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GrainGenes Sequence Report: AA039737

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Sequence
AA039737
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039737
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCGGCGTGACCCCTCGACCAACCCCCTCTCTCTCCTGCGTTGGCGGCGG
CGCCACATCCCCGCATTCCCCATGTCTCTCCCTCCCTTCCCCGCGCCCTC
CAGTTGATGCTCCCCGCCCCAACTCCGGCCGCCGTGATAGCCAGCTCGCC
GTCGCCGCCGCCTCCCTCTCCAGTCCTCCTCCTACCCCCTAAAGCCCTAG
CCCTCATGTGGCGCCGCCTACCCTCCCGCCGCCTCGCCTCCGCCCTCCTC
TCCGCCTCCGCTCCGCAGCTTCCTCCCCCTAATCCCCTCCACCGCCTACT
CCTTCCCGCCCCCACTGCCGCTACCGGGATCCTCCCTCCCCCGCGTCTCC
TGTGGGGGCAGCATCCCCCGCGATTCGCGTCGTCCTCCGCCGCGGCGGCC
GCCGAGGCCGTCTCCTCCGAGGAGGTTGAGGAGCCGCACCACGCGCTCGA
GGAGATCGTCCGCGTGGACCCCAAACCAGCCGCGGCAGGCGAGGCTGGGA
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AGCTGCTCGCCGACATGTGCGAGCATAAGCTGGCGCCCAACCTGCCCTAT
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TTCGAGTTTGGAGTGAATCTATACACTAAAATAAATCTAGATACATTTTC
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GGTGACATCAATTGAAACTATCAGTTTATTTTTTTCTTTTGGGTAAGTAT
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CCCCATGTACTCTGGGTTACTGGAACATGTACTAGGTGATTAGGTACGTC
TGGAGCCAAAAAAAAAGGATCCAAGTAATATTTTTTACAGTTGAAATTTT
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GCAAGGTACCCTTTAAAGAGGTTATGTAAATATAGTGGGAATGGTGCCAA
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GGCTAGACATCATTACTGTTGTTGGTAGTAATTTGACCTCTCATAATGGA
AAAATACACTTATCTTAGTTTTTCTTCTCTAACTGGGAATGGTGTCTGTG
TTTTTCTGATATCAAGTACATTGCTGGAGCATCGATAATCTAACTGTTAC
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TTTACATGTGTTGACATTGTGCCATAAAGAGGTACCTTCATTTTTCTTGG
GACGGAAAGTGATGCCTTTGTTAACTTCAATTTCCTTGCATATCTTTGGT
GTTTGCATTAATTTTCAGTGAGTTGTTAACTTGGCATTTATTTCTGCCAT
TGCACCACTTATGGTGACAACAATTAAATGTGATACTTGAAGTATAAACT
GCTAACGAGCTAGGGTAATGTTTTTTCCTTTTGTCCTTGACCAGGTTCGA
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AGATGCTCATGCAAAAGTATGCATTTTCTTATTTTGTGATGATAGATGTG
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GTTGGTAGCCGTTTGATTGAGATATTGATTGAAACAGCTCATATACAACC
ACCTGCTAGCCAATCTGCAGATAGTACACCTGAAATCCGACCTGCTTTCA
CACATGAAATGCGAACTGTGGCGAGAGAACAACAGTAATCATGTCAACTC
TTACTTAATACTTCTTGTCCCAAGAGCAGTGATGCTCAGTTCTAACATAT
GCTTTCTCTCATGCCTTGTACTTAAACAGGAAAAGTCGACGGTTTGGTGT
GATCAAGTGTGATCCACTGGTTCGACAAGGTCTAGATAGAACAGTAAGTC
GTCCTTTCTGTTACATTTGCAATGATTTTCTTCGTCCGATTTTTTTCCAT
AATGTCACATTTTCTTCATGGAAATATTTTCTGTAACAGGCAAAGCATAT
GGTCATACCTTACATGCCTATGTTGATTCCGCCAATCAATTGGACTGGGT
TGGTACTGCTTATCCATTTTGCTCACAGTTATTTTGCATATATGTGTTGT
ACTTAGTTGAAACTAATTATGTTGCTAGGTAGCTCAGCTGTGCTTCTAGT
GTGCTAGGTTACATAACACTGTTGCTGAGTGTAATCACTGATCAGAATGA
CCCCCCTTCTCAATTAGTTCAGTGTGTGGTTCATAATAGTGGGTGCTACT
CTGTTAGATCATTACTTCTATAACACTGACGAGTCACAGAGTTATCCCTA
ATTGTCATAACATCATGCCTGGAAGTTAGTAGTGCCATCCAGTAAATGTT
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GTTATGATTGAAATATTGGGGATCCTTTTCTAGCACACTTGATGCTTTAC
CAAAGCTGCTTCTCTTGTTAATGCGGTCTTGCACATCGACATGTTCATGG
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TCGGTTCCAGGCCTTAGATACTCTTGGGAGCACCAAGTGGAGGGTCAACA
AAAAGGTTCTTAGTATTGTTGACAGAGTATGGTCGAGTGGTGGCCGACTT
GCTGACTTGGTTGATCGTGCTGATGTGAGCTGTCACTTTTTCTCTCTTGA
TTTCATCTTATGAAGACTTTAAGGCATTGCTGTTTAACATGCCAACTTTT
GTTTCATGTAGGTTTCCCTACCAGATAAGCCTGACACTGAAGATGAAACT
GAGCTGAAGAAGTGGAGGTGGAACATGAGGTCAGCCAAGAAGGAGAATAG
TGAAAGGCATTCCCAGAGATGTGATGTAGAGCTTAAACTTGCTGTAAGCG
ACTATAAGGGGTCTTGCTATCGTTAACGATTGAGCTGGACATAACACACT
CAACCTTTACTGTTCATCTGACGTATCCTTGTTGGTAACAGGTAGCTCGG
AAAATGAAGGAAGAAGTTGGGTTTTACTACCCACACAACCTCGATTTTAG
AGGCCGTGCTTATCCAATGCATCCTTACCTTAATCACTTGGGTTCAGATC
TTTGTCGTGGAGTGTTGGAATTTTCTGAAGGTCGACCACTTGGTGAATCA
GGCTTGCGCTGGCTGAAGATACACCTAGCTAATTTGTATGCTGGAGGTGT
TGATAAGTTATCCTACGATGGTCGAATTGCATTTACTGAGAATCACCTGG
AGGACATATTTGACTCAGCTGATAGGCCTCTTGAAGGCAAGCGATGGTGG
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TGCACCAGGTACTGATGTTTTGTCTATGTTACATCATTCTGCTTCTCACG
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TGCTTTGCTAGGATAGAAAAAGTTAGTCATATTTGCTTCCGTCCCAAAGC
TTAAGGCTTATATTTTTTTTAAAAAAGTCAAGCAACGGAAAGTTTGACCA
AACTTTTAGAAAAAACTGTCAAGAACTATGATATTATATAGATACCATGT
GAAAATATGTTTCATGATGTATCAAAGGGTATGGGTTTCGTACTGTAAAT
ATTAATATTTTCCTCTAAAAAATTGGTCAAACTTTACGTAGTCTGAAATT
TGGAAAAAAAATATAAGCCTTAAGCTTTGAGATGGAGGTAGTATATAACA
ACGGCACGCTTTGATGCTTTCCAGAAAAGTATAACTGATGCCAAAATGAT
TGTATAATTTTTTTTAACTATTCGTGAGCATGACTTGACGAAATGATGTG
CAAATAAATCTTAAGTGCATGGTTATCTTAAAAGCAAGAATTTTCTTGCC
GCCCATGTGAACTAGTTTGATAAGGTTTCTTAGTTTTACCAAACATGTCA
TGGCTCATGGCAGAGCAACAGTCGGTCTAGTTCGGGAAGGAGATACACAT
TGAGTCCACGAAGGATGTACCTATGTTTTAAGAGTTAGGTTTTGTTTGAG
ATTGGTTTAGTCGAAGTTTTAATCTGTTAGGATTTAGTTATTTGATTTTG
GTAAGGATTTTCTTTCACTTAAGGAGGGATTGTTTCTTTAAAAGCAAGCA
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GTTTTATCACAGCAGCTTTATATCTACCAATTTCTGTTTCTTCGACCCCA
GCTATTCTCTCCAATCTGATTACATAACCGAACACCTAGCTTTGCTGGAC
AAGTTTAGGTGGGCAGTTACATGGGTTACAGGGTTAGCAATGGCACCGAA
ATATCCTGACTGTTCTTATGTAAATGTTAAATTGAAGGACAGACAGATTT
TGAGTTGCTAGAGTATCATTTTCTGCTTTGGGAAATCAATTCAGTCAAGG
TAACCAACTCAGCCAAAGATGGAAAACATCCCATGTCAGGCTGACAAGTG
GTGATGAGTGACAGCTTTTTTTACATTGTGTGCACCATTTAAATACACGG
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TGTTTTCTTTTCAGAAGTGTTTGAAATGTTACCTTGTGCATGTGTGCTAT
ATGTTGTACTCACTCCGTTCCAAAGTAGTTGACACAGCTTTGTCTGGATA
CACATGTATCTGACACGTTACATGTATCTAGAAAAGCTGCGTAATTAATT
TGGAACGGAGGGAGTAACTTGTAACTAGAATATTTAACATTTACGCAAGA
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CTAAACCATGTAGTTGCCCACCTAACCTTGTATAGTAAGGCTAGGTGTTG
AGTTATATGCTTGTGCTGGAGCAGAATCATGATATAACGTTTTATGTTTC
AGGATGGTTCTTGTAACGGCCTGCAGCACTATGCAGCTCTTGGAAGGGAT
AAGGTCAGTTCATGTTTCTATTAATTATTATGTTGTTCCTTTATCAAAGA
TTATGTTTGGCATGGAGAATATTTAAGTTTTGGTTAAATACATAATTACT
TCATAAATCAATTTTATGCAGCTGGGTGCCATTGCTGTCAACCTAGTTTC
TGGGGAGAAACCTGCAGATGTTTACTCTGGAATAGCTACCAGGTAGATGA
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GATGCATCCAATGCCTTCAGTTGATCCTGTAGACTCAGTTCATTTGAATT
ATTATTTAACTTCTACTATTTTCATTTTATTATGAAAAGCATTCACGTTT
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CCCTGATTGCTGCGCGTGCACCTTCCCGTGGCCTGATAAACCATGTATCA
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GGTCAACGGCAAAAACTGTACCATGTCAGGTTTTGGTCAAAACTATGCCA
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TTTTTACAGTTGAGGAATCAGGGTTTCCTGGCTCTGGAGTTGAGGGTCCA
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AATCCTGCTTAGTATCTTTAATGTGGCAGTGCCTTATCGACAAGTCAATT
AACTGTAAAAATATAGATTTAAGGATCAGGTCCAAGTTTATCCATCTTGA
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CCGTACACTTGTGATCCAGGGTCGTGGAAATTATGAGGAGAGATGCACAA
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TCATATGACGAAAATACTATGTTTCATAATATAAATATTTGGACGACATT
GTACCTCCGAGTTATACATATGTGTGCAGTAAAGCTGAGATCTGGTAAAT
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TGGAAATTCCTCGGATTAGCGCAAACCTAGCTAAGGTATTATGCTAAATG
TAGTTTATCCGAGACATTTCTCTAGAGAGCATATATGTATTCAGCTGATA
TAAAAGCATGTTGACTAAAAGGGCTGTCATAAAATTAGTGTTAATCTAAC
GTACTGAATAATGTCTGCCTTACCTATTTCATGGGACAGTTTGATTTGTG
TAATTGCTTTTAGTTGATGCCTCACAGGCCCACAAGGGATACTTAGAAAT
TACGTGAAGTTTTACGTGCTTATTATAAAATGCAGGTGGATAGGAAATTG
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ATTTATTGAAGCTTCCGTTCCATCAGCTAGCATATACACCTAGCACTAAA
GCACCTTTTTTTTTGTTTCTTTTTTCTTGATAGGTCACGCTGACAGCGCT
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GTGCCAAGGTATCATCAGCAGTATCATTTCTTTCTTCTGAATATCAGGCG
ATGTTTGATGCTGCATTTACATTATGCATAAGAAAATCCACTTCAATATC
ATGTTTTGGCTGCTTCATATGTAGTATTAGTACTGCTAGGTGATCACAAC
TTCATTTGTGAATGAAGCTTCATATTTGATCTGCTGGCTTGTCGAGTTGT
GGGTGATTTAAATACAGTAAAAGTTACTTGTTATTAAAGACATATTTCTT
TATTTTCAATATTTTTTGACATGCTGCAAAAAACATTGGGTCCGTATTAT
CTTAGAATTCGTTTCCGTTGGTATCCTGTTAGTGCCGAGTGCCCCAGCAG
GTACAATGTTCCTTTTTCTGTCTATACTTTTTGTAAAAGGCAGCGCGGGG
CCTGAAAGAGAGGAAAACCCGGGAACATGAAAATGAATAAAATATTCCAT
CCATCCCAAATTACTTGTCACGGATTTGTCTAGATACACATGTATCTAGA
CGCGTTTTAGTGTGTAGATATATACGTATCTAGACAAATATGTGACAAGT
AATTCAGGACGGAGGAAGTAGAATAAAAACTTAATTACTTTCTTGACTAT
TAGAAGAATGACACATTATATCTAAAGATTAAAAAAAGTTTGTCGAGGCA
AACTGCTACAGCCATCTTTCAGTTAACATTCTTTTTTGATGGTCAAGCTG
TCCTGCTTTATCCTTTTGAATTTCTGTCTCTAAACAGTTTGTCCTTTTTA
ACCTTGGATATTGAACGGTGGTCCATCTTCTTTGTCTGACAGGTAATTGC
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TGTCTAGATACGTTCAAATCTAGACAAAATCAAGTCAGTTATTTCTGGAT
AGAGGGAGTATATGTTCAGCACATCTTATTGAGAGTAGGGCGTTGGCTGT
TGAATGGTTTTTCGGCAGGAAGTTGGTAATTGAATTTTGTTTGCATAATT
TGAGCATCACATTGTTGGAGCCGTCGAACTTTTTGTTTTCCTCATATAGC
ACTGGCACATATAATGTATCATTATCCATACTTTTGGAATCTGATAGATC
CATTGAGGACTCTTTACTTAAATGGAATCCGATAGATCTATTGGAGATTC
TATTTAACGTGTATCCTTAAACCAGGTTATGGTGAAGCGGCAGAGGACTG
CTTTCCCTCCAAACTTTGTACACTCCCTTGATGGCTCTCATATGATGATG
ACTGCTGTTGCTTGCAAAAGACAGGGCCTACATTTTGCAGGTTAGAATTT
TACTATCTATCAGAGTATTTGTGGGATCCTTTTCTACGCCTGTGTATTTT
ACTATTAGCTTTTATGTATCAATGCAGGAGTTCATGATTCATATTGGACC
CACGCTTGCGATGTTGACACAATGAACAAGATACTTCGGGAAAAGTTCGT
GGAACTATACGATGCACCTATTTTAGAAAATGTATGTATTCTGCCATCTC
AGTTATTTACAGAGCTATTGAGCATTCCATTTAGTAACTGTAGCCTAAAT
CACTATCTATCTTTGTCATTTATTGGTTTATATTCCTCTTTGCCTGCACG
GCTTAGCTGATTGGGGCTTTGGTTCTATGCTTGTTGGTTTGTCACTTAGT
AGTCTTTTAGAACTATCATAATTGTTTGTTGTTTAGTGCTTCTTCGGCTC
CATGCTTTACCATGCCGAGCTTGCTTTTCTGTCTTGTTCTTTTCCTATAC
CGTGCATTCAGTTTGTTAACACAGCATATTTGATGCAGCTCTTGGAGAGC
TTCGAGACATCTTTCCCTACATTAAAATTTCCACCATTGCCAGAGAGGGG
TGATTTTGATATGAAGGATGTCCTCCAGTCAACATATTTCTTCAACTAGC
ACGATTACAAATGGCGTATTGTCCTCTGCTATCCAGCTGCGGCCTTGCAC
AGATCTTGAGTTCTGCCAGAGTACATGAGCGACTGACTCAGATGATGAAA
CTAATTCTTTTGCTTGATTGACGTGCCAACTTGTGGACAACTTGCATGAA
GATGATCCCACAAGAGTGGATTTACAGAGGTACACACAATGCTCTTGCTC
TGCTGCAGAATTACATGAATTATACACCATCCACCGAAAGCAAGGTGCAT
GTCTATTGCCAAGGAACTGGTAATAAACAGAGCTGGCCCAGGAGGAGATC
GATGAAAGGGACGGTCAAAATAAGTGCGGATATTATTTTTGTGTGTGTTT
GTGATATAGTGTAGTTTTTACCTGTGCCTCTTTTTTTCCTTTCTAAAGGC
TCATGGATAGCACACACACTCTGTATCTCCACAGATCATCAGATTCCTGT
AAATGTAATTATATGTAGTTTTTTGGCCTCTTCACTAACCTATCATTTTT
TCTTCTTATTTCTCTTAATTTATAGTTTGGAATCTGATGTGTGCGACACT
ATACTGTGGAAAAGTAATTCATAGCTACCATTGTAGTGTTGTACGATACT
ATCTATATAATAAAGTGATATACCGGGCTTCCTGTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.