Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA042601

[Submit comment/correction]

Sequence	AA042601
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA042601
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTTGTGGTTTGGTTTGGCAACAAACATAGGTGATGCCCTAAGAATCAAAT CTTTTTAGCAAATTGGATGCTAGCTGGACTGTGCCGGGCAAACTATTCTT ATATATAGTCGATGGCGTAATCATAAATCGGCAAAATCCTTCATCAGATT CATCGCGGCCAGCTTCTCCTAATTGAAGGCTAATCTTCAGGTTAGTGCTC TTGCCATTCTCCTGCTTAAACTAGTTTCTTGTCTTAATCTTCGCCATGGC CGCTATCTCTCGTGTTTGTCACCAAATCTGTAGCATAACTAAATTTCTTG AGAGTGATGATTTCAGCTTCTTCTCGATAGAACTTGCCCAATACTTTCAT GGCGAAGCGGTGTTAGTTCTCCCTTTCGTGTCGACGGGTGGGACGGATAT CTGGGTGTACTTTGTTTGGTTTTTCATTGCTTCTTTAGCCAGTTTAGCCC CAAATAAAAATGCATCTCGAGCTTCGTCTTCTTCTCTGTTTCCTTCTGTC CTTGACCGTGGTGGAAACGGCGGAGCCGTTGGGGGATCTTCCGGCCTTCA GATCTGGTGATTGCCTCCTGCCTTGGAGTCTCGGATCTGCTCCAGTTCGA GACTTATGCATAAGATGCGAGGTCGCGCCCGGCCGCCCGCCGTCAACCCT GCGCAGGAGATGCCGGCGGCAGAGGATGCTCGGTTTTGAGATTTGAAAAT GCAAGAATATTTTGCATGTACAGTATATGCTAGTACAATATAGTTGTGAC ATCCCGATACTCTCTCTGATTCCTCGATCTACCTATTTAATTTCCAAACC TAAATTTAAAAAAATTGTGTACGTCAGAATAATTATCAAAATAACAATAT GTATGAATTTGTGTTTTTGTTTCGATGATATATTTTGAATAAACCCAAAA TTAGCAGAATTTCAAAAACACAAATTCCGACACGCAATGAAACGCCAAGA TTCATGGTGCAACTCAATGAAATAATATTAAAGTGTTTGTCATCTAATAC ATTTATCTTACTCTCTCGAAACAGGCTTTCGCCCAGCTTTATAAATAAAG CACATCGGTGAGACCGCTGCTAGGCCAGACAGCACAACGCCCAAATGATA CAAGGGAACGAACAACTGAAAATGCTGGGGCAACAGCTAACACATGCCCA AAAGAAAAAGAAATGGAAAAGACGGCGAATCAACGAGACAAGGGTGACAG GCCACCGCTGCGCCCTCCGAATATGTCCCACCCCGCACCTGGCACCCCAA ATCGCCCAATGTCAAAACAGCACCTTCAGGAAGGGAAGCGTCGTGGCGAC GGCGCTGCTGTCCGGCCCAGAGCACAGGACCTAGGGTTTCCCCCGACACT CAGAGTAGAGTGGAGTAGGCCTATCCGCGACGCCCTCCAAGGACGCAAGG CGGCACCGCGGCGGAGTCGGACGAACCGACAAGGATTTCCCCCTAACCCC ACCCACAACAGAACTCCGGACGCTTCGGAGCACCACCACCAATCTCGCCA CCCACTAGCATGCGCCACCACAATAGCGCCGTCACCATCGCCACCGTCTC ATCGAAGACACAAGCAAGCAGTCCATAGGACAGATGCAAGAGACCAAGCT CGAGTCGAGGACTGCAGCACTACAACCGGCGGGAGGAACCCACCTCCACC ACCAAGGGTGGTCATCGCCCAGACAAAGCAGCAGGGACACACCAGGCCTG CGCGGGCCCGGTCGGGCCCCGAGGGGCCCGTAAAGCCCCCGCCGCCTTGC TGCAATGGGCCAGCCATGGTGCCGCCATCCCCAACCAGAGCCGAGTCACC GCCGCCGTCACCAGGAAGACCACGCCGCGGCGAACGCGCCGGCCCGCCGT AGCCCAAATCGGGCCCGAGGGGCCCAGATCTGGGCCGGGTGAAGACCGAC GCCAGAGGGCGTGCGTGCACCGCGCCGCGTCGTCCCGCCGTGCAAGACGG CGCCACCGCCCGCCACCACCCGGAGCAGGGCCGGACCGCCAGATCCCGAG GAGCACCGCCGCCGCTGAGAAGCTCGCCCCGACGGGCTCCCATGGCGCGG GGAGAGGAGAGCCGCCGGCGCCGGCGCCGCCCGGGCTTAGCCCGACGGCT CCTGCCGGCGGCGGCGACAGGGCAGGAGGGGAGGGAGAGGTCTGGCCGGA GGCGGAGAGGAAAGGCGCGCCGTCGCCCTCGGGGGGGCGAGAGCGCGTGC GTTTCTACCAATGACGTGTAAAATCTAGTCGACCGGCATCTGCCATACAT TTATCTTACAAGTCTAGCACAAGTTTAAAGTATAGGAAAACACAAAATAG ACAACATTCGAAAACAATGAAACAAGCTATTTTAGAATAGCAGTTTACCA GGTGCCATAAAGTTTTCTAAAGATTCATCAGGTTTCAGAAATCGATTCTC AAATATTGTAGTGATATATTCAATATTAGTTTTGTTCTTAAACTCTCTTT CCTAGAAACTCAAATATTTAGACGATTTTAGATCGAACTGATAGTTCAAA ATCTACAGAAGTTTCAAATCATGGAACAAGACAGTAGACTGACACAACAC AACATCCCATAAAGTATGGAGGAGTGAGAGGATGGCCATATGTCGTGCAC GGTAAAATTGCCGCTGTCTTTTTCCAATCTTACTTTCTCATGTCGCTCAA TTCTCCGTGTCTCCTCTCTTCCTCACTTTCTCTGCCTGGCCTCGCTCTTG GAAGTGGACGCAGGGCGAGGTTGGATCCTCGTCTTTATTTTTCTGCATAG ACCATGACAAATACCAGGATACGAAATTACATAAATAAGCTCCTAAAAAT GCTTAACGCCTTAAAACATGTTCAGTAGCACATATATATTGTCTAAACAG GGGCAAAAGTTTTGCCCTAATTAAGAAGAATCGCCTATTTAATTAATGAA ATTGATAAAAGCATCTTTGATATATTTCTAAGATGAGTAAGATTCTCTGT TGCTAAGCTCAGTACTAAAGCTACATGTTGGTGTAACCTCATAAAACATG GTTTGGACTTTTGCCCCCTATCGATGCTTTGTTCCATACAGTATGTTATG CGGTTCATTCTGATGAGAACACACACTGCCGTTATGTCTGTTGTTTTATG TAGGTACATGAGAAACTGAACTTGAACTTTTTTTACGGGCTGCTCATTCA TCATAGAGATATCTTTGTACTGTGCGGATCACCGCAAAATTCCCAATTAG CTGAATCATTGATGCACTGGATAAGCTGTAGAAATTAACTTCCAGGGCTC ACCCACAACCGGTGGAGAAGGTATACATGATTACATGATTACTACTCGTA GTATAAATGATATTATTGTGCCTATGGCTTATCCATTTAATTCCCTTCTC CCTCTTTACAATGAGATGTTTTGCTCATTCTAAATTTACGCGGAATGGCA GGTCTGAAAGAGTATGTTATGGAGAAAATTCTGCTTAAACAAAATACCCA CGATCTGTACTGTCGCAATTGCCATGTATGCATTACTGGAAGGGTGATTC TGCAAAAGAAATGGGCAAAGCTTTTGCCCTCATTTCAAAAAAAGATTCTG CGAAAGAAAGAAGTAGCACAAACAGTACCAGACGAACCACACAAAAAAAC ACATTTTGCAGAACCTTCTTGTAGTGCAGATCCGGAAGAGTATGATCTTG AAAAAATTCTGAGTGAGCAAGAGACTCATGAGCTGTACTGCCCCAATTGC AAGTCATGCATCACCAGGATGGTGGTGATCCTGAGAAGGAACCACTGGTC CCGGAAAGTATCCGCGGCTCGAACTGCGACTCGAATTGCAGCAGGTATCA TTCTTGATTTCTCATTAGTATGGCATTCTCAGATCAGCTAACAAGAAGTG TGAAATGCATAAAACAAGAAAAACAAACTGTATTTTACATCTGAACTTCT AGACTTCCGGTAATGTTATTTTCAGAGAGGTATGACCAAAGTATAAGAGC GCAACCTAAGTCCATAACCCCTTCCAAGTTCCAAGTAACTGTCTACATAA ACCCCTATCGAGAACCATAATCTTAAACTGGTGGTTTAACCGCAGTTTCA ACGGTTTTTTCTAGCTCGCCAGCATGGCCGGTCCAATGCGCTTAAAAAAC CACCCAGGCCTTTGGTATCAGTTTCTTCCGGTTGAACCGTCGGTCCGGTC TGGTTTCTAAACTGGGCTTCCAAGTAACTCTCCCGTCGTTCTATCTGCAA TAGCTACAGAGACCCCTATCGAGAACCACAATCTTGTACCGAGAACTCTA AACAAGGACCTAACGTTTGCAATTTCGTTTGAGGAAATTGCACAAATCAC CGCTAACATGCAACTATAAGTATTGCCTAATAAGCATTTTGATAACATTA CATGATATTAAGTGAGACGACAGACTGTTATGGTAACTAGCTATATTATT ATAACATCACACGTTGTAGACAAAATTAAGTGAGAAGACGGACTGTTATG GTAACTAGCTATATTAGTCTCCGTCCCTGGAGTAGTAAAAGTACTGTAAA ATTAGCAAAATAAAATACAAACTACAAAAAATACTTTGTTTTTGAAAGGG GCGTACCCAGCCTCTGTATCAACCAAAGCATACGGCATTTATTTCTTTAT TAAGCAGTAGCACAAAAGAGTTTTAAAAGAACATGTCACATGAAGTTGCC AGGTGAATCAACTAGCGAAATAAAGAAAAAGGCAACATGTCAACAAACTA CAGTTCTAAAACACTAGTGTCTTTCTCCAGGCATCATCAGGTCTTACTCT GTACCCACATGGTTGAGCTCAGGTTCATCACACTTTTGAATTAAACCAGC ACAGAACGCCTCGTCCCAGGGCCCCACATCCAAATCTTCTCCCATAAACC ATAAATCACTGTTCACAGACGATCAGAAACCTGGCTTGTACCTTTTTTTC TGGAGGATATTCCAATCATCTAGAAGGCGACATAACGAGAAAATCACATT CATAGGATCCTTAGGTATAATCCTTTGAAAACAAGCTCTATTTCTTGTTT TCTATAGATACCACAATAGCCCTGCAACACCTATGATGACCACTATCCTC TGTCTACCAGTAAATTTAGGTAACCCGTTTTGACATAAAACAAATAAATT CTTAGGTTTACCACCAATTCCTAAAGCACTACATACCATACTCCAATTAT ACCTAGCTAAGGGACACTCAAAGAATAAGGGACACTCAAAGAATAAACGA TTAATACTTGTCACCACAAAACTCACAGTTTTTGTTACATTTTCCAACCT TTCTTGATTAAATTATCCTGAGCTAAGATACTCTTCTTAACCATCAGCCA AACAAAATCTTTGAATTTGAGAAGCAATTTCAACCACCAAAACATTTTGT CTGGAAACAGGACATTTCTAGCTACCAAATAAGTATACAAACACTTAAAA AACTACAGATTTAGCCAATAACCAGATTAATTTTTCAGATTTATCATTCA AACACAACTAATTGCACACATCTAACAGCTTATTCCACATTGCAAAAGTG TCACCATATACACGCATCTCCTAAATTTAATGAAATTAAAATTCTGTGCA AAAATTTTAATATCTTGTGTAAAATTTAGATTGTAAAGACTAGAAAAAAC AACACATAAAGGTTTTCTTCCTACCCAAACGTCTTCCCAAAATATAATTT TCTGACTATCACCAATTATTATTTCATAAAAATTATAGAAAATATTCCCA TCAAAACATACAGAACCGTGAACAAATAACATAACTTTTTTCTTGAGTAA TAGTACCCCTATGAAGATATTTCTTCGAAATCATATTTTGCTAGTCATAA TTCTCGTTTTCTACTTGCCATAAACACTTACAAAGCAAACTAATATTCTT AAGATTTAAATTAGTCACACACCTAAACCCATGATCTCTTGGTAGACATT AGACCATTTGATAAGGTGATACTCACTAACACCTTTTTCCCACAAAAAAC TAGTAGGAAAAAGTCCCATCTTTCCTGGACACCTTTAGAAACATAAAACA TTGACATCCTAAAACCAGGAAGATTGCTCATATAGGTCTCATTTAGTATT AGTCTACCACCAAAAAAAAGTAAAACCCTTGGCTAACAAGCGGCTTTTCT ACCTTTTCTTCTATCGGTTCCAAATCTACACTATTTCAACTCTTAAAATG TAATCGTATCCCAAGATATATAAAAGGTAACACTCAAACTTTGCGGGTGA AAATATGAGAATATTCATCATGACTTGCTCTTACCAAAATAGTAAATGTC ACTTTTCATAAAATTGATCTTAAGACCAGTAAGGTGCTCAAAAGTACCCT ATCACTTTCCATATTATCTTCAAACAAAAAATAATGTCGTCGGCATATGG TGATATAGCCAAACCATCTTCATATAACATAGGAACTAAACCTCTAAGAA AAACGTATTCTTGAGCCCTTTTAATCAGGGTAGCAAGAACATCAGATGTA ATTTTAAAAATAATGGGGGGAAAAGGATCCACTTCCCTCAAACCTTGCCT AGTTAGAAATAAAGGCCCCATATTGTCATTAACCATGCCACTAACTTTAC CACATGAGTTTGCTTCTTTAGTCCATCTAATGAAATTGATAGGAAATACT TCGATTTCCAAGCAGAAAACATAAATTCTCAATTAAGTTTTTGTAAGACT TTTTGAATTCAATCTTAAACAAGATCCCAGACTTATTTTTAACATGCATA TAATGAATGGTTTCATGTAAAATAACTACACTATCTTGCAAGAAGCGTCC CTCAATAAAATCATATTGCACTTTTGACGCTACCACATCAGCTACTAAGA TAGCCCTATTGTTTAGTACCTTAGTGAAAAACTTAAACAAGACATTCCAT AAGACAATTGGCCTATGCATATGAATCTTATCCCCCGTTTTCTTTTAGGG ATCATAATAATAGTATCATCATTCACCCTAGAAATATCATTTTTCCTTTT TCATAAAAATCATTTAAAAAAGCTCAAGCAGATCATCAACAATCAATTCC CAGAACTTCTGGTAGAATTCAGTTGGAAACCCATTAAGCCTAAATATTTA TTATGTTTCATATTTAAAACAACATTTTTTCCACTACATGTTCCTTCCAG TTGGACGTGGGGATTTAAGAGAAGTTGAATTAGATCAAGGTGCATAATTT TTTCAAGATACAACACTAGCTAGTTTGTGTTTGGCTCTTATTTAGCTTGA ATTTATCTCTACCTCATCAACCAGTGTGTAGGATATATGACTAGTTCACA CAGAACATAAACCAAAATATGTTCACATTGTCTAGGATATATATAGAAAA AAAGAGTTGCCACACACTCACGTGACCTCGTCAATCATATGGAAATTCTC CTCGCTGTCACATCCCTAGCGTTGTTGCTCTTGCACTCATGCGGTCGTGG TACTATACACCATCTTTCACCTCCACTTAGGGATGGCACCCACACAATAG GGGTACGGATGGAGCCACCCTATAGCCATACTCATCTATTCCAAGCTTAC CTGTCACCCATACCATATTCGTCAATGGGTACAAATGTTTCCCATATCCA TCACCTGAACAAGATAAATTGGTATCTGTGGGTAAAAATATCTGCATTTA CAACACATCAAATTGAGCAAAAAATAGTCGTAAACTATAACATATAACCT ATTTTATAGACAACTGAACATACTCATACCCTATTGAACATAACTATAAC ATCGTTGAAAGGTGGGAATTTGTTACAAGCCTCAACCGAGGTAGGGTATA GCTCAACAGAAGAACAACAAAGCTTCTAGCCTATATTACATCCGACAGCT CAACCACAAGCATAAACCTAATACCAGTTGTTGATCTATTATGAGATTTA TGAATTAATCCTTTCAACAAAATTTTCTTTTCAGGAGTTTCAAAAACTGC AACAGTTTCTAAATATCCATATATTGTCGGTATGAGTGGGGATGGTAAAG AAGAAGTTGTATTAGAAAAAGGTACACTCATATTTCCAAAAACAAATCCT TAGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGTTTGACATTA CTCCCACATATTCTTATTTTAGAGCATTATGGGTTTTCCTTAAATCAAAC AATTGTAAGTTTGACCAATTATGTAGGAACATATTTCACAATTTAAAATA TCAAATTAGTATCATAATTCCTCATGATTTTAATTCTATGATGTATTTAA TTGGTGTTTGAGATGTTTATGTTTTATGTTTGGTCAAACTTTAAATAGTT TGACTTAGGACAAACTCACAATGAATTATAAAAAGAAATAGAGTAAGGAT GGTTAATCAATTCCTTTACTTAAATTATCATACTATAGAAATTGAAGATC AAGATGAGGAACTCGAAGCCTTGGAGAGCATATTAATTGATACAAGAGCC GAACCAATCATGATGTCATATAGACTTTTGAAGAAACTCACAAAGAATTT CTCCCATGTGATTGGTAGTGGTGGTTTCGGAGAGGTTTATATGGTATGGA CTTTTCTTGACAACCTATACAATTTTATATTTTGGAATATTTGTATGTGG GTTATGGATGCCAATGAGATAAGAATGTTATAGGGAGTTGTTCGAAATAT GAAGGTAGCCGTGAAGAAGCTTTCCAGAATAGACGAATTTTCTGAGCATC AATTTCAAGAAGAGCTCAAATGTTTAATAAAGGTTAAACACAAGAATATA GTAAGGTTTCTAGGGTATTGCTCAGATACACAACACGAGTTAGTACTCTG CAATGGAGTGCATATTTTGGCAGAATTGCGACAGAGGTTACTATGTTTTG AGTATGTGCCCAATAAAAGCCTTCAAGATTACCTTAAAGGTACCATGCTG CAACACCGTAACTTCGTTTTCCAATAGCATTTAACTATTCCGATGTCTCT TATCTTTCCTTAAAGTGCTTTTGTCCTTTAATTTTGCAGATAAATCTCAT GGACATGAATGGAATACACGTTATCAATTAATTAATGGAATTTGCCAGGG TTTGCATTATCTTCACAAAGAAGAACGTATTACTCATCTGGATCTTAAAC CCGATAATATTCTGCTGGATGCAGACATGGTTCCCAAAATAACGGACTTT GGTTTGTCAAGACGTTTTGGTGGAGAACAATCTAGAATGGTTACAAAACA TATCTTTGGATCTCTGTAAGAAAGATCTTTCGAATGATTTGTTATTCCTT TCACACTTAATCCATAATTCTTCTAACCAACATGTTGTCTTGCAGGGGAT ATGTTGCACCTGAATATCAGTTCGGAGGAGAAATATCATTCAAGTCAGAT ATCTTCAGTTTGGGCATCATAACCATGAAATTAGTGAGAGGGTGTAATGA TCTTCCCGACATTCAAAACGTAAGGGAAATTCATTTGACCGATATCATCC TTCCATATTGATTAGTTCATATGTACAAATACATTCCTAAACACATTGAG ATAGAAGTACATCCAATTTCTCTGTGTCTAGTGGCCTAGCTAGCTAGCTA CTTTCTCAATTTTGGTCTATGTATATCTAATTAAGTTAAAACTTTTAATG TTTTACTAAATTTATAGAAATATATACTAAGATCTGTAATACTAAATATG TTTTATTAGGCCATACATAATATTATTTTTTGTGAATATACATAATATAT TTATTTGGTATTGAAGATGTTGGGTTCTGGCGGGCAGGGCTAAGACTCAA GAAATTTTATGTCCACCGCTCTTTTGGGTTGTAGTGCGAGAAGGGTCCTG CCAGCTTTGTTTTGAGTCAAATACTATGACTATCAACATCTACAATTTCA AAATTGCATCACTAAATATATAGGAAAATATATTTATATAGCTATTTATG GTATTGTAGATGTTGACATTTCCTTTAGAAGTTTGGTCAAACTTATAAAC AGAATGACATTATATTACGAAACACAAGAGCACTCCAAGGCCATAAAGAG ATGCATTGATACCACCGAACAAGGTCAGAAACAAAATGATGACGGCTAAT GTGACGGATGGTGCACCATTCCAGACACACAAAAAAACTTTGACATGGAC GAGTAATAATATTCCCCATTTTAGTTTCCTAACGGTTATTAAGAAATTCA TGTTTTATGTTTTCTTGGAGTATTTTGGGTAATTCATAGTATTTATTCAT TTATCAAAATCTTTATAGTAGCTTATTGCAGTGTTCTACTCTTTACGTAC ATATACCCTCACTATAGTAGTAAGGAAAGCATTAGGTTGATGTGGCATAC TATTTATCTGTTCTACTCATTTCTCATTGACCTAAATTAGATATAGTTTT TTTAGAAACATATTTTTGATATAGTCTATCCTTACCAGTTAGGAATCGAC ATTTTTTGTGAAAAGTATCATCCTTAGTTTCTTACTTTGTCTTTTAAATG TTGCAGTGGCATGAATTTCTTGACACCGGCTGCCCACAAGTGAAGAGATG CATTGAAATAGCGCAGATTTGTGTGGATGATGATCAAGAAAAAAGACCAA CAATAGATCAAATTATTGATGCGCTGAATGAGAAGGACACCATATGATAC AAATGGTCCTCTAGTATTTAGTGAAGTATGGTCAATCATGAGTGCTACTT CTTCAATCCGTTGGGTACAATTTCTCAATTGATTCCTTAGCTCTCGGCCA ATTTGGTAGAGGCTATTTTGGTGGAAAAGGGAGGAAAAAGCACCATTTGA TCATCCTCGTGAAGTTTTCACTGCCAGGTCATGCATCTCCAAGAATCCAA TCTACTAAGGTTCCTGAGCACAATGGTGTTTGGTGCACCATACTATGCTT GGATGTAACACTTCAGTTCTATCCTTTTACTCTTTTTAGATAATTAACCT TTCCATTTTATACATAAGTTCTTTATGTAACTTACTATATCGTCTTCTTT TATAAAAAAATCTGAATTTGTTTACAATTGACACATTCATCTATGACAAA AGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.