Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA004942

[Submit comment/correction]

Sequence
AA004942
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004942
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGGCCGTGCGCAGTGCGCTGCCGTTCCCCAAGGCCCACAAGCAGATAGCC
CTCTTCCCTCTCCCACGCAGGTCCCGTTTCTCCGGCGCCCCAAACCCAAA
CCCTCGCCGTCGCAGCGCCACTTCCCCGGCGGCCAGACCGGCCGTATACT
CCCCCAGGGTTTAGCCGTTCGCACGACGGCAGCAGAGGCCATGGCGGACC
CACCTTCTCCTCGCCTCGACGAGGACACCTTCGGCCGCGACTTCAACGCC
TCGCCCTCTCGCAACGCTGCCCCCGCCCGTTCCGGTCTCTTCCCCCCTCT
CTCCTTTCAATCCTTCCCCGCGGCCTTTGTTTTTATTAACGTCCGAGCTT
TTGCTTCCGCGAAACTCACGTGGTTCCTATGGCGCTTTTTTCTGCTACCG
CTGCTTCTCTGCAGGGGAAAAGAGGCCGTTCGGCGATCTGGATGACGACG
AAGACGATGTGTTTGCTAACAAGAAGGTAATTGTTCTAGTTCCCACTTTT
AAAATTCAATACAAAATCTTTTGTATTTCTTGCCCCTGTTACCTTGCTGA
ATTTCGGTTACCACTACGCTTTGCAATAATGTAACATGAAAACATGCTTA
ACACTTTGGTCTTGGTGAAGCTGTTTCTGTCCTGAATGTATGGTGCGATG
AACGATACTATGGTTGTTTTCACATGGGATTGTGGAATAAGGAAACCAAA
TAGTTATTATAGGATAATGGAAAGATGCAATAAGAAAACTAAACATATGT
TTAATCCTACACAGTTCTTGCTTACCTACTAGTTGTATAAGTTTTGGCGA
TTTCTTGCGATTAGAAGATTTTTTAAGACGGCGAGTTGTGTGCAGGGAAA
GACAAAGGTGGAGGAGAGTGCACCCGGTGCTGCCACAGGGATGATTTTGT
CTCTTCGTGAAAGGTAAATTACTTTTTTTAAGTAACCTTTTGATCTATTG
CTTTTCTTCTACCAAATAACTGTTGCTATATTGTTAATTGTAAACATGGA
CTAATTTCTCTCCATGTTTTTGAAGTTTGCAGAACTGCAAAGAGAATCTC
GAATCGAACCAGGTGTGTAGTTAGTCACTGTTCTTTCATGTTCTCATTTT
GCTAGTAAAGTACAGTTTTGTTGAGCTGAATATCTAATGTGTTAGTGATT
TCGATTAATCTGTTATAACCCCATTCTTGTATAAACAATCACCGTTCACT
TATTTTTAGCTTTATTACTGTAATTGGTAAGAAATAACTGCAGGATATAT
ACCTTTTCTTATTGATAAAGGTTTTCCTGATGAATTATTAATGGACAAAC
CTGATCCTCTCACTCTCACATGTTTCAGAACAGCAATGAAGATTTTTTCA
ACCTATAGTGCTAGTTTGAACTTTTGACTACTTAATCATATAAAAATGCA
TGAAGTAATAAAAGTAACATACATACAGCCTATCTAAACTTTACTTGAAG
TTTAGACATCTGAGAAATAGAAAAGAAGTCACAACTACAAGTACACCCAG
TAAACATGTATTTCTCTTTAAGAATTAAGTGCAATGAATTAATGATTAAT
TGTATGTCACTGAAATGTGGAGATGTAGTTTCAATAACCATGTATGCAGT
TTAGTTCCACCAATGCAAGTTTGCATTCCGTTTCAGTGTGAGATACACAA
TGTTGTGAGCAGTAATTTCTGAAATACTGCATTTTTTAATGCATTACAGG
TGGAACTGGAAGCTGCTAAATCAGAAATTCAGAAGTGGCATTCAGCATTT
CAGAACATTCCAGCTGTACCTGCAGGAACTGATCCAGGTTGGCAAGTTAA
GAGCATCTCCACTCGTTGAGGCATTCCCAGGACAAATTTTGGTCCTGATG
GAGCTAATTTTGGTCCGGATGGAGCCCTGGGAATGGAACTTTCCCAGTAG
TGTTCCCAGCTTCGCGGCTCGCCTCGACAACGGCGAGGCCGAGCAAGACA
CGCATAGGAGCAGATGGCCGCGGGAGAGCACTGGGGCACGCGGAGCTCGA
TTGGTGGCTGCCGGCACGCGATTGGGGCGGCGCGGAGATCGATTGGGGCG
GCGCGGAGCTCGATTGGGGCGGCGTGGAGCTTGATTGGCTGCGGCACGGA
GCTCGACTGGGGTGGCGGGCGCACTCGGGGCGAGGTCGCGGGCGGCTAGG
GAGGCGGCGCGAGGAGTAGAGGGAGATGGGGGAGAGAGGGGACACGGGAG
GAAGGAGGCGAGCCTGGGCGGCGGCGGTTGGTGGCGAGGTTGACCCTGGG
GGTAGCGGCTGGCAGAGGAGGCGCGCGGCGTAGAGGCGTGCTGCGGCTGG
CGGCGGGCAGAGATCGAGGGAGAGGGGAGCTTGACGCGGCGGACGGGAAG
GGGAGAGAGACGGGGAGAGAGATAGGGGGAGAGAGAGGACACGTGGGGGA
GATTGATTGGGCAATCGTTCGATCCGGGGTTCCCAGGGCGTACCCAGCTT
CCTGGGTTCGGTTTGGGAAGCCCGGACGAAAACGGACCAAAATTCGGCCT
GGGAACGCCTCTTGGGAACGCTACTGGGGCGTTTTTTGCAAATCCGGACC
AAAAAACGTCCTGGGAATGGCCTCTTGGGAATGCTAGTGGAGATGCTCTA
AATCCAAGTCCTTTCTGTCTCTGGTAATGACTGAACAAATAATATCTATT
TATAAATGCAGAGCCTGTTTCGGTGGTTACTTATCTCAATAACCTAAAGT
CGTCGGAGGAGTCACTGAAGGAGCAGGTTGGTTCTTTTGGCATGCTTGTA
AAACTGGTGTAATACTTATAATTTGCTTTTGTTTAACTGTTGATTAATGC
TCAGCTGGAGAAAGCTAAGAAAAGAGAGGCTGCTTTTATTGTAACATTTG
CAAAACGAGAACAAGAGATTGCAGAATTAAAGGTACTCGCGGAGAGCCTC
CTTCTACAATGACAAACTTTTCAATTTGGATAAACCTGAGCAGTATTTTG
TGATTAATTGATTTCTAGTGTCCGTCTAGTTGTGCTGATTGGTGGTTATT
TTTCCTGTGAATTTGCAGTCTGCAGTCAGGGATTTGAAAACACAGTTGAG
GCCACCGTCAATGCAGGTATATATAATGCTGACTATGTATGGTGTTCTGC
ACTTCTGACAGTTTATTGTGCATTTGAAATTTGAATTCTTACTGTTCCTC
CGAAGTTGTTTGTGCGAGGATTATCTTCATTTGTTTTAAATGGAATTACT
GCAAAGTGTAAACTGTAAAAGAAGACTTCAGTAGCTAAAATTGTCTATTT
CGAACGTACCATGATTCTTATCTGCGTACTGCAATGTGTAAATCTTAATT
AGTATTGGACTTGTTACAACCGAATTTTCCCTTTGCACCAATACTGTACC
TAATAATGATTAGCTAGATTACTTTCACAGGCAAGTTGATGGCAGTAAAT
GTAAACCATATTATCATATTATTATTCTGGAAAACTCATATCCCCTGACC
CCAAAACGTGATCTGCAATACTCAATCCATATCCATACAATTCCACTCAC
CTAGTAGTCACCTACATATCCTAGAGGGACTAGCATTGAATGAATATATT
GTAGGGATGGTACAGACGATGAGGCAAGTAATATTTGTAGTATGCTACCA
TGTTAAGTGGATACCTGCTGTGTAGGTGCTAATTATTTGAAAATTAACCC
AGATTGATTTGCCATGTTCTTTTGTATGCTCTGCAAGGAGGGTAGTGAGA
AGTTTGGTCATTATTTTGCAACATACAAGAGATCATGTTCTAGTGATATG
GTTTGTGGTATTTTATATTGCATGTAGTACTTTTAAGAAGTTGAGGTGAG
ACTAATTGCATCCTCTCCTAGCTAAGCGGGATAATTACTGATGAAGGTAG
CCAGACCCGGCTACGAGTGGGTAGACATAGGATGAAATGAGCGAATAACT
AGAAGGGAATAGATTGATTATTCTTCCTTGATTTCCCTAAAAAATTACAT
GACCGACACAAACCTTCCAGTACATGTATGCAAATGAGTACTTTTCTAAT
CTCAATGTATTGTTCCGAGTAGATATTTCTTAGATCTATCTCTATTCTCT
AAGTCACCTTTCGTAACTCCTGTGGCCTGAAGCCACCTGCCCACACACTT
GCCAGACTCCTGCATCGATTCTCATTGGCTGCTGCATGCTGATGTTAACA
ACAGTAGCTAATACCAGTTTCTGTATTGAACAAACATCTTAGGGTTTGTC
TAGGAAGGATATTGTTTCTAAATTCAGTGACTTGAGTGATGAGCCTTGCT
GAAACAATAATCCGATTTCTCAATTGCAAGCTTAACACCACTTCACACAA
AATAGGGTAAACTTTGTTTCATGAAGAAGGAACATGAGATGCTCGAACTC
TGAAGACTGGTGCTCATCTATTCTAGCCTTCCATGTGTTTATCTTCTTTG
AAAATGTGTAAAAATACCTTAAGTTCAGTTTGGATATCTTCTCCTTCGTA
TCATATCTGTCATGTGACGGTTAAGTCTGGACTCCCTGCATGGTAGGATT
AGCTTCTTCCAAAAGCTGGCTTCTTAGAGAAGTTGTGGACATGGCTCTTT
GTATAGGAACAGGCTTAGGAACTGTTTGTAATGCAGGAACTGCTTGACAA
TTTCACAGGAGGAATTGGGATAATATTATCACATAAAAAATGCCGCCTTA
AGCTTCCTGCGAAGCCTTAGTGGCTTAGTAGTTGCACCCTGTATGGGGGG
CTTAGACTTTGGTTAGCTCTTGAATGAATTTTTAATAATGCCTAAACCCT
ATGTTGTTGCACTGGATAGCTTATTTACATAACTTATTATGTATGCTTTA
TCAGACAAGGCGATTATTGCTTGATCCAGCAATTCACGAGGAATTTACAC
GCTTAAAGGTCAGTGAATTCCCTTCAATCAGACGATTCTTCTTGCATCAT
ATTAGTTTGTACCAGCATTGCAGCATGTTAAGTAGAAAGCCTGGCGCCAT
AACATCTAATATAACCGTTATGTTAGGGTTCTGATGCCCTTTTGCACTAC
TTCTGTAATTTTAGCCAAACATGTAAGTTCTAGAAATATGTAACGAGACT
TGGCATGTCTTCTCTTGAACCAATGTTTGTAATAATCCTCTTAAGCAAGT
ATGCAAGGCAGAAAGCCCACCTTTTTCATCATATTGCATATAGCTGTCAC
AAAAATTGTGTTCTTATTTCTTAAAGTGGAAATTTTAGAAGATATAAGTA
ACAAATTGTTGCATGGGAACAAAGAGATTGGTAGTTAAAGTACAATACTC
AGTGTCCTATACATATATAGCTATCACAAAAGCTTTGTTAATGTCTTGAG
ATCTGACTTGTAGAAGATTTGGCAACAAATGTGCTATGTGGGAACAGAAC
AGATGGATAATGGAAGCATATTATTATATGATATACTAAGGATGATGATA
GCACCTTAAGAATTAGAAGTTAAAATTTGTGTTTTATATGTCCGAGGAAA
ACTGTAACTTACATACCTTGACTGACACTGCCTGTTTCTGTCCAGAATTT
GGCAGAAGAGAAAGAGAAAAAGATTAAAGAGCTACAGGACAATGTTGCTG
CTGTCAATTTTACTCCATCCAGCAAGCATGGGAAAATGCTAATGGCCAAG
TGTAGAACATTGCAAGAGGAAAATGAAGAGATTGGGGCAATGGCTTCTGA
AGGAAAAGTAAGTCTTCCAACAGATGTCAGCGGTTTGAATATGCTTCCAA
TTTGCGTCTGCCTTCCAAAGAATAGAATCGTTGGTTATTATTTGAACAAC
CACCATATTAGAACAGAAATGTTGTGCCTTAGTTTTGCCAGAATTAGGTG
TAACCAAGTTTTTATGGTGCAGATCCATGAACTTGGAATGAAAATTGCAG
TTCTGAAGACCCAGAACAATGAGCTCAGGAATCAATTCGATGGTACGTGT
CAACTTACACCCAAGCTAAAAGACTAGCGAAGAACCACTATATGTGTTTA
TACTTAATTTTGTTAAATCTGGTGTATATGGCTGGGCATCATATGTTATA
TATTGCTTAGAATTTTTCCGACTCATGATGTCGATTGTTGCTGCTGTAAA
ACTTTGGATCTGCTTAACCTTTGTTCTTTTGTTGTTCTTAGGGTTGTACA
AGCACATGGATGGCCTAACAAATGATGTTGAGAGGTCAAACGAAATGGTA
AGGATTCACCATTCTCGTTGCTACTAGTTTGCTTGTATTTTTTTCTCCAC
TTAAACTCTTTTGAACTGCCAACTATTACGCAGGTGTCCATTCTGCAAGA
GGAGCTAGAAGCTAAAGATGTGGAGCTGACGAGATTGAAGGAGATGCTTT
TGCAGAAAGAGGCAGCTGAAGACACAGCAGTTGAAGAAATAAACCAAGCT
GCAGATGATATGAACGCAACTACTTCTAGTCCGCAGCCGATAAAAATAGA
GGCCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.