Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA045495

[Submit comment/correction]

Sequence
AA045495
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045495
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGAACTTCAAATCGTGACCCTGACCACCCAAAAAGAGAGAGAAAAAAAGG
AATAAGAACTTGAAACTTGGACCCGGCTCAAACTCGCTAATGACTACTGA
CTGATCGACTCGAGTGGAGTCAACTCGGCTCGAATTCCAGCCCTGTATAT
ATGTGTGCTTCCCTCACATATAAAAAAAAAGTGTGCTTCCCTCACACTTG
GCTTTCCACGACCTCTTCCTTCTCTTACTTGCTCGTTCTCACGGAGATGG
AGAATGGAAATAAGCAGCTCCGCCTCCTGTGGTGCTGGGCGTTTGCCTTG
GCGCTGCTCGCGCTCGTCGAGGCGGACGGCTTTTTAGTGGACATCACTTA
TGTTGAGAGCGCCGTGGCCAAAGGAGCAGGTCAGTCACATAGCCTCTGTC
TTATGCTCTACCGGTTCATCCCTCACTTTCGTAAGTACTCTACTCGATTG
GCTGATCAATATAGTAGTAGCTTGATGTGTGCTTGAGTGATGCAGTGTGT
CTGGATGGAAGCCCACCGGCGTATCATCTTGCCCCAGGCTTCGGCTCCGG
GGTAAACAGCTGGCTGGTTCATTTTCATGTTAGTTGCAACGAACTAAACC
TTTATTTGTAGTAATACATATACATTCGTGCTTTACTGGATCCTCGAAAA
CCAAGGAATGGTAAGCTCAATCCTTTATGCGAAACGAACGGTGGCAGGGA
GGAGCATGGTGCAACAATGCGACGGACTGCCTGCGGCGTAGCCTCACGGC
GTTCGGGTCGTCCAAGGAGATGGCCAATCAGTCTGATTTCACCGGGATAT
TGAGCAACACCCCGGATTACAACCCAGGTACTCCGATTTCTGAACTTGGT
CGACGAATGCAAATTTTTGTCTGCTATGTTTTCTCTCTGGGTTTTAGCTG
TTCAGGGTTCAGATTTGCCCAGGCTCGGTGTAAATTCATTTTCTCATTTT
TTTTTTTTGGAAAAGTGGGGTGTGCACACAATCTCGCGGAATTTTAATCT
AAAATCTTACAAAGTGCACAGGACAGTTACAAAGTTCAGCCAAAGGAGAA
GATAATACATGACACATTTATACAACATGACTCATATTGCTAGGCCCCCA
TCTAAATTTGCCAGACATATCCCGTGCTGCCATTTTCAAATGGTCGCACC
TAGAGTACAACAACTCCACCTGCACTAGATAAAGATAGGATAGGATCAAC
TATGGATCCACCGGTAACATGGGAGATTATGATCTTGTTAAGAACATCAT
TTATTATATACTATATAAAAGCAACATAAAAATATCTAATAGAGCCATCA
CGTTAATCCATATCACCTAACTTATTTTGATGGTTAGATAAAAAATGTGT
GGCTAAAATTTAACAAGAGATCATTAGTTACGTAACTATGTTATCTGATT
TTACATGGTTTGACACGGTCCATATTAGATGTAATCGTGTACACGTGAGT
TAGGTAACTATATAATCTGGTTTGACACACGGGTCCATATTAGATGTACA
TACACACGTGAGATATATGGCTAGGTATTGTTTCTGGATGGATTAATTGG
ATATACAATCGTGGACTAATGTTGGTCATAGTGGGACTATCATATTACTA
GTATAATGCATATGATACTAGTGTATATATATGATACTATTTCTATATAT
ACAACCACGTGGGAAATACAAGGCTTATGATTACTAATTTCATTAAGTTT
TAGCCATAAATAAGTACTAGAAATTTAATGAAGAACACACACTTCTAGGT
ATAAGAACACGCACTGAGGATCTAATTTTTCCCTATGTGCATAGAAACTG
ATGTTTATGTATACATTAATGAGTATGCACACATTTCGTGCTACTTCTTA
GAGTATGAAGGTGAAAGCGAACTTTTTTCTAAATATGGTTTAGTTTTTGC
CATCAAGCCTCCACATGTAATCTGAGGAGAGGAAAAAAGGAAAAAAATAC
TAATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTGTTCATGCCA
ATGTAAGAAAAAAATTGTCGCATTTAAAATTATGAAATGACCAACATACT
TCCCTTTATAACATGGGCACATCAATTATTCATCTCATTAAAATAATGAT
AGTGTAAAGTAGTACATACAATATTTGTCTCATCTATTTTCCTTTAATTA
AGTAACCTAACAGAGACAAGTCACACACAGTGCATGAAGTGCCTCTGTGG
TTATTTCAAACCATCGGGAGACGGCACAATCTAAGATAATATGGTTTGAT
GGCATTACATTCTTAGACATGAAAGATAATAAGAGCATGTGTTTTATGCT
CGTCTGAACTGATAGGCTACTCTTTTCATCCCCAGTTACATGGCACATAA
ATTTAGTACAAATTCAATCCATTATAAATTTGATCAAATATATAGAAGGA
AATATCTACAACCAATTCATTGAACAACTACATTATGAAAATATATCCTA
TGGTCAATATATTGATATTGATTTGGTATTATATTTCATATTTTTTTATA
TGTTTGGTCAAACTAAGAAAGCAACATTGCCTTTTTAACTAAGGTATATA
CCATTTATTTATTGAAGAAGAGAGTGCAACTTAATTAAATCAATATAAGC
AATTAATTTTGCTTGTTTAAAACATAAAATATACGTTTCCTTGCAAGAAA
GATATCTTGATAACACATGTCTACATCTACTTGGAAATAGAGAAAATCCA
CTCTAATAAACCAAAAAAAAAAATGTGTTATGGAACCGAAACTAAAATTT
ATATGTATTTAGAGTAAACCCCCATGGCGCACTTGAGTTTCCTTATGTTG
GTGTTATACCGGGACCCCATTAATGTGACATGCGAGTTGAATCTTATTCC
AATAGTTACAAGTATACCAAATTATATATATGCGGGATCAAAGTAGGGGA
GCTAGATCAATAGCATGTTATTCATATATGCAAGTTTGGCCCCACGGAAA
TGACAATGTAACAAGGAATTTGTGTTTACATGTCAATCTCTGTAGTTTAT
TATCCCACCAAAATTAAAATGATGCCCCCTTGAAACTAATATGTCACTAT
ACTCATGTTGTATGATAAAGCAATACATGTAAACGAGAATTTTATACAAG
GGTAAAAGCTATCTATGAACGACATAAAAAAAGTAGATATAAATATTACA
TACTTTGTTTCATTACATATCACAAAATAGAATATTAAGAAAAATCTATC
ATTAAATTTGAGCAGAAAAATGAAAAATATCAAAGTTCAAAGATAGAATA
GGTTGCCATTATTTGGAATATATTTATTAAAAAGTGCAAATTTAAATCAT
GGAGATTGTGTCTTTGTTTAATACATGACATATTTAAGAATAAAAATTGA
ATGATAATATTCCATCATAGGATTAATGAGTAAATAAATTGATTATGACA
GTATAAAGTTCAAATTCTCAATATATGTTTCCCTAGCAGTCAAGAAAATT
TCTTTTATTCACTCCGCAAACTAAATCTCTTTGTAATTAGGGTAAAAGGT
TTACTAATTATTGAAATTCTTACATAATCACCCAATAAAATTATGTGTTA
AACTATCGCTTGTCCATAAAAATTTAATCATCATACATGTTTATACAAAC
CATAATTATCTTATCAAAGTACATATGATAAATAAAAAATAGAGTTAGGC
AAGAAAATCTCATGGTAGACCAAAATATTTAGTTAAATAATAAAAACCGA
GAATTTTGTATATAACTATTGATCTCGATACATTTTCATAATAGTACATA
TAATAATTTGACCATCAAGCTAATGTATCATCACTAAATATAACATTACT
ACTTATCTTAGCAACTATTTTAATGTAAATTACTATATGCACATCAACAT
ATAAGTTCTGTTGACTCTAAACCAACAATAAGGACGAGCATAATATTTAT
CCTCGTAGTGAAGTCACATAAAGTAAAAAACTACATCCTAGCTCGCTAGC
TTGCCCTCACATATAGTGGATCATATAATCATTGATATGATTATTTTATT
ATGCAACGTTATTTATTATCCCATAAATTGAGATGACCAAAGATGTCTCT
CGCACAATTCATTTTTTATTTAGCGTAATATTTATGGTGACTATAGACCC
ATATTTATTCTAATTGTATATAATATAAATTTCCTAACCCACAACAAGTT
GTAGGCATATTCAGACATTGCCCTCGAAACTGTGAGGGCCACCATGCTAG
TTATTTTAAAAATCAATAAAGCACACACTCTTACCTGGATTTGAGCCTTG
AGTTGTGTGTTAAAACTATTGAACCAGTTTTTGAAAATGCGAAGAGGAGG
AAATAATTCAGTATGTCTTTCACAGGGAAAAGGATGGTGAATTATTTCCT
CTTCTCAAAAGCGATATTTCTTATTCTCATCCCAATTACGTTTTTCAATG
GTATCCTTCAGCTACAACATTCTCTTATACTCGTATAGTTAAAATTTGAC
ATACTTCTTACAAAACCGACAGAAAGCCGTACAAATGTGCGGAAGTAGCT
AGAAAGTTTGGAAATTTATGAAAGTTAGGAACTATCCATCAAATGGTATA
GTTTAAGTGAAAATTAGAGTGGTGAAATTTTGCATCATATTTTTTCAATT
AATTCACAAAAAACCTTTTTTGACACTTAAAAATAGAAAATAAATCTTTT
ATATAAAACATGAAAATAATTTTGGCAACATTGTTAGTCATGTCAAGACG
CACATTTGTACCTAATATGCATCATTTTATTATTTAAAACCTCCATTAAT
GACGCCCAAGGATGACACGCGGCACGAGGATATGACATGTACCCTGTGTT
CGCCGAGTGCAACACTCGCATATAGCCCTTGTATGTTAAGCACTTCTAGT
TGCCGAGTGTTTTTTTATGCGCTCGGCATACAAAGGCTATCTGTCGAGCG
TTTCACGCAGCATATACAAAACAACTTAGCAACGAGGCTATTTCTTGTAG
GATTTTATGTCATTATAAAACTCTGGACAAAACTCCTCTGGTCTAGGAGC
TTTTTTATGCGGCTGGATTATGCCCGTCTCGAACCTAATGCCCCAAGGAC
ATGTGCAAAGTGAATGACATTTTTATCTGGGACAACTACGGTCTATTGTG
AGTACTCTCTTCCTCTAGAGAGAAATAGTTTCTGGATGAATCACCAAATA
ATCCCTTAAATAGTAGCCAGTAATTTAAGTTCTTAAATTTCTCTCACCTA
TAGTGGACCCGTCGTCATGATCTAAATGGAAAAGTTTTCTTCTTACGGTG
CTTCGCGTTTGTTACAATGTGGAAGTATCTTATATTACTACCCCACTAAC
CATTCTTGACTTTAGCTCTATGAGACCGCTTAGTCTGTTCATCTCGCATA
ACCTCAATGTGTGCTCAATTTGTCAAAAAACAGACTTCTACAACTGGAAC
AAGGTCCAGGTTATGTACTGCGATGGTTCCTCTTTTACCGGTAATAAGGA
AGAAGTTGATCCTGTGAGTGAGCCATACTCCATCCTTTCTTCATTTTTCC
GCTGCAGCCGGTATTAGTTACATTCTGCGCAAAGCTCTGTTTAATTTTTA
CAACTTTGGACAGAAGACAAATCTACACTATAGAGGCGCGAGGGTATGGC
AAGCAATTATAGAAGATCTGCTCGCGAAAGGAATGAACAGAGCTGAAAAT
GTATGCCTTCTTATTATAAGCATAATGCTTTGACATGCTGAAACTGTAGC
AAGCTCTAATTTCCTTTTTGGAAGGACGTTTTAGGCTCTAATTTCAGGAT
GTTCCGCTGGTGGATTAACTTCGATACTACACTGTGACAAATTTCATCAA
CTCCTGCCAGTGGGGGCCAATGTTAAATGTCTTTCTGATGCTGGTTTCTT
CCTCAATGTGTAAGACAATACTAGTACCGGAGCCAGTTGGAAGAAAAGGA
AAAGCATGCTCTCTGATTTTGCCACTTTGGAGATATACTAGGCACTGCAG
TAGATATAACATAGCAAGTCAGATTTCTGCATAATTAGTTCCTTGTCTTA
CGCTTTCTGCCTTTCTCTTACAGGGAAGACATTGCTGGAGAGGACCATGC
TGCTACCTTTTTCAATGATGTAGTTACAACACATGTATGCACATTCAGTA
CCTCTTGCTAGCTAATTGTACTGAAATAACTTGTTGTCGAATTACTAATG
CTTAAAACAAACACTATCTAAATTTTGGGTTCGACTATAATTTTGACAAA
GCGAGGCATGCATGCCTTAAAAGGAAACTCATTATGAAAAAAAATGCATT
TTACCTATATTTATGTTGTTTATCTGATTTTATTACGCACAAATACCTTA
GGGCTCCGCGATGAATTTGCCATCTCCATGCACTTCCAAGTTTCCCGCGG
GCGTGGTAAGAACTTCAAGCCGAATTATTATGCACATCTACTGATCTGAT
TACACTCCTATAGACTAACAATTTTCTTGGATGCAGTGCTTCTTTCCTCA
GAATGTGGTGAAACATATTAAGACACCTTTGTTCATCCTAAATGCAGCAT
ATGATTCATGGCAGGTAATCGTCAGATAGAAAAACATTTATTACTACTTG
TGTCCGTCAAGACATTAATCTTGTTTCCATTTTCACGTGCTGCAGATAGC
GCACAATTTGGTGCCAGGAGATTCTGATCCTCATTGGCAAAGCTGCAAGA
ATGATATAAGTCAATGTTCCGCGAAGCAACTAATGACGTTGCAGGGTAGG
TGGCACCGCATTTTACTGACCGGACAGCCATGACATTGCTTAGTATGTTC
ATCGAGACTTATGGTGCCATCACAGGATTTAGAGACCACTTTTTGGAAGC
ACTAGAGGAGCAAGGGAACTCCTCCACCAGAGGGCAGTTTATAAACTCGT
GCTTTGTGCACTGCCAGACCGAGATGCAGAAGACATGGTTCGCACCCGGA
TCTCCGGTGCTTGGTGAAAAAGTAAACACGTTCTTGCACACCCTGAGTTT
CCTTTACATATAAGTTTGACAACCTAATGTTAATCTTACAAGGGTTCCCC
TCTCTCTATTGTAGAAAATAGCAGACGCAGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.