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GrainGenes Sequence Report: AA021251

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Sequence
AA021251
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021251
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATCTCCAACACACACACGCACTACTAAAATTCCCAGACACTGCATCGCAC
CTCCCCCGTTGGTTCCCCCTCTCCCTCCTCAGATCCGATCTCTCCAACAC
GCGGGCACACACCACCCGCCCGCTACTGCGCCGTCTTGCTCGAGGGAGCT
CTCGCCGCCGCCGTCTTCCGCCATGGCGGCGGCTAACGCCCCCATCGCCA
TGCGCGAGGCGCTCACGGTAACAACACATCCACCATACTCGTGTCTCCCT
CTCTGTCGGAAGTCACGTCAGATCTCCGAGGGGAGGCTAGCTTGGGCATG
CGACTGACTGGCTGATACGCCTGCCATGGCGTTGGCGCTGTTGCTTGTTG
CAGCTGACGAGCCTGGGGATCGCGCCGCAGTTCGTCACCTTCACCCACGT
CACCATGGAGTCGGACAGGTACATCTGCGTCCGGGAAACCTCGCCGCAGA
ACAGCGTCGTCATCATCGACATGGCCATGCCTAGCCAGCCCCTCCGCAGG
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GTCGTGGGATCTGGGATAGTTGGGCGACGATCTCAACTTCCAGCTACTTA
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TTGTCATATGTTACCAGTCCTGGCAACACTATGTTTTAGTAACACATTTG
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ACGCAAAAGTAGGTTGTTCATCTAGTATATGAAATTTAATGATGAATAGG
TGCGTTTTAGAATTTCGAAATGACATCTGATGAAAGATCACAGACTCAAA
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TTTTGTTTATAATGTCCATGACCATGACTTTGAATTCCTTTAGTTGAGCA
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TTGTGAGTGCTGTTATCCTGTTGTCGTTTAGTTAATGCCTTATTGCTAAA
CTGGCTCAGCAGCTATTTGTCAAAGAAATTCCCCCTTATTACCTTTGCAG
CTTGTTTTATGTAGTTGTGGCAGGGTGGAGCTTTAATATCTAAATAAATT
TGTGAGTGTTGTTATCCTGATGTTGTTTTATGTATTTGTCAAAGTAATTT
ATTCTGGAGCGTACCGTTCTATACCCATTTGATGTGATATTATAGTTACT
GTGCTTTTCTGTGTAATAGTATTCTTTCCTTCAAATGAATTCTGATATTA
TAGTGCAAATAAGGTGATAGTGGCAAGGATATGTTTTCTCATGACCAGCA
TTGTCCTAACTTCAATCATTTAAGCTGAAATGACTGATTATACACTGACA
GGATAGTGTGTCTGTTATATAGTTGATTGGGAGAAACAAATCCTATAACA
ATTGTATATTTGAAATTCAACATTTACCATCTGTCCACGTCTATTGTCCT
AACTTCAATCATTTAAGCTGAAATGACTGATTATACACTGACAGGATAGT
GTGTCTGTTATATAGTTGATTGGGAGAAACAAATCCTATAACAATTGTAT
ATTTGAAATTCAACATTTACCATCTGTCCACATCTATCTGTATATTAAGG
AGTTTCCAAATAGCAGTAACAAATTTTCACTAAAATTTGCAGCCCAAATA
CCTGGAACGACACAGGATCACCTGCAAATCTTCAATATTGAGGCTAAAAC
TAAAGTAAAGTCGCACCAGATGCCAGAGCAGGTAAAAGTTTCAAGTCTTT
CCTAGTATACCTGGTCATTTTGTTTAAATTATTATCTTGGTGTATTATCT
TACATATCTTCTCTACTACAAACACAGGTTGTGTTCTGGAAATGGATCAC
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TTGAAGGTTAGTTCCCGGACAATGCACAGTTTTCTGCTTGAATACTATTT
CCAGCTGTGCATGATTTGGCTTGTATATATATGGAACTAAAATACTTGTT
GCTTGCTATTGCTGGAATATAGGAGATTCTGAACCTGCCAAGATGTTCGA
TAGGACAGCTAATTTGGCAAACAATCAGATTATCAACTACCGGTGTGATC
CAGCGGAGAAGTGGCTCGTGCTTATTGGAATCGCACCTGGTGCTCCAGAG
GTATGCAGAGAGCATTCTTAACAAACATCATTATAACGTGATGCACTTTT
TTTATAATTAAACATGGTACGGAGATCAAATTTCTTTTGTGACCCTTCTT
GCTATGGTTTCTGTTCCCCGGATTGTTTTGGCCACTCTTTACTGTACACG
ACTATAGATTATAATTTTGCAAAATTTAAGCAATCTTCTCTACCAAGTAC
TAAGTAGATGGTACCTTCTTATATGTGCCTCTTGTATTGATGGGCTTTCC
TTTTCATCTATCAGAGGCCGCAGTTGGTGAAGGGAAATATGCAACTTTTC
TCTGTAGATCAGCAGCGTAGCCAGGCACTTGAAGCCCACGCAGCATCTTT
TGCAACATTTAAGGTACCGTTCATTTATTTTGTACTGGTTATAATTATCG
TTTCTCTTCTAGTATTTACCCTCTGTGCCTGACTTCCCTTGTTTAGGTCC
CTGGCAATGAGAATCCATCAACGCTCATCTGTTTTGCCTCGAAGGCAACT
AATGCTGGACAGATTACTTCTAAGTTACATGTTATTGAACTGGGTGCCCA
GCCAGGTTTGCATTTAGACTGCCTTGTCATATTTTTCTTTCTATTTATTT
CTGCATTCAAAATTTTAGTAGATCACAGTTGAGACAAACAACCGTCTTGT
AAATGTGGAAGTACCTGTTTTATCCATCATACATCCATACCCTTGTGACT
CAGTATGACTATCAGAAATTTATTTTGTACAGTTTAGCCTATATCCTCCA
GCCTTTCTCCAAGTACATCCGCAGCCACTAAACTTGATTTCTTACTTAAA
TCATTCCCATGTTCTTATTTAATCCTTTATTGCAGGGAAACCTGGCTTTT
CCAAGAAGCAAGCCGATCTCTTCTTTCCTCCAGATTTCCAGGACGATTTT
CCTGTAGCCATGCAGGTGCATTTTATGCCCAAACGAAGAATACCATGTTA
GGTACCATAATATATCTAATTCGTTTTCTTCTTCTTTTGATTACAGATCT
CTCAAAAGTATGGCCTTGTCTACGTAATTACAAAGCTCGGCCTTTTGTTT
GTCTATGACCTGGAAACTGCTGCAGCAGTTTATAGAAATAGAATCAGTCC
AGATCCTATATTCTTGACAGCAGAGTCTTCTTCAACTGGTGGATTTTATG
CCATCAACAGAAGAGGGCAGGTTTTACATGCCACAGTTAATGATGCAACT
GTTGTGCCTTTTGTCAGCGGTCAAGTATGATCTCTTGCACTCCATAAATT
TCTTTACTGATGCATACACTAGATATTCCTTTCAAATTTCTAATACATTT
CTGTGCCTGCAGTTAAATAACCTTGAGCTAGCTGTGAATCTTGCCAAAAG
AGCTAATCTTCCTGGGGCAGAGAACTTGGTAAGCTCCATAACTAGACCTG
TGATAACTAGCTCCATAACTAGTATGTTTTTTGTGAATAGTGTTTCTAGA
TTTGCAGAATTGTTATTAGTTTTGCATAGTTTTTTTATGAGTTAGTATTT
CATTGCTAGACCTGTGATCTATTTGCTAATTTCATTGTGTTCCATAAGAA
GGGCATATCAACATGTTTATGCAGTTGTTCTCATTTTTCACTTGTGTTCC
TGTTGAACGCACACTTCTGAATTTGAGCCTATCATTCTTCACATGTATCT
TTGCTCCTGTGCCTAATGCTTGTGCTGTGGGTATTTCAGTGTCTCACAAA
CACCATGCACCATTACCCTTGCAGTCCTGCAATTTTTGGCACTTTATGTT
AGCTGCAAAATTCAAGGATTAATGTATATTTTACAATTGTTGATCTCATT
TGACATGTGGAGAGACTAACAGATATTTTAAATATTCTGAATTGCAGGTT
GTGCAAAGATTTCAGGAACTGTTTTCACAAACAAAATACAAGGAAGCAGC
AGAGCTGGCTGCAGAATCCCCTCAGGGTCTTCTGCGAACTCCTGATACTG
TTGCCAAATTTCAGGTGCCTTGTTTTGTTGCCTATGAAGATTTTGATATT
TATTTAGCTCATTTTCATTGCTCAGTTCCTACGTACTCCCTCCGTTTCAA
AATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGAAAATGTATCTAGACTTGTTTTA
GTGTGTAGATTCACACCAAACTTGAGTGAACCTACATACTAAAACAAGTC
TAGATACATTTGCTTTACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACAGAG
GGAGTATATACTTCCTTAGTAAGCTCCTTAATAAGCCAGCTGTCCTTCAT
AGCCCAAACTGTGTGAACTACAAAGGTGTGCTTGATATCTGATATTAGAG
ATAATTTTCTCTCACGGAATTTGCAGCAAAGCAACTAATGTGCTAATATG
TTGAAACCACCATAGCTCTTTTACAATTAAGCCGATTAGTTTTTTTACCA
TGAAGAGAGACTCAAGACTTTTTGTATATACTTGTTGGTCCTTAATGGAA
AGCACGATTAGGGAAGAGCAATATGATTACGGAGTCCTGCCTTTATTATT
CATGCTTAAAGTGTGTACTTCTAGTTCCTTACTTGAAAATATTACTAGAT
AAGAGATTCACTGACAAACAGAATAACAAATTCACATTATTACAAGTATA
CAACTTGTCGGCTTAACTGCAGGTTCTTTTGCTTGGCTGACGTGCTGTTT
GTGTGATTCAAATGCAGAGTGTTCCTGTTCAAGCTGGGCAAACACCTCCA
CTGTTGCAGTACTTTGGCACACTGCTAACTCGAGGGAAGCTAAATGCTTA
TGAGTCTCTTGAGTTATCTCGACTTGTTGTCAATCAGAACAAAAAGAATC
TCTTAGAGAATTGGCTGGCAGAAGACAAGCTAGAGTGCAGTGAAGAGCTA
GGAGATCTTGTTAAGGTAATATGGGTGTTGTGTGATGTTTGTCGATTGCA
CAGCATTCATCGTGCTTCCATGAATTTCATTCACTACTATGTGTGGATTG
TTCACTAACCGGTGCTTTGTTGTAGACCGTAGACAATGACCTTGCATTGA
AAATATACATAAAGGCTAGGGCAACTCCTAAAGTAGTTGCCGCTTTTGCT
GAAAGAAGGGAGTTTGACAAGATCCTTATCTATTCAAAACAGGTATATTG
CTTGGTACTTCTGAATTTTTCTGTTCAATAGAAAGTCCTGAGTTCAGCTT
GGAGCCTTGGCCATTGACCATCTTGCCTAAAACTTTTGCTGTTCCAGGTT
GGATACACTCCTGATTACCTCTTCCTCCTCCAGACCATCCTACGTACGGA
TCCACAGGTAATAGGTTTAAGGCTTTAAGCCAAACAGTGCTGTGATGAAC
GTTTAGCAGTTGGTTGTCAGCTTCTTTGATCTCATACATCCTTGCTAAAC
TGCATATTCTATATTCTTGGCCAGGGTGCTGTCAACTTTGCTCTCATGAT
GTCACAAATGGAAGGGGGTTGTCCATTAGATTATAATACTATAACTGATT
TGTTCCTTCAGGTATCCTTTCTATTCATATGAATGCTTTGCTGTTTTTAG
CCATATTTACTTCAAATTTCGGCTGTATGACTTGCTTCATGCGTCTTTTG
TTAATAGAGAAATATGATACGGGAGGCAACGGCTTTTCTGCTGGATGTTC
TGAAACCAAACTTAGAAGAGCATGCATTTCTTCAAACCAAGGTTAACATA
TAATTTATGTAAAACGAATGACTGCCCTAGACCTTTACCTCCTTTGGTTT
CTCAGTAGCTTCTTTTTGAATTCATTTTAGGTTTTGGAAATCAACTTGGT
GACTTACCCTAATGTTGCTGATGCCATCCTTGCTAATGGTATGTTCAGTC
ATTACGACCGCCCTCGTGTCGCTCAGCTCTGTGAAAAGGCTGGGTTGTAC
TTGCGAGCCCTCCAGGTCTGTATCTTTGCATGGTTTTGGTGTATATATTC
TCTCCATCTCACAGTTTATTAAGTCTTTATTGTGATACAGCACTATGCAG
AGTTGCCTGATATCAAACGCGTCATTGTCAATACCCACGCCATTGAGCCA
CAGGTTTGTTCTTTTCAGTTACGTTTGACTATCAATCTACTATTATCTGG
TCCGTTAACAACATCCTTTCGCAGGCACTCGTTGAGTTCTTTGGCACCCT
TTCAAAAGAATGGGCACTAGAGTGCATGAAGGACCTTCTACTGGTCAATC
TGAGAGGAAACCTTCAAATAGTTGTGCAGGTAATCCTTTTCAGCTTCCTT
TTAACTTTTGTTATTGCAGTTTCTTTCTTATATTGATTCTAATTGTGTCC
AATCCTTTGAACACCTCTGAAGGCTGCTAAAGAATACTCTGAGCAGCTAG
GAGTTGATGCTTGCATTAAACTATTTGAGCAATTTAAATCTTATGAGGGC
CTGTACTTTTTCTTGGGATCATATTTGAGCTCCAGGTACTTAAACCATAT
GTTAATATCTCTCAAGCATATTGTATGCCCAACATGTTAACATTATATTT
CTTTGCACAGTGAGGATCCAGATATTCACTTCAAGTACATAGAATCAGCT
GCAAGGACTGGACAGATCAAAGAAGTTGAGCGTGTAACCAGAGAGTCTAA
TTTCTATGATGCTGAGAAGACGAAGAACTATCTGATGGAAGCAAAACTAC
CTGATGCCCGCCCACTGATTAATGTTTGTGACCGCTTTGGTTTTGTTCCA
GATCTGACTCATTATCTGTACACAAATAACATGCTCAGGTATATTGAAGG
CTATGTACAGAAGGTATGTAAATCTTTGAACTTAGTGTTATTTGAGTACT
GCTCTTCTGATATGTTGAGTATATGAATGGTTCCTTTTGTCTGGTTTGTA
GGTGAACCCTGGAAATGCTCCGTTGGTAGTGGGGCAGCTACTTGATGATG
AGTGCCCTGAAGATTTCATTAAGGGTTTGATTTTATCTGTCCGCTCTCTT
CTTCCTGTTGAGCCCCTAGTTGACGAATGCGAGAAGAGGTGTGATTTTAT
TTAAAGTAGTTATTATCGTGTACATGTGCAGATTGGCACCTTTTTTAATC
ATATTTTTTCATCTTGTAATCAGGAACCGTCTACGTCTGCTTACACAATT
CTTGGAGCACTTAGTGAGTGAGGGTAGCCAAGACGTGCATGTCCATAATG
CTCTTGGGAAAATTATCATTGATAGCAACAACAACCCAGAGCATTTCCTT
ACTACCAACCCATTCTATGACTCACGTGTGGTGGGTAAATACTGTGAAAA
GCGGGATCCTACACTTGCTGTTGTTGCTTACAGGCGTGGACAATGTGATG
ATGAACTTATTAATGTGACCAACAAAAACTCACTGTTCAAGCTGCAAGCT
AGGTATGTTTATTGTTCATTGTCTTTCTGATGCCATATAATTTGGCTTGA
ATCATAATAACCATTGGGTCATTGCTTACATGTTCAGTCCTTTGTTTTGA
ATTGTTAGGTATGTGGTTGAAAGAATGGATAGTGATTTGTGGGATAAGGT
TCTACTCCCTGAAAATGAATACAGAAGGCAGTTCATAGACCAAGTTGTTT
CTACTGCCTTACCTGAAAGCAAGAGCCCCGAGCAAGTTTCTGCTGCTGTT
AAGGCTTTCATGGAAGCTGACCTCCCACATGAACTGATTGAACTTCTTGA
GAAGATTGTCCTTCAGAATTCGGCGTTCAGCGGAAACTTCAATCTTCAGA
ACCTGCTCATCTTGACAGCCATCAAGGCAGACCCGTCTAGGGTCATGGAT
TATGTTAACAGACTAGACAACTTTGATGGCCCTGCTGTTGGAGAAGTAGC
TGTTGATGCACAACTGTATGAGGAGGCCTTTGCCATATTCAAGAAGTTCA
ACTTAAATGTGCAGGCTGTCAATGTTCTATTAGATAATATCCGAAGCATA
GAAAGAGCCGAAGAATTTGCATTCCGCGTTGAAGAAGAGGCTGTTTGGAG
CCAAGTTGCTAAGGCCCAGTTGCGTGAAGGTTTAGTCAGCGAGGCAATTG
AGTCCTTCATCCGCGCAGATGATACATCACATTTCCTTGATGTCATCCGT
GCTGCTGAGGAAGCCGATGTATACCATGATTTAGTGAAGTACTTGCTGAT
GGTGAGGCAAAAGGCAAGGGAGCCCAAAGTTGATGGAGAACTCATCTTTG
CATATGCTAAGATCGATAAGCTCAGCGACATCGAAGAGTTTATTCTTATG
CCAAATGTTGCCAATCTCCAAAATGTTGGTGACCGGCTGTATGATGAAGA
ACTTTATGAAGCTGCAAAGATTATATATGCCTTCATCTCGAACTGGGCTA
GGTTAGCTGTCACCTTAGTTAAGCTGAAGCAGTTCCAAGGAGCTGTAGAT
GCTGCTCGCAAGGCTAACAGTGCTAAAACATGGAAGGAAGTATGCTTTGC
TTGTGTTGATGCTGAGGAGTTCCGTCTAGCACAAATATGTGGTCTCAACA
TTATCATTCAGGTATATATAAGCTGGAACATAACTCTTCTTTTGAAGCTA
TATTTTATGATCAATATATATTCCTAGCTCCCGAGGAACCATTATCTACT
CCTTTCTGACATGATTTCTTTTGTTTAGGTTGATGACTTGGAAGAAGTAA
GTGAATACTACCAGAACAGGGGATGTTTCAGTGAACTCATCTCTCTCATG
GAGAGTGGTCTTGGACTTGAACGTGCACATATGGGCATCTTTACAGAGCT
GGGAGTCCTTTATGCTAGATACCGCTATGAGAAGCTCATGGAGCACATCA
AGCTTTTCTCCACCCGTCTTAATATTCCTAAGCTTATTCGTGCTTGTGAT
GAACAACAACACTGGAAAGAGCTTACTTACCTATACATACAATATGATGA
ATTTGACAATGCTGCCACCACTATTATGAACCATTCTCCAGATGCATGGG
AGCATATGCAATTTAAGGATGTTGCTGTTAAGGTTGCAAATGTTGAGATA
TATTACAAGGCCGTGCACTTCTATTTGCAAGAACACCCTGATCTCATCAA
TGATCTTCTCAATGTGCTTGCACTTCGCTTGGATCACACAAGAGTTGTAG
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GAATATTTCTTTTGGTGTATGAGCTTTATATTTCTATCCTAAATTTTCAA
CTGTTCTTTTATACTCCTATACAGGCTGGACAGTTACATCTTGTGAAACC
ATACATGGTGGCTGTTCAAAGCAACAATGTCTCTGCTGTCAATGAAGCTT
TGAATGAGATTTATGTTGAAGAGGAGGATTACGAGAGGCTCCGTGAATCA
GTTGATATGCATGATAACTTTGATCAGATAGGTCTCGCGCAGAAGGTATA
AATGAAAGAACTAGACGATTGTGTAATGCTTGTTTTGGGTGTTACTGTTA
TTATAATCAGTGTCTTCAATTTTTGATCAGCTTGAGAAGCATGAATTGCT
TGAGATGAGGAGGATTGCTGCTTACATTTACAAGAAAGCTGGCAGATGGA
AGCAATCTATTGCCCTATCGAAGAAAGACAACATGTACAAGGATTGCATG
GAGACATGCTCACAGTCTGGTGACCGCGAGCTTTCGGAGGATTTGCTTGT
CTACTTTATCGAGCAGGTTTGTGTAAAAACATGTTCTGTTTGGATTGCTT
TTGGCGCAGTTGAGTAATGAGCATGCAATGTATTTTCCTGCTTGTTTTAA
TGCCCTCTATAATATTTCCAATTCAAGTGTTTTGTAGCATGAAAACTGCA
TACCATGTCTGTCGGCAGCATACAAACTAAACTAAGTGTAGATAAATCCA
AGAAATATGCAGTTTAAGCAAGCACAGAAAAACTCATCTCACTTGTATTA
GTTTTATTGAGATTCTGGCTTGTATTGTTTTGGCACATCATTGCATTTCT
AACGGGTAAGCATGTCTGCTTGTGTGTTGCAGGGAAAGAAAGAATGTTTT
GCTTCTTGCCTGTTTATTTGTTACGACTTAATTCGCGCGGATGTTGCCCT
TGAGCTCGCATGGACGAACAACATGCTGGACTTTGCTTTCCCCTACCTAT
TACAGGTATGTTATTTTCTTGTGTGTGTTTGGAAATGTTGAGTTACATAC
AGTTTGCTGTAATAGCACTCTTGTTATGCGTGCAGTACATCCGTGAGTAC
ACAAGCAAGGTAGATGACTTGGTAAAGGACAGGATTGAATCACAGAAAGA
AGAAAAAGCTAAAGAGCAGGAAGAGAAGGACGTTGTTGCTCAGCAGGTAA
CCTGAAGTGCTATTCTTTCTTGGTTTAACATCCCGCAGCTCATGCTTAGG
CAGACAGCATGACAAGTTTGGATTTTGTTACACAGAACATGTATGCCCAA
TTGCTCCCTCTCGCCTTGCCTGCTCCACCTGGCATGGGCGGTCCACCTCC
TATGGGCGGAATGGGCATGCCTCCTATGGGCGGGATGGGCATGCCTCCGA
TGGGCGGGATGGGTATGCCTCCGATGGGTCCTGGTCCGATGCCTGCATAC
GGGATGCCTCCAATGGGGAGCTACTAAGGGTGTTCCAGTTTGGCATTTGA
AGAACATAGATGATGTTGATTGTTTCAGTTTACACAGATGGGAAGCGCGG
TGATCCCGAGGTATCTTTGAAGTTGTAGATTTGGGCTATTGGTTTTTCGA
TTAATATTCTTTTGGTACCAGGACAACAATTGGCGAGCAATACCCCTAGC
CGAGGTACCGAGTTAATTTACTGGTTACAGTATATTATGGCCGGGTAGGA
TGAGGATGATTAGTTTGAGCTGAAGAAGAACGAGAGGCGGAGGACTGGTA
CCATTTGTATAGGTTGTGTGATAAAAGAAGTCTGTAGACATTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.