCTTTTTAC
CATGACAACAAAATGGTAAGGTACAGCAGAATGGTACAACAACCACATAG
ACTCCCTAGTATGCATTGGTTCAAGAAATTTGGGCCTGTCATTGACAAGG
AAACAAGAGATTTTGTCATTGGAGGGTTAAGAAGAAGCTGCGGAAGAAAC
AATTTTCTACAGCAACATTTATCGGAAAAACTGAACTAGGTTACGACAAT
GTTAACGAATGCAGGAGAGTACCTGCAACTAAAACTGAGAGTTGCTGAGG
AATGTGACCATGCATCGTGCGCTCTGAAACATTTTGTCTATCTTCTGCCA
AACCAAGGGTACCCCTCGAGGAGTAGATGCACATTCAGACTTGGATATAT
TCGAGCTACGAATACCATTGTACGACAGGATACCTGGATCTTGCTAAGAG
ATCCATAATACATACAAGCAAAACTAGGGATTTGCTCCACCGACGGGGAC
CCAAACCTGGGTAAGTCGTGTTCAACCATGTTCCTGGACATTCGTTATTT
TCATTCCCTCTCTCTCTCGATAAACCACCTCGATGGCTATATCCGTTACT
TCCCCACAACATATTTTTATTTCATTTTAATTTTTTGTGAAAATACCTGA
ACCAACATAAATAGAGTTGAAGAACTAACTTCTCCCACTTTGAAAATAAT
ATATACATTTCATACAGGTTAATTCATAAATATCTCCATCATGAGTTAAT
AATATCGAGTTAGCATCTCTATGCCTAGGACGTAGTTTCACAAGAAAGTC
AGGTACATACTTGTTGATAAATATCAACGATGATATTCAAGGATAATAGG
ATTAAATTGTTCATGAATACATGGAAATATTTATCATCACATGATTGATT
CCAGGGCATTTTTTTTAACAATGTGGGTACGCACTTTTTTACATGTTATC
TTGCTCAGAAAAATATTATACTCAGACAACATTTTCTCAACTTTAACTGA
CTACATGGTTATTGTATATATGCATTATTTATCAAAAGGCTTTTAATTCT
GATCTCATTTCACTGGTATTACCACTTCCCTAAAGTGTTAGGAAACGGTT
TTTTTCTTGGTCTTCATGGTTCTCGATCTTGGAGATATTCTCTTGGACAT
CAATATCTATATACATAATTATTACTCTGTACCAGTTTTTCTATACACAG
AAGCTCTCGATTCTCCTCGTGTCACTAGGTCCAATTAATAGATAGGGGCA
AACGAAGCCAACTCTGCTGCTAATCCAAGAAGCATGTAGGCAAAGATATA
TATCATCGCACCGCAAATGCTGAAGTTGATGCATTAGCCAAAAAAGGTTG
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TCCACCACCCTAATTTCTGTAGACAGAAAAGAGCAGTTGTTGTTGCATGA
ACAGTGTAGGCTGGCAGATGATTACAAAAGCAAAGGTTGCGAGCTCTGCT
GTCCAGTCATTGCTTTGCTTCAGACAAAATCAACAAGCTGGGTCTCTGGT
GTTTGCATAACTGGACGAGAATATTAAAGTAGTACTGCTGTCATCTTTGT
CTCTAGTAAAGTAGTACTGTAGTAGAATTTGCAGTCACAAGCACACGTCG
AGCTGTGCTGTGATTTACTGGCATATTTTTGGACATATTTATGCTAGGTG
TCGTTTGAAACTATTCGATACATTGCACCATTTCTATGTGCCTTCAATGA
GTTAGACCGTAATAACATGTGGCCTCCAAGAAAATACAATGGAAGTTATG
AAGGGTGAACCCTATAGGCTGTAGCCCCAACCATCAAATAAATTAGAAAA
TAATAAACCACTGGTCCCAACATTAACCAATTTCCTTCTAATGAGAAACT
AAATATATCTTTCCTTAAATCACTGAGGAAGAAACTAAAGATATCTTCAT
TATAGGTTGAAAATAATAAGTAATTTCTTGTGAGGCGAATATATGTATCC
GTAGCTCTTATTTAGTCACCATGGTGTCTACCACAATATGTCCATAGTGG
TGAATGAACCATGACACTTTACCTATTATGAAGGGAAAAAATGTCCATAT
TAATTTTCTAGTGTATGTAAATAATAGAAAATGTGCTATTGATGAATTTA
AATGTGCGAATAAAATTATAAATGTGCTCTCAGCGGTAGTAGATATTGTA
GGGACATTTCAATTTGTCGCTTATGATGTACGGATATTGTCGTATTTCTA
ATAGGAACCGATAACAACCCACAGAAATCTAGCTACCTTGTTATTAACGG
AATTTTTAATGGCCACTCACACGTCATGCACCCCATCGGCTGGTTACAGT
AATTCAGAAAATGTCACAAGATCGTCGTGTCAGGACAAGACACGTCGCTC
GGATCATAGTCGCCGCCATGGGATCGGTACCCTGACTTGATTTCTCTTTA
ACAGGATAAGCCCATAATCTGAGTCCGGAGCTGAATTAGCCGGGTGCAGA
AATTTTCCCCTTTGGCTGCACACTTTATCTCTGGCTGCCACATTCTCTAA
TATACCCATCCTCTCGGAACAAGACATGGTAGTCACTTCATCTATAAAAA
CTTATATATTTTTGTGTCATCTTCAAATTTATCACATTGCACTAATCAAT
GACTTAATTTGGAATGTTATAGAGGAGCCATAGATATATAATAGTATCTA
ACCATTCACAATATTTAGCGCACACATATATGCCTATTGGTAATCATGTT
GACGCCTTTGAGAGGTGGAGCCTCTGACGTTCTTCAGATTTAAATGAATA
ATAAAACTACTTCTAAGAAATTGGCAAATGAATAAACAATTAGACAATCG
ACATGGTTTAAGGCTTAAAAGGTATGGAATTAGACTGTTCCTACACCTGG
CCAATCGTATTAGGTAAGACTCAATGATGGTACAAAAATAAAATAATTAA
AACTTAACATTCTGAAATGAGGTCTTTTTTCCCACCATTATTGCGCTAAC
CTATTTTCAAAAATTAGATAGGCAATAAAAGTTATCCAATTAAACTATGC
CTGCATTCTACCAGCCAAATAGTTTAAGGGCCTAAATTCGCAATAAATCC
AATCTTGGCATTTTCTCAATGATTAAGGGGTAATGACAACAAAAATAAAC
GGGAGCAATAAATAGTAGGAATATGATAGCTGTCACTCCAACCTGCGGTG
TGTATGACATGTGTAAGTGGGGGTGGTTGTGGCTTGGGAACCCAATTCCC
CTATATATACCACACCCGCTCATTCGCAATCACCATCATTCTTACTCCCA
TTTCTGCATCGCCCTACTCTCCTCCCTTAGCTTCCTCCCGCTATCCCTAG
TCCTCGCTTTAAGTAGTAATGGCGGCTTCAATGCAGGTCAACACCCTTCC
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ATTTGTATAGAGTTTTAGTTTCTCCTTAGTTGGATGGGTAACTCAATACT
GTTGGGGAATCTGATGTTTTTGTTGCGTTTATTTGCTGGGTTAGGGTTTG
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AAACTTCGTTGCTGAGGTCGTCAAGATCTTCTGCGAGGACGGCGAGCAGA
TCATCGGCGAGCTTGCCAAGCTACTGTAATTGTGTTTCCTCTATTGCCTC
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GGGCAGCAGTGCAAAGTGAGGTTCTTTTCTTCGTCTTTTATGTCCTGTAG
GCTGTAGCTTGTGTGTTTCTGCAATAGCATAGGAGTGATGGTTCTTGTTA
GAGGTGCAAATCGGGTATTATGTTCCATAATTTTTTTAACCATGTTTATA
TCCCCATAGATTGGAAGGACATAGATCCTTTGTAAGGACGGTCATCTTGG
AGAAGACTTATCGTCGGTTTGATCATTCTAGTGTTTTACGAAGTAGATCT
GGCAAACGCGATTCATTTCACGTATTGGTGTATTATGACTAGCGCTTCCG
ATCCATATAGTGAGGGATGAGATAGGTTTGTCCCTTGTATTGATTTATCA
TTTACATCTAACGAACTTTATCCGTTCCGTACACATTGATGGCATCTTCC
AATTAATTTGCGAAGAGGTTGAGATACCATTTCATGATTTAGATCCGACA
AATCAGTTGTCGTTTTACTGTTTTGTGAATTATATCCGACAAATCATTTT
GTCGTTGTAATGTTTTATGGTTTAGATCTGACAAACTATTTGGCCGTTGT
AGACCCGGCAATCCATTTGGCTGTTTTAATGTTTTCCCATTGAGATCCGA
CAAACCATTTGGCCATTTTACCCTTTTATGATTTAGATATGACAAATCTT
TTTGTCGTTATACTACTTTATTACTTATCGCAAACCTTTCGGTTGTCGTA
GATATGACAGACTGTTTGGCTATTTTACTGTTCTATGTTTTAGATCCGTC
TGATCATTTAGCCATTGTGCTGGTATATGATTTAGATCTGGCATATATGA
GCCGCTTCGCTCAAATCGGATAGCTCAAGGCGTAGCACTCCACATTCTCC
CATGACAAGTTTTTCACCCAATTTGTATTGGAGGGGCTGACAGTGTTCTG
CTGTTGTAGTGTTTTAAACTAGATATGATAGGTTTGCATGTTTTGCCTTT
GTTTACGAAAAATATAGCAGCTCTTTTTTTGGTTTTGGGGCTTTGTTCTT
CTGGTATAGGTTCCCAAACCATGGTATTTTTAGTTTCATACAGAAGGTTT
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CTATTATGCGCAAACCATCCTATTTCCGTATCCATGTGGTTATATGGAAT
CAATGTTTGTTAGCCAATGAGTCTACATGCCTTTGTTTACCATAGGTTTT
CTTAGTTGTATTTAATTCACTTGTTAACCCATATATGGATGATCATAGTG
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ATGCTCTCTTACATTTATTAAATATAAAATTTGGTGGCACTTAGCTGATT
GTGTAGTATTAAATCTTACAGTGTTGGTGCTCAGAGAGTGAAGAACACCT
GCGTTCTGTTCCATGTGCTTAGTCAGGAGAAGAGGAGAGATGGGTTAGTA
TCTTGTATCATTATATCACAGTATTGTACTTCCTACTGAATATGGCCCAG
TTTTATATTAATGGCATTAGAGTATTATCGATATAATTGCGTGGTCATTG
CTTTTGTAAACTTCTAAAATATTCAGTCTTGGCAGAAAGATTGGCTGACT
GTACTGAGCTTGGTGGGTTAGGAGTGTGACTGTTTAGTACAACAAATCTG
TGCTTTAAAAATGTTATATTATATGTAGAAAACTATTCCACTCATGCTTA
AAAATTGTAGCTGCCATTAGATTTTTTTCTGTAATTAATAACATGCTCCT
TTCCTGATCTGTTAATGGAAAAGGGGCTTGACAACTTACTGAACTGTTCC
CCTTGTCAGGTGTCTCAAGGCATTGAATGCTCTGAGGAATGATTTCTATG
ATCTGCGCAACAAGTTTCAGAATTTGCTTCAGGTATTTACCTTAGATTTT
TCTGACACTCAGTGTTTACCTCTCGGTAGCATTGCAGTAAACCGGATGAT
CCATCTTCGAAGGATTTTTTTTATTCTGAAGTTTTGTTGTTATGCAAAAT
ATTAAACTAGACAGAAGACAAGATGATAATGGAACGGATTCAGCTAGTTT
GCTGCATAACAACAAACGAAAATCATGTTCATGAACTGAATGCAGTTAGT
TTGCCTGACATACATGAAATTACTAGCAATACCTTTGGAAGATAAACAAG
CATGGACATGCCATCTTCAGTTCTTTATATGCAAGTCTGTGTGGCATATG
CAGTGCTAAATTCTGAGTTATACTTAAGACCACCACATGGTGTCGAGAAT
ACTATTTAGGACTACCGGAAAACTTAGCTGAAAACATTCATTTACCGATT
ACTGGTTTGGGGTATGTCTGTATCTGAATCTTAGGTTCTGTTGCTCTAAA
AGGTCATTAGAATTTTTTTCATCTCAATTTTCGAAGCATTTATAGACTTC
ATGCATCTGACCTATTTTTCTGTTCTGCAATGCAGCTGGAGCAGCAGGTC
GCAAGCCTCCCATCCTAAGCAGTAAGCTGGAGCAACAGAGTGGGGCCCGC
ATGTTCTGACGGCACTGTTGCCTTTGAAGCCTTAGAACATGCTCAGTTTG
CTTTTATCTTGGAGTCGTTTGCCTCCGTGAGGCCTGCAGCCTGCTTAGAG
GCAAGCTGGTAATGTCTGTGTCGCCGACATGGTAGTGTCGTTCTGAATTC
TCAGTGGTCGAATAACAGTCATCCGCTGTCGCTTTGCGGATTCGTCGGTG
GTTAATCTGGCTGCTCAGTTCTAGCCGGTTTCTAGGTCGTAGGTTGGTCC
GCAGTGTAACCGTGACATAGTCGTTCCTTGTCGGTCGGTGGTGGATCGGC
TGTGGTTGTATGTTGTGGAGAACATTGCGGTGTCATTCTACTGTCAAGTT
ATGTTTGCTCTCGGAAAAAATGCGCGTACCATGAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.