Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040548

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040548
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040548
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGTTTAACGCCACTTTGGAAAACGGCGGCCCACCCGTCGGTAGGGTTTTT
GCCTTCCCTCCCCACCTCCACCCCGCCTCCATTCCCCGCGCCACCGGATC
ACCGCCGACCAGAATCGAGCCCTTTCCATCTCACTCCTCTCTCCTCGCTC
GCTCAGGAGGGCGCCCGCCGCCACGCCTCTGGCTCTCTGCTTCTCTCCGT
CGGTCGGCAGTCCGGCCCGCAAAGCTTCCCGGACGCACGAACCCAGTCGC
GCCCTTCTTCTCCGCTGCGGCGACGGCCCCCCGCTGCTCGTCTCGGCTGC
TGCGCTGCCACCGTTGGCCTGCCCCACCAGACTGGTAGCCTCCCGTCCTC
CTCCGCGCGACCCTCTGCTGACGCCGCCCGATTGCTGCGGCTCTGCCTGA
CTGCTCACTCACTCCTCACTTCCTCTGTTCCCCAGTCTAACTGCAGAACT
GCTCCTGACTGCTCTGGAGCTCTTCGGCTCGGCTGCCCCCCCCCCCCCCC
CTCAGCTAGGTAATTTCTTCAAAAGTTCAACTGGGTTGATTTGTAACTGA
ACCGATTTGTTGATTTAACAATTGTCTGTCATCAATTTCATGCTTTAGGG
ATAGAAGATGGTTTTTATCCACTGATTTCAACACCAAACCAATCAACAAA
TGCAAACCCTAGAATATGGTTCTCTCTAGATGATGGCTAAAGGTCTCATG
GAAAAGAGCAATAATGCGGGGGCAAAGAAATCTCCCCTGCAAATCCAGAT
GCTGGAGGGATTTTACTCCGGTAACTATACATGCTAATACTCCAAGCTCT
GTTCCTGCTGAATCTGTGCTACATATTCATTTTATGTTCTGTTTTGGGCT
GTGGCTGAATATGCTTTCATCCAGAGGTACAATATCCGAAGCCAGAGGAC
ATGACAGAGTATGCGGCATCTGTTGGTTTGACTTACAGTCAGATCAGAAT
ATGGTTCAAGGAGCGGAGGAGGAAAGAGAGGAAACACATGGAAGCCACAG
GGGTTCATATGGGAACACACGTTAGTGCAGGATCAAATTGTAGCAGCAGC
AGCAGGTATTCCTCTTTTTGCGAATCTGGCACGAACTATATTGTTGGTTT
GCGTGCTGAGGAGGGCACTATTGTCGGTAGGAGTACGAACCTCGTAGGAA
AGAAACACACACTTCGACCACAAGTTCTATTTCCAAAGGATTATATTCTC
CGGAAAGTCTTCCGCAAGGATGGTCCATCTCTTGGTGGTGAATTCGATCC
CCTGCCCCAACGCGCACATGGCCATGTCAGAGGTACGTCTCCACTAGCAA
TTTAAGGTCACTGAGAAGTCATTTACCGTCATAGCCATAGATATCTATCC
ATGTGTCAACCAGCTGGTTAAATCACCCAAAATGCCTAGATTGACTTAAT
CAAGTACACAGTTCTACTAACAACTCTGGTAACTGTTTCATCTTTTGGGT
TGAACGGTGAACAGCTCTTATGTTCCATCTCGAAAGACCGCTAGTAACTG
TTTTTGTGGTAATCAACATGCTATGTAAGGCCTAGCCTTTTCCTTGAGCC
ATGCACTCATTCCCATCTCAAAACAATGCTGTAACTGTTATGAGTTTGCA
TGGTATACAAGTTCCAACTTTTTCTTTGGCTTCTTCACTCATTTGGGACA
AAGAAATTATATTGAGAAGCTTGCGCTTGATTTTGTTCTCCTATTCGTTT
GTGCTAAAGTTGTGGTTGCTTTTGTTTCTTGGCGTACATTTTGGGCGAAC
AAGGAAAGTAGAAAGGATCTGCAGGCACTTTCAAAGCTCTTCTAATGCTT
GCTTCTGGTCTATTGTCAATGTTTTCAACTAATGCTGCCAACATATGTTG
CATACATCATTTGCGATTTGCATTCTTTAGATGTGGTTAAGACCCTAATA
ATATCAAATGGTCAATGCTGCTTTTTGTAGTTGCAGATACCACAGAGCAT
CATTCTTACCAGGACCAAGGCGTTATGAAAAAGAGAAAGGTATTATTTAG
GATGCCCAATTGTGTTCATTCTCATTTCTGTAACACATGTTTCTTGTGCT
AAACATTGTTGAACAGTTGGTACCATACCTCTTGTGTCTTTGTATGTACC
TAGTAACGTACTGGTGCTGACAGTTAATATGACCAAGCATCATTTTTGGT
TTTCGAGTACCACAGCCACCTAGTTATAAAATAGTCATTTTGTGAAAGCT
TCATCACTATTTAGGCTAAGTAAGCATTTTCATTGTCATTTCTAGCACAG
GTTTTGTTTCCTATTTAAGCATTGTTTACTGGTTGGTGCAATACCATTTT
GTGCCATCACGTCTGTATTATGACGAGTTAGTGTCATGTCCTGTGCTCGT
AGTCAGTCTGATCCAGCATAATGTTTCTTTCATTACCGGGTCTTTTTATA
TAACTAGAACCATGGACTCGGAAAATCAAGTATTGCCTTTGCTTATGGAG
GACAATAATCTTTTGAGCCAGGCAGTACAATAAGAAGTCCCATGTATTTT
ATTGGCCAAGAGATGACACCCACATTTAAACTGGGATACACCCCCTGCCT
TACTGGGTATCGCTTTTGTCCAGCCATTTGCTGTAACTGTCTTTCTGAAG
GCACTCAACCCTTTTTATTTTGTGGATAGATGTAAGGTTAGAACTCCGCT
GTGTTTGTCTCTTGAGATTTTTGTGTGTTTTCCAGTTACTGATTGACAGA
TTGTTTTCGTGTCTGAGCTGTAGATGCTGTCAACTAAACTAACTATTTGC
GCTCTTTCCTTTTTTTAATCCATGTTAATTTCTTTTCACTTGCTATATTG
ATACTTCTAATGATGTGTGCCACCTTTCTTATTAATTGTTCATCTGCAGG
TCATGGTGTCTACTGCACAGAGATCCACTTTGCCATGTGAGAACAATGAT
CCTGTGAGGAAGCATGGAGCTGGCAAAGGTTTAATGACAGTGTGGCATGC
AATGTATTCCCAAAATGCAGAAATTCAAGATGGCTCCAGTTTCATTGATG
AAACTGGTTGCTTGAGATCATTGAGACCATTTGACGATTGTGGTGGAAAG
ATTGTCCAAGTAAAGTCACTTATTTGATTGACCTGACACAGCCTATGTTA
TTTGAGATTGTCTTAGTTGTGTGTTCTGAATTAGCAACTCAGAATTTCCT
CTTTTTAATATTATACACAGAAACAAATTTTGCCAAGGAAGAAAATAAGC
AAAAAGAGTAAACCTCCAACGAGTAAAAGAAAGGTAATCTTTCTTACCTG
GCAAAGTCAAAATATGGAGAAGTCTAGTCTTCTTAAATCTAGACTAGTAG
AGCTACTAAAATGGGTGCATTTGGTAGGAAAACGAAAATAGAAGTAAAAT
GAAATTTGACCCTTTTAATATGGTTAAGTGGAACCTAATGTGCCTACTGT
GTAGAACATTTATGGTGATTTCTCCCTATTTTAGGTCCCATGTGGCAGAG
TTACTGATCTTAAGGAGCATCCTCAAGTGGTGTGCCTTCTTTCAGTTGAT
GAATCAGAATCCTCAGAACTACAAATTGAACAGGCAACTTTAGTTGATGA
TGAGGAGCTTGAGCTCAGTGAGTTACAAGCAGGTCCTAACCCGTTAAGAT
GTTCAGCTCATCTTTCTTCAACTGGGAGACACGGCTGCCCCCTTTGTAAA
GGTTTGCGATACCATCCTGCACCTTTTTGCACTCATGTTTTGTAAAATAG
TCAATTTACTGAAGCTTTTCTTGCAGATTTACTTGCCAGGTTTCCTCCAC
CAAGTGTTCGGATGAAACAACCATTTCCCACGAAACCTTGGGAATCTTCA
CCTGAAATGGTGAAAAAGCTTTTCCAGGTTATAGGCAGTACTTTGCTTTC
TGACCATACAGGAGTACTATTATCATCATTGATGGAATTTACCTTACTTG
ACATTATGAAAATCAGTTCACGGTCTAATATCTGTCCAACTTCTAGTAAC
TTATTGAATTTTCTCCATCGTTAATGAAAGTATCTTCCTTACTGCTGGTC
CTAGGACATGATTAGCCTTATGAATCTTTCCATCTGGCTACCTGAATATC
CTGGGAGTGCAAATATTTTAGACATGCTTTCACACAAATCTTCTGTATCT
GTATTTGGCTATTTTTTTTTAATTTTTGAGCATTAATGATCTAAACGTGT
CGTTGAAAAGCTTAGTACCTTCTGTATGCCCATACATACCAAACTCGGTT
AACCGCCAGATTCTTTCTCCCTTCTCGTAATGAGTGTGTTACTGTCATGT
TCGTTATGTATCCACCTTTCCTCTACTAATTCTTACTTTGAAACTTGTCC
AACATCTGTTAATTAGGAAATGTTCTTGCAGGTTGTCCGGTTTGTCTACT
CACATTTTGGTAGTATGGATGTCCACCCCTTTACATTTGATGATTTTGTA
CAGGCATTCCATGACAAGGTGCAAATTTTCGGTAAAACATTCCTGGAATT
AGCATGAGTCATTGTATTATTTGCTTACTGTGCAAATGTTACCTCCAGGA
CTCGTTGTTATTGGGGAAAGTACATGTCAGTCTTCTCAAGCTACTCATGT
TAAACACAGAAAGGGGCAGCAGCAATGTGTTTGTTCCACGATCTTCTAAA
GACACCAGATTTTTAAGCTTTGTGAACTTTGTGAGTTTTGAAAATGCGGC
TGCATTCTTTGTTTATTTCAAGCATCCAGATACATTTGCTTAGTAATCTA
TATCTATTAGGTTGTGGTGTCATTTCAGCATTGTCATACAGTCCACTGAT
GAATTTTGAATGAGCCGAAAACATAGTAGTAGATTCATTTTATTATTTTT
CTTTGTTCTGATTGTTAATTATTAGTCGTATATTTATTTATGTTGGCAAA
CTGTTGGTGAGTTTGTTGCACATTGTTTACAATTCCTTGAAGGCCGACAA
GGACCAACATGGTCTAATAAATGACAGTGTAGGATGAATCAAATTCATTC
TCTAGTAGCACAAGTCTACTAACTTGTATTGTTCATCTTAATTCATTATA
TTGAGTAAAAGAGACCGTGCAATCAGTGGCATAATGATGACCATACCATT
CTGTAGGATCCAATAAACCATAAAACTTTGTAAAGAAATTTAGTGTGTTA
TTCTTCTCCCATCTGCATTCATTTAGACCGTGGTTTTGTCTCAATTGCAG
CACCAAACTTCTGTTTCAGTTGAGGTGTTCATGTCAGTCACACGAGTTGT
TATAATTCTCATAGAATGCAGTTGATGTTACTGTAGTTATGTTGCAATTT
TGTTGAAGCCGTTTCTCTTTCAGGTTAGAGAGCAAGAATTCGATGTGAAT
TTTTGGATAAAATCCCTGAATTCTCTTTCTTGGGTTGAAATACTACGCCA
AGTTCTGGTTGCTTCAGGTTTTGGTTCAGATCACCATATGCTGAATCGGA
ATTTCTTTAACAAGGTACTTAATGGGACACCTAATTATTCTTGATCCTTT
TGGCACTTACATGTGGGTGTGCATGCCTTTCAGGCTACAGCTACCAACAT
TTGTATATATGCTGTAGCAATAGATTTCCCCTACTAGTCTGCAGGTAGTT
CAAGTATGTTCCAAAGTAACATATATCCTTTTGCTCCCATCTTACAGGAG
AAAAATCAAATGATTAAATATGGGTTACATCCTCGTACACTGAAAGGTGA
ATTGTTTGCACTATTGTCTAAGAAAGGAACCGGTGGGTTAAAGGTATCTG
AACTTGCCAAATCACCACAGGTATTTTTCTTTACAACATCAGAAATAAAC
TGTTTATGTTGATGACAGCTGGTCTTCTGCATATATTTTTGGTCAAGTAT
CTCCCTAGCATTTACTTGATTGTTCTCTCTTCAGATTGTCGATCTTAACC
TCTCAGGCGCATCAGAAGTGGAGCAGCTGATATTCTCAACTCTCTCTAGC
GACATCACATTATTTGAGAAGATTGCACCTTCTGCATACCGTCTCCGTGT
TGATCCTCGGATTAAAGGAAAAGAAGATCCTAGTTCAGACACCGAGGATT
CTGGAACTGTTGACGATGATGGGGATGCTAGCAGCAGTGGAGATGAATCT
GTTGGTCCACAAGACTTGAGTTTTCCTGAGCATGAAAGTAGAATTGTCAG
GAGGAAGCAGAAAAATACGAATAAATGCAGTGAAATTGATGAAAGTTATT
CCGGAGAACGATGGCTTCTGGGGTTGATGGAAGGCGAATACTCAGACCTA
AGCATCGATGAGAAGTTGGATTGTTTGGTTGCTTTACTAGATGTTGTTTC
TGGTGCTGGTTCTATTCCAAGGCTTGAGGTAACTTTCACTCTCTTTCGAT
ATATTTCAATTGCATCTCTCATCTTTGTTGAAGACAACATTGTTTAAACC
TTACTGAACTTGCAAAGTGACTAAAACCTGGAATTTAAGGATCATTATTC
TATCCTGTTATCGTTCGTTTTTCTGTATGCATGAAGTTTGCTACCTGACC
ATAGTGCTCTAGCTTGGTAATGCAATTATGTGGATAGTTGGATGTTCTTA
GATGATCAGATGAATTAGGAGGGCAAGGTCTCATTTTTAGAAGATTTCTG
GCATTATTGCTGTAGTTCTTTTTTGTTTTAAGTTATCCAAACCCATGAGC
CATTAATGCAAATTTATCTCCGGTATTCAAATTTTCTTCTATTGACGTGC
TTTATTCACTTCTCCACAAACTAATACAAATACTTTACACTTCAAATTGA
GTATTCTAGCTATACTATGACTGTCTCCTCATGGCTACAGGCATGTTTAG
AAGAAATGGACATTTTAAGTAGAGAATACTTGCCTTAGGATACCGTATAA
CTGTCAATCCAAGTCTTCGAAGTGAACATACATACATATCATAGTCTTTT
TTCTCAGTTGTGTTGCATAACTTATTGTGTTCACGTGCCAAGTTCAAGTC
CATCCTTCATACAAATGTTCCATTCTCTTTGTATACCCTGTTGGAAAAAA
CTGCAGTACCTTATATTATTATTATTTTCTACCGTTTGTAGGAACCACAA
AGTTTCCTGTCTAACATACAGAGAGCACAGTCACATGCATCAGGTGGAAA
AATAAAGAAGTTGACAAGAACCATTTATCAATCTAGTGACGAGCACTTAA
ATAGATCAGGAAGCTCTCACAGTTTTGATTCTTCTATGCAAGGACAGTCA
GGAAGCCCGAAAAGTCAGGATTACATTGCTGACTCTGGAATTAGTGAATC
ATCTACAGGATTTGCCCATCAGCCACAAATTGTTCTATTAGGGTCAGACC
GCAGGTATAACAACTATTGGCTCTTCCTTGGCCCATGTATGGCAGAGGAT
CCAGGGCATCGTAGGGTCTACTTTGAGTCCTCAGAAGATGGCCATTGGGA
GGTGATTGATTCACCACAGGTTGTGCACCTGCTACTTTGCTTAGATATAT
AACTTTGTCTCTGCCTCTTATTTAATCGCTCCTGTTTAAACTTCCACAAA
TAAAGTAACTGTTCTATCCTTCTTTTTTGCAATGCAGGAATTGCTTTCGC
TGCTGTCTGTCCTTGACATCAGAGGCACCAGGGAAGCTCATCTTCTTGCA
TCAATGAAAAAGAGACAAGCGTGTCTTTTTGAAGGCATGAAAAAACACTT
GGAAGATGGGAATGCAGTTGCGTTAGCAGCATCATCTGATTCTTCTCATT
CCGAGACAAGCAGTGGAAACAGAGATTCACCCAAGCCAATTAGTGGAGAT
GGAGCTTCACCCCTATCAGACATTGACAGTGCTTCTGTCCCCACATATCT
AGCTGGTAGTCTTTTAAATGCATCATCTGCAATAGTAACTGAAGGTAGGA
GAAGTGATGAGAAGGTACTTAAGTGGGAAAGGTCGCAAGCGTTAGATAAA
TGGATCTGGACTTCTTTCTATTCTTCTCTTACTGCTGTTAAGTGTGGCAA
GAGGTCACTTAAGGAATCACTTGTTCATTGTGAAAGTTGCCATGATTTGT
ACTGGAGAGATGAAAAACATTGTAGAATATGCCACTCTACTTTTGAGGTT
GGTTTTGATCTTGAAGAAAGATATGCTATACATGTGGCAACTTGCAGAGA
GTCTGAGGACATGTGCGATGTGCCAAATCATAAAGTGCTTCCTTCGCAGC
TGCAGGCACTTAAAGCAGCCATTCATGCTATTGAGGTGAGTACTAAAAAA
TGCTTGTCCTATGAAGTTAATTGTCTAGGATCTACTTTGTTGAGAAACTA
CATGGTGACTCAAAGTTTGAGTTATGTATTGGTCCTATTGGATTGCTAAT
CACTTGTTTGTACTAGTTTTCACAAAAAGCATATGTATTTCTTAGCAGCT
TCTTAATCTTCTATTTCCTTATAATATGTCATGATGTAGGCACACATGCC
TGCGGCAGCTTTTGCTGGTTTGTGGATGAAGTCTTCACACAAACTGTGGG
TTAAGCGGCTGCGACGAACATCATCACTACCCGAGCTTTTACAGGTCAGT
TATTTTCTGTCAGTTTCCATCATGATATGAGAACTATCATTAAGTTTCAA
GTAACTTACTCCGTATTTACTACCTTTTGTTTTGCCCTGTTTCTGCCCTG
CAGGTTCTTGTTGATTTTGTTGGGGCAATTGATGAGAATTGGTTGTACCA
AAGTTCCTCAGCAGTAAGCTTTAGTTCATATCTGGATGACATTACTGTAT
ACTTCCAAACAATGCCACAAACAACGTCTGCTGTTGCACTCTGGGCTGTC
AAATTGGATGTCCTCATTGCACCTTACTTGGTACAAGCTGATTCTGACAG
AGCATTAACCAAAGGGTCCATGCAGACAAGTACGTTTTTGGTAGATTCTC
GATGTTATCTAATGTTTCATGTGCTTCTTAAAGCTGTGAATTTGTCTTAT
TTACTACAATCAATGCCTTTGTGTACCTTAAGTTTTAATATAATATAATT
GTTCCAATGAAGCACTTTCGCATTCCAGAATCCAGAATGATATTTGTTCC
TGCACCTTTGTCTTGGTGTACTTTATCGGTATCCAGTAGTTTTATCAATC
AATATTGACACTGCGATTTAATAATTTAGATTACCCCAATATGTTGAACC
GTATTGCAACTTGCAAGCTCCATGGTTCGTCTCGGATTTTGTCTGAGCTT
CGCCTCAGACAAAATTAGGATTTCTTTTGGGAGAGTAACACTTCAAGCAT
ATTTAGAATTTTGAATTCAGTGTCAACAAATAGGGAAATCTATTGGGGTT
TTCTTACAGGCACGTAGGACATTAAATTCTATTATTTTCCAAACAGTACC
GGTACTAGAAACAGTATTGTGCAAACCGATTCATGTAGGGTGTCAAGTGG
GATCCCGCCAAAATCCCGAACAAAAATTTGAACTAGATTTTGACAAATGA
ACTATAAGGTGGGATTTTGGCGGGATCCCCACTTGACACCTTAGTTTCCT
AACTATATCTTCCCTTGTTGTGCCTAGTTTTATTTTTCAGAATTTTGATG
CTAACATTTATTCAATGTTCTTTTGTTTCTCTATTAACATTTTGCTGATC
ATACTATACAGGAACGCGAACGCAGGCATGCGTGAGATAGCTAGGAACTA
GATGGATTGTTTTGTTTGGTACTCCTGCAAGCACCCAGTTGCCACTTCTT
TTTGTTTTGCATCAGTTTCAATCTCTTGATTGATGTCCGCGATTTTTCTC
AAGGCGAGACGAGCATGATGCCTTTTTTTTTGCTTGATCCTGAGGCCTTC
ACCTTTTGAGATTGTGATCTTGAACTTCGCGGAAGCCATGTCATCTGTGT
TGTGTAGATTGGATGGCTGGACAAACATCATTTGTTCTCGCTTCTGGTGG
AGAACTGTGACGCGTGTACAATAATAGTAGATGCAAAAAATTCTTTGTTA
ATAATCATTGCTTGGGCTTTGTAAACTTTTTTGTACTTGTAGTGGTCAGA
GAGGCACTTGATTCCTATTCATGAAATAGAAGGGGGGCTATAATAGATCT
TTTTGCCAGTTTGCTGGGTAGGTCTTCTGCTTCCAGGAGAGCATCGCCTT
GTGCTTCTTAAAGCTGTGATTGTCTTGTTTACTACAATCAATGGCCTTTG
TGTCCCTTGACTTTTAATATAATCATTCCCATGAAGCACTTGTACATTCC
AGAATCCAGAATGATATTTATGCCTGCACCTAAATCTTGGTGCAATAGTT
TTCTCAATCAATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.