Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040144

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040144
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040144
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCGGATTCATGCCCTCATCATCAAATCAGGAACTTCATTGGACCTATA
TGCAGGGAGTGCTCTGATCGATGTCTATTCAAAGTTTTTACTTGTGGAGA
ATGCCAAAGTTGTGTTCAGTCTGATGCACAACAGGGACTTGGTAATCTGG
AATGCTATGATTTTTGGCTTTCCACAGAATGAGCAAAGGGAAGAGGCTGT
GAAGCTAATTAACCAGCTTCATATATCTGGGTTAAAACCTAATGAGTTCA
CATATGTTGCACTAGTACTGTGGCAAGTACCCTGGCAAGCATGTTTCATG
GCCAGCAGTTCCATGCCCAGATCATCAGAGAAGGTGTTGACAGTGACGCC
CATGTTTCAAATGCTCTCCTAGACATGTATGCAAAGTGGGGCTTCATCAA
ATAAGGACGGCTATTGTTTGAGTTAACATTTGGGAAAGGATGTCATCTGT
TAGAATTCCGTGATTTCAACGTATGCACAGCATGGTAGGGAATGGAATAG
AACCGAACTATGTGACTATTGTTGGTTTGTTGTCAGCATGTGCTTATGCA
GTCCTAATGGATCAAGGTTTAAACCACGTTATAACTCTATGAAAACAAAA
TATGTTGTTGAACCAGACACCGAGCACTATGATTCTGTGGTCAACCTTTT
TGGTCGTTCAGGCGAACTGCATGCTGCCAAGGAGTTTGTCGAAAGGAGTC
CGACTGAACCAGCTGTGGCCATCTGGAGGATCTTGTTGTGTGCCTGTCAT
ATGTTTGATAATGTTGAAATCGGGAGGCATGCCACTGAAATGGCACTCTT
GGTATATCCTACAGACAGTTGCCCTTTTGTTCTGATGTCAAATATGTATG
CCTCTAAAGGGGCGTGGGCTGATTCACAGAAGTTGAGACAAGGAATGGAT
TGTGCCGGCGTAGTGATCGAAGGAACCGGGGTATAGCTTGGTTGAGGTGA
TGGAGGTTCATGTGTTCATGCACGAGGACGGGAGCACTCGGAGGCAGACA
TATATACTCAGTACTGGATGACCTGACAAGTCTACTTCAAATTTCTGGGT
ATCTCCCTGATATCTCTCAACTTACTTTGCTTGATGAGAATGGTTGATTG
TACATGCTCTGTGTGTTAAAATTTAGCATCAGCCGAACCTATTTAAGTCA
GTTCTGGTACACCACTAGCTAATCCCAGAAGGATGACACTTTGCTGTGGT
AGTCCTTGGCTGTTTTCATTGATCAAATGCGTGAAAAAAAATCCAAGGAT
GCATATTTTAATGTCTGATCCGCATTTTACAAATTCTCACTCGGTAGCTA
ATATTAACACTTGAATTCTTTTATAGATTGAATCTTCTTTTCCAGAAGTC
TTCTTTTACTGTATAATATTAAAAACTTTAGCCCTGCTTTTGTATGCAAT
GAGAGAATTAGGCACAGTTGCCATCCCATAACAAAGGGGGAAACAGTAAG
TAACACATTCAGATTAATTTGCTCCTAAAAAAGTGCCTAAGTAAAATTTC
TTACTACTCAGGTTCAGCTGTCCAACATATTACGGTCACTACAGAAGTGT
AATTGATATCTTTACTCCATAATTGAAGGAGCCTTCTGCGTCAGTGTTCT
TTTTCAAGGACAGAATATTCAAAATGCCAATAAGACATCTTATTAAGCTA
GAATTTATCTTGGTGAAAAGTTAGATAACATAAACTTTACACTGGAATGT
GAAGATGTGCAAAATTCCAAAGTCATAATACCAGAGGAAATGGATTTTTT
CTAATAAAAACACATTGTGCAAGAAAAGTGGTTAGGTTGGGCACATTAGT
GTAAACGGTTAACTGTGGAGACAATCTGTTTTCAAATGGACGGCAGTTCT
TATATAGGGGCAGTTCTTATATAGGGGCAGTTCAAATGGACGGCAGTTCT
TATTTACCGCAACAAGCGAAGAACAACATACTTTGCTCAAATCATGGACA
AAATGTAGCAGTATTGGACAGGATTGAAGAAACACATATACATGCAAGCT
TGCCGTGTGCATGTCTCATACACAAATACATCATGTTGAATACTTGTAGA
TACAGCTTCCTGAATGGACAACAGGATGAAAACATCAGATTATTTTCTAA
GGTAGTGGTTTTCTGTGATTTCTAAGGAGCCCAGCCATGTTCAGATGACA
TTCCTTTCAGTTAGAGGTTATATGTATCTGTTAGTCCTTGAAGTTATGAC
AAATTTCTGAGCCAAATCAACAATACAAAGTCGACAGGATGGTACAATTT
GAGTTTCCACGATAAACAGCCAAGCCATAGAAAAAGTCAGAAACTATTGC
TCAAACTGACAAGATCAAAGCTACCTATAGCTGCAACATTTATAGAAGAT
ATACATGATACTTTAATGTTCATTGTACTGACTAATGTGATCCTTTGGTT
TGTTGTTAGGTCGAGAGGGCAAGAAACTACTGACGGATGGAAATCCCCGT
GTCTACCAAGTACAGAGCCCACTGTTTACAAGTTGATGCTCCAGCTCAAA
CCATGTTAAGAAGATCAGACTTGTAGTTTCGACCCAACCGAAACTTGAGC
TTCAAATAAGGCCATGCGCCTAGCAGCTTGGTAACAATAGGCAACGATCC
TACCAAAGCGCAGATTGCAATGGCCAGCCACTGAAGATGTGCAGCCAACA
CAGTGTAAAGACCAGTCGAGAAAGCTGTAGTTGTTGCAATGTATGCAAAC
CACATGAGCTTCCTTGTAAAGGATCTGTAGTAGATCAAGAACTCGTAATC
TTTCCACCTTGCTAAGATGCATATGAAGGCGACGATAAATGAGGAGCACA
TTGCTAAGGTATCAGAGATTAAAAATGCCTGAAATGCAGCCCTTCGAGAC
ATGATGGGAAGACCCTCGCTTCCACTAGCGCTGCTGTATCCTCCAGGAAG
GGTGAAAGGAGCGGCAAAGGTGATTGTGGTAATGAGTATAGCCACTAATG
AAGTGTTGCTTGTGTATGTCTGAGTTAGTGACTTCGCATCCATCCTTGAT
GCATCAGTCATTATTCGCGTGGTATGCGCATGAAGATTATAGACAGAGGT
GGCACCTCGCGGATCAGCTCTCAGCATAAGCATGATCACCTCATTCTGCA
TCAATTCAAAGGAAGGTACGATCAAATGGAGCTCATAGTGCAATAATAAT
GCCTAGTTATATAATTCTTGGACAATAGTTTTCCTAGTTTTTGTCAATCC
CCCACTACCTTTTGAGCACATTCATGCTGCACATGCTTCCCCTAGCCATG
ATTGAATTATTTAATGCTAGCTTGGCTCCTAATTTATCCTCGAAAAAAGC
AGTGCCTTGCTTGGCGACTCTGATATTGTTTAAAGGTGTATTTGCCTTTC
TGTCCAAATAACACATACCAAAAAATTGACAACATACACGTAACTCAGCT
TAGTCACATGACTTTGGCACTGCAAACAGCCCGATTAGCCAACCAAACTC
ACAAAAATGTGCATATGATGTTAACACAAAATTCCAAGGTTCGACACCTA
GATTGACATAGTTGGGCATACTGAACTTCTAATATATAGAAACATGCAAA
TTTAATATTAATGTGTAAACAAAAAACCACACATGTAACTAAACGAATGA
TCTAAATTGAATAATGATAGACTAGAATCAATAAGAATTGGGGTTTAAAC
GCCTTCTCATTTAACTTAATAGTCCTTCATAGTTGTTAATGTGTAAGCCT
AATAGCAACTGACATTTGTGTTGCATTGACTAAAAACCCTTTTGTATGCA
GCTGCACCATGTATGATTCTATATTGCTTGCATATAATAGGGAGAATGGG
GTACAGCACAGTAAAATACTCCCTCTGTTTAGAAATACTCCCTCTGTTTT
TAGAAACCCTTTTGTATGGTGCAGCTGTTAAAATACTCCCTCTGTTTCAG
ATGGGCACAAATATACTTACCCAGTTTAAGGTCTTGGCGCGATCCATGAT
GTCCGACAATACCCAAGCTGGTGAGGTACCACGGTTGTTCATCACTGTCG
TGTCTATATCTTTATGAGACAGTAAAGCAGCAACAATTTTAGGATAGCAC
TTCTCGACAGCAAGATGCAGAGCGGTTCTTCCCTGGCTGTCTTGCATGTT
GATGAGCTTACGAAGTTCTGGCATGCTCAGGACAAATTTAACAAACTCTT
CATAATTGTTCCATACAGCTGTATGAAGGCATGTCCATCTGTCAGCGCGC
GTTCCTCGACAAGGAGCGTCTGGGCAATGCTTAAGTAGCTCTCGAGCAGT
ATCAACATGACCTCCGTATGCAGCAACCTGAAGGAGAGTATAACCGTCAC
TCGTCATCTCATATCCTAAAGAAGAATCATGCTCCAGCAACACCCTTAGC
ATGTCAATCGTGTCACGGTATACAGCCGTACACATCGGAGTAAACACAGC
CTTGTGAGCAACTCTAGCCAGCCCAGGACGTGTTTCCATGATTCTTTTAG
CAACAACTGAGAATCAAAGCATGAATGATCATTGTTAACAGCCAAGGGAT
GATGATAGTATCCTAAATCAAGGCCAATTTTCTGTGAATAAATAGTACAG
CAGCAGTATTGGTTGCATGCTGTAGATTAGCAGAGATATCTCACCTGAAT
TTCCATTCCTCACGGCTGCATGCATGGTGCAGTGCATTGCATCCATCCTT
GTCTTTCTTCAGGATTGCCTCACTCAACCGTCGAGCTCGGTAGCATCCGA
GTAGGGCGGAAGCCACGGCAATACGACCGCTTCTCACGGCGGTGACAAGC
GGCGTCTCCCCATCCAGGTTTTGCAGGGAGAGGAGGGAGTCGTCTAGTGC
CACCACATCCGTGGAGAATCCCTTGTGACCTTGGAGGGATGATATGTGGA
GGCAGGTGTTCCAGTGCGGAGTCTTGCCGAGAAGAATGCCTGGATTATGA
CAGGCATAGTGCTTCATCGACGTGGAATCACCAGAGGTGGCTGCTTTCAG
GAGGTCTTGGTCCATCTGTGCCTCCGCCTAGCTTGCTTCTCCTTCTACTG
AATGCAGAAATGGAGAAAAAGAAGAACACCGATCGACCTACGATGCAACA
GAGTTCTGAAAAATTGAATAAGTGGTCTAGGGACAGCAATAATATGAACA
AATAGTTCGACGAGGAGAAGCAGAGTACGTGCCTGGCGAGAGCAGCAGAG
CACTCGCACTAATACTGAATGATTGGGGGAATGGCGTCCATGACAAGTAA
ACTGGAGCTTCAGTTATCAGTCTTGGTGGAACCTTTAAAGCTCCTGCCTG
ACTACGTGGTCACCTAAATTGATAAATTAAAGTTTGTAACACCCTCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.